Gastric Kriibs dorënner de Cardia an Net-Cardia Zorte ass déi zweet heefeg Ursaach vum Kriibs-Zesummenhang Doudesfäll weltwäit. En Ziel vun Net-Cardia gastric Kriibs genetesch waat loci goufen ënner asiatësch duerch Nepgen-grouss association Studien (GWASs) Déclaratioun. Dës Etude huet d'Auswierkunge vun eenheetlechen Nukleotid schiefgang (SNPs) vun laang intergenic Net-coding RNAs (lincRNAs) op Net-Cardia gastric Kriibs waat an Chinese Populatiounsschichte ze diskutéieren. Mir ausgewielt laang intergenic noncoding RNAs (lincRNAs) an Net-Cardia gastric Kriibs Risiko-Zesummenhang loci an identifizéiert 10 SNPs innerhalb lincRNA exonic Regiounen. Mir iwwerpréift ob genetesch schiefgang zu lincRNAs exons mat Net-Cardia gastric Kriibs Risiko vun 438 Net-Cardia Chinese Populatiounsschichte gastric Kriibs Patienten an 727 Kontroll Sujeten am Logistikzenter Réckgang mat verbonne sinn. Funktionell Relevanz gouf weider vun biochemical assays iwwerpréift. Mir hu fonnt, datt lincRNA-NR_024015 VerfÜgung rs8506AA gouf vill mat Risiko vun Net-Cardia gastric Kriibs (seng Chance Verhältnis verbonne war [ODER] = 1.56, 95% CI = 1.03-2.39, am Verglach mat der rs8506 AG oder GG . genotype weider stratification Analyse gewisen, datt de Risiko Effet vun subgroups vun Fëmmerten méi ausgeschwat gouf ( P VerfÜgung = 0.001) Biochemical Analyse bewisen, datt d'G zu eng huel änneren um rs8506G &plain. E der bindend Site fir has- desorganiséieren . Mir-526b, domat d'transcriptional Aktivitéit vun beaflossen lincRNA-NR_024015 VerfÜgung an déi Zell Prolifératioun Eis presentéieren Etude engem sécherlech Associatioun tëscht der rs8506G etabléierten > a polymorphism am lincRNA-NR_024015 VerfÜgung Exon an de Risiko vun Net-Cardia gastric Kriibs VerfÜgung Fro: Fan Komme, Yu R, Huang WX, CUI XX, Luo BH, Zhang LY (2014) d'ass-mir-526b bindend-Site rs8506G > A Polymorphism. am lincRNA-NR_024015 VerfÜgung Exon identifizéiert vun GWASs Predispose zu non-Cardia Gastric Cancer Risk PLoS NËMMEN 9 (3):. e90008. Doi: 10,1371 /journal.pone.0090008 VerfÜgung Redakter: Xiaoping Miao, Moe Key schafft vun Ëmwelt an Gesondheet, Schoul vun Ëffentlech Gesondheet, Tongji Medical College, Huazhong Universitéit vu Wëssenschaft an Technologie, China VerfÜgung Arnaque: 11. Dezember 2013; Akzeptéiert: 25. Januar 2014; Publizéiert: de 4. Mäerz 2014 zu Copyright: © 2014 Fan et al. Dëst ass eng oppen-Zougang Artikel ënnert de Bedingunge vun der Lizenz BY Creative Commons verdeelt, déi bereet benotzen Genehmegungen, Distributioun, an Reproduktioun vun all mëttelgrouss, gëtt d'Original Auteur an d'Quell Kaiser sinn VerfÜgung Funding:. Dës Etude ënnerstëtzt gouf vun der Suzhou sozial Entwécklung Fund Project (SS08047), Jiangsu Province de Key Medical Pompjeeën an 2011. d'funders hu keng Roll am Etude Design, Daten Kollektioun an Analyse, Décisiounen ze publizéieren, oder Virbereedung vun der mëttelalterlech Handschrëft. VerfÜgung Wettsträit Interessen: d'Auteuren hunn deklaréiert, datt keng Competitioun Interessen existéieren VerfÜgung Gastric Kriibs (GC) ass déi zweet Ursaach vum Kriibs weltwäit no haett Kriibs an 2010, obwuel veruerteelt Doudesfäll Virwaat Doud. liicht vun 774.000 hunn an 1990 bis ongeféier 755.000 am Joer 2010 erofgaangen [1], [2]. Epidemiological Studien hunn, datt Ëmwelt- Faktor gewisen, dorënner Ernährung, Tubak, Alkohol consumptions an, virun allem, Wonn mat Helicobacter pylori mat engem héichen Risiko fir GC verbonne sinn [3], [4]. Trotz dësen unerkannt Risiko Faktoren, iwwerzeegt Fuerscher nach déi genetesch Faktoren, besonnesch Single Nukleotid schiefgang (SNPs), wahrscheinlech eng wesentlech Roll an individuell d'Gefor vun den Entwécklungslänner gastric Kriibs wéi nëmmen eng Ëmwandlung vun ausgesat Persounen entwéckelen gastric Kriibs ze spillen [5] . VerfÜgung fir Datum, mat der Viraus vun transcriptome sequencing nächst Generatioun (RNS-weider), do e staarken Verréckelung gouf an eisem ganze Set vun transcriptional geometrescher Figur vun enger Krankheet Versteesdemech, dorënner Roman gët an Net-coding RNAs (ncRNAs) net duerch konventionell Analysë [6] gemooss - [9]. Vun all de Moment charakteriséiert Klassen vun Net-coding RNAs Molekülle, hunn dës laang genannt gouf Matsproocherecht ncRNAs (lincRNAs) méi wéi 200 nucleotides (NG) dass oppener liesen Rumm sinn opgepasst an net FAQ-coding Genen [7] iwwerlageren, [10]. [15] - Gruppe vun lincRNAs gewiescht ze soll mat wichteg bewosst Prozesser gewëssermoossen an Gewise wéi imprinting, X chromosome inactivation, pluripotency Ënnerhalt, an transcriptional Regulatioun [10] gutt charakteriséiert. Doriwwer eraus, hunn uginn Beweiser vun dysregulated lincRNA Ausdrock vun villen Cancers lincRNA als neien Aspekt vun der Biologie Gedenkminutt, mat Beweiser suggeréiert, dass eng gréisser Roll fir d'Bedeelegung vun lincRNA zu Mënsch tumorigenesis an Metastasen [16], [17]. Iwwerhaapt, e gutt beschriwwen Beispill, HOTAIR VerfÜgung der Contributiounen zu de stepwise Werdegang vun tumorigenesis [11], [18] studéiert hunn, d'Roll vun lncRNAs zu Kriibs Biologie ervirhiewt. Ausserdeem, déi laang noncoding RNS MALAT1 VerfÜgung (Metastasen-verbonne haett adenocarcinoma ët 1), ass heefeg misregulation a wéi engem predictive Bewaacher fir eng Villfalt vu mënschlechen Cancers vun de Colon, Broscht an Aarbecht [19] - [ ,,,0],22]. Trotzdem, huet de Mechanismen déi spezifesch Funktioun vun lincRNAs zu Kriibs Entwécklung Basisdaten net voll delineated ginn. VerfÜgung An de leschte Joerzéngt, Multiple unbiased Nepgen-grouss association Studien (GWAS) hunn eis Verständnis vun genetesch Variatioune Zesummenhang mat verschiddene jorelaang Zorte vu Krankheeten an Cancers duerch héich duerch dat Technologien [23]; awer, op d'mannst een-Drëttel vun de identifizéiert Varianten sinn am Net-coding Intervalle [24]. Viru Kuerzem, datt zwee GWAS datt verschidden waat Risiko loci datt mat Net-Cardia gastric Kriibs (NCGC) Risiko vun enger chinesescher Populatioun verbonne sinn. Bioinformatik Analyse huet vill lincRNAs genotzt, fir dësen loci sënnlech. Doriwwer eraus, verschidde relevant Single Nukleotid schiefgang (SNPs) an der exonic Regioune vun lincRNAs etabléiert, datt mat NCGC sech identifizéiert Associé kann; Ee, huet de Veräin tëscht genetesch Variatioune vun lincRNAs exons a Kriibs waat selten gemellt ginn. VerfÜgung Am Moment studéieren, Hypothes mir dass SNPs an der exonic Regioun vun lincRNAs Niveauen Ausdrock verännert kann an domat NCGC bäidroen kënnen. Fir dëst Hypothes Test, mir gehaal engem Spidol-baséiert case-Kontroll Etude zu de Associatiounen tëscht deenen SNPs an waat fir NCGC an enger chinesescher Populatioun ermëttelen. VerfÜgung Sécuritéit Themen All Sujeten an der aktueller Etude goufen ethnically homogen Han Chinese dorënner 438 NCGC Patienten an 727 gesond Kontrollen. Patienten déi Agrëff bei der laizistesch Spideeler vun Soochow University (Suzhou) mécht sech noeneen vun 2003 bis 2009, mat enger Äntwert Taux vun 94% agestallt. Patienten goufen aus Suzhou Stad a seng Ëmfeld Regiounen, an do waren keng Alter, Geschlecht, an Histologie Restriktiounen. Detailer iwwer de Medeziner Charakteristike vun de Patienten sinn an Table 1. D'entholl zesummegefaasst, Node, Metastasen (TNM) Klassifikatioun an entholl Stadium bewäert goufen no der 2002 American Gemeinsam Comité op Cancer Stadium System. Populatioun Kontrollen waren Kriibs-fräie Leit zu Suzhou Regioun wunnen; se sech an der selwechter Period vun engem muss Ëmfro ausgewielt wéi de Fäll gesammelt goufen. D'Kontroll Echantillon waren eis aus virdrun Studien sinn déi zoufälleg aus enger Datebank ausgewielt goufen deemools vun 3500 Persounen baséiert op engem physeschen Ënnersichung [25] - [27]. D'Miessung vun serum H.pylori immunoglobulin G an NCGC Patienten a Kontrollen war vun Aktivitéit-Hausnummeren immunosorbent assay (Elisa) alles. Dës Etude gouf vun der medezinesch Ethik Comité vun Soochow University guttgeheescht. All d'Mataarbechter sech genetesch-stinn ethnesch Han Chinese a keen hat Blutt transfusion an de leschte 6 Méint. eng schrëftlech informéiert Erlaabnes kritt huet, war jidderee fir en Interview mat engem strukturéierte Questionnaire geplangte ausgewielt Informatiounen ze sammelen, an 5 ml Randerscheinung Blutt gespend. VerfÜgung SNP selektionéiert VerfÜgung All publizéiert Literatur eng enquêtéiert association tëscht genetesch waat an NCGC Risiko sech beliwwert. Mir gesichte fir Studien bis August 2013 d'PubMed Datebank an Web vun Science benotzt. Relevant Sichbegrëffer sech "Nepgen-grouss association Etude", "GWAS", "NCGC", "gastric Kriibs", "Mo. Kriibs", an "asiatësch". Mir gesichte och manuell d'Referenz Lëschten zu ausgewielt Artikelen. Mir ausgeschloss éischtens e puer Artikelen, déi Scannen d'Titelen an abstracts vun Etüden, déi net op Englesch geschriwwen huet. Dunn, no der voller Text vun der reschtlech Artikelen liesen, identifizéiert mir eng final Formatioun vun Etüden. All der gewielter Studien begéint den Kriteren: (1) d'Resultat war op GWAS propagéieren baséiert par rapport zu NCGC zu Mënschen; (2) d'Artikelen goufen an Englesch publizéiert; (3) waren d'läscht Studien ausgewielt ënnert Donnéeën phpNuke an verduebelt Donnéeën; (4) GWAS war mat Chip Technologie gehaal. Déi grouss Exklusioun Critèren sech (1) Kritik, Léierprogrammer, Bréiwer, an editorials; (2) zweete Donnéeën; (3) net e Fall-Kontroll Design; an (4) phpNuke Daten oder Donnéeën vun de leschten Rapporen gehéieren. Next, mir d'waat loci vun GWAS fir NCGC zu ausgewielt Artikelen identifizéiert Fliger, 4 lincRNAs datt net am entweder Richtung mat all unerkannt Genen bannent engem 1-MB Palett vun dësen loci, iwwerlageren huet (eng total span vun 2 MB) huet schlussendlech identifizéiert vun de Mënscherechter lincRNAs Datebank [28]. Ausserdeem, war fir Bioinformatik Analyse vun haplotype Spär baséiert op Chinesesch Han Peking (CHB) Populatioun Daten zu HapMap (HapMap Data Netflix 27 Phase II + III, Februar 2009, op der NCBI B36 Versammlung, dbSNP b126) Haploview Software 4.2 benotzt. Dës SNPs mat mannerjäregen allele Ofstänn vu méi wéi 5% vun der chinesescher Populatioun ofgebaut gouf. Et waren dräi haplotype Bleck an der chinesescher Bevëlkerung (Dorënner 1A). D'haplotype-IV Empfänger SNPs sech mat der Haploview Software 4.2 Tagger Programm ausgewielt; et war dat den rs11752896, rs11752942, rs4714336 an rs4711631 fonnt der haplotype zu Spär 1 bei engem 100% Frequenz Daach (rs11752896 an rs11752942: D '= 1.0, r Genotyping Analys VerfÜgung Genom DNA war vun Randerscheinung Blutt lymphocytes vun der Etude Sujeten ofgebaut. Allele-spezifesch MALDI-Ënnerportal Mass spectrometry war benotzt der lues an de Veräin agesat, fir genotype analyséiert, wéi virdru beschriwwen [27], [29]. Eng total vun 60 Echantillon waren zoufälleg fir direkt sequencing ausgewielt der genotyping Resultater aus der Mass spectrometric Analyse ze bestätegen, an d'Resultater sech zu 100% eens. Ongeféier 10% vun de Echantillon och sech fir e blinded widderhuelen vun der genotyping ouni Wësse vun der viregter genotyping Resultat oder de Status ausgewielt vun engem Fall a Kontroll haten, an d'Resultater sech zu 100% eens. VerfÜgung Zell Kultur VerfÜgung d'293T oder HGC-27 Zellen sech aus der Zell Bank vun Type Kultur Collection vun der chinesescher Akademie vun de Wëssenschaften, Shanghai Institut vun Zell Biologie kaaft, an sech fir manner ewéi 6 Méint passaged. D'293T oder HGC-27 Zellen sech am DMEM mat héijen Zocker (Gibco-BRL, Gaithersburg, MD, USA) oder RPMI 1640 mëttelfristeg mat 10% Hëtzt-inactivated An et Bovine serum (Gibco-BRL, Gaithersburg, MD, USA) ergänzt haten an 50 μg /ml streptomycin (Gibco-BRL, Gaithersburg, MD, USA) op engem 37 ° C an der Präsenz vun 5% CO 2. VerfÜgung Subcellular Zersteckelung VerfÜgung HGC- 27 Zellen sech zu engem humidified incubator cultured fir 2 Deeg. Fir subcellular Zersteckelung Experimenter, bis zu 2 × 10 A-silico VerfÜgung Cepheid vun gesait z'erreechen entschlof vun Rs8506G > a vun LincRNA-NR_024015 Well verschidde Strukturen, méi wichteg Roll an der biologescher Funktiounen ze spillen; also benotzt mir RNAfold an SNPfold algorithms der putative Afloss vun rs8506G > ze soe; A op d'lokal folding Strukture vun lincRNA-NR_024015 VerfÜgung vun der 61-BP Regiounen analyséiert d'polymorphism Reliefsailen VerfÜgung Bau vun. reporter Plasmids VerfÜgung zwee reporter plasmids mat 160 BP lincRNA-NR_024015 VerfÜgung Exon Regioun ofgesprengt Reliefsailen der rs8506G oder rs8506A allele vun der Genewiz Company Wierderbuch waren (Suzhou, China) an duerno an der psiCHECK- gekloonten 2 elementar Vecteure (Promega, Madison, allem) (Dorënner 1B). Déi doraus resultéierend bauen mat lincRNA-NR_024015 VerfÜgung rs8506 SNP (psiCHECK-2-lincRNA-rs8506G an psiCHECK-2-lincRNA- rs8506A) vun sequencing bestätegt gouf. VerfÜgung flüchteg Transfections an Luciferase Assays Bioinformatik Analyse verroden, datt de rs8506G > A polymorphism um bindend Site vun microRNA Geldautomat ass-mir-526b (http://snpinfo.niehs.nih.gov/). Doduerch, vun der mimics an inhibitors ass-mir-526b (GenePharma Co, Shanghai) sech applizéiert den Effet vun ass-mir-526b op psiCHECK-2-lincRNA-rs8506 reporter Genen kënschtlech VerfÜgung ze analyséieren. D'293T oder HGC-27 Zellen am 24-gutt Placke rakommen sech (1 × 10 Expression Vecteure Construction VerfÜgung weider ze studéieren der Roll vun lincRNA-NR_024015 VerfÜgung zu Kriibs Werdegang, déi vollzäit Längt cDNA vun lincRNA-NR_024015 VerfÜgung rs8506G an rs8506A alleles sech Wierderbuch vun der Genewiz Company (Suzhou, China) an dann gekloonten an der pcDNA3.1 vectors ausser. Déi doraus resultéierend bauen mat lincRNA-NR_024015 VerfÜgung rs8506 SNP (pcDNA-lincRNA-rs8506G an pcDNA-lincRNA-rs8506A) vun sequencing bestätegt gouf. VerfÜgung RNS Isolatioun a Chemeschen RT-Hinnen alleguer Analys VerfÜgung Drëssegjärege-zwee NCGC Otemschwieregkeeten uplanzen sech aus biopsies vun eenzelne Patiente kritt an bei -80 ° C virum Analyse gespäichert. Total RNS gouf aus dëse kriibserreegend Stoffer mat TRIzol reagent (cuisine Research Center, INC) kritt. cDNA war vun mRNA mat de zoufälleg primer an Superscript II (Invitrogen) laut den Hiersteller d'Protokoll entsteet. Real-Zäit grouss polymerase Kette Reaktioun (RT-Hinnen alleguer) war d'famill Gentherapie Ausdrock vu bis ofgedonkelt duerchgefouert lincRNA-NR_024015 VerfÜgung, eng Abi Prism 7500 Haaptrei erkennen System benotzt (Obwuel Biosystems) baséiert op der SYBR-grénge Method, an GAPDH VerfÜgung wéi eng intern Referenzmaterial Gentherapie zu all Reaktioun benotzt gouf. VerfÜgung Zell Iwwersiicht Assay VerfÜgung am 96-gutt, Flatscreen-bottomed Placke (BD Biosciences, Bedford , MA), 100 μL HGC-27 Zellen cotransfected mat pcDNA-lincRNA-rs8506SNP an ass-mir-526b oder Kontroll huet an all gutt aliquoted. Zell Nuetsvolen war vun Zell Counting gemooss Kit-8 (CCK-8) (Dojindo schafft, Kumamoto, Japan) baséiert op der Uweisungen d'Hiersteller. VerfÜgung statistique Analys VerfÜgung D'Ënnerscheeder vun de distributions vun ausgewielt demographesch Verännerlechen tëscht Fäll a kontrolléiert, souwéi d'allele an genotype Ofstänn sech duerch zwee-eesäitegen Chi-wäissfeldreg Tester évaluéieren. Geknäppt Logistikzenter Réckgang Modeller goufen benotzt mam Risiko vun gastric Kriibs duerch Chance nennen d'Associatiounen vun genotypes vun SNPs Devis (ODER) an hir 95% Vertraue Intervalle (Direktiven ugeet), gefollegt vun stratification Analyse vum Alter, Geschlecht, fëmmen an drénken Status. Logistic Réckgang haut kennt gouf am Trend Test benotzt, grad esou wéi d'Potential multiplicative an additive Gentherapie-Gentherapie an der Gentherapie-Ëmwelt- Faktor Interaktioune ze diskutéieren. Ausserdeem, goufen d'Donnéeë weider duerch Sous-Gruppen vun der Klinik-agebousst Verännerlechen stratified. Statistique Muecht war vun der Reegel PS Software berechnen (http://biostat.mc.vanderbilt.edu/twiki/bin/view/Main/PowerSampleSize, Rampen 14. Dez 2010). One-Manéier ANOVA Test benotzt war den Effet vun verschiddenen SNPs op den lincRNA-NR_024015 VerfÜgung ët Ausdrock ze diskutéieren. All Tester goufen zwee-eesäitegen vun der SAS Software benotzen (Versioun 9,1; SAS Institut, Cary, NC, USA). A P VerfÜgung &Si besteet;. 0,05 als Kritär fir statistesch Bedeitung benotzt gouf VerfÜgung Genotypes an Risk vun Non-Cardia Gastric Cancer VerfÜgung An der presentéieren studéieren, fënnef SNPs sech tëscht Fäll a Kontrollen genotyped. Wéi an Table 2 gewisen, war fir rs8506G > engem groussen Veräin mat NCGC Risiko observéiert; A. Speziell, awer d'Resultater vun genotyping dass am Verglach mat der rs8506GG oder AG genotype, lincRNA-NR_024015 VerfÜgung rs8506AA gouf vill mat Risiko vun Net-Cardia gastric Kriibs (seng Chance Verhältnis [ODER] = 1.56, 95% verbonne war CI = 1.03-2.39). Ausserdeem ware keng Differenze am anere véier SNPs iwwerpréift ( P VerfÜgung > 0,05). Sou, konnt mir dat genetesch Variant rs8506G > ofzeschléissen;. A polymorphism zu lincRNA-NR_024015 VerfÜgung zu mediating de Risiko vun NCGC eng wesentlech Roll spillt VerfÜgung Stratification Analys vun Rs8506G > A Genotypes an Risk vun NCGC VerfÜgung Mir standing weider engem stratification Analyse vun den Associatiounen tëscht Variant genotypes a Gefor vun NCGC vun subgroups vun clinicopathological Charakteristike vun NCGC vun dëser Etude. Wéi an Table 3 gewisen, war zu Themen mat fëmmen eng wichteg Associatioun tëscht der Variant genotypes an de Risiko vun NCGC observéiert (seng ODER = 2.48, 95% CI = 1.63-3.78, homogeneity Test P VerfÜgung = 0.001) , datt fëmmen suggeréiert modulates der Associatioun tëscht der lincRNA-NR_024015 VerfÜgung rs8506G &plain eng Variant genotypes an de Risiko vun NCGC. Nee groussen Veräin huet an aner subgroups fonnt. VerfÜgung bewosst Characterization vun LincRNA-NR_024015 D'Niveaue vun nuklearem Kontroll ët ( U6 VerfÜgung), cytoplasmic Kontroll ët ( GAPDH VerfÜgung mRNA), an lincRNA-NR_024015 VerfÜgung zu nuklear an cytoplasmic ufale vun HGC-27 Zellen vun RT-qPCR évaluéieren waren, respektiv. D'Resultater weisen, dass GAPDH VerfÜgung mRNA exklusiv am cytoplasmic Ëmwandlung nogewise gouf, iwwerdeems Keimzell-zréckbehalen U6 VerfÜgung Kannerbetreiung an der Nuklearenergie Ëmwandlung fonnt gouf. An lincRNA-NR_024015 VerfÜgung Ausdrock war Kannerbetreiung cytoplasmic (Dorënner 1B) VerfÜgung A-silico VerfÜgung Analys vum Effekt vun Rs8506G &plain. A vun LincRNA-NR_024015 Ausschöpfung RNAfold an SNPfold algorithms zu zu-silico VerfÜgung Analyse, mir virausgesot lokal strukturell Changementer vun lincRNA-NR_024015 VerfÜgung vun der rs8506G > ëmmer; a polymorphism innerhalb der exonic Regioun vun lincRNA-NR_024015 VerfÜgung. Als zu Dorënner 1c a D gewisen, proposéiert d'Resultater, déi den G zu Eng huel Ännerung vun rs8506G > A direkt d'folding vun lincRNA-NR_024015 VerfÜgung Impakt, deen d'Modalitéite Site fir de microRNA Afloss kann. Dëst kann da Afloss der lincRNA-NR_024015 VerfÜgung Gentherapie Ausdrock VerfÜgung Rs8506G &plain. A Genotypes Influence der LincRNA-NR_024015 VerfÜgung Expression vun der bindend vun jonken Studenten Has-Mir-526b kënschtlech zwee luciferase reporter Gentherapie gesond enthale rs8506G oder a allele vun transiently Co-transfecting mat rescht assayed waren an inhibitor vun ass-mir-526b datt zu rs8506G > predicated sech verbindlech; a polymorphic Site vun Bioinformatik Analyse. D'Resultat vun luciferase Aktivitéit gewisen, datt d'HEG-27 Zellen transiently Co-transfected ass-mir-526b mimics a bauen d'rs8506G allele bedeitend reduzéiert luciferase Aktivitéit Schatzkummer wouvun, zu enger Konzentratioun-ofhängeg Manéier, an d'ass-mir-526b inhibitors vill réckgängeg an upregulated hir Aktivitéiten. Allerdéngs war kee evident änneren fir reporter Gentherapie mat enger allele mat ass-mir-526b mimics oder inhibitors ( P VerfÜgung > 0,05) behandelt observéiert (Dorënner 2A). D'selwecht Resultater goufen och observéiert wann dës Experimenter widderholl huet 293T Zellen (Dorënner 2B) benotzt VerfÜgung Association vun Rs8506G &plain. A Genotypes mat LincRNA-NR_024015 VerfÜgung Expression VerfÜgung Mir gesammelt 32 entholl Stoffer aus der onbehandelt NCGC Patienten mat verschiddene genotypes an standing real-Zäit Hinnen alleguer d'Auswierkunge vun lincRNA-NR_024015 VerfÜgung rs8506G > ze diskutéieren; a op lincRNA-NR_024015 VerfÜgung Ausdrock. D'Resultat huet opgedeckt, datt Patienten mat der rs8506AG an rs8506AA genotypes ausgedréckt bedeitend méi héich lincRNA-NR_024015 VerfÜgung mRNA Niveauen (mengen ± Sem) am Verglach zu wwerreeche vun der rs8506GG genotype (AG: 0,029 ± 0,005; AA: 0,040 ± 0,005; GG: 0,019 ± 0,004; P VerfÜgung = 0.023), wéi am Sauerdall 2C dës VerfÜgung den Effet vun MiRNA-ofhängeg Reglement vun LincRNA-NR_024015 VerfÜgung Expression op Zell prolifération. VerfÜgung Mir propagéieren weider ob der lincRNA-NR_024015 VerfÜgung rs8506G > a genotypes hunn Auswierkungen op Zell Prolifératioun vun kënschtlech VerfÜgung. Als zu Dorënner 2D zougedréckt, lincRNA-NR_024015 VerfÜgung Ausdrock ofgeholl no 24 h transfection vun Zellen transiently Co-transfected mat pcDNA-lincRNA-rs8506G an ass-mir-526b Verglach mat deene Co-transfected mat pcDNA-lincRNA- rs8506A an ass-mir-526b ( P VerfÜgung &Si besteet; 0.001). Zellen mat ofgeholl Ausdrock vun lincRNA-NR_024015 VerfÜgung eng schwaach Zell Taux mat Zellen am Verglach haten transfected mat pcDNA-lincRNA-rs8506A an ass-mir-526b vum Dag 2 ( P VerfÜgung = 0,004 ) (Dorënner 2E) VerfÜgung am Moment Spidol-baséiert case-Kontroll Etude am Ganzen 438 Patienten an 727 gesond Kontrollen, eise Grupp d'rs8506G fonnt > wouvun;. a ass verbonne mat Risiken vun NCGC. Eis Daten huet, datt Sujeten der rs8506AG an rs8506AA genotypes hat e wesentleche fräi Risiko fir NCGC Verglach mat der GG genotype Droen ( P VerfÜgung &Si besteet; 0,05). Ausserdeem, wossten et datt eng héich Risiko Effet vun dëser polymorphism méi nozekommen fëmmen Sujete war. Fir eis Wëssen, ass dat déi éischt Étude globaalt der Associatioun tëscht der Varianten an exonic vun lincRNA a Gefor vun NCGC diskutéieren. VerfÜgung Als aner Klass vun reglementaresche noncoding RNAs, hunn lincRNAs, kuerzem un den Offäll vu noncoding geplënnert RNS studéieren. Dës mRNA-wëll Molekülle, feelen engem groussen Open liesen Rumm, sidd allgemeng capped, spliced an polyadenylated hunn zu engem Netzwierk vu bewosst Prozesser wéi nuklear Architektur, Regulatioun vun der Gentherapie Ausdrock, immun Iwwerwaachung, oder embryonal Stammzellenfuerschung pluripotency agebonne ginn. Eng Handvoll Etuden hu bewisen lincRNAs als neien Aspekt vun der Biologie an enger Rei vu Krankheet erausgeschielt, an Ännerungen am Ausdrock Niveau vun lincRNAs vläicht um transcriptional, post-transcriptional an epigenetic Niveauen [18], [30] zu Kriibs Biologie droen - [32]. Eng groussaarteg lincRNA, ANRIL VerfÜgung no System goufen an Kriibs Werdegang agebonne, typesch epigenetic Gentherapie Ausdrock repressing via verbindlech bis an zousätzlech chromatin verbidden investéiert [33], [34]. Anere bekannten Beispill ass de lincRNA, GAS5 VerfÜgung; [37] - genetesch geometrescher Figur bei dësem lincRNA nët gewiescht an vill Zorte vun erhéijen, inklusiv melanoma, Broscht, an Aarbecht Cancers [35] fonnt. Dës Verse vun Beweiser ënnerstëtzt d'Wichtegkeet vun lincRNAs zu bewosst Biologie an oncogenesis. Viru Kuerzem, zwee GWASs hunn e Ziel vun NCGC waat loci gemellt (5p13.1, 3q13.31, 8q24.3, 6p21.1 an 7p15.3), datt mat der Entwécklung vun NCGC assoziéiert. Bioinformatik Analyse réischt puer lincRNAs fir dësen loci zougemaach. Ausserdeem, an der exonic Regioune vun lincRNAs wellkomm puer relevant Single Nukleotid schiefgang (SNPs) dat mat NCGC Associé kann sech identifizéiert. Well mir all, an dene leschte Joerzéngt, mat der Disponibilitéit vun grouss-Skala RNS sequencing bekannt, et elo ass ëmmer ganz kloer, datt dausende vu Krankheet-Zesummenhang genetesch Varianten ausserhalb vun Genen gewunnt oder souguer an Net-coding gët schon kritt gi vun Nepgen Projet zu Mamendéieren [24]. Rezent enstanen dofir hunn d'Associatioun tëscht SNPs gewunnt an lincRNAs a mënschlech Cancers uginn. Zum Beispill, baséiert op der 1000 Genomes Donnéeën, Guangfu Jin an colleages hun fonnt dass Regioune vun lncRNA engem SNPs Dicht gläicht FAQ-coding Regiounen haten an weider d'phenotype-Zesummenhang SNPs vun GWAS um lncRNA Regioun gemellt forcéiert kënne bis Aarbecht riskéieren [bäidroen ,,,0],38]. Eng rezent Etude confirméiert och, datt eng genetesch polymorphism zu lincRNA-uc003opf.1 VerfÜgung Gentherapie eng fräi Risiko vun Entwécklungslänner esophageal squamous Zell carcinoma an Chinese Populatiounsschichte assoziéiert ass [39]. Erginn, eis heiteg Etude ass konsequent mat virdrun bruet huet dass lincRNA-NR_024015 VerfÜgung an der Zytoplasma mëttelméisseg méi räich ass wéi am helle fractionated gastric Kriibs Zellen, suggeréiert, dass d'Funktioune vun dëser lincRNAs an der Zytoplasma Nofolleg ass . Eis Resultater gëtt eng staark Beweiser enger Hypothes fir cytoplasmic Regulatioun, an deem d' lincRNA-NR_024015 VerfÜgung rs8506G > ënnerstëtzen;. A SNP den Ausdrock vun dëser lincRNA vun verbidden d'obligatoresch Site fir déi ass-mir-526b Afloss kann am Moment studéieren, eis Resultat vun association tëscht engem genetesch polymorphism an der exonic Regioune vun engem lincRNA an waat fir NCGC war éischtens an Chinese Populatiounsschichte kritt. Déi relativ grouss Echantillonen benotzt ofgeholl der Gréisst vum Örs datt statistesch nogewise ka ginn. Ausserdem, hu mir eng Etude Muecht vun iwwer 90% (two-eesäitegen Test, α = 0,05) z'entdecken eng ODER vun 1,28 fir d'rs8506AG + AA genotypes (geschitt bei enger Frequenz vun 42,5% ënner der Kontrollen) erreecht hun, wou am Verglach mat der rs8506GG genotype. Virun allem, ass de Veräin biologically plausibel an ass konsequent mat der Experienz vun eiser funktionell Studien. VerfÜgung An Conclusioun, déi heiteg Etude d'éischt Beweiser gëtt, déi genetesch schiefgang an der exonic Regioune vun lincRNAs eng kruzial Roll spillen eenzelne zu mediating waat fir NCGC. Eis Resultater Ënnerstëtzung weider d'Hypothes, datt genetesch Varianten an lincRNA exonic Regiounen microRNA-mediated Regulatioun an Zesummenhang mat der Gefor vun GC Afloss kann. Eis Conclusiounen Adjudant Confirmatioun am groussen, mat Preferenz Bevëlkerung-baséiert, case-Kontroll Studien, souwéi duerch gutt-entworf mechanistic Studien. VerfÜgung
Aféierung VerfÜgung
spontan a Methode VerfÜgung
Resultater VerfÜgung
gesait VerfÜgung
Dicussion VerfÜgung
Neie Prozess weist verbessert Iwwerliewe fir Patienten mat fortgeschrattem kolorektalen BRAF-mutanten Kriibs
SARS-CoV-2 Infektioun verlängert viral Verloscht a Lymphozytenverloscht bei Patienten mat Kriibs
Thiopurine kéinte hëllefen eng viral Replikatioun a mënschleche Coronavirus ze stoppen
Plastik elo allgemeng a mënschlechen Hocker fonnt
Ongesond Darmmikrobiom reduzéiert de synaptesche Gehir vum Gehir,
Et ass sécher rau Liewensmëttel fir Hausdéieren ze fidderen,
Entdeckung vun 100 nei Genen kann d'Fuerschung iwwer Pigmentéierungskrankheeten hëllefen
Eng nei Studie gefouert vu Fuerscher vum Kings College London an dem Erasmus MC University Medical Center Rotterdam huet 124 Genen entdeckt déi eng Schlësselroll spillen fir dFaarf vu mënschlechen Hoe
Nei entdeckt grouss Phagen verschwannen d'Liewen/Net-Liewensgrenz
Eng nei Studie am Journal publizéiert Natur weist datt et wuertwiertlech Honnerte vu Viren grouss genuch si fir Bakterien ze konsuméieren, a mat Eegeschafte déi typesch si fir e liewegen Organismus
Gutt a mëndlech Mikrobiome viraussoen der COVID-19 Gravitéit
Eng Fro déi weider onbeäntwert bleift wärend der lafender Coronavirus Krankheet 2019 (COVID-19) Pandemie war firwat gëtt et en ënnerscheedlechen Hit-and-Miss Muster wann et ëm eng schwéier Krankheet g