PLoS ONE: Mir-184 Įrišimas-Svetainės rs8126, T > C polimorfizmas į TNFAIP2 yra susijęs su rizika skrandžio vėžio

Anotacija

Fonas

TNFAIP2
yra svarbus genas dalyvauja apoptozės. Vieno nukleotido polimorfizmas (SNP) Savo Mirna jungimosi vietų gali moduliuoti funkcijų Mirna netikslinių genų ir tokiu būdu riziką vėžio. Šiame tyrime mes ištirti ryšį tarp potencialiai funkcinių VNP-ai į Mirna jungimosi vietų į TNFAIP2 parsisiųsti ir skrandžio vėžio rizika JAV gyventojų.

metodų 3'UTR srities

Mes atlikome atvejo-kontrolės tyrimas 301 skrandžio vėžiu sergantiems pacientams ir 313 vėžiu be kontrolės dažnumą atitikimo pagal amžių, lytį ir tautybę. Mes genotipą keturių pasirinkote TNFAIP2
SNP (rs8126, T > C rs710100 "G > A rs1052912" G > A ir rs1052823 G > T). Ir naudojo logistinės regresijos analizę siekiant įvertinti jų asociacijos, VNP-ai su vėžio rizika

rezultatai

rs8126 CK genotipas buvo susijęs su žymiai padidėjusi rizika skrandžio vėžiu (koreguotas = 2.00, 95% PI = 1,09-3,64 ir p
= 0,024) , palyginti su bendromis rs8126 TT + TC genotipų, ypač dabartinių geriančių. Tačiau nė vienas iš kito, TNFAIP2
SNP buvo susijęs su rizika skrandžio vėžio.

Išvados

Mūsų duomenys rodo, kad TNFAIP2
Mirna privalomas svetainė rs8126 T > C SNP gali būti žymeklis jautrumo skrandžio vėžio, ir ši išvada reikia toliau jį patvirtinti didesnių tyrimų

nurodomoji dalis: Xu Y Ma o, J. o Liu Z Wang Le Tan D. ir kt. (2013) Mir-184 Įrišimas-Svetainės rs8126, T > C polimorfizmas yra TNFAIP2
yra susijęs su rizika skrandžio vėžio. PLoS ONE 8 (5): e64973. Doi: 10,1371 /journal.pone.0064973

redaktorius: Natanas A. Ellis Ilinojaus universitetas Čikagoje, Jungtinės Amerikos Valstijos

Įstojo: Lie 23, 2012 m Priėmė: Balandžio 23, 2013 m Paskelbta: Gegužės 28, 2013

Visos teisės saugomos: © 2013 Xu et al., Tai atviros prieigos straipsnis platinama pagal Creative Commons Attribution licencija, kuri leidžia nevaržomai naudotis, paskirstymo ir dauginimąsi bet kokioje laikmenoje sąlygomis, su sąlyga, kad pirmasis autorius ir šaltinis įskaitomos

Finansavimas:. Šis darbas parėmė nacionalinio sveikatos instituto suteikia R01 CA131274 ir R01 ES011740 (K. Wei) ir P30 CA016672 (Teksaso MD Anderson Cancer Center universitetas). Jo turinys vien autorių atsakomybė ir nebūtinai atitinka oficialią nuomonę apie Nacionalinių sveikatos institutų. Į finansuotojai neturėjo vaidmenį studijų dizainas, duomenų rinkimo ir analizės, sprendimų skelbti, ar ruošiant rankraštį

konkuruojančių interesų: prof. Qingyi Wei iš M. D. Anderson Hiustonas, Teksasas, yra už PLoS ONE redaktorius. Tai nekeičia autorių laikytis visų PLoS ONE politikos dalijimosi duomenimis ir medžiagų.

Įvadas

Skrandžio vėžys yra viena iš pagrindinių priežasčių vėžio mirčių pasaulyje, nors abu jo dažnis ir mirtingumas mažėjo naujausioje dešimtmetį [1]. 2010, ten buvo maždaug 21.000 naujai diagnozuota pacientams ir 10,570 mirčių šios ligos Jungtinėse Amerikos Valstijose [2]. Epidemiologiniai tyrimai rodo, kad aplinkos veiksniai, įskaitant dietos aukštos sūdyti ir nitrinti maisto, tabako, alkoholiniai suvartojimo ir ypač Helicobacter pylori
( h. Pylori
) infekcijos, yra svarbūs veiksniai, su skrandžio vėžio etiologijos [3]. Tačiau tik žmonių priimti panašias gyvenimo stilių ar frakcija veikiami tų pačių aplinkos rizikos veiksnių galiausiai išsivysčiusių skrandžio vėžiu, rodo, kad priimančiosios arba genetinių veiksnių, taip pat gali vaidinti svarbų vaidmenį ligos etiologiją [4].

Tarp visų patofiziologinių kitimo, susijusio su įvairių etiologinis veiksnių, susijusių su skrandžio vėžio, oksidacinio DNR pakenkimo epitelinių ląstelių, skrandžio indukcija buvo įrodyta, kad stiprus nurodo į kancerogenezėje [5], [6]. Kad būtų užkirstas kelias nekontroliuojamai ląstelių augimą, gaunama iš šio DNR pažeidimai rūšies, kai ląstelės ciklo kontrolės mechanizmai turi būti pradėtas, kad būtų išvengta mutacijų atsiradimo arba į inicijuoti apoptozę ląstelių su didele žala DNR.

mikro RNR ( miRNAs), iš endogeninio ar mažų ne kodavimo reguliavimo RNR klasė, neigiamai reguliuoti genų ekspresiją ne po transkripcijos lygio per hibridizacija papildomų sekų 3 "neišverstas regione (3'UTR) Tikslinių Messenger RNR (iRNR) [ ,,,0],7], [8], [9], [10]. Naujausi tyrimai parodė reikšmingą poveikį miRNAs apie įvairių biologinių procesų, įskaitant ląstelių diferenciacijos, dauginimosi, ląstelinį ciklą, taip pat apoptozės. Altered išraiškos miRNAs taip pat jų galimos funkcijos naviko slopintuvai ir onkogenų buvo įrodytas kelių tipų vėžio, įskaitant skrandžio vėžio [11], [12]. Tuo tarpu, keli gana dažni genetiniai variantai, pavyzdžiui, vieno nukleotido polimorfizmas (SNP), buvo nustatyta, kad biologinių žymenų, skirtų genetinis polinkis vėžio molekulinės epidemiologinių tyrimų. Dėl jų galimą poveikį Mirna saviraiškos ir vėlesnio poveikio iRNR transkripcija, Mirna VNP-ai ar Mirna susijusių VNP-ai, kaip antai įsikūręs Mirna jungimosi vietų ties 3 'neišverstas regione (UTR) jų tikslinių genų, buvo susijęs su esminiai genetiniai veiksniai jautrumo įvairių vėžio. Nuo jų vaidmenys vėžio etiologija lieka neaišku, svarbu suprasti funkcinius ir evoliucinę reikšmę šių Mirna susijusių VNP-ai per jų poveikis vėžio rizikai ir jų sąveika su aplinkos rizikos veiksnių skrandžio vėžio [13] etiologijos.

Priklausymas SEC6 šeimos, naviko nekrozės faktoriaus α-baltymas 2 (TNFAIP2, taip pat žinomas kaip B94 arba EXOC3L3), kuris yra vienos rūšies proapoptotinį baltymų, iš pradžių buvo nustatyta, kad geno, kurio išraiška gali būti sukeltas pagal naviko nekrozės faktoriaus alfa (TNF) į bambos venos endotelio ląstelių [14]. TNFAIP2
yra chromosomos 14q32 ir koduoja iš 654 aminorūgščių liekanų baltymų kurių tariamasis molekulinė masė 73 kDa. Susideda iš 11 egzonų ir 10 intronai TNFAIP2
apima maždaug 13.45 KB genomo DNR [15]. Į dbSNP duomenų bazę (http://egp.gs.washington.edu/~~HEAD=pobj), tai genas Pranešama, kad 180 SNP, iš kurių 15 SNP į 3'UTR srities TNFAIP2
yra įsikūręs prognozavo miRNAs jungimosi vietų, bet tik keturi iš šių Mirna susijusių VNP-ai yra dažni [ty nedidelis alelio dažnis (ADP) > 0,05]. Šie keturi SNP yra rs8126 T > C (lokalizuotas per privalomą svetainėje Mir-184), rs710100 G > A (pagal Pasaulis-155), rs1052912 "G > A (pagal Pasaulis-105) ir rs1052823 G > T (per miR- 550) (http://compbio.uthsc.edu/miRSNP) [pav. 1A].

Neseniai atlikti tyrimai parodė, kad šie SNP padarytų per Mirna jungimosi vietų potencialiai gali būti susijęs su žmogaus vėžio rizika [15], [16]. Taigi, mes iškėlė hipotezę, kad TNFAIP2
SNP yra susijęs su polinkiu į skrandžio vėžį. Norėdami patikrinti šią hipotezę, mes atlikome atvejo-kontrolės tyrimą, kuriuo siekiama įvertinti ryšį tarp šių keturių TNFAIP2
SNP į Mirna jungimosi vietų ir rizikos skrandžio vėžio JAV ne Ispaniškas baltas gyventojų.

medžiagos ir metodai

Studijų dalykai

Studijų dalykai buvo pacientams, sergantiems naujai diagnozuota ir histologiškai patvirtinta skrandžio vėžio Teksaso MD Anderson Cancer Center (Hiustonas TX) universiteto nuo 2002 kovo iki 2011 vasario, kurie buvo įdarbinti nuolat atvejo-kontrolės tyrimo skrandžio vėžio. Tuo pačiu metu, vėžio nemokamai kontrolinės grupės tiriamųjų buvo įdarbinti naudojant dažnio prisitaikymo amžiaus (± 5 metai), seksas ir etniškumas (ne Ispaniškas baltymus vs kiti) vykstančio molekulinės epidemiologijos tyrimo galvos ir kaklo vėžiu nuo 2002 ir 2011 m [17]. Šie vėžio nemokamai kontrolinės grupės tiriamųjų nebuvo ligoninių pacientai, kurie buvo ieško sveikatos priežiūros, nei genetiškai nesusiję su atvejais. Papildoma informacija apie rizikos veiksnius, pavyzdžiui, rūkymo ir alkoholio vartojimo, buvo surinkta iš kiekvieno reikalavimus atitinkančio subjekto, kuriam buvo numatyta sutikimą. Tyrimo protokolas buvo patvirtintas Teksaso MD Anderson Cancer Center institucinio vertinimo tarybos universitete.

genotipo

Genomo DNR buvo išskirta iš Leukocitų kailio frakcija kiekvieno kraujo mėginio, naudojant kraujo Mini Kit (Qiagen, Valensija, Kalifornija), pagal gamintojo instrukcijas. DNR švarumo ir koncentracijos lėmė spektrofotometru matuojant optinį tankį esant 260 ir 280 nm UV spektrofotometras.

atrinkti du, TNFAIP2
SNP, rs710100 ir rs1052912 buvo genotipą naudojant TaqMan metodiką 384 duobučių lėkšteles ir skaityti su Sequence Detection Software apie ABI-Prizmė 7900 priemonę, pagal gamintojo nurodymus, Applied Biosystems (Foster City, CA), kurie taip pat tiekiamas pradmenis ir zondai. Kiekvienas plokštė įtraukti keturis neigiamus kontrolinius mėginius, dubliuoti teigiamos kontrolės ir aštuonis pakartotinius mėginius. Amplifikacijos sąlygos buvo taip:. 50 ° C temperatūroje 2 min, 95 ° C temperatūroje 10 min, po to 40 ciklų 95 ° C temperatūroje 15 sekundžių, ir 60 ° C temperatūroje 1 min

Kadangi TaqMan tyrimas nebuvo tinkamas kitų dviejų VNP-ai, ty, rs8126 ir rs1052823, jie buvo nustatytas genotipas pagal PGR-restrikcijos fragmentas Polimorfizmas ilgio metodu, kuriame praimerius, siekiant sukurti naujų restrikcijos vietas, naudojamų sustiprinti fragmentus, kuriuose yra polimorfizmus už abiejų dviejų VNP-ai. [18] pradmenų, naudojamų genotipo tyrimų sekos buvo 5'-GGGGCCGGCTCTCTTGGGCC-3 'ir 5'-CACACGTACAAAGACCTTGGGCATCC-3' už rs8126, ir 5'-CCTTCGGACTCAGGCATGACTC-3 'ir 5'-GTAAGGCAGTACCTGGGAAAAGGGTA -3 "už rs1052823. PGR profilis: pradžioje iš lydymosi pakopos 95 ° C temperatūroje 5 min, 35 ciklų 95 ° C temperatūroje 30 S, 60 ° C temperatūroje 45 s ir 72 ° C temperatūroje 1 min ir galutiniu pratęsimo žingsnio 72 ° C temperatūroje 10 min. PGR produktai rs8126 C alelio 105 bazių porų (bp) buvo suardomas Apa
Aš fermento (New England Biolabs, Beverly, MA) į du fragmentus 85 bp ir 20 bp, o tų rs1052823 G alelis 108 bp buvo suardomas RSA
(naujas Anglija BioLabs) trijų fragmentų 83 bp, 15 bp ir 10 bp. Tyrimas sėkmės rodiklis visiems genotipų buvo > 99%, o kartotinių tyrimai dėl > 10% mėginių buvo 100 derančius

Statistinė analizė

χ ^{2 bandymai. buvo atliekami palyginti demografinių kintamųjų ir pasirinktų rizikos veiksnių, tokių kaip rūkymas ir alkoholinių suvartojimo pasiskirstymą tarp atvejų ir kontrolės. Hardy-Weinberg pusiausvyra buvo išbandytas pagal gerumą-of-Fit χ 2 bandymas palyginti pastebėtus genotipas dažnius su tikėtina tie vėžiu be kontrolės. Į genotipų asociacijos TNFAIP2
SNP su rizika skrandžio vėžio buvo įvertinta apskaičiuojant šansų santykį (ŠS) ir jų 95% pasikliautinasis intervalas (CIS) iš abiejų univiariate ir daugiamatis logistinės regresijos modelių atvejo-kontrolės analizės , po stratifikacijos pagal amžių analizė (≤59 vs > 59 metų), lytį, tautybę (balta vs ne balta), rūkymas ir alkoholio vartojimas statusą. Visi šie tyrimai buvo atliekami su arba be koregavimo demografinių kintamųjų ir pasirinktų rizikos veiksnių. Proc haplotipas į SAS /genetikos programinės įrangos, naudojant lūkesčiai-max imization (EM) algoritmą buvo atliktas siekiant generuoti maksimalaus tikėtinumo sąmatas haplotipas dažnius. Haplotipų su dažniais, < 5% buvo sujungti į vieną grupę. Visi testai buvo dvipusiai, ir P
< 0,05 buvo laikomas už statistinio reikšmingumo nukirpimas. Visi statistinės analizės buvo atliekamos su statistinė analizė sistemos programinė įranga (Versija 9.2; SAS Institute, Cary, NC).}

Rezultatai

demografinės charakteristikos ir rizikos veiksniai skrandžio vėžio

Šiame tyrime dalyvavo 301 skrandžio vėžiu sergantys pacientai ir 313 vėžiu nemokamai kontrolę. 1 lentelė apibendrina demografinių charakteristikų pasiskirstymas ir pasirinktas rizikos veiksnius skrandžio vėžio. Dėl dažnio atitikimą naudojami mūsų studijų dizainas, nebuvo reikšmingo skirtumo paskirstymo amžiaus (amžiaus mediana 59 metų amžiaus), lytį ir tautybę. Matyt, nebuvo jokio skirtumo rūkymo ir gėrimo statusą tarp atvejų ir kontrolės. Tačiau šie kintamieji buvo toliau pakoreguota atsižvelgiant į tolesnius daugiamatis logistinės regresijos modelių kontroliuoti už bet kokius likusius komplikuota dėl pagrindinės poveikio pasirinktų VNP-ai.

TNFAIP2
genotipai ir rizikos skrandžio vėžio

genotipas pasiskirstymai pasirinktų keturių TNFAIP2
VNP-ai tarp atvejų ir kontrolės, yra išvardyti 2 lentelėje pastebėtam dažnių genotipas šių VNP-ai visi buvo susitarusi su tais, tikimasi Hardy-Weinberg pusiausvyros dalykai ( P
= 0,234 už rs1052823 G > T P
= 0,698 už rs710100 G > A ir P
= 0,125 už rs1052912 G > A), išskyrus už rs8126 T > C ( P
= 0,013) atvejais. Prašymo dėl TNFAIP2
rs8126 T >genotipų pasiskirstymas C buvo 56.48% už TT, 32.56% CT ir 10.96% už CK nustatytais atvejais, gerokai skiriasi nuo tų, kontrolės, kuris buvo 52,72% ir TT , 41,53 CT ir 5,75 už CC. Šis skirtumas buvo statistiškai reikšmingas ( P
= 0,019) pagal recesyvinis modelio (rs8126 T > C CC /TT + KT). (2 lentelė)

Be to, TNFAIP2
SNP rs8126, T > C vienintelis iš keturių pasirinkto TNFAIP2
SNP į Mirna jungimosi vietų, statistiškai reikšmingas ryšys tolesnį logistinė regresinė analizė. Tiksliau, rs8126 homozigotiškas CK genotipas buvo tik ribinis susijęs su padidėjusia rizika skrandžio vėžiu (pakoreguota arba = 1.76, 95% PI = 0,96-3,27 ir P
= 0,072), lyginant su TT genotipą, bet ši rizika padidėjo (koreguotas = 2.00, 95% PI = 1,09-3,64 ir P
= 0,024), palyginti su bendromis rs8126, T variantas genotipų (2 lentelė). Tačiau po sluoksninė analizę pagal amžių, lytį, tautybę, rūkymas ir alkoholio vartojimas statusą, tik dabartinių rūkalių pogrupyje, bet ne girdyklas, ar padidėjusi rizika likti statistiškai reikšmingas su didesniu variacijos įvertinimų (Pritaikytas arba = 4.04 , 95% PI = 1,08-15,08 ir P
= 0,038) (3 lentelė), nors pogrupis turėjo ribotas pastabas. Joks kitas reikšmingas ryšys rastas bendrų padarinių visų keturių TNFAIP2
VNP-ai į Mirna jungimosi vietų analizė.

TNFAIP2
haplotipų ir rizikos skrandžio vėžio

haplotipas taip pat buvo ištirta, siekiant nustatyti, ar kokia nors konkreti haplotipas gali būti susijęs su skrandžio vėžio riziką. Kaip parodyta Fig. 1B, TNFAIP2
rs1052823 ir rs1052912 yra didelė šarnyro pusiausvyros pažeidimo (LD) (r ^{2 = 0,87); Todėl rs1052912 nebuvo įtraukti į haplotipas analizė. Keturi haplotipas buvo įrodyta, kad dažniai > 5% tarp visų atvejų, o kiti rečiau pasitaikantys haplotipų (dažniai < 5%) buvo sujungti į vieną grupę į analizę. Keturių bendrų haplotipas (rs8126 /rs1052823 /rs710100 T-G G C-G-A, T-G-A ir C-t-A) sudarė 90.53% ir 94.72% nuo bylų ir kontrolę, atitinkamai chromosomų. Tačiau dažnių pasiskirstymas haplotipų statistiškai reikšmingai nesiskyrė tarp atvejų ir kontrolės, ir jų asociacijos, kurių rizika skrandžio vėžio nebuvo reikšmingas, taip pat. Be tolesnei analizei apie kitus nedažni haplotipų, kad haplotipas rs8126 /rs1052823 /rs710100: CGG statistiškai reikšmingas ryšys su vėžio rizika (Pritaikytas arba = 2.60, 95% PI = 1,39-4,85 ir P
= 0,003) , palyginti su bendrąja haplotipas TGG. (4 lentelė)}

Diskusijos

Ši ligoninė pagrindu atvejo-kontrolės tyrimo, mes nustatėme, kad TNFAIP2
Pasaulis-184 jungimosi vietos variantas rs8126 CK genotipas buvo reikšmingai susijęs su padidinta rizika susirgti skrandžio vėžio gydymui recesyvinį genetinės modelį. Be stratifikacijos analizės, toks poveikis buvo labiau akivaizdu dabartinių geriančių, kurie gali būti atsitiktinis pogrupyje. Tačiau nebuvo statistinis įrodymų, kad su rizika, kad pirmajame variante genotipų kitų pasirinktų VNP-ai, įskaitant rs1052823 G >ligos asociacijas; T rs710100 "G > A ir rs1052912" G > A nei bendras analizes ar susisluoksniavusi analizę pagal amžių, rasės, tautybės, rūkymas statusas ar gerti statusas. Be to, haplotipas analizė nenustatė jokių papildomų pogrupius su bendru dažnumo didelė rizika.

Neseniai du genomo asociacijos studijos (GWASs) pranešė reikšmingas asociacijas keletą genetinių variantų su skrandžio vėžio rizikos Kinijos gyventojų taip pat Japonijos ir Korėjos gyventojai [19], [20]. SNP iš TNFAIP2
genas nebuvo tarp pateikiamų top-hitai, nes tik alelių asociacijų, o ne genetinius modelius, kaip antai recesyvinis modelį, buvo išbandytas šių GWAS studijas. Šioje studijoje su ribotu imties dydis, pasirinktas SNP rs8126, T > C SNP TNFAIP2
Mirna privalomas svetainė, SNP, kad nebuvo įtrauktas, nei LD su įtraukė į GWAS lustas, buvo susijęs su skrandžio vėžio. Ši išvada, tačiau reikia toliau jį patvirtinti didesnių studijas.

Keletas tyrimų ištyrė VNP-ai vaidmenį Mirna jungimosi vietų į skrandžio vėžio etiologiją. Atvejo ir kontrolės asociacijos tyrimas Japonijos gyventojų 552 atvejų ir 697 kontrolės parodė, kad rs2910164 CK genotipas anksto miRNAs (MIR-146A) buvo statistiškai susijęs su padidėjusia rizika skrandžio vėžio [21]. Kitas panašus skrandžio vėžio tyrimas Kinijos gyventojų parodė žymiai padidėjusi rizika tiriamiesiems su variantas CC homozigotas PPN-196a-2, palyginti su laukinio tipo homozigotiniu TT ir heterozigotinių CT vežėjams. Tai SNP taip pat buvo įrodyta, kad turime stiprią asociaciją su limfmazgių metastazių [22]. Panašus poveikis kombinuotiems rs895819 AG + GG genotipų val-mir-27a A Kinijos atliktas tyrimas Qingmin S buvo rasta ir kt
[23]. Daugiau funkciniai tyrimai parodė, kad variantas C alelis gali būti atsakingas už padidėjusi išraiškos PPN-27a, mažinant iRNR raiška jos tikslinio geno ZBTB10
(cinko pirštų ir BTB domeną, turintį 10), galimas mechanizmas kuris HSA-mir-27a
SNP vaidina svarbų vaidmenį skrandžio vėžio jautrumą [23]. Tačiau nėra paskelbti tyrimai tyrė SNP gyvenantis Mirna privalomas seka skrandžio vėžio vaidmenį.

TNFAIP2
( B94
) yra citokinų varoma pirminis atsakas genas, kuris iš pradžių buvo klonuotas iš TNF-alfa-indukuojamas transkripto žmogaus stimuliuojama endotelio ląstelių [15]. Tolesni tyrimai parodė, kad tai gali būti aktyvuota, išskyrus TNF veiksnių, įskaitant interleukino-1β ar lipopolisacharidų [24]. Iš TNFAIP2
išraiška buvo atskleista būti egzistavo embriono kepenyse ir inkstuose, taip pat vyrų subrendusių lytinių ląstelių ir kraujodaros ir limfinių audinių [25]. Nors funkcija TNFAIP2
genas vis dar nėra plačiai žinomas, buvo pasiūlyta, kad TNFAIP2
gali žaisti kelis vaidmenis organų vystymąsi, įskaitant darinius, kraujo ląstelių diferenciacijos, myelopoiesis ir spermatogenezės , Be to, buvo pranešta, kad genas buvo represuoti į čiulpų ląstelių ūmios promielocitine leukemija (APL) pacientų ir kad jos tikslinės mRNR gali būti iki reguliuojama visi-įdega-RA (retino rūgštis) [26].

MIR-184 yra viena kopija genų ir evoliuciškai užkonservuoti ne nukleotidų lygio nuo musių žmonėms. Nors jo paskirtis išlieka neaiški, kai kurie tyrimai rodo MIR-184 kaip potencialus onkogeninių kandidatą. Vienas tyrimas suragėjusių ląstelių karcinoma (SCC) liežuvio parodė, kad Pasaulis-184, gali vaidinti svarbų vaidmenį iš dalies antiapoptozės ir platinimu liežuvio somatinių ląstelių kiekio ląstelėse [27]. Kitas tyrimas parodė, kad pirmiausia Pasaulis-184 žymiai sumažino naviko vystymąsi ir padidinti bendrą išgyvenimą į orthotopic pelių modelį neuroblastoma [28]. Vėliau tyrimas nustatė, kad Pasaulis-184 buvo įtraukti į bendrą genetinį keliu per orientacija serino /treoninkinaze AKT2 veikdamas su MYCN transkripcijos veiksnio slopinti neuroblastoma ląstelių išgyvenimą [29]. Kartu paėmus, šie tyrimai rodo galimą vaidmenį PPN-184 tolygiam vėžio riziką. Tačiau neaišku, ar SNP savo jungimosi vietų gali dar pakeisti tokį moduliavimą.

Mūsų ankstesnės tyrimo 1,077 pacientams, sergantiems suragėjusių ląstelių karcinoma galvos ir kaklo (chemoterapiniais) ir 1,073 vėžio nemokamai kontrolės ne Ispaniškas baltas gyventojų, kurie įvertino į VNP-ai asociacijas TNFAIP 2
genų su chemoterapiniais rizika [24], taip pat nustatė, kad, palyginti su rs8126 TT genotipą, variantas KT ir CC genotipai buvo susijęs su padidėjusia chemoterapiniais rizika dėl reagavimo alelio dozė būdu [18]. Į genotipą-fenotipas koreliacijos analizė 37 chemoterapiniais ląstelių linijų ir periferinio kraujo vienabranduolėse ląstelių (PKVL) nuo 43 chemoterapiniais pacientams rs8126CC genotipas buvo susijęs su sumažėjusiu išraiška TNFAIP2
mRNR. Kartu paėmus, šie duomenys rodo, kad Mir-184 jungimosi vietos SNP (rs8126T > C), į 3'UTR srities TNFAIP2
yra funkcionalus, galbūt keičiant TNFAIP2
išraišką ir prisideda prie chemoterapiniais jautrumo [18]. Mūsų išvados skrandžio vėžio sutampa su į galvos ir kaklo vėžiu.

Nors mūsų tyrimas neatskleidė pagrindinį poveikį kitų VNP-ai į Mirna jungimosi vietų, TNFAIP2
apie bendrą rizikos skrandžio vėžio, mes mano, kad rs8126 CK variantas homozigotiškas genotipas, palyginti su bendromis genotipų (LK + TT), buvo susijęs su žymiai padidėjo vėžio riziką. Statistinė įrodymų, kad galėtų būti išlaikytas tik viena pogrupio geriančių į stratifikaciją analizuoja rodo labai mažą mėginio dydį šioje studijoje. Nors tabako vartojimas ir alkoholio vartojimas buvo laikomas didelės rizikos, skrandžio vėžio, mūsų derančio dizaino ketinta kontroliuoti jų komplikuota dėl pagrindinių poveikio pasirinktų VNP-ai, kuriame overmatching gali atsitikti dėl galimų asociacijų tarp atitikimo kintamųjų (amžiaus ir seksas) ir žinomi rizikos veiksniai (rūkymas ir alkoholio vartojimas) šiame tyrime gyventojų. Be papildomo haplotipas analizės, o keturi bendro dažnio haplotipas neįrodė jokios statistinės vėžio riziką asociacija, nepilnametis dažnis haplotipas rs8126 /rs1052823 /rs710100: C-G-G pasirodė padidėjo rizika, palyginti su bendrąja haplotipas, T-G-G. Žemo dažnio haplotipų analizė rodo, kitokią išvadą, būtent todėl, kad gali būti untyped žemo dažnio SNP, kuris yra susietas su skrandžio vėžio. Papildomi tyrimai yra reikalingi patikrinti šį rezultatą.

Tačiau, kadangi šis tyrimas yra, mūsų žiniomis, pirmasis tyrimas TNFAIP2
SNP ir skrandžio vėžio rizika, geriausiai laikyti mūsų išvados preliminarūs ir didesni tyrimai garantuoja, kad toliau įvertinti šių VNP-ai vaidmenį skrandžio vėžio etiologiją. Kitas dabartiniame tyrime apribojimas buvo informacijos apie H trūkumas. Helicobacter pylori infekcijos
statusą dalykų. Nuo h. pylori
infekcija skrandžio pacientų buvo gana neįprasta, JAV [30], palyginti su tais, Pietų Amerikoje [31] ir Azijos šalių [32], pacientai įdarbinti mūsų tyrime nebuvo išbandytas infekcijos po jų vizito į ligoninė. Todėl įtraukimas H. pylori
informacija turėtų būti laikoma ateityje didesnių studijas.

Padėka

Mes dėkojame Margarita plaučių ir Jessica Fiske už jų pagalbą įdarbinant dalykus ir surinkimo klausimyną, informaciją ir Jianzhong Jis, Kejing xu ir Min Zhao ir už jų pagalbą kraujo perdirbimo ir DNR ekstrakcijai.

• PLoS ONE: epigenetinius Triukšmo slopinimo miR-338-3p Prisideda prie tumorogeniš- skrandžio vėžio nukreipiant SSX2IP
• PLoS ONE: Intratumor Hipoksija Skatina imuninę tolerancijos skatinančius reguliavimo T ląstelių per TGF-β1 skrandžio vėžio