PLoS ONE: Mir-184 Uvez-Site rs8126 T &C Polimorfizam u TNFAIP2 je povezana s rizikom od želučani Cancer

Sažetak pregled

Pozadina pregled

TNFAIP2 pregled je ključna gena koji su uključeni u apoptozi. Polimorfizama (SNP-ova) u svojim veznih mjesta Mirna mogao modulirati funkcije Mirna-ciljnih gena, a time i rizik od karcinoma. U ovoj studiji ispitivali smo asocijacije između potencijalno funkcionalnih SNP u Mirne vezna mjesta 3'UTR TNFAIP2 pregled i želuca rizik od raka u SAD-u populaciji. Pregled

Metode pregled

proveli smo case-control studija 301 pacijenata oboljelih od raka želuca i 313 oboljelih od raka, bez kontrole frekvencije podudaraju prema dobi, spolu i nacionalnosti. genotipiziran smo odabrali četiri TNFAIP2 pregled SNP-a (rs8126 T &C, rs710100 G > A, rs1052912 G > A i rs1052823 G > t). i koriste logističke regresijske analize za procjenu udruge ovih SNP-ova s ​​rizikom od raka

Rezultati

rs8126 CC genotip povezan sa značajno povišenim rizikom od raka želuca (korigirani OR = 2,00, 95% CI = 1,09-3,64 i p pregled = 0,024) , u usporedbi s kombiniranim rs8126 TT genotipa + TC, osobito u sadašnjim piju. Međutim, niti jedan od drugoga TNFAIP2
SNP bio povezan s rizikom od raka želuca. Pregled

Zaključci pregled

Naši podaci sugerirali da je TNFAIP2 pregled Mirna vezno mjesto rs8126 T &C SNP može biti marker za osjetljivost na rak želuca, a ovaj nalaz zahtijeva daljnju provjeru valjanosti od strane velikih studija pregled

Izvor: Xu Y, Ma H, Yu H, Liu Z, Wang LE, Tan D,. et al. (2013) Mir-184 Uvez-Site rs8126 T &C Polimorfizam u TNFAIP2 pregled je povezana s rizikom od raka želuca. PLoS ONE 8 (5): e64973. doi: 10,1371 /journal.pone.0064973 pregled

Urednik: Nathan A. Ellis Sveučilišta Illinois u Chicagu, Sjedinjene Američke Države Netlogu

Primljeno: 23. srpnja 2012; Prihvaćeno: 23. travnja 2013; Objavljeno: 28. svibnja 2013 pregled

Copyright: © 2013 Xu i sur. Ovo je otvorenog pristupa članak distribuirati pod uvjetima Creative Commons Imenovanje License, koja omogućuje neograničeno korištenje, distribuciju i reprodukciju u bilo kojem mediju, pod uvjetom da je izvorni autor i izvor su zaslužan

financiranja. Ovo djelo je podržan od strane Nacionalnog instituta za zdravstvo daje R01 CA131274 i R01 ES011740 (P Wei), i P30 CA016672 (The University of Texas MD Anderson Cancer Center). Njegov sadržaj su isključivo odgovornost autora i nužno ne predstavljaju službene stavove National Institutes of Health. U financijeri nisu imali ulogu u studiju dizajna, prikupljanja i analize podataka, Odluka o objavi, ili pripremu rukopisa pregled

suprotstavljenih interesa. Prof Qingyi Wei iz M. D. Anderson Houston, Texas, je urednik PLoS ONE. To ništa ne mijenja pridržavanje autorovih svim PLoS ONE politika na razmjenu podataka i materijala. Pregled

Uvod pregled

karcinoma želuca je jedan od glavnih uzroka smrti izazvane rakom u svijetu, iako su oba njegova incidencija i smrtnost su u padu u posljednjem desetljeću [1]. U 2010. godini bilo je oko 21.000 novodijagnosticiranih bolesnika i 10,570 smrtnih slučajeva ove bolesti u SAD-u [2]. Epidemiološke studije pokazale su da okolišni čimbenici, uključujući i prehrana bogata slanih i nitrirani hrane, korištenje duhana, alkoholnih potrošnju i, posebice, Helicobacter pylori pregled ( H. Pylori pregled) infekcije, važni su čimbenici za etiologiji karcinoma želuca [3]. Međutim, samo mali dio ljudi donose slične stilove života ili izloženi istim faktorima rizika za okoliš na kraju razvili rak želuca, sugerirajući da je host ili genetski faktori također mogu igrati ulogu u nastanku bolesti. [4] pregled

Među patofiziološkim promjena izazvanih raznim etiološkim čimbenika vezanih na želučane raka, indukcija oksidativnog oštećenja DNA u epitelnim stanicama želuca je pokazano da je jaka veza u karcinogenezi [5], [6]. Kako bi se spriječilo nekontrolirano rast stanica uslijed ove vrste oštećenja DNA, neki mehanizmi kontrole staničnog ciklusa mora biti pokrenut kako bi se spriječilo pojavu mutacija ili inicirati apoptozu stanica s nadmoćnom oštećenja DNK. Pregled

mikroRNA ( miRNAs), razred endogenog i malih nekodiranom regulatorne RNA negativno reguliraju ekspresiju gena na post-transkripcijskoj razini kroz hibridizaciju s komplementarnim sekvencama na 3 'netranslatirano područje (3'UTR) od RNA ciljne glasnika (mRNA) [ ,,,0],7], [8], [9], [10]. Novije studije su pokazale značajne učinke miRNAs na različitim biološkim procesima, uključujući staničnu diferencijaciju, proliferaciju, napredovanja staničnog ciklusa, kao i apoptozu. Izmijenjeni izrazi miRNAs, kao i njihovi mogući funkcije tumorskih potiskivača i onkogena prikazane su u nekoliko vrsta raka, uključujući rak želuca [11], [12]. Međutim, nekoliko relativno česte genetske varijante, kao što je polimorfizama (SNP-ova) su identificirani kao biomarkera za genetsku osjetljivost na rak molekularnim epidemiološkim studijama. Zbog potencijalnih učinaka na Mirni izražavanja i naknadno djelovanje na mRNA transkripciju, Mirna SNP ili Mirna vezane SNP, kao što su one koje se nalaze u vezna mjesta Mirna na 3 'netranslatiranu regiju (UTR) od ciljnih gena, su uključeni kao ključni genetski faktori u podložnost različitim oblicima raka. Od njihove uloge u nastanku raka ostaje nejasno, to je važno razumjeti funkcionalno i evolucijski značaj ovih Mirna povezane SNP kroz njihove učinke na rizik od raka i njihove interakcije s čimbenicima rizika okoliša u etiologiji raka želuca [13]. Pregled

pripada obitelji SEC6, faktora tumorske nekroze α inducirane protein 2 (TNFAIP2, također poznat kao B94 ili EXOC3L3), koji je jedna vrsta proapoptotska proteina, izvorno je identificirana kao gen čija ekspresija se može inducirati faktorom tumorske nekroze alfa (TNFa) u endotelne stanice umbilikalne vene [14]. TNFAIP2 pregled nalazi se na kromosomu 14q32 i kodira protein od 654 aminokiselinskih ostataka sa očitom molekularnom težinom od 73 kDa. Sastoji se od 11 eksona i 10 introna, TNFAIP2 pregled obuhvaća oko 13.45 kb genomske DNA [15]. U dbSNP bazu podataka (http://egp.gs.washington.edu/~~HEAD=pobj), taj gen je izvijestio da su 180 SNP-ova, od kojih je 15 SNP u 3'UTR TNFAIP2 pregled se nalaze u predviđeni miRNAs veznih mjesta, ali samo četiri od tih Mirna povezane SNP su uobičajene [tj manjinski alel frekvencija (MAF) 0,05]. Ove četiri SNP su rs8126 T &C (lokalizirana unutar vezanja za MIR-184), rs710100 G > A (u roku od Mir-155), rs1052912 G > (u roku od Mir-105) i rs1052823 G > T (unutar miR- 550) (http://compbio.uthsc.edu/miRSNP) [Sl. 1A]. Pregled

Nedavne studije su pokazale da su ovi SNP u vezna mjesta Mirna potencijalno može biti povezana s ljudskom rizik od raka [15], [16]. Dakle, pretpostavili smo da je TNFAIP2 pregled SNP su povezane s osjetljivošću na karcinoma želuca. Da bi testirali tu hipotezu, proveli smo case-control studija procijeniti povezanost između ove četiri TNFAIP2 pregled SNP u Mirne vezna mjesta i rizik od raka želuca u SAD-u non-Hispanjolci bijele populacije. Pregled

Materijali i metode

ispitanika pregled

ispitanici su bili pacijenti s nedavno dijagnosticiran i histološki potvrđeno rak želuca na Sveučilištu Texas MD Anderson Cancer Center (Houston TX) između ožujka 2002. i veljače 2011. godine, koji su bili regrutirani za tekuću case-control studija karcinoma želuca. U isto vrijeme, raka bez kontrole Ispitanici su regrutirani pomoću frekvencija odgovara na dob (± 5 godina), spol i etničku pripadnost (non-Hispanjolci bijelo rublje vs ostalih) iz trajnog epidemiološkoj studiji molekularne od raka glave i vrata između 2002 i 2011. [17]. Ove raka bez kontrole subjekti nisu bili bolnički pacijenti koji su u potrazi zdravstvenu zaštitu, niti su genetski povezana s predmetima. Dodatne informacije o faktorima rizika, kao što su pušenje i uporaba alkohola, iz svake prihvatljivog subjekta koji je pod uvjetom informirani pristanak. Protokol istraživanja je odobren od strane University of Texas MD Anderson Cancer Center institucionalni pregled odbor. Pregled

genotipa pregled

Genska DNA je izvađen iz Serumska frakcija svakog uzorka krvi pomoću krvi Mini Kit (Qiagen, Valencia, CA), u skladu s uputama proizvođača. čistoća DNA i koncentracije su određena spektrofotometrijskom mjerenje apsorbancije pri 260 i 280 nm UV spektrofotometra. pregled

odabrana dva TNFAIP2 pregled SNP, rs710100 i rs1052912, su genotipizirani korištenjem metodologije TaqMan u 384 jamica i čitati sa softverom Sequence Detection na ABI-Prism 7900 isprave, u skladu s uputama proizvođača, Applied Biosystems (Foster City, CA), koji je također isporučena početnica i proba. Svaka ploča uključena četiri negativne kontrole, umnožavati pozitivne kontrole i osam ponovljenih uzoraka. Uvjeti amplifikacije su bili slijedeći. Na 50 ° C 2 min, 95 ° C kroz 10 min, nakon čega slijedi 40 ciklusa 95 ° C 15 sekundi i 60 ° C tijekom 1 min pregled

Budući TaqMan test nije bio pogodan za druga dva SNP-ova, tj rs8126 i rs1052823, su genotipizirani metodom polimorfizma duljine fragmenta PCR ograničenje, u kojem su klice da bi se stvorio nova restrikcijska mjesta, a koji se koristi za pojačavanje fragmenta koji sadrže polimorfizme za oba dva SNP-ova. [18] u sekvencije primera korištena za genotipiziranje testovima su 5'-GGGGCCGGCTCTCTTGGGCC-3 'i 5'-CACACGTACAAAGACCTTGGGCATCC-3' za rs8126, i 5'-CCTTCGGACTCAGGCATGACTC-3 'i 5'-GTAAGGCAGTACCTGGGAAAAGGGTA -3 'za rs1052823. PCR profil sastojala se od inicijalnog koraka taljenja od 95 ° C tijekom 5 minuta, 35 ciklusa 95 ° C za 30 s, 60 ° C za 45 s i 72 ° C tijekom 1 minute i finalna ekstenzija korak na 72 ° C 10 min. PCR proizvodi za rs8126 C alela 105 parova baza (bp) su probavljaju u Apa pregled sam enzima (New England Biolabs, Beverly, MA) s dva fragmenta od 85 bp i 20 bp, a one rs1052823 G alela od 108 bp se probavljaju u RSA pregled i (New England Biolabs) na tri fragmenta od 83 bp, 15 bp i 10 bp. Uspjeh stopa test za sve genotipove bio 99%, a ponovljeni testovi za > 10% uzoraka bilo 100 saglasan

Statistička analiza

χ ^{2 ispitivanja. provedena su za usporedbu distribuciju demografskih varijabli i odabranih faktora rizika, kao što su pušenje i alkoholna potrošnju, između predmeta i kontrole. Hardy-Weinberg ravnoteže bila testirana goodness-of-fit χ 2 test za usporedbu promatrane frekvencije genotipova s ​​očekivanim one u kontroli raka-free. Udruge genotipova TNFAIP2 pregled SNP s rizikom od raka želuca procijenjeni su izračuna omjer vjerojatnosti (OR) i njihovih 95% intervala pouzdanosti (CI) iz oba univiariate i multivarijatne logističke regresije modela u case-control analize , nakon čega slijedi stratifikacije analizi dobi (≤59 vs. > 59 godina), spolu, etničkoj pripadnosti (bijelo naspram ne-bijeli), pušenje i pijenje status. Sve ove analize su izvedene sa ili bez podešavanja za demografskih varijabli i odabranih faktora rizika. Proc haplotip u SAS /Genetics softvera pomoću očekivanje-max-imization (EM) algoritam je provedeno za generiranje maksimalne procjene vjerojatnost haplotipu frekvencija. Haplotipova s ​​frekvencijama < 5% su spojene u jednu grupu. Svi testovi su dvostrano, a P izvoznici < 0,05 smatrana gušeći za statističke značajnosti. Sve statističke analize provedene su uz Statistička analiza sustava (verzija 9.2; SAS Institute, Cary, NC). Pregled}

Rezultati pregled

Demografska obilježja i faktori rizika za rak želuca Netlogu

studija je uključivala 301 pacijenata oboljelih od raka želuca i 313 raka bez kontrole. Tablica 1 prikazuje raspodjelu demografske karakteristike i odabrane faktore rizika za rak želuca. Zbog frekvencije podudaranja koristi u našem studiju dizajna, nije bilo značajne razlike u distribucijama dobi (srednja dob 59 godina), seks i etničku pripadnost. Očigledno, nije bilo razlika u pušenju i status među predmetima i kontrola za piće. Međutim, ove varijable su dodatno prilagoditi za daljnjim multivarijatne logističke regresije modela za kontrolu za svaku preostalu zbrka na glavnom učinku odabranih SNP. Pregled

TNFAIP2 pregled Genotipovi i rizik od raka želuca Netlogu

genotipa distribucija odabranih četiri TNFAIP2 pregled SNP između predmeta i kontrola navedene su u tablici 2. promatranom frekvencije genotipova tih SNP bili u dogovoru s onima očekuje od Hardy-Weinberg ravnoteže u ispitanici ( P pregled = 0,234 za rs1052823 G > T, P pregled = 0,698 za rs710100 G > i P pregled = 0,125 za rs1052912 G >), osim za rs8126 T &C ( P pregled = 0,013) u slučajevima. Raspodjela genotipova za TNFAIP2 pregled rs8126 T &C su 56,48% za TT, 32.56% za CT i 10,96% za CC u slučajevima, bitno različita od onih u kontrolnoj skupini, što je 52.72% za TT , 41.53 za CT i 5,75 za CC. Ova razlika je bila statistički značajna ( P pregled = 0,019) pod recesivnim modelom (rs8126 T > C CC /TT + CT). (Tablica 2) pregled

Osim toga, TNFAIP2 pregled SNP rs8126 T &C je samo jedan od četiri odabrane TNFAIP2 pregled SNP u vezna mjesta Mirna, pokazala je statistički značajna povezanost u daljnjem logističkom regresijom. Naime, rs8126 homozigota CC genotipa bila samo granica povezana s povećanim rizikom od raka želuca (prilagođen OR = 1.76, 95% CI = 0,96-3,27 i P pregled = 0,072), u usporedbi s TT genotip, ali taj rizik povećan (korigirani OR = 2,00, 95% CI = 1,09-3,64 i P pregled = 0,024), u usporedbi s kombiniranim genotipova rs8126 T varijanti (Tablica 2). Međutim, u sljedećem stratificirani analize po dobi, spolu, etničkoj pripadnosti, pušenje i status piće, samo u podskupini sadašnjih pušača, ali ne piju, je li povišen rizik i dalje statistički značajna s većim varijacijama u procjenama (korigirani OR = 4.04 , 95% CI = 1,08 do 15,08 i P pregled = 0,038) (Tablica 3), iako je podgrupa imala ograničene opažanja. Niti jedna druga značajna povezanost pronađena je u analizi za zajedničke učinke svih četiriju TNFAIP2 pregled SNP u veznih mjesta Mirna. Pregled

TNFAIP2 pregled haplotipova i rizik od raka želuca

haplotipa također su istraživali kako bi se utvrdilo da li je bilo posebno haplotip može biti povezana s rizikom od nastanka karcinoma želuca. Kao što je prikazano na slici. 1B, TNFAIP2 pregled rs1052823 i rs1052912 su u visokoj spojnici neravnoteže (LD) (r ^{2 = 0,87); prema tome, rs1052912 nije bila uključena u analizu haplotipa. Četiri haplotipa koji su pokazali da imaju frekvenciju > 5% među svim slučajevima, a drugi manje uobičajene haplotipova (frekvencije < 5%) se kombiniraju u jednu skupinu u analizi. Četiri zajednička haplotipa (rs8126 /rs1052823 /rs710100: T-G-G, C-G-A, T-G-A i C-T-A) iznosi 90.53% i 94.72% od kromosoma slučajevima i kontrole. Međutim, raspodjela učestalosti haplotipova nije bila statistički različita između predmeta i kontrole, a njihova povezanost s rizikom od raka želuca nisu bili značajni. U daljnjoj analizi o drugim neuobičajeno haplotipova, haplotipa rs8126 /rs1052823 /rs710100: CGG pokazao je statistički značajnu povezanost s rizikom od raka (korigirani OR = 2,60, 95% CI = 1,39-4,85 i P pregled = 0,003) u usporedbi sa zajedničkim haplotip TGG. (Tablica 4) pregled}

Rasprava pregled

U ovoj bolnici se temelji na case-control studija, otkrili smo da je TNFAIP2 pregled Mir-184 vezno mjesto varijanta rs8126 CC genotipa bio je statistički značajno povezana s povećanim rizikom od razvoja raka želuca u recesivnog genetskog modela. U stratifikacije analize, takav učinak je bio uočljiviji u podskupini sadašnjih alkoholičara, koji bi mogao biti prilika nalaz. Međutim, nije bilo statistički dokazi o povezanosti s rizikom od bolesti za varijantu genotipova drugih odabranih SNP-ova, uključujući rs1052823 G > T, rs710100 G > A i rs1052912 G > A, bilo u ukupnim analizama ili u stratificiranom analizama prema dobi, spol, etnicitet, pušenje ili status za piće. Osim toga, analiza haplotipova nije identificirala sve dodatne podgrupe sa zajedničkim frekvenciji s visokim rizikom. Pregled

Nedavno dvije studije udruga genoma širom (GWASs) objavili značajne asocijacije nekoliko genetskih varijanti sa želučanim rizikom od raka u kineskim populacije kao i japanski i korejski populacija [19], [20]. SNP je od TNFAIP2 pregled gena nisu među prijavljenim top-hitove, jer samo alelskih udruga, a ne genetskim modelima, kao što je recesivno modela, ispitani su u ovim GWAS studija. U ovom istraživanju s ograničenom veličinom uzorka, odabrani SNP rs8126 T &C SNP u TNFAIP2 pregled, mjesto vezivanja Mirna, SNP koji nije bio uključen ni u LD s onima uključen u GWAS čip, bio je povezan s karcinomom želuca. Ovo otkriće, međutim, potrebna daljnja provjera valjanosti od strane velikih studija. Pregled

Nekoliko istraživanja su istraživali ulogu SNP u vezna mjesta Mirna u etiologiji raka želuca. Studija slučaja za kontrolu udruga u japanskoj populaciji od 552 slučajeva i 697 kontrola pokazala da je rs2910164 CC genotipa u pre-miRNAs (Mir-146A) statistički je povezana s povećanim rizikom od raka želuca [21]. Još jedan sličan želuca istraživanje raka u kineskoj populaciji pokazali značajno povećan rizik u osoba s varijantom CC homozigoti Mir-196a-2 u usporedbi s divljim tipom homozigotni TT i heterozigotnih CT prijevoznika. Ovaj SNP je također pokazala da ima jaku povezanost s limfnih čvorova metastaza [22]. Slični učinci su nađeni za kombinirani rs895819 AG + GG genotipa sati-Mir-27a u kineskoj studiji provode Qingmin s i sur pregled [23]. Nadalje funkcionalna analiza je pokazala da je varijanta C alel može biti odgovoran za pojačanom ekspresijom Mir-27a, smanjenjem ekspresije mRNA svog ciljnog gena, ZBTB10 pregled (cink prst i BTB domena koja sadrži 10), moguće mehanizam kojima je HSA-Mir-27a pregled SNP igra važnu ulogu u rak želuca osjetljivosti [23]. Međutim, nema objavljenih studija koje su istraživali ulogu SNP borave u Mirni obvezujuće slijed raka želuca. Pregled

TNFAIP2 pregled ( B94 pregled) je citokin-driven primarni odgovor gen koji je izvorno kloniran iz TNF-a induciranog transkripta u ljudskim stimulira endotelne stanice [15]. Daljnje studije su otkrili da bi to moglo biti aktivirana faktora osim TNF uključujući interleukin-1B ili lipopolisaharidom [24]. Izraz TNFAIP2 Netlogu je otkriveno da se je postojala u embrionalnom jetre i bubrega, kao i kod muških zrelim zametnih stanica i hematopoetskih i limfnog tkiva [25]. Iako je funkcija TNFAIP2 pregled gena još je uvijek nepoznanica, bilo je sugerirano da se TNFAIP2 pregled može imati višestruku ulogu u razvoju organa, uključujući i vaskulogeneze, diferencijacije krvnih stanica, mijelopoezu i spermatogenezu , Osim toga, to je izvijestio da je gen koji je potisnut u stanicama koštane srži od akutne leukemije promijclocitnu (APL) bolesnika, a da njegove ciljne mRNA može biti up-regulirana sva-tans-RA (retinoična kiselina) [26]. Pregled

Mir-184 je jedan kopija gena i evolucijski konzerviran na razini nukleotida od muha na ljude. Iako je njegova funkcija ostaje nejasno, neke studije su predložili Mir-184 kao potencijalni onkogenim kandidata. Jedna studija o karcinomu pločastih stanica (SCC) jezika pokazala je da Mir-184 može igrati ulogu u dijelu u anti-apoptoze i proliferacije jezik SCC stanica [27]. Druga studija je pokazala da je prvo Mir-184 znatno smanjen razvoj tumora i povećanog ukupno preživljenje u ortotropnih mišjem modelu neuroblastoma [28]. Kasnije istraživanje pokazalo je da Mir-184 je bio uključen u zajedničku genetsku put kroz ciljanje kinaze AKT2 serin /treonin djelujući s faktorom MYCN transkripcije inhibiraju preživljenje stanica neuroblastoma [29]. Uzeti zajedno, ove studije ukazuju na moguću ulogu Mir-184 u modulaciji rizik od raka. Međutim, nije jasno da li SNP u vezna mjesta mogu dovesti do promjene takvu modulaciju. Pregled

U našem prethodnom istraživanju u 1.077 bolesnika s karcinomom skvamoznih stanica glave i vrata (SCCHN) i 1.073 oboljelih od raka bez kontrole u non-Hispanjolci bijela populacija, koja ocjenjuje udruga iz SNP-a TNFAIP 2 pregled gena s SCCHN rizika [24], također je utvrdio da, u usporedbi s rs8126 TT genotip, neusvojena CT i CC genotipovi bili su povezana s povećanim rizikom SCCHN u alela-odgovora na dozu način [18]. U korelacije genotipa-fenotip 37 SCCHN staničnih linija i mononuklearnih stanica periferne krvi (PBMC) od 43 SCCHN pacijentima rs8126CC genotip povezan sa smanjenom ekspresijom TNFAIP2 pregled mRNA. Uzeti zajedno, ovi rezultati ukazuju na to da je Mir-184 vezno mjesto SNP (rs8126T > C) u 3'UTR TNFAIP2 pregled je funkcionalna, možda modulacijom TNFAIP2 pregled izraz i doprinosi SCCHN osjetljivost [18]. Naši rezultati u raka želuca su u skladu s onima u području glave i vrata raka. Pregled

Iako je naša studija nije otkriti bilo glavni učinak drugih SNP-u je Mirna vezna mjesta za TNFAIP2 pregled na ukupni rizik karcinoma želuca, nismo pronašli da rs8126 CC varijanta homozigota genotip, u usporedbi s kombiniranim genotipova (TC + ​​TT), bio je povezan sa značajno povećanim rizikom od nastanka karcinoma. Statistička dokazi koji bi mogli biti kontinuirana samo u jednoj podskupini alkoholičara slojevitost analizira ukazuje na vrlo ograničenu veličinu uzorka prema ovom istraživanju. Iako je uporaba duhana i alkoholnih potrošnja je smatran glavnim rizicima za rak želuca, naš odgovarajući dizajn je namijenjen za kontrolu njihove zbrka na glavnih učinaka odabranih SNP-ova, u kojoj overmatching moglo dogoditi zbog mogućih povezanosti koji se podudaraju varijabli (dob i seks), a poznati čimbenici rizika (pušenje i pijenje) u ovom istraživanju populacije. U dodatne analize haplotipa, dok su četiri uobičajena frekvencija haplotipovi nisu pokazali statističku povezanost rizik od raka, na manju učestalost haplotip rs8126 /rs1052823 /rs710100: C-G-G pokazao da imaju povećan rizik, u usporedbi sa zajedničkim haplotipa T-G-G. Analiza niske frekvencije haplotipova sugerira drugačiji zaključak, naime, da postoji svibanj biti tipizirana niske frekvencije SNP koji je povezan s rakom želuca. Dodatne studije su potrebne kako bi potvrdili ovaj rezultat. Pregled

Međutim, budući da je ova studija je, kako nam je poznato, prva studija o TNFAIP2 pregled SNP i želuca smanjuje rizik od raka, naši rezultati su najbolji u obzir preliminarni, a veće studije su jamstvo da dodatno procijeniti ulogu ovih SNP-ova u etiologiji raka želuca. Drugo ograničenje u studiji je nedostatak informacija o H. pylori
status infekcije subjekata. Budući da H. pylori pregled infekcije želuca bolesnika bio je relativno rijedak u SAD-u [30], u usporedbi s onima u Južnoj Americi [31] i azijskih zemalja [32], pacijenti regrutirani u našem istraživanju nisu bili testirani na infekcije nakon njihovog posjeta bolnica. Stoga, uključivanje H. pylori pregled informacija treba uzeti u obzir u budućim većim studijama. pregled

Priznanja

Zahvaljujemo Margaret pluća i Jessica Fiske za pomoć u zapošljavanju subjekte i prikupljanje informacija upitnik i Jianzhong On, Kejing Xu, a Min Zhao, a za njihovu pomoć u preradi krvi i DNA ekstrakcije. pregled