Абстрактный
Фон
фактор транскрипции миелина 1 (MYT1) и его гомолога MYT1-типа (MYT1L) являются два главных члена MYT /NZF семьи факторов транскрипции, которые высоко связаны между собой, имеют высокую степень идентичности и показывают аналогичные регуляторные функции в развитии нервной системы. Есть свидетельства из нескольких экспериментов цитологических, показывающие, что MYT1 связано с раком.
Выводы /Значение
<р> В заключение, эти данные представляют первое доказательство того, что MYT1L rs17039396 варианты могли бы идентифицировал как благоприятный прогностический индикатор для рака желудка, особенно среди кардиального рака желудка. Дальнейшая проверка в других крупных исследованиях с различными этнических групп и функциональных оценок необходимы
<р> Образец цитирования:. Чжан Y, Чжу H, Чжан X, D Гу, Чжоу X, Ван М., и др. (2013) Клиническое значение MYT1L Генные полиморфизмы в китайских пациентов с раком желудка. PLoS ONE 8 (8): e71979. DOI: 10.1371 /journal.pone.0071979
<р> Редактор: Хирому Suzuki, Саппоро медицинский университет, Япония
<р> Поступило: 10 марта 2013 года; Принято: 6 июля 2013 года; Опубликовано: 28 августа 2013
<р> Copyright: © 2013 Чжан и др. Это статья с открытым доступом распространяется в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution, которая позволяет неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе, при условии, что оригинальный автор и источник кредитуются
Финансирование:. Это исследование была частично поддержана Национальным фондом естественных наук Китая (81230068, 81000880, 81071641, 81202268, 81201570 и 81102089), фонд естественных наук провинции Цзянсу (BK2011773, BK2011775 и BK2011194), программы фундаментальных исследований Цзянсу провинциального департамента образования (11KJB330002 и 12KJA330002), Цзянсу провинциальной Выпускники инновационный проект (CXZZ12_0594), Программа Цзянсу провинциальной 12-й пятилетний на развитие здоровья по технологиям и образованию проекта, Цин Лан проекта Цзянсу провинциального департамента образования и приоритет Academic программы развития Jiangsu Высшие учебные заведения (общественного здравоохранения и профилактической медицины). Доноры не играет никакой роли в дизайн исследования, сбора и анализа данных, решение о публикации или подготовки рукописи
<р> Конкурирующие интересы:.. Авторы заявили, что не существует никаких конкурирующих интересов
Введение материалы и методы Исследуемая популяция Результаты Связь между клинико-патологическими переменных и общей выживаемости Далее многослойный анализ и ступенчато Кокса модель регрессии для выживания среди кардиального рака Обсуждение Некоторые ограничения данного исследования следует обратить внимание. Во-первых, только один SNP в MYT1L оценивается, и вполне возможно, что некоторые другие важные ОНП пренебрегают или наблюдаемые ассоциации могут быть связаны с другими полиморфизмов в неравновесном сцеплении с rs17039396 полиморфизма. Во-вторых, Helicobacter Pylori, как известный решающим фактором в желудочном канцерогенезе, не рассматривалась в связи с отсутствием соответствующей последующей информации. И, наконец, для проверки соотношения генотип-фенотип, дальнейшее расследование ведется с целью выяснения связи между rs17039396 полиморфизм и уровни экспрессии белка MYT1L в желудочном раковых тканях и будет сообщено отдельно.
<р> рак желудка (GC) представляет четвертый наиболее распространенной формой рака и второй ведущей причиной развития рака, связанных с смертности во всем мире [1]. Самые высокие показатели заболеваемости и смертности наблюдаются в Восточной Азии, преимущественно в Китае [1]. Замечательные улучшения были сделаны на сегодняшний день в комплексных стратегий лечения комбинированной хирургии, химиотерапии, лучевой терапии, и целенаправленной терапии, но у пациентов GC-прежнему имеют плохой прогноз, с 5-летней общей выживаемости на 30% [2]. Хотя классификация TNM была широко считается наилучшей имеющейся клинической мерой агрессии опухоли и прогноза, очевидные различия выхода даже среди пациентов в той же стадии [3]. Кроме того, многочисленные генетические и эпигенетические изменения вовлечены в многоступенчатом процессе онкогенеза желудка человека и развития [4]. Таким образом, обнаружение легко доступных молекулярных маркеров и их применение в объединена с традиционной диагностики рака, постановка и прогноз может в значительной степени быть полезны для улучшения ранней диагностики, скрининга лиц с высоким уровнем риска, а также уход за пациентами [5] , В последние годы увеличилось исследования были сосредоточены на выявлении генетических вариантов, которые могли бы играть роль в развитии и прогрессировании рака желудка [6].
<Р> цинковый палец (ZnF) семейство генов представляют собой одну из самых больших семейств генов , что составляет около 3% генов генома человека [7], и выполняют важные функции в разнообразных событиях в области развития и клеточных процессов, таких как контроль клеточной пролиферации, дифференцировки, развития и смерти [8]. Миелин фактор транскрипции 1 (MYT1 или нейронная цинковый палец 2 (NZF2)) и его гомолог MYT1 типа (MYT1L или NZF1) являются двумя основными членами MYT /NZF факторов семьи транскрипции, каждый из которых содержит шесть копий ZNF с <суб> 2HC консенсусной последовательности C. Они очень связаны между собой и обладают высокой степенью идентичности (91% для пальца регионов и 62% на уровне белка) [9], [10]. Кроме того, оба белка набирать одни и те же гистондезацетилазы регулировать нейронную транскрипцию через их взаимодействие с sin3b [11], указывая на аналогичные регулирующие функции в нейрогенеза. Для того чтобы выяснить молекулярные механизмы радиоиммунотерапия о лечении рака желудка клеток, экспрессирующих d9-Е-кадгерина с 213Bi-d9MAb, Зайдль и др. [12] количественно 380 экспрессию гена 213Bi обработанных опухолевых клеток и обнаружили, что 213Bi-индуцированной гибели клеток была инициирована G2 ареста и повышающей регуляции нескольких генов, в том числе MYT1. Кроме того, исследование показало, что цитологическое исследование с-Jun N-концевой киназы -опосредованной фосфорилирования MYT1, сопровождая MYT1 оверэкспрессии, сыграли важную роль в UVA-индуцированного апоптоза и подавления кожи канцерогенеза [13]. Хотя сам MYT1L не ранее сообщалось, связанный с раком, весьма гомологичны MYT1 [9], [10] и потеря MYT1 функции могут быть компенсированы MYT1L активностью [14]. Таким образом, мы предполагаем, что ген MYT1L может быть также связано с раком желудка. Ян и др. проанализировали 444,044 зародышевых генетических одиночных нуклеотидных полиморфизмов (SNP) в этнически разнообразной группе 2534 детей с острым лимфобластным лейкозом и при условии значительные доказательства того, что локус в 2p25.3 (rs17039396) в гене MYT1L проявляет самую сильную ассоциацию с рецидивом заболевания [15] , Поэтому мы проводим это исследование с целью изучения, имеет ли MYT1L rs17039396 полиморфизм потенциальное значение в качестве молекулярных прогностических маркеров для рака желудка, которые помогут в дальнейшем определить подгруппы населения, которые подвергаются более высокому риску плохого заболевания и, следовательно, требуют более агрессивного лечения и более строгий послеоперационном вверх.
<р> Все исследование было одобрено Институциональным наблюдательным советом Нанкин медицинского университета (Нанкин, Китай), и каждый из пациентов подписали информированное согласие на использование клинических образцов для анализа полиморфизма генов. В этом ретроспективном исследовании 944 пациентов с гистологически подтвердили рак желудка, который получил хирургическую резекцию в период с января 1999 по декабрь 2006 года были набраны из Исин Народной больницы (Исин, провинция Цзянсу, Китай). Никто не получавших ранее лучевой терапии или химиотерапии до операции и не все из них получили адъювантной химиотерапии. 944 фиксированных формалином и Parrffin встраиваемый образцы были получены из отдела патологии этой больницы. Конечная точка была общая выживаемость (OS), которая была рассчитана с момента операции до смерти или последнего наблюдения в датах смерти марта 2009 года были подтверждены обзор свидетельства о смерти стационарных и амбулаторных медицинских записей или получены с помощью последующих мер телефонные звонки. Пациенты еще живы были подвергнуты цензуре. Максимальное время выживаемости составила 119,0 месяцев, а медиана выживаемости составила 70,0 месяцев. Демографические особенности и клинико-патологические переменные были обобщены в таблице 1, которые были получены из медицинских записей пациентов. Классификация TNM стадия была оценена в соответствии с критериями 7-го издания американского Объединенного комитета по вопросам рака (AJCC).
генотипирование
<р> геномную ДНК экстрагировали из парафин несущей опухоль ткани с использованием протеиназы К пищеварение, с последующей экстракцией изопропанолом и осаждением этанолом. Генотипирование образцов проводили мультиплексной технологии создания моментальных снимков с использованием ABI флуоресценции на основе метода различения анализа аллельного (Applied Biosystems, Foster городе, CA, США), которое было подробно описано в предыдущем исследовании [16]. Праймеры были разработаны, чтобы прокалить в непосредственной близости от нуклеотида в месте мутации: вперед, 5'- ТАТ TAG TCT GAR TCT GCT GGC CTT TG-3 '; реверс, 5'- GAC TTC ACC TCC ACC ACC AGG A-3 '. Праймеры для расширения были следующими: 5'-ТТТ ССТ ОАС ОАС ГГА ССА GAT TT-3 '. В SNAPSHOT продукты анализировали с использованием ABI 3130 генетического анализатора (Applied Biosystems) и генотипы были определены GeneMapper анализ программного обеспечения версии 4 (Applied Biosystems). анализ генотипа проводился двумя исследователями, ослепленных до конца выживание очков. Генотипирование было подтверждено секвенированием случайно выбранных 10% образцов, и результаты были 100% согласные. Тем не менее, 35 случаев потерпел неудачу в генотипирования из-за плохого качества ДНК, которые были исключены в дальнейшем анализе. И, наконец, 909 больных раком желудка были включены в анализ.
Статистический анализ
<р> Статистический анализ проводили с использованием SPSS версии 16.0 для Windows (SPSS Inc., Чикаго, Иллинойс, США). Кривые выживаемости Kaplan-Meier и тест журнала ранга были использованы для анализа выживаемости. Одномерные или многомерный Кокс модели пропорциональных рисков была принята для оценки соотношения сырой опасности (ч), скорректированная подголовников и их 95% доверительный интервал (ДИ), с поправкой на вмешивающиеся факторы. Кроме того, Cox ступенчато регрессионный анализ для оценки независимых воздействий SNP или клинико-патологическими особенностями на общую выживаемость после корректировки на других ковариатами, с уровнем значимости P
&л; 0,05 для ввода и P
> 0,10 для удаления соответствующих объясняющих переменных. Харди-Вайнберга аллелей в отдельных локусов оценивали с помощью х 2 тест доброкачественность-оф-приступе. Все тесты были двусторонними и P
&л;. 0,05 считалось статистически значимым
<р> Окончательный население этого исследования состояла из 909 пациентов. Пациенты характеристики и клинические данные приведены в таблице 1. В период последующего наблюдения 119 месяцев, умер 421 пациентов. Существовали 699 мужчин (76,9%) и 210 женщин (23,1%), со средним возрастом 62 лет в пределах от 28 до 83 лет. Клинико-патологические характеристики, включая размер опухоли, гистологических типов, дифференциация, глубина вторжения, метастазов в лимфатических узлах, отдаленных метастазов и TNM стадии были связаны со временем выживаемости (лог-ранговый P
&л; 0,05). В частности, у пациентов с размером опухоли &GТ; 5 см (MST, 48 месяцев) было 43% значительно более высокий риск смерти (HR = 1,43, 95% ДИ = 1.18-1.73), по сравнению с теми, с размером опухоли ≤5 см (MST , 74 месяцев), а также диффузного типа больных раком желудка (MST, 50 месяцев) было 45% значительно более высокий риск смерти (HR = 1,45, 95% ДИ = 1.19-1.773), чем у пациентов кишечного типа (MST , 77 месяцев). Кроме того, как глубина инвазии и TNM стадии увеличивается, риск смерти от рака желудка показали значительное увеличение таким образом, доза-реакция (лог-ранговый P
&л; 0,001)
<. h3> ассоциации MYT1L rs17039396 с клиническими результатами ГК
<р> Среди 944 образцов пациентов ГК, MYT1L rs17039396 успешно генотипированы в 909 образцах. Частота каждого генотипа была 57,0% (518 экземпляров) для варианта GG, 37,8% (344 экз) для варианта GA, и 5,2% (47 образцов) для варианта АА. Генотип частоты MYT1L rs17039396 в случаях с последующим HWE ( P
= 0,21). Анализ выживаемости Каплана-Мейера и модели пропорционального риска Кокса использовали для оценки прогностического эффекта MYT1L rs17039396 на пациентах GC в различных генетических моделей (таблица 2). Не было обнаружено значимых ассоциаций между MYT1L rs17039396 генотипов и OS пациентов GC в любых генетических моделей. Далее мы оценили ассоциации многослойным анализа локализации опухоли и гистологических типов. В общей модели, MYT1L rs17039396 полиморфизм был связан с выживанием рака кардии (лог-ранговый P
= 0,015, рис. 1). Время выживания пациентов с генотипом GA (MST 98 месяцев) существенно отличалась по сравнению с пациентами с GG генотипом (MST 47 месяцев), который имел 44% более высокий риск смерти (HR = 0,56, 95% ДИ = 0,39 -0,81). В доминирующей модели, значительно более низким риском смерти (HR = 0,57, 95% ДИ = 0.40-0.81) был найден (лог-ранговый P
= 0,001), как показано на рис. 2.
<р> Вклад MYT1L rs17039396 аллель к повышению выживаемости кардии больных раком желудка были дополнительно оценены многослойным анализа размер опухоли, гистологические типы, степень дифференциации, глубина инвазии, узел метастаз лимфатический, отдаленные метастазы и TNM стадии. В результате, в стратифицированной анализа среди кардиального рака желудка, мы обнаружили, что этот эффект защиты был более заметным среди подгрупп пациентов с размером опухоли ≤5 см (скорректированный HR = 0,34, 95% ДИ = 0.19-0.64), хорошо умеренная рак желудка (скорректированный HR = 0,59, 95% ДИ = 0.35-0.98), отсутствие лимфатических узлов метастазы (скорректированный HR = 0,49, 95% ДИ = 0.31-0.76), без отдаленных метастазов (скорректированный HR = 0,59, 95% ДИ = 0.41-0.84) (Таблица 3). Кокс пошаговый регрессионный анализ был проведен для оценки независимого влияния клинико-патологическими переменных и rs17039396 SNP на OS пациентов с кардиального раком желудка. Как показано в таблице 4, две переменные (этап TNM и MYT1L rs17039396) были включены в регрессионной модели путем ступенчатого выбора ковариант- переменных и rs17039396 SNP было показано, чтобы быть независимым защитным фактором для рака кардии с 44% снижением риска (HR = 0,56, 95% ДИ = 0.39-0.79, P
= 0,001).
<р> В настоящем исследовании мы изучали эффект MYT1L rs17039396 SNP на прогрессирование и выживание GC. Наши результаты показали, что гетерозиготы генотип (ГА) имели значительно более высокий уровень выживаемости по сравнению с гомозиготном генотипе (GG), а ассоциация также наблюдалась при анализе доминирующей модели (GA /AA против
GG), предполагая, что MYT1L rs17039396 аллель может быть связано с выживанием GC.
<р> В наших результатах, MYT1L rs17039396 была достоверно коррелирует с улучшением выживаемости кардии карциномы, но не некардиальных отделов рака желудка. Существует в последнее время все больше доказательств того, что тип кардиального рака желудка имеет характеристики, отличные от типа некардиальных отделов с точки зрения этиологии, патологии, канцерогенеза, биологическое поведение, прогноз и даже генетического фона. Например, Камангар et.al сообщил, что инфекции H.pylori был сильным фактором риска для не-кардии рака желудка, но было обратно пропорционально связано с риском развития рака желудка кардии [17]. По сравнению с не-кардии рака желудка, рак желудка кардии ассоциируется с симптомами рефлюкса, преобладанием в белых мужчин и с большей частотой опухолей дифференцируются типа [18]. Кроме того, большая тенденция к низкодифференцированная гистологии, узел метастаза лимфатический, продвинутой стадии патологический TNM и плохим прогнозом были описаны как характеристики кардиального карциномы [19]. Поэтому целесообразно рассмотреть вопрос о кардии карциному в качестве конкретной категории GC. Можно сказать, что беспорядочный сочетание двух подтипов GC может маскировать или производить недооценке силы подлинных ассоциаций. В стратифицированных анализах, когда приуроченных к пациентам с некоторыми специальными клинико-патологическими особенностями, такими как размер опухоли ≤5 см, хорошо умеренной рака желудка, нет лимфатических узлов, метастазов нет отдаленных метастазов, время выживания для субъектов, несущих GA или генотипов AA больше, чем для GG генотипов, что свидетельствует о том, что упомянутые выше прогностические факторы могут иметь комбинированный эффект с rs17039396 на превосходной ОС кардиального рака желудка
<р> ген MYT1L (MIM: 613084). карты с хромосома 2p25.3 с 542161 п.н., содержащей двадцать пять экзонов (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/GENE/). Экзон 1 до экзона 5 и дистальной части экзона 25 являются нетранслируемые области, в то время как остальные 19 экзонов и проксимальная часть экзона 25 являются кодирующих областей. Wang и др. [20] было установлено, что rs3748989 в экзоне 9 гена MYT1L присвоил предрасположенность к большим депрессивным расстройством. Контролируемое исследование с относительно большим размером выборки показал, что rs17039584 расположен вблизи 5 'нетранслируемые области и rs10190125 в интроне 1 гена MYT1L были значительно связаны с шизофренией [21]. Наше исследование показало значительную корреляцию rs17039396, расположенного по адресу интрона 3 с кардиального раком желудка. Хотя роль этих полиморфизмов в экспрессии генов MYT1L и их точных функциональных и биологических значимостей были в значительной степени неизвестны, то нетрудно предположить, что антонимичных мутации, происходящие в экзонов в кодирующих областях могут привести к заменам аминных кислот, изменяют структуру кодирования -белками, и впоследствии влияют на их биологические функции. Принимая во внимание, каков механизм действия интронных полиморфных вариантов? Он все больше и больше становится очевидным, что интронные вариации зародышевые может включать в себя изменения генной регуляции и обработки транскрипта, или производят варианты сплайсинга [22] - [24]. В последнее время T к G изменяется при 309 й нуклеотид в первом интроне гена MDM2 (SNP309) было найдено и показано увеличение сродства активатора транскрипции Sp1, что приводит к более высокому уровню MDM2 РНК и белка и последующее ослабление р53 пути [25]. Впоследствии исследование случай-контроль, включая 438 управления и 410 пациентов со спорадическим раком желудка при условии доказательств, подтверждающих ассоциацию MDM2 SNP309 как с повышенной восприимчивости к желудочной карциномы и неблагоприятным прогнозом [26]. Кроме того, Narla и др. [27] сообщили, что относительно распространенным интронного полиморфизм гена KLF6 повышает альтернативный сплайсинг и ассоциируется с повышенным риском развития рака простаты. С учетом упомянутых выше доказательства, разумно предположить, что MYT1L интронные полиморфизмы могли бы оказывать свои функции с помощью альтернативных экспрессии генов или сплайс-варианты, которые позволяют генерировать изоформы белка, имеющих различные функции биологии. Насколько нам известно, не было никаких опубликованных попыток охарактеризовать функциональные последствия полиморфизма MYT1L интронов. Следовательно, четкие молекулярные механизмы, с помощью которых генетические варианты оказывают их биологические Последствия требует дальнейшего экспериментального исследования.
<Р> Белок MYT1L играет решающую роль в развитии центральной нервной системы, поэтому разумно предположить, что изменения в его уровня экспрессии или функции в результате генетических изменений может привести к психических расстройств [20] - [21]. Тем не менее, как именно этот белок влияет на восприимчивость, прогрессирование или прогноз опухоли далеко не ясно. Белок MYT1L является членом миелин фактора транскрипции 1 семейства, который модулирует пролиферацию и дифференцировку олигодендроцитов путем контроля транскрипционной активности генов, участвующих вниз по течению в спецификации клонов [28]. Кроме того, Райли и др. [29] выдвинул гипотезу, что MYT1L регулирует экспрессию гена ZNF804A у больных шизофренией. На основании этих доказательств, мы предположили, что генетическое изменение в гене MYT1L может влияет на его функцию, чтобы регулировать уровни экспрессии наборов генов опухолей, связанных с, и, следовательно, включает в канцерогенезе. Другим правдоподобным объяснением его ассоциации с раком желудка заключается в контроле прогрессии клеточного цикла. за исключением транскрипционной активности, MYT1 также функционирует в качестве киназы клеточного цикла регулируется. Dai и др. [30] показали, что регуляция Myt1 и Wee1 индуцирует фосфорилирование Cdc2, ведущего к G2 M ареста в нормальной клеточной линии /. Белка-супрессора опухоли р53 играет решающую роль в онкогенеза и предотвращает пролиферацию раковых клеток, склонных главным образом, контролируя ход клеточного цикла и апоптоза. Пассер и др. [31] установлено, что до регулируемой экспрессии TSAP6, транскрипционно активируется р53, может увеличить MYT1 активность, что приводит к задержке клеточного цикла и подавления роста раковых клеток, подверженных. Кроме того, более недавнее исследование исследования функции MYT1 в контрольной точки восстановления с последующим повреждением ДНК показал, что подавление MYT1 потенциируется с повреждением ДНК для ингибирования роста опухолевых клеток в моделях опухолей ксенотрансплантата мышей, вовлекая MYT1 в качестве потенциальной мишени для противораковых терапии [ ,,,0],32]. Эти данные подчеркивают вклад белка MYT1 в регуляции клеточного цикла и вовлекают его в качестве потенциальной мишенью для анти-терапии рака. Хотя MYT1L уже быть не сообщается функционировать для модулирования прогрессии клеточного цикла, весьма гомологичны MYT1 [9] - [10] и потеря функции MYT1 может быть компенсировано MYT1L активностью [14]. Так что вполне вероятно, что MYT1L белок может иметь такую же роль в регуляции процесса клеточного цикла и их изменения, вытекающие из генетической изменчивости могут быть вовлечены в процесс tumorgentic. Взятые вместе, представленные результаты потенциального участия гена MYT1L в побуждает нас ингибирование роста опухоли для дальнейшего охарактеризовать его структуру, биологическую функцию, а также взаимодействие с другими партнерами по исследованиям в пробирке или естественных условиях.
<Р> В conclution, наши результаты представляют собой первая демонстрация того, что MYT1L rs17039396 SNP может быть связан с прогнозом больных раком кардии. Выживаемость больных в доминантной модели была значительно лучше, чем выживание в общей модели, предполагая, что мутантный аллель может служить подходящим маркером для прогнозирования выживаемости больных раком кардии, особенно в китайской популяции. Следовательно, тестирование на MYT1L rs17039396 SNP, в сочетании с другими традиционными прогностическими факторами могут существенно помочь отличить подгруппу пациентов с плохим прогнозом, тем самым помогая совершенствовать терапевтические решения в лечении рака желудка.
Выражение признательности
<р> Мы благодарим доктора Da Дин и г-жу Янь Лю Genesky Biotech (Шанхай, Китай) за отличную техническую помощь.
Сырой корм для домашних животных представляет опасность для людей и животных
Многопрофильный подход к разработке лекарств против COVID-19
Генетический риск аутоиммунитета может быть связан с различиями в микробиоме кишечника.
Грибы и бактерии в кишечнике могут в равной степени влиять на здоровье человека и тяжесть заболевания.
Алкоголь повреждает микробиом во рту
Микробиомы кишечника и полости рта предсказывают тяжесть COVID-19
COVID-19:как выглядит болезнь
Поскольку все больше информации о болезни COVID-19 собирается из первых рук, появляется более точная картина клинических особенностей. Как проявляется COVID-19 Итак, как это начинается? Государств
Длительное использование антибиотиков недоношенными способствует развитию лекарственно-устойчивых кишечных бактерий.
Очень недоношенные дети часто болеют и нуждаются в лечении антибиотиками, чтобы спасти свою жизнь. Тем не мение, когда эта форма терапии длится 20 месяцев и более, он может влиять на микробиом кишечни
Исследование предполагает связь между употреблением пробиотиков и «затуманенностью мозга».
Исследование, проведенное в Медицинском колледже Джорджии при Университете Августа, показало, что прием пробиотиков может привести к значительному накоплению бактерий в тонком кишечнике, что приводит