Cilj pregled
DNA mctiltransfcrazu 3b (DNMT3b) igra važnu ulogu u abnormalnom metilacije u nastanku tumora. Polimorfizam DNMT3b Metode Četiri stotine i četrdeset sedam histološki-potvrđenih slučajeva raka želuca, 111 atrofija slučajevi želučani i 961 kontrola bez tumora je upisano u radnu sobu. Pet oznaka SNP (rs6119954, rs1569686, rs4911107, rs4911259 i rs8118663) od DNMT3b Rezultati pregled Medijan praćenja vremena za 422 želučanih bolesnika s prognozu informacija bila je 55,1 (51,8-58,5) mjeseca. Otkrili smo da osobe s rs1569686 varijanta genotipa (TG /GG) su značajno povezane s lošom prognozom kod karcinoma želuca u odnosu na one koji nosi TT genotip (HR = 1,43, 95% CI: 1,02-1,99). Ovaj trend je očitije u dugoročni opstanak raka želuca. Slični rezultati su promatrani za G alel nositelja rs4911107 i T alela nositelja rs4911259 što su ta dva mjesta su u potpunoj spojnici neravnoteže s rs1569686. U rs8118663 GG nositelji skloni živjeti kraće od AA /AG genotip (HR = 2,72, 95% CI: 1,45-5,12) u bolesnika koji žive duže od 2,0 godina. Niti jedan od pet SNP-ova bilo je povezano s rizicima raka želuca ili želuca atrofije. I nema veza postoji između svakog od pet SNP-ova i DNMT3b izražavanja u. Pregled Zaključci pregled Ovo istraživanje pruža dokaze da je DNMT3b pregled polimorfizmi mogu predvidjeti dugoročni opstanak od raka želuca , Međutim, daljnje studije su potrebne da bi se otkrilo temeljne biološke uloge DNMT3b pregled polimorfizma pregled Izvor:. Wang C, Jia Z, Cao D, ti L, Jin M, Wu X, et al , (2015) Polimorfizam DNA mctiltransfcrazu 3b i Udruge za razvoj i prognoza u rak želuca. PLoS ONE 10 (8): e0134059. doi: 10,1371 /journal.pone.0134059 pregled Urednik: Valli De Re, Centro di Riferimento Oncologico, IRCCS National Cancer Institute, ITALIJA pregled Primljeno: 16. travnja 2015; Prihvaćeno: 3. srpnja 2015; Objavljeno: 11. kolovoz 2015 pregled Copyright: © 2015 Wang et al. Ovo je otvoreno pristupa članak distribuirati pod uvjetima Creative Commons Imenovanje License, koja omogućuje neograničeno korištenje, distribuciju i reprodukciju u bilo kojem mediju, pod uvjetom da je izvorni autor i izvor su zaslužan pregled Podaci Dostupnost: sve relevantne podatke su u radu i njegove popratne podatke datoteka pregled Financiranje:. Ovaj rad je podržan od strane Nacionalne zaklade prirodoslovni Kine (81072369, JJ), Nacionalni Natural Science Foundation of China (81373084, JJ), Nacionalni Natural Science Foundation of China (81273065, XYC), Norman Bethune program Sveučilišta Jilin (2013025, JJ), zaklada za mlade od prvih bolnice Sveučilišta Jilin (JDYY42013014, ZFJ), Zaklade za mlade od prvih bolnice Sveučilišta Jilin (JDYY42013018 , DHC), te znanosti i tehnologije za razvoj programa Jilin provincije (20150414014GH, JJ). U financijeri nisu imali ulogu u studiju dizajna, prikupljanja i analize podataka, Odluka o objavi, ili pripremu rukopisa pregled U konkurenciji interese.. Autori su izjavili da ne postoje suprotstavljeni interesi pregled Uvod pregled rak želuca (GC) je jedan od najčešćih malignih tumora u Kini, te je drugi vodeći uzrok smrti uzrokovana tumorom [1, 2]. Helicobacter pylori pregled ( H pregled. pylori pregled) je klasificiran kao skupina I kancerogen raka želuca od strane IARC 1994. [3]. H pregled. pylori pregled je također jedan od faktora rizika za želučane atrofije (GA), koji je uključen u razvoj raka želuca [4, 5]. Iako je polovica svjetske populacije ima H pregled. pylori pregled infekcije, samo mali dio njih napredovati do kroničnog atrofični gastritis, a zatim karcinoma želuca. To sugerira moguću ulogu domaćina genetskih čimbenika u odgovor na kronični H DNA metilacije je jedan od su Epigenetske modulacije i važno je u pravilu transkripcija i kromatina struktura pregradnje [7]. Netipična metilacije DNA može dovesti do genoma širom hypomethylation i regionalne Hipermetilacija, koji je identificiran kao mogući mehanizam inaktivacije gena za suzbijanje tumora [8-10]. DNA metiltransferaza-3b (DNMT3b) je de novo pregled mctiltransfcrazu i više izražena u različitim tumorima, kao što su rak pluća [11], karcinomi dojke [12], hepatocelularni karcinom [13] i velikom B- stanični limfomi [14]. U prethodnoj rad je pokazao da DNMT3b izraženi su značajno više u želučanom tkivu karcinoma u usporedbi s onom sparenim kontrolnih uzoraka [15]. I više razine DNMT3b su prijavili da se uključe u limfnih čvorova metastaza raka jajnika [16] i kraće ukupno preživljavanje akutne mijeloične leukemije [17]. To sugerira moguću ulogu DNMT3b u razvoju i progresiji tumora. Pregled DNMT3b pregled smješta u kromosomu 20q11.2 s ukupnom veličinom 47kb. Smatralo se da je u jednom nukleotidu gena (SNP-ova) unutar promotorske regije DNMT3b pregled gen može mijenjati razine ekspresije gena [18]. Prethodne studije su pokazale da SNP-ovi za DNMT3b pregled su u korelaciji s osjetljivošću različitih tipova raka, kao što je karcinom stanica jetre [19], karcinom pluća [18], nazofaringealni karcinom [20], raka dojke [7] i želuca rak [21], a Azad i ostali [22] su pokazali da DNMT3b pregled rs2424913 polimorfizma je povezana s povećanim rizikom opasnosti od u raka glave i vrata. Ovi SNP je utvrđeno da utječu na aktivnost DNMT3b pregled na DNA metilacije promjenom razine DNMT3b, čime modulaciji osjetljivost na rak [23, 24]. Pregled Međutim, koliko smo znam, nema papira bio dostupan na ulogu DNMT3b pregled polimorfizma u prognozi raka želuca. U ovom istraživanju ispitali smo povezanost između polimorfizama DNMT3b pregled gena i osjetljivosti od karcinoma želuca, kao i želučani atrofije i kliničkopatološka obilježja i preživljavanje karcinoma želuca u kineskoj populaciji. Pregled materijal i metode pregled Etika izjava pregled Ova studija je odobren od strane Etičkog povjerenstva Prve bolnice Sveučilišta Jilin. Pismeni informirani pristanak dobiveni su iz svih predmeta prije sudjelovanje u ovom istraživanju. Pregled Studijska populacija Novodijagnosticirani raka želuca prolaze tumorectomy pozvani su na studij na Odsjeku želučanih i debelog kirurgija, Prva bolnica Sveučilišta Jilin (Changchun, Kina) tijekom 2008. godine do 2010. godine je ukupno 447 slučajeva s patohistološki dijagnosticiran rak želuca, bili su uključeni i niti jedan od slučajeva su primili kemoterapiju ili radioterapiju prije operacije. Osnovna klinička obilježja su prikupljeni iz medicinske dokumentacije ili putem telefonskog razgovora. Definirali smo kemoterapiju kao učinkovit tretman u trajanju od najmanje 3 ciklusa. Pacijenti su primili nekoliko postoperativnih kemoterapijskim protokolima, uključujući FOLFOX-4 režimu (kombinaciji s 5-fluorouracil, leukovorin i oksaliplatin); XELOX režim (kapecitabin i oksaliplatin); druge kemoterapije, kao što su kapecitabin ili samo 5-fluorouracila. U istom razdoblju, ispitanici pohađaju zdravstveni pregled-up centar bez povijesti tumora bili su pozvani da u kontrolnoj skupini u istoj bolnici, a 1072 osobe su potpisali informirani pristanak. Među njima su pronađeni 150 subjekti imaju želučane atrofije ispita u serumu pepsinogen i 111 po potvrđeni su biopsijom i histopatologijom i bili uključeni kao želučani atrofije grupi. Preostali predmeti (961) su bile uključene u kontrolnoj skupini. Pet mililitara periferna krv prikupljena je od svih sudionika i pohranjeni na -80 ° C do genomske DNA ekstrakcije. Pregled slučajeva raka želuca su popraćene su telefonske pozive tri mjesec, šest mjeseci i godinu dana nakon tumorectomy i svaki od godinu dana kasnije sve do smrti ili zadnji rasporedu praćenja. Slučajevi neće biti uključeni u analizu preživljenja ako (i) oni su izgubljeni za praćenje na prvi put u telefonskom razgovoru, ili (ii) da su umrli od komplikacija kirurškog zahvata u perioperacijske razdoblju. Vrijeme preživljavanja je definirano kao vrijeme od dana kirurških operacija na dan smrti ako su umrli bolesnici ili datuma zadnjeg uspješnog razgovora ako su pacijenti izgubili od praćenja ili živ do kraja studije , Preživljavanje vrijeme pravo je cenzuriran, osim da su pacijenti umrli od raka želuca. Pregled Testovi H pregled. pylori pregled infekcije i dijagnoza želučane atrofije pregled serum imunoglobulin G (IgG) protutijela na H Netlogu. pylori pregled, pepsinogen I (PGI) i pepsinogen II (PGII) su ocijenjeni od strane imunoenzimnim testom (ELISA) nakon uputama proizvođača (Biohit, Finska). Pojedinci s PGI < 82.3 ng /ml, a omjeri PGI /PGII < 6.05 su bili pozitivni na želučanu atrofije probira, a zatim potvrđen biopsijom i histopatologijom kroz gastroskopija [25]. Koeficijent interday varijacije (CV) od kontrolnim uzorcima među kompleti su za 4,5%, 4,3% i 4,7% za H Netlogu. pylori pregled IgG, PG I i II PG, respektivno. Označavanje SNP izbor pregled SNP-ova koji pokrivaju područje od DNMT3b pregled analizirani su pomoću SNPbrowser Software v4.0 na temelju Han kineskog stanovništva u HapMap projekta (2009/06/02 HapMap). Četiri označavanje SNP-a (tagSNPs, rs6119954, rs4911107, rs4911259 i rs8118663) odabrani su koji bi mogli pokriti 22 SNP-ova u DNMT3b pregled s minimalnim manje frekvencije alela (MAF) od 0,05 i par-mudar r pregled 2 od 0,8 ili veći [26]. Osim toga, još tri SNP, rs2424913, rs6087990 i rs1569686, također su bili namijenjeni da bude izabran kao SNP-ova kandidata. Međutim, samo rs1569686 genotipizirane su rs2424913 imao premalu MAF (0.012, podaci iz HapMap projekta) i rs6087990 je u apsolutnom LD ( D pregled '= 1 i r pregled 2 = 1) s rs4911107. Konačno, pet SNP, rs6119954 (introna), rs1569686 (promotor), rs4911107 (introna), rs4911259 (introna) i rs8118663 (3 'postranični regija) su odabrani za genotipizacija. Pregled genotipa pregled genomska DNA je izvađen iz cijelog uzorka krvi pomoću krvi genomske DNA ekstrakcija setove sljedeće upute proizvođača (Axygen bioznanosti i SAD). Genotipovi svakog SNP određeni su TaqMan genotipizaciju testovi slijedeći protokol proizvođača u 384 jažica (Applied Biosystems, SAD). Sekvence početnica i proba dostupni su na zahtjev. Polimerizirajuće lančane reakcije (PCR) bili su kako slijedi: 1 ciklus od 95 ° C kroz 10 min, nakon čega slijedi 40 ciklusa 95 ° C za 15 s i 60 ° C tijekom 1 min. Procesi amplifikacije su provedena na Bio-Rad S1000 toplinska Biciklističkii (Bio-Rad, California) i gotovih proizvoda koje su pročitali na ABI PRISM 7900 HT Sequence detektor pomoću niza detektor softver v2.3 (Applied Biosystems, USA). Dvije prazne kontrole su uključene u svaki 384-i testa olakšavanje softver za prepoznavanje genotipova. Pet posto nasumično odabranih duplikate uzoraka bili su uključeni u svaki 384 jamica za kontrolu kvalitete, a ukupna saglasan iznosila je 99,91%. Pregled Imunohistokem pregled DNMT3b izraz procijenjena je u tumorskom tkivu 104 pacijenata rak želuca po metodi imunohistokemija. Odjeljci 4 uM debljine od tkiva blokova su izrezani, deparafmizirane i obojani korištenjem imunoperoksidaznog tehniku streptavidin-biotin. Ukratko, sekcije tkiva su inkubirani preko noći na 4 ° C s anti-humanim DNMT3b poliklonskim protutijelom (1: 200 razrijeđene, SC-20704, Santa Cruz, USA). Signale se vizualizira s 3, 3-diaminobenzidinu (DAB) i slajdovi su prebrojane s hematoksilinom. Kao negativne kontrole, stakalca su tretirani s izotipova IgG kao zamjenu primarnih protutijela. Obojeni slajdovi su ocijenjeni od strane dva neovisna patologa, koji su bili zaslijepljeni iz kliničkih podataka. Široko prihvaćena HSCORE sustav se koristi za procjenu bojenja intenziteta i postoci stanica obojenih s određenom veličinom intenziteta. HSCORE je izračunata slijedećom jednadžbom: HSCORE = ΣPi (i) (i = 0, 1, 2, 3, Pi = 0-100%). I označava intenzitet obojenja, tj bez bojenje = 0, slabo bojanje = 1, umjerena = 2 bojanje i intenzivno obojenje = 3. Pi predstavlja postotke obojenih stanica s intenzitetima variraju od 0 do 100%. HSCORE u rasponu od 0 do 300 pregled Statistička analiza pregled Kontinuirana podataka, kao što su dob i HSCORE ocjenama DNMT3b izraza su sažeti kao medijan (25. do 75. percentila) i usporedili po Mann-Whitney U Test ili Kruskal-Wallis test. Kategorične podaci su opisani kao frekvencije i postotka i uspoređene pomoću χ 2 test ili Fisher točnog testa kada je to prikladno. Frekvencije genotipova svakog SNP se odrediti izravnim brojanje i odstupanje od Hardy-Weinberg ravnoteže u kontrolnoj skupini je ocijenjen od strane goodness-of-fit χ 2 test. Povezanost ravnoteže (LD) između parova Biallelic lokusa određena je pomoću dvije mjere, D pregled 'i r pregled 2. Bezuvjetno logistička regresijska analiza je korištena za izračun omjer vjerojatnosti (OR ') i 95% intervala pouzdanosti (CIS), uz prilagodbe za eventualne Ëimbenike (dob kao varijabla razmjera, seks kao nominalnu varijablu i H pregled. pylori pregled antitijela kao nominalne varijable). Survival funkcije pacijenata s rakom želuca unutar svakog SNP crtano po Kaplan-Meier metodi i uspoređene Log-Rank test. omjeri opasnosti (HR) sa 95% CI su se kvantificirati utjecaj genotipa svake SNP na ukupno preživljenje i izračunate su s Cox regresijska modela. Za haplotipova s frekvencijama > 1%, su ocijenjeni rizici na osjetljivosti i smrti opasnosti u odnosu na referentni haplotip (glavni haplotip u kontrolnoj skupini) koji koriste bezuvjetnu logistička regresija model i Cox regresijska modela, odnosno s THESIAS verzija 3.1 softvera [27, 28]. Svi statistički testovi bili dvosmjerni i P pregled vrijednost < 0,05 smatra se statistički značajnom. Ako nije drugačije navedeno, ranije analize provedene su u SAS 9.1.3 software (SAS Institute Inc., USA). Pregled Rezultati Subject karakteristike Ukupno 1519 ispitanika, 447 slučajeva raka želuca, 111 želučani atrofija slučajevima i 961 kontrola bez tumora su bili uključeni u ovu studiju. Karakteristike svih subjekata prikazani su u tablici 1. demografskih čimbenika, dobi i spolu, nisu ravnomjerno raspoređeni u tri skupine koje GC grupa imala više muških i starijih osoba. A 69,1% od GC slučajeva bilo je pozitivno na H Netlogu pylori pregled, što je znatno više nego u kontrolnoj skupini (49,7%, P izvoznici < 0,001). Dok je ne- znatno manji od želuca atrofije skupini (75,7%, P pregled = 0,176). Kao što ovi faktori mogu pomiješati učinke SNP, usporedbe distribucije genotipova u nastavku bili su prilagođeni prema dobi, spolu i H pregled. pylori pregled infekcija. slučajeva raka Većina želučani imala crijevnu vrsta raka (87,3%) i 140 bolesnika primljenih postoperativne kemoterapije (31,3%). pregled Udruga SNP s rizikom od raka želuca ili želuca atrofije pregled Četiri SNP lokusa , rs1569686, rs4911107, rs4911259 i rs8118663, bile u skladu sa Hardy-Weinberg ravnoteže u kontrolnoj skupini ( P pregled bila 0,321, 0,341, 0,362 i 0,874, redom). Rs6119954 mjesto, međutim, utvrđeno je da se odstupilo od njega ( P pregled = 0.0331). Ipak, ovo mjesto je uključeno u konačnoj analizi, jer je stopa podudarnost duplikata uzorka rs6119954 je 100%. Mjerenja par-mudar vezivanja neravnoteže su navedeni u S1 tablici. Tri loci, rs1569686, rs4911107 i rs4911259 pokazala potpunu poluge neravnoteže ( D pregled '> 0,98, r pregled 2 > 0,96). Stoga, samo rs1569686 su analizirani predstavlja rs4911107 i rs4911259. Pregled U odnosu na najčešći genotip svake SNP-a, nema razlike zabilježena je na distribucijama tri lokusa između želuca grupe raka i kontrolne skupine, nakon prilagodbe za dob , seks i H pregled. pylori pregled infekcija (Tablica 2). Nitko alela ili haplotip je bio povezan s rizikom od raka želuca. Slični negativni rezultati dobiveni su na rizik od želučanog atrofije (tablica 2). Osim toga, nema udruge uočene su između SNP-ova ili haplotipa i rizik od H Netlogu. pylori pregled infekcije u kontrolnoj skupini (S3 tablici). Genetski distribucija SNP analizirani su prema kliničko parametrima kao što su veličina tumora, stadiju, ocjene i udaljenih metastaza u slučajevima raka želuca. Pacijenti koji nose AA genotipa rs6119954 imali veću učestalost udaljenim metastazama (25,6% vs Netlogu. 9,1%, P pregled = 0,003). I pacijenti nose AA genotipa rs8118663 imali više udjela veličina tumora ≥5 cm (33,5% vs Netlogu. 23,3%, P pregled = 0,040) (S4 Tablica). Pregled Udruga SNP sa preživljavanje karcinoma želuca pregled Praćenje informacija bila dostupna za 435 (97,3%) bolesnika s rakom želuca do veljače 2015. trinaest pacijenata je umrlo od postoperativnih komplikacija u roku od 30 dana na početku studije i takvi slučajevi bili su isključeni iz analize učinaka SNP na preživljavanje. Konačno, 422 slučajeva su bili uključeni u analizu preživljavanja. Tijekom praćenja, 195 (46,2%) bolesnika je umrlo od raka želuca, 14 (3,3%) slučajeva je umro od drugih uzroka, 203 bolesnika (48,1%) živi i 10 (2,4%) bolesnika su izgubili pratiti. Medijan praćenja put je 55,1 mjeseci (raspon od 1,1 do 79,2 mjeseci) U svim slučajevima u analizu preživljenja. Pregled Cox regresijska analiza je provedena procijeniti povezanost DNMT3b pridruživanju između SNP i izražavanja DNMT3b Netlogu DNMT3b izraz je procijenjena u kancerogenog tkiva od 104 slučajeva raka želuca pomoću imunohistokemijske metode. DNMT3b ekspresija opažena je uglavnom u jezgri stanica i razine ekspresije bile visoke (HSCORE > 200) u 64 slučajeva (61,5%), umjerena (100 < HSCORE≤200) u 30 (28,8%), niska (HSCORE≤100) u 2 (1.9%) i negativno (HSCORE = 0) u 8 (7,7%). Rezultati izražavanja prema genotipova tri SNP-lokusa su prikazani u tablici 4. Međutim, postoji razlika od DNMT3b izražavanja može se uočiti između genotipova svakog SNP-a. Pregled Rasprava pregled U ovom istraživanju , sustavno istraživali ulogu varijanti DNMT3b pregled gena u razvoju i prognozi raka želuca u velikoj populaciji. Otkrili smo da rs1569686 TG /GG genotipova statistički su značajno povezane s lošim preživljavanje raka želuca. Osim toga, primijetili smo da DNMT3b Većina radova objavljenih samo fokusirati na ulogu DNMT3b pregled u carcinogensis raznih malignih bolesti. Koliko nam je poznato, ovo je prvi izvještaj koji opisuje povezanost DNMT3b Mi i dalje po prvi puta istraživali povezanost DNMT3b DNMT3b pregled gen kodira DNMT3b, A član obitelji DNA metiltransferaze koji sudjeluje u širokom opsegu bioloških procesa, uključujući razvoj tumora i tumorgenesis [29]. Nekoliko prethodnih istraživanja su pokazala da polimorfizam DNMT3b pregled povezani s razvojem raka u različitim tumora. Shen et al [18] kao prvo izvijestio da su nositelji T alela, posebice heterozigotni (CT) od rs2424913, imali su gotovo dva puta veći rizik od rizika od raka pluća u odnosu na homozigotni CC genotipa u bijele populacije. Osim toga, pronađeno je to C do T opća genetska varijanta DNMT3b promotor temeljno povećava ekspresiju mRNA [30]. Međutim, uloga rs2424913 na rak na kineskom može biti zanemariva kao C alela na kineskog stanovništva je odsutan ili rijetko [20], značaj velike raznolikosti u DNMT3b pregled SNP distribucija može biti zbog različitih etničkih skupina , nepoznati čimbenici okoliša ili međuigra između okolišnih čimbenika i genetske predispozicije. Rs1569686 je da je to povezano s osjetljivošću raka pluća [31] i želučani rak [21], ali ne i hepatocelularni karcinom [19], rak ezofagusa [32] i nazofaringealni karcinom [20]. U jednom od prethodnih meta-analize na temelju 24 case-control studija, DNMT3b pregled rs1569686 G alela je identificiran kao niske faktor rizika za razvoj raka debelog crijeva [33]. Rs1569686 se nalazi u CpG loša promotorske regije. U testu promotora vitro su pokazala da rs1569686 polimorfizam ne utječe na transkripcijsku aktivnost DNMT pregled promotor [34], no točan mehanizam u velikoj mjeri nepoznanica. Studija Lee et al [35] pokazalo je da je rs6087990 u promotorske regije DNMT3b pregled, što je u potpunoj LD s rs1569686, može modificirati aktivnost promotora DNMT3b Dva ograničenja treba uzeti u obzir u našem istraživanju. Jedan je bio da samo SNP s minimalnim manje alela 0,10 ili veći uključeni su zbog kriterija odabira. Niske varijacije frekvencija mogu također u korelaciji s razvojem raka, kao što su rs2424913 [22]. Daljnje istraživanje pokriva SNP-ova s niske frekvencije je potrebno. Drugi je da je follow-up vrijeme za slučajeva raka želuca čini nedovoljno jer se većina slučajeva na desnoj strani parcele preživljavanja cenzurirani. Utjecaji SNP na dugoročni opstanak ne može biti u potpunosti riješiti, iako trend može se promatrati. Međutim, kada su predmeti podijeljeni u podskupine živi dulje od dvije godine, može se uočiti značajna povezanost na dugoročnu prognozu. Ipak, uloga DNMT3b pregled na rak želuca, bit će revalorizirana i ažurirati u budućnosti kao follow-up je još u tijeku. Pregled Zaključci pregled Ukratko, nalazimo polimorfizama DNMT3b pregled može utjecati na ukupno preživljenje od raka želuca, što upućuje na potencijal DNMT3b pregled SNP kao koristan marker predviđanja ukupno preživljenje od raka želuca, osobito u bolesnika koji su preživjeli dulje od dvije godine. Međutim, nismo promatrati bilo značajne povezanosti između DNMT3b pregled varijanti i rizika od raka želuca i želučanog atrofije. Daljnja istraživanja potrebna su kako bi u potpunosti razjasniti ulogu DNMT3b pregled na rak želuca u različitim etničkim populacijama. Pregled popratne podatke priznanja Autori zahvaljujem svima koji sudjeluju u ovom istraživanju, posebno Ying Song za svoj rad na praćenju tema i Chang-Song Guo za njegovu tehničku podršku. pregled
gena može utjecati na DNMT3b pregled aktivnosti i povezana je s rizikom od nastanka karcinoma. Cilj ovog rada bio je ispitati povezanost polimorfizama (SNP-ova) od DNMT3b pregled gena i sklonost i prognoza raka želuca. Pregled
gena genotipizirane pomoću TaqMan analize. DNMT3b izraz je ocijenjena u 104 tkiva raka metodom imunohistokemijske. Pregled
. pylori infekcija pregled i razvoj raka želuca, zatim [6]. Pregled
Udruga SNP s kliničko parametrima želučanog karcinoma Netlogu
genotipova na preživljavanje karcinoma želuca pomoću dominantan ili recesivan model. Otkrili smo da rs1569686 TG /GG varijanta genotip bio povezan sa statistički značajnim 43% povećan rizik od smrti u usporedbi s TT genotip u dominantnom modelu. Osim toga, tendencija učinaka na dugoročni opstanak može se promatrati iz parcela preživljavanja. Dakle, podgrupa analize su izvedene u bolesnika koji žive dulje od dvije godine. Pacijenti koji nose G alela (TG ili GG genotipa) od 1569686 je utvrđeno da žive kraće nego one od TT genotip (HR = 2,46, 95% CI: 1.29-4.69, P pregled = 0,006), nakon prilagodbe za dob, spol, TNM stadij i kemoterapija nakon tumorectomy (Slika 1A). Slični rezultati opaženi su za G alel prijenosnika rs4911107 i T alela nosače rs4911259 u ukupnom preživljavanje raka želuca (Tablica 3). A oni koji nosi GG genotipa rs8118663 obično imaju kraće vrijeme preživljenja od alela nosačima (AA ili AG) nakon prilagodbe za dob, spol, TNM stadiju i kemoterapije nakon tumorectomy (HR = 2,72, 95% CI: 1.45-5.12, p pregled = 0,002) (slika 1B). pregled
polimorfizmi utječu na dugoročno preživljavanje od raka želuca i učinak je bio još jači kod pacijenata koji žive dulje od dvije godine. Pregled
polimorfizma i preživljavanje raka želuca u kineskoj populaciji. Naše je istraživanje pokazalo je da DNMT3b pregled varijante pridonijela dugoročnom preživljavanju raka želuca. DNMT3b pregled rs1569686 varijanta TG ili GG genotipa nositelji su pokazali povećan HR s P pregled-vrijednost od 0,036 (HR = 1,43, 95CI: 1,02-1,99), u usporedbi s TT divljeg tipa. Osim toga, pojedinac nosi G alela od rs1569686 (TG ili GG) imaju 2,46 puta povećanje rizika smrtnosti od ne G alela prijevoznika u bolesnika koji žive duže od 2 godine (Slika 1a), a pojedinci nose rs8118663 GG genotipa imaju tendenciju da imaju veći rizik u dugoročni opstanak (Slika 1B). pregled
polimorfizama i kliničke karakteristike pacijenata s rakom želuca. Pacijenti koji nose rs6119954 AA genotip imao više frekvencije udaljenim metastazama, što sugerira da rs6119954 polimorfizam može biti uključen u progresiji karcinoma želuca. Slično tome, bolesnici s rs8118663 AA genotipa obično imaju veću veličinu tumora (≥5cm), što upućuje da rs8118663 SNP mogu igrati ulogu u napredovanju tumora GC pacijenata. Uzeti zajedno, svi ti rezultati pokazali prediktivni vrijednost DNMT3b
polimorfizama za napredovanje i opstanak prognozu u bolesnika s karcinomom želuca. Pregled
, transkripcije aktivnost T alela bila je značajno niža u odnosu na C alel, no polimorfizam rs1569686 ne utječe na aktivnost promotora. U našoj studiji, međutim, nismo promatrati bilo povezanost rs1569686 s razvojem raka želuca ili želuca atrofije, što je važan čimbenik rizika za rak želuca (tablica 2). Također, nismo promatrati bilo razlike DNMT3b izražavanja unutar genotipova svaki SNP koriste metodu imunohistokemija. Osnovni mehanizam DNMT3b pregled na rak želuca treba razjasniti u budućim istraživanjima. Druga mjesta, rs2424908, što je u potpunoj spojnici neravnoteže s rs8118663 ( r pregled 2 = 0,956), također je utvrđeno da se uključe u tumoru, kao što je jednjak raka [32] i rak debelog crijeva [ ,,,0],34]. Međutim, u našem istraživanju, može se uočiti nikakva pozitivna povezanost s rakom želuca. Slično našem nalazu, izvijestio je Yang i suradnici koji DNMT3b pregled rs2424908 polimorfizmi nisu bili povezani s osjetljivošću na karcinoma želuca u južnom kineskom stanovništva [36]. Dakle, više studija može biti potrebno zaključiti uloge genetskog polimorfizma DNMT3b pregled u razvoju raka želuca. Pregled
S1 tablicu. Koeficijenti Povezanost neravnoteže ( D pregled ') i r pregled 2 između DNMT3b pregled htSNPs pregled doi:. 10,1371 /journal.pone.0134059.s001
(docx) pregled S2 stol. Klinički podaci pacijenata s rakom želuca pregled doi:. 10,1371 /journal.pone.0134059.s002 pregled (docx) pregled S3 stol. Udruga SNP i H pregled pylori pregled infekcije u kontrolnoj skupini pregled doi:.. 10,1371 /journal.pone.0134059.s003 pregled (docx) pregled S4 Tablica , Raspodjela genotipova prema kliničkih parametara slučajeva raka želuca pregled doi:. 10,1371 /journal.pone.0134059.s004 pregled (docx) pregled S1 Potpora podataka. Klinički podaci i genotipske frekvencije polimorfizama gena DNMT3b u slučajevima i kontrola
DOI: 10.1371. /Journal.pone.0134059.s005
(XLS)
Modulacija mikrobiote i ponovno uspostavljanje eubioze mogli bi pomoći u suzbijanju komplikacija COVID-19
Nove interakcije domaćin-virus-mikrobiom tijekom COVID-19 mogu odrediti ishod
Mikrobi na jeziku mogli bi se koristiti za dijagnosticiranje raka gušterače
Istaknuti i ključni zaključci s Bostonskog bakterijskog sastanka (BBM) 2019.
Zemlje sa starijom populacijom imaju veće infekcije i smrtnost od SARS-CoV-2,
Rizik od raka jednjaka mogao bi se smanjiti esomeprazolom i niskim dozama aspirina
Migracije utječu na crijevnu mikrobiotu, što opet utječe na zdravlje istraživača
Ljudska crijeva sadrže trilijune korisnih i prijateljskih bakterija koje čine mikrobiom. Utvrđeno je da ti mikrobi imaju veliki utjecaj na ljudska stanja, uključujući opće zdravlje na mentalno zdravlj
Znanstvenici dokazuju ulogu mikrobioma u pretilosti
Novo istraživanje koje je predstavio dr. Christoph Thaiss u svom nagrađivanom eseju za knjigu “ Znanost i nagrada SciLifeLab za mlade znanstvenike ”opisuje nekoliko bakterijskih metabolita u ljudski
Novi super aktivirajući receptor makrofaga mogao bi objasniti hiperinflamaciju u teškom obliku COVID-19
Imunitet je zanimljiva stvar. Iako je bitan u zaštiti tijela od invazije patogena i stranih antigena, također se može okrenuti protiv tijela i pokrenuti destruktivne imunološke procese. Nova studija o