PLoS ONE: Vaikutus XPD /ERCC2 polymorfismit on mahasyövän riski eri Ethnicities: järjestelmällinen katsaus ja meta-analyysi

tiivistelmä

Background

Mahdolliset xeroderma pigmentosum ryhmä D (XPD), jota kutsutaan myös Leikkauskorjauksessa rajat sisältyy ryhmä kaksi (ERCC2), Lys751Gln ja Asp312Asn polymorfismien ovat sekaantuneet mahasyövän riskiä eri etnisten ryhmien.

Methods

selvitti vaikutuksen XPD Lys751Gln ja Asp312Asn polymorfismien sen alttiuteen mahasyövän eri etnisten ryhmien kautta järjestelmällinen katsaus ja meta-analyysi. Jokainen aluksi mukana artikkeli teki laadun arviointi. Toivottavaa tiedot poimittiin ja rekisteröity tietokantoihin. 13 tutkimukset olivat lopulta oikeutettuja meta-analyysi Lys751Gln polymorfismin ja 9 tutkimusten meta-analyysi Asp312Asn polymorfismin. Hyväksyimme todennäköisesti sopiva geneettinen malli (väistyvä malli) sekä Lys751Gln ja Asp312Asn polymorfismit. Mahdollisia lähteitä heterogeenisyys etsittiin ulos kautta alaryhmä ja herkkyysanalyysit ja julkaisu harhojen arvioitiin.

Tulokset

Tilastollisesti merkittäviä havaintoja ilmeisesti huomattava aasialaisilla muttei valkoihoisilla sekä XPD Lys751Gln ja XPD Asp312Asn polymorfismit. Tilastollisesti merkittävä havainto oli nähtävissä noncardia-tyyppinen mahasyöpä varten XPD Lys751Gln polymorfismi. Tilastollisesti merkittävä havainto näkyi myös laadukkaita alaryhmässä, pieni-ja-kohtalainen otoskoko alaryhmä, julkaistut artikkelit vuoden 2007 jälkeen, tai PCR-RFLP genotyypityksen alaryhmä XPD Asp312Asn polymorfismin.

Johtopäätökset

Meidän meta-analyysi osoittaa, että XPD Gln751Gln (CC) genotyyppi ja Asn312Asn (AA) genotyyppi saattaa tuntua herkempiä mahasyövän aasialaisilla muttei valkoihoinen väestö, mikä viittaa siihen, että nämä kaksi genotyypit voivat olla tärkeitä biomarkkerit mahasyövän alttius Aasian populaatiot, olettaen, että on edelleen vahvistettu hyvin suunnitelluissa kokeissa eri etnisten ryhmien. Gln751Gln (CC) genotyyppi voi liittyä myös noncardia-tyypin mahalaukun syövän riski, joka olisi myös vahvistaa eri etnisten tulevaisuudessa.

Citation: Xue H, Lu Y, Lin B, Chen J, Tang F, Huang G (2012) Vaikutus XPD /ERCC2 polymorfismit on mahasyövän riski eri Ethnicities: järjestelmällinen katsaus ja meta-analyysi. PLoS ONE 7 (9): e43431. doi: 10,1371 /journal.pone.0043431

Editor: Rui Medeiros, IPO, Inst Port Oncology, Portugali

vastaanotettu: 05 huhtikuu 2012; Hyväksytty: 20 heinäkuu 2012; Julkaistu: 13 syyskuu 2012

Copyright: © Xue et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä työ on tukenut The National Natural Science Foundation of China (avustukset 30830038, 30970842 ja 81071180); "973" Project (2012CB932604); New Drug Discovery Project (2012ZX09506-001-005); Key Project Science and Technology komissio Shanghai kunta (avustukset 10JC1410000); ja Shanghai Leading Academic Kuri Project (avustus S30203). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Vaikka maailmanlaajuinen mahasyövän esiintyvyys on vähentynyt, sen kuolleisuus silti toisella sijalla [1]. Kiinassa, mahasyöpä jopa muodostaa yksi tappava syöpäsairauksia [2]. Kuten on yleisesti tiedossa, tarttuva, ravinnon, ympäristön, ja geneettiset tekijät sekaantuneet mahasyövän, mutta ne altistuvat riskitekijöitä, jotka lopulta kehittää mahasyöpä muodostaa pienemmän osan [3], mikä viittaa siihen, että isäntä geneettinen alttius on tärkeä rooli maha- syöpäriski eri etnisten ryhmien. Tällaiset eri alttiuden voitaisiin selittää, osittain yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) herkkien geenien eri etnisten ryhmien [4], [5]. Meidän aiemmin julkaistu meta-analyysi paperit ovat antaneet lisätodisteita tällaisista etnisesti alttiita eroja [5], [6].

On yleisesti tunnustettu, että DNA on pysyttävä vakaina tekemään sen ratkaisevan elintoimintojen, mutta se on jatkuvasti alttiita eri endogeenisiä ja /tai eksogeenisiä vahingoista ja siten sen todennäköinen mutaatiot voivat kerääntyä ja syövän syntymistä voi esiintyä vaurioituneen DNA. DNA korjaus järjestelmä kuitenkin on tärkeä rooli ylläpitämisessä toimintojen normaalien solujen ja genomin eheyden läpi käänteinen vaurioituneen DNA [7]. Peritty toiminnallinen polymorfismit tai kertynyt mutaatioita DNA: n korjaukseen geenit voivat vaikuttaa isännän kyky korjata vaurioitunut DNA ja siten moduloida syöpäriskiä [8]. SNP yhteisten DNA korjaukseen geenit on tunnistettu [9] ja osoitettiin liittyä satunnaista karsinogeneesi [10], [11].

nukleotidi- Leikkauskorjauksessa (NER), yksi tärkeimmistä DNA korjaukseen reittejä ihmisillä , kykenee poistamaan helix-vääristävät base leesioiden ultraviolettivalon (UV) ja joukko kemiallisia aineita [12]. XPD uskotaan osallistuvan DNA purkautuisi aikana NER ja transkription koska sillä on yksijuosteisen DNA-riippuvaista ATPaasi ja 5'-3 'DNA helikaasiaktiivisuudet [13], [14]. XPD (ERCC2) geeni, joka sijaitsee kromosomissa 19q13.3 käsittää 23 eksonia ja sen polymorfismien uskotaan syntynee rakenteellinen korjauksilla NER koulutusjakson ja vaikutus syöpäalttiutta. Laajimmin tutkittu XPD polymorfismien assosiaatioita syövän alttiuden käsittävät nonsynonymous A > C korvaaminen eksonissa 23 aiheuttaen lysiini (Lys) ja glutamiinin (Gin) substituution kodonissa 751 (Lys751Gln, rs1052559), joka on nonsynonymous G > Korvaushoidon eksonissa 10 mikä johtaa asparagiinihappo (Asp) ja asparagiini (Asn) substituution kodonissa 312 (Asp312Asn, rs1799793), ja synonyymi C > Korvaushoidon eksonissa 6 säilyttäen arginiini (R) tähteen kodonissa 156 (Arg156Arg, rs238406) [15].

vuonna 2005 Huang WY et al.
julkaisi ensimmäisen tutkimuksen mukaan XPD Lys751Gln polymorfismin suhteen mahasyövän riski [16]. Sittemmin tutkijat ovat raportoineet yhteenliittymien XPD Lys751Gln, Asp312Asn, ja /tai Arg156Arg kanssa herkkyys mahasyövän eri etnisten ryhmien, mutta vaihtelevin tai ristiriitaisia ​​tuloksia [17] - [30]. On vain yksi julkaistu artikkeli koskee Arg156Arg polymorfismin suhteen mahasyövän riski [28]. Tähän mennessä on ollut kolme asiaa julkaistu meta-analyysi paperit keskittyvät XPD polymorfismien [31] - [33]. Kaksi artikkelia lähinnä huolissaan yleisen syöpään alttiuksien sijaan mahasyövän alttius perusteellisesti [31], [32], mikä antaa vähemmän tietoa sen yhdessä mahalaukun syövän riski. Vielä tärkeämpää on, nämä kolme meta-analyysit [31] - [33] kaikki epäonnistuneet hyväksymään todennäköisin sopiva geneettinen malli, ja siten aito arvot näiden tilastollisten tulokset voivat vaarantua.

Näin pyritään meidän meta-analyysi oli tutkia, sopivimmalla geneettinen malli, vaikutus XPD polymorfismien mahalaukun syövän riskiä eri etnisten ryhmien ja tunnistaa mahdollisia lähteitä heterogeenisuus tukikelpoisten tutkimuksissa.

Materiaalit ja menetelmät

haku strategia

systemaattinen kirjallisuushaku suoritettiin artikkeleita koskevat XPD /ERCC2 SNP liittyvät mahalaukun syövän riski. MEDLINE, EMBASE tietokannat, Kiinan kansallisen Knowledge Infrastructure (CNKI), Web of Science, ja BIOSIS tietokantoja käytettiin samanaikaisesti yhdistelmän termejä "XPD", "ERCC2", "DNA korjaus", "NER", "Lys751Gln", "Asp312Asn", tai "Arg156Arg"; "Geeni"; "Polymorfismi", "variantti" tai "SNP"; ja "mahasyöpä", "mahasyöpä", tai "mahasyöpä" joulukuuhun 2011. Haku suoritettiin ilman rajoituksia kieli. Laajuus atk kirjallisuudesta laajennettiin mukaan viiteluettelot haetaan artikkeleita. Asiaa alkuperäisartikkeleita haettiin myös manuaalisesti.

Tutkimus Selection

koskevat tutkimukset yhdistys XPD /ERCC2 SNP (Lys751Gln, Asp312Asn, ja /tai Arg156Arg) mahalaukun syövän riskiä, ​​oli jos seuraavat ehdot täyttyvät: (i) kuvatun tutkimuksen yhdistyksen ainakin yhden XPD /ERCC2 SNP mahalaukun syöpä; (Ii) tutkimus kertoo numerot sekä valvonnan ja mahalaukun syöpätapausta; (Iii) Tulokset ilmaistiin odds ratio (OR), jossa 95%: n luottamusväli (CI); ja (iv) tutkimukset olivat tapausverrokkitutkimuksista tai sisäkkäisiä tapaus-verrokki niistä.

Methodological Quality Arviointi

tunnistaa laadukkaita tutkimuksia, olemme lähinnä hyväksyi ennalta kriteerit Quality arviointi alun perin ehdottanut Thakkinstian et al.
[34], mukauttaa Camargo et al.
[35], ja hioo Xue et al.
[5] - [7]. Kriteerit (nähdään taulukosta S1 online-tilassa) kattaa uskottavuus valvonnan, edustavuus tapauksissa konsolidointi mahasyöpä, genotyypitys tutkimus, ja yhdistys arviointi. Methodological laatu oli itsenäisesti arvioineet kaksi tutkijaa (Lin B ja Lu Y). Erimielisyydet ratkaistiin keskustelemalla. Tulospalvelu vaihtelivat alimmasta nollasta korkein kymmeneen. Artikkelit pisteet pienempi kuin 6,5 katsottiin "alhaisen tai kohtalaiseen laatua" niistä, kun taas alhaisempi kuin 6,5 oli ajatellut kuin "korkealaatuinen" niistä.

Data Extraction

seuraavat tiedot kustakin artikkeli poimittiin: laatijat, julkaisuvuosi, maa, etnisyys osallistujien (luokiteltu valkoihoisten, aasialaiset, jne.), tutkimuksen suunnittelu, lähde valvonnan määrä valvontaa ja tapauksissa genotyypitysmenetelmää, jakelu ikä ja sukupuoli, Lauren luokittelu (suoliston, hajanainen, tai sekoitettu), anatominen luokittelu (cardia tai ei-cardia syöpä), tupakointi tapana, juominen tapana ja Helicobacter pylori
tartunnan tilan.

tiedot uutettiin ja rekisteröity kahteen tietokantoihin itsenäisesti kaksi tutkijaa (Lin B ja Lu Y), jotka olivat sokeita lehden nimiä, laitosten tai rahasto avustuksia. Eroavaisuuksia näiden kahden tutkijoiden ratkaistiin tutkijan (Xue H), jotka osallistuivat keskusteluun niiden kanssa ja teki lopullisen päätöksen.

Tilastollinen analyysi

Kaikki tilastolliset analyysit suoritettiin käyttäen STATA tilasto-ohjelmalla (versio 10.1, STATA Corp, College Station, TX). Kaksipuolisen Ps < 0,05 katsottiin tilastollisesti merkitsevä. Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) kontrolleissa laskettiin jälleen meidän meta-analyysi. Chi-neliö hyvyyttä käytettiin testaamaan poikkeama HWE (merkitsevä tasolla 0,05).

Kerroin suhde (OR) ja 95%: n luottamusväli (95% CI) arviointiin käytettiin vahvuus yhdistysten välillä XPD /ERCC2 SNP ja mahasyövän riskiä. OR _{1, OR 2, ja OR 3 laskettiin genotyyppien CC vs. AA, CA vs. AA, ja CC vs. CA for XPD Lys751Gln polymorfismi; AA vs. GG, GA vs. GG, ja AA vs. GA varten XPD Asp312Asn polymorfismi; AA vs. CC, CA vs. CC, ja AA vs. CA for XPD Arg156Arg polymorfismin, vastaavasti. Pareittain erot käytettiin määrittämään sopivimman geneettistä mallia. Jos OR 1 = OR 3 ≠ 1 ja OR 2 = 1, väistyvä malli on ehdotettu. Jos OR 1 = OR 2 ≠ 1 ja OR 3 = 1, määräävä malli on hiljaista. Jos OR 2 = 1 /TAI 3 ≠ 1 ja OR 1 = 1, täydellinen overdominant malli on ehdotettu. Jos OR 1 > OR 2 > 1 ja OR 1 > OR 3 > 1, tai OR 1 < OR 2 < 1 ja OR 1 < OR 3 < 1, eli codominant malli on ilmoitettu [34]. Ota XPD Lys751Gln polymorfismi esimerkkinä havainnollistamaan sitä. Jos hallitseva malli osoitti, alkuperäinen ryhmittely oli romahtanut ja uusi ryhmä C: n kantajia (CC plus CA) verrattiin AA genotyyppi; jos väistyvä malli ehdotettiin, CC verrattiin ryhmään AA plus CA; jos täydellistä overdominant malli hiljaista, ryhmä CC plus AA verrattiin CA; tai jos codominant malli vihjaillaan, CC verrattiin CA ja AA, vastaavasti.}

Q tilastoa käytettiin arvioimaan heterogeenisuus sisältämien tutkimusten meta-analyysi. I-squared ( I
^{2) arvo, joka edustaa vaihtelua OR johtuvista heterogeenisuus käytettiin sitten määrittämään, missä määrin tällaisten Tutkimusten välisten heterogeenisuus [36]. Mukaan äskettäin julkaissut Venetsia kriteerien [37], " I
2 < 25% edustaa ole heterogeenisyys, I
2 = 25-50% on kohtalainen heterogeenisyys, I
2 = 50-75% on suuri heterogeenisyys, ja I
2 > 75% edustaa äärimmäistä heterogeenisyys ". Tutkimusten välisten varianssi Tau-squared (τ 2) arvoa käytettiin myös arvioimaan Tutkimusten välisten varianssi. Kiinteä-vaikutukset mukaan käyttämällä Mantel-Haenszel (M-H) menetelmällä, käytettiin laskemaan yhdistettyä syrjäisimpien alueiden homogeenisuutta olemassa perusteella Q-testin p-arvo vähintään 0.1.By vastoin satunnainen vaikutusten malli, käyttämällä Dersimonian ja Laird menetelmä (D + L), hyödynnettiin jos oli heterogeenisyys perustuu Q-testi p-arvo on alle 0,1. Jopa yhdenmukaistettua-tutkimukset, D + L menetelmää käytettiin myös. Meta-regressioanalyysisarjoissa ja alaryhmäanalyyseissa käytettiin tutkimaan ja ohjaamaan potentiaalisia heterogeenisuus tutkimuksissa. Merkitys yhdistettyä syrjäisimpien alueiden testattiin Z testi (P ​​< 0,05 katsottiin merkitseväksi).}

herkkyysanalyysi tehtiin, jossa meta-analyysissä arviot laskettiin jälkeen jokainen tutkimus on jätetty pois kustakin vuorollaan.

Lopuksi julkaisu bias arvioitiin suorittamalla suppilo tontteja laadullisesti, ja arvioitu Begg ja Egger testit kvantitatiivisesti.

tulokset

Literature Etsi ja Study Selection

Sen jälkeen kattava haku, yhteensä 140 artikkelia Englanti ja 7 Kiinan haettiin. Meidän meta-analyysi alun perin mukana yhteensä 15 tutkimukset [16] - [30], joka täyttää kriteerit. Nuo 15 tutkimukset olivat alustavasti aiheellista meta-analyysi yhdistysten mahasyövän suhteen XPD SNP, joista 13 tutkimuksia koskevien XPD Lys751Gln polymorfismi [16] - [26], [28], [29], 9 kyseisistä tutkimuksista XPD Asp312Asn polymorfismi [17] - [21], [23], [27], [28], [30], ja vain 1 tutkimus koski XPD Arg156Arg polymorfismi [28]. 1 artikkeli [23] on indeksoitu sekä Englanti ja Kiinan etsimistä moottorit.

Perinteisesti ottaen jokainen tutkimus, joka poikkesi HWE olisi pitänyt poistaa; kuitenkin, Minelli C et ai. totesi hiljattain, että tutkimuksia, jotka näyttävät poiketa HWE olisi tutkittava tarkemmin eikä vain sulkea pois, ellei ole muita syitä epäillä laatua tutkimuksen [38]. Tähän mennessä se on edelleen epäselvä, onko tutkimuksissa poikkesi HWE pitäisi hyväksyä tai hylätä suorittamisessa meta-analyysi. Meidän meta-analyysi, 3 kyseisistä tutkimuksista XPD Lys751Gln polymorfismi [16], [25], [29] poikettiin HWE, ja 3 tutkimuksista koski XPD Asp312Asn polymorfismi [17], [27], [30] Myös poikettu HWE; kuitenkin, kun otetaan huomioon, että numerot osallistujien näissä tutkimuksissa olivat suuria ja koska Herkkyysanalyysit käytäisiin vihdoin pysyi näissä tutkimuksissa meidän meta-analyysi.

Niinpä 13 tutkimukset [16] - [26] , [28], [29], joissa on yhteensä 6344 tarkastusten ja 2750 tapauksia XPD Lys751Gln polymorfismi, ja 9 tutkimukset [17] - [21], [23], [27], [28], [30] kanssa 3429 säätimet ja 1715 tapauksia XPD Asp312Asn polymorfismin olivat lopulta oikeutettuja meta-analyysi XPD polymorfismien. Vastaavat ominaisuudet nähtiin taulukossa 1 ja taulukossa 2. vuokaavio kirjallisuushausta ja tutkimus valinta valaistiin kuviossa 1.

Kaiken Meta-analyysi, Meta-regressio Analyysit ja Alaryhmä analyysit

Sillä XPD Lys751Gln polymorfismi, OR _{1 (p-arvo), OR 2 (p-arvo), ja OR 3 (p-arvo) oli 1,22 (p = 0,266), 1,11 (p = 0,369) ja 1,02 (p = 0,811), vastaavasti tuskin mielistelevä tietyn mallin vaikutus oletettujen alttiita C-alleelin. Heterogeenisyys chi-neliö oli 29,83 (df = 12), p-arvo oli 0,003, ja I
^{2 oli 59,8%. Sen jälkeen meta-regressioanalyysillä yhden kovariaattina (etnisyys koostuu valkoihoisilla, aasialaiset tai turkki väestö), p-arvot kertoimen t-arvo aasialaiset, valkoihoiset, tai Turkin väestöstä oli 0,001, 0,139, ja 0,585, tässä järjestyksessä; vahvasti osoittaa, että aasialaiset yksittäinen kovariaattina voisi useimmiten olla lähde heterogeenisuus tutkimuksissa. τ 2 aasialaiset, valkoihoiset, tai Turkin väestö yhden kovariaattina olivat 0, 0,09178, ja 0,1347, vastaavasti. Aasialaisille single kovariaattina, τ 2 laski +0,1233-0, mikä osoittaa aasialaiset yksittäinen kovariaattina voisivat selittää 100%: n lähteen heterogeenisuus tutkimuksissa. Kun stratifioitu etnisyys Alaryhmäanalyysissa, OR 1 (p-arvo), OR 2 (p-arvo), ja OR 3 (p-arvo) keskuudessa Aasian väestöstä oli 2,63 (p = 0,002), 1,14 ( p = 0,653), ja 1,51 (p = 0,034), tässä järjestyksessä, erittäin osoittaa väistyvä malli vaikutus oletettujen alttiita C-alleelin (OR 1 = OR 3 ≠ 1 ja OR 2 = 1).}}

XPD Asp312Asn polymorfismi, OR _{1 (p-arvo), OR 2 (p-arvo), ja OR 3 (p-arvo) oli 1,75 (p = 0,015), 1,15 (p = 0,549), ja 1,47 (p = 0,003), tässä järjestyksessä, erittäin osoittaa väistyvä malli vaikutus oletettujen alttiita alleelin (OR 1 = OR 3 ≠ 1 ja OR 2 = 1) . Heterogeenisyys chi-neliö oli 9,91 (df = 8), p-arvo oli 0,272, ja I
^{2 oli 19,2%, mikä osoittaa ei heterogeenisuus tutkimuksia. Sen jälkeen meta-regressioanalyysillä yhden kovariaattina (etnisyys koostuu valkoihoisista tai aasialaiset), p-arvo kertoimen t-arvo etnisyyden yhden kovariaattina oli 0,277, mikä osoittaa, että etnisyys voi olla yksi syy vähän heterogeenisuus tutkimuksissa. τ 2 laski 0,0354-0,02075, mikä osoittaa etnisen voisi selittää 41,4% lähteen pikku heterogeenisuus tutkimuksissa. Vastaavasti kun stratifioituna etnisyys Alaryhmäanalyysissa, OR 1 (p-arvo), OR 2 (p-arvo), ja OR 3 (p-arvo) keskuudessa Aasian väestöstä oli 2,10 (p = 0,026), 1,22 (p = 0,574), ja 1,80 (p = 0,008), tässä järjestyksessä, osoittaa edelleen, väistyvä malli vaikutus oletettujen alttiita alleelin (OR 1 = OR 3 ≠ 1 ja OR 2 = 1 ).}}

Yhteenvetona väistyvä geneettinen malli lopulta valittiin sekä XPD Lys751Gln ja XPD Asp312Asn polymorfismit meidän meta-analyysissä.

meidän meta-analyysissä, saatavilla olevat tiedot olivat kerrostunut, valossa etnisen osallistujien tulee valkoihoiset, aasialaiset, ja turkki väestöstä. Kuviossa 2, tilastollisesti merkitseviä löydöksiä todettiin aasialaiset muttei valkoihoisilla tai Turkin väestöstä (sekä XPD Lys751Gln ja XPD Asp312Asn polymorfismit). Yhdistetty syrjäisimmät alueet (95% CI, p-arvo) oli 2,41 (1,69-3,43, p = 0,000), 0,98 (0,82-1,17, p = 0,803), ja 0,97 (0,33-2,82, p = 0,954) aasialaisilla, valkoihoiset, ja Turkin väestö (XPD Lys751Gln polymorfismi osa A) tai 1,77 (1,19-2,63, p = 0,005) ja 1,31 (0,86-1,99, p = 0,211) aasialaisilla ja valkoihoisilla (XPD Asp312Asn polymorfismi osassa B), tässä järjestyksessä. Kuten XPD Lys751Gln polymorfismi, P-arvot heterogeenisyys Q-tilastotieto kaukasialaisissa, aasialaiset ja Turkin väestöstä oli 0,802, 0,701 ja 0,045; I
^{2 olivat 0,0%, 0,0%, ja 75,1%; ja τ 2 oli 0,0000, 0,0000 ja 0,4489, mikä kuvastaa ei heterogeenisuus sisällä valkoihoisilla tai aasialaiset, mutta äärimmäisen heterogeenisyys sisällä Turkin väestöstä (esitetty taulukossa 3). Kuten XPD Asp312Asn polymorfismi, P-arvot heterogeenisyys Q-tilasto kaukasialaisissa ja aasialaiset olivat 0.180 ja 0.470; I
2 oli 41,6% ja 0,0%; andτ 2 olivat 0,0587 ja 0,0000, mikä kuvastaa ei heterogeenisyys sisällä aasialaiset, mutta kohtalainen heterogeenisuus sisällä valkoihoiset (esitetty taulukossa 4).}

Kuten taulukosta 3 ja taulukossa 4, erityisiä tietoja XPD Lys751Gln ja XPD Asp312Asn polymorfismien stratifioitiin vastaavasti perusteella otoskoko, kahteen alaryhmään: suuri otos (kokonaismäärä valvontaa ja tapauksissa vähintään 500) ja pienten ja keskivaikea näyte (kokonaismäärä valvonnan ja tapausten vähemmän kuin 500) alaryhmiin. Tilastollisesti merkittävä havainto todettiin joko pienten ja keskivaikea näytteen alaryhmä tai suuren otoksen vastine XPD Lys751Gln polymorfismi, koska yhdistetyistä syrjäisimmät alueet (95% CI, p-arvo) oli 0,96 (0,61-1,51, p = 0,858) varten entinen ja 1,17 (0,84-1,64, p = 0,351) ja jälkimmäinen, vastaavasti; mutta tilastollisesti merkittävä löydös havaittiin pienten ja keskivaikea näytteen alaryhmä, mutta ei suuria näytteessä vastine Asp312Asn polymorfismi, koska yhdistetyistä syrjäisimmät alueet (95% CI, p-arvo) oli 1,74 (1,18-2,56, p = 0,005) ja entinen ja 1,35 (0,82-2,21, p = 0,239) jälkimmäisen, vastaavasti.

tiedot olivat myös kerrostunut mukaisesti laadun arviointi tulokset, laadukkaiksi (pisteet vähintään 6,5) ja matalan ja kohtalaiseen laatu (pisteet alle 6,5) alaryhmiin. Kuten XPD Lys751Gln polymorfismi, ei tilastollisesti merkittävä havainto oli todistamassa joko laadukkaita alaryhmä tai matala-ja-kohtalainen laatu vastine, koska yhdistetty syrjäisimmät alueet (95% CI, p-arvo) oli 1,20 (0,91-1,60, p = 0,199) entisen ja 0,61 (0,34-1,11, p = 0,104) jälkimmäisen. Kun etnisyys Saharan kerrostuminen tehtiin korkealaatuisten alaryhmä, tilastollisesti merkittävä löydös oli paljon ilmeisesti todistamassa joukossa aasialaiset mutta ei tilastollisesti merkittävä havainto todettiin valkoihoisilla koska yhdistetyistä syrjäisimmät alueet (95% CI, p-arvo) oli 2,54 (1,77-3,65, p = 0,000) entisen ja 0,98 (0,82-1,17, p = 0,803) ja jälkimmäinen, vastaavasti. Kuten Asp312Asn polymorfismi, tilastollisesti merkittävä löydös oli todistamassa korkealaatuisten alaryhmä muttei matalan ja kohtalaiseen laatu vastine, koska yhdistetyistä syrjäisimmät alueet (95% CI, p-arvo) oli 1,56 (1,05-2,33, p = 0,028) entisen ja 1,42 (0,85-2,40, p = 0,184) jälkimmäisen. Samoin, kun etnisyys Saharan kerrostuminen tehtiin korkealaatuisten alaryhmä, tilastollisesti merkittävä löydös oli paljon ilmeisesti todistamassa joukossa aasialaiset mutta ei tilastollisesti merkittävä havainto todettiin valkoihoisilla koska yhdistetyistä syrjäisimmät alueet (95% CI, p-arvo) oli 2,37 (1.29- 4,36, p = 0,005) entisen ja 1,31 (0,86-1,99, p = 0,211) jälkimmäisen, vastaavasti.

tiedot olivat lisäksi kerrostunut mukaisesti julkaisemiseen, osaksi aikaisemman julkaisun alaryhmä ( julkaistut artikkelit ennen tai 2007) ja myöhemmin julkaistu alaryhmä (artikkelit vuoden 2007 jälkeen). Kuten XPD Lys751Gln polymorfismi, ei tilastollisesti merkittäviä havaintoja ei tehty sillä perusteella, että yhdistetyistä syrjäisimmät alueet (95% CI, p-arvo) oli 0,89 (0,66-1,19, p = 0,428) entisessä ja 1,23 (0,84-1,81, p = 0,285) jälkimmäisessä vastaavasti. Kuten Asp312Asn polymorfismi, tilastollisesti merkittävä löydös havaittiin myöhemmin julkaisun alaryhmä mutta ei aikaisempaa julkaisua alaryhmä sillä perusteella, että yhdistetyistä syrjäisimmät alueet (95% CI, p-arvo) oli 1,46 (1,02-2,09, p = 0,041) vuonna entinen ja 1,61 (0,89-2,92, p = 0,115) jälkimmäisessä vastaavasti.

Kun mahasyövän luokiteltiin ei-cardia (tai distaalinen) ja cardia alatyyppeihin, tilastollisesti merkittävä löydös todettiin niiden joukossa ei -cardia tyypin mutta ei joukossa cardia tyyppiä XPD Lys751Gln polymorfia sillä perusteella, että yhdistettyjen syrjäisimmät alueet (95% CI, p-arvo) oli 2,03 (1,16-3,54, p = 0,013) keskuudessa ei-cardia tyyppi ja 0,88 (0,66-1,18, p = 0,403) keskuudessa cardia tyyppi. Kuten Asp312Asn polymorfismi, ei tilastollisesti merkittävä havainto havaittiin keskuudessa cardia tyyppi sillä perusteella, että yhdistettyjen OR (95% CI, p-arvo) oli 0,89 (0,56-1,43, p = 0,642), mutta OR (95% CI, p-arvo ) koskien ei-cardia tyyppiä ei voitu laskea, koska ainoastaan ​​yhden tutkimuksen [21] selvästi mainittu lukumäärät genotyyppien kuin cardia tyyppiä.

Mitä patologian, mahasyöpä voitiin luokitella suoliston, hajanainen, tai sekoitettu alatyyppejä, mutta vain 1 tutkimuksen [19] selvästi käsitellään ja mainitsi numerot genotyyppien hajakuormituksen alatyypin syöpä; Näin patologista alatyyppi kerrostumista ei voitu tehdä meidän meta-analyysi.

sekoittavat tekijät, kuten helikobakteeri
infektion tai tupakointi ei voitu analysoida meidän meta-analyysi, koska tarvittavat olennaiset tiedot vähintään kaksi tutkimusta ei voisi olla saatavilla meidän meta-analyysi.

kun genotyyppi tekniikoita tutkittiin tilastollisesti merkittävä havainto todettiin kussakin genotyypitys tekniikka alaryhmä XPD Lys751Gln polymorfismin vuoksi yhdistettiin syrjäisimmät alueet (95% CI, p-arvo) oli 0,94 (0,68-1,29, p = 0,701) ja 1,67 (0,68-4,14, p = 0,265) vuonna RFLP ja TagMan alaryhmien, vastaavasti; mutta tilastollisesti merkittävä löydös havaittiin RFLP genotyypitys alaryhmä, mutta ei suora sekvensointi alaryhmä Asp312Asn polymorfismin koska yhdistetty syrjäisimmät alueet (95% CI, p-arvo) oli 1,90 (1,09-3,31, p = 0,023) ja 1,24 (0,70-2,20, p = 0,450), tässä järjestyksessä.

Herkkyysanalyysi

Meta-analyysit tehtiin toistuvasti, kun kukin nimenomaisessa tutkimuksessa oli poistettu. Tulokset osoittivat, että random-vaikutukset arvioiden ennen ja jälkeen poistetaan kustakin tutkimuksesta oli samanlainen suuren, mikä viittaa kohtalaisen korkea vakauden meta-analyysin tuloksia. Sillä XPD Lys751Gln polymorfismi, kuten kuvassa 3 A osan kaikkein vaikuttaminen yksittäinen tutkimus yleisestä yhdistetystä arvioiden näytti olevan tutkimuksen Long XD et al. [25], coincidently poikkesi HWE, herkkyysanalyysissä kuitenkin ilmoittanut kohtalaisen korkea vakaus tulosten tosiasiat että syrjäisimmät alueet (95% CI, p-arvo) oli 1,12 (0,85-1,48, p = 0,410) ennen poistamista kyseisen tutkimuksen ja 0,98 (0,83-1,15, p = 0,781) poistamisen jälkeen kyseisen tutkimuksen. Ottaen huomioon tutkimuksen [16] suoritti Huang WY et al. joka poikkesi HWE, että syrjäisimpien alueiden (95% CI, p-arvo) oli 1,12 (0,85-1,48, p = 0,410) ennen poistamista, että tutkimuksen ja 1,17 (0,87-1,58, p = 0,309) poistamisen jälkeen kyseisen tutkimuksen että kaikki etnisyyden, mikä osoittaa erittäin vakaa tuloksista. Samoin poistamisen jälkeen tutkimuksen [29], joilla Engin AB ym., Myös poikkesi HWE, OR (95% CI, p-arvo) tuli 1,19 (0,91-1,57, p = 0,209), että kaikkien etnisyys, mikä osoittaa erittäin vakaa tuloksista. Jos kaikki kolme poikkesivat-HWE tutkimuksissa [16], [25], [29] poistettiin, OR (95% CI, p-arvo) tuli 1,06 (0,88-1,28, p = 0,555), että kaikkien etnisyyden, mikä osoittaa kohtalaisen korkea vakauden tulosten (sen kuvista, jätettiin pois johtuen paperin pituus).

Asp312Asn polymorfismi, kuten kuvassa 3 osassa B, kaikkein vaikuttavia yksittäinen tutkimus yleisestä yhdistetystä arvioiden näytti olevan toteuttama tutkimus Chen Z et al. [28], herkkyysanalyysissä kuitenkin ilmoittanut kohtalaisen korkea vakaus tulosten tosiasiat että syrjäisimmät alueet (95% CI, p-arvo) oli 1,48 (1,12-1,97, p = 0,007) ennen poistamista, että tutkimuksen ja 1,32 (1,04-1,70, p = 0,025) poistamisen jälkeen kyseisen tutkimuksen. Jos kaikki kolme poikkesivat-HWE tutkimuksissa [17], [27], [30] poistettiin, OR (95% CI, p-arvo) tuli 1,56 (1,05-2,33, p = 0,028), että kaikkien etnisyyden, myös osoittaa kohtalaisen korkea vakauden tulosten (sen kuvista, jätettiin pois johtuen paperin pituus).

kumulatiivinen Meta-analyysi

kumulatiivinen meta-analyysit XPD Lys751Gln polymorfismin yhdistys tehtiin myös keskuudessa aasialaiset ja valkoihoiset kautta valikoima julkaisemiseen ja kokonaismäärä otoskoko. Kuten kuvassa 4 osan A taipumusta merkittävästi yhdistysten XPD Lys751Gln polymorfismin näkyi keskuudessa aasialaiset. Kuviossa 4 B osaan taipumusta nolla yhdistysten XPD Lys751Gln polymorfismin voitiin todeta valkoihoisilla aikajärjestyksessä. Samanlaisia ​​kaltevuuksia voitiin tarkkailla Asp312Asn polymorfismin eri etnisen väestön (kuviot ei esitetty).

Julkaisu Bias Analysis

Julkaisu bias alustavasti tutkinut suppilo tonttien laadullisesti ja arvioitiin Begg ja Egger testit määrällisesti . Sillä XPD Lys751Gln polymorfismi, sen suppilo juoni (kuvio 5A) osoitti, että pisteitä lähes symmetrisesti, pääasiassa sisällä pseudo 95% luotettavuusrajat. P-arvot olivat 0,428 ja 0,989 in Begg testi ja Egger testi vastaavasti mielistelevä ole julkaistu bias. Sillä Asp312Asn polymorfismi, sen suppilo juoni (kuvio 5B) osoitti, että pisteitä lähes symmetrisesti, pääasiassa sisällä pseudo 95% luotettavuusrajat. P-arvot olivat 0,108 ja 0,045 in Begg testi ja Egger testi vastaavasti mielistelevä ei tai vähän julkaisun bias.

Keskustelu

Meidän meta-analyysi tilastollisesti merkittäviä havaintoja ilmeisesti huomattava aasialaisilla mutta ei valkoihoisilla sekä XPD Lys751Gln ja XPD Asp312Asn polymorfismit. Myös tulosten perusteella kumulatiivisen meta-analyysin perusteella taipumusta merkitseviä aasialaisilla sekä XPD Lys751Gln ja XPD Asp312Asn polymorfismien voitaisiin tietenkin nähdä, kun lajiteltu julkaisemiseen ja koko otoksen koko. XPD Gln751Gln (CC) ja Asn312Asn (AA) genotyypit saattaa tuntua herkempiä mahasyövän aasialaisilla. Meidän meta-analyysien mukaan Gln751Gln (CC) ja Asn312Asn (AA) genotyypit voivat olla tärkeitä biomarkkerit mahasyövän herkkyyden Aasialaisille, olettaen, että on edelleen vahvistettava tulevaisuudessa hyvin suunnitelluissa kokeissa aasialaisilla. Myös erilaiset tai jopa ristiriitaisia ​​riski yhdistysten, jos niin, eri etnisten ryhmien olisi edelleen huolellisesti tutkittu ja vahvisti tulevaisuudessa.

XPD Asp312Asn SNP, vaikka I
^{2 ( %) oli 19,2 ja τ 2 oli 0,0354, kuten on esitetty taulukossa 4, teoreettisesti edustavat vain vähän tai ei lainkaan heterogeenisyys; käytännössä, kun etnisyys Alaryhmäanalyysissa, arvot I
2 (%) ja τ 2 tuli 0,0 ja 0,0000 aasialaiset ja 41.6 ja 0,0587 varten valkoihoiset, vastaavasti, osoittaa edelleen, että todella ei heterogeenisuus olemassa keskuudessa aasialaiset tutkimusten sijaan valkoihoisilla kollegansa. Koska tämä, olemme sitä mieltä, että ositus tai alaryhmä analyysit tarvitaan edelleen meidän meta-analyysi.}

• PLoS ONE: luontaisen immuniteetin ja Non-Hodgkinin lymfooma (NHL) Vastaavat Geenit Sisäkkäisistä tapauskontrollitutkimuksessa mahasyövän riski
• PLoS ONE: paljastuu Molecular mekanismi mahasyövän Marker anneksiini A4 Cancer Cell Proliferation käyttäminen eksoni Arrays