PLoS ONE: Utjecaj XPD /ERCC2 polimorfizama na rak želuca rizik među različitih nacionalnosti: sustavni pregled i meta-Analysis

Sažetak pregled

Pozadina pregled

Potencijal kseroderma pigmentna skupina D (XPD) , koji se nazivaju ekscizija popravak cross-besplatno skupina dva (ERCC2), Lys751Gln i Asp312Asn polimorfizmi su uključeni u želučanom rizik od raka među različitih nacionalnosti. pregled

Metode

cilj smo istražiti učinak XPD Lys751Gln i Asp312Asn polimorfizmi na podložnost rakom želuca između različitih etničkih skupina kroz sustavni pregled i meta-analize. Svaki početku uključeni članak zabio za kvalitetnu procjenu. Poželjne podaci su izvađeni i registrirane u bazama podataka. 13 Studije su konačno ispunjava uvjete za meta-analizu Lys751Gln polimorfizma i 9 studija za meta-analizu Asp312Asn polimorfizma. Usvojili smo se najvjerovatnije odgovarajući genetski model (recesivni model) za oba Lys751Gln i Asp312Asn polimorfizama. Potencijalni izvori heterogenosti su tražili preko podskupina i analiza osjetljivosti, te objavljivanje pristranosti su procijenjene. Pregled

Rezultati

Statistički značajna otkrića su očito što je navedeno u Azijata, ali ne u bijelaca i za XPD Lys751Gln i XPD Asp312Asn polimorfizama. Statistički značajno otkriće moglo se vidjeti u noncardia tipa rakom želuca za XPD Lys751Gln polimorfizma. Statistički značajno otkriće također može vidjeti u visokoj kvaliteti podskupini, malih i umjereno uzorak veličine podgrupa, radovi objavljeni nakon 2007. godine, ili PCR-RFLP genotipizacija podskupina za XPD Asp312Asn polimorfizma. Pregled

Zaključci pregled

Naša meta-analiza pokazuje da XPD Gln751Gln (CC) genotipa i Asn312Asn (AA) genotip svibanj činiti se biti više osjetljiv na rak želuca u azijskim populacijama, ali ne u bijelom populacijom, što ukazuje da ta dva genotipovi mogu biti važni biomarkeri želuca osjetljivosti raka za azijske populacije, pretpostavka koju treba dodatno potvrđeno u dobro dizajnirane studije među različitih nacionalnosti. Gln751Gln (CC) genotip može također biti povezana s noncardia tipa rizik od raka želuca, koji se također treba potvrditi između različitih etničkih skupina u budućnosti pregled

Izvor:. Xue H, Lu Y, Lin B, Chen J, Tang F, Huang G (2012) Utjecaj XPD /ERCC2 polimorfizama na rak želuca rizik među različitih nacionalnosti: sustavni pregled i meta-analiza. PLoS ONE 7 (9): e43431. doi: 10,1371 /journal.pone.0043431 pregled

Urednik: Rui Medeiros, IPO, Inst Port Oncology, Portugal pregled

Primljeno: 5. travnja 2012; Prihvaćeno: 20. srpnja 2012; Objavljeno: 13. rujna 2012 pregled

Copyright: © Xue i sur. Ovo je otvorenog pristupa članak distribuirati pod uvjetima Creative Commons Imenovanje License, koja omogućuje neograničeno korištenje, distribuciju i reprodukciju u bilo kojem mediju, pod uvjetom da je izvorni autor i izvor su zaslužan

financiranja. Ovo djelo je podržan od strane Nacionalne zaklade prirodoslovni Kine (donacija 30830038, 30970842 i 81071180); "973" Projekt (2012CB932604); Novi Drug Discovery projekta (2012ZX09506-001-005); ključ Projekt znanosti i tehnologije komisije općine Šangaj (potpore 10JC1410000); a Šangaj Vodeći akademska disciplina projekta (grant S30203). U financijeri nisu imali ulogu u studiju dizajna, prikupljanja i analize podataka, Odluka o objavi, ili pripremu rukopisa pregled

U konkurenciji interese.. Autori su izjavili da ne postoje suprotstavljeni interesi pregled

Uvod pregled

Iako je u svijetu želuca pojava raka je smanjen, njegova smrtnost još uvijek nalazi na drugom [1]. U Kini, rak želuca i predstavlja jedan od najsmrtonosnijih zloćudnih bolesti [2]. Kao što je poznato, zarazne, prehrambene, zaštite okoliša i genetski faktori su uključeni u želučanom karcinogeneze, ali one izložene rizičnim čimbenicima koji su u konačnici razviti rak želuca sadrži manji udio [3], sugerirajući da domaćin genetičku podložnost igra važnu ulogu u želučanom rizik od karcinoma među različitih nacionalnosti. Takvi različiti osjetljivost može se objasniti, djelomično, polimorfizama (SNP-ova) prijemljivih gena između različitih nacionalnosti [4], [5]. Naše prethodno objavljeni meta-analiza radovi su dali dodatne dokaze za takve etnički osjetljivih razlika [5], [6]. Pregled

To je široko poznato da DNA mora ostati stabilna poduzeti svoje ključne fiziološke funkcije, ali je uporno ranjive na razne endogenih i /ili egzogenih štete, a time i njezine vjerojatne mutacije mogu akumulirati i može doći do karcinogeneze zbog oštećene DNA. DNA popravak sustava, međutim, igra važnu ulogu u održavanju funkcije normalnih stanica i cjelovitost genoma kroz ukidanja oštećene DNK [7]. Naslijeđeni funkcionalne polimorfizama ili akumulirane mutacije DNA popravka gena mogu utjecati na sposobnost računala za popravak oštećene DNA, a time i modulirati rizik od raka. [8] SNP popravka gena zajedničkog DNK identificirani su [9] i pokazao da su povezani s sporadičnim karcinogeneze [10], [11]. Pregled

nukleotida ekscizija popravak (Ner), jedan od glavnih popravka DNA putova kod ljudi je sposoban za uklanjanje baznih lezije helix-iskrivljeno produkciji ultraljubičasto svjetlo (UV) i niz kemijskih sredstava [12]. XPD se vjeruje da sudjeluju u DNA amortizacija tijekom Ner i transkripciju jer posjeduje jednu cjedilu DNA ovisna ATPaze i 5'-3 'DNA uzvojnice [13], [14]. XPD (ERCC2) gen, koji se nalazi na kromosomu 19q13.3, sastoji se od 23 eksona i njegove polimorfizmi su mislili da izazove strukturne promjene Nerovu puteva i raka utjecaj osjetljivosti. Najčešće istražuju XPD polimorfizmi u udrugama s osjetljivošću od raka obuhvaćaju nonsynonymous A &C supstitucija u eksona 23 uzrokujući lizin (Liz) na glutamin (GLN) zamjene u kodon 751 (Lys751Gln, rs1052559), A nonsynonymous G > supstitucije u eksona 10 dovodi do asparaginske kiseline (Asp), na asparagin (Asn), supstitucijom u kodonu 312 (Asp312Asn, rs1799793) i sinonimi C > supstitucije u eksonu 6 uz očuvanje arginin (R) ostatak u kodonu 156 (Arg156Arg, rs238406) [15]. pregled

u 2005. godini Huang WY i sur. pregled, objavio je prvo istraživanje su uključeni u XPD Lys751Gln polimorfizma u odnosu na želučanu rizik od raka [16]. Od tada, istraživači su izvijestili udruge XPD Lys751Gln, Asp312Asn i /ili Arg156Arg s osjetljivošću na rak želuca između različitih etničkih skupina, ali s različitim ili proturječnim rezultatima [17] - [30]. Postoji samo jedan objavljeni članak u vezi Arg156Arg polimorfizma u odnosu na želučanu rizik od raka [28]. Do sada, bilo je tri relevantna objavljeni meta-analiza radovi koji se odnose na XPD polimorfizama [31] - [33]. su dva članka se uglavnom bavi ukupnim osjetljivost raka nego rak želuca osjetljivosti u dubini [31], [32], čime se osigurava manje informacija o njegovoj povezanosti s rizikom od nastanka karcinoma želuca. Što je još važnije, one tri meta-analize [31] - [33] sve nije usvojio najvjerojatniji primjereno genetski modela, a time i autentične vrijednosti tih statističkih rezultata mogla biti ugrožena pregled

U skladu s tim, cilj. naša meta-analiza bio je istražiti, korištenja najprikladnije genetski model, učinak XPD polimorfizama na rizik od raka želuca između različitih etničkih skupina i identificirati moguće izvore heterogenosti među prihvatljivih studija. pregled

Materijali i metode

Traži Strategija pregled

sustavno traženje literature provedena je za članke u vezi XPD /ERCC2 SNP-ova povezane s rizikom od nastanka karcinoma želuca. MEDLINE, EMBASE baze podataka, kineski infrastrukture Nacionalni znanja (CNKI), Web of Science i BIOSIS baze podataka istovremeno su se koristili u kombinaciji s terminima "XPD", "ERCC2", "DNA popravak", "NER", "Lys751Gln" "Asp312Asn" ili "Arg156Arg"; "gen"; "Polimorfizam", "varijantu" ili "SNP"; i "rak želuca" "karcinom želuca", ili "rak želuca" do prosinca 2011. Potraga je izvedena bez ikakvih ograničenja na jeziku. Opseg računalnog pretraživanja literature je proširen u skladu s referentnim listama pronađenih članaka. Relevantni izvorni članci su također tražili ručno. Pregled

Studija Izbor pregled

Studije o pridruživanju XPD /ERCC2 SNP-a (Lys751Gln, Asp312Asn i /ili Arg156Arg) s rizikom od raka želuca su uključeni ako je su ispunjeni sljedeći uvjeti: (i) istraživanje opisao povezanost barem jednog od XPD /ERCC2 SNP s rakom želuca; (Ii) bilo istraživanje pokazuje brojeve obje kontrole i slučajeva raka želuca; (Iii) Rezultati su izraženi kao omjer izgleda (OR) s 95% intervala pouzdanosti (CI); i (iv) studije su case-control ili postavljena case-control one. pregled

metodoloških Quality OCJENA pregled

Kako prepoznati kvalitetne studije, uglavnom smo usvojili predefinirane kriterije kvalitete ocjenjivanja u početku predložio Thakkinstian i sur
[34], adaptirao Camargo i sur
[35], a oplemenjena Xue i sur
[5] -... [7]. Kriteriji (vidi u tablici S1 online) pokrivaju vjerodostojnost kontrole, reprezentativnost slučajeva, konsolidacija od raka želuca, genotipizacija pregleda i ocjene pridruživanja. Metodološki kvalitete, neovisno procijenjena je dva ispitivača (Lin B i Lu y). Nesuglasice su riješene kroz raspravu. Bodovi u rasponu od najniže nula do najviše deset. Članci s rezultatom nižim od 6,5 smatrani su "low-ili-umjerene kvalitete" sam sebe, dok oni ne niže od 6,5 su mislili kao "visoke kvalitete" one. Pregled

Podaci Ekstrakcija pregled

sljedeće podatke iz svakog članka ekstrahira su: autora, godina izdanja, zemlji, etničke pripadnosti sudionika (kategorizirane kao bijelaca, Azijata i sl), studij dizajna, izvor kontrole, broj kontrola i predmeta, metode genotipizacija, distribucija dobi i spol, Lauren je klasifikacija (crijevna, difuzna ili mješoviti), anatomska klasifikacija (kardija ili ne-kardija karcinoma), pušenje navika, pijući navike i Helicobacter pylori pregled infekcije status. pregled

podaci su izvađeni i registrirana u dvije baze podataka, neovisno od dva ispitivača (Lin B i Lu y) koji su bili slijepi za imena časopisa, institucija ili fond dodjeljuje. Svako odstupanje između tih dviju istražiteljima je riješen od strane istražitelja (Xue H), koji su sudjelovali u raspravi s njima i izvršio konačnu odluku. Pregled

Statistička analiza pregled

Sve statističke analize provedene su pomoću Stata statistički softver (verzija 10.1, Stata Corp, College Station, TX). Obostrani Ps < 0,05 smatrane su statistički značajne. Hardy-Weinberg ravnoteže (HWE) u kontrolama ponovno je izračunat u našoj meta-analize. Hi-kvadrat ocjena prilagodbe da se ispita odstupanje od HWE (značajan na razini 0.05). Pregled

Tečajevi omjera (OR) i 95% intervali pouzdanosti (95% CI) su korišteni za procjenu čvrstoće povezanost između XPD /ERCC2 SNP i želučane rizik od raka. ILI _{1 ili 2, a ILI 3 izračunate su za genotipova CC u odnosu na AA, CA odnosu AA i CC u odnosu na CA za XPD Lys751Gln polimorfizma; AA u odnosu na GG, GA odnosu na GG, i AA u odnosu na GA za XPD Asp312Asn polimorfizma; AA u odnosu na CC, CA odnosu na CC, i AA u odnosu na CA za XPD Arg156Arg polimorfizam, respektivno. Parovima razlike su korišteni za određivanje najprikladniji genetskog modela. Ako ILI 1 = OR 3 ≠ 1 i ILI 2 = 1, recesivni model predložen. Ako ILI 1 = OR 2 ≠ 1 i ILI 3 = 1, dominantni model podrazumijeva. Ako ILI 2 = 1 /ILI 3 ≠ 1 i ILI 1 = 1, potpuni superdominantan model predložen. Ako OR R1 OR R2 1 i OR R1 OR R3 1 ili OR 1 < OR 2 < 1, a OR 1 < OR 3 < 1, prikazanje kodominantni model naznačeno [34]. Uzmi XPD Lys751Gln polimorfizma kao primjer da je ilustrirati. Ako je navedeno dominantan model, original grupiranje je propao, a nova skupina C nosača (CC plus CA), u usporedbi s AA genotipa; Ako je predloženo recesivni model CC je u odnosu na skupinu AA plus CA; ako je podrazumijevao potpuni superdominantan model, grupa CC plus AA je u usporedbi s CA; ili ako je insinuirao kodominantni model CC je u usporedbi s CA i AA, respektivno. pregled}

Statistika Q je korišten za procjenu heterogenost preko studija uključenih u meta-analizi. I-kvadrat ( Ja pregled ^{2) vrijednost, što predstavlja varijaciju u OR pripisati heterogenosti onda se upotrijebi za određivanje stupnja takvom između-studija heterogenosti [36]. Prema nedavno objavljenim kriterijima Venecija [37] ", I pregled 2 < 25% ne predstavlja heterogenost, I pregled 2 = 25-50% predstavlja umjerenu heterogenost, Ja pregled 2 = 50-75% predstavlja veliku heterogenost i Ja pregled 2 > 75% predstavlja ekstremnu heterogenost ". Između-studija varijance Tau-kvadrat (τ 2) vrijednost je također bio korišten za procjenu između-studija varijance. Na određeno učinci modela, metodom Mantel-Haenszel (M-H), korišten je za izračunavanje Spojeni ORS kada homogenost postojala na osnovi Q-test p vrijednost, ništa manje nego 0.1.By Nasuprot tome, slučajni učinci modela, koristeći DerSimonian i Laird metodom (D + L), korišten je da postoji heterogenost temelju Q-test p vrijednost manja od 0,1. Čak i za homogenost među-studija, D + Metoda L je također bio korišten. Meta-regresija analize i analiza podskupina su korišteni za istraživanje i kontrolu potencijalnih izvora heterogenosti preko studija. Značaj pomiješanih ORS testirana je Z testa (P < 0.05 je smatrana značajnom) pregled}

Analiza osjetljivosti je provedeno, u kojem su izračunate procjene meta-analiza nakon svakog jedna studija koja se izostaviti u svakom zauzvrat <.. br>

Na kraju, objavljivanje pristranosti je procijenjena obavljanje toka parcele kvalitativno, a procjenjuje se Begg-a i Egger-a testovi kvantitativno. pregled

Rezultati

Literatura traženja i odabira studija pregled

Nakon sveobuhvatne potrage, uzeo je ukupno 140 članaka u engleskom i 7 u kineski. U našoj meta-analize u početku je bilo uključeno ukupno 15 studije [16] - [30] koji su zadovoljili kriterije za uključivanje. Ti 15 studije su preliminarno primjereno meta-analize udruga s rakom želuca u vezi XPD SNP, među kojima 13 studije u pitanju XPD Lys751Gln polimorfizam [16] - [26], [28], [29], 9 studije u pitanju XPD Asp312Asn polimorfizam [17] - [21], [23], [27], [28], [30], a samo jedna studija u pitanju XPD Arg156Arg polimorfizam [28]. 1 članak [23] je indeksirana u oba engleski i kineski traženja motora pregled

Tradicionalno gledano, svaka studija koja odstupilo od HWE trebao biti uklonjen. Međutim, Minelli C et al. nedavno je istaknuo da su studije koje se pojavljuju odstupanja od HWE treba istražiti i dalje, a ne samo isključeni, osim ako postoje drugi razlozi za sumnju u kvalitetu studija [38]. Do danas, to je još uvijek neuvjerljiv li studije odstupilo od HWE treba uključiti ili isključiti u provođenju meta-analizu. U našoj meta-analizi, 3 studije u pitanju XPD Lys751Gln polimorfizma [16], [25], [29] su odstupili od HWE i 3 studija tiče XPD Asp312Asn polimorfizma [17], [27], [30] Također su odstupili od HWE; Međutim, s obzirom da je broj sudionika u tim studijama bili su veliki i budući da analize osjetljivosti će se provoditi, konačno smo ostali one studije u našoj meta-analize pregled

Dakle, 13 studija [16] -. [26] , [28], [29] s ukupno 6344 kontrola i 2750 slučajeva za XPD Lys751Gln polimorfizma i 9 studija [17] - [21], [23], [27], [28], [30] s 3429 kontrole i 1715 slučajeva za XPD Asp312Asn polimorfizma su u konačnici uvjete za meta-analizu XPD polimorfizama. Odgovarajuće karakteristike viđeni su u tablici 1 i tablici 2. dijagram toka za pretraživanje literature i studija izbor bio osvijetljen na slici 1. pregled

Općenito Meta-analiza, Meta-regresija Analize i podskupina Analize pregled

Za XPD Lys751Gln polimorfizma ili _{1 (p vrijednost) ili 2 (p vrijednost) i ILI 3 (p vrijednost) su bili 1,22 (p = 0,266), 1,11 (p = 0,369) i 1,02 (p = 0,811), odnosno, teško insinuating određeni model učinak pretpostavljenog osjetljiv C alel. Heterogenost hi-kvadrat je 29.83 (D. F. = 12), p vrijednost bila 0.003, i Ja pregled ^{2 bio je 59,8%. Nakon meta-regresijske analize pomoću jednog kovarijan (etnicitet sastavljena od bijelaca, Azijata, ili Turaka), P vrijednosti koeficijenta t vrijednost za Azijate, bijelaca, ili Turaka bili su 0.001, 0.139 i 0.585, odnosno; snažno ukazuje na to da su Azijati jedan kovarijan uglavnom mogu predstavljati izvor heterogenosti preko studija. τ 2 za Azijate, bijelaca, ili turska populacija jednog kovarijata bili 0, 0,09178, a 0,1347, odnosno. Za Azijate jednom kovarijata, τ 2 smanjio se sa 0.1233 na 0, što ukazuje Azijati jednu kovarijan može vrijediti i za 100% od izvora heterogenosti preko studija. Kad stratificiran prema etničkoj pripadnosti analize podskupina ili 1 (p vrijednost) ili 2 (p vrijednost) i ILI 3 (p vrijednost) među azijskoj populaciji bile su 2,63 (p = 0,002), 1,14 ( p = 0.653), i 1,51 (p = 0,034), odnosno visoko ukazuje recesivni modela učinak pretpostavljenog osjetljivog C alela (OR 1 = OR 3 ≠ 1, OR 2 = 1). pregled}}

Za XPD Asp312Asn polimorfizma ili _{1 (p vrijednost) ili 2 (p vrijednost) i ILI 3 (p vrijednost) su bili 1,75 (p = 0,015), 1,15 (p = 0.549), i 1,47 (p = 0,003), odnosno visoko ukazuje recesivni modela učinak pretpostavljenog osjetljivog a alela (OR 1 = OR 3 ≠ 1, OR 2 = 1) , Heterogenost hi-kvadrat je bio 9,91 (D. F. = 8), p vrijednost je 0,272 i Ja pregled ^{2 bio je 19,2%, što ukazuje ne heterogenost preko studija. Nakon meta-regresijske analize pomoću jednog kovarijan (etnicitet sastavljena od bijelaca ili Azijata), p vrijednost koeficijenta t vrijednost za etničke pripadnosti jednoj kovarijata je 0.277, što znači da je etnicitet može predstavljati jedan od izvora malo heterogenosti preko studija. τ 2 smanjio se od 0.0354 do 0.02075, što ukazuje na etničku pripadnost može vrijediti i za 41,4% od izvora malo heterogenosti preko studija. Slično tome, kada stratificirani po nacionalnosti analize podskupina ili 1 (p vrijednost) ili 2 (p vrijednost) i ILI 3 (p vrijednost) među azijsku populaciju bila 2,10 (p = 0,026), 1,22 (p = 0.574), i 1,80 (p = 0,008), odnosno, i dalje pokazuje recesivni modela učinak pretpostavljenog osjetljivog a alela (OR 1 = OR 3 ≠ 1, OR 2 = 1 ). pregled}}

Sve u svemu, recesivni genetski modela u konačnici je izabran i za XPD Lys751Gln i XPD Asp312Asn polimorfizama u našoj meta-analize. pregled

U našoj meta-analizi, dostupni podaci bili stratificirani, u svjetlu nacionalnih sudionika, u bijelaca, Azijata i turskog stanovništva. Na slici 2, statistički značajna otkrića zabilježena je u Azijata, ali ne u bijelaca ili turskog stanovništva (i XPD Lys751Gln i XPD Asp312Asn polimorfizama). Sakupljene ORS (95% CI, p vrijednost) bili su 2,41 (1,69 - 3,43, p = 0,000), 0,98 (0,82 - 1,17, p = 0,803) i 0,97 (0,33 - 2,82, p = 0,954) u Azijate, bijelaca, i turska populacija (XPD Lys751Gln polimorfizma u Dijelu a) ili 1,77 (1,19 - 2,63, p = 0,005) i 1,31 (0,86 - 1,99, p = 0,211) u Azijata i bijelaca (XPD Asp312Asn polimorfizam u Dijelu B), respektivno. Što se tiče XPD Lys751Gln polimorfizam, P vrijednosti heterogenosti Q-statistika u bijelaca, Azijata i turskog stanovništva bile 0,802, 0,701 i 0,045; Ja pregled ^{2 su 0,0%, 0,0% i 75,1%; i τ 2 su 0,0000, 0,0000 i 0,4489, odnosno, pokazujući nikakvu heterogenost unutar bijelaca ili Azijata, ali je ekstremno heterogenost unutar turskog stanovništva (prikazano u tablici 3). Što se tiče XPD Asp312Asn polimorfizam, P vrijednosti heterogenosti Q-statistika u bijelaca i Azijata su 0.180 i 0.470; Ja pregled 2 su 41,6%, odnosno 0,0%; andτ 2 su bili 0,0587 i 0,0000, odnosno, pokazujući nikakvu heterogenost unutar Azijata, ali je umjeren heterogenost unutar bijelaca (prikazani u tablici 4).}

Kao što je prikazano u Tablici 3 i Tablici 4, specifični podaci za XPD Lys751Gln i XPD Asp312Asn polimorfizmi su stratificirani, odnosno, na osnovi uzorka, u dvije podgrupe: veliki uzorak (ukupan broj kontrola i slučajeva ne manje od 500) i mala-i-umjerena uzorka (ukupan broj kontrola i predmeta manje od 500) podskupine. Nije bilo statistički značajno otkriće je navedeno u oba malih i umjerenih uzorka podgrupi ili velikom uzorku kolegom za XPD Lys751Gln polimorfizam, s obzirom da su skupljene ORS (95% CI, p vrijednost) bili su 0,96 (0,61 - 1,51, p = 0,858) za bivši i 1,17 (0,84 - 1,64, p = 0,351) za potonje, odnosno; Međutim, statistički značajan nalaz zabilježen je u malom-a-umjereno uzorka podgrupe, ali ne u velikom uzorku protuteža Asp312Asn polimorfizam, s obzirom da su skupljene ORS (95% CI, p vrijednost) bili su 1,74 (1,18 - 2,56, p = 0,005) za bivši i 1.35 (0,82-2,21, p = 0,239) za potonje, respektivno. pregled

podaci su također bili stratificirani, u skladu s ocjenama kvalitete ocjenjivanja, u visokoj kvaliteti (rezultati ne manje od 6.5) i niske i umjerene kvalitete (rezultati manji od 6,5) podskupine. Što se tiče XPD Lys751Gln polimorfizam nije bilo statistički značajno otkriće je svjedočio u bilo visoke kvalitete podgrupa ili niskim i umjerenim kvalitete kolege, s obzirom da su udružena ORS (95% CI, p vrijednost) bili su 1,20 (0,91 - 1,60, p = 0,199) za bivše i 0,61 (0,34 - 1,11, p = 0,104) za potonje. Kad etnička sub-stratifikacija je provedena za visoku kvalitetu podskupine, statistički značajno otkriće je toliko očito svjedoče među Azijatima, ali ne i statistički značajno otkriće je zabilježen kod bijelaca jer su skupljene ORS (95% CI, p vrijednost) bili su 2,54 (1,77 - 3,65, p = 0.000) za bivše i 0,98 (0,82 - 1,17, p = 0,803) za potonje, respektivno. Što se tiče Asp312Asn polimorfizam, statistički značajno otkriće je svjedočio u visokoj kvaliteti podskupine, ali ne u low-i-umjereno kolege, s obzirom da su skupljene ORS (95% CI, p vrijednost) bili su 1,56 (1,05 - 2,33, p = 0,028) za bivše i 1,42 (0,85 - 2,40, p = 0,184) za potonje. Isto tako, kad etničkoj pripadnosti pod-stratifikacija je provedena za visoku kvalitetu podskupine, statistički značajno otkriće je toliko očito svjedoče među Azijatima, ali ne i statistički značajno otkriće je zabilježen kod bijelaca jer su skupljene ORS (95% CI, p vrijednost) bili su 2.37 (1.29- 4,36, p = 0,005) za bivše i 1,31 (0,86 - 1,99, p = 0,211) za potonje, respektivno. pregled

podaci su dodatno stratificiran, u skladu s vremenom objave, u ranije objave podskupine ( radovi objavljeni prije ili tijekom 2007. godine), a kasnije objavljivanje podskupinu (radovi objavljeni nakon 2007. godine). Što se tiče XPD Lys751Gln polimorfizam, nema statistički značajnih otkrića su primijećeni na osnovu toga što su skupljene ORS (95% CI, p vrijednost) su bili 0,89 (0,66 - 1,19, p = 0,428) u bivšoj i 1.23 (0,84-1,81, p = 0.285), u posljednjem, respektivno. Što se tiče Asp312Asn polimorfizam, statistički značajno otkriće zabilježeno je u kasnijem objave podgrupe, ali ne u ranije objave podskupine na osnovu toga što su skupljene ORS (95% CI, p vrijednost) su bili 1,46 (1,02 - 2,09, p = 0,041) u bivši i 1.61 (0,89-2,92, p = 0,115) u potonjem, respektivno. pregled

Kada se rak želuca se svrstati u ne-kardija (ili distalni) i kardija podtipova, statistički značajno otkriće je pronađena među ne -cardia tipa, ali ne kod tipa za XPD Lys751Gln polimorfizma na temelju činjenice da skupljenim ORS cardia (95% CI, p vrijednost) bili su 2,03 (1,16 - 3,54, p = 0,013) među vrstama ne-cardia i 0.88 (0,66-1,18, p = 0,403) između vrsta cardia. Što se tiče Asp312Asn polimorfizam nije bilo statistički značajno otkriće je uočena kod tipa cardia na temelju toga Sakupljene ILI (95% CI, p vrijednost) je bio 0,89 (0,56-1,43, p = 0,642), ali ILI (95% CI, p vrijednost ) u vezi tipa ne-kardija ne može se izračunati, jer samo jedna studija [21] jasno navedeno brojeve genotipova tipa ne-cardia. pregled

Što se tiče patologije, rak želuca može se svrstati u crijeva, difuzno, ili mješoviti podtipova, ali samo jedna studija [19] jasno bavila i spomenuo broj genotipova difuznog raka podtipa; tako patološki podtip stratifikacija ne može biti učinjeno u našoj meta-analize. pregled

čimbenici kao što su Helicobacter pylori pregled infekcija ili pušenje ne može se analizirati u našoj meta-analizi, jer potrebnih relevantnih podataka najmanje dvije studije nisu mogli biti dostupni u našoj meta-analize. pregled

I kad se u obzir genotipizacija tehnike, nije bilo statistički značajno otkriće je zabilježen u svakoj genotipizacija tehnika podskupine za XPD Lys751Gln polimorfizam jer udružuje ORS (95% CI, p vrijednost) bila 0,94 (0,68-1,29, p = 0.701) i 1,67 (0,68-4,14, p = 0.265) u RFLP i TagMan podgrupe respektivno; Međutim, statistički značajno otkriće je navedeno u RFLP genotipizacija podskupine, ali ne u izravno sekvenciranje podskupine za Asp312Asn polimorfizam jer skupni ORS (95% CI, p vrijednost) bili 1,90 (1,09 - 3,31, p = 0,023) i 1,24 (0,70-2,20, p = 0,450), respektivno. pregled

Analiza osjetljivosti pregled

Meta-analize provedene su u više navrata, kada je uklonjen svaki pojedini studij. Rezultati su pokazali da slučajni efekti procjene prije i nakon brisanja svakog istraživanja bili su slični u cjelini, što ukazuje na umjereno visoku stabilnost rezultata meta-analize. Za XPD Lys751Gln polimorfizam, kao što je prikazano na slici 3. Dio A, najutjecajniji jedna studija o općem skupnom procjenama činilo se da je studija provedena od strane Long XD et al. [25], slučajno odstupio od HWE, analiza osjetljivosti, međutim, pokazala umjereno visoku stabilnost rezultatima iz činjenice da su ORS (95% CI, p vrijednost) su 1,12 (0,85 - 1,48, p = 0,410), prije uklanjanja te studije i 0,98 (0,83-1,15, p = 0,781) i nakon uklanjanja te studije. S obzirom na studije [16] provodi Huang WY et al. koji skreće od HWE, s OR '(95% Cl, p-vrijednost) 1,12 (0,85-1,48, p = 0.410), prije uklanjanja tog istraživanja i 1.17 (0,87-1,58, p = 0,309) i nakon uklanjanja te studije za sve etničke pripadnosti, što ukazuje na visoku stabilnost rezultata. Slično, nakon uklanjanja studije [29] provodi Engin AB i sur., Također odstupio od HWE, OR (95% Cl, p vrijednost) postali 1,19 (0,91-1,57, p = 0.209) za sve nacionalnosti, pokazuje visoku stabilnost rezultata. Ako su sve tri odstupio-HWE studija [16], [25], [29] su uklonjene, OR (95% CI, p vrijednost) postao je 1,06 (0,88 - 1,28, p = 0,555) za sve etničke pripadnosti, što ukazuje na umjereno visoka stabilnost rezultata (The ilustriraju brojke su izostavljeni zbog duljine papira). pregled

za Asp312Asn polimorfizam, kao što je prikazano na slici 3. Dijelu B, najviše utječu na jednom studija o općem skupnom procjenama, čini se, studija provedena od strane Chen Z et al. [28], analiza osjetljivosti, međutim, pokazala umjereno visoku stabilnost rezultatima iz činjenice da su ORS (95% CI, p vrijednost) su 1,48 (1,12 - 1,97, p = 0,007), prije uklanjanja te studije i 1.32 (1,04-1,70, p = 0,025) i nakon uklanjanja te studije. Ako su sve tri odstupio-HWE studija [17], [27], [30] su uklonjene, OR (95% CI, p vrijednost) postao je 1,56 (1,05 - 2,33, p = 0,028) za sve etničke pripadnosti, također ukazuje umjereno visoka stabilnost rezultata (The ilustriraju brojke su izostavljeni zbog duljine papira). pregled

Kumulativni Meta-analiza pregled

Zbirni meta-analize XPD Lys751Gln polimorfizma udruge su također provedena među Azijatima i bijelci putem asortimanom vrijeme izdanja i ukupan broj uzorka. Kao što je prikazano na slici 4. dijela A, sklonostima značajnih udruga za XPD Lys751Gln polimorfizam može vidjeti među Azijatima. Na slici 4 odjeljka B sklonostima null udruga za XPD Lys751Gln polimorfizam može se primijetiti kod bijelaca kronološkim redoslijedom. Slični sklonosti može se promatrati za Asp312Asn polimorfizma između različitih nacionalnosti populacijama (slike nisu prikazani). Pregled

Objava Bias Analiza pregled

pristranosti Objava preliminarno ispitan je dimnjak parcela kvalitativno i procjenjuje Begg-a i Egger-a testovi kvantitativno , Za XPD Lys751Gln polimorfizam, njegov lijevak zemljište (slika 5A) pokazala je da točkice gotovo simetrično raspoređena, pretežno u pseudo 95% granice pouzdanosti. P vrijednosti su 0.428 i 0.989 u Begg testom i Egger-ovim testom, odnosno, insinuirati da ne objave pristranosti. Za Asp312Asn polimorfizam, njegov lijevak zemljište (slika 5B) pokazala je da točkice gotovo simetrično raspoređena, pretežno u pseudo 95% granice pouzdanosti. P vrijednosti su 0,108 i 0,045 u Begg testom i Egger-ovim testom, odnosno, insinuirati nema ili malo publikaciju pristranosti. Pregled

Rasprava pregled

U našoj meta-analizi statistički značajnih otkrića su očito što je navedeno u Azijata, ali nije u bijelaca, kako za XPD Lys751Gln i XPD Asp312Asn polimorfizama. Također, na temelju nalaza kumulativnih meta-analize, a sklonostima značajnih udruga u Azijata za oba XPD Lys751Gln i XPD Asp312Asn polimorfizama moglo očito vidi kada razvrstani prema vremenu objave, a ukupne veličine uzorka. XPD Gln751Gln (CC) i Asn312Asn (AA) genotipovi mogu činiti se biti više osjetljiv na rak želuca u Azijata. Naši meta-analize ukazuju na to da Gln751Gln (CC) i Asn312Asn (AA) genotipovi mogu biti važni biomarkeri želučane osjetljivosti raka za Azijate, pretpostavka da treba i dalje potvrđeno u budućim dobro dizajnirane studije u azijskim populacijama. Također su različite, pa čak i suprotstavljenih udruga rizika, ako je tako, između različitih nacionalnosti treba dodatno detaljno istražio i potvrdio u budućnosti. Pregled

Za XPD Asp312Asn SNP-a, iako je Ja pregled ^{2 ( %) bio je 19,2, a τ 2 bio 0,0354, kao što je prikazano u tablici 4, teoretski predstavlja mali ili nikakav heterogenost; praktički, nakon što je etnicitet analize podskupina, vrijednosti Ja pregled 2 (%) i τ 2 postala 0.0 i 0,0000 za Azijate i 41,6 i 0.0587 za bijelaca, odnosno, što dalje ukazuje da je, zapravo bez heterogenost postojala među Azijatima studija nego kod bijelaca kolegama. S obzirom na to, mislimo da je stratifikacija ili analiza podskupina i dalje su potrebni u našoj meta-analize.}