PLoS One: a hatás XPD /ERCC2 polimorfizmus Gyomor rák kockázatát között különböző etnikumok: rendszeres felülvizsgálatát és meta-Analysis

absztrakt katalógusa

Háttér katalógusa

Lehetséges xeroderma pigmentózumot D csoport (XPD) , más néven kimetszés javítás határon ingyenes csoport két (ERCC2) Lys751Gln és Asp312Asn polimorfizmusok szerepet játszanak a gyomorrák kockázata között különböző etnikumok. katalógusa

módszerek

Arra törekedtünk, hogy vizsgálja meg a hatását XPD Lys751Gln és Asp312Asn polimorfizmusok hajlamot gyomorrák között különböző etnikumok keresztül rendszeres felülvizsgálatát és meta-analízis. Minden kezdetben tartalmazza a cikket szerzett minőségi értékelést. Kívánatos adatok kivontuk, és nyilvántartott adatbázisok. 13 tanulmány végső soron jogosult a meta-analízis Lys751Gln polimorfizmus és 9 tanulmány meta-analízisét Asp312Asn polimorfizmus. Elfogadtuk a valószínűleg megfelelő genetikai modell (recesszív modell) mindkét Lys751Gln és Asp312Asn polimorfizmusok. Potenciális heterogenitás kerestek keresztül történik alcsoport és érzékenységi vizsgálatok és publikációs torzítást becsülték. Katalógusa

Eredmények katalógusa

A statisztikailag szignifikáns megállapításai nyilvánvalóan megjegyezte ázsiaiak, de nem a kaukázusi mind XPD Lys751Gln és XPD Asp312Asn polimorfizmusok. Statisztikailag szignifikáns eredmény lehetett látni noncardia típusú gyomorrák az XPD Lys751Gln polimorfizmus. Statisztikailag szignifikáns eredmény is látható minőségi alcsoportban, a kis-és közepes minta mérete az alcsoportban megjelent cikkek 2007 után, vagy a PCR-RFLP genotípus-alcsoport XPD Asp312Asn polimorfizmus. Katalógusa

Következtetések katalógusa

a meta-analízis azt jelzi, hogy XPD Gln751Gln (CC) genotípus és Asn312Asn (AA) genotípus tűnhet, hogy sokkal érzékenyebb a gyomorrák az ázsiai populációk de nem kaukázusi populációban, ami arra utal, hogy a két genotípus fontos lehet biomarkerek gyomorrák fogékonyság az ázsiai populációk, feltételezve, hogy tovább kell erősíteni a jól megtervezett tanulmányok a különböző etnikumok. Gln751Gln (CC) genotípus is társulhat noncardia típusú gyomorrák kockázatát, amelyet szintén meg kell erősíteni a különböző etnikumok a jövőben. Katalógusa

Citation: Xue H, Lu Y, Lin B, Chen J, Tang F, G Huang (2012) A hatás XPD /ERCC2 polimorfizmus Gyomor rák kockázatát között különböző etnikumok: rendszeres felülvizsgálatát és meta-analízis. PLoS ONE 7 (9): e43431. doi: 10,1371 /journal.pone.0043431 katalógusa

Szerkesztő: Rui Medeiros, IPO, Inst Port Onkológia, Portugália katalógusa

Beérkezett: április 5., 2012; Elfogadva: július 20, 2012; Megjelent: szeptember 13, 2012 katalógusa

Copyright: © Xue et al. Ez egy nyílt hozzáférésű cikk feltételei szerint terjeszthető a Creative Commons Nevezd meg! Licenc, amely engedélyezi a korlátlan használatát, a forgalmazás és a reprodukció bármilyen adathordozón, feltéve, hogy az eredeti szerző és a forrás jóváírásra. Katalógusa

Forrás: Ez a munka támogatta a Nemzeti Természettudományi Alapítvány Kína (támogatások 30830038, 30970842, 81071180 és); "973" projekt (2012CB932604); New Drug Discovery Project (2012ZX09506-001-005); A Key Project Tudományos és Technológiai Bizottságának Shanghai Önkormányzat (támogatások 10JC1410000); és a Shanghai Vezető tudományterületen Project (támogatási S30203). A finanszírozók nem volt szerepe a tanulmány tervezés, adatgyűjtés és elemzés, döntés, hogy közzéteszi, vagy a készítmény a kézirat. Katalógusa

Érdekütközés: A szerzők kijelentették, hogy nem ellentétes érdekek léteznek. Katalógusa

Bevezető

Bár világszerte gyomorrák előfordulása csökkent, a halálozás is a második helyen áll. [1] Kínában, a gyomorrák még képezi az egyik leginkább halálos daganatok [2]. Amint széles körben ismert, a fertőző, diétás, környezeti és genetikai faktorok játszanak a gyomor karcinogenezis, de azok, kitéve a kockázati tényezők, akik végül fejleszteni gyomorrák tartalmaz egy kisebb arányban [3], ami arra utal, hogy a befogadó genetikai fogékonyság fontos szerepet játszik a gyomor rák kockázatát a különböző etnikumok. Az ilyen különböző érzékenysége lehetne magyarázni, részben, egyetlen nukleotid polimorfizmusok (SNP) a fogékony gének között különböző etnikumok [4], [5]. A korábban közzétett metaanalízis papírok további bizonyítékot ilyen etnikailag érzékeny különbségeket [5], [6]. Katalógusa

Széles körben elfogadott, hogy a DNS-t kell maradnia, hogy saját alapvető élettani funkciókat, de kitartóan téve a különböző endogén és /vagy exogén károk és így annak várható mutációk felhalmozódnak és a rák kialakulásának bekövetkezhetnek a sérült DNS-t. DNS-javító rendszer, azonban fontos szerepet játszik fenntartásában funkciói a normális sejtek és genom integritásának a megfordításával a sérült DNS [7]. Örökölt funkcionális polimorfizmus vagy felhalmozódott mutációk DNS repair gének befolyásolhatják a befogadó kapacitás, hogy helyrehozza a sérült DNS, és így módosítják a rák kockázata [8]. SNP közös DNS-javító gént azonosítottak [9], és bizonyította, hogy kapcsolódik a szórványos karcinogenezissel [10], [11]. Katalógusa

A nukleotid kimetszés javítás (NER), az egyik legnagyobb a DNS javító mechanizmusokat emberben , képes eltávolítására hélix torzító bázis elváltozások által termelt ultraibolya fény (UV) és egy sor kémiai szerek [12]. XPD úgy vélik, hogy részt vegyenek a DNS letekercselési alatt NER és a transzkripció, mert rendelkezik egyszálú DNS-függő ATPáz és az 5'-3 'DNS helikáz tevékenységek [13], [14]. XPD (ERCC2) gén található kromoszóma 19q13.3, magában foglalja a 23 exon és polimorfizmusok úgy gondolják, hogy ébresszen szerkezeti elváltozások NER út és befolyása a rák hajlam. A legszélesebb körben vizsgált XPD polimorfizmusok társulásai rákos fogékonyság tartalmazhat egy nonsynonymous a >C szubsztitúció az exon 23 okozva lizin (Lys) a glutamin (Gin) szubsztitúció kodon 751 (Lys751Gln, rs1052559), egy nonsynonymous G > A szubsztitúció az exon 10, ami egy aszparaginsav (Asp) az aszparagin (Asn) szubsztitúció kodon 312 (Asp312Asn, rs1799793) és egy szinonim C > a szubsztitúció az exon 6 megőrizve az arginin (R) maradékot kodon 156 (Arg156Arg, rs238406) [15]. katalógusa

2005-ben, Huang WY et al. katalógusa megjelent az első vizsgálatban az XPD Lys751Gln polimorfizmus kapcsolatban gyomorrák kockázatát [16]. Azóta a kutatók arról számoltak be, társulásai XPD Lys751Gln, Asp312Asn, és /vagy Arg156Arg a fogékonyság gyomorrák a különböző etnikumok, de vegyes vagy egymásnak ellentmondó eredményeket [17] - [30]. Csak egy megjelent cikket érintő Arg156Arg polimorfizmus kapcsolatban gyomorrák kockázatát [28]. Eddig három olyan releváns publikált meta-analízis cikkek, melyek az XPD polimorfizmusok [31] - [33]. Két cikk elsősorban érintett általános rák érzékenységét helyett gyomorrák fogékonyság mélység [31], [32], és ezáltal kevesebb információt társítását gyomorrák kockázatát. Ennél is fontosabb, az a három metaanalízis [31] - [33] összes nem fogadta el a legvalószínűbb megfelelő genetikai modell, és így a hiteles értékeket az ezen statisztikai eredmények veszélybe kerül. Katalógusa

Ennek az a célja, meta-analízis volt, hogy feltárja, a leginkább megfelelő genetikai modell, a hatás XPD polimorfizmusok gyomorrák kockázata a különböző etnikumok és azonosítása lehetséges forrásai közötti sokféleség a támogatható vizsgálatok. katalógusa

anyagok és módszerek

keresés stratégia katalógusa

a szisztematikus irodalmi kutatást végeztünk cikkek tekintetében XPD /ERCC2 SNP kapcsolódó gyomorrák kockázatát. A MEDLINE, EMBASE adatbázisok, Kínai Nemzeti Knowledge infrastruktúra (CNKI), a Web of Science, és Biosis adatbázisok együtt használni a kombinált feltételek "XPD", "ERCC2", "DNS-javítás", "NER", "Lys751Gln" "Asp312Asn", vagy "Arg156Arg"; "gén"; "Polimorfizmus", "változat", vagy "SNP"; és "gyomorrák", "gyomor carcinoma", vagy "gyomorrák" legfeljebb 2011. december végrehajtott keresés korlátozások hiányában nyelvet. Hatálya számítógépes szakirodalmi kutatás bővült szerinti referencia listákat letöltött cikkeket. A vonatkozó eredeti cikkeket is kérte manuálisan. Katalógusa

Study Selection katalógusa

Tanulmányok társulásáról szóló XPD /ERCC2 SNP (Lys751Gln, Asp312Asn, és /vagy Arg156Arg) a gyomorrák kockázatát vontak be a következő feltételek teljesülése esetén: (i) bármely tanulmányban a társulás legalább az egyik XPD /ERCC2 SNP gyomorrák (Ii) minden olyan tanulmányt jelentettek a számát vezérli és gyomorrák esetek; (III) Eredmények fejeztük esélyhányados (OR) 95% -os konfidencia intervallumok (Cl); és (iv) vizsgálatok eseti vagy eset-kontroll is. katalógusa

Módszertani minőség értékelése katalógusa

azoknak a magas színvonalú tanulmányokat, főleg elfogadott előre meghatározott kritériumok Quality értékbecslés által eredetileg javasolt Thakkinstian et al.
[34], kiigazított Camargo et al.
[35], valamint finomítani Xue et al.
[5] - [7]. A kritériumok (táblázatban látható S1 online) terjed hitelességének ellenőrzése, reprezentativitása esetben konszolidációja gyomorrák, genotípus-vizsgálatot, és az egyesülés értékelést. Módszertani minősége volt egymástól függetlenül két kutató (Lin B és Lu Y). Nézeteltérések során tisztázták vitát. Pontszámok között mozgott a legalacsonyabb nulla a legmagasabb tíz. Cikkek a pontszám alacsonyabb, mint 6,5 tartották "alacsony vagy közepes fokú minőség" is, mivel ezek nem kevesebb, mint 6,5 volt úgy, mint "kiváló minőségű" is. Katalógusa

Adatkiemelés katalógusa

A következő adatokat minden cikket nyerték: szerzők, megjelenés éve, ország, etnikai résztvevők (minősíteni kaukázusi, ázsiai, stb), a vizsgálat felépítése, forrás ellenőrzése, az ellenőrzések száma és az esetek, genotípus-módszer, forgalmazása kor és nem, Lauren besorolás (bél, diffúz, vagy vegyes), anatómiai besorolás (cardia vagy nem cardia rák), a dohányzás, ivás szokását és Helicobacter pylori fertőzés katalógusa állapotát. katalógusa

Az adatok kivontuk, és nyilvántartott két adatbázis függetlenül két kutató (Lin B és Lu Y), aki vak volt naplóelnevezés, intézmények vagy alapjuttatás. Bármilyen eltérés a két nyomozó volt megoldani a kutató (Xue H), aki részt vett a vita velük, és tette a végső döntést. Katalógusa

Statisztikai elemzés katalógusa

A statisztikai elemzések során STATA statisztikai szoftver (10.1 verzió, STATA Corp, College Station, TX). Kétoldalas Ps < 0,05 tekintettük statisztikailag szignifikánsnak. A Hardy-Weinberg (HWE) a kontrollokban számítottuk ismét a mi meta-analízis. A chi-négyzet illeszkedési ben használt teszt eltérést HWE (szignifikáns 0,05 szinten). Katalógusa

Odds arány (OR) és a 95% -os konfidencia intervallum (95% CI) értékeléséhez használt ereje egyesületek között XPD /ERCC2 SNP-k és a gyomorrák kockázatát. OR _{1 vagy 2, és az OR 3 számoltunk genotípusok CC vs. AA, CA versus AA és CC versus CA XPD Lys751Gln polimorfizmus; AA vs. GG, GA versus GG, valamint az AA vs. GA XPD Asp312Asn polimorfizmus; AA vs. CC, CA versus CC, és az AA vs. CA XPD Arg156Arg polimorfizmus, ill. A páronkénti különbségek meghatározására használták a leginkább megfelelő genetikai modell. Ha OR 1 = OR 3 ≠ 1 és OR 2 = 1, recesszív modell javasolt. Ha OR 1 = OR 2 ≠ 1 és OR 3 = 1, a domináns modell feltételezett. Ha OR 2 = 1 /OR 3 ≠ 1 és OR 1 = 1, a teljes overdominant modellt javasolt. Ha OR 1 > OR 2 > 1 OR 1 > OR 3 > 1 vagy OR 1 < OR 2 < 1 OR 1 < OR 3 < 1, a kodomináns modell jelezte [34]. Vegye XPD Lys751Gln polimorfizmus, mint egy példát rá. Ha egy uralkodó modell azt már jeleztük, az eredeti csoportosítás összeomlott, és az új csoport C hordozók (CC plusz CA) hasonlították össze AA genotípus; Ha egy recesszív modell javasolták, CC-t, mint a csoport AA plusz CA; ha egy teljes overdominant modellt burkolt, a csoport CC plusz AA összehasonlították CA; vagy ha egy kodomináns modellt insinuated, CC hasonlították össze a CA és az AA, ill.}

Q statisztikai analízist használtuk a értékelésére heterogenitás a vizsgálatok szerepelnek a meta-analízis. I-négyzet ( I katalógusa ^{2) érték, ami változása VAGY tulajdonítható heterogenitás ezután számszerűsíthető az mértékének ilyen egyes vizsgálatok heterogenitása [36]. Szerint a nemrég megjelent Velence kritériumok [37], " I katalógusa 2 < 25% nem jelent heterogenitás, I katalógusa 2 = 25-50% képviseli mérsékelt heterogenitás, I katalógusa 2 = 50-75% képvisel nagy heterogenitás, és I katalógusa 2 > 75% azt jelenti, szélsőséges heterogenitás ". Egyes vizsgálatok variancia Tau-négyzet (τ 2) értéket használták, hogy értékelje egyes vizsgálatok variancia. A rögzített hatások modell alkalmazásával Mantel-Haenszel (M-H) módszer, alkalmaztunk kiszámításához az egyesített legkülső amikor homogenitás létezett alapján Q-teszt p értéke nem kevesebb, mint 0.1.By ellentétben, egy random-hatás modell, használva DerSimonian és Laird módszer (D + L), használtunk ha volt heterogenitás alapuló Q-teszt p értéke kisebb, mint 0,1. Még a homogenitás között-tanulmányok, D + L módszert is alkalmaztunk. Meta-regresszió alcsoportelemzések alkalmaztunk, hogy vizsgálja meg és ellenőrzik potenciális heterogenitás vizsgálatok között. A jelentősége egyesített legkülső teszteltük Z teszt (P < 0,05 értéket tekintettük szignifikánsnak). Katalógusa}

Az érzékenység elemzést végeztünk, amelyben a meta-analízis becslések kerültek kiszámításra után mindenki tanulmány elhagyásával minden körben.

Végül publikációs torzítás értékelték elvégzésével tölcsér parcellák minőségileg és becslések szerint Begg és Egger tesztek mennyiségileg. katalógusa

Eredmények katalógusa

irodalom kutathatók Selection katalógusa

Miután átfogó keresés, összesen 140 cikkek angol és 7 kínai nyertük vissza. A mi meta-analízis kezdtük összesen 15 tanulmány [16] - [30], amely megfelel a kritériumoknak. A 15 vizsgálatok előzetesen megfelelő meta-analízis a társulások gyomorrák kapcsolatos XPD SNP, melyek közül 13 érintett vizsgálatok XPD Lys751Gln polimorfizmus [16] - [26], [28], [29], a 9. érintett vizsgálatok XPD Asp312Asn polimorfizmus [17] - [21], [23], [27], [28], [30], és csak 1 tanulmány érintett XPD Arg156Arg polimorfizmus [28]. 1 cikk [23] indexelve angol és kínai kereső motorok. Katalógusa

A hagyományos értelemben olyan vizsgálatok, amelyek eltértek HWE kellett volna távolítani; Azonban Minelli C et al. nemrég rámutatott, hogy a tanulmányok jelennek meg, hogy eltérjenek HWE kell tovább vizsgálni, nem pedig csak ide, ha vannak más megkérdőjelezhető minősége a tanulmány [38]. A mai napig, még mindig nem egyértelmű, hogy a tanulmányok eltért HWE kell vonni vagy zárható lefolytatása meta-analízis. A mi meta-analízis, 3 érintett vizsgálatok XPD Lys751Gln polimorfizmus [16], [25], [29] a eltért HWE és 3 érintett vizsgálatok XPD Asp312Asn polimorfizmus [17], [27], [30] is eltért HWE; Figyelembe véve azonban, hogy a résztvevők száma az említett vizsgálatok nagy és tekintettel arra, hogy érzékenységi elemzéseket kell végezni, végül maradt ezen tanulmányok a mi meta-analízis. katalógusa

Így 13 tanulmány [16] - [26] [28], [29], összesen 6344 ellenőrzést és 2750 esetekben XPD Lys751Gln polimorfizmus és 9 tanulmány [17] - [21], [23], [27], [28], [30] 3429 ellenőrzések és 1715 esetekben XPD Asp312Asn polimorfizmus végül jogosultak a meta-analízis XPD polimorfizmus. A megfelelő jellemzőit az 1. táblázatban látható és a 2. táblázatban a folyamatábra szakirodalmi kutatás és tanulmány kiválasztás volt megvilágítva az 1. ábrán katalógusa

Általános meta-analízis, Meta-regressziós elemzések és Alcsoportelemzések katalógusa

Az XPD Lys751Gln polimorfizmus, OR _{1 (p-érték), OR 2 (p-érték) és OR 3 (p-érték) volt 1,22 (p = 0,266), 1,11 (p = 0,369) és 1,02 (p = 0,811), illetve alig burkolt egy adott modell hatása feltételezett fogékony C allél. Heterogenitás chi-négyzet-volt 29.83 (D. F. = 12), p-érték 0,003 volt, és I katalógusa ^{2 59,8%. Miután meta-regressziós analízissel egyetlen kovariáns (etnikai tagjai kaukázusiak, ázsiaiak, vagy török ​​lakosság), p értéke együttható t értéke az ázsiaiak, kaukázusiak, vagy a török ​​lakosság voltak 0,001 0,139 és 0,585, illetve, határozottan arra utal, hogy az ázsiaiak egyetlen kovariáns lehetne leginkább képezik a forrását heterogenitás vizsgálatok között. τ 2 ázsiaiak, kaukázusiak, vagy a török ​​lakosság egyetlen kovariáns voltak: 0, 0,09178, és 0,1347, ill. Ázsiaiak egyetlen kovariáns, τ 2 csökkent ,1233-0, jelezve ázsiaiak egyetlen kovariáns lehet 100% -át a forrás heterogenitás vizsgálatok között. Amikor rétegezni etnikai alcsoport-analízis OR 1 (p-érték), OR 2 (p-érték) és OR 3 (p-érték) között az ázsiai népesség volt 2,63 (p = 0,002), 1,14 ( p = 0,653), és 1,51 (p = 0,034), illetve nagyon jelezve recesszív modell hatása feltételezett fogékony C allél (OR 1 = OR 3 ≠ 1 és OR 2 = 1).}}

XPD Asp312Asn polimorfizmus, OR _{1 (p-érték), OR 2 (p-érték) és OR 3 (p-érték) volt 1,75 (p = 0,015), 1,15 (p = 0,549), és 1,47 (p = 0,003), illetve nagyon jelezve recesszív modell hatása feltételezett fogékony allél (OR 1 = OR 3 ≠ 1 és OR 2 = 1) . Heterogenitás chi-négyzet-9,91 (D. F. = 8), p értéke 0,272 és I katalógusa ^{2 19,2%, jelezve, hogy nincs heterogenitás vizsgálatok között. Miután meta-regressziós analízissel egyetlen kovariáns (etnikai álló kaukázusi vagy ázsiai), p értéke együttható t érték etnikai egyetlen kovariáns volt 0,277, ami azt jelzi, hogy az etnikai képezhetné egyik forrása a kis heterogenitás vizsgálatok között. τ 2 csökkent ,0354-0,02075, jelezve etnikai kitehetik 41,4% a forrás kis heterogenitás vizsgálatok között. Hasonlóképpen, ha rétegzett etnikai alcsoport-analízis OR 1 (p-érték), OR 2 (p-érték) és OR 3 (p-érték) között az ázsiai népesség volt 2,10 (p = 0,026), 1,22 (p = 0,574), és 1,80 (p = 0,008), illetve további jelezve recesszív modell hatása feltételezett fogékony allél (OR 1 = OR 3 ≠ 1 és OR 2 = 1 ).}}

Mindent összevetve, egy recesszív genetikai modellt végül megválasztani mind XPD Lys751Gln és XPD Asp312Asn polimorfizmusok meta-analízis. katalógusa

a mi meta-analízis, a rendelkezésre álló adatok rétegzett, fényében etnikai résztvevők, a kaukázusiak, ázsiaiak, és a török ​​lakosság. A 2. ábrán statisztikailag szignifikáns eredményeket észleltek ázsiaiak, de nem a kaukázusi vagy török ​​lakosság (mindkét XPD Lys751Gln és XPD Asp312Asn polimorfizmusok). Az egyesített legkülső régiók (95% CI, p-érték) volt 2,41 (1,69-3,43, p = 0,000), 0,98 (0,82-1,17, p = 0,803), és 0,97 (0,33-2,82, p = 0,954) az ázsiaiak, kaukázusi, és török ​​lakosság (XPD Lys751Gln polimorfizmus részében) vagy 1,77 (1,19-2,63, p = 0,005) és 1,31 (0,86-1,99, p = 0,211) a ázsiaiak és kaukázusiak (XPD Asp312Asn polimorfizmus B rész), ill. Ami XPD Lys751Gln polimorfizmus, P értékeit heterogenitás Q-statisztika a kaukázusi, ázsiaiak, és a török ​​lakosság voltak 0,802, 0,701, 0,045 és; I katalógusa ^{2 rendre 0,0%, 0,0% és 75,1%; és τ 2 volt 0,0000, 0,0000, 0,4489 és, mutatva nem heterogenitása kaukázusi vagy ázsiai, de extrém heterogenitása török ​​lakosság (3. táblázat mutatja). Ami XPD Asp312Asn polimorfizmus, P értékeit heterogenitás Q-statisztika a kaukázusi és az ázsiaiak voltak 0.180 és 0.470; I katalógusa 2 41,6% és 0,0%; andτ 2 volt, 0,0587 és 0,0000, mutatva nem heterogenitás belül ázsiaiak, de mérsékelt heterogenitás belül kaukázusiak (a 4. táblázatban látható).}

Amint azt a 3. táblázatban és a 4. táblázatban, jellemző adatok XPD Lys751Gln és XPD Asp312Asn polimorfizmusok rétegezni, illetve alapján mintanagyság, két csoportra: nagy minta (az összes ellenőrzés és esetek nem kevesebb, mint 500), és a kis-és közepes minta (az összes ellenőrzés és tokok kevesebb, mint 500) alcsoportokban. Nem volt statisztikailag szignifikáns eredmény volt megfigyelhető mindkét kis-és közepes minta alcsoport vagy nagymintás partnerének XPD Lys751Gln polimorfizmus, tekintettel arra, hogy az egyesített legkülső régiók (95% CI, p-érték) 0,96 (0,61-1,51, p = 0,858) a volt és 1,17 (0,84-1,64, p = 0,351) az utóbbi rendre; azonban statisztikailag szignifikáns eredmény volt megfigyelhető a kis-és közepes minta alcsoport, de nem nagy minta partnerének Asp312Asn polimorfizmus, tekintettel arra, hogy az egyesített legkülső régiók (95% CI, p-érték) volt 1,74 (1,18-2,56, p = 0,005) a az előbbi és 1,35 (0,82-2,21, p = 0,239), az utóbbi, ill.

az adatokat is rétegzett, összhangban a minőség értékelése pontszámok, a magas minőségű (pontszámokat nem kevesebb, mint 6,5) és alacsony-és közepes minőségű (pontszámok kevesebb, mint 6,5) alcsoportok. Ami XPD Lys751Gln polimorfizmus statisztikailag szignifikáns eredmény volt megfigyelhető mindkét alcsoportban kiváló minőségű, vagy alacsony-és közepes minőségű párja, tekintettel arra, hogy az összevont legkülső régiók (95% CI, p-érték) volt 1,20 (0,91-1,60, p = 0,199) a volt és 0,61 (0,34-1,11, p = 0,104) az utóbbi. Amikor etnikai al-rétegződés végeztünk minőségi alcsoport, statisztikailag szignifikáns eredmény volt sok látszólag tanúja ázsiaiak között, de statisztikailag nem szignifikáns eredmény jegyezte között kaukázusiak, mert az egyesített legkülső régiók (95% CI, p-érték) volt 2,54 (1,77-3,65, p = 0,000) a volt és 0,98 (0,82-1,17, p = 0,803) az utóbbi volt. Ami Asp312Asn polimorfizmus statisztikailag szignifikáns eredmény volt megfigyelhető a magas színvonalú alcsoportban, de nem az alacsony-és közepes minőségű párja, tekintettel arra, hogy az egyesített legkülső régiók (95% CI, p-érték) volt 1,56 (1,05-2,33, p = 0,028) a volt és 1,42 (0,85-2,40, p = 0,184) az utóbbi. Hasonlóképpen, ha etnikai al-rétegződés végeztünk minőségi alcsoport, statisztikailag szignifikáns eredmény volt sok látszólag tanúja ázsiaiak között, de statisztikailag nem szignifikáns eredmény jegyezte között kaukázusiak, mert az egyesített legkülső régiók (95% CI, p-érték) esetében 2,37 (1.29- 4,36, p = 0,005) a volt és 1,31 (0,86-1,99, p = 0,211) az utóbbi volt. katalógusa

az adatok nem voltak emellett rétegzett, összhangban megjelenés ideje, a korábbi közzététel alcsoport ( megjelent cikkek előtt vagy 2007-ben) és a későbbi kiadvány alcsoport (megjelent cikkek 2007 után). Ami XPD Lys751Gln polimorfizmus nem volt statisztikailag szignifikáns eredményeket figyeltek meg azon az alapon, hogy az egyesített legkülső régiók (95% CI, p-érték) volt 0,89 (0,66-1,19, p = 0,428), a korábbi 1,23 (0,84-1,81, p = 0,285) az utóbbi, ill. Ami Asp312Asn polimorfizmus statisztikailag szignifikáns eredmény volt megfigyelhető a későbbi kiadvány alcsoport, de nem a korábbi kiadvány alcsoport azon az alapon, hogy az egyesített legkülső régiók (95% CI, p-érték) volt 1,46 (1,02-2,09, p = 0,041) a a korábbi és 1,61 (0,89-2,92, p = 0,115), az utóbbi esetében. katalógusa

Ha a gyomorrák sorolták nem cardia (vagy távolabbi) és cardia altípusok, statisztikailag szignifikáns eredmény közül került, nem -cardia típus, de nem szerepel cardia típusú XPD Lys751Gln polimorfizmus azon az alapon, hogy az egyesített legkülső régiók (95% CI, p-érték) volt 2,03 (1,16-3,54, p = 0,013) között nem cardia típusú és 0,88 (0,66-1,18, p = 0,403) között cardia típus. Ami Asp312Asn polimorfizmus statisztikailag szignifikáns eredmény volt megfigyelhető között cardia típus azon az alapon, hogy az egyesített OR (95% CI, p-érték) 0,89 (0,56-1,43, p = 0,642), de OR (95% CI, p értéke ) tekintetében nem cardia típusú nem lehetett kiszámítani, mivel csak egy tanulmány [21] egyértelműen feltüntetve a számok a genotípus nem cardia típusát. katalógusa

Ami a patológia, gyomorrák sorolható bél, diffúz, vagy vegyes altípusok, de csak 1 tanulmány [19] egyértelműen foglalkozott, és megemlíti a számok a genotípusok diffúz altípus rák; így patológiai altípusa rétegződés nem lehetett elvégezni a meta-analízis. katalógusa

A zavaró tényezők, mint a Helicobacter pylori fertőzés katalógusa vagy dohányzási státusz nem lehetett elemezni a meta-analízis, mert a szükséges vonatkozó adatait legalább két tanulmány nem lehet hozzáférni a meta-analízis. katalógusa

És amikor a genotípus technikák tartották, statisztikailag szignifikáns eredmény volt megfigyelhető az egyes genotípus-technika alcsoport XPD Lys751Gln polimorfizmus miatt összevont legkülső (95% CI, p-érték) volt 0,94 (0,68-1,29, p = 0,701) és 1,67 (0,68-4,14, p = 0,265), a RFLP és TagMan alcsoportok esetén; azonban statisztikailag szignifikáns eredmény volt megfigyelhető RFLP genotípus-alcsoportban, de nincs közvetlen szekvenálása alcsoport Asp312Asn polimorfizmus miatt összevont legkülső (95% CI, p-érték) volt 1,90 (1,09-3,31, p = 0,023) és 1,24 (0,70-2,20, p = 0,450), ill. katalógusa

Sensitivity Analysis katalógusa

Meta-analízist végeztek egymás után többször egyes vizsgálatok már eltávolították. Az eredmények azt mutatták, hogy a véletlenszerű hatások becslések előtt és után a törlését az egyes vizsgálatok hasonló volt nagy, ami arra utal, mérsékelten magas stabilitást a meta-elemzés eredményeit. Az XPD Lys751Gln polimorfizmus, amint a 3. ábrán látható rész, a leginkább befolyásoló egyetlen tanulmány a teljes összesített becslését úgy tűnt, hogy a tanulmány által végzett hosszú XD et al. [25], coincidently eltért HWE, az érzékenységi elemzés azonban azt jelezték, mérsékelten magas stabilitását az eredmények a tényt, hogy a legkülső régiók (95% CI, p-érték) volt 1,12 (0,85-1,48, p = 0,410) eltávolítása előtt e tanulmány és 0,98 (0,83-1,15, p = 0,781) eltávolítása után a tanulmány. Tekintettel a tanulmány [16] által végzett Huang WY és munkatársai. amely eltért HWE, a legkülső régiók (95% CI, p-érték) volt 1,12 (0,85-1,48, p = 0,410) eltávolítása előtt, hogy tanulmányi és 1,17 (0,87-1,58, p = 0,309) eltávolítása után a tanulmány az összes etnikai, ami nagy stabilitását az eredményeket. Hasonlóképpen, eltávolítása után a tanulmány [29] által végzett Engin AB et al., Szintén eltért HWE, az OR (95% CI, p-érték) lett 1,19 (0,91-1,57, p = 0,209), az összes etnikai, jelezve, nagy stabilitás az eredmények. Ha mind a három eltért-HWE tanulmány [16], [25], [29] eltávolították, az OR (95% CI, p-érték) lett 1,06 (0,88-1,28, p = 0,555), az összes etnikai, jelezve, mérsékelten nagy stabilitás az eredmények (a szemléltető ábrák kihagytuk hossza miatt a papír).

Asp312Asn polimorfizmus, amint a 3. ábrán látható B rész, a leginkább befolyásoló egyetlen tanulmány a teljes összesített becslését úgy tűnt, hogy a tanulmány szerint Chen Z et al. [28], az érzékenységi elemzés azonban azt jelezték, mérsékelten magas stabilitását az eredmények a tényt, hogy a legkülső régiók (95% CI, p-érték) volt 1,48 (1,12-1,97, p = 0,007) eltávolítása előtt, hogy tanulmányi és 1,32 (1,04-1,70, p = 0,025) eltávolítása után, hogy a tanulmány. Ha mind a három eltért-HWE tanulmány [17], [27], [30] eltávolították, az OR (95% CI, p-érték) lett 1,56 (1,05-2,33, p = 0,028), az összes etnikai, feltüntetve közepesen nagy stabilitást az eredmények (a szemléltető ábrák kihagytuk hossza miatt a papír). katalógusa

Összesített meta-analízis katalógusa

Összesített metaanalízisének XPD Lys751Gln polimorfizmus egyesület is végeztünk ázsiaiak között és kaukázusiak keresztül választék megjelenés ideje és száma a minta méretét. Amint a 4. ábrán látható része, a hajlamait felé szignifikáns összefüggést az XPD Lys751Gln polimorfizmus lehetett látni ázsiaiak között. A 4. ábrán a B. rész a hajlamait felé null egyesületek XPD Lys751Gln polimorfizmus lehet jegyezni között kaukázusiak időrendi sorrendben. Hasonló hajlamok lehetett megfigyelni Asp312Asn polimorfizmus a különböző etnikai populációk (ábra nem látható). Katalógusa

publikációs torzítás Elemzés katalógusa

Publikációs torzítás előzetesen megvizsgálta tölcsér parcellák minőségileg által becsült Begg és Egger tesztek mennyiségileg . Az XPD Lys751Gln polimorfizmus, annak tölcsér plot (5A ábra) azt mutatta, hogy képpont majdnem szimmetrikusan elosztott, túlnyomórészt a pszeudo 95% -os megbízhatósági határokat. P értékek 0,428 és 0,989 közé Begg-teszt és Egger-teszt, illetve burkolt nincs publikációs torzítás. A Asp312Asn polimorfizmus, annak tölcsér plot (5B ábra) azt mutatta, hogy képpont majdnem szimmetrikusan elosztott, túlnyomórészt a pszeudo 95% -os megbízhatósági határokat. P értékek 0,108 és 0,045 közé Begg-teszt és Egger-teszt, illetve burkolt nem vagy egy kicsit publikációs torzítás. Katalógusa

Vita katalógusa

A mi meta-analízis szignifikáns megállapításai nyilvánvalóan megjegyezte ázsiaiak, de nem a kaukázusi mind XPD Lys751Gln és XPD Asp312Asn polimorfizmusok. Szintén megállapításai alapján a halmozott metaelemzésekről a hajlamait felé szignifikáns összefüggést az ázsiaiak mind XPD Lys751Gln és XPD Asp312Asn polimorfizmusok lehetett nyilvánvalóan látható, amikor sorolva megjelenés ideje és a teljes minta méretét. XPD Gln751Gln (CC) és Asn312Asn (AA) genotípus tűnhet fogékonyabbak gyomorrák ázsiaiak. A meta-analízisek azt mutatják, hogy Gln751Gln (CC) és Asn312Asn (AA) genotípus lehet fontos biomarkerek a gyomorrák fogékonyság az ázsiaiak, a feltételezés, hogy tovább kell erősíteni a jövőben jól megtervezett vizsgálatban az ázsiai populációk. Szintén a különböző, sőt ellentétes kockázat egyesületek, és ha igen, a különböző etnikumok tovább kell aprólékosan vizsgálni, és újra megerősítette a jövőben. Katalógusa

XPD Asp312Asn SNP, bár I katalógusa ^{2 ( %) volt 19,2 és τ 2 volt 0,0354, amint a 4. táblázatban látható, elméletileg képviselő kevés vagy semmilyen heterogenitás; Gyakorlatilag, miután etnikai alcsoport-analízis az értékek I katalógusa 2 (%) és τ 2 lett 0,0 és 0,0000 ázsiaiak és 41,6 és 0,0587 a kaukázusiak, illetve további jelezte, hogy ténylegesen nem heterogenitás állt ázsiaiak között tanulmányok semmint a kaukázusi társaik. Tekintettel erre, úgy gondoljuk, hogy a rétegződés vagy alcsoport elemzések továbbra is szükség van a mi meta-analízis.}