Plos ONE: Altered Izražanje inducirajo s hipoksijo Factor-1 a (HIF-1 a) in njenih regulatornih genov želodčnega raka Tissues

Povzetek

Tissue hipoksija povzroči ponovno načrtovanje celičnega metabolizma in lahko vodi v normalnem transformacije celic in napredovanje raka. Hipoksija-inducibilnih faktor 1-alfa (HIF-1α), ključni transkripcijski faktor, igra pomembno vlogo pri razvoju želodca in napredovanja raka. Ta študija je namenjen za preiskovanje osnovnega regulativnega signalno pot v raka želodca uporablja vzorce želodčne rak tkiva. Integracija genske ekspresije profila in transkripcijski regulatorni element baze podatkov (tred) je bila izvedena za identifikacijo HIF-1 a ↔ NFκB1 → BRCA1 → stat3 ← STAT1 genskih poti in njihovih reguliranih genov. Podatki so pokazali, da je bilo 82 različno izražene gene, ki bi jih lahko ureja teh petih transkripcijskih faktorjev v želodcu tkivih raka in ti geni oblikovana 95 načinov regulacije, med katerimi je sedem genov (MMP1, TIMP1, TLR2, FCGR3A, IRF1, FAS in TFF3 ) sta pesto molekule, ki so urejene vsaj dva od teh petih transkripcijskih faktorjev hkrati pa so povezani s hipoksijo, vnetja in imunskih motenj. Real-Time PCR in western blot pokazala povečanje HIF-1 a v mRNA in ravni beljakovin, kot tudi TIMP1, TFF3 v mRNA v želodčnih tkivih raka. Podatki so prva študija dokazati HIF-1 a-urejeno transkripcijske faktorje in njihovih ustreznih omrežnih genov pri raku želodca. je potrebna nadaljnja študija z večjim velikosti vzorca in bolj funkcionalnih preizkusih za potrditev teh podatkov in nato prevedejo v klinično odkrivanje biomarkerjev in strategije zdravljenja za rakom želodca

Navedba. Wang J, Ni Z, Duan Z, Wang G Li F (2014) spremenjeno Izražanje inducirajo s hipoksijo Factor-1 a (HIF-1 a) in njenih regulatornih genov želodčnega raka tkiv. PLoS ONE 9 (6): e99835. doi: 10,1371 /journal.pone.0099835

Urednik: Pankaj K. Singh, University of Nebraska Medical Center, Združenih držav Amerike

Prejeto: 10. januar 2014; Sprejeto: 19. maj 2014; Objavljeno: 13. junij 2014

Copyright: © 2014 Wang et al. To je odprtega dostopa članek razširja pod pogoji Creative Commons Attribution License, ki omogoča neomejeno uporabo, distribucijo in razmnoževanje v katerem koli mediju, pod pogojem, da prvotni avtor in vir knjižijo

Financiranje:. To delo je podprl delno z donacijami National Natural Science Foundation of China (̭20108025 in̬71897), Specialized raziskovalni sklad za doktorski program za visoko šolstvo Kitajske (É10061120093), Kitajska podoktorski znanstvene fundacije (É10491311 inÉ2T50285), temelj Jilin Provincial Health Department (É1Z049), fundacija za Jilin Province znanost in tehnologijo Ministrstvo (É30522013JH inÉ40414048GH) in Bethune programa Norman Jilin University (É2219). Med financerji imel nobene vloge pri oblikovanju študije, zbiranje in analizo podatkov, sklep, da se objavi, ali pripravi rokopisa

nasprotujočimi si interesi.. Avtorji so izjavili, da ne obstajajo konkurenčni interesi

Uvod

rak želodca je četrti najpogostejši rak in drugi najpogostejši vzrok smrti zaradi raka na svetu, ki prizadene približno 800.000 ljudi in 65.000 smrti zaradi raka vsako leto [1]. Prejšnje študije so pokazale, da je zmotno celični metabolizem ključni element v tumorigeneze in raka napredovanja [2], [3]. Posebej je bilo reprogramiranje presnovi energije vključi kot nastajajoče znak raka [4] in nenormalno presnovo energije je zaznati v različnih rakom pri ljudeh, torej bo rakave celice reprogramirati svojo presnovo s povečanjem glikoliza namesto mitohondrijske oksidativne fosforilacije za pridobivanje celic energije [5]. Hipoksijo tkiv, je ključna gonilna sila vodi v celično presnovo reprograming [6]. Pod hipoksija okolje, je celica glikoliza inducirane in vodi v povečanje proliferacije celic in posledično tvori začaran krog hipoksija orožja povečujejo hipoksije, ki spodbujajo transformacijo celic in napredovanje [7] raka. Na nivoju gena, hipoksija-inducibilnih faktor-1 (HIF-1) je primarni kisik občutljiva transkripcijski aktivator in pomaga celice prilagoditi nizke napetosti kisika (hipoksije) [8]. HIF-1 je sestavljen iz konstitutivno izražen beta-podenote in hipoksija-inducibilnih alfa-podenote. Slednji (HIF-1α) stabilizirana le pod hipoksične pogoje in ureja HIF-1 transkripcijski dejavnosti [9]. Do danes je HIF-1α pokazale, da aktivirate več ciljnih genov, ki vključujejo v ključnih vidikov biologije raka, vključno z eritropoezo, angiogenezo, presnovo glukoze, celično proliferacijo /preživetje in apoptoze [10]. HIF-1α lahko interakcijo z različnimi drugimi povezanih z rakom transkripcijski faktorji (TF) in tvorijo kompleksno TF-gen prepisu regulativni mrežo med razvoja in napredovanja raka. Tako pojmovanje ni presenetljivo postavljeno, da rakave celice različno in patoloških vzorcev transkripcijske v primerjavi z normalnimi celicami [11]. Prejšnje študije so pokazale, up-regulacijo HIF-1 a izražanja v želodcu tkiv in celic [12], [13] z rakom, medtem ko ostajajo prav temeljne regulativne mehanizme je treba opredeliti. Tako je v tej raziskavi smo uporabili tudi Affymatrix EXON Arrays identificirati razlika izražanja genov profil v želodčnih tkiva raka, in izvedli PCR v realnem času in western blot analiz za potrditev podatkov. nadalje smo gradili zmotne TF-gen prepisu regulativni mrežo, povezano z HIF-1 a izražanja z integracijo transkripcijski regulatorni element baze podatkov (tred) [14] in izražanja genov profila uporabo cytoscape programske opreme. Ta študija bi se lahko ugotovilo sistematično obrazložil s tem povezanih načinov ureditve transkripcijskih povezanih s hipoksijo in zagotoviti vpogled informacije za prihodnje odkrivanje biomarkerjev in strategiji novega zdravljenja raka želodca.

Rezultati in Razprava

profiliranja z različno izraženih genov pri raku želodca v primerjavi z običajnimi tkiv

za ugotavljanje različno izražene gene na raka želodca, smo izkoriščeni Affymatrix eXON Polja, ki vsebujejo 17.800 človeških genov na profil pet parov raka želodca in normalnih tkivih (podatki bolnikov so je razvidno iz tabele S1). Našli smo skupno 2546 različno izraženih genov, od katerih je bilo 2422 do reguliranih in 124 so bile dol reguliranih (tabela S2). Natančneje, HIF-1α precej visoko izraženo v želodčnih tkivih rakom v primerjavi s sosednjimi normalnih tkivih (P < 0,01). Nadaljevali smo potrjeni podatkov mikromrež z izvedbo kvantitativne realnem času RT-PCR in Western Blot v nadaljnjih 10 parov raka želodca v primerjavi z običajnimi tkiva (so podatki pacientov pokazali v Tabeli S1). izražanja HIF-1α mRNA pokazala 2,55 ± 0,56 krat up-regulacije v tumorskih tkivih, v primerjavi z običajnimi tiste (p < 0,01); western blot analiza je pokazala jasno ločitev med relativne gostote beljakovin HIF-1 a v tumorskih tkivih (0,41 ± 0,24) v primerjavi z normalno da tiste (0,17 ± 0,15) s p < 0,01, lahko rezultati je predstavljena na sliki 1 in sliki S1. Dejansko je prejšnji študija je pokazala, da je bila HIF-1α povsod izražene v človeških in mišjih tkivih pod hipoksije [15] in v želodčnih tkivih raka [12], [13], čezmernim ki je bila povezana s slabo prognozo bolnikov z rakom želodca [12 ], [13]. Tako smo dodatno analizirali HIF-1α overexpression povezana TFS in njihovih možnih ciljanja genov v želodcu tkiva raka.

Identifikacija HIF-1α overexpression povezana TF ter njihove možne ciljanje genov v želodcu tkivih rakom

Če želite ugotoviti, HIF-1α overexpression povezana TFS in njihovih možnih ciljanja genov, transkripcijski regulatorni element baze podatkov (tred) zagotavlja edinstveno orodje za analizo tako cis
- in trans
- regulatorne elemente pri sesalcih, ki pomaga bolje razumeti celovito genskih predpisov in regulatornih omrežij, zlasti na ravni transkripcijskih predpisov. Tako, s pomočjo profila integracija izražanje genov in upravne informacije iz tred, smo analizirali HIF-1 a in druge štiri povezane z HIF-1α transkripcijske faktorje (tj NFκB1, BRCA1, stat3 in STAT1), ki so bile vse up-urejena v raka želodca tkiva in ugotovil, da so oblikovali te TF-genskih mrež z 82 genov, od katerih je 79 so up-regulirane in 3 so navzdol reguliranih (tabela S3). Slika 2 je pokazala analiza bi-grozdov teh 82 različno izraženih genov v želodcu tkivih rakom v primerjavi z normalno tkivo.

Po tem je bila uporabljena Database za pripis, vizualizacijo in integriranih Discovery (DAVID) [16] za funkcionalno označevanje teh 82 različno izraženih genov. naštete smo top štiri razrede bolezni, ki so povezani s temi 82 okvarjenih genov (tabela 1) in ugotovila, da je najbolj pomemben razred Rak z 29 genov, sledijo okužbe (18 genov), srca in ožilja (25 geni) in imunske bolezni (26 geni) .

Identifikacija želodca, povezanih z rakom prepisovanje faktorja gena (TF-gen) omrežje

na podlagi transkripcijske regulativnega element baze podatkov in genske ekspresije profilu, smo gradili transkripcijski regulativni okvir v zvezi z HIF- 1α ↔ NFκB1 → BRCA1 → stat3 ← STAT1 s temi 82 genov v želodcu tkivih raka. Naši podatki so pokazali, da lahko ti 82 genov tvorijo 95 različnih načinov regulacije (slika 3A) in podroben TF-gen načini regulacije informacije so navedene v tabeli S4.

Da bi bolje razumeli regulativni mrežo, smo zgradili kratek okvir mreže (slika 3B). Transcription dejavniki HIF-1α ↔ NFκB1 → BRCA1 → stat3 ← STAT1 bili sposobni oblikovati okvir regulativnega omrežja, s katerim neposredno urejene 21, 45, 2, 12, 10 genov, oz. NFκB1 je neposredno urejal HIF-1 a in je res, da je bila večina regulatornega omrežja neposredno ureja HIF-1 a (21/82) in NFκB1 (45/82), ključnih regulatorjev, povezanih s hipoksijo in vnetja pri rakavih obolenj [ ,,,0],17]. rak želodca je označen s hipoksijo tkiv in kroničnega vnetja (kot Helicobacter pylori
infekcija). V naši trenutni raziskavi, HIF-1α bila bistveno navzgor regulirano v raka želodca v primerjavi s sosednjimi normalnih tkivih (P < 0,01). Poleg tega je naš sedanji podatki kažejo, da je bil izraz več kot 20 genov, ki so neposredno ureja HIF-1 a spremeni v želodčnih tkivih raka, vključno NFκB1, ključni regulator molekule v vnetja in raka [18] in usmerjanje NFκB bi lahko bili koristni pri kemoprevencija različnih človeških raka [19].

dolvodno od regulativnega pathway omrežje je v glavnem ureja stat3 (12/82) in STAT1 (10/82), člani signala pretvornik in aktivator transkripcije družine ( Statistika). Statistika signalizacija z Jak je kanonično pot za regulacijo genov, ki so vključeni v mnogih fizioloških procesov s prenosom signalov iz celične membrane v jedro [20]. Za ureditev parakrin citokinov signalizacije in spremembe v metastatskih mest, stat3 ima tako tumor, notranje in zunanje učinke [21]. Ciljanje Jak-stat3 signalne poti, se šteje kot potencialnega terapevtskega strategije, zlasti v okviru vnetja tumorja in imunitete [21]. Stalno deregulacija genov, ki jih vztrajno aktivnega NFκB in stat3 na tumorja mikrookolja dve ključni vidiki za vnetja in malignega napredovanja [17]. Prejšnja študija je pokazala sodelovanja učinek stat3 in HIF-1 a za aktivacijo genov pod hipoksija okolja s karcinomom ledvičnih celic celic [22]. Poseben mehanizem aktivacije Jak-STAT, še posebej stat3 na raka želodca, da se določi, čeprav je naš sedanji podatki v želodčnih tkivih raka je pokazala bistveno višjo raven JAK1, stat3 in STAT1 izražanja.

analiza Funkcija pesta -genes

dana transkripcijski faktor lahko regulira desetine, če ne stotine, ciljnih genov, pri čemer lahko en gen ureja več različnih TF v genskih regulacijskih mrež. Tako smo predpostavili, da se pest geni ureja več transkripcijskih faktorjev hkrati pri bolnikih z rakom želodca, ki imajo lahko sinergijske učinke na človeško rakotvornost. V trenutni študiji smo identificirali sedem genov (vključno MMP1, TIMP1, TLR2, FCGR3A, IRF1, FAS in TFF3), ki jih je mogoče neposredno ureja vsaj dveh ključnih faktorjev transkripcije, večina od njih so pest vozlišča, ki povezujejo z NFκB1 in statistika pot (slika 4). Ker transkripcijski faktorji uravnavajo ciljnih genov skozi prepisovanje odvisen način uravnavajo svojo mRNA izraz, tu smo izvedli QRT-PCR preučiti izraz TIMP1 in TFF3 mRNA, dve ciljni geni HIF-a Relativna izraz TIMP1 in TFF3 mRNA je 1,58 ± 0,25 in 2,16 ± 0,59 zložite-urejeno v desetih tumorja v primerjavi z normalno tkivo, v tem zaporedju (slika 1).

Poleg tega je družina metaloproteinaz matriksa (MMP) je glavni zunajcelični matriks preoblikovanje encime, aktivnost, ki je rezultat medsebojnega tumorskih celic in tumorskega mikrookolja in strogo nadzorovane s transkripcijskim aktivaciji, vključuje kompleksno aktivacijo proteolitični kaskade kot tudi endokrinega sistema inhibitorjev tkivnih metaloproteinaz (TIMPs) [23]. MMP1 so poročali, da se vključijo v rakave celice invazije želodca [24]. Poleg tega TLR2 je član cestninskih podobnih receptorjev in igra ključno vlogo pri priznavanju patogenov in aktivacije naravne imunosti po aktivaciji NFκB. TLR2 lahko deluje kot pobudnik za dajanje okuženega ali poškodovanih celicam še eno priložnost, da se razvije v rakaste celice in celične proliferacije nenadzorovano [25]. Medtem, Fc fragment IgG, z nizko afiniteto IIIa receptorja (FCGR3A, znan tudi kot CD16a) spada v družino gama receptorjev Fc (FCGR). FCGR3A
polimorfizma je povezan z dovzetnostjo za nekatere avtoimunske bolezni in FCGR3A ima pomembno vlogo pri odpravi imunskih kompleksov iz telesa in sodeluje tudi pri citotoksičnih odzivov proti tumorskih celic in povzročiteljev okužb [26]. Interferon regulatorni faktor (IRF) -1 je tudi imunski aktivna molekula in vnetne regulator proces, je bilo ugotovljeno, aktivacija IRF-1 in NF-κB se sočasno aktivira melanoma [27]. Poleg tega, polimorfizmi v deteljast faktorja 3 ( TFF3
) promotor so bile povezane z dovzetnostjo želodčnega raka [28] in TFF3 je urejeno tako HIF-1 in NFκB [29]. Čezmerno TFF3 je neodvisna kazalnik za skupno preživetje bolnikov želodca raka [30]. Spet FAS (znan tudi kot TNFSF6 /CD95 /APO-1) sodi v tumorske nekroze superdružine dejavnik receptorjev (član 6) in igra pomembno vlogo pri regulaciji zunajbesedilno apoptozo poti [31]. Zmanjšana FAS izraz je bila povezana s povečanim tveganjem za raka, ki ga downregulation za FAS-posredovane apoptoze [32]. Vendar pa naši trenutni podatki so pokazali protislovno visok nivo ekspresije FAS v želodčni rak tkiv oglasov nadaljnji študij je potrebno, da ga potrdite. Na splošno se spremeni izražanje teh genov v želodcu tkivih raka potrebna nadaljnja preverjanja, kot biomarkerjev za želodčne diagnozo raka in prognozo. Ti geni so ključnega pomena pri vnetju in imunsko povezane bolezni, ki bi lahko še dodatno kaže na pomen Helicobacter
pylori okužbe pri razvoju želodca in napredovanja raka.

Materiali in metode

Tissue vzorci

A skupno 15 bolnikov z rakom želodca je bilo zaposlenih za raka in daljni normalno zbirko tkivo iz prve bolnišnici Jilin University, Changchun, China. Ta študija je odobril Odbor za etiko kolegiju osnovnih medicinskih znanosti, Jilin University, je vsak bolnik privolil v pisno obveščena obrazec za privolitev. Podatki so bili analizirani anonimno. Vsa tkiva so bili odvzeti iz kirurškega prostoru in snap-zamrznemo in shranimo v tekočem dušiku v 10 minutah po resekciji. TNM in histološka klasifikacija so bile izvedene v skladu s Svetovne zdravstvene organizacije meril (WHO).

RNA izolacija in mikromrež hibridizacija in skeniranje

Tissue RNA smo izolirali s pomočjo TRIzola (Invitrogen, CA, ZDA) in nadalje očistimo z RNeasy Mini kit (Qiagen, Düsseldorf, Nemčija), v skladu z navodili proizvajalca. koncentracija RNA je bila nato določena z uporabo UV2800 ultravijolično spektrofotometra (UNIC, NY, ZDA) z razmerjem A260 /A280 med 1.8~2.0 in koncentracijo RNA je bila v razponu od 100 ng /ul do 1 g /ul.

GeneChip Human ekson 1,0 ST (Affymetrix, CA, ZDA) smo uporabili za profiliranje različno izraženih genov v želodčnih tkivih rakom v primerjavi z običajnimi tiste skladu s protokolom, ki ga Affymetrix (P /N 900.223). Na kratko, je bila uporabljena 1 mikrogramov predlogo RNA za obrnjeno prevedejo v cDNA in cDNA vzorce smo razgradili v cDNA fragmentov z endonukleazami in nato označena z reagentom za označevanje DNA, ki jih Affymetrix. Po tem so označeni cDNA vzorce uporabimo kot sonde za hibridiziranje na matrični čipov z inkubacijo pri 45 ° C in vrti pri 60 rpm 17 ur. Po oprane in obarvajo čipe po hibridizacije, so čipi skeniranih uporabo GeneChip Scanner3000 z GeneChip operacijski programski opremi (GCOS). Vsi instrumenti, čips in reagenti so bili vsi kupljeni od Affymetrix.

Analiza različno izraženih genov pri raku v primerjavi z normalno tkivo

je uporabljal GeneChip Operacijski Programska oprema za analizo čipov in izvleček surovin slike signala podatkov. V GEO nizi podatkov NCBI pristopnega števila naši raziskavi je: GSE56807. neobdelanih podatkov o signalih so se nato uvozijo in analizirali z Limma algoritem za identifikacijo diferencialno izraženih genov. Linearni modeli in empirične metode Bayesove so bili za analizo podatkov. To je preprečilo gen z zelo majhno kratno spremembo od ocenjeni kot različno izražena samo zaradi nenamerno majhnega ostanka SD. Dobljene P vrednosti so bile prilagojene z uporabo BH FDR algoritem. Geni so menili, da je treba bistveno različno izražena, če bi bila oba vrednosti FDR < 0,05 (nadzorovanje pričakovani FDR, da ne več kot 5%) in izražanje genov je pokazala, vsaj 2-krat spremembe med rakom in njihove ustrezne normalnih tkiv s Log2FC > 1 ali log2FC < -1, Vrednost P < 0.05.

Kvantitativna real-time RT-PCR

Za analizo QRT-PCR, je manj kot 5 mikrogramov skupno RNA reverzno prepisana na cDNA z 1 ^{st sklop cDNA sintezi Kit (Takara , Dalian, Kitajska); izražanje mRNA za prehrano HIF-1 a, TIMP1 in TFF3 so bile pregledane s QRT-PCR z SYBR premiks Ex Taq (Takara, Dalian, Kitajska) in Applied Biosystems 7300 Fast Real-Time PCR sistema. Relativno izražanje mRNA smo normalizirali na beta-aktina izražanje primerjalne metode Ct (2 -ΔΔCt, ΔCt = Ct _{ciljno Ct β-aktin, ΔΔCt = ΔCt tumor-ΔCt normalno). Vse primerji so bili oblikovani z Primer Premier 6 programske opreme, so primerji zaporedja za ojačanje navedeni v tabeli 2. Podatki iz QRT-PCR smo analizirali z GraphPad Prism različice 5.0, so bile razlike med skupinami statistično ovrednotiti vzorec enostranske t-test s p vrednost < 0,05 šteje za znatno}}

Western blot analiza

o 1 mm ^{3 vzorcev tkiva so polirana s tekočim dušikom potem homogenizirano v celično lizo pufru (Beyotime, Kitajska), v. 4 ° C za 30 minut, odstranimo celične ostanke s centrifugiranjem pri 10000 rpm 20 minut pri 4 ° C. Koncentracijo proteina smo analizirali s Bradfordu beljakovin testom (Bio-Rad, ZDA). Celoten protein smo ločili z 10% SDS-PAGE in nato prenese na PVDF membrano (0,45 um) 2 h. Po 2 urah blokiranja s 5% mleka v TBST, inkubirana membrano z miško proti HIF-1 a (Santa Cruz, CA, ZDA) na 1:200 redčenju in miške anti-beta-aktina (proteintech, ZDA) na 1: 2000 redčenja pri 4 ° C za 12 ur, čemur sledi 2 urah inkubacije pri kozjega proti-miš IgG (proteintech, ZDA) pri 1:2000 razredčenju. Po pranju ga TBST, odkrijejo membrane signalov z uporabo okrepljenega kemiluminescenco ECL (Beyotime, Kitajska). J software Sliko si je zaprosila za kvantitativno analizo signalov intenzivnosti HIF-1α z normirano beta-aktina ravni. Podatki so bili analizirani z GraphPad Prism različice 5.0, so bile razlike med skupinami statistično ovrednotiti vzorec enostranske t-test z vrednostjo P < 0,05 šteje za znatno}

Gradnja genske mreže prepis faktor na podlagi genske ekspresije. profil in transkripcije regulatorni element baze podatkov

Transcription faktor (TF) gen omrežje je bilo zgrajeno na podlagi genske ekspresije profilu in transkripcijske podatkovni bazi regulatorni element (tred) s pomočjo cytoscape programske opreme v skladu z regulativnim interakcije in vrednosti razlika izražanja vsakega TF in gen. Sosednosti matrika TF in genov je bila narejena s odnosov atributov med vsemi genov in TF. Elipsa v TF-genske mreže zastopana genov z rdečo (up-regulirana) in zelena (navzdol reguliran), trikotniki predstavlja transkripcijske faktorje. Razmerje med TF in njihovimi cilji so bili zastopani s puščicami, je Smer puščice od vira do cilja.

Analiza povezana bolezni genov in genov pot napisano

Database za pisanje, Vizualizacija in Integrated Discovery (DAVID) funkcionalno zaznambe programska oprema je bila uporabljena za analizo funkcionalno obogatitev okvarjenih genov. "GENETIC_ASSOCIATION_DB_DISEASE_CLASS" možnost, če informacije o bolezni združenje obogatitev genskih skupin. Izbrali smo "GENETIC_ASSOCIATION_DB_DISEASE_CLASS" za ugotavljanje obogatitev razreda bolezen in "KEGG_PATHWAY" za obogatitev pathway z metodo Benjamini določitvi pomembno score≥1.3 za bogatenje.

Podpora Informacije
sliki S1.
blot analiza Western od HIF-1 a 10 parov raka želodca in normalnih tkivih
doi:. 10,1371 /journal.pone.0099835.s001
(DOC)
Tabela S1. Podatki
Bolniki
doi:. 10,1371 /journal.pone.0099835.s002
(DOC)
Tabela S2.
Povzetek 2546 različno izraženih genov v želodcu tkivih rakom v primerjavi z oddaljenih normalnih tkivih. raven izražanja genov v želodcu tkivih rakom v primerjavi z oddaljenih normalnih tkivih bili vsaj 2-krat drugačna z vrednostjo p < 0,05
doi:. 10,1371 /journal.pone.0099835.s003
(XLSX)
Tabela S3.
Povzetek these82 različno izraženih genov v TF-regulativni mrežo v želodčnih tkivih raka
doi:. 10,1371 /journal.pone.0099835.s004
(XLSX)
Tabela S4.
95 načinov ureditve z 82 diferencialnimi genov, ki nastanejo v TF-gena regulativni mrežo. Vse informacije ureditev izvira iz transkripcijske regulatorni element baze podatkov (tred)
doi:. 10,1371 /journal.pone.0099835.s005
(XLSX)

Priznanja

Prav tako se zahvaljujem Medjaden Bioscience Limited (Hong Kong, Kitajska), za urejanje in lektoriranje ta rokopis.

• Plos ONE: Simulacija Swansons Literatura-Based Discovery: anandamid Zdravljenje zavira rast želodca rakavih celic v in vitro in in silico
• Plos ONE: Interlevkin 17A Spodbuja Rak želodca invazivnost preko NF-κB posredovana Matrix metaloproteinaz 2 in 9 Expression