Background a wëllt VerfÜgung
N-glycan biomarkers zu gastric Kriibs (GC Fir z'identifizéieren an ze validéieren ) an hir Basisdaten molekulare Mechanismus Aktiounsradius ze entschlësselen. VerfÜgung
Method VerfÜgung
Am Ganzen, 347 Persounen, mam GC (gastric Kriibs) oder atrophic gastritis a gesond Kontrollen och Patienten, sech zoufälleg an engem ënnerdeelt Training Grupp (n = 287) an eng Retrospektiv Confirmatioun Grupp (n = 60). Serum N-glycan profiling war mat DNA sequencer-assisteiert /fluorophore-assisteiert rechnen electrophoresis (DSA-FACE) erreecht. Zwee diagnostic Modeller baséieren op der N-glycan Profiler mat Logistikzenter stepwise Réckgang gebaut. D'diagnostic Leeschtungsfähegkeet vun all Modell gouf am Réckbléck, mèi évaluéieren (n = 60), a Suivi (n = 40) cohorts. Lectin blotting war standing total Kär-fucosylation ze bestëmmen, an den Ausdrock vun Genen am Kär-fucosylation am GC Équipe gouf vum Géigendeel transcriptase-polymerase Kette Reaktioun analyséiert. VerfÜgung
Resultater VerfÜgung
Mir identifizéiert mannst 9 N-glycan Strukturen (Bierger) an de Niveau vum Kär fucose Pestiziden an fucosyltransferase huet ofgeholl bedeitend an GC. Zwee diagnostic Modeller, designéierte GCglycoA an GCglycoB, gebaut GC differenzéiert aus Kontroll an atrophic gastritis. D'Gebidder ënner Receiver Fonctionnementskäschten fir béid charakteristesche (ROC) Kéieren (AUC) GCglycoA an GCglycoB sech méi héich wéi déi fir CEA, CA19-9, CA125 an CA72-4. Verglach mat CEA, CA19-9, CA125 an CA72-4, fräi der Empfindlechkeet vun GCglycoA 29,66%, 37,28%, 56,78% an 61,86%, respektiv, an der Genauegkeet fräi 10,62%, 16,82%, 25,67% an 28,76%, respektiv . Fir GCglycoB, fräi der Empfindlechkeet 27,97%, 35,59%, 55,09% an 60,17% an der Genauegkeet fräi 21,26%, 24,64%, 31,40% an 34,30% am Verglach mat CEA, CA19-9, CA125 an CA72-4, bzw.. No curative Agrëff, de Kär fucosylated hierstellen (Héichpunkt 3) an de ganzen Kär fucosylated N-glycans (sumfuc) opgehuewe goufen. VerfÜgung
Konklusiounen VerfÜgung
D'Resultater uginn, datt d'diagnostic Modeller op dräi baséiert glycan lues sinn wäertvoll a noninvasive Alternativen fir GC z'identifizéieren. Mir Sputnik Kär-fucosylation zu souwuel Otemschwieregkeeten an serum aus GC Patienten Verréngerung vun der ofgeholl Ausdrock vun fucosyltransferase Resultat kann VerfÜgung
Fro:. Liu L, Yan B, Huang J, Gu Q, Wang L, Fang M, et al. (2013) D'Umeldung an Characterization vun Buch vun der Woch N-glycan-baséiert Biomarkers zu Gastric Cancer. PLoS NËMMEN 8 (10): e77821. Doi: 10.1371 /journal.pone.0077821 VerfÜgung
Redakter: Rakesh K. Srivastava, D'Universitéit vu Kansas Medical Center, Vereenegt Staate vun Amerika VerfÜgung
Arnaque: Mee 14, 2013; Akzeptéiert: 4 September 2013; Publizéiert: 17. Oktober 2013 VerfÜgung
Copyright: © 2013 Liu et al. Dëst ass eng oppen-Zougang Artikel ënnert de Bedingunge vun der Lizenz BY Creative Commons verdeelt, déi bereet benotzen Genehmegungen, Distributioun, an Reproduktioun vun all mëttelgrouss, gëtt d'Original Auteur an d'Quell Kaiser sinn VerfÜgung
Funding:. Dës Aarbecht gouf vun der National Natural Science Foundation of China (Stipendie 81102693 an 81102565) ënnerstëtzt. D'funders hu keng Roll am Etude Design, Daten Kollektioun an Analyse, Décisioun, oder Virbereedung vun der mëttelalterlech Handschrëft ze publizéieren VerfÜgung
Wettsträit Interessen:.. D'Auteuren hunn deklaréiert, datt keng Competitioun Interessen existéieren VerfÜgung
Gastric Kriibs (GC) ass de véiert stäerkste verwandelt Kriibs an der drëtter Virwaat Ursaach vum Kriibs-Zesummenhang Doud, mat enger Heefegkeet vun ongeféier 930.000; Joer, ass et weltwäit fir iwwer 700.000 Doudesfäll responsabel, an de fënnef-Joer Iwwerliewe Taux ass 20-30% [1]. Fir Patiente mat GC, Survival ass vun der pathologic Etapp vun der Krankheet an der Zäit vun Diagnos diktéiert. Leider sinn d'gemeinsam Symptomer vun GC zu der Krankheet net spezifesch, an fréi Etapp GC kann net deitlech Symptomer féieren. Trotz waarden Wëssen vun de molekulare Mechanismen datt malignant Transformatioun an Metastasen regléieren, de globale Iwwerliewe Taux vu Patienten mat GC huet net vill verbessert. Puer Molekülle hunn als GC biomarkers, dorënner carcinoembryonic antigen (CEA) fir Thes Iwwerwaachung, rechnen antigen 19-9 (CA19-9), rechnen antigen 125 (CA125) a rechnen antigen 72-4 (CA72-4) rekommandéiert [2- 6]. Mä keng vun dëse entholl lues huet op eng fréi Etapp fir diagnosing GC genuch Sensibilitéit oder Spezifizitéit bewisen. Alternativ, Erhéijunge gastroscopy den Taux vun Frist Diagnosen, mä de diagnostic Wäert vun gastroscopy ass déi kascht, Risiken, an onpraktesch limitéiert. Dofir, et ass eng dréngend néideg fir d'Entwécklung vun noninvasive biomarkers dass fréi ze erkennen GC aktivéiert. VerfÜgung
Méi Beweiser proposéiert de Verfall vun der N-Hausnummeren glycan als potentiell biomarkers fir diagnosing Kriibs erauskoum ginn hätt. Virdrun Studien observéiert wesentlechen Ännerunge vun N-Hausnummeren glycan zu verschiddene Cancers a Kriibs Zell Linnen déi pancreatic Kriibs, Broscht Kriibs, Aarbecht Kriibs, spillt Kriibs a Liewer Kriibs [7-11] gehéiert. Weider Analyse vun GC och sënnlech datt gratis Komplex-Typ N-glycans alldeeglech zu MKN7 an MKN45 Zell Linnen [12]. Allerdéngs sinn déi Fluktuatioune an Ofwandlung vum N-Hausnummeren glycan am GC Patienten nach largement onbekannt. VerfÜgung
An eiser leschter Studie mat DNA sequencer-assisteiert /fluorophore-assisteiert capillary electrophoresis (DSA-FACE), mir bewisen, dass e muerden α-1,3-fucosylated triantennary glycan an enger biantennary glycan sech duerchaus spezifesch a sensibel Kandidat HCC biomarkers [13]. An der aktueller Etude, et geheescht mir DSA-FACE N-glycans serum zu Echantillon vun Patienten bis retrospectively Profil mam GC oder atrophic gastritis an aus gesond Persounen. Mir zeechne der identifizéiert GC N-glycan lues mat Receiver Fonctionnementskäschten charakteristesche (ROC) Kéieren a validéiert de lues zu mèi a Suivi cohorts. Eist Zil war eng villverspriechend uweist fir en an z'entdecken GC mat verbessert Spezifizitéit an Empfindlechkeet z'identifizéieren VerfÜgung
1.1:. Réckbléck Kohort VerfÜgung
D'Etude Protokoll vun ofgeseent gouf d'Chinese IFLA- Comité vun Human Resources bei der zweeter Military Medical Universitéit. Schrëftlech informéiert Averständnes war vun der Patiente an der gesond Kontrollen kritt. VerfÜgung
Am Ganzen, 247 Patienten mat GC (n = 138) oder atrophic gastritis (n = 109) waren tëscht 2010 agestallt an 2012. D'Diagnosen fir all d'Coursë Patienten goufen histopathologically vun 2 pathologists um Changhai Spidol, Second Military Medical University (Shanghai, China) confirméiert. An der Kontroll haten, 128 age- a Sex-stemmt gesond Fräiwëlleger (Krankheet-gratis) sech während der selwechter Zäit wéi iwwregens. Déi heeschen Alter an d'Geschlecht Verdeelung waren am 3 Gruppen iwwereneestëmmen. E Resumé vun den Patient Daten ass an Table 1. GC Patienten gëtt, déi aus der Etude ausgeschloss preoperative radiotherapy, Chimiotherapie goen, oder chemoradiotherapy dobäi waren.
Mëttler ± Fils oder Nr (%) VerfÜgung charakteristesche
Control (n = 128) VerfÜgung Atrophic Gastritis (n = 109) VerfÜgung GC (n = 138) VerfÜgung Age, y50.10 ± 5.9552.11 ± 6.2951.01 ± 6.01Men75 (58,59) 60 ( 55,05) 70 (50,72) CEA-positiv 5 (3,91) 23 (21,10) 62 (44,93) CA19-9-positiv 11 (8,59) 20 (18,35) 53 (38,41) CA125-positiv 7 (5,47) 10 (9,17) 28 (20.29) CA72-4-positiv 8 (6,25) 12 (11,01) 22 (15,94) TNM stageI22 (15.94) II28 (20.29) III63 (45.65) IV25 (18.12) Table 1. Charakteristiken vun der Formatioun Grupp. VerfÜgung Croix : GC, gastric carcinoma; Fils, Norm deviation. CSV Luet CSV
Eng total vun 60 Patiente (20 vun all Grupp) goufen aus der 3 Gruppen ausgewielt uewe fir Retrospektiv Kontrollen beschriwwen; déi reschtlech Patienten (n = 315) waren am Training Formatioun ze bauen d'diagnostic Modell mat abegraff. Während den 2 Joer vun der Etude, 40 vun den 138 Patienten mat GC am Training Grupp sech virun iwwerwaacht an der curative Agrëff, baséiert op Disponibilitéit. Den Training Grupp abegraff 118 Patienten mat GC, 89 Patiente mat atrophic gastritis, an 108 gesond Kontrollen. VerfÜgung
schafft a Krankheete Daten fir all d'Participanten aus Medeziner medezinesch records kritt huet, wirklech Rapporten, an perséinlech Interviewen. D'Daten gesammelt abegraff Geschlecht, Alter, an gastric Kriibs Funktiounen (wéi entholl Standuert, histologic Schouljoer, Déift vun Invasioun, an lymph Node Metastasen). Serum Echantillon waren ier chirurgesch resections kritt; dës Echantillon sech aus ganz Blutt gesammelt e Liewesniveau Protokoll benotzt, fir 20 Minutten am 10,000xg centrifuged, an bei -80 ° C gespäichert. Krankheet Werdegang vun de GC Patienten war no séiert fir d'siwent Editioun vun der American Gemeinsam Comité [14]: 20 Patienten (16.95%) haten Etapp ech Krankheet, 25 (21.17%) haten Etapp II Krankheet, 54 (45.76%) haten Etapp III Krankheet, an 19 (16.10%) haten Etapp IV Krankheet VerfÜgung
1.2:. spéit Kohort VerfÜgung
fir d'predictive Wäert vun den uewe beschriwwen, an der Retrospektiv Etude etabléierten Modeller diskutéieren, mir elo propagéieren eng zousätzlech Kohort (n = 60) vu Patienten mat GC (n = 20) oder atrophic gastritis (n = 20) an vun gesond Persounen (n = 20) vum Mee 2012 bis November 2012 um selwechte Spidol. D'Prozeduren an Strategien waren déi selwecht wéi déi uewen beschriwwen VerfÜgung
1,3:. Ray Echantillon VerfÜgung
Ray Echantillon vun 20 vun den 138 GC Patiente kritt huet; 2 eraus, eng entholl an eng bascht Otemschwieregkeeten Echantillonen, sech geholl. D'Otemschwieregkeeten Echantillon (ongeféier 1 cm 1,4:. Routine ze erkennen entholl lues VerfÜgung Routine entholl Bewaacher assays sech mat normalen Methoden standing an reagents . CEA an CA19-9 Niveauen sech op eng Abbott I2000 alles, an CA72-4 an CA125 Niveauen mat engem Roche Cobas E601 gemooss. De präventive Nivo'en vun den Hiersteller ze recommandéieren fir CEA, CA19-9, CA125 an CA72-4 sech 5.0 μg /L, 39 U /L, 40 U /ml an 9,8 U /ml, bzw.. D'assays waren am Departement vun schafft Medezin, Changhai Spidol, Zweete Military Medical University, Shanghai standing VerfÜgung 1,5:. Serum FAQ N-Glycan profiling VerfÜgung Serum FAQ N-glycan analyséiert goufen gesuergt wéi virdru beschriwwen [13]. Kuerz, mat 8-aminonaphtalene-1,3,6-trisulphonic Seier aus der Proteinen mat peptide-N-glycosidase F (PNGase F) (New England Biolabs, Boston, MA) Fortgeschratten Verëffentlechung der N-glycans zu 2 μL vun serum sech (Invitrogen, Karlsbad CA). Sialic Seier war mat geläscht arthrobacter ureafaciens VerfÜgung sialidase (Roche Bioscience, gekësst Alto, CA), an de Filteren Echantillon waren DSA-FACE Technologie analyséiert benotzt op enger capillary electrophoresis-baséiert ABI3130 genetesch Organer (Obwuel Biosystems, Foster Stad , CA). Den 9. héchste Moundalpen datt an all d'Echantillonen fonnt goufen (ausmaachen > 90% vun der aktiver serum N-glycans) benotzt GeneMapper (Obwuel Biosystems) analyséieren. All N-glycan Struktur gouf, déi norméierend seng Héicht un der Zomm vun de Spëtzte vun all de Moundalpen numerically beschriwwen, an mir analyséiert dës Daten benotzt SPSS 18,0 statistesch Software (SPSS Galaxy Chicago, IL). VerfÜgung 1,6 : Ray FAQ erauszéien a lectin blotting VerfÜgung sech D'Stoffer homogenized engem Zement an pestle benotzt an lysis gefiermt mat engem protease inhibitor Cocktail (Roche kinnt, Meylan, Frankräich) resuspended. D'unlysed Ëmwandlung war vun centrifugation (bei 4 ° C fir 10 Minutten zweemol um 12000xg) geläscht. D'Konzentratioun vun soluble FAQ war mat der BioRad assay (BioRad, Marnes-la-Coquette, Frankräich) alles, an d'Echantillonen bei -80 ° C gespäichert goufen. VerfÜgung Am Ganzen, 25 μg vun serum FAQ oder 50 μg vun FAQ aus gefruerenem Otemschwieregkeeten ofgebaut gouf vun 10% Natrium dodecyl sulfate-polyacrylamide gelies electrophoresis getrennt. D'gels sech mat CBB G250, oder d'Proteinen am gelies Kierchefënster sech zu engem nitrocellulose Membran (Whatman /Schleicher & Schuell, Versailles, Frankräich) transferéiert Kär-fucosylated Proteinen ze entdecken. D'Schläimhait sech Nuecht op 4 ° C mat 5% Bovine serum albumin zu Tris-gefiermt Salins (TBS: 140 mm NaCl an 10 mm Tris-HCl) gespaart an dann fir 1 Stonn bei Raumtemperatur mat 5 μg /ml vun biotinylated Lëns incubated Culinaris agglutinin a (LCA) (Vecteure Laboratoiren, Burlingame, CA) zu TBS mat 0,05% Tween-20 (TBST). No 4 Mëtten vun 10 Minutten all mat TBST, goufen d'Schläimhait mat IRDye 800CW Streptavidin incubated (1: 10.000; LI-Cor Biosciences, Lincoln, héich) fir 1 Stonn bei Raumtemperatur, gewäsch 4 Mol mat TBST, an entwéckelt mat der Odyssee fonnt Infraroutemissiounen Imaging System (LI-Cor Biosciences). Sidd albumin (Fläch, St. Louis, MO) war als negativ Kontroll fir de lectin blot benotzt VerfÜgung 1,7:. Total RNS erauszéien aus Otemschwieregkeeten a grouss real-Zäit Hinnen alleguer VerfÜgung RNS ofgebaut gouf aus gefruerenem Stoffer enger QIAGEN RNeasy Mini Kit Hëllef no der Uweisunge d'Hiersteller (QIAGEN GmbH, Hilden, Däitschland). De Rengheet an Konzentratioun vun den RNS sech mat engem spectrophotometer (Eppendorf, Hamburg, Däitschland) alles. cDNA war vun 2 μg vun insgesamt RNS mat engem ëmgekéierte Transkriptiouns reagent (Toyobo, Rekorder, Japan) Wierderbuch. D'primers benotzt entworf Primer Express (Obwuel Biosystems), an de Message sinn an Table 2. VerfÜgung Gene VerfÜgung Stiermer Primer (5'-3) virgestallt VerfÜgung Réckproduktioun Primer (5'-3) D'cDNAs sech zu enger Obwuel Biosystems 7300 Real-Time Hinnen alleguer Maschinn an engem total Reaktioun Volume vun 20 μL Implikatioune verstärkt, datt 10 μL vun 2x Fast SYBR Green Master Mix (Obwuel enthale Biosystems, ëmfaasst Fast-Start Taq DNA polymerase Reaktioun gefiermt), de deoxynucleotide Adenosintriphosphat Mëschung (dorënner deoxyuridine Adenosintriphosphat, SYBR Green ech hannendrun, an MgCl2), an 2 μL vun der primers fir all Gentherapie (bei engem Finale Konzentratioun vun 0,5 μΜ all) . All Reaktioun war zu triplicate gesuergt. D'Hinnen alleguer Vëlo ware wéi follegt zesummen: denaturation bei 95 ° C fir 5 Minutten duerno vun 40 Zykle vun 95 ° C fir 15 Sekonnen, 59 ° C oder 55 ° C fir 15 Sekonnen, an 72 ° C fir 45 Sekonnen VerfÜgung. d'famill Ausdrock vun α-1,6-fucosyltransferase (Fut8) an guanosine diphosphate (PIB) -fucose Fernsehn (PIB-fuc-TR) an all Prouf war normalized fir d'Expressioun vun der GAPDH housekeeping Gentherapie vun der loung subtracting Zyklus (Kosovo) Wäert vun GAPDH aus, datt vun Fut8 oder PIB-TR (ΔCt). Déi fantastesch Ënnerscheed war vun subtracting der ΔCt vum Test kennt aus, datt vun der Kontroll Prouf berechent der ΔΔCt an dono de 2 ^ -ΔΔCt ze kréien. Threshold Zyklus Wäerter iwwer 40 geknuppt ënnert d'Magnéitfeld Niveau considéréiert. Schocken Kéiren kritt huet fir all Reaktioun ze garantéieren, dass en eenzelt Produit Implikatioune war VerfÜgung 1.8:. Statistique Analyse VerfÜgung All déi grouss Verännerlechen goufen als déi mengen ± normale deviation ausgedréckt, wann et net anescht uginn. Déi grouss Verännerlechen sech Verglach Student d'T-Test mat Analysë vun Varianz, oder nonparametric Tester. Pearson d'Korrelatioun Ech an de verbonne Wahrscheinlechkeeten (P) sech benotzt der kennenzeléieren tëscht de Parameteren ze zéien; Spearman d'Korrelatioun Ech goufen fir ordinal Diskussioun Verännerlechen berechent. Roman glycan biomarkers sech bestëmmt an charakteriséiert op engem Stiermer stepwise Logistikzenter Réckgang Analyse baséiert. D'diagnostic Leeschtung vun eenzelne biomarkers a vun der diagnostic Modeller war mat ROC rop Analyse bewäert. Der Sensibilitéit, Spezifizitéit, positiv predictive Wäert (PPV), negativ predictive Wäert (NPV), a Genauegkeet benotzt optimal cutoff Wäerter vun der ROC Kéiren ausgewielt berechent. All d'Untersuchungshaft P Wäerter sinn 2-tailed, an P Wäerter &Si besteet; 0,05 waren statistesch relevant considéréiert. Statistesch analyséiert goufen benotzt SPSS 18,0 fir Windows (SPSS Galaxy) standing VerfÜgung 2.1:. Verschidde N-Glycan Profiler an Patienten mat GC oder atrophic gastritis a gesond Kontrollen VerfÜgung Ausschöpfung DSA-FACE Technologie, iwwerpréift mir der N-glycan Profiler an Patienten mat GC (n = 118) oder atrophic gastritis (n = 89) an an gesond Persounen (n = 108). Mir laachen an statistesch de Moundalpen der 3 Gruppen Verglach. Op d'mannst 9 N-glycan Strukturen (Bierger) waren an all d'Echantillonen (Dorënner 1) identifizéiert. VerfÜgung CALLEWAERT et al an Liu et al virdrun eng strukturell Analys vun dësen N-glycans publizéiert [15,16]. D'Moyenne relativ Heefegkeet vun dësen N-glycan Strukturen ass an Table 3. D'Heefegkeet vun de Strukturen an de Moundalpen nëmmen 1, 2, 3, 5, 6, 7, virgestallt an 9 war vill verschidde am GC, atrophic gastritis, a gesond Kontroll Gruppen, beweist dass verschidden N-glycan Musteren ënner verschiddene Konditiounen pathophysiological vierdrun. Am Verglach mat de gesond Kontroll Grupp, Moundalpen nëmmen 1, 2, 5 an 9 eropzesetzen (P &Si besteet; 0,05) an de Moundalpen nëmmen 3, 6 a 7 waren an der GC Grupp (P &Si besteet; 0.001) ofgeholl. D'Heefegkeet vun de Strukturen an de Moundalpen nëmmen 3, 5, 6, 7, an 9 war vill verschidde am GC Grupp am Verglach mat der atrophic gastritis Grupp (Dorënner 2). 2,2: Bau- a Evaluatioun vun engem diagnostic Modell baséiert op N-Glycan lues gastric Kriibs Patienten ze differenzéieren aus gesond Kontrollen VerfÜgung Mir évaluéiert de GC-Zesummenhang N-glycan hire Restaurant baséiert op engem Logistikzenter Réckgang Analyse. Logistic Réckgang Ech sech ëm d'Chance nennen fir jiddwereng vun den onofhängege Verännerlechen ze schätzen. D'GCglycoA mathematic Formule war de GC Patienten aus der gesond Kontrollen (GCglycoA = -1.072 + 0.957 * peak4-0.331 * peak6 + 0.646 * peak9) differenzéiert gebaut. Fir d'Fähegkeet vun GCglycoA, CEA, CA19-9, CA125 an CA72-4 bewäerten ze GC Patienten diskriminéieren, zeechne mir der Géigend ënner dem ROC Kéiren (AUC). Verglach mat CEA (AUC = 0.74), CA19-9 (AUC = 0.76), CA125 (AUC = 0.72) an CA72-4 (AUC = 0.67), GCglycoA méi wierksam ënnerscheeden GC Patienten aus normal Kontrollen (AUC = 0.88) an der Training Grupp (Dorënner 3A). Table 4 Lëschten der Empfindlechkeet, Spezifizitéit, PPV, NPV, a Genauegkeet fir d'Cepheid vun GC vun CEA, CA19-9, CA125, CA72-4 an GCglycoA. CEA um recommandéiert Wäert vun 5.0 Dummeldéng /ML eng Empfindlechkeet vun 45,76% haten, 37 U /ML CA19-9 eng Empfindlechkeet vun 38,14% haten, 40 U /ML CA125 haten eng Empfindlechkeet vun 18,64%, an 9,8 U /ML CA72- 4 haten eng Empfindlechkeet vun 13,56%. Eng optimal cutoff Wäert vun -0,772 war fir GCglycoA baséiert op der ROC rop Analyse ausgewielt. Op dëser cutoff Wäert, déi GCglycoA eng Empfindlechkeet vu 75,42%, wat eng Erhéijung vun der Empfindlechkeet vun 29,66% ass, 37,28%, 56,78% an 61,86% am Verglach mat CEA, CA19-9, CA125 an CA72-4, bzw.. D'diagnostic Richtegkeet vun GCglycoA am GC Patienten aus gesond Kontrollen fräi vun 10,62%, 16,82%, 25,67% an 28,76% am Verglach mat CEA, CA19-9, CA125 an CA72-4 aneren, bzw.. Wann de Modell fir d'Retrospektiv Confirmatioun Grupp applizéiert gouf, huet d'Empfindlechkeet 45,00%, 45,00%, 55,00% an 55,00% an der Genauegkeet fräi 15.00% 17.50% 20.00% an 20.00% am Verglach mat CEA, CA19-9, CA125 an CA72-4, bzw. (Table 5). VerfÜgung Cutoff Wäert VerfÜgung Richteg Status, Nr vun Sujeten D'mèi Evaluatioun uginn, datt d'Empfindlechkeet 65,00% verbessert, 65,00%, 85,00% an 80,00% an der Genauegkeet verbessert 30,00%, 27,50%, 37,50% an 37,50% am Verglach mat CEA, CA19-9, CA125 an CA72-4, bzw. (Table 6). VerfÜgung Cutoff Wäert VerfÜgung Richteg Status, Nr vun Sujeten 2,3: Bau- a Evaluatioun vun engem diagnostic Modell gastric Kriibs aus atrophic gastritis VerfÜgung differenzéiert engem Logistikzenter Réckgang Modell benotzt, aner diagnostic Modell (GCglycoB) war tëscht GC an atrophic gastritis differenzéiert gegrënnt: GCglycoB = 5.273-1.371 * peak2 + 0.781 * peak4-0.453 * peak6 + 0.221 * peak9. Déi optimal cutoff Wäert fir GCglycoB (0.594) war baséiert op der ROC rop Analyse ausgewielt. Am Training Grupp, huet de AUC fir GCglycoB 0,82 hierkommen d'AUCs fir CEA, CA19-9, CA125 an CA72-4 0,65 waren, 0,63, 0.69 an 0,64, respektiv (Dorënner 3B). D'diagnostic Richtegkeet vun GCglycoB am GC aus atrophic gastritis aneren huet 21,26%, 24,64%, 31,40% an 34,30% an der Empfindlechkeet fräi 27,97%, 35,59%, 55,09% an 60,17% am Verglach mat CEA, CA19-9, CA125 an CA72- 4, respektiv (Table 7). An der Confirmatioun Grupp, representéiert d'85,00% Genauegkeet vun GCglycoB eng Hausse vun 40,00%, 45,00%, 65,00% an 55,00% an der 85,00% Empfindlechkeet uginn eng Erhéijung vun 22.50%, 22.50%, 30,00% an 30,00% am Verglach mat CEA, CA19-9, CA125 an CA72-4, bzw. (Table 8). VerfÜgung Cutoff Wäert VerfÜgung Richteg Status, Nr vun Sujeten An der mèi Grupp, GCglycoB méi korrekt war (85.00% vs. 30,00%, 30,00%, 10.00% an 15.00%) a sensibel (90.00% vs. 62,50%, 62,50%, 55,00% an 55,00% ) wéi CEA, CA19-9, CA125 an CA72-4, bzw. (Table 9). VerfÜgung Cutoff Wäert VerfÜgung Richteg Status, Nr vun Sujeten 2,4: Ofgeholl Niveau vun insgesamt Kär-fucosylated Proteinen am gastric Kriibs VerfÜgung D'Gesamt vun Kär α-1,6-fucose Reschter (d'Zomm vun de Moundalpen nëmmen 1, 2, 3, 4 , 6 a 7) war wesentlech méi déif (P &Si besteet; 0,001; Table 2) an GC Patiente wéi zu atrophic gastritis Patienten an normal Kontrollen. Fir dëst ze fannen confirméieren, évaluéiert mir d'Konzentratioun vun Kär fucosylated Proteinen am serum an Otemschwieregkeeten vun Patienten mat GC LCA benotzen well et speziell glycoproteins erkennt mat α-1,6-fucosylated-N-acetyl-D-glucosamine-asparagine (GlcNAc- ASPLanguage) an der trimannosyl Kär. An serum, waren et der manner LCA-verbindlech Kär fucose Reschter vun der GC Grupp wéi am atrophic gastritis an normal Gruppen (Dorënner 4A). D'total Kär fucose Iwwerfloss war ënneschten an GC erhéijen wéi an vläit bascht Otemschwieregkeeten (Dorënner 4B). Fir festzestellen, ob de Klimawandel an total Kär fucosylation am GC erhéijen huet geännert glycosylation biosynthesis Zesummenhang, d'Heefegkeet vun mammalian α-1,6-fucosyltransferase (Fut8) an guanosine diphosphate Fernsehn (PIB-TR) zu GC erhéijen an bascht Otemschwieregkeeten gouf analyséiert vun RT-Hinnen alleguer. D'Resultater Teamchef Fut8 mRNA Ausdrock niddreg zu erhéijen wéi zu bascht Otemschwieregkeeten (Dorënner 4C). Allerdéngs war et kee groussen Ënnerscheed zu guanosine diphosphate (PIB) -fucose Fernsehn (PIB-fuc-TR) Gentherapie Ausdrock tëscht erhéijen an bascht Otemschwieregkeeten (Dorënner 4D) VerfÜgung 2,5:. Neierung an N-Glycan lues virun an der curative Agrëff VerfÜgung d'Heefegkeet vun de Strukturen an de Moundalpen nëmmen 1, 4, an 9 war vill verschidden der Chirurgie am Verglach mat virun Chirurgie (Table 10). D'Resultater uginn, datt d'Luucht am Kär fucosylated hierstellen (Héichpunkt 3) a Ganzen Kär fucosylated N-glycans (sumfuc) huet no Chirurgie réckgängeg. Zéng Wochen nom Agrëff, gouf de GCglycoA Wäert negativ zu 11 vun den 40 Patiente mat GC, wéi d'GCglycoB Wäert huet an 22 vun de 40 Patienten mat GC. 2,6: kennenzeléieren tëscht der diagnostic Modeller an de Medeziner Parameteren VerfÜgung Momentan, déi entholl biomarkers CEA, CA19-9, CA125 an CA72-4 gi fir d'Kontroll an Iwwerwaachung vun GC oft benotzt. Dofir, mir der kennenzeléieren tëscht den eenzelne N-glycan lues alles (dorënner de diagnostic Modellen), de entholl biomarkers an der TNM Etapp. VerfÜgung D'Resultater uginn, datt nëmmen d'TNM Etapp positiv mat GCglycoA verbonne war (r = 0,355, P &Si besteet; 0.001) an GCglycoB (r = 0,345, P &Si besteet; 0.001) (Table 11). D'Heefegkeet vun de Strukturen an de Moundalpen nëmmen 6 a 9 war vill verschidden tëscht TNM Etappen (Table 12). VerfÜgung Korrelatioun
Fut85'CCTGGCGTTGGATTATGCTCA 3'5'CCCTGATCAATAGGGCCTTCT 3'GDP-Tr5'CTGCCTCAAGTACGTCGGTG 3'5'CCGATGATGATACCGCAGGTG 3'GAPDH5'ATGGGGAAGGTGAAGGTCG 3'5'GGGGTCATTGATGGCAACAATA 3'Table 2. Polymerase Kette Reaktioun primer Pair Message VerfÜgung Croix:. A , adenosine; C, cytidine; G, guanosine; T, thymidine; Fut8, fucosyltransferase; PIB-TR, guanosine diphosphate-fucose Fernsehn CSV Luet CSV Resultater VerfÜgung
Also ± Fils
VerfÜgung verännerleche VerfÜgung Control (n = 128) VerfÜgung Atrophic Gastritis (n = 108) VerfÜgung GC (n = 138) VerfÜgung F
P
Age, y
Test VerfÜgung GC +
GC- VerfÜgung Sensibilitéit,% VerfÜgung Spezifizitéit,% VerfÜgung PPV,% VerfÜgung NPV,% VerfÜgung Richtegkeet,% VerfÜgung CEA (5 Dummeldéng /ml) GC + 54545.7695.3791.5361.6869.47 GC-64103CA19-9 (37 U /ml) GC + 451038.1490.7481.8257.3163.27GC-7398CA125 (40 U /ml) GC + 22718.6493.5275.8651.2754.42GC-96101CA72-4 (9,8 U /ml) GC + 16813.5692.5966.6749 .5151.33GC-102100GCglycoA (-0.77) GC + 891675.4285.1984.7676.0380.09GC-2992Table 4. d'Diagnostic Power fir aneren Gastric Carcinoma vun de Kontrolle vun den Training Group VerfÜgung Croix: + positiv;. - Negativ; GC, gastric carcinoma; GCglycoA, N-glycan Bewaacher-baséiert gastric Kriibs diagnostic Modell A; NPV, negativ predictive Wäert; PPV, positiv predictive Wäert. CSV Luet CSV Cutoff Wäert VerfÜgung Richteg Status, Nr vun Sujeten
Test VerfÜgung GC + VerfÜgung GC- VerfÜgung Sensibilitéit,%
Spezifizitéit,% VerfÜgung PPV,% VerfÜgung NPV,% VerfÜgung Richtegkeet,% VerfÜgung CEA (5 Dummeldéng /ml) GC + 8040.00100.00100.0062.5070.00GC-1220CA19-9 (37 U /mL GC) + 8140.0095.0088.8961.2967.50GC-1219CA125 (40 U /ml) GC + 6030.00100.00100.0058.8265.00GC-1420CA72-4 (9,8 U /ml) GC + 6030.00100.00100.0058.8265.00GC-1420GCglycoA (-0.77) GC + 17385.0085.0085.0085.0085.00GC-317Table 5. d'Diagnostic Power fir aneren Gastric Carcinoma aus der Kontrolle vun de Réckbléck Préifen Group VerfÜgung Croix:. + positiv; - Negativ; GC, gastric carcinoma; GCglycoA, N-glycan Bewaacher-baséiert gastric Kriibs diagnostic Modell A; NPV, negativ predictive Wäert; PPV, positiv predictive Wäert. CSV Luet CSV
Test VerfÜgung GC + VerfÜgung GC- VerfÜgung Sensibilitéit,%
Spezifizitéit,% VerfÜgung PPV,% VerfÜgung NPV,% VerfÜgung Richtegkeet,% VerfÜgung CEA (5 Dummeldéng /ml) GC + 6130.0095.0085.7157.5862.50GC-1419CA19-9 (37 U /mL GC) + 6030.00100.00100.0058.8265.00GC-1420CA125 (40 U /ml) GC + 2010.00100.00100.0052.6355.00GC-1820CA72-4 (9,8 U /ml) GC + 3115.0095.0075.0052.7855.00GC-1719GCglycoA -0.77GC + 19295.0090 .0090.4894.7492.50GC-118Table 6. d'Diagnostic Power fir aneren Gastric Carcinoma vun de Kontrolle vun den spéit Préifen Group VerfÜgung Croix:. + positiv; - Negativ; GC, gastric carcinoma; GCglycoA, N-glycan Bewaacher-baséiert gastric Kriibs diagnostic Modell A; NPV, negativ predictive Wäert; PPV, positiv predictive Wäert. CSV CSV Luet
Test VerfÜgung GC + VerfÜgung GC- VerfÜgung Sensibilitéit,% VerfÜgung Spezifizitéit,% VerfÜgung PPV,% VerfÜgung NPV,% VerfÜgung Richtegkeet,% VerfÜgung CEA (5 Dummeldéng /ml) GC + 541945.7678.6573.9752.2459.90GC-6470CA19-9 (37 U /ml) GC + 451738.1480.9072.5849.6656.52GC-7372CA125 (40 U /ml) GC + 22818.6491.0173.3345.7649.76GC-9681CA72-4 (9,8 U /mL ) GC + 16813.5691.0166.6744.2646.86GC-10281GCglycoB (0.594) GC + 88873.7391.0191.5872.3281.16GC-3081Table 7. d'Diagnostic Power fir aneren Gastric Carcinoma aus Atrophic Gastritis am Training Group VerfÜgung Croix:. + positiv; - Negativ; GC, gastric carcinoma; GCglycoB, N-glycan Bewaacher-baséiert gastric Kriibs diagnostic Modell B; NPV, negativ predictive Wäert; PPV, positiv predictive Wäert. CSV Luet CSV Cutoff Wäert VerfÜgung Richteg Status, Nr vun Sujeten
Test VerfÜgung GC + VerfÜgung GC- VerfÜgung Sensibilitéit,%
Spezifizitéit,% VerfÜgung PPV,% VerfÜgung NPV,% VerfÜgung Richtegkeet,% VerfÜgung CEA (5 Dummeldéng /ml) GC + 9445.0080.0069.2359.2662.50GC-1116CA19-9 (37 U /mL ) GC + 8340.0085.0072.7358.6262.50GC-1217CA125 (40 U /ml) GC + 4220.0090.0066.6752.9455.00GC-1618CA72-4 (9,8 U /ml) GC + 6430.0080.0060.0053.3355.00GC-1416GCglycoB (0.594) GC + 17385.0085.0085.0085.0085.00GC-317Table 8. d'Diagnostic Power fir aneren Gastric Carcinoma aus Atrophic Gastritis am Réckbléck Préifen Group VerfÜgung Croix:. + positiv; - Negativ; GC, gastric carcinoma; GCglycoB, N-glycan Bewaacher-baséiert gastric Kriibs diagnostic Modell B; NPV, negativ predictive Wäert; PPV, positiv predictive Wäert. CSV Luet CSV
Test VerfÜgung GC + VerfÜgung GC- VerfÜgung Sensibilitéit,%
Spezifizitéit,% VerfÜgung PPV,% VerfÜgung NPV,% VerfÜgung Richtegkeet,% VerfÜgung CEA (5 Dummeldéng /ml) GC + 6130.0095.0085.7157.5862.5GC-1419CA19-9 (37 U /mL ) GC + 6130.0095.0085.7157.5862.5GC-1419CA125 (40 U /ml) GC + 2010.00100.00100.0052.6355.00GC-1820CA72-4 (9,8 U /ml) GC + 3115.0095.0075.0052.7855.00GC-1719GCglycoB (0.594) GC + 17185.0095.0094.4486.3690.00GC-319Table 9. d'Diagnostic Power fir aneren Gastric Carcinoma aus Atrophic Gastritis am spéit Préifen Group VerfÜgung Croix:. + positiv; - Negativ; GC, gastric carcinoma; GCglycoB, N-glycan Bewaacher-baséiert gastric Kriibs diagnostic Modell B; NPV, negativ predictive Wäert; PPV, positiv predictive Wäert. CSV CSV Luet
Mëttler ± Fils oder Paracetamol (interquartile Gamme)
T VerfÜgung Azeton VerfÜgung verännerleche VerfÜgung ier befënnt VerfÜgung No befënnt
P
Peak 1
CEA VerfÜgung CA19-9 VerfÜgung CA125 VerfÜgung CA72-4
TNM Etapp VerfÜgung GCglycoA VerfÜgung GCglycoB VerfÜgung Peak 1r
0.210a0.127a0.006a-0.023a0.088a0.250b0.055bP
0.0160.1480.9440.7930.3160.0040.532Peak 2r
0.009a0.038a0.011a-0.067a0.010a0.224b-0.099bP
0.9170.6670.9040.4450.9060.0100.258Peak 3r
0.083a0.094a0.066a0.039a-0.115a-0.216b-0.346bP
0.3480.2860.4550.6540.1930.013<0.001Peak 4r
-0.045a0.160a0.047a-0.006a-0.091a0.122b0.074bP
0.6130.0680.5940.9430.3010.1670.403Peak 5r
-0.029a-0.156a-0.020a0.097a0.108a0.299b0.478bP
0.7430.0760.8160.2700.2180.001<0.001Peak 6r
0.009a0.020a0.044a-0.114a-0.348a-0.757b-0.787bP
0.9210.8170.6180.197<0.001<0.001<0.001Peak 7r
-0.039a0.089a-0.075a-0.161a-0.245a-0.368b-0.517bP
0.6580.3110.3940.0660.005<0.001<0.001Peak 8r
-0.135a-0.058a0.002a-0.087a-0.035a-0.215b0.011bP
0.1240.5130.9840.3210.6920.0140.897Peak 9r
0.028a-0.072a-0.034a0.095a0.315a0.794b0.591bP
0.7510.4130.7030.280<0.001<0.001<0.001GCglycoAr
-0.033b-0.042b-0.012b0.046b0.355b10.869bP
0.7100.6370.8960.605<0.001<0.001GCglycoBr
-0.052b-0.045b0.027b0.105b0.345b0.869b1P
0.5580.6110.7600.232<0.001<0.001Sumfuccr
0.061a0.151a0.040a-0.108a-0.170