Plos ONE: Vpliv XPD /ERCC2 polimorfizmov na Rak želodca tveganja med različnimi etničnimi skupinami: sistematični pregled in Meta-Analysis

Povzetek

Ozadje

Možna pigmentne kseroderme skupina D (XPD) , imenovan tudi popravilo izrezu navzkrižno brezplačen skupina dva (ERCC2), Lys751Gln in Asp312Asn polimorfizmi so bili vpleteni v želodčnem tveganje za nastanek raka med različnimi etničnimi skupinami.

Metode

Naš namen je, da razišče vpliv XPD Lys751Gln in Asp312Asn polimorfizmov na dovzetnost za raka želodca med različnimi etničnimi skupinami skozi sistematični pregled in meta-analize. Vsak sprva vključena članek je dosegel za kakovostno presojo. Zaželeni podatki so bili pridobljeni in so registrirana v podatkovnih bazah. 13 Študije so končno upravičeni do metaanalizi Lys751Gln polimorfizma in 9 študij za metaanalizi Asp312Asn polimorfizma. Sprejeli smo najbolj verjetno primerno genetskega modela (recesivna model) tako za Lys751Gln in Asp312Asn polimorfizmov. Možni viri heterogenosti so iskali prek podskupine in analize občutljivosti, in so bili ocenjeni objave pristranskost.

Rezultati

Statistično pomembne ugotovitve pa so bile očitno zapisano v Azijci, ne pa pri belcih tako XPD Lys751Gln in XPD Asp312Asn polimorfizmi. Statistično pomembna ugotovitev je mogoče videti na raka želodca noncardia tipa za XPD Lys751Gln polimorfizma. Statistično pomembna ugotovitev se lahko kaže tudi v visoki kakovosti podskupini, malih in srednje velikost vzorca podskupina, članki objavljeni po letu 2007, ali PCR-RFLP genotipizacija podskupina za XPD Asp312Asn polimorfizem.

Sklepi

Naša meta-analiza kaže, da lahko XPD Gln751Gln (CC), genotip in Asn312Asn (AA) genotip zdi, da so bolj dovzetni za raka želodca v azijske populacije, vendar ne v belcih prebivalstva, kar kaže, da se lahko dva genotipov pomembni biomarkerjev občutljivosti raka želodca za azijske populacije, ob predpostavki, da je treba še potrditi dobro zasnovane študije med različnimi etničnimi skupinami. Gln751Gln (CC) genotip je lahko povezana tudi z noncardia tipa tveganje za nastanek raka na želodcu, ki bi morala biti potrjena tudi med različnimi etničnimi skupinami v prihodnosti

Navedba. Xue H, Lu Y, Lin B, Chen J, Tang F, Huang G (2012): Vpliv XPD /ERCC2 polimorfizmov na Rak želodca tveganja med različnimi etničnimi skupinami: sistematični pregled in metaanaliza. PLoS ONE 7 (9): e43431. doi: 10,1371 /journal.pone.0043431

Editor: Rui Medeiros, IPO, Inst Port Oncology, Portugalska

Prejeto: 5. april 2012; Sprejeto: 20. julij 2012; Objavljeno: 13. september 2012

Copyright: © Xue et al. To je odprtega dostopa članek razširja pod pogoji Creative Commons Attribution License, ki omogoča neomejeno uporabo, distribucijo in razmnoževanje v katerem koli mediju, pod pogojem, da prvotni avtor in vir knjižijo

Financiranje:. To delo je podprt s strani The National Natural Science Foundation Kitajske (subvencije 30830038, 30970842 in 81071180); "973" Project (2012CB932604); New Drug Discovery Project (2012ZX09506-001-005); Ključ Projekt znanost in tehnologijo komisije Občine Shanghai (donacije 10JC1410000); in Shanghai Glavno Academic Disciplina Project (dotacija S30203). Med financerji imel nobene vloge pri oblikovanju študije, zbiranje in analizo podatkov, sklep, da se objavi, ali pripravi rokopisa

nasprotujočimi si interesi.. Avtorji so izjavili, da ne obstajajo konkurenčni interesi

Uvod

Čeprav je incidenca po vsem svetu želodčni rak zmanjšal, njena smrtnost še vedno na drugem mestu [1]. Iz Kitajske, želodčni rak čeprav je eden izmed najbolj letalnih malignostmi [2]. Kot je znano, so nalezljive, prehranskih, okoljskih in genetskih dejavnikov vpleten v želodcu rakotvornosti, ampak tistih, ki so izpostavljeni dejavnikom tveganja, ki v končni fazi razvoj raka želodca obsega manjši delež [3], kar kaže, da gostitelja genetsko dovzetnost igra pomembno vlogo pri želodca tveganje za nastanek raka med različnimi etničnimi skupinami. Takšne različne občutljivosti se lahko pojasni, v delu, ki ga enojnih nukleotidnih polimorfizmov (SNP), dovzetnih genov med različnimi etničnimi skupinami [4], [5]. Naši že objavljene meta-analize dokumentov so zagotovili dodatne dokaze za te etnično občutljivih razlik [5], [6].

To je splošno priznano, da je DNA ostane stabilna, da opravi svoje temeljne fiziološke funkcije, vendar je vztrajno dovzetni za različne endogene in /ali zunanjih škodo, in tako bi lahko njegove verjetne mutacije kopičijo in se lahko pojavijo nastanek raka zaradi poškodovane DNK. Sistem popravilo DNA, vendar igra pomembno vlogo pri ohranjanju funkcije normalne celice in celovitost genoma z odpravo poškodovanega DNK [7]. Dedne funkcionalnih polimorfizmov ali nabrane mutacije popravljanja DNA genov lahko vpliva na sposobnost gostitelja za popravilo poškodovanega DNK in tako uravnava tveganje za nastanek raka [8]. SNP repair genov skupne DNK so [9] identificirati in dokazati, da je povezan z sporadične rakotvornost [10], [11].

nukleotidov izrezu popravila (NER), eden od glavnih poti za popravilo DNA v ljudeh je, da odpravlja-vijačnice izkrivljajo baze lezije proizvaja ultravijolične svetlobe (UV) in vrsto kemičnih snovi [12]. XPD je verjel, da sodelujejo pri razreševanju DNK med NER in transkripcijo, saj ima single-strand DNA-odvisno ATPase in 5'-3 DNA helikaze dejavnosti "[13], [14]. XPD (ERCC2) gen, ki se nahaja na kromosomu 19q13.3, obsega 23 eksonov in njegove polimorfizmi so mislili, da lahko povzročila strukturne spremembe za NER poti in dovzetnosti za raka vpliv. Najpogosteje raziskovali XPD polimorfizmi v združenjih, z občutljivostjo raka obsega nonsynonymous A > C zamenjava v eksonu 23 povzroča lizin (Lys) do glutamin (GLN) zamenjavo v kodonu 751 (Lys751Gln, rs1052559), ki je nonsynonymous G > nadomestitve v eksonu 10 vodi do aspartinske kisline (Asp) do asparagina (Asn) substitucijo v kodonu 312 (Asp312Asn, rs1799793) in sinonim C > nadomestitve v eksonu 6. hkrati ohranjanje arginin (R), ostanek pri kodonu 156 (Arg156Arg, rs238406) [15].

leta 2005, Huang WY et al.
objavila prvo študijo vključenih v XPD Lys751Gln polimorfizma v odnosu do želodca tveganje za nastanek raka [16]. Od takrat so raziskovalci poročali združenja XPD Lys751Gln, Asp312Asn in /ali Arg156Arg z dovzetnostjo za rakom želodca med različnimi etničnimi skupinami, vendar z mešanimi ali nasprotujočih si rezultatov [17] - [30]. Obstaja samo en objavljen članek o Arg156Arg polimorfizem v odnosu do želodca tveganje za nastanek raka [28]. Do danes je bilo tri ustrezne objavljene meta-analize dokumentov, ki se osredotočajo na XPD polimorfizmov [31] - [33]. Dva članki so bili v glavnem ukvarja s splošnimi rakom dovzetne in ne dovzetnosti za raka želodca v globino [31], [32], kar zagotavlja manj informacij o svoji povezavi s tveganjem za nastanek raka želodca. Še pomembneje je, ti trije metaanalize [31] - [33] vse uspelo sprejeti najverjetnejša primerno genetskega modela, in bi bilo ogroženo, zato so avtentični vrednosti teh statističnih rezultatov

V skladu s tem je cilj. naša meta-analize je bil raziskati, z uporabo najbolj ustrezno genetsko model, učinek XPD polimorfizmov na tveganje za nastanek raka želodca med različnimi etničnimi skupinami in ugotoviti možne vire heterogenosti med upravičene študij.

materiali in metode

iskanje strategija

sistematično iskanje literature je bila izvedena za članke o XPD /ERCC2 SNP, povezane s tveganjem za nastanek raka želodca. MEDLINE, podatkovne baze Embase, kitajski infrastrukture National Knowledge (CNKI), Web of Science, in podatkovne baze BIOSIS so hkrati uporablja s kombinacijo izrazov "XPD", "ERCC2", "DNA popravilo", "NER", "Lys751Gln" "Asp312Asn" ali "Arg156Arg"; "Gen"; "Polimorfizem", "varianta" ali "SNP"; in "želodčnega raka", "karcinom želodca" ali "rak želodca" do decembra 2011 je bil Iskanje potekati brez kakršnih koli omejitev jeziku. Obseg računalniškega pregleda literature smo razširili v skladu z referenčnimi sezname pridobljenih člankov. Ustrezni originalni predmeti so iskali tudi ročno.

Študijski Izbor

Študije o pridružitvi XPD /ERCC2 ang SNP (Lys751Gln, Asp312Asn in /ali Arg156Arg) s tveganjem za nastanek raka želodca, je bilo, če je vključena bili izpolnjeni naslednji pogoji: (i) vsak študijski opisal asociacijo najmanj enega izmed XPD /ERCC2 SNP z rakom želodca; (Ii) vsaka študija poročali številke obeh kontrol in primerov raka želodca; (Iii) rezultati so bili izraženi kot razmerje obetov (OR) s 95% intervali zaupanja (CI); in (iv) Študije so bile primerov in kontrol ali ugnezdena tisti sodna nadzora.

metodoloških Quality cenitve

Če želite ugotoviti, študij visoke kakovosti, smo v glavnem sprejeti vnaprej določena merila za kakovost Cenitev sprva Thakkinstian predlagala et al
[34], prilagojen s Camargo et al
[35], ter jih izboljšala Xue et al
[5] -... [7]. Merila (razvidno iz tabele S1 spletu) zajema verodostojnost nadzora, reprezentativnosti primerov, konsolidacijo raka želodca, pregleda genotipizacije, in oceno združenje. Metodološko kakovost je neodvisno ocenila dva preiskovalcev (Lin B in Lu Y). Nesoglasja so se odpravili skozi razpravo. Ocene gibale od najnižje nič do najvišje deset. Izdelki z rezultatom nižja od 6,5, so bile obravnavane "nizko ali srednje kakovosti" tiste, medtem ko so tisti, ki ni nižja od 6,5 misli kot "visoke kakovosti" narave.

Podatki Pridobivanje

naslednje podatke iz vsakega članka so bili pridobljeni: avtorji, leto izdaje, država, narodnosti udeležencev (v kategorijo belcih, Azijci, itd), študija oblikovanja, vir kontrol, število kontrol in primerov, metode genotipizacije, distribucijo starosti in spol, klasifikacija Lauren (črevesne, difuzna ali mešana), anatomski razvrstitev (Cardia ali ne-Cardia rak), kajenje navada, pitje navade in Helicobacter pylori
stanje okužbe.

podatki so bili pridobljeni in so registrirana v dveh podatkovnih baz neodvisno dveh preiskovalcev (Lin B in Lu Y), ki so bili slepi za imena revijah, institucij ali nepovratnih sredstev sklada. Vsako neskladje med tema dvema preiskovalci so reševali raziskovalec (Xue H), ki je sodeloval v razpravi z njimi in ki je dokončno odločitev.

Statistična analiza

Vse statistične analize smo opravili s pomočjo stata statistične programske opreme (različica 10.1, stata Corp, College Station, TX). Two-sided Ps < 0,05, so bile obravnavane statistično značilne. Hardy-Weinberg ravnovesje (HWE) v nadzoru je bila ponovno izračunana v naši meta-analizo. Hi-kvadrat dobrota prileganje je bila uporabljena za testiranje odstopanja od HWE (znatno na ravni 0,05).

Kvota razmerja (OR) in 95% intervali zaupanja (95% IZ) so bili uporabljeni za oceno trdnosti vezi med XPD /ERCC2 SNP in tveganje za nastanek raka želodca. ALI _{1, ALI 2, in ali 3 so bili izračunani za genotipov CC v primerjavi z AA, CA v primerjavi z AA in CC v primerjavi CA za XPD Lys751Gln polimorfizma; AA v primerjavi z GG, GA primerjavi GG, in AA v primerjavi GA za XPD Asp312Asn polimorfizma; AA v primerjavi s CC, CA primerjavi CC in AA v primerjavi CA za XPD Arg156Arg polimorfizem oz. Parne razlike so bile uporabljene za določitev najustreznejše genetskega modela. Če ALI 1 = ali 3 ≠ 1 in OR 2 = 1, recesivno model je predlagal. Če ALI 1 = ali 2 ≠ 1 in OR 3 = 1, prevladujoč model implicitno. Če ALI 2 = 1 /ALI 3 ≠ 1 in OR 1 = 1, popolna overdominant model je predlagal. Če ALI R1 ALI R2 1 in OR R1 ALI R3 1 ali ALI 1 'ALI 2'1 in OR 1 < ALI 3 < 1, je model kodominantni navedeno [34]. Bodite XPD Lys751Gln polimorfizem kot primer za ponazoritev. Če je bil prevladujoči model navedeno, je prvotna skupina propadel in nova skupina C prevoznikov (CC plus CA), je bila v primerjavi z genotipom AA; če je bil recesivna vzorec predlagano je bilo CC v primerjavi s skupino AA plus CA; če je bila popolna overdominant modela implicitno, je skupina CC plus AA v primerjavi s CA; ali če je bil model kodominantni insinuated je CC v primerjavi s CA in z AA oz.}

statistika Q je bila uporabljena za oceno heterogenost čez študij, vključenih v meta-analizo. I-kvadrat ( I
^{2) vrednost, ki predstavlja spremembo v OR pripisati heterogenosti je bil nato uporabljen za količinsko stopnjo takšnega med študijami raznovrstnosti [36]. Po nedavno objavljenih meril Benetke [37], " I
2 < 25% ne predstavlja heterogenost, I
2 = 25-50% predstavlja zmerno heterogenost, I
2 = 50-75% predstavlja veliko heterogenost in I
2 > 75% predstavlja izjemno heterogenost ". variance med študijami Tau-kvadrat (τ 2), vrednost je bila uporabljena tudi za ocenjevanje variance med-študija. Vzorec-fiksnih učinkov, s pomočjo Mantel-Haenszlov metodo (M-H), je bila uporabljena za izračun združijo najbolj oddaljene regije, ko homogenost obstajala na podlagi Q-testne p vrednosti ne manj kot 0.1.By Nasprotno pa naključnih učinkov modela, uporabo DerSimonian in način Laird (D + L), je bil uporabljen, če je bila heterogenost glede na Q-testni p vrednost je manjša od 0,1. Tudi za homogenosti med študijami, ki se uporablja je tudi D + metoda L. Metaregresijska analize in analiza podskupin so bili uporabljeni za raziskovanje in nadzoru morebitnih virov heterogenosti celotni študij. Pomen združenih oddaljenih regij smo testirali s testom Z (P < 0,05 je zdelo pomembno)}

Analiza občutljivosti je bila izvedena, v katerih so bile izračunane ocene je meta-analiza, potem ko je vsak od študija izpusti v vsaki vrsti <.. br>

na koncu, objava pristranskost je bila ocenjena z izvajanjem lijak parcel kakovostno in po oceni Begg je in Egger je testi kvantitativno.

Rezultati

literatura iskanje in študija Izbor

po celoviti iskanje, so bile poiskane skupno 140 člankov v angleščini in 7 v kitajščini. V naši meta-analizi so bili prvotno vključenih skupaj 15 študij [16] - [30], ki je izpolnjevala pogoje za vključevanja. Te 15 študije so bile predhodno primerno meta-analize združenja z rakom želodca v zvezi XPD SNP, med katerimi je zadevna 13 študije XPD Lys751Gln polimorfizem [16] - zadevne [26] [28] [29], 9 študije XPD Asp312Asn polimorfizem [17] - [21], [23], [27], [28], [30], in samo 1 študija zadeva XPD Arg156Arg polimorfizem [28]. 1 članek [23] je bila indeksirana v angleščini in kitajski iskanjem motorjev

Tradicionalno gledano, vsaka študija, ki odstopajo od HWE bi bilo treba odstraniti.; Vendar Minelli C sod. pred kratkim poudaril, da bi bilo treba študije, ki se zdi, da odstopajo od HWE raziskovali še naprej, ne le izključiti, razen če obstajajo drugi razlogi za dvom o kakovosti študija [38]. Do danes je še vedno ni dokončen ali je treba študije odstopali od HWE vključen ali izključen pri izvedbi meta-analizo. V naši meta-analize, 3 zadevne študije XPD Lys751Gln polimorfizem [16] [25] [29] so se oddaljil od HWE, in zadeva študijah 3. XPD Asp312Asn polimorfizem [17] [27] [30] so odstopale tudi HWE; Vendar, če upoštevamo, da je bilo število udeležencev v teh študijah velik in glede na to, analize občutljivosti bi izvedli, smo na koncu ostali teh študij v naši metaanalizi

Tako je 13 študij [16] - [26]. [28], [29] s skupno 6344 kontrol in 2750 primerov za XPD Lys751Gln polimorfizma in 9 študij [17] - [21] [23] [27] [28] [30] z 3429 nadzor in 1715 primerov za XPD Asp312Asn polimorfizma so končno upravičeni do metaanalizi XPD polimorfizmov. Ustrezne značilnosti, so opazili v preglednici 1 in 2. Shematski prikaz iskanja literature in študije izboru je osvetljena na sliki 1.

Na splošno Meta-analiza, Meta-regresija Analize in podskupine Analize

Za XPD Lys751Gln polimorfizem, ALI _{1 (p vrednost), ali 2 (p vrednost), in ali 3 (p vrednost) je bila 1,22 (p = 0,266), 1,11 (p = 0,369) in 1.02 (p = 0,811), v tem zaporedju, težko sklepali posebno modela učinek domnevnega občutljivega alel C. Heterogenost chi-kvadrat je bil 29.83 (D.F. = 12), p vrednost je 0,003, in I
^{2 je bil 59,8%. Po meta-regresijsko analizo po eno kovariablo (etičnost, sestavljeno iz belcih, Azijci ali turško prebivalstvo), str vrednosti koeficienta t vrednost za Azijce, belci, ali turško prebivalstvo je bilo 0.001, 0.139 in 0.585, v tem zaporedju; močno nakazuje, da bi lahko Azijci single hkratna večinoma predstavljajo vir heterogenosti v vseh študijah. τ 2 za Azijce, belci, ali turški prebivalstva samega kovariablo bilo 0, 0,09178 in 0,1347 oz. Za Azijci samega kovariablo τ 2 zmanjšal od 0.1233 do 0, kar pomeni, Azijci sam kovariablo lahko predstavljajo 100% vir heterogenosti v različnih študijah. Ko razdeljeni glede na analizo etnično podskupin, ALI 1 (p vrednost), ali 2 (p vrednost), in ali 3 (p vrednost) med azijske populacije je bilo 2,63 (p = 0,002), 1.14 ( p = 0,653) in 1,51 (p = 0,034), v tem zaporedju, močno kaže na recesivno modela učinek domnevnega občutljivega alel C (OR 1 = ali 3 ≠ 1 in OR 2 = 1).}}

Za XPD Asp312Asn polimorfizem, ALI _{1 (p vrednost), ali 2 (p vrednost), in ali 3 (p vrednost) je bila 1,75 (p = 0,015), 1.15 (p = 0,549) in 1,47 (p = 0,003), v tem zaporedju, močno kaže na recesivno modela učinek domnevnega občutljivega a alel (OR 1 = ali 3 ≠ 1 in OR 2 = 1) . Heterogenost chi-kvadrat je 9,91 (D.F. = 8), je bila vrednost p 0,272, in I
^{2 je bila 19,2%, kaže, da ni heterogenost čez študij. Po meta-regresijsko analizo po eno kovariablo (etičnost, sestavljeno iz belcev in Azijci), str vrednosti koeficienta t vrednost za narodnosti enotno kovariablo je 0,277, kar pomeni, da etničnost lahko predstavljajo enega od virov malo raznolikosti v različnih študijah. τ 2 zmanjšal od 0.0354 do 0.02075, kar pomeni, etičnost lahko predstavljajo 41,4% vira malo raznolikosti v različnih študijah. Podobno je bilo, ko razdeljeni glede na analizo etnično podskupin, ALI 1 (p vrednost), ali 2 (p vrednost), in ali 3 (p vrednost) med azijske populacije 2,10 (p = 0,026), 1,22 (p = 0,574) in 1,80 (p = 0,008), oziroma, še bolj kaže na recesivno modela učinek domnevnega občutljivega a alel (OR 1 = ali 3 ≠ 1 in OR 2 = 1 ).}}

Če povzamemo, je bil recesivno genetsko model, na koncu izbran za oba XPD Lys751Gln in XPD Asp312Asn polimorfizmov v naši meta-analizo.

v našem meta-analize, so bili razpoložljivi podatki stratificiran, glede etničnih udeležencev, v belci, Azijci in turškega prebivalstva. Na sliki 2, so bile ugotovljene statistično pomembne ugotovitve v Azijci, vendar ne pri belcih ali turškega prebivalstva (tako XPD Lys751Gln in XPD Asp312Asn polimorfizmi). Združena oddaljene regije (95% KI, p vrednost) je bila 2,41 (1,69-3,43, p = 0,000), 0,98 (0,82-1,17, p = 0,803) in 0,97 (0,33-2,82, p = 0,954) in Azijci, belcih, in turško prebivalstvo (XPD Lys751Gln polimorfizem v delu A) ali 1,77 (1,19-2,63, p = 0,005) in 1,31 (0,86-1,99, p = 0,211) v Azijci in belci (XPD Asp312Asn polimorfizem v delu B), v tem zaporedju. Kot je za XPD Lys751Gln polimorfizem, vrednosti P heterogenosti Q-statistike pri belcih, Azijci in turško prebivalstvo je bilo 0,802, 0,701 in 0,045; I
^{2 je bila 0,0%, 0,0% in 75,1%; in τ 2 je bilo 0,0000, 0,0000 in 0,4489, oziroma, kar kaže ne heterogenost v belci in Azijci, toda skrajno heterogenost v turški prebivalstva (prikazano v tabeli 3). Kot je za XPD Asp312Asn polimorfizem, so bile vrednosti P heterogenosti Q-statistike pri belcih in Azijci 0,180 in 0,470; I
2 41,6% in 0,0%; andτ 2 so bili 0,0587 in 0,0000, oziroma, kar kaže ne heterogenost v Azijci, vendar zmerno heterogenost v belcih (prikazane v tabeli 4).}

Kot je prikazano v tabeli 3 in tabeli 4, posebni podatki za XPD Lys751Gln in XPD Asp312Asn polimorfizmi bili razdeljeni, in sicer na podlagi velikosti vzorca, v dve podskupini: velika vzorca (skupno število kontrol in primerov nič manj kot 500) ter malih in srednje vzorca (skupno število kontrol in primerov manj kot 500) podskupine. Statistično pomembna ugotovitev je zapisano v obeh malih in zmerno vzorca podskupine ali velikega vzorca protiutež XPD Lys751Gln polimorfizma, saj so zbrana najbolj oddaljene regije (95% cis, p vrednost) 0,96 (0,61-1,51, p = 0,858), za nekdanji in 1,17 (0,84-1,64, p = 0,351), za slednje, v tem zaporedju; Vendar pa je bila statistično pomembna ugotovitev je navedeno v majhnem-in-zmerno vzorca podskupine, vendar ne v velikem vzorca protiutež Asp312Asn polimorfizma, saj so zbrana najbolj oddaljene regije (95% cis, p vrednost) 1,74 (1,18-2,56, p = 0,005), za nekdanji in 1,35 (0,82-2,21, p = 0,239), za slednje, oz.

so podatki tudi stratificiran, v skladu z ocenami o kakovosti ocenjevanja, v visoki kakovosti (rezultati ne manj kot 6,5) in nizko in srednje kakovosti (rezultati manj kot 6.5) podskupin. Kot je za XPD Lys751Gln polimorfizem ni bila statistično pomembna ugotovitev priča bodisi visoke kakovosti podskupini ali nizko-in-srednje kakovosti kolegom, saj so bile združene najbolj oddaljene regije (95% cis, p vrednost) 1,20 (0,91-1,60, p = 0,199) pri prvem in 0,61 (0,34-1,11, p = 0,104), za slednje. Ko je bil etnično pripadnost sub-stratifikacija izvaja za visoko kakovost podskupine, je bila statistično pomembna ugotovitev precej očitno priča med Azijci, vendar ni statistično pomembna ugotovitev je bila med belci opozoriti, ker so zbrana najbolj oddaljene regije (95% cis, p vrednost) 2,54 (1,77-3,65, p = 0,000), pri prvem in 0,98 (0,82-1,17, p = 0,803), za slednje, oz. Kot je za Asp312Asn polimorfizem, je bila statistično pomembna ugotovitev priča v visoki kakovosti podskupinah, ne pa v nizko-in-srednje kakovosti kolegom, saj so zbrana najbolj oddaljene regije (95% cis, p vrednost) 1,56 (1,05-2,33, p = 0,028) pri prvem in 1,42 (0,85-2,40, p = 0,184), za slednje. Prav tako, ko je bila etnično pripadnost sub-stratifikacija izvaja za visoko kakovost podskupine, statistično pomembna ugotovitev je bila precej očitno priča med Azijci, vendar ni statistično pomembna ugotovitev je bila med belci opozoriti, ker so zbrana najbolj oddaljene regije (95% cis, p vrednost) 2,37 (1.29- 4,36, p = 0,005), pri prvem in 1,31 (0,86-1,99, p = 0,211), za slednje, oz.

so podatki dodatno slojevit, v skladu s časom objave, v podskupini prej objave ( članki pred ali v letu 2007) in kasneje objava podskupina (člankov, objavljenih po letu 2007). Kot je za XPD Lys751Gln polimorfizem, ni statistično so na podlagi dejstva, da so se zbrana najbolj oddaljene regije (95% cis, p vrednost) 0,89 (0,66-1,19, p = 0,428), v prvem primeru ugotovljene bistvene ugotovitve in 1,23 (0,84-1,81, p = 0,285) v slednje oz. Kot je za Asp312Asn polimorfizem, je bila statistično značilno izsledek v kasnejšem objave podskupine, vendar ne v prejšnji publikaciji podskupine na podlagi tega, da so se zbrana najbolj oddaljene regije (95% cis, p vrednost) 1,46 (1,02-2,09, p = 0,041) v nekdanji in 1,61 (0,89-2,92, p = 0,115), v slednjem, oz.

Ko se je rak želodca razvrščeni v ne-Kardije (ali oddaljeni) in Cardia podtipi, je bila statistično pomembna ugotovitev je med non -cardia tipa, vendar ne med vrsto Cardia za XPD Lys751Gln polimorfizma na podlagi tega, da združenih oddaljenih regij (95% KI, p vrednost) je bila 2,03 (1,16-3,54, p = 0,013) med tipa, Cardia in 0,88 (0,66-1,18, p = 0,403) med vrsto Cardia. Kot je za Asp312Asn polimorfizem, je med vrsto Cardia niso opazili statistično pomembna ugotovitev na podlagi dejstva, da s skupnimi OR (95% KI, p vrednost) je bila 0,89 (0,56-1,43, p = 0,642), vendar OR (95% KI, p vrednost ) glede tip non-Cardia ni bilo mogoče izračunati, saj le ena študija [21] jasno navedena števila genotipov tipa, Cardia.

V smislu patologije, želodčni rak se lahko razvrstijo v črevesju, difuzna, ali mešati podtipe, vendar samo 1 študija [19] jasno obravnavati in omenjena števila genotipov razpršenega raka influence; Tako patološki podtip razslojevanje ni mogoče narediti v naši meta-analizo.

moteči dejavniki, kot so Helicobacter pylori
okužbe ali kajenje ni bilo mogoče analizirati v naši meta-analizi, ker so potrebne ustreznih podatkov vsaj dve študiji ne more biti dostopne v naši meta-analizo.

In ko se je štela genotipizacija tehnike, ni statistično pomembna ugotovitev je bila ugotovljena v vsaki genotipizacija tehniko podskupine za XPD Lys751Gln polimorfizma, saj združi najbolj oddaljene regije (95% KI, p vrednost) je bila 0,94 (0,68-1,29, p = 0,701) in 1,67 (0,68-4,14, p = 0,265) v RFLP in TagMan podskupinah, in sicer; Vendar pa je bila ugotovljena statistično pomembna ugotovitev v RFLP genotipizacije podskupini, vendar ne v Neposredna zaporedja podskupine za Asp312Asn polimorfizma, saj smo zbrali najbolj oddaljene regije (95% cis, p vrednost) 1,90 (1,09-3,31, p = 0,023) in 1,24 (0.70-2.20, p = 0,450), sta bila.

Analiza občutljivosti

Meta-analize večkrat izvedena, ko je bila odstranjena vsaka posamezna študija. Rezultati so pokazali, da so bile ocene naključnih učinkov, pred in po izbrisu vsake študije podobno na splošno, kaže na zmerno visoko stabilnost rezultatov meta-analize. Za XPD Lys751Gln polimorfizma, kot je prikazano na sliki 3 dela A, najbolj vplivanje ena študija o skupnih združenih ocen Kaže, da je študija, ki jo Long XD et al opravili. [25], po naključju oddaljil od HWE, analize občutljivosti, pa je navedeno zmerno visoko stabilnost rezultatov iz dejstev, ki so najbolj oddaljene regije (95% CI, p vrednost) 1,12 (0,85-1,48, p = 0,410) pred odstranitvijo te študije in 0,98 (0,83-1,15, p = 0,781), po odstranitvi te študije. Glede na študijo [16] Huang WY et al izvesti. ki se oddaljil od HWE, najbolj oddaljene regije (95% interval zaupanja, p vrednost) je bila 1,12 (0,85-1,48, p = 0,410) pred odstranitvijo te študije in 1,17 (0,87-1,58, p = 0.309), po odstranitvi te študije za vse etničnosti, kar kaže na veliko stabilnost rezultatov. Podobno je po odstranitvi študije [29], ki ga Engin AB et al., Prav tako oddaljil od HWE izvedena je OR (95% interval zaupanja, p vrednost) postal 1,19 (0,91-1,57, p = 0.209) za vse etničnosti, kaže visoko stabilnost rezultatov. Če vse tri študije so odstopali-HWE [16] [25] [29] so bile odstranjene je OR (95% interval zaupanja, p vrednost) je postal 1,06 (0,88-1,28, p = 0,555), za vse narodnosti, kar kaže na zmerno visoka stabilnost rezultatov (v ponazarjajo podatki so bili izpuščeni zaradi dolžine papirja).

Asp312Asn polimorfizma, kot je prikazano na sliki 3, del B, najbolj vplivanja enotni študija o splošnih združenih ocenah zdela študija, ki jo Chen Z et al opravili. [28], analiza občutljivosti, pa je navedeno zmerno visoko stabilnost rezultatov iz dejstev, ki so najbolj oddaljene regije (95% CI, p vrednost) 1,48 (1,12-1,97, p = 0,007) pred odstranitvijo te študije in 1,32 (1,04-1,70, p = 0,025), po odstranitvi te študije. Če vse tri študije so odstopali-HWE [17] [27] [30] so bile odstranjene je OR (95% interval zaupanja, p vrednost) je postal 1,56 (1,05-2,33, p = 0,028), za vse narodnosti, ki navajajo tudi zmerno visoka stabilnost rezultatov (The ponazarjajo številke so bile izpuščene zaradi dolžine papirja).

Kumulativni Meta-analiza

so bile izvedene tudi Kumulativni meta-analize XPD Lys751Gln polimorfizem zveze med Azijci in belci preko izbor času objave in skupno število velikosti vzorca. Kot je prikazano na sliki 4 dela A bi lahko nagnjenja v smeri večjih društev za XPD Lys751Gln polimorfizma treba obravnavati med Azijci. Na sliki bi lahko ugotovil, 4 del B v naklone smeri null združenja za XPD Lys751Gln polimorfizma med belci v kronološkem vrstnem redu. lahko opazimo podobne nagnjenja za Asp312Asn polimorfizem med različnimi etnično pripadnost populacije (sliki ni prikazan).

Objava Bias Analiza

Objava pristranskosti je predhodno pregledal izpušnem parcel kvalitativno in po oceni Begg je in testi Egger je kvantitativno . Za XPD Lys751Gln polimorfizma, njegov lijak ploskve (slika 5A), je pokazala, da pike skoraj simetrično porazdeljena, pretežno v psevdo intervalom zaupanja 95%. P vrednosti so 0,428 in 0,989 v Begg testu in Egger testu, oziroma, insinuating ni objave pristranskosti. Za Asp312Asn polimorfizma, njegov lijak ploskve (slika 5B), je pokazala, da pike skoraj simetrično porazdeljena, pretežno v psevdo intervalom zaupanja 95%. P vrednosti so 0,108 in 0,045 v Begg testu in Egger testu, oziroma, lahko sklepali brez ali z malo objava pristranskosti.

Pogovor

V našem metaanalizi so bile statistično pomembne ugotovitve očitno zapisano v Azijci, vendar ne pri belcih tako za XPD Lys751Gln in XPD Asp312Asn polimorfizmov. temelji tudi na ugotovitvah kumulativnih meta-analize, bi lahko nagnjenja v smeri večjih društev v Azijci tako za XPD Lys751Gln in XPD Asp312Asn polimorfizmov se očitno opazili, ko razporejene po času objave in skupno velikost vzorca. XPD Gln751Gln (CC) in Asn312Asn (AA) genotipi morda zdi, da so bolj dovzetni za raka želodca v Azijci. Naši meta-analize kažejo, da so lahko Gln751Gln (CC) in Asn312Asn (AA) genotipov pomembne biomarkerjev dovzetnosti za raka želodca za Azijce, domneva, da je treba še potrditi v prihodnje dobro zasnovanih študij v azijskih populacijah. Tudi različne ali celo nasprotujoče združenja tveganja, če je tako, med drugim bi morale biti različne narodnosti še bolj natančno raziskati in ponovno potrdil v prihodnosti.

Za XPD Asp312Asn SNP, čeprav I
^{2 ( %) je bila 19,2 in τ 2 je bil 0,0354, kot je prikazano v tabeli 4, teoretično predstavlja malo ali nič raznolikost; praktično, po analizi etnično podskupin, vrednosti I
2 (%) in τ 2 postal 0.0 in 0,0000 za Azijce in 41,6 in 0.0587 za belcih, v tem zaporedju, nadalje kaže, da dejansko ni heterogenost med Azijci študij, ne pa pri belcih kolegi obstajala. Glede na to, menimo, da so še vedno potrebna stratifikacija ali podskupine analize v naši meta-analizo.}

• Plos ONE: naravne imunosti in ne-Hodgkinov limfom (NHL) Povezane Geni v zadevi-Control Študija Vgnezdeno za Rak želodca tveganja
• Plos ONE: Odkrivanje Molekularni mehanizem želodca Rak Marker aneksin A4 Cancer Cell širjenju Uporaba eksonu Arrays