Povzetek
Ozadje
TNFAIP2 Mi smo opravili študijo primera kontrolno 301 želodčnih bolnikov z rakom in 313 rakavih brez nadzora-frekvenčnih usklajenih po starosti, spolu in narodnosti. genotipizacijo smo štiri izbrane TNFAIP2 Rezultati genotip rs8126 CC je bila povezana z bistveno povečano tveganje za raka želodca (prilagojena OR = 2,00, 95% CI = 1,09-3,64 in P Naši podatki kažejo, da je TNFAIP2 Navedba: Xu Y, Ma H, Yu H, Liu z, Wang LE, Tan D. et al. (2013) MIR-184 rs8126 Binding-Site T > C polimorfizma v TNFAIP2 Urednik: Nathan A. Ellis, University of Illinois v Chicagu, Združene države Amerike Prejeto: 23. julij 2012; Sprejeto: 23. april 2013; Objavljeno: 28. maj 2013 Copyright: © 2013 Xu et al. To je odprtega dostopa članek razširja pod pogoji Creative Commons Attribution License, ki omogoča neomejeno uporabo, distribucijo in razmnoževanje v katerem koli mediju, pod pogojem, da prvotni avtor in vir knjižijo Financiranje:. To delo je bila podprta z Nacionalnega inštituta za zdravje zagotavlja R01 CA131274 in R01 ES011740 (Q. Wei), in P30 CA016672 (University of Texas MD Anderson Cancer Center). Njegova vsebina je izključno odgovornost avtorja in ne odražajo nujno uradnih stališč National Institutes of Health. Med financerji imel nobene vloge pri oblikovanju študije, zbiranje in analizo podatkov, sklep, da se objavi, ali pripravi rokopisa Konkurenčni interesi:. Prof Qingyi Wei iz doktor Anderson Houstonu v Teksasu, je urednik za PLoS ONE. To ne spremeni pripadnost avtorjev vseh PLoS ONE politike o izmenjavi podatkov in materialov. raka želodca, je eden od glavnih vzrokov smrti zaradi raka v svetu, čeprav sta njegovo pojavnost in umrljivost upada v zadnjem desetletju [1]. V letu 2010 je bilo približno 21.000 na novo diagnosticiranih bolnikov in 10,570 smrti te bolezni v ZDA [2]. Epidemiološke študije so pokazale, da okoljski dejavniki, vključno prehrana z veliko slanih in nitrirane živil, uporabe tobaka, alkoholnih porabe in, še posebej, Helicobacter pylori Med vsemi patofiziološke spremembe, ki jih različni etiološke dejavnikov, povezanih želodca raka povzročajo, indukcijo oksidativne poškodbe DNK v epitelnih celic želodca je bilo dokazano, da je močna povezava na rakotvornost [5], [6]. Da bi preprečili nenadzorovane rasti celic, ki izhajajo iz te vrste poškodbe DNK, morajo nekateri kontrolni celični cikel mehanizme treba začeti, da se prepreči nastanek mutacij ali sproži apoptozo celic z ogromno škodo na DNK. MicroRNAs ( miRNAs), razred endogenega in majhne nekodiranih regulativnega RNA, negativno uravnavajo izražanje genov na post-transkripcijski ravni prek hibridizacije do komplementarnih sekvenc v 3 'neprevedene regije (3'UTR) ciljnega messenger RNA v (mRNA) [ ,,,0],7], [8], [9], [10]. Nedavne študije so pokazale znatne učinke miRNAs na različnih bioloških procesov, vključno s celično diferenciacijo, proliferacijo, napredovanju celičnega ciklusa, kot tudi apoptoze. Spremenjeni izrazi miRNAs kot tudi njihove morebitne funkcije tumorskih razbijal in onkogeni so dokazali na več vrst raka, vključno z rakom želodca [11], [12]. Medtem, nekaj relativno pogoste genetske variante, kot enojnih nukleotidnih polimorfizmov (SNP), ki so bile opredeljene kot biomarkerjev za genetsko predispozicijo za raka, ki ga molekularnih epidemioloških študij. Zaradi njihovih morebitnih učinkov na miRNA izražanja in kasnejši vpliv na mRNA transkripcijo, Mirna SNP ali v zvezi z miRNA SNP, kot so tiste, ki se nahajajo v Mirnski vezavnih mest na neprevedene regije 3 '(UTR) svojih ciljnih genov, ki so bili vpleteni kot ključne genetski dejavniki pri dovzetnosti za različnimi vrstami raka. Ker je njihova vloga pri raku etiologija še vedno ni jasno, da je pomembno razumeti funkcionalno in evolucijski pomen teh povezanih z miRNA SNP prek svojih učinkov na tveganje za nastanek raka in njihove interakcije z dejavnikom okoljskih tveganj pri nastanku raka želodca [13]. pripadajo družini SEC6 je tumor nekrotizirajočega faktorja α-inducirano protein 2 (TNFAIP2, znan tudi kot B94 ali EXOC3L3), ki je ena vrsta pro-apoptotske proteina, prvotno opredeljen kot gen, katerega izražanje lahko povzročil ki jih je tumor nekroze faktor alfa (TNF) v centralnih vene endotelijskih celic [14]. TNFAIP2 Nedavne študije so pokazale, da lahko ti SNP v Mirnski vezavnih mest lahko povezana s tveganjem človeškega raka [15], [16]. Zato smo predpostavili, da je TNFAIP2 Študijski predmeti Študijski predmeti so bili bolniki z novo diagnosticiranim in histološko potrjeni želodčnega raka na Univerzi v Teksasu MD Anderson Cancer Center (Houston TX) med marcem 2002 in februarjem 2011, ki so bili zaposleni za tekoče študije primerov in kontrol raka želodca. Hkrati so rak brez kontrolnih oseb zaposlili s pomočjo frekvenčnega usklajevanje na starost (± 5 let), spol, in etičnost (non-Hispanic beljakov v primerjavi z drugimi) iz tekoče študije molekularne epidemiologije raka glave in vratu med 2002 in 2011 [17]. Ta rak brez nadzora predmeti niso bili v bolnišnici bolniki, ki so bili iščejo zdravstveno varstvo, niti genetsko povezana z primerih. Dodatne informacije o dejavnikih tveganja, kot so kajenje in uživanje alkohola, so se zbirali od vsakega upravičenega subjekta, ki je predvideno soglasja. Protokol študije je bil odobren z University of Texas MD Anderson Cancer Center institucionalni pregled krovu. genomske DNK je bila vzeta iz buffy coat frakcije vsakega vzorca krvi s pomočjo Blood Mini Kit (Qiagen, Valencia, CA), v skladu z navodili proizvajalca. čistost DNA in koncentracije smo določili s spektrofotometrično merjenjem absorbance pri 260 in 280 nm z UV spektrometra. Izbrana sta TNFAIP2 Ker TaqMan test ni bil primeren za druga dva SNP, tj rs8126 in rs1052823, so genotip, ki jih PCR-omejitev metode fragment dolžine polimorfizma, v katerem so bili primerji namenjen za ustvarjanje novih restrikcijska mesta in se uporablja za ojačanje fragmente, ki vsebujejo polimorfizmov za oba dva SNP. [18] sekvence primerji, ki se uporabljajo za genotipizacije testih so bili 5'-GGGGCCGGCTCTCTTGGGCC-3 'in 5'-CACACGTACAAAGACCTTGGGCATCC-3 "za rs8126 in 5'-CCTTCGGACTCAGGCATGACTC-3' in 5'-GTAAGGCAGTACCTGGGAAAAGGGTA -3 "za rs1052823. Profil PCR sestavljena iz začetne stopnje tališčem 95 ° C za 5 minut, 35 ciklov 95 ° C za 30 sekund, 60 ° C 45 sekund in 72 ° C za 1 min in končno stopnjo razširitve 72 ° C 10 min. PCR produkt za alel rs8126 C 105 baznih parov (bp) so prebavi, ki jih APA Statistična analiza V χ 2 testa. so bile izvedene za primerjavo porazdelitev demografske spremenljivke in izbranih dejavnikov tveganja, kot so kajenje in alkoholne porabe, med primeri in kontrolami. Hardy-Weinberg ravnovesje je bil testiran s χ 2 preizkus bog-of-fit primerjavo opažene genotipov s pričakovanimi tistim v nadzor rakavih bolezni. Združenja genotipov TNFAIP2 Demografske značilnosti in dejavniki tveganja za Rak želodca Ta študija je vključevala 301 rakom želodca bolnikov in 313 kontrol rakave bolezni. Tabela 1 povzema porazdelitev demografske značilnosti in izbranih dejavnikov tveganja za raka želodca. Zaradi frekvence ujemanja, ki se uporablja v naši raziskavi design, ni bilo bistvenih razlik v razdelitvi starosti (povprečna starost 59 yrs), spol in narodnost. Očitno je, da ni bilo nobene razlike v kajenje in stanje med primerov in kontrol pitje. Vendar pa so te spremenljivke dodatno prilagojena za nadaljnje multivariatne logistične regresijskih modelov za nadzor za vsako preostalo zavajajočih na glavni učinek izbranih SNP. Razporejenost genotipov izbranih štirih TNFAIP2 Poleg tega TNFAIP2 haplotipi so raziskovali tudi ugotoviti, ali se vsak posebej haplotip lahko povezana s tveganjem za nastanek raka želodca. Kot je prikazano na sliki. 1B, TNFAIP2 Pogovor V tej študiji primerov in kontrol, ki temeljijo bolnišnici, smo ugotovili, da je TNFAIP2 Pred kratkim sta združenje študije genoma vsej (GWASs) so poročali pomembne združenja več genskih variant s tveganjem želodčnega raka kitajskega prebivalstva kot tudi japonski in korejski prebivalstvo [19], [20]. SNP od TNFAIP2 Nekaj študije so raziskovali vlogo SNP v Mirne vezavnih mest v etiologiji raka želodca. Zveza študija primerov in kontrol v japonski populaciji 552 primerov in 697 kontrol je pokazala, da je CC genotip rs2910164 v napolnjeni miRNAs (miR-146A) statistično povezana s povečanim tveganjem za raka želodca [21]. Druga podobna želodca študija raka na kitajskega prebivalstva pokazali bistveno povečano tveganje pri osebah z homozigoti z varianta CC Mir-196a-2 v primerjavi z divjim tipom homozigotno TT in heterozigotnih CT prevoznikov. To SNP je pokazala tudi, da imajo močne povezave z bezgavkah metastaze [22]. Podobne učinke so bile ugotovljene pri kombiniranih rs895819 AG + GG genotipov hrs-MIR-27a v kitajske študije, ki jih izvajajo Qingmin S et al TNFAIP2 MIR-184 je en sam gen kopiranje in evolucijsko ohranjeni na ravni nukleotidov od muhe do človeka. Čeprav je njegova funkcija ostaja nejasno, so nekatere študije kažejo, MIR-184 kot potencialni onkogenih kandidata. Ena od študij na ploščatocelični karcinom (SCC) jezika je pokazala, da bi miR-184 pomembno vlogo pri delu v anti-apoptozo in proliferacijo jezik SCC celic [27]. Druga študija je prvič pokazala, da miR-184 bistveno zmanjša razvoj tumorja in povečano skupno preživetje v orthotopic mišje modela nevroblastoma [28]. Kasneje študija je pokazala, da je bila miR-184, vključenih v skupni genetski poti do ciljnih serin /treonin kinaze Akt2 je tako, da deluje z MYCN transkripcijski faktor, da zavira nevroblastoma celic preživetja [29]. Skupaj, te študije kažejo na možno vlogo miR-184 v zvezni tveganje za nastanek raka. Vendar pa ni jasno, ali lahko SNP v njegovih vezavnih mest nadalje spremeni tako modulacijo. V prejšnji študiji pri 1.077 bolnikih s ploščatoceličnim karcinomom glave in vratu (SCCHN) in 1.073 nadzor rakavih bolezni v non-Hispanic belo prebivalstvo, ki je ocenil združenja za SNP v TNFAIP 2 Čeprav je naša raziskava ni odkrila glavni učinek drugih SNP v miRNA mesta za vezavo TNFAIP2 Ker pa je ta študija je, da nam je znano, je prva študija na TNFAIP2 Priznanja Zahvaljujemo Margaret pljuč in Jessica Fiske za njihovo pomoč pri vpisovanju predmetov in zbiranje podatkov na vprašalnik in Jianzhong je, Kejing Xu, in Min Zhao in za njihovo pomoč pri predelavi krvi in ekstrakcijo DNK.
je bistvena gen vključen v apoptozo. Enonukleotidnih polimorfizmov (SNP) v svojih miRNA vezavnih mest lahko modulirajo funkcij miRNA-ciljnih genov in s tem tveganje za raka. V tej študiji smo raziskovali povezav med potencialno funkcionalne SNP v miRNA veznih mest za 3'UTR TNFAIP2
in tveganje raka želodca v populaciji ZDA.
Metode
SNP (rs8126 T > C, rs710100 G > A, rs1052912 G > A in rs1052823 G > T). in uporabili logistično regresijsko analizo po oceni združenja teh SNP s tveganjem za raka
= 0,024) v primerjavi s kombinacijo rs8126 TT + TK genotipov, zlasti v trenutnih pivcev. Vendar nobena od drugih TNFAIP2
SNP je bila povezana s tveganjem za raka na želodcu.
Sklepi
miRNA vezavnega mesta rs8126 T > C SNP je lahko marker za dovzetnosti za raka želodca, in to ugotovitev zahteva dodatno potrditev s strani večjih študij
je povezano s tveganjem za želodčne raka. PLoS ONE 8 (5): e64973. doi: 10,1371 /journal.pone.0064973
Uvod
( H. Pylori
) okužbe, so pomembni dejavniki pri etiologiji raka želodca [3]. Vendar pa je le majhen delež ljudi, ki sprejemajo podobne življenjskega sloga ali izpostavljeni enakim okoljskih dejavnikov tveganja sčasoma razvile raka na želodcu, kar kaže, da so gostiteljice ali genetskih dejavnikov, lahko prav tako igrajo vlogo pri nastanku bolezni [4].
se nahaja na kromosomu 14q32 in kodira protein 654 aminokislinskih ostankov z navidezno molekulsko maso 73 kDa. Sestavljen iz 11 eksonov in 10 intronov, TNFAIP2
razteza približno 13.45 kb genomske DNA [15]. V zbirki podatkov dbSNP (http://egp.gs.washington.edu/~~HEAD=pobj), je ta gen poročajo, da imajo 180 SNP, od tega 15 SNP-jev v 3'UTR TNFAIP2
se nahajajo v napovedano miRNAs vezavnih mest, ampak le štiri od teh povezanih z miRNA SNP so pogosti [tj minor alel frekvenca (MAF) > 0,05]. Te štiri SNP so rs8126 T > C (locirane v vezavno mesto za miR-184), rs710100 G > A (v miR-155), rs1052912 G > A (v pokoj-105) in rs1052823 G > T (v miR- 550) (http://compbio.uthsc.edu/miRSNP) [sl. 1A].
SNP so povezane z dovzetnostjo za rakom želodca. Da bi preverila to hipotezo, smo izvedli študijo primera za nadzor, da oceni povezavo med temi štirimi TNFAIP2
ang SNP v Mirni vezavo strani in tveganje za raka želodca v ZDA non-Hispanic belega prebivalstva.
materiali in metode
genotipizacijo
SNP, rs710100 in rs1052912 smo genotipizacijo na podlagi metodologije TaqMan v 384-jamicami in v povezavi s programsko opremo Sequence Detection o ABI-Prism 7900 instrumenta, v skladu z navodili proizvajalca, Applied Biosystems (Foster City, CA), ki je priložena tudi začetnih oligonukleotidov in sonde. Vsaka plošča vključena štiri negativne kontrole, razmnoževati pozitivne kontrole in osem ponavljajoče se vzorce. Pogoje pomnoževanja so bili naslednji:. 50 ° C za 2 min, 95 ° C za 10 minut, čemur sledi 40 ciklov 95 ° C 15 sekund in 60 ° C, 1 minuto
sem encimov (New England Biolabs, Beverly, MA) do dveh fragmentov 85 bp in 20 bp, medtem ko tiste rs1052823 G alel od 108 bp so prebavi, ki jih RSA
I (New England Biolabs) do trije drobci 83 bp, 15 bp in 10 bp. Stopnja uspešnosti test za vse genotipe bil > 99%, in ponavljajoče testi za > 10% vzorcev je bilo 100 skladnih
SNP s tveganjem za nastanek raka želodca so bili ocenjeni z izračunom razmerij obetov (OR) in njihove 95% intervali zaupanja (CIS) iz obeh univiariate in multivariatnih logističnih regresijskih modelov v analizi primera nadzora , sledi analiza stratifikacije glede na starost (≤59 vs > 59 let), spol, etnično pripadnost (bela vs non-belo), kajenje in pitje status. Vse te analize so bile izvedene z ali brez prilagoditve glede na demografske spremenljivke in izbranih dejavnikov tveganja. Proc haplotip v SAS /Genetics programske opreme z uporabo algoritma pričakovanje-max-imization (EM) je bila izvedena za ustvarjanje največje ocene verjetnosti haplotip frekvenc. Haplotipov s frekvencami < 5% združimo v eno skupino. Vsi testi so bili dvostranski, in P
< 0.05 smo imeli mejna statistične značilnosti. Vse statistične analize smo opravili s Statistična analiza sistema programske opreme (različica 9.2, SAS Institute, Cary, NC).
Rezultati
TNFAIP2
genotipi in tveganja želodčnega raka
SNP med primerov in kontrol, so navedeni v tabeli 2. opazili genotipov teh SNP so bili vsi v soglasju s tistimi, ki jih ravnotežju Hardy-Weinberg v pričakovanjih predmeti ( P
= 0,234 za rs1052823 G > T, P
= 0,698 za rs710100 G > A in P
= 0,125 za rs1052912 G > a), razen za rs8126 T > C ( P
= 0,013) v primerih. Razporejenost genotipa za TNFAIP2
rs8126 T > C je bilo 56.48% za TT, 32.56% za CT in 10.96% za CC v primerih, bistveno drugačne od tistih v kontrolni, kar je 52,72% za TT , 41.53 za CT in 5,75 za CC. Ta razlika je bila statistično značilna ( P
= 0,019) pod recesivno modela (rs8126 T > C CC /TT + CT). (Tabela 2)
SNP rs8126 T > C, ki je le eden od štirih izbrani TNFAIP2
SNP v Mirni vezavnih mest, je pokazala statistično pomembna povezava v nadaljnjo logistično regresijsko analizo. Natančneje, je bil CC Genotip rs8126 homozigotno le mejno povezana s povečanim tveganjem za raka želodca (popravljeni OR = 1,76, 95% CI = 0,96-3,27 in P
= 0,072), v primerjavi z genotipom TT, vendar to tveganje poveča (prilagojena OR = 2,00, 95% CI = 1,09-3,64 in P
= 0,024), v primerjavi s kombiniranimi rs8126 T variante genotipa (tabela 2). Vendar pa je v naslednji razslojeni analize glede na starost, spol, etnično pripadnost, kajenje in stanje pitne, le v podskupini trenutnih kadilcev, vendar ne pivcev, ni povišano tveganje še naprej statistično značilno z večjim razlike v ocenah (popravljeni OR = 4.04 95% CI = 1,08-15,08 in P
= 0,038) (tabela 3), čeprav je podskupina omejene pripombe. Nobena druga pomembna združenje je bilo ugotovljeno v analizi po skupnih učinkov vseh štirih TNFAIP2
SNP v Mirne vezavna mesta.
TNFAIP2
haplotipov in tveganje želodčnega raka
rs1052823 in rs1052912 so v veliko genetsko neravnostežje (LD) (r 2 = 0,87); zato rs1052912 ni bila vključena v analizo haplotip. Štiri haplotipov je pokazalo, da imajo frekvence > 5% med vsemi primerih, medtem ko druge manj pogosti haplotipov (frekvence < 5%) so bili združeni v eni skupini v analizi. V štirih skupnih haplotipov (rs8126 /rs1052823 /rs710100: T-G-G, C-G-A, T-G-A in C-T-A) znašal 90.53% in 94.72% na kromosomih primerov in kontrol, v tem zaporedju. Vendar pa je porazdelitev pogostnosti haplotipov ni bilo statistično razlikuje med primeri in kontrol ter njihova združenja s tveganjem za nastanek raka želodca niso bile velike, kot dobro. V nadaljnji analizi o drugih občasni haplotipov so haplotiski rs8126 /rs1052823 /rs710100: CGG pokazala statistično značilno povezavo s tveganjem za nastanek raka (prilagojeno OR = 2,60, 95% CI = 1,39-4,85 in P
= 0,003) v primerjavi s skupnim haplotipom TGG. (Tabela 4)
miR-184 vezavno mesto varianta rs8126 CC genotip je značilno povezana s povečano tveganje za razvoj raka želodca v recesivna genetskega modela. V analizi razslojevanja, je tak učinek bolj očitna v podskupini trenutnih pivcev, ki bi lahko naključen. Vendar pa ni bilo statističnih dokazov o povezavi s tveganjem za bolezni, za variantnih genotipov drugih izbranih SNP, vključno rs1052823 G > T, rs710100 G > A in rs1052912 G > A, bodisi v skupnih analiz ali stratificiran analize po starosti, spol, etnično pripadnost, kajenje ali stanje pitje. Poleg tega analiza haplotip ni ugotovila nobenih dodatnih podskupine s skupno frekvenco z visokim tveganjem.
gene niso bili med poročali top-zadetkov, saj le alelne združenja namesto genetskih modelov, kot je recesivno modela smo testirali v teh študijah GWAS. V tej študiji z omejeno velikostjo vzorca, izbrana SNP rs8126 T > C SNP v TNFAIP2
miRNA zavezujoča spletno stran, SNP, ki ni bil vključen niti v LD s tistimi, vključenimi v čipu GWAS, je povezana z rakom želodca. Ta ugotovitev pa je treba dodatno potrditev s strani večjih študij.
[23]. Nadaljnje funkcionalne analize so pokazale, da lahko alel varianta C odgovoren za povišano izražanje miR-27a, z zmanjšanjem mRNA ekspresije njegovega ciljnega gena, ZBTB10
(cink prst in BTB domene, ki vsebujejo 10), morebitno mehanizem, ki ga ki HSA-MIR-27a
SNP igra pomembno vlogo pri občutljivosti želodca raka [23]. Vendar pa ni objavljenih študij raziskovala vlogo SNP prebivajo v miRNA zavezujoče zaporedje raka želodca.
( B94
) je a-citokin poganja glavni odgovor gen, ki je bil prvotno kloniran iz TNF-alfa-inducibilnih transkript v endotelijskih celic človeških stimulirani [15]. Nadaljnje raziskave so pokazale, da se lahko aktivira razen TNF dejavnikov, vključno interlevkin-1β ali lipopolisaharid [24]. Izraz TNFAIP2
je pokazala, da bi obstajala le v zametkih jetra in ledvice, pa tudi pri moških zrelih zarodnih celic in krvotvorne in limfnega tkiva [25]. Čeprav je funkcija TNFAIP2
gen je še vedno v veliki meri neznan, je bilo predlagano, da TNFAIP2
lahko igra več vlog v razvoju organov, vključno z vaskulogeneze, diferenciacijo krvnih celic, mielopoeze in spermatogeneza . Poleg tega so poročali, da je bil gen zatrta v mozga celic akutno promielocitno levkemijo (APL) bolnikov in da bi njegova ciljna mRNA up-urejena vsi-tans-RA (retinojska kisline) [26].
gen z SCCHN tveganja [24], smo tudi ugotovili, da v primerjavi z rs8126 TT genotipa so bile variantne CT in CC genotipov povezana s povečanim tveganjem SCCHN na način, odzivno alel-doza [18]. V analizi primerjalno genotip, fenotip 37 celičnih linij SCCHN in periferne krvi mononuklearnih celicah (PBMC) od 43 bolnikov SCCHN, je rs8126CC genotip povezana z zmanjšano izražanje TNFAIP2
mRNA. Če povzamemo, ti rezultati kažejo, da MIR-184 vezavno mesto SNP (rs8126T > C) TNFAIP2
je 3'UTR funkcionalna, po možnosti s spreminjanjem TNFAIP2
izraza in prispeva k SCCHN dovzetnost [18]. Naše ugotovitve pri raku želodca so v skladu s tistimi v raku glave in vratu.
o celotni tveganja raka želodca, nismo ugotovili, da rs8126 CC varianta homozigotna genotip, v primerjavi s kombinacijo genotipov (TC + TT), je bila povezana z znatno povečano tveganje za nastanek raka. Statistična dokaz, da se lahko obdrži samo v eni podskupini pivcev v razslojevanje analize kažejo na zelo omejeno velikost vzorca te študije. Čeprav so uporaba tobaka in alkoholnih poraba šteje kot večjim tveganjem za raka na želodcu, je bila namenjena naša ujemanje oblikovanje nadzorovati njihovo zavajajočih o glavnih vplivih izbranih SNP, v katerih bi lahko overmatching zgodi zaradi morebitnih povezav med ujemajočih spremenljivk (starost in sex) in znani dejavniki tveganja (kajenje in pitje) v tej populaciji v študiji. V dodatni analizi haplotip, medtem ko štiri skupne frekvenčne haplotipov ni pokazal statistično združenje tveganja raka, je manjše frekvence haplotip rs8126 /rs1052823 /rs710100: C-G-G je izkazalo, da je povečano tveganje v primerjavi s skupnim haplotipom T-G-G. Analiza nizkofrekvenčnih haplotipov kaže drugačnega zaključka, in sicer, da lahko pride do netipskih nizke frekvence SNP, ki je povezana z rakom želodca. Dodatne študije so potrebne za potrditev tega rezultata.
SNP-ji in tveganje za nastanek raka na želodcu, naše ugotovitve so najbolj šteje predhodne in večje študije so utemeljene nadalje oceniti vlogo teh SNP v etiologiji raka želodca. Druga omejitev trenutne študije je bilo pomanjkanje informacij o H. pylori
stanje okužba predmetov. Ker H. pylori
okužba v želodčnih bolnikih je bila relativno pogost pojav v ZDA [30], v primerjavi s tistimi v Južni Ameriki [31] in azijskih držav [32], bolniki, zaposleni v naši raziskavi niso bili testirani na okužbo ob njihovem obisku na bolnišnica. Zato vključitev H. pylori
informacije je treba obravnavati v prihodnjih večjih študij.
Kislinski pH poveča okužbo s SARS-CoV-2 z regulacijo receptorjev ACE2
Študija povezuje porabo fermentirane zelenjave z nizko smrtnostjo zaradi COVID-19
Hrana, ki spodbuja črevesje, lahko po vsem svetu odpravi podhranjenost otrok
Študija osvetljuje vzroke izčrpavajočih črevesnih bolečin
Odkritje 100 novih genov bi lahko pomagalo pri raziskavah pigmentacijskih bolezni
Omejeno črevesno vnetje pri COVID-19
Kislinski pH poveča okužbo s SARS-CoV-2 z regulacijo receptorjev ACE2
Trajajoča pandemija koronavirusa 2019 (COVID-19), ki jo povzroča nov koronavirus, in sicer hud akutni respiratorni sindrom koronavirus 2 (SARS-CoV-2), je po vsem svetu zahteval več kot 4,6 milijona ži
Študija razkriva protivirusne učinke kurkumina
Kurkumin, naravna spojina, ki jo najdemo v začimbni kurkumi, lahko pomaga odpraviti nekatere viruse, raziskave so pokazale. Študija, objavljena v Revija za splošno virusologijo je pokazala, da lah
Otroci so imunsko pripravljeni na SARS-CoV-2
V zadnjih 20 letih se je pojavilo najmanj 30 novih bolezni, ki zdaj skupaj ogrožajo zdravje več sto milijonov ljudi. Za mnoge od teh bolezni ni zdravljenja, zdravilo, ali cepivo. Medtem ko je večina t