PLoS ONE: fattori di suscettibilità genetica su geni coinvolti nella biosintesi di steroidi Hormone Pathway e progesterone recettore per il cancro gastrico rischio

Astratto

Sfondo

L'obiettivo dello studio è stato quello di indagare il ruolo dei geni ( HSD3B1
, CYP17A1
, CYP19A1
, HSD17B2
, HSD17B1
) coinvolti nel percorso ormone biosintesi e progesterone recettore steroideo ( PGR
) nell'eziologia del cancro gastrico in una base di popolazione studio di associazione genetica in due fasi.

Metodi

nella fase di scoperta, 108 SNPs candidati nei geni ormone steroide biosintesi percorso relativi e PGR
sono stati analizzati in 76 cancro gastrico casi e 322 controlli nel coreano Multi-center Cancer coorte. Statisticamente SNP significativi individuati nella fase di scoperta sono stati nuovamente valutati in una serie di 386 casi e 348 controlli estesi. Pooled- e meta-analisi sono state condotte per riassumere i risultati.

Risultati

dei 108 SNPs in steroide ormone biosintesi geni legati pathway e PGR
analizzato in fase istruttoria , 23 SNPs in PGR
nel modello recessivo e 10 SNPs in CYP19A1
nei modelli recessiva o additivi sono risultati significativamente associati ad un aumentato rischio di cancro gastrico ( p
< 0.05). Le frequenze alleliche minori degli SNP sia nella fase di discovery e di estensione non erano statisticamente differenti. Pooled- e meta-analisi ha mostrato CYP19A1
rs1004982, rs16964228 e rs1902580 ha avuto un aumento del rischio di cancro gastrico (pooled OR [95% CI] = 1,22 [1,01-1,48], 1.31 [1,03-1,66], 3.03 [1,12-8,18], rispettivamente). Al contrario, tutti i PGR
SNP non erano statisticamente significativamente associati al rischio di cancro gastrico.

Conclusioni

I nostri risultati suggeriscono CYP19A1
che i codici dell'aromatasi
possono svolgere un ruolo importante nella associazione del rischio di cancro gastrico ed essere un marcatore genetico per il cancro gastrico predisposizione

Visto:. Cho LY, Yang JJ, Ko KP, Ma SH, Shin a, Choi BY, et al. (2012) fattori di suscettibilità genetica su geni coinvolti nella biosintesi di steroidi Hormone Pathway e progesterone recettore per il cancro gastrico rischio. PLoS ONE 7 (10): e47603. doi: 10.1371 /journal.pone.0047603

Editor: Michael Scheurer, Baylor College of Medicine, Stati Uniti d'America

Ricevuto: 29 aprile 2012; Accettato: 12 settembre 2012; Pubblicato: 23 Ottobre, 2012

Copyright: © Cho et al. Questo è un articolo ad accesso libero distribuito sotto i termini della Creative Commons Attribution License, che permette l'uso senza restrizioni, la distribuzione e la riproduzione con qualsiasi mezzo, a condizione che l'autore originale e la fonte sono accreditati

Finanziamento:. Questo studio è stata sostenuta da una sovvenzione (1) il nazionali di R & D Programma per il controllo del cancro, Ministero della Salute & Welfare, Repubblica di Corea (0520140); (2) Il programma di ricerca di scienza di base attraverso il National Research Foundation della Corea finanziato dal Ministero dell'Istruzione, della Scienza e della Tecnologia [NRF-2009-353-0066258]; e (3) il programma di Laboratorio di Ricerca di Base (BRL) attraverso il National Research Foundation della Corea finanziato dal Ministero dell'Istruzione, della Scienza e della Tecnologia [2.011-0.001.564]. I finanziatori avevano alcun ruolo nel disegno dello studio, la raccolta e l'analisi dei dati, la decisione di pubblicare, o preparazione del manoscritto

Competere interessi:.. Gli autori hanno dichiarato che non esistono interessi in competizione

Introduzione

mortalità per cancro gastrico è la seconda più grande al mondo [1]. Gastrico incidenza del cancro è di circa due volte maggiore tra gli uomini rispetto alle donne in molte regioni del mondo [2], e il rapporto diventa più piccolo, dopo 60 anni di età, quando la maggior parte delle donne raggiungono la menopausa. Gastrico incidenza del cancro negli uomini è più del doppio rispetto alle donne nella popolazione coreana (62,2 vs.
24,6 ogni 100.000 persone) [3]. Questa coerenza globale di un elevato rapporto maschi l'incidenza femminile nel cancro gastrico può essere dovuto a una differenza ormonale tra uomini e donne. Quindi, è stato ipotizzato che gli ormoni steroidei sessuali femminili, gli estrogeni e progesterone, possono svolgere un ruolo protettivo nei gastrica incidenza del cancro.

Anche se in contrasto, gli studi epidemiologici supportano questa ipotesi. Molti studi epidemiologici hanno riportato una diminuzione del rischio di cancro gastrico con una maggiore esposizione in vita agli estrogeni endogeni [4] - [11], mentre alcuni studi hanno mostrato alcuna associazione [12] - [16]. Animali e in vitro
studi supportano questa ipotesi. ratti femmine e castrati avevano una minore incidenza di cancro gastrico rispetto ai ratti non trattati di sesso maschile nel modello di carcinogenesi N-metil-N'-nitro-N-nitrosoguanidina [17]. In H. pylori
indotta gastrico modello murino di cancro, 17 beta-estradiolo ha agito come un fattore protettivo nella carcinogenesi gastrica [18]. Gli estrogeni hanno dimostrato un aumento di apoptosi nelle cellule umane AGS cancro gastrico [19]. Inoltre, gli estrogeni stimolò espressione di peptidi trilobate che sono importanti nella protezione della mucosa dello stomaco [20]. Anche se gli studi pubblicati sulle influenza dell'estrogeno sul rischio di cancro gastrico sono incoerenti, una recente meta-analisi supporta l'esposizione più lungo per gli effetti degli estrogeni di origine sia ovarico o esogena può ridurre il rischio di cancro gastrico [21].

L'estrogeno e progesterone sono sintetizzati nella via di biosintesi dell'ormone steroideo. recettori degli ormoni steroidei come gli estrogeni e progesterone sono stati identificati e sono espressi in mucosa e il cancro gastrico tessuti [22] - [26]. Pertanto, steroidi percorso ormone biosintesi e dei loro recettori possono essere alterati da variazioni genetiche di geni correlati, alterando in tal modo e che contribuiscono alla suscettibilità individuale al cancro gastrico. Dei recettori ormonali, in particolare, ci siamo concentrati sul recettore del progesterone ( PGR
) perché il progesterone potrebbe essere un fattore importante per la carcinogenesi gastrica di estrogeni. Uno studio su animali [27] ha dimostrato che onapristone, un anatagonist progesterone, inibito la crescita del tumore gastrico, così come la crescita estradiolo-stimolata.

L'ipotesi di questo studio è polimorfismi genetici coinvolti nella via ormone steroideo biosintesi e PGR
può influenzare la suscettibilità individuale nello sviluppo del cancro gastrico. Per studiare l'ipotesi, è stato condotto uno studio di associazione genetica in due fasi: 1) la fase di scoperta è stata un'analisi candidato approccio del gene concentrandosi su cinque geni coinvolti nella via di biosintesi degli steroidi ( HSD3B1
, CYP17A1
, CYP19A1
, HSD17B2
, e HSD17B1
) e del gene del recettore dell'ormone ( PGR
); 2) la fase di estensione esaminato ulteriormente gli SNP più significativi individuati nell'analisi della scoperta.

Materiali e metodi

Studio Popolazione

Nella fase di scoperta, la popolazione a base di nested popolazione in studio caso-controllo è stato reclutato dal coreano Multi-center Cancer coorte (KMCC), una comunità basata sulla coorte prospettica di partecipanti reclutati da quattro aree urbane e rurali in Corea (Haman, Chungju, Uljin, e Youngil) dal 1993 al 2004 [28]. I partecipanti hanno completato un questionario di intervista standardizzati dettagliati basati sullo stile di vita in generale, la storia medica, l'attività fisica, la dieta, fattori riproduttivi, esposizione ai pesticidi, e fattori ambientali aggiuntivi. I campioni di sangue e macchia di urina sono stati raccolti e conservati rispettivamente a -70 ° C e -20 ° C,.

31 dicembre 2002, 136 casi di cancro gastrico nel KMCC sono stati identificati attraverso legami di record computerizzati per la nazionale registro tumori, il certificato di morte nazionale, e l'assicurazione sanitaria cartelle cliniche. I metodi di follow-up passivi sono stati segnalati per essere efficiente del 99% e la completezza è stato assicurato [29]. I casi diagnosticati prima assunzione (n = 36) e senza campioni di sangue (n = 16) sono stati esclusi. controlli senza cancro sono stati selezionati in modo casuale dalla popolazione KMCC. C'erano quattro controlli appaiati per ogni caso di cancro gastrico mediante campionamento densità di incidenza in base all'età (± 5 anni), il sesso, quartiere residenziale, e l'iscrizione. Inoltre, otto casi e 14 controlli sono stati esclusi a causa di DNA insufficiente o scarsa genotipizzazione. Infine, 76 casi e 322 controlli sono stati inclusi nella fase di scoperta.

Nella fase di estensione, 388 cancro gastrico set caso-controllo sono stati selezionati come segue. Ci sono stati 95 nuovi casi di cancro gastrico e 52 casi prevalenti nel dicembre 2008 e 52 casi supplementari i cui campioni di sangue sono stati successivamente ottenuto dal KMCC. Inoltre, dal marzo 2002 al settembre 2006, 490 pazienti con nuova diagnosi di cancro gastrico da due ospedali universitari in Corea che erano stati identificati Chungnam University Hospital e Hanyang GURI University Hospital. I dati epidemiologici e campioni di sangue venoso sono stati raccolti al momento della diagnosi o prima di un intervento chirurgico del cancro gastrico. Tra questi, sono stati inclusi 189 casi con campioni di DNA sufficienti e il consenso informato. controlli basati sulla comunità appaiati per età (± 5 anni), sesso e anno di immatricolazione 2001-2005 sono stati selezionati in modo casuale dalla KMCC. Ci sono stati due casi e 40 controlli esclusi a causa della scarsa genotipizzazione e il campione insufficiente. Infine, 386 casi e 348 controlli sono stati inclusi nella fase di estensione. Raggruppati e meta-analisi inclusi 462 casi e 670 controlli.

Etica Dichiarazione

Tutti i partecipanti hanno fornito consenso informato scritto prima di entrare gli studi. I protocolli di studio per la KMCC e studi caso-controllo nested attuali sono stati approvati dalla revisione tavole istituzionali della Seoul National University Hospital e del National Cancer Center di Corea (H-0110-084-002, C-0907-044-2861-170 ), e Hanyang University Hospital (2003-4)

gene candidato e SNP Selection

ci sono stati sette geni in fase di discovery selezionati dalla revisione della letteratura che sono stati i seguenti:. recettore del progesterone ( PGR
); citocromo P450, famiglia 19, sottofamiglia A, polipeptide 1 ( CYP19A1
); citocromo P450, famiglia 17, sottofamiglia A, polipeptide 1 ( CYP17A1
); idrossisteroide (17-beta) deidrogenasi 1 ( HSD17B1
); idrossisteroide (17-beta) deidrogenasi 2 ( HSD17B2
); idrossi-delta-5-steroide deidrogenasi, 3 beta e delta-isomerasi steroide 1 ( HSD3B1
).

candidati polimorfismi a singolo nucleotide (SNP) di geni selezionati sono stati selezionati in base alla seguente criteri: 1) segnalati per avere un possibile significato funzionale in studi precedenti; 2) la frequenza minore allele (MAF) > 0,05 nel database asiatici come SNP500Cancer, HapMap o CGAP utilizzando dbSNP ID (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP); 3) contemporaneamente, MAF > 0,05 a HapMap giapponese (JET). Infine, 117 SNP con un punteggio di progettazione = 1,1, r ^{2 > 0.8 in cinque geni candidati nella via ormone steroideo biosintesi e PGR
sono stati genotipizzati. Ci sono stati 105 SNP situati nella regione introne, (regione di accompagnamento o UTR) otto SNPs situati nella regione del promotore, e quattro SNPs situati nella regione codificante (Appendice S1).}

Nella fase di estensione, SNPs erano selezionata come segue. Per PGR
, nell'analisi di scoperta, 23 SNPs sono stati significativi e ha creato una grande Haploblock. C'erano due SNPs dei 23 SNPs situati nella codifica o regione 3UTR. Le prime e permutati p
-Valori erano meno di 0,04. Per CYP19A1
, ci sono stati dieci SNP significativi (prime p
-value < 0,05) si trova nella regione introne. CYP19A1
creato sei blocchi e le SNPs significativi in ​​fase di discovery erano situati in blocchi 4, 5 e 6.

La genotipizzazione

concentrazioni di DNA genomico sono stati misurati per ogni studio i soggetti di uno spettrofotometro (NanoDrop ND-1000, NanoDrop Technologies). La genotipizzazione in fase di scoperta è stata effettuata utilizzando test GoldenGateTM (Illumina®, San Diego, CA). Dei 117 SNP, nove SNP sono stati ritenuti inutilizzabili a causa di fallimento di genotipizzazione (andrs9939740 rs6203), tasso di chiamata SNP < 90% (rs2236780, rs12594293, rs12592697, rs597255, e rs2830), monomorfismo (rs7175531, rs4243229), e sono stati esclusi in le analisi. Infine, abbiamo analizzato 108 SNP in sei geni (tasso di genotipizzazione del 99,5%) in 76 casi e 322 controlli. Per garantire il controllo della qualità e valutare tasso di concordanza intra-soggetto, 52 campioni duplicati sono stati distribuiti in modo casuale nella piastra di genotipizzazione. tassi di concordanza per tutti i dosaggi erano superiore al 99%.

La genotipizzazione nella fase di estensione è stata effettuata utilizzando il test IlluminaVeraCodeGoldenGate con BeadXpress secondo il protocollo del produttore (Illumina, San Diego, CA, USA) [16]. Per garantire l'affidabilità dei due diversi metodi di genotipizzazione, 135 campioni (59 casi e 76 controlli) sono stati genotipizzati sia dal Genome-Wide SNP umana Array 5.0 e il IlluminaVeraCodeGoldenGate Assay, e il tasso di concordanza era > 98,2%. A causa dell'alto tasso di concordanza, tutti i campioni sono stati inclusi nell'analisi; campioni discordanti non sono stati eliminati dall'analisi.

Analisi statistica

Chi-quadro e Student t
-test sono stati condotti per confrontare caratteristiche selezionate tra i casi di cancro gastrico e controlli. Differenza di caratteristiche selezionate che erano il sesso, l'età, H. pylori
infezione, CagA e VacAseropositivity, fumo di sigaretta, consumo di alcool, e la storia gastrite tra casi e controlli sono stati determinati da un p
-value di 0,05

Hardy-Weinberg (. HWE) è stata valutata nel gruppo di controllo per tutti gli SNP utilizzando il test chi-quadro o il test esatto di Fisher con un livello di cut-off di HWE p-value < 0,0001. Nell'analisi di scoperta, l'associazione tra i singoli SNP e rischio di cancro gastrico è stata valutata sulla base grezza e permutati p
-Valori utilizzando il test rapporto di verosimiglianza (LRT) con un grado di libertà nella additiva, dominante, e modelli recessivo. Il modello additivo assume un effetto dose-risposta con un numero crescente di varianti alleliche. I modelli dominanti e recessivi sono test per l'allele minore. Se d è l'allele minore e D è il principale allele, il modello dominante è DD vs.
Dd + Dd e il modello recessivo è dd vs.
DD + Dd. Permutati p
-Valori sono stati stimati da 100.000 test di permutazione nel singolo modello SNP. Per evitare associazioni spurie con risultati falsi positivi, il tasso di scoperta di false (FDR) utilizzando un metodo Benjamini-Hochberg è stata calcolata [30]. il rischio di cancro gastrico è stato calcolato come odds ratio (OR) e gli intervalli di confidenza al 95% (IC) utilizzando incondizionato modello di regressione logistica aggiustamento per i fattori di rischio che sono stati l'età, abitudine al fumo (sempre vs.
mai), H. pylori
infezione (positivo vs.
negativo) e CagA sieropositività (positivo vs.
negativo) nel additiva, dominante e modelli recessivi. Haploblocks sono stati creati utilizzando l'algoritmo di default [31] e tag-SNP sono stati identificati in analisi di aplotipo.

Nella fase di estensione, gli SNPs più significativi in ​​fase di discovery sono stati ri-analizzati. Sulla base l'additivo e /o modelli recessivi, il rischio di cancro gastrico è stato stimato come O [95% IC] utilizzando incondizionato modello di regressione logistica l'adeguamento per gli stessi fattori di rischio di cui sopra. Il livello di significatività statistica per le fasi di scoperta e di estensione è stata p
-value < 0.05. Per riassumere i risultati dalla scoperta e l'estensione analisi, sono stati condotti pooled- e meta-analisi. Utilizzando il modello effetti fissi, riassunti O [95% IC] sono stati calcolati. Inoltre, l'eterogeneità tra gli studi è stata valutata dalle statistiche Cochran Q [32]

Tutte le analisi statistiche sono state effettuate utilizzando il software SAS versione 9.1 (SAS Institute, Cary, North Carolina), PLINK software versione 1.06 (http.: //pngu.mgh.harvard.edu/purcell/plink) [33], e il software Haploview 4.1 (http:. www.broadinstitute.org/haploview/haploview)

Risultati

era alcuna differenza significativa tra casi e controlli per tutte le caratteristiche selezionate nelle materie di scoperta e di estensione ( p
> 0,05) (Tabella 1). Nel pool-analisi, un maggior numero di casi sono stati CagA e VacA sieropositivi e fumatori ( p
< 0,05).

dei 108 SNPs in cinque geni steroide ormone biosintesi correlate e PGR
analizzati nella fase di scoperta, 23 SNPs in PGR
nel modello recessivo e 10 SNPs in CYP19A1
nei modelli recessiva o additivi sono risultati significativamente associati ad un aumento cancro gastrico rischio nel singolo analisi SNP ( p
< 0,05). PGR
rs542384, PGR
rs543215, PGR
rs613120, e PGR
rs1456765 presentato 100.000 test di permutazione p
< 0,01 , anche se FDR p-value non sono state significative (Tabella 2).

blocchi Haplotype sono stati identificati dalla trama LD. Un blocco è stato definito da PGR
che comprendeva tutti i 27 PGR
SNP dalla fase di scoperta (Figura S1), mentre sei blocchi sono stati definiti da CYP19A1
(figure 1, 2, e 3).

le frequenze alleliche minori del SNP sia nella fase di discovery e di estensione non erano statisticamente differenti. Pooled- e meta-analisi ha mostrato CYP19A1
è stata un'associazione statisticamente significativa con il rischio di cancro gastrico. alleli minori G, T e A per rs1004982, rs16964228 e rs1902580, rispettivamente, hanno riportato un 1,22 (IC 95% [1,01-1,48]), 1.31 (95% CI [1,03-1,66]), e 3,03 (95% CI [1,12-8,18]) aumentato rischio di cancro gastrico, rispettivamente, nel pool-analisi. La meta-analisi ha mostrato associazioni simili. Al contrario, tutti i PGR
SNP non un'associazione statisticamente significativa con il rischio di cancro gastrico (Tabella 3).

Discussione

CYP19A1
polimorfismi genetici, in particolare rs1004982, rs16964228, rs1902580, sono stati associati con un aumentato rischio di cancro gastrico nel corso di studio. L'analisi ha mostrato scoperta 23 SNPs in PGR
sono stati associati ad un aumentato rischio di cancro gastrico e ha creato una grande haploblock in aplotipo analisi, anche se le associazioni non sono stati significativi nel pool-analisi.

CYP19A1
codifica CYP19
aromatasi, un membro della superfamiglia del citocromo P450 che è il principale enzima che catalizza la finale e rate-limiting passo della biosintesi degli estrogeni (aromatizzazione di androstenedione e testosterone in estrone ed estradiolo, rispettivamente, ) [34]. CYP19
gene è mappato sul cromosoma 15q21.1, si estende su circa 123 kb, e la regione normativo contiene almeno 190 promotori distinti che regolano in maniera segnale specifico-pathway [35] o con ormonale controllato tessuto-specifica promotori, come gonadica o stroma adiposo [36] - [39]. CYP19
mutazioni hanno dimostrato un aumento o una diminuzione dell'attività dell'aromatasi alterando in tal modo i livelli di estrogeni [40] circolanti - [43]. CYP19A1
studi variazioni genetiche legate studiato l'associazione con i vari tipi di cancro ormonali come il seno, dell'endometrio, dell'ovaio, della prostata e [44] - [49]. l'attività dell'aromatasi stimolata seno crescita delle cellule tumorali [50], i livelli di espressione dell'aromatasi sono aumentati nei tumori della mammella [51], ed è stata la principale fonte di 17β-estradiolo in tumori al seno e dei tessuti circostanti nelle donne in postmenopausa [52], [53]. Gli studi sul ruolo di CYP19A1
specifico alla carcinogenesi gastrica umana sono limitati. Tuttavia, forte espressione di mRNA CYP19
aromatasi è stato mostrato in mucosa gastrica nei ratti adulti, e l'attività dell'aromatasi in campioni umani di carcinoma gastrico è stato dimostrato [25]. Ciò suggerisce un meccanismo che Polym codifica varianti orfici di CYP19
geni possono influenzare la suscettibilità cancro alterando suo enzima codificato, sia attraverso l'espressione o la funzione, per modulare la sintesi degli estrogeni. I nostri risultati suggeriscono la possibilità che le varianti genetiche di CYP19A1
(rs1004982, rs16964228 e rs1902580) potrebbero essere coinvolti in alterando i livelli di estrogeni e che riguardano l'apoptosi, la funzione della mucosa, carcinogenesi, e quindi il rischio di cancro gastrico.

ci sono studi limitati che esaminano i geni del pathway metabolismo degli ormoni steroidi e cancro gastrico. Uno studio giapponese ha osservato un'associazione statisticamente significativa tra diversi CYP19A1
SNP (rs4646 e rs1902586) e rischio di cancro gastrico [54]. Uno studio basato sulla popolazione in Polonia, che comprendeva 295 casi di cancro gastrico e 415 controlli anche genotipizzati un paio delle stesse SNPs (rs4646 e rs1902586), tuttavia, una significativa associazione non è stato trovato [55]. Questi SNP non sono stati genotipizzati nel nostro studio, tuttavia, altri SNPs di CYP19A1
ha mostrato associazioni statisticamente significative. Abbiamo genotipizzati CYP19A1
rs16964228, rs1902580 e rs1004982 che si trova nella regione introne in tre blocchi, blocco 4, Block 5, e Block 6, rispettivamente. Sebbene la rilevanza funzionale di CYP19A1
rs16964228, rs1902580 e rs1004982 per CYP19
enzima non è chiaro, CYP19A1
può agire come un indicatore chiave della suscettibilità individuale e la sua genetica varianti possono modificare lo sviluppo del cancro gastrico, ma un'ulteriore conferma è garantito

Molti studi esaminati CYP19A1
con tumori ormonale associati, come al seno, alla prostata, dell'endometrio [56] - [59]. . SNP rs10046 (T) e rs936306 (T) sono suggeriti per essere 'alleli alta attività' a causa della loro associazione con il 10% al 20% l'aumento dei livelli di estradiolo ed estrone circola nelle donne in post-menopausa [58], [60], [61] , anche se non ha mostrato associazione significativa con il cancro al seno [60], [62]. Nel corso di studio, rs10046 non era genotipizzazione, ma rs936306 stato genotipizzazione. Mentre rs936306 è stato significativo nella fase di scoperta, rs936306 era insignificante nella meta-analisi combinate e.

La nostra analisi ha mostrato scoperta 23 SNPs in PGR
sono stati associati con un aumentato rischio di cancro gastrico. Nella nostra analisi dell'aplotipo, i significativi 23 SNP dall'analisi scoperta, oltre ai rimanenti quattro PGR
SNP che sono stati genotipizzati, formato un'unica grande blocco, suggerendo questi SNP sono correlati tra loro e sono associati con gastrica cancro. Tuttavia, a causa potenza insufficiente nel modello recessivo, la fase di estensione non ha relazione un'associazione statisticamente significativa con qualsiasi PGR
SNP. PGR
livelli erano significativamente aumentati nei tessuti gastrici dei pazienti tumorali, mentre non nel tessuto normale [63] suggerendo mucosa gastrica può essere il tessuto bersaglio per l'azione del progesterone [64]. Pertanto, varianti polimorfiche di PGR
possono essere coinvolti nella modifica della suscettibilità al cancro gastrico alterando la sua espressione codificata stato del recettore e la funzione.

Anche se questo è stato uno studio a due fasi che mirava ad aumentare il numero di materie di studio, il potere era comunque basso, e non ha permesso l'analisi stratificata in base a fattori ormonali, come lo stato di menopausa, il sesso, e il tipo di cancro, come cardiaca e non cardiaca. L'eziologia del cancro gastrico è multi-fattoriale, e una comprensione approfondita dei fattori di rischio e di protezione e le sue interazioni contribuirà a fornire una migliore comprensione della malattia. Inoltre, nella fase di estensione, l'ospedale e casi basati sulla comunità sono stati abbinati ai controlli basati sulla comunità che possono introdurre bias. Tuttavia, pregiudizi informazione è stata ridotta al minimo dal momento che le persone nascono con i loro geni e le variazioni nei geni non sono comuni. Inoltre, bias di selezione è stato ridotto al minimo perché i casi sono stati abbinati a controlli in base a importanti fattori di rischio nella fase iniziale di studio di progettazione.

Lo studio è uno studio di associazione genetica in due fasi. Nell'approccio candidato analisi genetica, SNPs significativi che sono stati identificati in fase istruttoria sono stati nuovamente analizzati nella fase di estensione. In secondo luogo, questo studio caso-controllo nested basato sulla popolazione è privo di molti pregiudizi comuni nei disegni retrospettivi. fattori di confondimento sono stati aggiustati per in modelli multivariati.

In sintesi, questo bifase relazioni di studio di associazione genetica di popolazione CYP19A1
varianti genetiche, rs16964228, rs1902580 e rs1004982, sono significativamente associati rischio di cancro gastrico e sembrano essere un marcatore genetico di suscettibilità nella carcinogenesi gastrica nella popolazione coreana. Dato CYP19A1 s '
ruolo chiave nella biosintesi degli estrogeni, CYP19A1
polimorfismi che alterano la produzione di estrogeni possono essere coinvolti nella carcinogenesi gastrica. Sono necessari ulteriori studi di estrogeni e testosterone biomarcatori dal sangue e nelle urine per confermare e ulteriormente comprendere la base molecolare.

Informazioni di supporto
Figura S1.
PGR
mappa genetica e LD blocco. valori D 'e LOD sono stati utilizzati per la selezione dei colori LD in fase istruttoria. SNP indicato nelle caselle rappresentano SNP ri-analizzato nell'estensione
doi:. 10.1371 /journal.pone.0047603.s001
(TIFF)
appendice S1.
Informazioni dettagliate sui geni candidati e SNPs nella via ormone steroideo biosintesi e PGR
.
doi: 10.1371 /journal.pone.0047603.s002
(DOCX)

• PLoS ONE: MicroRNA-149 inibisce la proliferazione e la progressione del ciclo cellulare attraverso la destinazione dei ZBTB2 in Human gastrico Cancer
• PLoS ONE: Interazione tra GSTP1 Val allele e infezione da H. pylori, fumo e consumo di alcol e rischio di cancro gastrico tra i cinesi Population