Stomach Health > Maag Gezondheid >  > Gastric Cancer > Maagkanker

PLoS ONE: De associatie tussen individuele SNPs of Haplotypes van Matrix metalloproteïnase 1 en MaagKanker gevoeligheid, Progression en prognose

De abstracte

Achtergrond

De single nucleotide polymorphisms (SNPs) in matrix metalloproteinase 1 (MMP-1) spelen een belangrijke rol in sommige kankers. Deze studie onderzocht de associaties tussen individuele SNPs of haplotypes in MMP-1 en gevoeligheid, clinicopathologische parameters en prognose van maagkanker in een grote steekproef van de Han-bevolking in het noorden van China.

Methods

In dit geval gecontroleerde studie, waren er 404 patiënten met maagkanker en 404 gezonde controles. Zeven SNPs gegenotypeerd met behulp van de MALDI-TOF MS systeem. Dan, SPSS-software, Haploview 4.2 software, Haplo.states software en THEsias software werden gebruikt om de relatie tussen individuele SNPs of haplotypes van MMP-1 en maagkanker gevoeligheid, progressie en prognose te schatten.

Resultaten

Onder zeven SNPs werden geen individuele SNPs gecorreleerd aan maag kankerrisico. Bovendien kunnen alleen de rs470206 genotype had een correlatie met histologische graden, en patiënten met GA /AA had en celdifferentiatie in vergelijking met de patiënten met genotype GG (OR = 0,573; 95% Cl: 0,353-0,929; P = 0,023). Dan hebben we gebouwd een vier-marker haplotype blok dat 4 voorkomende haplotypes bevatte: TCCG, GCCG, TTCG en TTTA. Echter, alle vier gemeenschappelijke haplotypes had geen correlatie met de maag risico op kanker en we hadden geen relatie tussen deze haplotypes en clinicopathologische parameters bij maagkanker niet vinden. Voorts noch individuele SNPs of haplotypes had een associatie met de overleving van patiënten met maagkanker.

Conclusies

Deze studie evalueerde polymorfismen van de MMP-1 gen bij maagkanker met een MALDI-TOF MS methode in een grote Noord-Chinese-case-control cohort. Onze resultaten gaven aan dat deze zeven SNPs van MMP-1 niet nuttig kunnen zijn als significant markers maagkanker gevoeligheid, progressie of prognose, althans in de Han populatie voorspellen in noordelijk China

Citation:. Song YX, Zhou X, Wang ZN, Gao P, Li aL, Liang JW, et al. (2012) De vereniging tussen individuele SNPs of Haplotypes van Matrix metalloproteïnase 1 en MaagKanker gevoeligheid, Progression en prognose. PLoS ONE 7 (5): e38002. doi: 10.1371 /journal.pone.0038002

Editor: Yury E. Khudyakov, Centers for Disease Control and Prevention, de Verenigde Staten van Amerika

Ontvangen: 30 januari 2012; Aanvaard: 29 april 2012; Gepubliceerd: 24 mei 2012

Other Languages