PLoS ONE: iš XPD /ERCC2 polimorfizmas poveikį skrandžio vėžio riziką tarp skirtingų etninių grupių: sisteminė apžvalga ir meta-Analysis

Anotacija

Fonas

Galimas xeroderma pigmentinės D grupė (XPD) , taip pat vadinamas iškirpimas remontas du (ERCC2) kryžminio nemokamas grupė, Lys751Gln ir Asp312Asn polimorfizmas buvo susijęs skrandžio vėžio rizika tarp skirtingų etninių grupių.

metodai

Siekėme ištirti XPD poveikį Lys751Gln ir Asp312Asn polimorfizmas dėl jautrumo skrandžio vėžio tarp skirtingų etninių grupių sistemingai peržiūrėti ir meta-analizė. Kiekvienas iš pradžių apėmė straipsnis buvo gavo kokybės įvertinimą. Pageidautina duomenys buvo išgauti ir įregistruota į duomenų bazes. 13 tyrimai buvo galiausiai gauti meta-analizės Lys751Gln polimorfizmo ir 9 tyrimų dėl metaanalizės Asp312Asn polimorfizmo. Mes priėmė tikriausiai reikia genetinę modelį (recesyvinis modelis) tiek Lys751Gln ir Asp312Asn polimorfizmas. Potencialūs šaltiniai heterogeniškumo buvo ieškoma per pogrupio ir jautrumo analizę, ir skelbimo subtilybėmis buvo įvertinta.

Rezultatai

Statistiškai reikšmingi rezultatai buvo akivaizdžiai pažymėta azijiečių bet ne baltaodžiams tiek XPD Lys751Gln ir XPD Asp312Asn polimorfizmas. Nustatytas statistiškai reikšmingas, gali būti vertinamas noncardia tipo skrandžio vėžio XPD Lys751Gln polimorfizmo. Nustatytas statistiškai reikšmingas, taip pat gali būti vertinamas aukštos kokybės pogrupyje, mažos ir vidutinio sunkumo imties dydis pogrupis, straipsniai skelbiami po 2007 arba PGR RFLP genotipo pogrupis XPD Asp312Asn polimorfizmo.

Išvados

Mūsų metaanalizė rodo, kad XPD Gln751Gln (BK) genotipas ir Asn312Asn (AA) genotipas gali atrodyti labiau linkusios į skrandžio vėžio Azijos populiaciją, tačiau ne baltaodžių gyventojų, rodo, kad šie du genotipai gali būti svarbūs biologiniai žymenys skrandžio vėžio jautrumą Azijos gyventojų, prielaida, kad reikia dar kartą patvirtino gerai suprojektuoti studijas tarp skirtingų etninių grupių. Gln751Gln (BK) genotipas taip pat gali būti susijęs su noncardia tipo skrandžio vėžio rizika, kuri taip pat turėtų būti patvirtintas tarp skirtingų tautybių ateityje

nurodomoji dalis:. Xue O Lu Y Lin B Chen J Tango F Huang G (2012) iš XPD /ERCC2 polimorfizmas poveikį skrandžio vėžio riziką tarp skirtingų etninių grupių: sisteminė apžvalga ir metaanalizė. PLoS vieną iš 7 (9): e43431. Doi: 10,1371 /journal.pone.0043431

redaktorius: Rui Medeiros IPO, Inst uosto onkologijos Portugalija

Įstojo: Balandžio 5, 2012 m Priėmė: Lie 20, 2012 m Paskelbta rugsėjo 13, 2012

Visos teisės saugomos: © Xue ir kt. Tai atviros prieigos straipsnis platinama pagal Creative Commons Attribution licencija, kuri leidžia nevaržomai naudotis, paskirstymo ir dauginimąsi bet kokioje laikmenoje sąlygomis, su sąlyga, kad pirmasis autorius ir šaltinis įskaitomos

Finansavimas:. Šis darbas rėmė Nacionalinė Gamtos mokslo fondo Kinijos (dotacijos 30830038, 30970842 ir 81071180); "973" projektas (2012CB932604); Nauja vaistų atradimo projektas (2012ZX09506-001-005); raktas projektas Mokslo ir technologijų komisijos Šanchajaus savivaldybės (dotacijos 10JC1410000); ir Šanchajaus vedantis akademinės disciplinos projektas (dotacija S30203). Į finansuotojai neturėjo vaidmenį studijų dizainas, duomenų rinkimo ir analizės, sprendimų skelbti, ar ruošiant rankraštį

konkuruojančių interesų.. Autoriai pareiškė, kad nėra konkuruojantys interesai egzistuoja

Įvadas

Nors visame pasaulyje skrandžio vėžio atvejų sumažėjo, jo mirtingumas vis dar užima antrą vietą [1]. Kinijoje, skrandžio vėžys, net yra vienas iš labiausiai mirtinų piktybinių navikų [2]. Kaip yra plačiai žinomas, infekcinių, mitybos, aplinkos ir genetinių veiksnių yra susijęs skrandžio kancerogenezėje, bet tie, kurie patiria rizikos veiksnių, kuris galiausiai sukurti skrandžio vėžys sudaro nedidelė dalis [3], o tai rodo, kad priimančiosios genetinę jautrumą vaidina svarbų vaidmenį skrandžio vėžio rizika tarp skirtingų etninių grupių. Tokie įvairūs jautrumą galima paaiškinti, iš dalies, vieno nukleotido polimorfizmas (SNP) ligai imlių genų tarp skirtingų etninių grupių [4], [5]. Mūsų anksčiau paskelbti metaanalizė dokumentus pateikė papildomų įrodymų tokiems etniškai jautriems skirtumų [5], [6].

Plačiai pripažįstama, kad DNR turi išlikti stabili atlikti savo svarbiausius fiziologines funkcijas, bet tai atkakliai pažeidžiami įvairių endogeninių ir /arba išorės žalą ir tokiu būdu jos galimas mutacijos gali kauptis, todėl gali pasitaikyti Kancerogeninis dėl pažeisto DNR. DNR reparacijos sistema, tačiau vaidina svarbų vaidmenį išlaikant normalios ląstelės ir genomo vientisumui funkcijas per pažeistą DNR [7] atstatymui. Paveldimos funkcinius polimorfizmas ar susikaupusios mutacijos DNR remonto genų gali turėti įtakos šeimininko gebėjimą atkurti sugadintą DNR ir taip moduliuoti vėžio riziką [8]. SNP bendrų DNR remonto genų buvo [9] nustatytas ir įrodytas būti susijęs su pavienių kancerogenezėje [10], [11].

nukleotidų iškirpimas remontas (NER), vienas iš pagrindinių DNR reparacijos mechanizmus žmonėms , gali pašalinti HELIX iškreipiančių bazinių pakitimų gaminami ultravioletinių spindulių (UV) ir cheminių medžiagų [12] masyvo. XPD Manoma dalyvauti DNR nepanaikina ner ir transkripcijos metu, nes ji turi vieno kryptis DNR priklausoma ATPazės ir 5'-3 'DNR helikazės veikla [13], [14]. XPD (ERCC2) genas, esantis chromosomų 19q13.3, sudaro 23 egzonų ir jos polimorfizmas yra manoma, kad sukelti struktūrinius pakeitimus Nero kelio ir įtaka vėžio jautrumą. Plačiausiai ištirtas XPD polimorfizmas asociacijose su vėžio jautrumą sudaro nonsynonymous a > C Keitimas egzono 23 sukelia lizino (LYS) į glutamino (Gln) keistina kodono 751 (Lys751Gln, rs1052559) A nonsynonymous G > Pakeitimo egzono 10, kuri galėtų tapti asparto rūgšties (Asp) asparagino (Asn) pat gali būti pakeista kodono 312 (Asp312Asn, rs1799793), ir sinonimas C > pakeitimo į egzono 6, o išsaugojimo arginino (R) likučiai kodono 156 (Arg156Arg, rs238406) [15].

2005 m Huang WY , et al.,
išleido pirmąjį tyrimą dalyvauja XPD Lys751Gln polimorfizmo atsižvelgiant į skrandžio vėžio rizika [16]. Nuo tada, mokslininkai pranešė asociacijas XPD Lys751Gln, Asp312Asn ir /arba Arg156Arg su polinkiu į skrandžio vėžio tarp skirtingų etninių grupių, bet su sumaišytų arba prieštaringų rezultatų [17] - [30]. Yra tik vienas paskelbtas straipsnis apie Arg156Arg polimorfizmas, susijusių su skrandžio vėžio rizika [28]. Iki šiol, yra buvę trys atitinkamas paskelbtas metaanalizė dokumentai sutelkiant dėmesį XPD polimorfizmas [31] - [33]. Du straipsniai iš esmės buvo susijęs su bendrais vėžio jautrumą, o ne skrandžio vėžio jautrumą gylis [31], [32], taip suteikiant mažiau informacijos apie jo kartu su skrandžio vėžio riziką. Dar svarbiau, kad šie trys metaanalizės [31] - [33] visi nepriėmė labiausiai tikėtiną atitinkamais genetiniais modelį ir gali būti pakenkta todėl autentiškų vertybių tų statistinių rezultatų

Todėl tikslas. Mūsų metaanalizė buvo ištirti, naudojant tinkamiausias genetinę modelyje XPD polimorfizmas poveikį skrandžio vėžio rizika tarp skirtingų etninių grupių ir nustatyti galimus šaltinius heterogeniškumo tarp reikalavimus atitinkančių tyrimų.

medžiagos ir metodai

Paieška strategija

sistemingas literatūra paieška buvo atlikta straipsnių dėl XPD /ERCC2 SNP, susijusių su skrandžio vėžio riziką. MEDLINE, EMBASE duomenų bazės, Kinijos nacionalinė žinių infrastruktūrą (CNKI) Web of Science ir BIOSIS duomenų bazės buvo naudojami kartu su terminų kartu "XPD", "ERCC2", "DNR remontas", "NER", "Lys751Gln" "Asp312Asn" arba "Arg156Arg"; "Genas"; "Polimorfizmas", "variantas", arba "SNP"; ir "skrandžio vėžys", "skrandžio karcinoma" arba "Skrandžio vėžys" iki 2011 m gruodžio Krata buvo atlikta be jokių apribojimų kalba. Kompiuterines literatūros apimtis buvo išplėsta pagal atskaitos sąrašus, gautus straipsnius. Atitinkamos originalūs straipsniai, taip pat buvo ieškoma rankiniu būdu.

Studijų pasirinkimas

Tyrimai, susiję su XPD /ERCC2 SNP (Lys751Gln, Asp312Asn ir /arba Arg156Arg) kartu su skrandžio vėžio rizika buvo įtrauktos, jei buvo įvykdytos šios sąlygos: (i) bet kokį tyrimą apibūdino bent vieną iš XPD /ERCC2 VNP-ai su skrandžio vėžiu, asociaciją; (Ii) bet tyrimas pranešė abiejų kontrolės ir skrandžio vėžio atvejų skaičių; (III) rezultatai buvo išreikštas šansų santykis (OR) su 95% pasikliovimo intervalai (PI); (iv) tyrimai

metodinę Kokybės vertinimas

Jei norite identifikuoti aukštos kokybės studijas, mes daugiausia priėmė iš anksto kokybės kriterijus pareigūnų įvertinimas pradžių pasiūlė Thakkinstian buvo atvejo-kontrolės, arba įdėtos atveju kontrolės tie. ir kt
[34], pritaikyti Camargo, ir kt
[35], o rafinuotas Xue ir kt
[5] -... [7]. Kriterijai (pasireiškė S1 Lentelė online) padengti patikimumą kontrolės, reprezentatyvumą atvejų, konsolidavimą skrandžio vėžio, genotipo nagrinėjimu ir asociacijos vertinimu. Metodinė kokybė nepriklausomai įvertino du tyrėjai (LIN B Lu Y). Nesutarimai buvo išspręsta per diskusiją. Natos svyravo nuo žemiausio nulio iki aukščiausio dešimties. Straipsniai su rezultatas mažesnis kaip 6,5 buvo laikoma "mažai arba vidutinio sunkumo kokybės" tuos, o tie ne mažesnis kaip 6.5 buvo suvokiami kaip "aukštos kokybės" tie.

Duomenų gavyba

Žemiau duomenis iš kiekvieno straipsnio buvo paimti: autoriai, publikavimo metus, šalį, tautybę dalyvių (priskirti kategorijai Baltųjų, azijiečių ir tt), studijų dizainas, šaltinis kontrolės, patikrinimų skaičių ir atvejų, genotipo metodą, paskirstymo amžiaus ir lytį, Lauren klasifikacija (žarnyno, difuzinis arba mišri), anatomijos klasifikacija (Cardia ar ne Cardia vėžys), rūkymo įprotį, geriamojo įpročio ir Helicobacter pylori
infekciją.

duomenys buvo paimti ir nepriklausomai įregistruota į dvi duomenų bazes dviejų tyrėjų (LIN B Lu Y), kuris buvo aklas žurnalų pavadinimų, įstaigų ar fondų dotacijų. Bet koks neatitikimas tarp šių dviejų tyrėjų buvo išspręsta tyrėjo (Xue H), kuris dalyvavo diskusijoje su jais ir padarė galutinį sprendimą.

Statistinė analizė

Visi statistinės analizės buvo atliekamos naudojant STATA statistikos programinė įranga (Versija 10,1, STATA Corp ", College Station, TX). Dvipusis PS < 0,05 buvo laikomas statistiškai reikšmingas. Hardy-Weinberg pusiausvyra (HWE) kontrolinės grupės buvo apskaičiuojamas vėl mūsų metaanalizę. Chi-kvadrato gerumas Fit buvo naudojama patikrinti nuokrypis nuo HWE (reikšmingas 0,05 lygmenyje).

Kursai santykis (OR) ir 95% pasikliautinieji intervalai (PI 95%) buvo naudojamos įvertinti jėgų sąsajas tarp XPD /ERCC2 VNP-ai ir skrandžio vėžio riziką. Arba _{1, arba 2, ir OR 3 buvo apskaičiuojamas genotipas CK palyginti AA, CA, palyginti su AA ir MK, palyginti su CA už XPD Lys751Gln polimorfizmo; A. prieš GG, GA, palyginti su VS, ir AA, palyginti su GA už XPD Asp312Asn polimorfizmo; A. prieš CK, CA, lyginant su CK, ir AA, palyginti su CA už XPD Arg156Arg polimorfizmo, atitinkamai. Poromis skirtumai buvo naudojamos siekiant nustatyti tinkamiausią genetinę modelį. Jei ARBA 1 = arba 3 ≠ 1 ir OR 2 = 1, A recesyvinis modelis siūloma. Jei ARBA 1 = arba 2 ≠ 1 ir OR 3 = 1, dominuojantis modelis numanomas. Jei ARBA 2 = 1 /ARBA 3 ≠ 1 ir OR 1 = 1, pilnas overdominant modelis siūloma. Jei ARBA 1 > arba 2 > 1 ir OR 1 > arba 3 > 1 arba arba 1 "< arba 2" < 1 ir OR 1 "< arba 3 "< 1 A codominant modelis yra nurodyta [34]. Paimkite XPD Lys751Gln polimorfizmas, kaip pavyzdžiui, ją iliustruoti. Jei buvo nurodyta dominuojanti modelis, originalus grupavimas buvo žlugo ir nauja grupė C vežėjams (CK plius ĮA) buvo lyginamas su AA genotipu; jei recesyvinis modelis buvo pasiūlyta, CK, palyginti su AA plius CA grupės; jei pilnas overdominant modelis buvo numanoma, kad CK plius AA grupė buvo lyginama su CA; arba jei codominant modelis buvo įsiskverbiama, CK buvo lyginamas su CA ir su AA, atitinkamai.}

Klausimas statistika buvo naudojamas įvertinti heterogeniškumas visoje tyrimai įtraukti į metaanalizę. Aš-kvadrato ( Aš
^{2) vertė, ty variacijos arba priskirtini heterogeniškumo tada buvo naudojami kiekybiškai įvertinti tokio tarp-studijos heterogeniškumo [36] laipsnį. Pagal neseniai paskelbtus Venecija kriterijus [37], " Aš
2" < 25% atstovauja ne heterogeniškumas Aš
2 = 25-50% sudaro vidutinio heterogeniškumas, Aš
2 = 50-75% sudaro didelę heterogeniškumas ir Aš
2 > 75% sudaro itin heterogeniškumo ". Tarp-studijos dispersija Tau-kvadrato (τ 2) vertė taip pat buvo naudojama įvertinti tarp-studijos dispersiją. Fiksuoto poveikis modelis, naudojant Mantel-Haenzel (M-H) metodą, kuris dirbo apskaičiuoti bendrus atokiausi regionai, kai homogeniškumas egzistavo apie K-testo p reikšmė ne mažiau kaip 0.1.By priešingai pagrindu, atsitiktinis poveikis modelis, naudojant DerSimonian ir Laird metodą (d + L), buvo panaudota, jei ten buvo heterogeniškumas remiantis Q-testo p vertė yra mažesnė nei 0,1. Net ir vienodumą-tyrimų, taip pat buvo naudojama D + L metodas. Meta-regresinės analizės ir pogrupių analizė buvo naudojama, siekiant ištirti ir kontroliuoti galimą šaltinius heterogeniškumo visoje studijas. Sukauptų atokiausių regionų reikšmingumas buvo išbandytas Z bandymas (P < 0,05 buvo laikomas reikšminga)}

Jautrumo analizė buvo atlikta, kuriame metaanalizė sąmatos buvo skaičiuojamas po kiekvieno vienas tyrimas buvo praleista kiekvieno posūkio <.. Br>

Galiausiai, leidyba šališkumo buvo įvertintas atliekant piltuvo sklypai kokybiškai ir apskaičiuota Begg "ir EGGER anketa testai kiekybiškai.

rezultatai

literatūra paieška ir tyrimas atranka

po išsamaus paieškai, 140 straipsnių anglų ir 7 kinų viso buvo paimti. Mūsų metaanalizę pradžių buvo įtraukti visiškai 15 tyrimų [16] - [30], kuri atitiko įtraukimo kriterijus. Tie 15 tyrimai buvo preliminariai tikslinga meta-analizės asociacijų su skrandžio vėžiu, dėl XPD VNP-ai, tarp kurių 13 tyrimai susiję XPD Lys751Gln polimorfizmas [16] - atitinkamai [26], [28], [29], 9 tyrimai XPD Asp312Asn polimorfizmas [17] - [21], [23], [27], [28], [30], ir tik 1 tyrimas susijęs XPD Arg156Arg polimorfizmas [28]. 1 straipsnis [23] buvo indeksuotas anglų ir kinų ieško variklių

Tradiciškai kalbant, bet tyrimas, nukrypo nuo HWE turėjo būti pašalintas.; Tačiau, Minelli C ir kt. neseniai pažymėjo, kad tyrimai, kurie atrodo nukrypti nuo HWE turėtų būti tiriami toliau, o ne tik atmesti, nebent yra kitų priežasčių abejoti tyrimo [38] kokybę. Iki šiol, tai dar negalutiniai, ar studijos nukrypo nuo HWE turėtų būti įtraukti ar neįtraukti atliekant metaanalizę. Mūsų metaanalizę, 3 atitinkami tyrimai XPD Lys751Gln polimorfizmas [16], [25], [29] buvo nukrypta nuo HWE, ir 3 tyrimai susiję XPD Asp312Asn polimorfizmas [17], [27], [30] taip pat buvo nukrypta nuo HWE; Tačiau, atsižvelgiant į kad dalyvių šių tyrimų skaičius buvo didelis ir turint omenyje, kad jautrumo analizė būtų atlikta, mes pagaliau liko tas studijas mūsų metaanalizę

Taigi, 13 tyrimai [16] - [26]. [28], [29] su 6344 kontrolę ir 2750 atvejais XPD Lys751Gln polimorfizmo ir 9 tyrimų [17] iš viso - [21], [23], [27], [28], [30] su 3429 kontrolė ir 1715 atvejai XPD Asp312Asn polimorfizmo buvo galiausiai gauti meta-analizės XPD polimorfizmas. Atitinkamos charakteristikos buvo matyti 1 lentelėje ir 2 lentelėje Plūsmkarte literatūros paieškos ir studijų pasirinkimo buvo apšviestas 1 pav

Apskritai metaanalizė, meta-regresijos analizė ir pogrupis analizė

Dėl XPD Lys751Gln polimorfizmo arba _{1 (p reikšmė) arba 2 (p reikšmė), ir arba 3 (p reikšmė) buvo 1,22 (p = 0,266), 1,11 (p = 0,369) , ir 1,02 (p = 0,811), atitinkamai, sunkiai Insynuacyjny tam tikro modelio poveikį spėjamame neatsparių C alelio. Heterogeniškumas chi kvadrato buvo 29,83 (D.F. = 12), p reikšmė buvo 0,003, o Aš
^{2 buvo 59,8%. Po meta regresinę analizę, naudojant vieną kovariantą (etniškumas, sudarytas iš Baltųjų, azijiečių ar turkų gyventojų), p vertybes koeficientas t vertės azijiečių, baltaodžių, ar turkų gyventojų buvo 0,001, 0,139 ir 0,585, atitinkamai; primygtinai rodo, kad Azijos vieną kintamųjų, daugiausia būtų sudaro heterogeniškumo šaltinį per studijas. τ 2 už azijiečių, baltųjų, ar turkų gyventojų vienu kovariantą buvo 0, 0,09178 ir 0,1347, atitinkamai. Dėl azijiečių vieną kovariantą, τ 2 sumažėjo nuo 0.1233 iki 0, nurodant azijiečių vieną kovariantą galėtų sudaryti 100% heterogeniškumas visoje tyrimų šaltinis. Kai suskirstyti pagal etninę kilmę pogrupių analizę arba 1 (p reikšmė) arba 2 (p reikšmė), ir arba 3 (p reikšmė) tarp Azijos gyventojų buvo 2,63 (p = 0,002), 1,14 ( p = 0,653), ir 1.51 (p = 0,034), atitinkamai, yra labai nurodant recesyvinį modelio poveikį spėjamame neatsparių C alelio (ARBA 1 = ARBA 3 ≠ 1 ir OR 2 = 1).}}

XPD Asp312Asn polimorfizmo arba _{1 (p reikšmė) arba 2 (p reikšmė), ir arba 3 (p reikšmė) buvo 1,75 (p = 0,015), 1,15 (p = 0,549), ir 1.47 (p = 0,003), atitinkamai, yra labai nurodant recesyvinį modelio poveikį spėjamame neatsparių a alelio (ARBA 1 = ARBA 3 ≠ 1 ir OR 2 = 1) , Heterogeniškumas chi kvadrato buvo 9,91 (D.F. = 8), p reikšmė buvo 0,272, o Aš
^{2 buvo 19,2%, nurodantis heterogeniškumas per studijas. Po meta regresinę analizę, naudojant vieną kovariantą (etniškumas, sudarytas iš baltaodžių ar azijiečių), P vertės koeficientas t vertės tautybės vieną kovariantą buvo 0,277, tai rodo, kad etniškumas galėtų būti vienas iš Mažosios heterogeniškumo visoje tyrimų šaltinių. τ 2 sumažėjo nuo 0.0354 iki 0.02075, nurodant etniškumas galėtų sudaryti 41,4% nuo mažai heterogeniškumo visoje tyrimų šaltinis. Panašiai, kai suskirstyti pagal etninę kilmę pogrupių analizę arba 1 (p reikšmė) arba 2 (p reikšmė), ir AR 3 (p reikšmė) tarp Azijos gyventojų buvo 2,10 (p = 0,026), 1.22 (p = 0,574), ir 1,80 (p = 0,008), atitinkamai, toliau nurodant recesyvinį modelio poveikį spėjamame neatsparių a alelio (ARBA 1 = ARBA 3 ≠ 1 ir OR 2 = 1 ).}}

kartu A recesyvinis genetinis modelis galiausiai buvo pasirinkta tiek XPD Lys751Gln ir XPD Asp312Asn polimorfizmas mūsų metaanalizę.

mūsų metaanalizę, turimi duomenys buvo suskirstyti, į etninių dalyvių šviesos, į baltųjų, azijiečių ir Turkijos gyventojų. 2 paveiksle, statistiškai reikšmingi faktai buvo pažymėta azijiečių bet ne baltaodžiams ar Turkijos gyventojų (tiek XPD Lys751Gln ir XPD Asp312Asn Polimorfizmas). Suminė PVA (95% NVS, p reikšmė) buvo 2,41 (1,69-3,43, p = 0,000), 0,98 (0,82-1,17, p = 0,803) ir 0,97 (0,33-2,82, p = 0,954) azijiečiams, baltaodžių, ir turkų gyventojų (XPD Lys751Gln polimorfizmas A dalyje) arba 1,77 (1,19-2,63, p = 0,005) ir 1,31 (0,86-1,99, p = 0,211) ir mongolidų ir europidų rasės (XPD Asp312Asn polimorfizmo B dalyje), atitinkamai. Kaip XPD Lys751Gln polimorfizmo, p vertybių heterogeniškumas Q-statistika baltaodžiams, azijiečių ir Turkijos gyventojų buvo 0,802, 0,701 ir 0,045; Aš
^{2 buvo 0,0%, 0,0% ir 75,1%; ir τ 2 buvo 0,0000, 0,0000 ir 0,4489, atitinkamai, demonstruodama ne heterogeniškumas per baltaodžių ar azijiečių, tačiau ekstremalios heterogeniškumas per Turkijos gyventojų (kaip parodyta 3 lentelėje). Kaip XPD Asp312Asn polimorfizmo, p vertės heterogeniškumo Q-statistika baltaodžiams ir azijiečių buvo 0.180 ir 0.470; Aš
2 buvo 41,6% ir 0,0%; andτ 2 buvo 0,0587 ir 0,0000, atitinkamai parodant ne heterogeniškumas per azijiečių, bet saikingai heterogeniškumas per baltaodžių (parodyta 4 lentelėje).}

Kaip parodyta 3 ir 4 lentelėse, konkretūs duomenys XPD Lys751Gln ir XPD Asp312Asn polimorfizmas buvo suskirstyti atitinkamai, remiantis imties dydį, į du pogrupius: didelis duomenų imties charakteristikos (iš viso kontrolės ir atvejais ne mažiau kaip 500) ir mažos ir vidutinio sunkumo mėginių (iš viso kontrolės ir atvejų mažiau nei 500) pogrupius. Statistiškai reikšmingas, buvo pažymėta, arba nedidelio ir vidutinio sunkumo imties pogrupio ar didelis mėginio kolega už XPD Lys751Gln polimorfizmo, turint omenyje, kad surinktus PVA (95% NVS, p reikšmė) buvo 0,96 (0,61-1,51, p = 0,858), kad buvęs ir 1,17 (0,84-1,64, p = 0,351), kad pastarasis, atitinkamai; Tačiau statistiškai reikšmingas, buvo pažymėta, mažųjų ir vidutinio sunkumo imties pogrupio, bet ne didele mėginio kolega už Asp312Asn polimorfizmo, turint omenyje, kad surinktus PVA (95% NVS, p reikšmė) buvo 1,74 (1,18-2,56, p = 0,005) ir buvęs ir 1,35 (0,82-2,21, p = 0,239), kad pastarasis, atitinkamai.

duomenys taip pat buvo sluoksninė, laikantis kokybės vertinimo balai, į aukštos kokybės (balai ne mažiau kaip 6,5) ir žemo ir vidutinio sunkumo kokybės (balais mažiau nei 6.5) pogrupius. Kaip XPD Lys751Gln polimorfizmo, nėra statistiškai reikšmingas, buvo liudininku arba aukštos kokybės pogrupio ar mažo ir vidutinio sunkumo kokybės kolega, nes Suminė PVA (95% NVS, p reikšmė) buvo 1,20 (0,91-1,60, p = 0,199) už buvęs ir 0,61 (0,34-1,11, p = 0,104), kad pastarasis. Kai žmogaus etniškumas subrangos stratifikacija buvo atliekama aukštos kokybės pogrupyje, statistiškai reikšmingas, buvo daug, matyt, matė tarp azijiečių, bet statistiškai reikšmingas, buvo pažymėta, tarp baltaodžių, nes surinktus PVA (95% NVS, p reikšmė) buvo 2,54 (1,77-3,65, p = 0,000) ir buvęs, ir 0,98 (0,82-1,17, p = 0,803), kad pastarasis, atitinkamai. Kaip Asp312Asn polimorfizmo, statistiškai reikšmingas, buvo liudininkas aukštos kokybės pogrupyje, bet ne mažai ir vidutinio sunkumo kokybės kolega, nes Suminė PVA (95% NVS, p reikšmė) buvo 1,56 (1,05-2,33, p = 0,028) už buvęs ir 1,42 (0,85-2,40, p = 0,184), kad pastarasis. Be to, kai etniškumas subrangos stratifikacija buvo atliekama aukštos kokybės pogrupyje, statistiškai reikšmingas, buvo daug, matyt, matė tarp azijiečių, bet statistiškai reikšmingas, buvo pažymėta, tarp baltaodžių, nes surinktus PVA (95% NVS, p reikšmė) buvo 2,37 (1.29- 4.36, p = 0,005) ir buvęs, ir 1,31 (0,86-1,99, p = 0,211), kad pastarasis, atitinkamai.

duomenys buvo papildomai sluoksninė, laikantis paskelbimo metu, į anksčiau skelbti pogrupio ( paskelbta prieš arba 2007 straipsniai) ir vėliau leidinį pogrupis (paskelbta po 2007 straipsniai). Kaip XPD Lys751Gln polimorfizmo, statistiškai reikšmingų pokyčių atsirado dėl to, kad surinktus PVA (95% NVS, p reikšmė) buvo 0,89 (0,66-1,19, p = 0,428) Buvusiojoje ir 1,23 (0,84-1,81, p = 0,285) pastarųjų, atitinkamai. Kaip Asp312Asn polimorfizmo, statistiškai reikšmingas, buvo pastebėtas vėliau paskelbimo pogrupyje, bet ne anksčiau skelbti pogrupyje dėl to, kad Suminė PVA (95% NVS, p reikšmė) buvo 1,46 (1,02-2,09, p = 0,041) ir buvęs ir 1,61 (0,89-2,92, p = 0,115) ir pastarasis, atitinkamai.

skrandžio vėžys buvo suskirstyti į ne Cardia (arba distalinio) ir CARDIA potipiai, statistiškai reikšmingas, buvo rasta tarp ne -cardia tipo, bet ne tarp CARDIA tipo XPD Lys751Gln polimorfizmo dėl to, kad Apibendrinus PVA (95% NVS, p reikšmė) buvo 2,03 (1,16-3,54, p = 0,013) tarp ne CARDIA tipo ir 0,88 (0,66-1,18, p = 0,403) tarp CARDIA tipo. Kaip Asp312Asn polimorfizmo, nėra statistiškai reikšmingas, buvo pastebėtas tarp CARDIA tipo dėl to, kad sutelktų ARBA (95% NVS, p reikšmė) buvo 0,89 (0,56-1,43, p = 0,642), tačiau ARBA (95% NVS, p reikšmė ) dėl ne Cardia tipas negalėjo būti apskaičiuota, nes tik vienas tyrimas [21] aiškiai paminėjo genotipų ne CARDIA tipo numeriai.

kalbant apie patologiją, skrandžio vėžys gali būti skirstomi į žarnyno, difuzinis, arba sumaišyti potipius, bet tik 1 tyrime [19] aiškiai sprendžiami ir paminėjo genotipų pasklidosios potipio vėžio numerius; taip patologinis potipis stratifikacija negalėjo būti padaryta mūsų metaanalizę.

Trikdantys veiksniai, kaip antai Helicobacter pylori
infekcija arba rūkyti statusas negalėjo būti analizuojamas mūsų meta-analizę, nes reikalingų atitinkamų duomenų bent du tyrimai gali būti neprieinamas mūsų metaanalizę.

ir kai buvo laikomi genotipo metodai, nėra statistiškai reikšmingas, buvo pažymėta kiekvieno genotipo technika pogrupis XPD Lys751Gln polimorfizmo nes sujungiami PVA (95% NVS, p reikšmė) buvo 0,94 (0,68-1,29, p = 0,701) ir 1,67 (0,68-4,14, p = 0,265) ir RFLP ir TagMan pogrupius atitinkamai; Tačiau statistiškai reikšmingas, buvo pažymėta RFLP genotipo pogrupiuose, bet ne tiesioginių sekos pogrupis Asp312Asn polimorfizmo nes sukauptos PVA (95% NVS, p reikšmė) buvo 1,90 (1,09-3,31, p = 0,023) ir 1,24 (0.70-2.20, p = 0,450), atitinkamai.

jautrumo analizė

metaanalizė buvo atlikta pakartotinai kai kiekvienas pirma tyrimas buvo pašalintas. Rezultatai parodė, kad atsitiktinių efektų įvertinimai prieš ir po kiekvieno tyrimo ištrynimą buvo panašūs didelis, tai rodo, vidutiniškai aukštą stabilumą meta-analizės rezultatais. Dėl XPD Lys751Gln polimorfizmo, kaip parodyta 3 paveiksle A dalyje, labiausiai įtakojančia vieną tyrimą dėl bendrų bendrojo fondo skaičiavimais atrodė atliktas tyrimas Long XD ir kt. [25], coincidently nukrypo nuo HWE, jautrumo analizę, tačiau nurodė, vidutiniškai aukštą stabilumą rezultatais faktų, kad PVA (95% CI, p reikšmė) buvo 1,12 (0,85-1,48, p = 0,410) prieš šalinimas šio tyrimo ir 0,98 (0,83-1,15, p = 0,781), po to tyrimo pašalinimas. Atsižvelgiant į tyrimo [16], atliktu Huang WY et al. kuri nukrypo nuo HWE, atokiausiems regionams (95% PI p reikšmė) buvo 1,12 (0,85-1,48, p = 0,410) iki šio tyrimo pašalinimo ir 1,17 (0,87-1,58, p = 0.309), po to tyrimo šalinimas už visų tautybę, nurodant didelį stabilumą rezultatų. Panašiai, po to, kai tyrimo pašalinimo [29], atliktu pagal Enginas AB "ir kt., Taip pat stiprus iš HWE, AR (95% PI, p reikšmė) tapo 1.19 (0,91-1,57, p = 0,209) už visų tautybę, nurodant didelį stabilumą rezultatų. Jei visi trys nukrypo-HWE tyrimai [16], [25], [29] buvo pašalintas, ARBA (95% PI, p reikšmė) tapo 1,06 (0,88-1,28, p = 0,555) už visų tautybę, nurodant saikingai didelis stabilumas rezultatų (The iliustruojantys skaičiai buvo praleisti dėl popieriaus ilgį).

Asp312Asn polimorfizmo, kaip parodyta 3 pav B dalyje, labiausiai įtakojantys vienas tyrimas dėl bendrų bendrojo fondo skaičiavimais atrodė tyrimas atliktas Chen Z et al. [28], jautrumas analizė, tačiau nurodė, vidutiniškai aukštą stabilumą rezultatais faktų, kad PVA (95% CI, p reikšmė) buvo 1,48 (1,12-1,97, p = 0,007) iki šio tyrimo ir 1,32 šalinimas (1,04-1,70, p = 0,025) po to, kai šio tyrimo pašalinimo. Jei visi trys nukrypo-HWE tyrimai [17], [27], [30] buvo pašalintas, ARBA (95% PI, p reikšmė) tapo 1,56 (1,05-2,33, p = 0,028), kad visi žmogaus etniškumas, taip pat nurodant vidutiniškai didelis stabilumas rezultatų (The iliustruojantys skaičiai buvo praleisti dėl popieriaus ilgį).

Kaupiamasis metaanalizė

Kaupiamasis meta-analizė XPD Lys751Gln Polimorfizmas asociacijos taip pat buvo atliktas tarp azijiečių ir europidų rasės per paskelbimo laiko ir skaičiaus imties dydis asortimentas. Kaip parodyta 4 pav A dalyje polinkius link reikšmingų asociacijų XPD Lys751Gln polimorfizmo gali būti vertinamas tarp azijiečių. Paveiksle 4 B dalį polinkius link null asociacijų XPD Lys751Gln polimorfizmo galima pastebėti, tarp baltaodžių chronologine tvarka. Panašūs polinkiai gali būti stebimi Asp312Asn polimorfizmo tarp skirtingų etninės gyventojų (duomenys neparodyti).

Leidinys Paklaida analizė

Leidinys šališkumo buvo preliminariai išnagrinėjo kanalo sklypų kokybiškai ir apskaičiuota Begg "ir EGGER anketa testai kiekybiškai , Dėl XPD Lys751Gln polimorfizmo, jo piltuvėlis sklypas (5a pav) parodė, kad taškai beveik simetriškai paskirstytas, daugiausia per pseudo 95% pasikliovimo rėžiais. P vertės buvo 0,428 ir 0,989 iš Begg testo ir EGGER testo, atitinkamai, Insynuacyjny neskelbiamas šališkumo. Dėl Asp312Asn polimorfizmo, jo piltuvėlis sklypas (5b pav) parodė, kad taškai beveik simetriškai paskirstytas, daugiausia per pseudo 95% pasikliovimo rėžiais. P vertės buvo 0,108 ir 0,045 iš Begg testo ir EGGER testo, atitinkamai, Insynuacyjny nėra arba mažai leidinį šališkumo.

Diskusijos

Mūsų metaanalizę statistiškai reikšmingi faktai buvo, matyt pažymėta azijiečių bet ne baltaodžiams tiek XPD Lys751Gln ir XPD Asp312Asn polimorfizmas. Taip pat remiantis kaupiamuoju metaanalizes išvadas, polinkius link reikšmingų asociacijų azijiečių tiek XPD Lys751Gln ir XPD Asp312Asn polimorfizmas gali būti akivaizdžiai matyti, kai rūšiuojami pagal publikavimo data ir visos imties. XPD Gln751Gln (CK) ir Asn312Asn (AA) genotipai gali atrodyti labiau linkusios į skrandžio vėžio azijiečiams. Mūsų metaanalizės rodo, kad Gln751Gln (CK) ir Asn312Asn (AA) genotipai gali būti svarbūs biologiniai žymenys skrandžio vėžio jautrumą dėl azijiečių, prielaida, kad reikia dar kartą patvirtino ateityje gerai suprojektuoti studijų Azijos gyventojų. Taip pat skirtingi ar net prieštaringi rizikos asociacijos, jei taip, tai tarp skirtingų etninių grupių turėtų būti toliau kruopščiai ištirtas ir dar kartą patvirtino, kad ateityje.

XPD Asp312Asn SNP, nors Aš
^{2 ( %) buvo 19,2 ir τ 2 buvo 0,0354, kaip parodyta 4 lentelėje, teoriškai atstovauja mažai arba jokios įvairiapusiškumą; praktiškai po etniškumas pogrupio analizė, vertybių, Aš
2 (%) ir τ 2 tapo 0,0 ir 0.0000 už azijiečių ir 41,6 ir 0.0587 už baltaodžių, atitinkamai, ir toliau rodo, kad, iš tikrųjų ne heterogeniškumas egzistavo tarp azijiečių tyrimų, o ne tarp Baltųjų kolegomis. Atsižvelgiant į tai, manome, kad stratifikacijos ar pogrupių analizė vis dar reikia mūsų metaanalizę.}

• PLoS ONE: Įgimtas imunitetas ir Ne Hodžkino limfoma (NHL) Susiję genų įdėtos atvejo ir kontrolės tyrimas skrandžio vėžio riziką
• PLoS ONE: demaskuojant molekulinio mechanizmo skrandžio vėžio Marker aneksino A4 Vėžys ląstelių proliferaciją Naudojant Exon masyvai