PLoS One: genetikai hajlam tényezők a gének a Szteroid hormon bioszintézis és progeszteron receptor gyomorrák Risk

absztrakt katalógusa

Háttér katalógusa

A vizsgálat célja az volt, hogy megvizsgáljuk a szerepe gének ( HSD3B1 katalógusa, CYP17A1 katalógusa, CYP19A1 katalógusa, HSD17B2 katalógusa, HSD17B1 katalógusa) részt vesz a szteroid hormon bioszintézis és progeszteron receptor ( PGR katalógusa) etiológiájában gyomorrák egy populációs alapú kétfázisú genetikai asszociációs vizsgálat. katalógusa

módszerek katalógusa

a felfedezés fázis, 108 jelölt SNP a szteroid hormon bioszintézis kapcsolatos gének és PGR katalógusa elemezték 76 gyomorrák esetek és 322 vezérlők a koreai Multi-Center rák Cohort. Statisztikailag szignifikáns SNP azonosított felfedezés fázisban újra értékelték kiterjesztett készlet 386 esetek és 348 kontroll. Pooled- és meta-analízist végeztek össze az eredményeket. Katalógusa

Eredmények katalógusa

A 108 SNP szteroid hormon bioszintézis kapcsolatos gének és PGR katalógusa elemezni felfedezés szakaszában 23 SNP PGR katalógusa a recesszív modell és 10 SNP CYP19A1 katalógusa a recesszív vagy additív modell szignifikáns összefüggést mutattak fokozott gyomorrák kockázatát ( p katalógusa < 0,05). A minor allél frekvenciái SNP-k, mind a felfedezés és kiterjesztés fázisok nem voltak statisztikailag különbözőek. Pooled- és metaanalízis kimutatta CYP19A1 katalógusa rs1004982, rs16964228 és rs1902580 kockázata nagyobb volt a gyomorrák (összevont OR [95% CI] = 1,22 [1,01-1,48], 1,31 [1,03-1,66] 3,03 [1,12-8,18]) kapcsolatosan. Ezzel ellentétben, PGR katalógusa SNP statisztikailag nem szignifikáns összefüggést a gyomorrák kockázatát. Katalógusa

Következtetések katalógusa

Eredményeink azt sugallják, CYP19A1
kódoló aromatáz katalógusa játszhat fontos szerepet az egyesület a gyomorrák kockázatát, és olyan genetikai markert gyomorrák érzékenység. katalógusa

Citation: Cho LY, Yang JJ, Ko KP, Ma SH, Shin a, Choi BY, et al. (2012) Genetikai fogékonyság tényezők a gének a Szteroid hormon bioszintézis és progeszteron receptor gyomorrák kockázata. PLoS ONE 7 (10): e47603. doi: 10,1371 /journal.pone.0047603 katalógusa

Vágó: Michael Scheurer, Baylor College of Medicine, Amerikai Egyesült Államok katalógusa

Beérkezett: április 29, 2012; Elfogadva: szeptember 12, 2012; Megjelent: október 23, 2012 katalógusa

Copyright: © Cho és mtsai. Ez egy nyílt hozzáférésű cikk feltételei szerint terjeszthető a Creative Commons Nevezd meg! Licenc, amely engedélyezi a korlátlan használatát, a forgalmazás és a reprodukció bármilyen adathordozón, feltéve, hogy az eredeti szerző és a forrás jóváírásra. Katalógusa

Forrás: Ez a tanulmány támogatott a támogatás (1) a Nemzeti R &D Program for Cancer Control egészségügyi Minisztérium & Jóléti, Koreai Köztársaság (0520140); (2) Az Alap Science Research Program a Nemzeti Kutatási Alapítvány Koreai Minisztérium támogatja az Oktatási, Tudományos és Technológiai [NRF-2009-353-0066258]; és (3) az Alap Research Laboratory (BRL) programot a Nemzeti Kutatási Alapítvány Koreai Minisztérium támogatja az Oktatási, Tudományos és Technológiai [2011-0001564]. A finanszírozók nem volt szerepe a tanulmány tervezés, adatgyűjtés és elemzés, döntés, hogy közzéteszi, vagy a készítmény a kézirat. Katalógusa

Érdekütközés: A szerzők kijelentették, hogy nem ellentétes érdekek léteznek. Katalógusa

Bevezető

a gyomorrák halálozás a második legnagyobb a világon. [1] A gyomorrák előfordulása körülbelül kétszer nagyobb férfiaknál, mint a nők számos régiójában a világ [2], és az arány egyre kisebb lesz a 60 éves korban, amikor a legtöbb nő eléri a menopauza. A gyomorrák előfordulása a férfiaknál több mint a duplája, mint a nőknél a koreai lakosság (62,2 vs.
24,6 100.000 fő) [3]. Ez a globális konzisztenciája magas férfi-nő incidencia arány a gyomorrák miatt lehet hormonális különbség a férfiak és a nők. Tehát azt feltételezték, hogy a női nemi szteroid hormonok, az ösztrogén és a progeszteron, lehet védő szerepe a gyomorrák előfordulása. Katalógusa

Bár következetlen, epidemiológiai vizsgálatok alátámasztják ezt a feltételezést. Számos epidemiológiai tanulmány számolt csökkent kockázatot gyomorrák nagyobb élettartam expozíció endogén ösztrogén [4] - [11], míg egyes tanulmányok nem mutatott összefüggést [12] - [16]. Állati és in vitro katalógusa tanulmányok is alátámasztják ezt a hipotézist. Nő és kasztrált patkányokban incidenciája alacsonyabb volt a gyomorrák, mint a nem kezelt hím patkányokon N-metil-N'-nitro-N-nitrozo-guanidinnel carcinogenesis modell [17]. H. pylori katalógusa indukált gyomorrák egérmodellben 17-béta-ösztradiol járt, mint védő tényező a gyomorrák karcinogenezissel [18]. Ösztrogén bizonyította növekedését apoptózist AGS humán gyomorrák-sejtek [19]. Ezen túlmenően, az ösztrogén stimulálta expresszióját hármaskaréj peptidek, melyek fontosak a nyálkahártya védelmét a gyomorban [20]. Bár publikált tanulmányok ösztrogén hatással gyomorrák kockázatát következetlen, egy friss meta-analízis támogatja hosszabb expozíciós ösztrogén hatását sem petefészek vagy exogén eredetű csökkentheti a gyomorrák kockázatát [21]. Katalógusa

Az ösztrogén és progeszteron szintetizálódnak a szteroid hormon bioszintézis útvonal. A szteroid hormon receptorok, mint például az ösztrogén és a progeszteron azonosították és vannak kifejezve gyomornyálkahártya és a rák a szövetekben [22] - [26]. Ezért szteroid hormon bioszintézis útvonal és receptoraik változtatni lehet genetikai variációk rokon gének, ezáltal megváltoztatva és hozzájárulva az egyéni érzékenység gyomorrák. Hormonális receptorok, különösen összpontosítottunk a progeszteron receptor ( PGR katalógusa), mert a progeszteron lehet jelentős mértékben hozzájárul a gyomor-karcinogenezis, mint az ösztrogén. Egy állatokon [27] kimutatta, hogy onapristont, a progeszteron anatagonist gátolta gyomor tumor növekedését, valamint az ösztradiol stimulálta a növekedést. Katalógusa

A hipotézist a jelenlegi tanulmány genetikai polimorfizmusok részt vesz a szteroid hormon bioszintézis és PGR katalógusa befolyásolhatja az egyéni érzékenység a gyomorrák kialakulásával. Hogy vizsgálja meg a hipotézis, kétfázisú genetikai asszociációs vizsgálatot végeztek: 1) a felfedezés fázis egy jelölt gén megközelítés fókuszáló elemzés öt résztvevő gének szteroid bioszintézis ( HSD3B1 katalógusa, CYP17A1
, CYP19A1 katalógusa, HSD17B2 katalógusa, és HSD17B1 katalógusa), és a hormon-receptor gén ( PGR katalógusa); 2) A kiterjesztett fázis tovább vizsgálta a legjelentősebb SNP azonosított felfedezés elemzés. Katalógusa

Anyagok és módszerek katalógusa

Vizsgálati populáció katalógusa

A felfedezés szakaszában, a népesség-alapú beágyazott eset-kontroll vizsgálat populáció volt, akiket a koreai Multi-Center Rák kohort (KMCC), a közösségi alapú prospektív résztvevők felvett négy városi és vidéki területek Koreában (Hámán, Chungju, Uljin és Youngil) 1993 és 2004 között [28]. A résztvevők részletes standardizált interjú kérdőívek általános életmód, kórtörténet, fizikai aktivitás, táplálkozás, reproduktív faktorok, növényvédőszer expozíció és további környezeti tényezők. Vér és spot vizeletmintákat gyűjtöttünk és tároltuk -70 ° C és -20 ° C-on, ill.

31 december 2002, 136 gyomorrák esetek az KMCC azonosítottak keresztül számítógépes rekord kötéseket a nemzeti rákregiszterébôl nemzeti halotti bizonyítványt, és az egészségbiztosítási orvosi feljegyzések. A passzív nyomonkövetési módszereket leírták, hogy 99% -os hatékony és teljesség biztosított [29]. Diagnosztizált esetek felvétele előtt (N = 36), és anélkül, hogy vérmintát (N = 16) kizárták. Rák-mentes kontroll véletlenszerűen kiválasztott KMCC populációban. Négyen voltak ellenőrzések illeszkedik minden gyomorrák előfordulása esetén a sűrűség mintavétel alapján az életkor (± 5 év), szex, lakónegyed, és beiratkozás. Emellett nyolc eset és 14 kontroll kizárták elégtelensége miatt a DNS vagy rossz genotipizáláshoz. Végül, 76 esetben és 322 kontrollokat a felfedezés szakaszában. Katalógusa

A kiterjesztett fázisban, 388 gyomorrákos eset-kontroll szett került kiválasztásra az alábbiak szerint. Voltak 95 új gyomorrákos esetek 52 elterjedt esetben 2008 decemberében és 52 további esetben, akiknek vérmintákat később nyert KMCC. Ezen túlmenően, a 2002. március 2006. szeptember 490 újonnan diagnosztizált gyomorrákos betegek két egyetemi kórházak Koreában voltak Chungnam Egyetemi Kórház és Hanyang Egyetem GURI Kórház azonosítottak. Epidemiológiai adatok és vénás vérmintákat gyűjtöttünk a diagnosztizálás időpontjában vagy azt megelőzően gyomorrák műtét. Közülük 189 esetben elegendő DNS-mintát és tájékozott hozzájárulása vontak be. A közösségi alapú ellenőrzések igazítottuk az életkor (± 5 év), a szex és a beiratkozási év 2001-2005 véletlenszerűen kiválasztott KMCC. Két esetben és 40 kontroll miatt kizárták rossz genotipizáláson és elégtelen minta. Végül 386 esetben 348 kontrollokat a terjeszkedését. Összegyűjtöttük és metaanalízis szerepel 462 esetben, és 670 kontroll. Katalógusa

Etikai Nyilatkozat katalógusa

Minden résztvevő írásos beleegyezését adta, mielőtt a tanulmányokat. A vizsgálati protokollt az KMCC és a jelenlegi eset-kontroll vizsgálatok által jóváhagyott intézményi etikai bizottság a Szöuli Nemzeti Egyetemi Kórház és a Nemzeti Rákkutató Központ Korea (H-0110-084-002, C-0907-044-2861-170 ) és Hanyang University Hospital (2003-4).

kandidáns gén és az SNP Selection

voltak hét gének felfedezése fázis választott irodalmi áttekintés, hogy a következők voltak: progeszteron receptor ( PGR katalógusa); citokróm P450 család 19, alcsalád A polipeptid 1 ( CYP19A1 katalógusa); citokróm P450 család 17, alcsalád A polipeptid 1 ( CYP17A1 katalógusa); hidroxiszteroid (17-béta) dehidrogenáz 1 ( HSD17B1 katalógusa); hidroxiszteroid (17-béta) dehidrogenáz 2 ( HSD17B2 katalógusa); hidroxi-delta-5-szteroid-dehidrogenáz, 3 béta- és szteroid delta-izomeráz 1 ( HSD3B1
).

vont egypontos nukleotid polimorfizmus (SNP) a kijelölt géneket szerint kiválasztott, a következő kritériumoknak: 1) számoltak be, hogy egy esetleges funkcionális jelentősége a korábbi tanulmányok; 2) minor allél gyakorisága (MAF) > 0,05 ázsiai adatbázisok, mint például SNP500Cancer, HapMap vagy CGAP segítségével dbSNP azonosítók (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP); 3) egyidejűleg, MAF > 0.05 HapMap japán (JET). Végül 117 SNP egy tervezési pont = 1,1, r ^{2 > 0,8 öt jelölt gének a szteroid hormon bioszintézis és PGR katalógusa genotípust. Voltak 105 SNP található intronterülettől nyolc SNP található a promoter régió (határoló régió vagy UTR), és négy SNP található a kódoló régió (függelék S1). Katalógusa}

A kiterjesztett fázisban SNP voltak kiválasztott a következők szerint. Mert PGR katalógusa, a felfedezés elemzés, 23 SNP szignifikáns, és létrehozott egy nagy Haploblock. Két SNP a 23 SNP található, a kódoló vagy 3UTR régióban. A nyers és permutált p katalógusa -értékei kisebb volt, mint 0,04. Mert CYP19A1 katalógusa, volt tíz jelentős SNP (nyers p katalógusa -érték < 0,05) található intronterülettől. CYP19A1
létrehozott hat blokkok és a jelentős SNP-k a felfedezés fázisban található blokkok 4., 5., és 6.

genotipizálása

A genomiális DNS-koncentrációt mértünk minden tanulmány alanyok spektrofotométerrel (NanoDrop ND-1000, NanoDrop Technologies). Genotípus a felfedezés fázisban végeztük GoldenGateTM vizsgálattal (Illumina®, San Diego, CA). A 117 SNP, kilenc SNP ítélt használhatatlan meghibásodása miatt genotípus (rs6203 andrs9939740), SNP lehívási mérték < 90% (rs2236780, rs12594293, rs12592697, rs597255 és rs2830), monomorphism (rs7175531, rs4243229), és kizárták a az elemzést. Végül elemeztük 108 SNP hat gén (genotipizálás mértéke 99,5%) 76 esetek és 322 vezérlők. Annak biztosítása érdekében, minőség-ellenőrzés és értékeli egyénen belüli egyezési arány, 52 ismétlődő mintákat véletlenszerűen oszlanak el a genotípus-lemez. Egyezés árak Minden vizsgálatot nagyobb, mint 99%.

genotipizálása a kiterjesztési fázisban végeztük a IlluminaVeraCodeGoldenGate tesztben, BeadXpress szerint a gyártó protokollja (Illumina, San Diego, CA, USA) [16]. Megbízhatósága érdekében a két különböző genotípus-módszer, 135 minta (59 esetben 76 kontroll) genotípust mind a genomot Human SNP Array 5.0 és a IlluminaVeraCodeGoldenGate vizsgálat, valamint a megfelelési arány > 98,2%. Mivel a magas konkordancia arány, az összes mintát vontunk be az elemzésbe; disszonáns mintákat nem távolítják el az elemzést. katalógusa

Statisztikai elemzés katalógusa

Chi-négyzet és Student t katalógusa -teszt végeztek összehasonlítani a kiválasztott jellemzők között gyomorrák esetek és a kontrollok. Különbség a kiválasztott jellemzők, amelyek nem, életkor, H. pylori fertőzés katalógusa, CagA és VacAseropositivity, a dohányzás, az alkoholfogyasztás, és gyomorhurut történelem közötti esetek és a kontrollok meghatározása egy p katalógusa -érték 0,05. katalógusa

A Hardy-Weinberg ( HWE) értékeltük a kontroll csoport minden SNP khi-négyzet teszt vagy Fisher-féle egzakt tesztet egy cut-off szint HWE p-érték < 0,0001. A felfedezés elemzés, a szövetség között egyes SNP-k és a gyomorrák kockázatát alapján értékeljük nyers és permutált p katalógusa -értékei a likelihood ratio teszt (LRT) egy fokú szabadságot adalékanyag, domináns, és recesszív modellek. Az adalék modell feltételezi egy dózis-válasz hatást egyre több variáns allélek. A domináns és recesszív modell vizsgálatok a minor allél. Ha d minor allél és D a fő allél, a domináns modell DD vs. Katalógusa dd + Dd és recesszív modell dd vs. Katalógusa DD + Dd. Permutált p katalógusa -értékei becsültük 100000 permutáció vizsgálatok az egységes SNP modell. Annak elkerülése érdekében hamis asszociációkat hamis pozitív eredmények, téves elfogadási arány (FDR) alkalmazásával Benjamini- Hochberg módszer került kiszámításra [30]. A gyomorrák kockázatát számították esélyhányados (OR) és a 95% -os megbízhatósági intervallumok (CI) alkalmazásával feltétlen logisztikus regressziós modell kiszűrése kockázati tényezők, amelyek az életkor, a dohányzási státusz (soha vs.
Soha), H. pylori fertőzés katalógusa (pozitív vs. katalógusa negatív) és CagA szeropozitivitást (pozitív vs. katalógusa negatív) az adalékanyag, domináns, és recesszív modell. Haploblocks jött létre az alapértelmezett algoritmus [31] és a tag-SNP-t azonosítottak haplotípus analízis. Katalógusa

A kiterjesztett fázisban a legjelentősebb SNP felfedezése fázisban Ismét elemezték. Alapján az adalékanyag és /vagy recesszív modellek, gyomorrák kockázatát becsülték OR [95% CI] segítségével feltétlen logisztikus regressziós modell beállításával azonos kockázati tényezők, mint a fent említett. A statisztikai szignifikancia szintje a felfedezés és a mellék fázisban volt p katalógusa -érték < 0,05. Összefoglalva az eredményeket a felfedezés és a mellék elemzések, pooled- és meta-analízist végeztek. A fix-hatás modellt, össze OR [95% CI] kerültek kiszámításra. Továbbá, a heterogenitás, a vizsgálatba értékelték a Cochran Q statisztika [32]. Katalógusa

Minden statisztikai analízist végeztünk SAS szoftver verzió 9.1 (SAS Institute, Cary, North Carolina), Plink szoftververzió 1.06 (http: //pngu.mgh.harvard.edu/purcell/plink) [33], és Haploview 4.1 szoftver (http: www.broadinstitute.org/haploview/haploview). katalógusa

Eredmények katalógusa

nem volt szignifikáns különbség az esetek és kontrollok minden kiválasztott jellemzők felfedezése és hosszabbító alanyok ( p katalógusa > 0,05) (1. táblázat). Az összesített elemzés, nagyobb számú eset CagA és VacA szeropozitív és dohányáruk ( p katalógusa < 0,05). Katalógusa

A 108 SNP öt szteroid hormon bioszintézis kapcsolatos gének és PGR katalógusa elemzett felfedezés szakaszában, 23 SNP PGR katalógusa a recesszív modell és 10 SNP CYP19A1 katalógusa a recesszív vagy additív modell szignifikáns összefüggést mutattak fokozott gyomorrák kockázat az egységes SNP analízis ( p katalógusa < 0,05). PGR katalógusa rs542384, PGR katalógusa rs543215, PGR katalógusa rs613120, és PGR katalógusa rs1456765 bemutatott 100000 permutációs teszt p katalógusa < 0,01 bár FDR p-érték nem volt szignifikáns (2. táblázat). katalógusa

haplotípus blokkok azonosítottak az LD telek. Egy blokk által definiált PGR katalógusa, amely tartalmazta a 27 PGR
SNP a felfedezés fázis (ábra S1), míg hat blokkok által meghatározott CYP19A1 katalógusa (1., 2 és 3).

a minor allél frekvenciái a SNP-k, mind a felfedezés és kiterjesztés fázisok nem voltak statisztikailag különbözőek. Pooled- és metaanalízis kimutatta CYP19A1 katalógusa statisztikailag szignifikánsan összefügg a gyomorrák kockázatát. Minor allélek G, T, és A az rs1004982, rs16964228, és rs1902580, illetve számolt 1,22 (95% CI [1,01-1,48]), 1,31 (95% CI [1,03-1,66]), és 3,03 (95% CI [1,12-8,18]) fokozott kockázata gyomorrák, illetve az összegyűjtött-elemzést. Metaanalízis hasonló kapcsolatban. Ezzel ellentétben, PGR katalógusa SNP statisztikailag nem szignifikáns összefüggést a gyomorrák kockázatát (3. táblázat). Katalógusa

Vita katalógusa

CYP19A1 katalógusa genetikai polimorfizmusok, kifejezetten rs1004982, rs16964228, rs1902580, arra jár fokozott kockázata gyomorrák a jelenlegi vizsgálatban. A felfedezés elemzés azt mutatta, 23 SNP PGR katalógusa összefüggésben voltak a megemelkedett gyomorrák kockázatát, és létrehozott egy nagy haploblock a haplotípus analízis, bár szervezetek nem voltak szignifikánsak az összevont elemzés. Katalógusa

CYP19A1
kódolja CYP19
aromatáz, tagja a citokróm P450 szupercsalád hogy a fő enzim, amely katalizálja a végső és sebességmeghatározó lépés az ösztrogén bioszintézisét (aromatizálást androsztén-dion és tesztoszteron ösztronná és ösztradiol, illetőleg ) [34]. CYP19
gén van leképezve kromoszóma 15q21.1, ível mintegy 123 kb, és a szabályozó régió legalább 190 elkülönült promoterek szabályozzák jelpálya-specifikus módon [35], vagy szövet-specifikus hormontúltermeléssel ellenőrzött promoterek, például a gonadális vagy zsírszövet stroma [36] - [39]. CYP19
mutációk bebizonyították növekedett vagy csökkent az aromatáz aktivitását, ezáltal megváltoztatva szintje a keringő ösztrogén [40] - [43]. CYP19A1 katalógusa genetikai variáció kapcsolatos tanulmány vizsgálta az egyesület különböző hormonfüggő rákos megbetegedések, például emlőrák, méhnyálkahártya, petefészek, prosztata és [44] - [49]. Az aromatáz aktivitás stimulált mellrák sejtek növekedését [50], az aromatáz expressziós szintek fokozott emlőtumorok [51], és volt a fő forrása a 17β-ösztradiol emlődaganatok és a környező szövetek postmenopausalis nők [52], [53]. Tanulmányok a szerepét CYP19A1
specifikus emberi gyomor karcinogenezis korlátozottak. Azonban, erős expresszióját mRNS CYP19
aromatáz volt látható gyomornyálkahártya felnőtt patkányokban, és az aromatáz aktivitás gyomor karcinóma emberi mintákban kimutatható volt [25]. Ez arra utal, hogy a mechanizmus poli kódoló orfikus változatai CYP19 katalógusa gének befolyásolhatják a rák fogékonyságot megváltoztatásával az általa kódolt enzim, akár kifejezés vagy függvény modulálják ösztrogén szintézis. Eredményeink arra utalnak, hogy genetikai variánsai CYP19A1 katalógusa (rs1004982, rs16964228 és rs1902580) érintett lehet megváltoztatásával ösztrogén szint és érintő apoptózis, nyálkahártya funkció, karcinogenezis, és így a gyomorrák kockázatát. Katalógusa

van korlátozott vizsgálatokat, hogy vizsgálja meg a gének a szteroid hormon anyagcsere útvonal és gyomorrák esetén. Egy japán tanulmány megfigyelhető statisztikailag szignifikáns összefüggést több CYP19A1 katalógusa SNP (rs4646 és rs1902586) és a gyomorrák kockázatát [54]. A populáció-alapú vizsgálat Lengyelországban, amely tartalmazta a 295 gyomorrákos esetek és 415 vezérlők is genotipizált pár azonos SNP (rs4646 és rs1902586), azonban szignifikáns összefüggést nem található [55]. SNP nem genotipizált a tanulmányban azonban más SNP a CYP19A1 katalógusa mutatott statisztikailag szignifikáns összefüggést. Mi genotipizált CYP19A1 katalógusa rs16964228, rs1902580 és rs1004982, hogy található az intron régió három blokk, blokk 4, Block 5, és 6. rovat, ill. Bár a funkcionális jelentősége CYP19A1
rs16964228, rs1902580 és rs1004982 az CYP19 katalógusa enzim nem világos, CYP19A1 katalógusa eljárhat kulcsfontosságú marker egyéni érzékenység és genetikai variánsok módosíthatják a gyomorrák kialakulásával, de további megerősítést indokolt. katalógusa

Számos tanulmány vizsgálta, CYP19A1 katalógusa hormontúltermeléssel kapcsolódó rák, mint a mell, prosztata, endometrium [56] - [59] . SNP-k rs10046 (T) és rs936306 (t) javasolta, hogy "nagy aktivitású allélek" miatt Association 10% -ról 20% megnövekedett keringő ösztradiol és ösztron posztmenopauzás nők [58], [60], [61] bár nem mutatott szignifikáns összefüggést a mellrák [60], [62]. A jelenlegi vizsgálat során, nem volt rs10046 genotipizálásával de rs936306 volt genotipizálásával. Míg rs936306 jelentős volt a felfedezés szakaszában, rs936306 jelentéktelen volt az összevont és metaanalízis. Katalógusa

A felfedezés elemzés azt mutatta, 23 SNP PGR katalógusa arra jár fokozott kockázata gyomorrák. A mi haplotípus analízis, jelentős 23 SNP-k a felfedezés elemzés, amellett, hogy a maradék négy PGR
SNP hogy genotipizálása, kialakult egy nagy blokk, ami arra utal, ezek SNP korrelálnak egymással, és amelyek kapcsolatban vannak a gyomor rák. Azonban, mivel nincs elegendő erő a recesszív modellben a meghosszabbított fázisban nem jelentett statisztikailag szignifikáns összefüggést találtunk az egyetlen PGR
SNP. PGR katalógusa szint szignifikánsan emelkedett gyomorrákos betegek szöveteiben, ugyanakkor nem a normális szövetekben [63] utal a gyomor nyálkahártyáját lehet a cél szövetben progeszteron fellépés [64]. Ezért polimorf változatait PGR katalógusa lehet vonni módosítását gyomorrák érzékenység megváltoztatása révén kódolt receptor státusz expressziójának és funkciójának. Katalógusa

Bár ez a két fázisú vizsgálatban, amelynek célja, hogy növelje a számot a vizsgálati alanyok, a hatalom mégis alacsony, és nem tette lehetővé a rétegzett elemzés szerint hormonnal kapcsolatos tényezők, mint a klimaxos állapot, a nem és a rák típusa, például szív- vagy nem-szív. A etiológiája gyomorrák többtényezős, és egy alapos megértése a kockázati és védő tényezők és a kölcsönhatásokat segíti majd még jobban megértsék a betegség. Sőt, a meghosszabbított fázisban, a kórházi és a közösségi alapú esetben egyezett a közösségi alapú vezérlést, amely bevezetni elfogultság. Azonban információ torzítás minimálisra csökkent, mivel az emberek születnek, gének és változások a gének nem gyakori. Továbbá, szelekciós torzítás minimálisra csökkent, mert az esetekben egyeztette az ellenőrzés szerint fontos kockázati tényező a kezdeti vizsgálat tervezési szakaszban. Katalógusa

A tanulmány egy kétfázisú genetikai asszociációs vizsgálat. A jelölt megközelítés genetikai elemzés jelentős SNP-k azonosítottak a felfedezés szakaszában Ismét elemezték a terjeszkedését. Másodszor, ez a populáció-alapú eset-kontroll vizsgálat mentes sok előítélet közös retrospektív tervez. A zavaró tényezők voltak korrigált többváltozós modellek. Katalógusa

Összefoglalva, ez a populáció-alapú kétfázisú genetikai asszociációs vizsgálat jelentések CYP19A1 katalógusa genetikai variánsok, rs16964228, rs1902580 és rs1004982, jelentősen összefüggő gyomorrák kockázatát, és úgy tűnik, hogy a genetikai markere érzékenység a gyomor karcinogene- koreai lakosság. CYP19A1 katalógusa 's kulcsszerepe ösztrogén bioszintézis, CYP19A1 katalógusa polimorfizmus, amelyek megváltoztatják az ösztrogén termelés lehet vonni gyomor kialakulásában. További vizsgálatok az ösztrogén és a tesztoszteron biomarkerek vérben és a vizeletben van szükség, hogy erősítse meg, és jobban megértsük a molekuláris alapja. Katalógusa

alátámasztó információk
ábra S1.
PGR katalógusa gén térkép és LD blokk. D 'és LOD értékeket használták kiválasztása LD színsémát a felfedezés szakaszában. SNP rovataiban képviseli SNP újra elemezni a kiterjesztés. Katalógusa doi: 10,1371 /journal.pone.0047603.s001 katalógusa (TIFF) hotelben függelék S1.
részletes információ a jelölt gének és SNP a szteroid hormon bioszintézis és PGR katalógusa.
doi: 10,1371 /journal.pone.0047603.s002 katalógusa (DOCX) hotelben