PLOS ONE: Le miR-184 Binding-Site rs8126 T > C polymorphisme TNFAIP2 est associée au risque de gastrique Cancer

Résumé

Contexte

TNFAIP2
est un gène essentiel impliqué dans l'apoptose. polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) dans ses sites de liaison miARN peuvent moduler les fonctions des gènes miARN cibles et ainsi le risque de cancers. Dans cette étude, nous avons étudié les associations entre les SNP potentiellement fonctionnels dans le miRNA sites de la 3'UTR de TNFAIP2
et le risque de cancer gastrique dans une population américaine.

Méthodes de liaison

Nous avons mené une étude cas-témoins de 301 patients atteints de cancer gastrique et 313 témoins sans cancer fréquence appariés selon l'âge, le sexe et l'origine ethnique. Nous génotypage quatre sélectionné TNFAIP2
SNPs (rs8126 T > C, rs710100 G > A, rs1052912 G > A et rs1052823 G > T). Et utilisé l'analyse de régression logistique pour évaluer les associations de ces SNP avec le risque de cancer

Résultats

Le rs8126 génotype CC a été associée à un risque significativement élevé de cancer gastrique (OR ajusté = 2,00, IC à 95% = 1,09 à 3,64 et P
= 0,024) , par rapport aux rs8126 TT génotypes + TC combinés, en particulier chez les buveurs actuels. Cependant, aucun des autres TNFAIP2
SNP a été associée à un risque de cancer de l'estomac.

Conclusions

Nos données suggèrent que le TNFAIP2
miRNA site de liaison rs8126 T > C SNP peut être un marqueur de susceptibilité au cancer gastrique, et cette constatation nécessite une validation supplémentaire par des études plus larges

Citation: Xu Y, Ma H, Yu H, Liu Z, Wang LE, Tan D,. et al. (2013) Le miR-184 rs8126 Binding-site T > C Polymorphisme dans TNFAIP2
est associée au risque de cancer gastrique. PLoS ONE 8 (5): e64973. doi: 10.1371 /journal.pone.0064973

Editeur: Nathan A. Ellis, Université de l'Illinois à Chicago, États-Unis d'Amérique

Reçu le 23 Juillet 2012; Accepté le 23 Avril 2013; Publié: 28 mai 2013

Droit d'auteur: © 2013 Xu et al. Ceci est un article en accès libre distribué sous les termes de la licence Creative Commons Attribution, qui permet une utilisation sans restriction, la distribution et la reproduction sur tout support, à condition que l'auteur et la source originelle sont crédités

Financement:. Ce travail a été soutenue par l'Institut national de la santé accorde R01 CA131274 et R01 ES011740 (Q. Wei) et P30 CA016672 (Université du Texas MD Anderson Cancer Center). Son contenu relève de la seule responsabilité des auteurs et ne représentent pas nécessairement les vues officielles des National Institutes of Health. Les bailleurs de fonds ont joué aucun rôle dans la conception de l'étude, la collecte et l'analyse des données, la décision de publier, ou de la préparation du manuscrit

Intérêts concurrents:. Prof Qingyi Wei de M.D. Anderson Houston, Texas, est un éditeur pour PLOS ONE. Cela ne modifie pas l'adhésion des auteurs à tous les PLOS ONE politiques sur les données et les matériaux de partage.

Introduction

Le cancer gastrique est l'une des principales causes de décès liés au cancer dans le monde, bien que les deux l'incidence et la mortalité ont diminué dans la dernière décennie [1]. En 2010, il y avait environ 21.000 patients nouvellement diagnostiqués et 10,570 décès de cette maladie aux États-Unis [2]. Des études épidémiologiques ont suggéré que les facteurs environnementaux, y compris le régime alimentaire riche en aliments salés et nitrés, l'usage du tabac, les consommations alcoolisées et, en particulier, Helicobacter pylori
( H. pylori
) infection, sont des facteurs importants pour l'étiologie du cancer gastrique [3]. Cependant, seule une fraction des personnes qui adoptent des styles ou de vie similaires exposés aux mêmes facteurs de risque environnementaux finalement développé un cancer gastrique, ce qui suggère que les hôtes ou les facteurs génétiques peuvent également jouer un rôle dans l'étiologie de la maladie [4].

Parmi tous les changements physiopathologiques causés par divers facteurs étiologiques liés aux cancers gastriques, l'induction de dommages oxydatifs à l'ADN dans les cellules épithéliales de l'estomac a été démontré être un maillon fort de la cancérogenèse [5], [6]. Pour empêcher une croissance cellulaire incontrôlée résultant de ce type de lésions de l'ADN, certains mécanismes de contrôle du cycle cellulaire doivent être lancées pour prévenir l'apparition de mutations ou d'initier l'apoptose des cellules avec des dommages écrasante à l'ADN.

microARN ( miARN), une classe d'ARN réglementaire non codante endogène et petite, réguler négativement l'expression des gènes au niveau post-transcriptionnel par hybridation à des séquences complémentaires dans la région 3 'non traduite (3'UTR) des ARN messagers cibles (ARNm) [ ,,,0],7], [8], [9], [10]. Des études récentes ont montré des effets significatifs de miARN sur divers processus biologiques, y compris la différenciation cellulaire, la prolifération, la progression du cycle cellulaire et l'apoptose. les expressions modifiées de miARN ainsi que leurs fonctions potentielles de gènes suppresseurs de tumeur et les oncogènes ont été démontrées dans plusieurs types de cancer, notamment le cancer gastrique [11], [12]. Entre-temps, plusieurs variantes génétiques relativement courantes, telles que des polymorphismes de nucléotides simples (SNP) ont été identifiés en tant que biomarqueurs pour une prédisposition génétique au cancer par des études épidémiologiques moléculaires. En raison de leurs effets potentiels sur l'expression des miARN et impact sur la transcription d'ARNm, miRNA SNPs ou SNPs liés miRNA, tels que ceux situés dans les sites de liaison miRNA à la région 3 'non traduite (UTR) de leurs gènes cibles, ont été impliqués comme facteurs génétiques cruciaux dans la susceptibilité à divers cancers. Depuis leur rôle dans l'étiologie du cancer reste incertaine, il est important de comprendre la signification fonctionnelle et évolutive de ces SNPs liés miRNA-par leurs effets sur le risque de cancer et de leur interaction avec des facteurs de risque environnementaux dans l'étiologie du cancer gastrique [13].

Appartenant à la famille SEC6, la protéine facteur de nécrose tumorale α induite par 2 (TNFAIP2, également connu sous le nom B94 ou EXOC3L3), qui est une sorte de protéine pro-apoptotique, a été initialement identifié comme un gène dont l'expression peut être induite par le facteur de nécrose tumorale alpha (TNFa) dans des cellules endothéliales de veine ombilicale [14]. TNFAIP2
est situé sur le chromosome 14q32 et code pour une protéine de 654 résidus d'acides aminés avec un poids moléculaire apparent de 73 kDa. Composé de 11 exons et 10 introns, TNFAIP2
couvrent approximativement 13.45 kb d'ADN génomique [15]. Dans la base de données dbSNP (http://egp.gs.washington.edu/), ce gène est rapporté que 180 SNPs, dont 15 SNP dans le 3'UTR de TNFAIP2
sont situés dans le prédit miARN sites de liaison, mais seulement quatre de ces SNPs liés miARN sont courants [ie fréquence mineure allèle (CRG) > 0,05]. Ces quatre SNP sont rs8126 T > C (localisé dans le site de liaison pour miR-184), rs710100 G > A (au sein de miR-155), rs1052912 G > A (au sein de miR-105) et rs1052823 G > T (au sein de Mir- 550) (http://compbio.uthsc.edu/miRSNP) [Fig. 1A].

Des études récentes ont montré que ces SNP dans les sites de liaison miARN peuvent potentiellement être associés à un risque humain de cancer [15], [16]. Par conséquent, nous avons supposé que TNFAIP2 de les SNP sont associés à la susceptibilité au cancer gastrique. Pour tester cette hypothèse, nous avons mené une étude cas-témoins pour évaluer l'association entre ces quatre TNFAIP2 de les SNP dans miRNA sites et risque de cancer gastrique de liaison dans une population blanche non hispanique US

Matériel et méthodes

sujets de l'étude

Les sujets étaient des patients nouvellement diagnostiqués et histologiquement confirmé cancer gastrique à l'Université du Texas MD Anderson cancer Center (Houston TX) entre Mars 2002 et Février 2011, qui ont été recrutés pour une étude cas-contrôle permanent du cancer gastrique. Dans le même temps, les sujets témoins sans cancer ont été recrutés en utilisant la fréquence correspondant à l'âge (± 5 ans), le sexe et l'origine ethnique (les blancs non hispaniques vs autres) à partir d'une étude de l'épidémiologie moléculaire en cours de la tête et du cou entre 2002 et 2011 [17]. Ces sujets témoins sans cancer ne sont pas les patients hospitalisés qui cherchaient des soins de santé, ni génétiquement sans rapport avec les cas. Des renseignements supplémentaires sur les facteurs de risque, comme le tabagisme et la consommation d'alcool, a été prélevé sur chaque sujet admissible qui avait fourni un consentement éclairé. Le protocole d'étude a été approuvé par l'Université du Texas MD Anderson Cancer Center comité d'examen institutionnel.

Génotypage

L'ADN génomique a été extrait de la fraction de la couche leucocytaire de chaque échantillon de sang en utilisant un kit de sang Mini (Qiagen, Valencia, CA) selon les instructions du fabricant. la pureté et les concentrations d'ADN ont été déterminées par mesure spectrophotométrique de l'absorbance à 260 et 280 nm par spectrophotomètre UV.

Le sélectionné deux TNFAIP2
SNPs, rs710100 et rs1052912, ont été génotypés en utilisant la méthode TaqMan dans plaques et 384 puits lire avec le logiciel de détection de séquence sur un 7900 instrument ABI-Prism, selon les instructions du fabricant, Applied Biosystems (Foster City, CA), qui a également fourni des amorces et des sondes. Chaque plaque comprenait quatre contrôles négatifs, dupliqué contrôles positifs et huit échantillons répétés. Les conditions d'amplification étaient les suivantes:. 50 ° C pendant 2 min, 95 ° C pendant 10 minutes, suivi de 40 cycles de 95 ° C pendant 15 s et 60 ° C pendant 1 min

Parce que le TaqMan essai ne convient pas pour les deux autres SNP, à savoir rs8126 et rs1052823, ils ont été génotypées par la méthode de la longueur des fragments polymorphisme PCR restriction, dans laquelle les amorces ont été conçues pour créer de nouveaux sites de restriction et utilisés pour amplifier les fragments contenant les polymorphismes pour les deux SNP les deux [18]. les séquences des amorces utilisées pour des essais de génotypage ont été 5'-GGGGCCGGCTCTCTTGGGCC-3 'et 5'-CACACGTACAAAGACCTTGGGCATCC-3' pour rs8126, et CCTTCGGACTCAGGCATGACTC 5'-3 'et 5'-GTAAGGCAGTACCTGGGAAAAGGGTA -3 'pour rs1052823. Le profil de PCR consistait en une étape initiale de fusion de 95 ° C pendant 5 min, 35 cycles de 95 ° C pendant 30 s, 60 ° C pendant 45 s et 72 ° C pendant 1 min et une étape d'extension finale de 72 ° C 10 minutes. Les produits de PCR pour rs8126 C allèle de 105 paires de bases (pb) ont été digérés par le Apa
I enzyme (New England Biolabs, Beverly, MA) à deux fragments de 85 pb et 20 pb, tandis que celles de rs1052823 allèle G de 108 pb ont été digérés par le Rsa
I (New England Biolabs) à trois fragments de 83 pb, 15 pb et 10 pb. Le taux de réussite de test pour tous les génotypes a > 99%, et les essais répétés pour > 10% des échantillons étaient 100 concordant

Analyse statistique

Les χ ^{2 tests. ont été réalisées pour comparer la répartition des variables démographiques et facteurs de risque, comme le tabagisme et alcoolisées consommation, entre les cas et les témoins. L'équilibre de Hardy-Weinberg a été testé par un χ Test de qualité d'ajustement 2 pour comparer les fréquences des génotypes observés avec ceux attendus dans les contrôles sans cancer. Les associations de génotypes de TNFAIP2 de les SNP présentant un risque de cancer gastrique ont été estimés en calculant les odds ratios (OR) et leurs intervalles de confiance à 95% (IC) des deux modèles de régression logistique univiariate et multivariées dans les analyses cas-témoins , suivie d'une analyse de la stratification par âge (≤59 vs > 59 ans), le sexe, l'origine ethnique (blanche par rapport aux non-blanc), le tabagisme et le statut potable. Toutes ces analyses ont été effectuées avec ou sans ajustement pour les variables démographiques et facteurs de risque. Proc HAPLOTYPE dans le logiciel SAS /Genetics en utilisant l'algorithme espérance-max-minimisa- (EM) a été réalisée pour générer des estimations du maximum de vraisemblance de fréquences d'haplotypes. Haplotypes avec des fréquences < 5% ont été combinés en un seul groupe. Tous les tests étaient bilatéraux, et un P
< 0,05 a été considérée comme le seuil de signification statistique. Toutes les analyses statistiques ont été réalisées avec le logiciel Statistical Analysis System (version 9.2, SAS Institute, Cary, NC).}

Résultats

Caractéristiques démographiques et facteurs de risque de cancer gastrique

Cette étude a inclus 301 patients atteints de cancer gastrique et 313 témoins sans cancer. Le tableau 1 résume la répartition des caractéristiques démographiques et facteurs de risque pour le cancer gastrique. En raison de la fréquence correspondante utilisée dans notre conception de l'étude, il n'y avait pas de différence significative dans les distributions d'âge (âge médian de 59 ans), le sexe et l'origine ethnique. Apparemment, il n'y avait pas de différence de fumer et boire de l'état entre les cas et les témoins. Cependant, ces variables ont également été ajustés dans d'autres modèles de régression logistique multivariée pour contrôler toute confusion résiduelle sur l'effet principal de SNPs sélectionnés.

TNFAIP2
Génotypes et risque de cancer gastrique

les distributions des génotypes des sélectionnés quatre TNFAIP2
SNP entre les cas et les témoins sont énumérés dans le tableau 2. la observé fréquences des génotypes de ces SNP étaient tous en accord avec celles attendues par l'équilibre de Hardy-Weinberg dans les sujets ( P
= 0,234 pour rs1052823 G > T, P
= 0,698 pour rs710100 G > A et P
= 0,125 pour rs1052912 G > A), à l'exception pour rs8126 T > C ( P
= 0,013) dans les cas. Les distributions des génotypes pour TNFAIP2
rs8126 T > C étaient 56,48% pour TT, 32,56% pour la TDM et 10,96% pour les CC dans les cas, très différents de ceux dans les contrôles, qui était 52,72% pour TT , 41,53 pour CT et 5,75 pour CC. Cette différence était statistiquement significative ( P
= 0,019) dans le cadre du modèle récessif (rs8126 T > C CC /TT + CT). (Tableau 2)

En outre, le SNP rs8126 T >
TNFAIP2; C, le seul parmi les quatre sélectionnés TNFAIP2
SNP dans des sites de liaison miRNA, a montré une différence statistiquement association significative en outre une analyse de régression logistique. Plus précisément, le rs8126 homozygote génotype CC n'a été limite associée à un risque accru de cancer gastrique (OR ajusté = 1,76, IC à 95% = 0,96 à 3,27 et P
= 0,072), par rapport au génotype TT, mais ce risque accru (OR ajusté = 2,00, IC à 95% = 1,09 à 3,64 et P
= 0,024), par rapport aux rs8126 T variant génotypes combinés (tableau 2). Cependant, dans l'analyse stratifiée suivante selon l'âge, le sexe, l'origine ethnique, le tabagisme et l'état de consommation d'alcool, seulement dans le sous-groupe des fumeurs actuels, mais pas les buveurs, ne le risque élevé reste statistiquement significative avec une plus grande variation dans les estimations (OR ajusté = 4,04 , IC à 95% = 1,08 à 15,08 et P
= 0,038) (tableau 3), bien que le sous-groupe avait des observations limitées. Aucune autre association significative n'a été trouvée dans l'analyse des effets conjoints de tous les quatre TNFAIP2
SNP dans les sites de liaison miARN.

TNFAIP2
haplotypes et risque de cancer gastrique

Les haplotypes ont également été explorées afin de déterminer si un haplotype particulier peut être associé à un risque de cancer de l'estomac. Comme on le voit sur la Fig. 1B, TNFAIP2
rs1052823 et rs1052912 sont en déséquilibre de liaison élevée (LD) (r ^{2 = 0,87); Par conséquent, rs1052912 n'a pas été inclus dans l'analyse des haplotypes. Quatre haplotypes ont été montré pour avoir des fréquences > 5% parmi tous les cas, tandis que d'autres haplotypes moins courants (fréquences < 5%) ont été combinés en un seul groupe dans l'analyse. Les quatre haplotypes communs (rs8126 /rs1052823 /rs710100: T-G-G, C-G-A, T-G-A et C-T-A) ont représenté 90,53% et 94,72% des chromosomes des cas et des témoins, respectivement. Cependant, la distribution des fréquences d'haplotypes n'a pas été statistiquement différente entre les cas et les témoins, ainsi que leurs associations avec le risque de cancer gastrique ne sont pas significatives aussi bien. Dans une analyse plus approfondie sur les autres haplotypes rares, les rs8126 haplotype /rs1052823 /rs710100: CGG ont montré une association statistiquement significative avec le risque de cancer (OR ajusté = 2,60, IC à 95% = 1,39 à 4,85 et P
= 0,003) , par rapport à l'haplotype commun TGG. (Tableau 4)}

Discussion

Dans cette étude cas-témoins en milieu hospitalier, nous avons trouvé que le TNFAIP2
miR-184 site de liaison variante rs8126 génotype CC était significativement associé avec un risque élevé de développer un cancer gastrique dans un modèle génétique récessive. Dans l'analyse de la stratification, un tel effet était plus évident dans le sous-groupe des buveurs actuels, ce qui pourrait être dû au hasard. Cependant, il n'y avait aucune preuve statistique d'une association avec le risque de la maladie pour des variantes de génotypes d'autres SNP sélectionnés, y compris rs1052823 G > T, rs710100 G > A et rs1052912 G > A, soit dans l'ensemble des analyses ou des analyses stratifiées par âge, le sexe, l'origine ethnique, le statut de fumeur ou de l'état de boisson. De plus, l'analyse des haplotypes n'a pas identifié de sous-groupes supplémentaires avec une fréquence commune à haut risque.

Récemment, deux études d'association pangénomique (Gwäss) ont signalé des associations significatives de plusieurs variants génétiques avec le risque de cancer gastrique chez les populations chinoises ainsi que les populations japonaises et coréennes [19], [20]. SNPs du gène TNFAIP2 de ne figuraient pas parmi les meilleurs-hits signalés, parce que les associations ne alléliques plutôt que des modèles génétiques, tels que le modèle récessive, ont été testés dans ces études GWAS. Dans la présente étude, avec une taille limitée de l'échantillon, sélectionné SNP rs8126 T > C SNP dans TNFAIP2 de site de liaison miRNA, un SNP qui ne figurait pas, ni dans LD avec ceux qui sont inclus dans la puce GWAS, est associée à un cancer gastrique. Cette constatation doit cependant encore être validés par des études plus larges.

Peu d'études ont étudié le rôle des SNP dans les sites de liaison miARN dans l'étiologie du cancer gastrique. Une étude d'association cas-témoins dans une population japonaise de 552 cas et 697 contrôles a démontré que le rs2910164 génotype CC en pré-miARN (miR-146a) a été statistiquement associée à un risque accru de cancer gastrique [21]. Une autre étude de cancer gastrique similaire dans une population chinoise a montré une augmentation significative du risque chez les sujets avec les homozygotes variante CC de miR-196a-2 par rapport au type sauvage TT homozygotes et hétérozygotes porteurs de CT. Ce SNP a également été montré pour avoir une forte association avec métastase ganglionnaire [22]. Des effets similaires ont été trouvés pour les combinés rs895819 génotypes AG + GG de hrs-mir-27a dans une étude chinoise menées par Qingmin S et al
[23]. D'autres analyses fonctionnelles ont indiqué que la variante C allèle pourrait être responsable de l'expression élevée de miR-27a, en réduisant l'expression de l'ARNm de son gène cible, ZBTB10
(doigt de zinc et le domaine BTB contenant 10), un mécanisme possible par dont le hsa-mir-27a
SNP joue un rôle dans la prédisposition au cancer gastrique [23]. Cependant, aucune étude publiée ont étudié le rôle des SNP résidant dans la miRNA séquence de liaison dans le cancer gastrique.

TNFAIP2
( B94
) est une réponse primaire entraînée par les cytokines gène qui a été initialement clone à partir de la transcription de TNF-α inductible dans les cellules endothéliales humaines stimulées [15]. D'autres études ont montré que cela pourrait être activé par des facteurs autres que le TNF, y compris l'interleukine-1β ou lipopolysaccharide [24]. L'expression de TNFAIP2
a été révélé être existé dans le foie et le rein embryonnaire, ainsi que dans les cellules mâles matures germinales et hématopoïétique et les tissus lymphoïdes [25]. Bien que la fonction de la gène TNFAIP2 de est encore largement inconnue, il a été suggéré que TNFAIP2
peut jouer plusieurs rôles dans le développement des organes, y compris la vasculogenèse, la différenciation des cellules sanguines, myélopoïèse et spermatogenèse . En outre, il a été signalé que le gène a été réprimée dans les cellules de la moelle osseuse de leucémie promyélocytaire aiguë (APL) patients et que ses ARNm cibles pourrait être régulée à la hausse par tous-tans-RA (acide rétinoïque) [26].

miR-184 est un gène à copie unique et évolutivement conservée au niveau des mouches à l'homme de nucléotides. Bien que sa fonction reste incertaine, certaines études ont suggéré miR-184 en tant que candidat potentiel oncogène. Une étude sur le carcinome à cellules squameuses (SCC) de la langue a montré que miR-184 pourrait jouer un rôle dans le cadre de la lutte contre l'apoptose et la prolifération des cellules langue SCC [27]. Une autre étude a démontré tout d'abord que miR-184 a réduit significativement le développement de la tumeur et la survie globale accrue dans un modèle murin orthotopique du neuroblastome [28]. Une étude plus récente a révélé que miR-184 a été impliqué dans une voie génétique commune en ciblant la sérine /thréonine kinase AKT2 en agissant avec le facteur de transcription MYCN pour inhiber la survie des cellules de neuroblastome [29]. Pris ensemble, ces études suggèrent un rôle possible de miR-184 dans la modulation de risque de cancer. Cependant, on ne sait pas si SNP dans ses sites de liaison peuvent modifier en outre une telle modulation.

Dans notre étude précédente en 1077 patients présentant un carcinome épidermoïde de la tête et du cou (SCCHN) et 1.073 témoins sans cancer dans une population blanche non hispanique, qui a évalué les associations du SNP de TNFAIP 2
gène avec le risque SCCHN [24], nous avons également constaté que, par rapport au génotype rs8126 TT, les variantes CT et CC génotypes étaient associé à un risque accru de SCCHN d'une manière réponse allèle de dose [18]. Dans le génotype-phénotype analyse de corrélation des 37 lignées cellulaires de SCCHN et les cellules mononucléaires du sang périphérique (PBMC) provenant de 43 patients atteints de SCCHN, le génotype rs8126CC a été associée à une expression réduite de TNFAIP2
ARNm. Pris ensemble, ces résultats suggèrent que le site miR-184 de liaison SNP (rs8126T > C) dans le 3'UTR de TNFAIP2
est fonctionnel, éventuellement en modulant l'expression
TNFAIP2 et contribue à SCCHN la sensibilité [18]. Nos résultats dans le cancer gastrique sont compatibles avec ceux de la tête et du cou cancer.

Bien que notre étude n'a révélé aucun effet principal d'autres SNP dans le miRNA sites TNFAIP2
sur le risque global contraignant du cancer de l'estomac, nous avons trouvé que la variante génotype homozygote rs8126 CC, par rapport aux génotypes combinés (TC + ​​TT), a été associée à un risque accru de cancer de manière significative. Les données statistiques qui ne pouvait être soutenue dans un sous-groupe de buveurs dans la stratification des analyses suggère la taille de l'échantillon très limité de la présente étude. Bien que l'usage du tabac et la consommation d'alcool ont été considérés comme des risques majeurs pour le cancer gastrique, la conception de notre correspondance était destinée à contrôler leur confusion sur les principaux effets des SNPs sélectionnés, dans lequel overmatching pourrait se produire en raison d'associations possibles entre les variables correspondant à (âge et sexe) et les facteurs de risque connus (tabagisme et consommation d'alcool) dans cette population d'étude. Dans l'analyse des haplotypes supplémentaires, tandis que quatre haplotypes de fréquences communes n'a pas démontré une association statistique du risque de cancer, le mineur rs8126 fréquence haplotype /rs1052823 /rs710100: C-G-G a prouvé avoir un risque accru, par rapport à l'haplotype commun T-G-G. L'analyse des haplotypes basse fréquence suggère une conclusion différente, à savoir qu'il peut y avoir un faible SNP typées de fréquence qui est associée à un cancer gastrique. Des études supplémentaires sont nécessaires pour valider ce résultat.

Cependant, puisque la présente étude est, à notre connaissance, la première étude sur le TNFAIP2 de les SNP et le risque de cancer de l'estomac, nos résultats sont les mieux considérés des études préliminaires, et les grandes sont nécessaires pour évaluer davantage le rôle de ces SNP dans l'étiologie du cancer gastrique. Une autre limitation dans l'étude actuelle a été le manque d'informations sur le H. pylori
état d'infection des sujets. Depuis H. pylori de l'infection chez les patients gastriques était relativement rare aux États-Unis [30], par rapport à ceux en Amérique du Sud [31] et les pays d'Asie [32], les patients recrutés dans notre étude ont pas été testées pour l'infection lors de leur visite à la hôpital. Par conséquent, l'inclusion de H. pylori de l'information devrait être pris en compte dans les futures études plus importantes.

Remerciements

Nous remercions Margaret Lung et Jessica Fiske pour leur aide dans le recrutement des sujets et la collecte de l'information du questionnaire et Jianzhong He, Kejing Xu, et Min Zhao et pour leur aide dans le traitement du sang et de l'extraction de l'ADN.

• PLOS ONE: Silencing épigénétique de miR-338-3p Contribue à tumorigénicité dans le cancer gastrique par ciblage SSX2IP
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