PLoS ONE: L'effetto di XPD /ERCC2 polimorfismi sul cancro gastrico rischio tra diverse etnie: una revisione sistematica e una meta-analisi

Astratto

Sfondo

Potenziale gruppo xeroderma pigmentoso D (XPD), chiamato anche riparazione per escissione trasversale gratuito gruppo due (ERCC2), Lys751Gln e Asp312Asn polimorfismi sono stati implicati nel rischio di cancro gastrico tra le diverse etnie.

Metodi

Si è voluto esplorare l'effetto di XPD Lys751Gln e Asp312Asn polimorfismi sulla suscettibilità al cancro gastrico tra diverse etnie attraverso una revisione sistematica ed una meta-analisi. Ogni articolo inizialmente incluso è stato segnato per la valutazione della qualità. Auspicabile dati sono stati estratti e registrati in banche dati. 13 studi sono stati in ultima analisi, ammissibili per la meta-analisi di Lys751Gln polimorfismo e 9 studi per la meta-analisi di Asp312Asn polimorfismo. Abbiamo adottato il modello genetico più probabilmente appropriata (modello recessivo) sia per i polimorfismi Lys751Gln e Asp312Asn. Potenziali fonti di eterogeneità sono stati ricercati tramite sottogruppi e analisi di sensibilità, e bias di pubblicazione sono stati stimati.

Risultati

risultati statisticamente significative erano apparentemente osservato negli asiatici ma non in caucasici sia per XPD Lys751Gln e XPD polimorfismi Asp312Asn. Un risultato statisticamente significativo potrebbe essere visto in noncardia tipo cancro gastrico per XPD Lys751Gln polimorfismo. Un risultato statisticamente significativo potrebbe essere visto anche in sottogruppo di alta qualità, piccolo-e-moderate dimensioni sottogruppi del campione, gli articoli pubblicati dopo il 2007, o PCR-RFLP genotipizzazione sottogruppo per XPD Asp312Asn polimorfismo.

Conclusioni

la nostra meta-analisi indicano che XPD Gln751Gln (CC) genotipo e Asn312Asn genotipo (AA) può sembrare di essere più suscettibili al cancro gastrico nelle popolazioni asiatiche, ma non nelle popolazioni caucasiche, suggerendo che i due genotipi possono essere importanti biomarker di gastrico suscettibilità al cancro per le popolazioni asiatiche, il presupposto che ha bisogno di essere ulteriormente confermata in studi ben progettati tra le diverse etnie. Gln751Gln (CC) genotipo può anche essere associata a noncardia-tipo il rischio di cancro gastrico, che dovrebbe anche essere confermato tra diverse etnie in futuro

Visto:. Xue H, Lu Y, Lin B, Chen J, Tang F, G Huang (2012) l'effetto di XPD /ERCC2 polimorfismi sul cancro gastrico rischio tra diverse etnie: Una revisione sistematica e meta-analisi. PLoS ONE 7 (9): e43431. doi: 10.1371 /journal.pone.0043431

Editor: Rui Medeiros, IPO, Inst Port Oncologia, Portogallo

Ricevuto: 5 aprile 2012; Accettato: 20 luglio 2012; Pubblicato: 13 settembre 2012

Copyright: © Xue et al. Questo è un articolo ad accesso libero distribuito sotto i termini della Creative Commons Attribution License, che permette l'uso senza restrizioni, la distribuzione e la riproduzione con qualsiasi mezzo, a condizione che l'autore originale e la fonte sono accreditati

Finanziamento:. Questo lavoro è stata sostenuta dalla National Science Foundation naturale della Cina (sovvenzioni 30830038, 30.970.842 e 81.071.180); "973" Progetto (2012CB932604); New Drug Discovery Project (2012ZX09506-001-005); il progetto chiave della Scienza e della Tecnologia della Commissione di Shanghai Comune (sovvenzioni 10JC1410000); e la Shanghai leader accademico Disciplina del progetto (concessione S30203). I finanziatori avevano alcun ruolo nel disegno dello studio, la raccolta e l'analisi dei dati, la decisione di pubblicare, o preparazione del manoscritto

Competere interessi:.. Gli autori hanno dichiarato che non esistono interessi in competizione

Introduzione

Anche se tutto il mondo l'incidenza del cancro gastrico è diminuita, la sua mortalità colloca ancora secondo [1]. In Cina, il cancro gastrico costituisce anche uno dei tumori più letali [2]. Come è noto, fattori infettivi, dietetici, ambientali e genetiche sono implicati nella carcinogenesi gastrica, ma quelli esposti a fattori di rischio che infine sviluppare cancro gastrico comprende una proporzione minore [3], suggerendo che ospitano predisposizione genetica gioca un ruolo importante nella gastrica il rischio di cancro tra le diverse etnie. Tali diverse suscettibilità potrebbe essere spiegato, in parte, da polimorfismi a singolo nucleotide (SNP) di geni suscettibili tra diverse etnie [4], [5]. Le nostre carte di meta-analisi precedentemente pubblicati hanno fornito ulteriori elementi di prova per tali differenze etnico suscettibili [5], [6].

E 'ampiamente riconosciuto che il DNA deve rimanere stabile per intraprendere le sue funzioni fisiologiche cruciali, ma è persistentemente vulnerabile a diversi danni endogene e /o esogene e quindi le sue mutazioni probabili potrebbero accumulare e possono verificarsi carcinogenesi a causa del DNA danneggiato. sistema di riparazione del DNA, tuttavia, svolge un ruolo fondamentale nel mantenere le funzioni delle cellule normali e l'integrità del genoma attraverso l'inversione del danneggiato [7] DNA. Ereditati polimorfismi funzionali o accumulato mutazioni dei geni di riparazione del DNA possono influenzare la capacità di accoglienza per riparare il DNA danneggiato, e quindi modulano il rischio di cancro [8]. SNPs di geni di riparazione del DNA comune sono stati identificati [9] e ha dimostrato di essere legato alla carcinogenesi sporadica [10], [11].

Nucleotide riparazione per escissione (NER), una delle principali vie di riparazione del DNA negli esseri umani , è in grado di rimuovere le lesioni di base elica di distorsione prodotta dalla luce ultravioletta (UV) e una vasta gamma di agenti chimici [12]. XPD è creduto di partecipare svolgimento DNA durante NER e la trascrizione perché possiede singolo filamento di DNA-dipendente ATPasi e 5'-3 'attività DNA elicasi [13], [14]. XPD (ERCC2) gene, che si trova sul cromosoma 19q13.3, composto da 23 esoni e dei suoi polimorfismi si pensa di generare alterazioni strutturali del percorso NER e suscettibilità al cancro influenza. I più ampiamente studiati polimorfismi XPD in associazioni con suscettibilità al cancro comprendono una nonsynonymous A > C sostituzione in esone 23 provocando una lisina (Lys) a glutammina (Gln) sostituzione nel codone 751 (Lys751Gln, rs1052559), un nonsynonymous G > Una sostituzione nell'esone 10 in direzione di un acido aspartico (Asp) per asparagina (Asn) sostituzione nel codone 312 (Asp312Asn, rs1799793), e sinonimo C > una sostituzione nell'esone 6 e salvaguardando il arginina (R) residuo in codone 156 (Arg156Arg, rs238406) [15].

nel 2005, Huang WY et al.
pubblicato il primo studio ha coinvolto in XPD Lys751Gln polimorfismo in relazione al rischio di cancro gastrico [16]. Da allora, i ricercatori hanno riportato associazioni di XPD Lys751Gln, Asp312Asn, e /o Arg156Arg con la suscettibilità al cancro gastrico tra le diverse etnie, ma con risultati alterni o in conflitto [17] - [30]. C'è solo un articolo pubblicato riguardante Arg156Arg polimorfismo in relazione al rischio di cancro gastrico [28]. Ad oggi, ci sono state tre importanti documenti di meta-analisi pubblicata concentrandosi su polimorfismi XPD [31] - [33]. Due articoli sono preoccupati principalmente con suscettibilità cancro complessivi piuttosto che gastrica suscettibilità al cancro in profondità [31], [32], fornendo così meno informazioni sulla sua associazione con il rischio di cancro gastrico. Ancora più importante, questi tre meta-analisi [31] - [33] tutto non è riuscito ad adottare il modello genetico più probabile del caso, e quindi i valori autentici di questi risultati statistici potrebbero essere compromesse

Di conseguenza, l'obiettivo di. la nostra meta-analisi era quello di esplorare, utilizzando il modello genetico più adatto, l'effetto dei polimorfismi XPD sul rischio di cancro gastrico tra diverse etnie e di identificare possibili fonti di eterogeneità tra gli studi ammissibili.

Materiali e Metodi

strategia di ricerca

Una ricerca sistematica della letteratura è stata effettuata per articoli riguardanti SNP XPD /ERCC2 associati al rischio di cancro gastrico. Il database MEDLINE, EMBASE, cinese Conoscenza Nazionale Infrastructure (CNKI), Web of Science, e banche dati BIOSIS sono stati utilizzati contemporaneamente con la combinazione dei termini "XPD", "ERCC2", "riparazione del DNA", "NER", "Lys751Gln", "Asp312Asn", o "Arg156Arg"; "gene"; "Polimorfismo", "variante", o "SNP"; e "cancro gastrico", "carcinoma gastrico", o "cancro allo stomaco" fino a dicembre 2011. La ricerca è stata effettuata senza alcuna restrizione sul linguaggio. L'ambito di ricerca bibliografica computerizzata è stato ampliato in base alle liste di riferimento degli articoli recuperati. I relativi articoli originali sono stati anche cercato manualmente.

studio di selezione

Gli studi sull'associazione di XPD /ERCC2 SNPs (Lys751Gln, Asp312Asn, e /o Arg156Arg) con il rischio di cancro gastrico sono stati inclusi se il sono state soddisfatte le condizioni seguenti: (i) qualsiasi studio descritto l'associazione di almeno uno di XPD /ERCC2 SNP con cancro gastrico; (Ii) qualsiasi studio ha riportato il numero di entrambi i controlli e casi di cancro gastrico; (Iii) i risultati sono stati espressi come odds ratio (OR) con il 95% intervallo di confidenza (CI); e (iv) gli studi sono stati quelli caso-controllo caso-controllo o nidificate.

metodologica qualità di valutazione
criteri

​​Per identificare studi di alta qualità, abbiamo principalmente adottato predefiniti per qualità Valutazione inizialmente proposti da Thakkinstian et al
[34], adattato da Camargo et al
[35], e raffinato da Xue et al
[5] -... [7]. I criteri (vedere nella Tabella S1 online) coprono la credibilità dei controlli, la rappresentatività dei casi, il consolidamento del cancro gastrico, l'esame genotipizzazione, e la valutazione di associazione. La qualità metodologica è stata valutata in modo indipendente da due ricercatori (Lin B Lu Y). I disaccordi sono stati risolti attraverso la discussione. I punteggi andavano dal più basso pari a zero al massimo dieci. Gli articoli con il punteggio inferiore a 6,5 ​​sono stati considerati "di qualità bassa o moderata" quelli, mentre quelli non inferiore a 6,5 ​​sono stati pensati come "alta qualità" quelli.

Dati Estrazione

Il dopo i dati di ogni articolo sono stati estratti: autori, anno di pubblicazione, il paese, l'etnia dei partecipanti (classificati come caucasici, asiatici, ecc), disegno dello studio, fonte di controlli, numero di controlli e di casi, metodo di genotipizzazione, distribuzione di età e il sesso, la classificazione di Lauren (intestinale, diffuso, o misto), la classificazione anatomica (cardias o non-cardias cancro), abitudine di fumare, bere abitudine e Helicobacter Pylori
stato infettivo.

I dati sono stati estratti e registrati in due basi di dati in modo indipendente da due ricercatori (Lin B Lu Y) che erano ciechi ai nomi di riviste, istituzioni o sovvenzioni del fondo. Qualsiasi discrepanza tra i due investigatori è stato risolto dal ricercatore (Xue H), che hanno partecipato alla discussione con loro e ha reso una decisione finale.

Analisi statistica

sono state eseguite tutte le analisi statistiche utilizzando STATA software statistico (versione 10.1, STATA Corp, college Station, TX). Due lati Sal < 0,05 sono stati considerati statisticamente significativi. Hardy-Weinberg (HWE) nei controlli è stato calcolato di nuovo nella nostra meta-analisi. La bontà del chi-quadrato di adattamento è stato utilizzato per testare la deviazione da HWE (significativo al livello 0,05).

odds ratio (OR) e il 95% intervallo di confidenza (IC 95%) sono stati utilizzati per valutare la forza della associazioni tra XPD /ERCC2 SNP e il rischio di cancro gastrico. O _{1 o 2, e OR 3 sono stati calcolati per i genotipi CC contro AA, CA contro AA e CC contro CA per XPD Lys751Gln polimorfismo; AA contro GG, GA contro GG, e AA contro GA per XPD Asp312Asn polimorfismo; AA contro CC, CA contro CC, e AA contro CA per XPD Arg156Arg il polimorfismo, rispettivamente. Le differenze a coppie sono stati usati per determinare il modello genetico più appropriato. Se O 1 = O 3 ≠ 1 e OR 2 = 1, un modello recessivo è suggerito. Se O 1 = O 2 ≠ 1 e OR 3 = 1, un modello dominante è implicito. Se O 2 = 1 /O 3 ≠ 1 e OR 1 = 1, un modello sovradominante completo è suggerito. Se O 1 > O 2 > 1 e OR 1 > O 3 > 1, o OR 1 < O 2 < 1 e OR 1 < O 3 < 1, un modello codominante è indicato [34]. Prendere XPD Lys751Gln polimorfismo come un esempio per illustrare esso. Se un modello dominante è stato indicato, il raggruppamento originale è stato crollata e il nuovo gruppo di vettori C (CC plus CA) è stato confrontato con AA genotipo; se un modello recessivo stato suggerito, CC stato confrontato con il gruppo di AA più CA; Se un modello sovradominante completo è stato implicato, il gruppo di CC plus AA è stato confrontato con CA; o se un modello codominante è stato insinuato, CC è stato confrontato con CA e con AA, rispettivamente.}

La statistica Q è stato utilizzato per valutare l'eterogeneità tra gli studi inclusi nella meta-analisi. I-squared ( I
^{2) valore, che rappresenta la variazione in o attribuibili a eterogeneità è stato poi utilizzato per quantificare il grado di tale eterogeneità tra gli studi [36]. Secondo i criteri recentemente pubblicati Venezia [37], " I
2 < il 25% rappresenta l'assenza di eterogeneità, I
2 = 25-50% rappresenta eterogeneità moderata, I
2 = 50-75% rappresenta grande eterogeneità, e I
2 > il 75% rappresenta estrema eterogeneità ". scostamento tra-studio Tau-squared (τ 2) il valore è stato utilizzato anche per valutare la varianza tra gli studi. Un modello a effetti fissi, utilizzando il metodo di Mantel-Haenszel (M-H), è stato impiegato per calcolare le RUP aggregati quando omogeneità esisteva sulla base di Q-test p valore non inferiore a contrasto 0.1.By, un modello ad effetti casuali, utilizzando DerSimonian e il metodo Laird (D + L), è stata utilizzata se c'era eterogeneità basato su Q-test p valore inferiore a 0,1. Anche per l'omogeneità tra-studi, è stato utilizzato anche D + metodo L. Meta-analisi di regressione e l'analisi dei sottogruppi sono stati utilizzati per esplorare e controllare le potenziali fonti di eterogeneità tra gli studi. Il significato di RUP pool è stata testata con il test Z (P < 0.05 è stato considerato significativo)}

analisi di sensibilità è stata condotta, in cui le stime di meta-analisi sono stati calcolati dopo ogni uno studio effettivamente omesso in ogni turno <.. br>

Infine, bias di pubblicazione è stata valutata eseguendo trame imbuto qualitativamente, e stimato da Begg e di test di Egger quantitativamente.

Risultati

Letteratura Ricerca e Selezione di studio

dopo la ricerca completa, per un totale di 140 articoli in inglese e 7 in cinese sono stati recuperati. Nella nostra meta-analisi sono stati inizialmente inclusi complessivamente 15 studi [16] - [30], che ha incontrato i criteri di inclusione. Quei 15 studi sono stati preliminarmente opportuno meta-analisi delle associazioni con cancro gastrico in materia di XPD SNP, tra cui 13 studi in questione XPD Lys751Gln polimorfismo [16] - [26], [28], [29], 9 studi in questione XPD Asp312Asn polimorfismo [17] - [21], [23], [27], [28], [30], e solo 1 studio in questione XPD Arg156Arg polimorfismo [28]. 1 articolo [23] è stato indicizzato in entrambi i motori Searching cinese inglese e

Tradizionalmente parlando, qualsiasi studio che deviato da HWE avrebbero dovuto essere rimosse.; tuttavia, Minelli C et al. recentemente sottolineato che gli studi che sembrano deviare da HWE dovrebbero essere studiati ulteriormente non solo esclusi a meno che non ci sono altri motivi per dubitare della qualità dello studio [38]. Fino ad oggi, è ancora inconcludenti se gli studi deviato dalla HWE dovrebbero essere inclusi o esclusi nella conduzione meta-analisi. Nella nostra meta-analisi, 3 studi in questione XPD Lys751Gln polimorfismo [16], [25], [29] sono stati deviato dalla HWE, e 3 studi in questione XPD Asp312Asn polimorfismo [17], [27], [30] sono stati anche deviato dal HWE; Tuttavia, considerando che il numero di partecipanti a questi studi erano grandi e dato che analisi di sensitività sarebbe stata condotta, abbiamo finalmente rimasti gli studi nella nostra meta-analisi

In questo modo, 13 studi [16] - [26]. , [28], [29] con un totale di 6344 controlli e 2750 casi di XPD Lys751Gln polimorfismo, e 9 studi [17] - [21], [23], [27], [28], [30] con 3429 controlli e 1715 casi di XPD Asp312Asn polimorfismo alla fine sono stati ammessi al meta-analisi dei polimorfismi XPD. Le caratteristiche corrispondenti sono stati osservati in Tabella 1 e Tabella 2. Il diagramma di flusso di ricerca bibliografica e di studio selezione è stata illuminata in Figura 1.

Nel complesso meta-analisi, analisi meta-regressione e analisi dei sottogruppi

Per XPD Lys751Gln polimorfismo, O _{1 (valore p) o 2 (valore p), e OR 3 (valore p) erano 1.22 (p = 0,266), 1.11 (p = 0,369) , e 1,02 (p = 0,811), rispettivamente difficilmente insinuandosi un particolare effetto modello putativo C allele sensibili. L'eterogeneità chi-quadrato era 29.83 (D.F. = 12), il valore p è stato 0.003, e I
^{2 era 59,8%. Dopo l'analisi di meta-regressione usando solo covariata (etnia composta da caucasici, asiatici, o popolazione turca), valori di p di valore t coefficiente per gli asiatici, caucasici, o popolazione turca erano 0.001, 0.139 e 0.585, rispettivamente; fortemente indicando che gli asiatici singolo covariate potrebbe costituire per lo più la fonte di eterogeneità tra gli studi. τ 2 per gli asiatici, caucasici, o popolazione turca singolo covariate erano 0, 0,09,178 mila, e 0,1347, rispettivamente. Per gli asiatici singolo covariate, τ 2 diminuito ,1233-0, indicando gli asiatici singolo covariate potrebbe rappresentare il 100% della fonte di eterogeneità tra gli studi. Quando stratificato per l'analisi etnia sottogruppi, O 1 (valore p) o 2 (valore p), e OR 3 (valore p) tra popolazione asiatica erano 2,63 (p = 0,002), 1.14 ( p = 0,653), e 1.51 (p = 0,034), rispettivamente, altamente indicando un effetto modello recessivo di putativo C allele sensibili (OR 1 = O 3 ≠ 1 e OR 2 = 1).}}

Per XPD Asp312Asn polimorfismo, O _{1 (valore p) o 2 (valore p), e OR 3 (valore p) erano 1,75 (p = 0,015), 1.15 (p = 0,549), e 1.47 (p = 0,003), rispettivamente altamente indicando un effetto modello recessiva putative suscettibile un allele (O 1 = OR 3 ≠ 1 e OR 2 = 1) . L'eterogeneità chi-quadrato è stato 9.91 (D.F. = 8), il valore p è stato 0,272, e I
^{2 è stata del 19,2%, indicando eterogeneità tra gli studi. Dopo l'analisi di meta-regressione usando solo covariata (etnia composta da caucasici o asiatici), valore di p valore t coefficiente per etnia singolo covariata era 0,277, indicando che l'etnicità potrebbe costituire una delle fonti di poco l'eterogeneità tra gli studi. τ 2 diminuito 0,0354-0,02075, indicando etnia potrebbe rappresentare il 41,4% della fonte di poca eterogeneità tra gli studi. Allo stesso modo, quando stratificati per l'analisi etnia sottogruppi, O 1 (valore p) o 2 (valore p), e OR 3 (valore p) tra popolazione asiatica erano 2.10 (p = 0.026), 1.22 (p = 0,574), e 1,80 (p = 0,008), rispettivamente, indicando inoltre un effetto modello recessivo di putativo sensibili allele a (O 1 = O 3 ≠ 1 e OR 2 = 1 ).}}

Nel loro insieme, un modello genetico recessivo è stato infine scelto per entrambi i polimorfismi XPD Lys751Gln e XPD Asp312Asn nella nostra meta-analisi.

nella nostra meta-analisi, i dati disponibili sono stati stratificati, alla luce dei partecipanti etnici, in caucasici, asiatici, e la popolazione turca. Nella figura 2, i risultati statisticamente significativi sono stati osservati negli asiatici, ma non nei caucasici o popolazione turca (sia XPD Lys751Gln e XPD Asp312Asn polimorfismi). Gli OR pool (IC al 95%, valore p) erano 2,41 (1,69-3,43, p = 0.000), 0,98 (0,82-1,17, p = 0,803), e 0,97 (0,33-2,82, p = 0,954) negli asiatici, caucasici, e la popolazione turca (XPD Lys751Gln polimorfismo nella parte a) o 1.77 (1,19-2,63, p = 0,005) e 1,31 (0,86-1,99, p = 0,211) in rispettivamente asiatici e caucasici (XPD Asp312Asn polimorfismo nella parte B),. Per quanto riguarda XPD Lys751Gln polimorfismo, valori di P di eterogeneità Q-statistica in caucasici, asiatici, e la popolazione turca erano 0,802, 0,701 e 0,045; I
^{2 erano 0,0%, 0,0% e 75,1%; e τ 2 erano 0.0000, 0.0000, e 0,4489 rispettivamente, dimostrando senza eterogeneità all'interno caucasici o asiatici, ma estrema eterogeneità all'interno popolazione turca (mostrato in tabella 3). Per quanto riguarda XPD Asp312Asn polimorfismo, valori di P di eterogeneità Q-statistica in caucasici e asiatici erano 0.180 e 0.470; I
2 erano 41,6% e 0,0%; andτ 2 sono stati 0,0587 e 0.0000, rispettivamente, dimostrando senza eterogeneità all'interno asiatici, ma l'eterogeneità moderata all'interno caucasici (indicati nella tabella 4).}

Come mostrato nella Tabella 3 e Tabella 4, i dati specifici per XPD Lys751Gln e polimorfismi XPD Asp312Asn sono stati stratificati, rispettivamente sulla base della dimensione del campione, in due sottogruppi: ampio campione (il numero totale di controlli e casi di non meno di 500) e del campione di piccole e-moderata (il numero totale di controlli e casi meno di 500) sottogruppi. No statisticamente significativo trovare è stato osservato in entrambi i piccoli-and-moderata sottogruppo campione o grande controparte campione per XPD Lys751Gln polimorfismo, dato che le RUP pool (IC al 95%, valore p) erano 0,96 (0,61-1,51, p = 0,858) per la primi e 1,17 (0,84-1,64, p = 0,351) per quest'ultimo, rispettivamente; comunque un risultato statisticamente significativo è stato osservato nel piccolo-e-moderata sottogruppo campione, ma non in grande controparte campione per Asp312Asn polimorfismo, dato che le RUP pool (IC al 95%, valore p) erano 1,74 (1,18-2,56, p = 0,005) per il primo e 1,35 (0,82-2,21, p = 0,239) per il secondo, rispettivamente.

i dati erano anche stratificata, in conformità con i punteggi di valutazione della qualità, in alta qualità (colonne non meno di 6,5) e qualità bassa e moderata (punteggi meno di 6,5) sottogruppi. Per quanto riguarda XPD Lys751Gln polimorfismo, non trovando statisticamente significativo è stato assistito in entrambi i sottogruppi di alta qualità o controparte a bassa e moderata di qualità, dato che le RUP in pool (IC al 95%, valore p) erano 1,20 (0,91-1,60, p = 0,199) per il primo e 0,61 (0,34-1,11, p = 0,104) per quest'ultimo. Quando etnia sub-stratificazione è stata effettuata per sottogruppo di alta qualità, un risultato statisticamente significativo è stato molto apparentemente assistito tra gli asiatici, ma senza risultato statisticamente significativo è stato osservato tra i caucasici, perché le RUP pool (IC al 95%, valore p) erano 2,54 (1,77-3,65, p = 0.000) per il primo e 0,98 (0,82-1,17, p = 0,803) per il secondo, rispettivamente. Per quanto riguarda il polimorfismo Asp312Asn, un risultato statisticamente significativo è stato assistito nel sottogruppo di alta qualità, ma non in controparte a bassa e moderata di qualità, dato che le RUP pool (IC al 95%, valore p) erano 1,56 (1,05-2,33, p = 0,028) per il primo e 1,42 (0,85-2,40, p = 0,184) per quest'ultimo. Allo stesso modo, quando l'etnia sub-stratificazione è stata effettuata per sottogruppo di alta qualità, un risultato statisticamente significativo è stato molto apparentemente assistito tra gli asiatici, ma senza risultato statisticamente significativo è stato osservato tra i caucasici, perché le RUP pool (IC al 95%, valore p) erano 2.37 (1.29- 4,36, p = 0,005) per il primo e 1,31 (0,86-1,99, p = 0,211) per il secondo, rispettivamente.

I dati erano inoltre stratificato, in linea con tempi di pubblicazione, nel sottogruppo precedente pubblicazione ( articoli pubblicati prima o nel corso del 2007) e il sottogruppo successiva pubblicazione (gli articoli pubblicati dopo il 2007). Per quanto riguarda XPD Lys751Gln polimorfismo, statisticamente significativi sono stati osservati risultati sulla base del fatto che le RUP pool (IC al 95%, valore p) erano 0,89 (0,66-1,19, p = 0.428) nel primo e 1,23 (0,84-1,81, p = 0.285) nel secondo, rispettivamente. Per quanto riguarda il polimorfismo Asp312Asn, un risultato statisticamente significativo è stato osservato nella pubblicazione sottogruppo più tardi, ma non nel precedente sottogruppo pubblicazione sulla base del fatto che le RUP pool (IC al 95%, valore p) erano 1,46 (1,02-2,09, p = 0,041) in il primo e 1,61 (0,89-2,92, p = 0,115) nel secondo, rispettivamente.

Quando il cancro gastrico è stato classificato in non-cardias (o distale) e sottotipi cardia, una scoperta statisticamente significativa è stata trovata tra non tipo -cardia ma non tra tipo cardia per XPD Lys751Gln polimorfismo sulla base del fatto che le RUP pool (IC al 95%, valore p) erano 2,03 (1,16-3,54, p = 0.013) tra tipo non-cardias e 0,88 (0,66-1,18, p = 0,403) tra tipo di Cardia. Per quanto riguarda Asp312Asn polimorfismo, non trovando statisticamente significativa è stata osservata tra tipo cardias sulla base del fatto che il pool o (IC al 95%, valore p) è stato 0,89 (0,56-1,43, p = 0,642), ma OR (IC al 95%, valore di p ) per quanto riguarda il tipo non-cardias non poteva essere calcolato perché solo uno studio [21] chiaramente menzionato il numero di genotipi di tipo non-cardias.

In termini di patologie, cancro gastrico potrebbe essere classificato in intestinale, diffuso, o sottotipi misti, ma solo 1 studio [19] chiaramente affrontato e citato il numero di genotipi di cancro sottotipo diffuso; in tal modo patologico sottotipo stratificazione non poteva essere fatto nella nostra meta-analisi.

fattori di confondimento come Helicobacter pylori
infezione o abitudine al fumo non poteva essere analizzato nella nostra meta-analisi in quanto necessari dati rilevanti di almeno due studi non potevano essere accessibili nella nostra meta-analisi.

E quando le tecniche di genotipizzazione sono stati considerati, non statisticamente significativo trovare è stato notato in ogni tecnica genotipizzazione sottogruppo per XPD Lys751Gln polimorfismo perché OR pool (IC al 95%, valore di p) erano 0,94 (0,68-1,29, p = 0,701) e 1,67 (0,68-4,14, p = 0,265) in RFLP e TagMan sottogruppi, rispettivamente; comunque un risultato statisticamente significativo è stato osservato in RFLP genotipizzazione sottogruppo ma non nel sottogruppo diretto sequenziamento per Asp312Asn polimorfismo perché OR pool (IC al 95%, valore p) erano 1,90 (1,09-3,31, p = 0,023) e 1,24 (0,70-2,20, p = 0.450), rispettivamente.

Sensitivity Analysis

meta-analisi sono state condotte ripetutamente quando ogni studio particolare era stato rimosso. I risultati hanno indicato che le stime effetti casuali, prima e dopo l'eliminazione di ogni studio erano simili in generale, suggerendo moderatamente alta stabilità dei risultati meta-analisi. Per XPD Lys751Gln polimorfismo, come mostrato in figura 3, parte A, il più influenzamento studio singolo sulle stime composito complessivo sembrava essere lo studio condotto da lunga XD et al. [25], per coincidenza deviato dalla HWE, l'analisi di sensitività, tuttavia, indicato moderatamente elevata stabilità dei risultati dei fatti che le RUP (95% CI, valore p) erano 1,12 (0,85-1,48, p = 0.410) prima della rimozione di tale studio e 0,98 (0,83-1,15, p = 0,781) dopo la rimozione di tale studio. In vista dello studio [16] condotto da Huang WY et al. che viene deviato da HWE, gli OR (95% CI, valore p) erano 1,12 (0,85-1,48, p = 0.410) prima della rimozione di tale studio e di 1,17 (0,87-1,58, p = 0.309) dopo la rimozione di tale studio per tutto etnia, indicando elevata stabilità dei risultati. Analogamente, dopo la rimozione dello studio [29] condotto da Engin AB et al., Deviato anche da HWE, OR (95% CI, valore p) diventa 1,19 (0,91-1,57, p = 0,209) per tutta etnia, indicando elevata stabilità dei risultati. Se tutti i tre studi deviato-HWE [16], [25], [29] sono stati rimossi, l'OR (95% CI, valore p) è diventato 1,06 (0,88-1,28, p = 0,555) per il tutto etnia, indicando moderatamente elevata stabilità dei risultati (le figure illustrano stati omessi a causa della lunghezza della carta).

per Asp312Asn polimorfismo, come mostrato in figura 3, parte B, il più influenzando studio singolo sulle stime composito complessivo sembrava essere lo studio condotto da Chen Z et al. [28], l'analisi di sensitività, tuttavia, ha indicato moderatamente elevata stabilità dei risultati dei fatti che le RUP (95% CI, valore p) erano 1,48 (1,12-1,97, p = 0,007) prima della rimozione di tale studio e 1.32 (1,04-1,70, p = 0,025) dopo la rimozione di tale studio. Se tutti i tre studi deviato-HWE [17], [27], [30] sono stati rimossi, l'OR (95% CI, valore p) è diventato 1,56 (1,05-2,33, p = 0,028) per il tutto etnia, indicando anche moderatamente elevata stabilità dei risultati (le cifre che illustrano sono stati omessi a causa della lunghezza della carta).

cumulativo meta-analisi

cumulative meta-analisi di XPD Lys751Gln associazione polimorfismo sono stati condotti anche tra gli asiatici e caucasici attraverso l'assortimento di data di pubblicazione e il numero totale di dimensione del campione. Come mostrato in Figura 4 parte A, le inclinazioni verso associazioni significative per XPD Lys751Gln polimorfismo potrebbe essere visto tra gli asiatici. Nella Figura 4, parte B, le inclinazioni verso associazioni nulli per XPD Lys751Gln polimorfismo potrebbe essere notato tra i caucasici in ordine cronologico. inclinazioni simili potrebbero essere osservati per Asp312Asn polimorfismo tra le diverse popolazioni di etnia (figure non mostrate).

pubblicazione Bias Analisi

bias di pubblicazione è stato preliminarmente esaminato da trame imbuto qualitativamente e stimato da Begg e di test di Egger quantitativamente . Per XPD Lys751Gln polimorfismo, la sua trama imbuto (Figura 5A) ha dimostrato che i punti quasi simmetricamente distribuite, prevalentemente all'interno di pseudo 95% limiti di confidenza. I valori di P sono stati 0.428 e 0.989 nella prova di Begg e il test di Egger, rispettivamente, insinuando senza bias di pubblicazione. Per Asp312Asn polimorfismo, la sua trama imbuto (Figura 5B) ha dimostrato che i punti quasi simmetricamente distribuite, prevalentemente all'interno di pseudo 95% limiti di confidenza. I valori di P erano 0,108 e 0,045 nella prova di Begg e il test di Egger, rispettivamente, insinuando no o un po 'bias di pubblicazione.

Discussione

Nella nostra meta-analisi risultati statisticamente significativi sono stati notati a quanto pare negli asiatici, ma non in caucasici sia per XPD Lys751Gln e polimorfismi XPD Asp312Asn. anche sulla base dei risultati della meta-analisi cumulativa, le inclinazioni verso associazioni significative negli asiatici sia per XPD Lys751Gln e polimorfismi XPD Asp312Asn potrebbero essere ovviamente visto quando ordinati per data di pubblicazione e la dimensione totale del campione. XPD Gln751Gln (CC) e genotipi Asn312Asn (AA) possono sembrano essere più suscettibili al cancro gastrico negli asiatici. Nostra meta-analisi suggeriscono che Gln751Gln (CC) e Asn312Asn (AA) genotipi possono essere importanti biomarker di suscettibilità al cancro gastrico per gli asiatici, l'ipotesi che deve essere ulteriormente confermata in futuro studi ben progettati nelle popolazioni asiatiche. Anche le diverse o addirittura contrastanti associazioni di rischio, in caso affermativo, tra le diverse etnie dovrebbero essere ulteriormente meticolosamente studiato e riconfermato nel futuro.

Per XPD Asp312Asn SNP, anche se I
^{2 ( %) era 19,2 e τ 2 era 0,0354, come illustrato nella Tabella 4, teoricamente rappresentano poco o nessun eterogeneità; In pratica, dopo l'analisi dei sottogruppi etnia, i valori di I
2 (%) e τ 2 divennero 0.0 e 0.0000 per gli asiatici e 41.6 e 0,0587 per i caucasici, rispettivamente, inoltre indica che, in realtà , senza l'eterogeneità esisteva tra gli asiatici studi piuttosto che tra i caucasici controparti. Detto questo, riteniamo che le analisi di stratificazione o sottogruppo sono ancora necessari nella nostra meta-analisi.}

• PLoS ONE: immunità innata e di linfoma non-Hodgkin (NHL) correlati geni in una studio caso-controllo di studio per il cancro gastrico Risk
• PLoS ONE: Rivelare il meccanismo molecolare del cancro gastrico Marker annessina A4 in Cancer Cell Proliferation Utilizzando Exon Arrays