PLoS ONE: Het effect van XPD /ERCC2 Polymorfismen op maagkanker Risk tussen verschillende etnische groepen: een systematische review en meta-analyse

De abstracte

Achtergrond

Potentiële xeroderma pigmentosum groep D (XPD), ook wel excisie reparatie cross-gratis-groep twee (ERCC2), Lys751Gln en Asp312Asn polymorfismen zijn betrokken bij de maag risico op kanker tussen de verschillende etnische groepen.

Methods

Ons doel was om het effect van XPD Lys751Gln en Asp312Asn polymorfismen op de gevoeligheid voor maagkanker tussen de verschillende etnische groepen te verkennen door middel van een systematische review en meta-analyse. Elke eerste instantie opgenomen artikel werd gescoord voor de kwaliteit van de beoordeling. Wenselijk data werden geëxtraheerd en in databases geregistreerd. 13 studies waren uiteindelijk in aanmerking voor de meta-analyse van Lys751Gln polymorfisme en 9 studies voor de meta-analyse van Asp312Asn polymorfisme. Wij keurden de meest waarschijnlijk geschikte genetische model (recessief model) voor zowel Lys751Gln en Asp312Asn polymorfismen. Potentiële bronnen van heterogeniteit werden gezocht via subgroep en gevoeligheidsanalyses, en publicatie vooroordelen werden geschat.

Resultaten

statistisch significante bevindingen waren blijkbaar opgemerkt in Aziaten, maar niet in Kaukasiërs voor zowel de XPD Lys751Gln en XPD Asp312Asn polymorfismen. Een statistisch significante bevinding kan worden gezien in noncardia-type maagkanker voor XPD Lys751Gln polymorfisme. Een statistisch significante bevinding kan ook worden gezien in hoge kwaliteit subgroep, kleine en matige steekproefgrootte subgroep, artikelen gepubliceerd na 2007, of PCR-RFLP genotypering subgroep XPD Asp312Asn polymorfisme.

Conclusies

Onze meta-analyse blijkt dat XPD Gln751Gln (CC) genotype en Asn312Asn (AA) genotype lijken meer vatbaar zijn voor maagkanker in Aziatische bevolking, maar niet in de Kaukasische populatie te zijn, wat suggereert dat de twee genotypen kunnen belangrijke biomarkers van maagkanker gevoeligheid voor de Aziatische bevolking, tot de veronderstelling dat moet verder worden bevestigd in goed opgezette studies tussen de verschillende etnische groepen. Gln751Gln (CC) genotype kan ook worden geassocieerd met noncardia-type maagkanker risico, dat ook moet worden bevestigd tussen de verschillende etnische groepen in de toekomst

Visum:. Xue H, Lu Y, B Lin, Chen J, Tang F, G Huang (2012) Het effect van XPD /ERCC2 Polymorfismen op maagkanker Risk tussen verschillende etnische groepen: een systematische review en meta-analyse. PLoS ONE 7 (9): e43431. doi: 10.1371 /journal.pone.0043431

Editor: Rui Medeiros, IPO, Inst Port Oncology, Portugal

Ontvangen: 5 april 2012; Aanvaard: 20 juli 2012; Gepubliceerd: 13 september 2012

Copyright: © Xue et al. Dit is een open-access artikel gedistribueerd onder de voorwaarden van de Creative Commons Attribution License, die onbeperkt gebruik, distributie en reproductie maakt in elk medium, op voorwaarde dat de oorspronkelijke auteur en de bron worden gecrediteerd

Financiering:. Dit werk werd gesteund door de National Natural Science Foundation of China (subsidies 30830038, 30970842 en 81071180); "973" Project (2012CB932604); New Drug Discovery Project (2012ZX09506-001-005); Key Project van Wetenschap en Technologie Commissie van Shanghai Gemeente (subsidies 10JC1410000); en de Shanghai vooraanstaande academische Discipline Project (subsidie ​​S30203). De financiers hadden geen rol in de studie design, het verzamelen van gegevens en analyse, besluit te publiceren, of de voorbereiding van het manuscript

Competing belangen:.. De auteurs hebben verklaard dat er geen tegenstrijdige belangen bestaan ​​

Introductie

Hoewel wereldwijd maagkanker incidentie is afgenomen, zijn sterfelijkheid gelederen nog steeds seconde [1]. In China, maagkanker vormt ook een van de meest dodelijke tumoren [2]. Zoals bekend, zijn infectieziekten, voeding, milieu- en genetische factoren betrokken bij maagkanker, maar de blootgestelde risicofactoren die uiteindelijk maagkanker te ontwikkelen omvat een ondergeschikte hoeveelheid [3], wat suggereert dat gastheer genetische gevoeligheid speelt een belangrijke rol in de maag kankerrisico tussen de verschillende etnische groepen. Dergelijke verschillende gevoeligheden kunnen worden verklaard, gedeeltelijk, door single nucleotide polymorphisms (SNPs) van gevoelige genen onder verschillende etnische groepen [4], [5]. Onze eerder gepubliceerde meta-analyse papieren zijn aanvullend bewijs geleverd voor een dergelijk etnisch gevoelig verschillen [5], [6].

Het is algemeen erkend dat DNA stabiel zijn cruciale fysiologische functies te voeren moet blijven, maar het is aanhoudend kwetsbaar voor verschillende endogene en /of exogene schade en aldus de vermoedelijke mutaties kunnen accumuleren en kanker kunnen optreden als gevolg van het beschadigde DNA. DNA herstelsysteem echter, speelt een cruciale rol bij de functie van normale cellen en integriteit van het genoom door de omkering van de beschadigde DNA [7]. Erfelijke functionele polymorfismen of mutaties geaccumuleerd DNA repair genen kan de ontvangende vermogen om het beschadigde DNA herstellen beïnvloeden en daarmee moduleren kankerrisico [8]. SNPs gemeenschappelijke DNA herstel genen geïdentificeerd [9] en aangetoond worden gekoppeld aan sporadische carcinogenese [10], [11].

Nucleotide excisie reparatie (NER), een van de voornaamste DNA repair pathways in mensen , kan verwijderen helix verstoren base laesies geproduceerd door ultraviolet licht (UV) en een reeks chemische middelen [12]. XPD wordt verondersteld om aan DNA afwikkelen tijdens NER en transcriptie omdat zij over enkelstrengs DNA-afhankelijke ATPase en 5'-3 'DNA helicase activiteiten [13], [14]. XPD (ERCC2) gen, gelegen op chromosoom 19q13.3, bestaat uit 23 exonen en de polymorfismen worden verondersteld om structurele veranderingen van NER-route en de invloed van kanker gevoeligheid veroorzaken. De meest onderzochte XPD polymorfismen in associaties met kanker gevoeligheid bestaan ​​uit een nonsynonymous A > C substitutie in exon 23 het veroorzaken van een lysine (Lys) naar glutamine (Gln) substitutie in codon 751 (Lys751Gln, rs1052559), een nonsynonymous G > Een substitutie in exon 10 leidt tot een asparaginezuur (Asp) aan asparagine (Asn) substitutie in codon 312 (Asp312Asn, rs1799793) en een synoniem C > a substitutie in exon 6 met behoud van het arginine (R) residu in codon 156 (Arg156Arg, rs238406) [15].

in 2005,
publiceerde de eerste studie die betrokken zijn bij XPD Lys751Gln polymorfisme in relatie tot maagkanker het risico [16] Huang WY et al.. Sindsdien hebben onderzoekers gemeld verenigingen van XPD Lys751Gln, Asp312Asn, en /of Arg156Arg met de gevoeligheid voor maagkanker tussen de verschillende etnische groepen, maar met gemengde of tegenstrijdige resultaten [17] - [30]. Er is slechts één gepubliceerde artikel over Arg156Arg polymorfisme met betrekking tot maagkanker risico [28]. Tot op heden zijn er drie relevante gepubliceerde meta-analyse papers gericht op XPD polymorfismen zijn [31] - [33]. Twee artikelen zijn voornamelijk bezig met de algehele kanker gevoeligheden in plaats van maagkanker gevoeligheid in de diepte [31], [32], waardoor minder informatie over de associatie met de maag risico op kanker. Nog belangrijker, deze drie meta-analyses [31] - [33] faalden de meest waarschijnlijke geschikte genesemodel nemen, en dus de echte waarden van de statistische resultaten kunnen worden aangetast

Bijgevolg teneinde. onze meta-analyse was om te verkennen, met behulp van de meest geschikte genetische model, het effect van XPD polymorfismen op de maag kankerrisico tussen verschillende etnische groepen en mogelijke bronnen van heterogeniteit te identificeren onder de in aanmerking komende studies.

Materialen en methoden

zoekstrategie

Een systematisch literatuuronderzoek werd verricht naar artikelen met betrekking tot XPD /ERCC2 SNPs geassocieerd met maag risico op kanker. De MEDLINE, EMBASE databases, Chinese National Knowledge Infrastructure (CNKI), Web of Science en BIOSIS databases gelijktijdig gebruikt met de combinatie van termen "XPD", "ERCC2", "DNA repair", "NER", "Lys751Gln" "Asp312Asn" of "Arg156Arg"; "gen"; "Polymorfisme", "variant" of "SNP"; en "maagkanker", "maagcarcinoom", of "maagkanker" tot en met december 2011. Het onderzoek werd uitgevoerd zonder enige beperking van de taal. De reikwijdte van geautomatiseerde literatuuronderzoek werd uitgebreid volgens de literatuurlijsten van artikelen opgehaald. De desbetreffende originele artikelen werden ook handmatig gezocht.

Study Selection

Onderzoek naar de associatie van XPD /ERCC2 SNPs (Lys751Gln, Asp312Asn, en /of Arg156Arg) met maag risico op kanker werden opgenomen indien de volgende voorwaarden is voldaan: (i) een studie beschreef de associatie van ten minste één van XPD /ERCC2 SNPs met maagkanker; (Ii) elke studie rapporteerde de nummers van beide regelaars en maagkanker cases; (Iii) de resultaten werden uitgedrukt als odds ratio (OR) met 95% betrouwbaarheidsintervallen (CI); en (iv) studies waren case-control of geneste case-control degenen.

methodologische kwaliteit Beoordeling

Om kwalitatief hoogwaardige studies te identificeren, we voornamelijk aangenomen vooraf gedefinieerde criteria voor Quality Beoordeling aanvankelijk door Thakkinstian voorgesteld et al
[34], aangepast door Camargo et al
[35], en verfijnd door Xue et al
[5], -... [7]. De criteria (te zien in tabel S1 online) te dekken geloofwaardigheid van de controles, de representativiteit van de gevallen, de consolidatie van maagkanker, genotypering onderzoek en vereniging assessment. Methodologische kwaliteit werd onafhankelijk beoordeeld door twee onderzoekers (Lin B en Lu Y). Meningsverschillen werden opgelost door middel van discussie. Scores variëren van nul de laagste naar de hoogste tien. Artikelen met de score lager dan 6,5 werden beschouwd als 'low-of-matige kwaliteit "die, terwijl die niet lager dan 6,5 werden beschouwd als" hoge kwaliteit "degenen.

Data Extraction

De volgende gegevens van elk artikel werden geëxtraheerd: auteurs, jaar van uitgave, land, etniciteit van de deelnemers (gecategoriseerd als blanken, Aziaten, etc.), studie ontwerp, de bron van de controles, het aantal controles en van de gevallen, genotyperingsmethode, de verdeling van leeftijd en geslacht, classificatie Lauren's (darm, diffuus, of gemengd), anatomische classificatie (cardia of non-cardia kanker), roken gewoonte, het drinken gewoonte en Helicobacter pylori
infectiestatus.

De gegevens werden geëxtraheerd en onafhankelijk van elkaar door twee onderzoekers (Lin B en Lu Y) die blind tijdschrift namen, instellingen of het fonds subsidies waren in twee databases geregistreerd. Enige discrepantie tussen deze twee onderzoekers werd opgelost door de onderzoeker (Xue H), die in de discussie deelgenomen met hen en maakte een uiteindelijke beslissing.

Statistische analyse

Alle statistische analyses werden uitgevoerd met behulp STATA statistische software (versie 10.1, STATA Corp, College Station, TX). Twee-zijdige P < 0,05 werden statistisch significant beschouwd. Hardy-Weinberg evenwicht (HWE) in de controlegroep werd opnieuw berekend in onze meta-analyse. De chi-kwadraat goedheid van fit werd gebruikt om afwijkingsproef van HWE (significant op het niveau van 0,05).

Odds ratio (OR) en 95% betrouwbaarheidsintervallen (95% BI) werden gebruikt om de sterkte van beoordelen associaties tussen XPD /ERCC2 SNPs en maag risico op kanker. OF _{1, OF 2, en OR 3 werden berekend voor genotypes CC versus AA, CA versus AA en CC versus CA voor XPD Lys751Gln polymorfisme; AA versus GG, GA versus GG en AA versus GA voor XPD Asp312Asn polymorfisme; AA versus CC, CA versus CC en AA versus CA voor XPD Arg156Arg polymorfisme, respectievelijk. De paarsgewijze verschillen werden gebruikt om de meest geschikte genetische model te bepalen. Als OR 1 = OR 3 ≠ 1 en OR 2 = 1, een recessief model wordt voorgesteld. Als OR 1 = OR 2 ≠ 1 en OR 3 = 1, een dominante model wordt geïmpliceerd. Als OR 2 = 1 /OF 3 ≠ 1 en OR 1 = 1, een complete overdominant model wordt voorgesteld. Als OR 1 > OF 2 > 1 en OR 1 > OF 3 > 1, of OR 1 < OF 2 < 1 en OR 1 < OF 3 < 1, een codominant model wordt aangegeven [34]. Neem XPD Lys751Gln polymorfisme als een voorbeeld om dit te illustreren. Als een dominant model werd aangegeven, werd de oorspronkelijke groep samengevouwen en de nieuwe groep C dragers (CC plus CA) vergeleken met AA genotype; als een recessief model werd gesuggereerd werd CC vergeleken met de groep AA plus CA; als een complete overdominant model werd geïmpliceerd, werd de groep van CC plus AA ten opzichte van CA; of als een co-dominante model insinueerde, CC vergeleken met CA en met AA resp.}

De Q statistiek werd gebruikt heterogeniteit beoordelen in studies in de meta-analyse omvatte. I-squared ( I
^{2) waarde, die variatie in OR wijten heterogeniteit werd vervolgens gebruikt om de mate waarin zij tussen studies heterogeniteit [36] kwantificeren. Volgens recent gepubliceerde Venetië criteria [37], " I
2 < 25% betekent geen heterogeniteit, I
2 = 25-50% vertegenwoordigt matige heterogeniteit, I
2 = 50-75% vertegenwoordigt grote heterogeniteit en I
2 > 75% vertegenwoordigt extreme heterogeniteit ". Between-studie variantie Tau-kwadraat (τ 2) waarde werd ook gebruikt om tussen-studie variantie te evalueren. Een vaste effecten model behulp Mantel-Haenszel (M-H) methode werd toegepast om de verzamelde UPR berekenen wanneer homogeniteit bestond op basis van Q-proef p-waarde niet minder dan 0.1.By contrast, een random-effects model, met behulp van DerSimonian en Laird methode (D + L), werd gebruikt als er heterogeniteit gebaseerd op Q-toets p-waarde van minder dan 0,1. Zelfs voor de homogeniteit onder-studies, werd D + L methode ook gebruikt. Meta-regressie-analyses en subgroep analyses werden gebruikt om te verkennen en te controleren potentiële bronnen van heterogeniteit tussen de studies. De betekenis van samengevoegde UPR werd getest door Z-test (P < 0,05 werd als significant beschouwd)}

gevoeligheidsanalyse uitgevoerd, waarbij de meta-analyse schattingen werden berekend na elk onderzoek wordt weggelaten elke beurt <.. br>

Tot slot, publicatiebias werd bepaald door het uitvoeren van de trechter percelen kwalitatief en geschat door Begg en testen Egger's kwantitatief.

Resultaten

Literature Search en Selection Study

na uitgebreid zoeken, werden in totaal 140 artikelen in het Engels en 7 in het Chinees opgehaald. In onze meta-analyse werden aanvankelijk geheel opgenomen studies 15 [16] - [30], die voldeden aan de inclusiecriteria. Die 15 studies waren voorlopig afgestemd op de meta-analyse van de associaties met maagkanker betrekking XPD SNPs, waaronder 13 studies betrokken XPD Lys751Gln polymorfisme [16] - betrokken [26], [28], [29], 9 studies XPD Asp312Asn polymorfisme [17] - [21], [23], [27], [28], [30], en slechts 1 studie betrokken XPD Arg156Arg polymorfisme [28]. 1 artikel [23] werd geindexeerd in het Engels en Chinees zoeken motoren

Traditioneel gesproken, elke studie die afweek van HWE moeten zijn verwijderd.; echter Minelli C et al. onlangs op gewezen dat de studies die lijken af ​​te wijken van HWE moeten worden onderzocht verder in plaats van alleen uitgesloten, tenzij er andere redenen om te twijfelen aan de kwaliteit van het onderzoek [38]. Tot op heden is nog onduidelijk of studies afgeweken HWE moeten worden opgenomen of uitgesloten uitvoeren meta-analyse. In onze meta-analyse, 3 betrokken studies XPD Lys751Gln polymorfisme [16], [25], [29] waren afgeweken HWE en 3 studies betrokken XPD Asp312Asn polymorfisme [17], [27], [30] werden ook afgeweken HWE; Aangezien echter het aantal deelnemers aan deze studies grote en aangezien gevoeligheidsanalyses worden uitgevoerd waren we uiteindelijk bleven deze studies in meta-analyse

Zo 13 studies [16] -. [26] , [28], [29] met een totaal van 6344 controles en 2750 gevallen XPD Lys751Gln polymorfisme en 9 studies [17] - [21], [23], [27], [28], [30] met 3429 controles en 1.715 gevallen voor XPD Asp312Asn polymorfisme waren uiteindelijk in aanmerking voor de meta-analyse van XPD polymorfismen. De bijbehorende eigenschappen werden gezien in Tabel 1 en Tabel 2. De stroomschema van literatuuronderzoek en studie selectie werd belicht in Figuur 1.

Algemeen Meta-analyse, meta-regressie Analyses en subgroep Analyses

Voor XPD Lys751Gln polymorfisme, OR _{1 (p-waarde), OR 2 (p-waarde) en OR 3 (p-waarde) was 1,22 (p = 0,266), 1,11 (p = 0,369) en 1,02 (p = 0,811), respectievelijk nauwelijks insinuerende een bepaald model effect van vermoedelijke vatbare allel C. Heterogeniteit-chi kwadraat was 29,83 (D. F. = 12), p-waarde was 0,003 en I
^{2 was 59,8%. Na meta-regressie-analyse met behulp van enkele covariaat (etniciteit bestaat uit blanken, Aziaten, of Turkse bevolking), p-waarden van coëfficiënt t waarde voor Aziaten, blanken, of Turkse bevolking waren 0,001, 0,139 en 0,585, respectievelijk; sterk aangeeft dat Aziaten enkele covariaat meestal de bron van heterogeniteit tussen de studies kunnen vormen. τ 2 voor Aziaten, blanken, of Turkse bevolking enkele covariate waren 0, 0,09178 en 0,1347, respectievelijk. Voor Aziaten enkele covariaat, τ 2 gedaald ,1233-0, wat aangeeft Aziaten enkele covariaat zou goed zijn voor 100% van de bron van heterogeniteit tussen de studies. Wanneer gestratificeerd naar etniciteit subgroepanalyse, OR 1 (p-waarde), OR 2 (p-waarde) en OR 3 (p-waarde) onder Aziatische bevolking waren 2,63 (p = 0,002), 1,14 ( p = 0,653) en 1,51 (p = 0,034), respectievelijk sterk wijst een recessief model effect van vermoedelijke gevoelige C-allel (OR 1 = OR 3 ≠ 1 en OR 2 = 1).}}

Voor XPD Asp312Asn polymorfisme, OR _{1 (p-waarde), OR 2 (p-waarde) en OR 3 (p-waarde) was 1,75 (p = 0,015), 1,15 (p = 0,549) en 1,47 (p = 0,003), respectievelijk sterk wijst op een recessief model effect van vermeende gevoelige a-allel (OR 1 = OR 3 ≠ 1 en OR 2 = 1) . Heterogeniteit-chi kwadraat was 9.91 (D. F. = 8), p-waarde was 0,272 en I
^{2 was 19,2%, wat aangeeft geen heterogeniteit tussen de studies. Na meta-regressie-analyse met behulp van enkele covariaat (etniciteit bestaat uit blanken of Aziaten), p-waarde van de coëfficiënt t waarde voor etniciteit enkele covariaat was 0,277, wat aangeeft dat etniciteit zou een van de bronnen van kleine heterogeniteit tussen de studies opleveren. τ 2 gedaald 0,0354-0,02075, met vermelding van etniciteit zou goed zijn voor 41,4% van de bron van de kleine heterogeniteit tussen de studies. Ook wanneer gestratificeerd naar etniciteit subgroepanalyse, OR 1 (p-waarde), OR 2 (p-waarde) en OR 3 (p-waarde) onder Aziatische bevolking waren 2,10 (p = 0,026), 1,22 (p = 0,574) en 1,80 (p = 0,008), respectievelijk, verder wijst op een recessief model effect van vermeende gevoelige a-allel (OR 1 = OR 3 ≠ 1 en OR 2 = 1 ).}}

bij elkaar genomen, werd een recessief erfelijke model uiteindelijk gekozen voor zowel de XPD Lys751Gln en XPD Asp312Asn polymorfismen in onze meta-analyse.

in onze meta-analyse van de beschikbare gegevens waren gelaagd, in het licht van de etnische deelnemers, in blanken, Aziaten, en de Turkse bevolking. In figuur 2, werden statistisch significante bevindingen genoteerd in Aziaten, maar niet in Kaukasiërs of Turkse bevolking (zowel XPD Lys751Gln en XPD Asp312Asn polymorphisms). De gepoolde OR's (95% CI, p-waarde) was 2,41 (1,69-3,43, p = 0,000), 0,98 (0,82-1,17, p = 0,803) en 0,97 (0,33-2,82, p = 0,954) in Aziaten, blanken, en Turkse bevolking (XPD Lys751Gln polymorfisme in deel A) of 1,77 (1,19-2,63, p = 0,005) en 1,31 (0,86-1,99, p = 0,211) bij Aziaten en blanken (XPD Asp312Asn polymorfisme in deel B), resp. Zoals voor XPD Lys751Gln polymorfisme, P-waarden van heterogeniteit Q-statistiek bij blanken, Aziaten, en de Turkse bevolking waren 0,802, 0,701 en 0,045; I
^{2 waren 0,0%, 0,0% en 75,1%; en τ 2 waren 0,0000, 0,0000 en 0,4489, respectievelijk, tonen geen heterogeniteit in blanken en Aziaten, maar extreme heterogeniteit binnen de Turkse populatie (Tabel 3). Zoals voor XPD Asp312Asn polymorfisme, P-waarden van heterogeniteit Q-statistiek bij blanken en Aziaten waren 0,180 en 0,470; I
2 waren 41,6% en 0,0%; andτ 2 waren 0,0587 en 0,0000, respectievelijk, tonen geen heterogeniteit binnen Aziaten, maar matige heterogeniteit binnen blanken (Tabel 4).}

Zoals getoond in Tabel 3 en Tabel 4, specifieke gegevens voor XPD Lys751Gln en XPD Asp312Asn polymorfismen werden gestratificeerd, respectievelijk, op basis van de steekproefgrootte, in twee subgroepen: grote steekproef (het totale aantal controles en gevallen niet minder dan 500) en kleine-en-matige monster (het totale aantal controles en gevallen minder dan 500) subgroepen. Geen statistisch significante bevinding werd genoteerd in zowel kleine en matige sample subgroep of grote steekproef tegenhanger voor XPD Lys751Gln polymorfisme, gezien het feit dat de gepoolde OR's (95% CI, p-waarde) was 0,96 (0,61-1,51, p = 0,858) voor de eerste en 1,17 (0,84-1,64, p = 0,351) voor de laatste, respectievelijk; echter een statistisch significante bevinding werd opgemerkt in kleine en gematigde subgroep monster maar niet in grote steekproef tegenhanger van Asp312Asn polymorfisme, omdat de gepoolde OR's (95% CI, p waarde) was 1,74 (1,18-2,56, p = 0,005) voor de eerste en 1,35 (0,82-2,21, p = 0,239) voor de tweede resp.

de gegevens werden ook gestratificeerd volgens de kwaliteitsbeoordeling scores, tot hoogwaardige (scores liefst 6,5) en low-and-matige kwaliteit (scoort minder dan 6,5) subgroepen. Zoals voor XPD Lys751Gln polymorfisme, werd geen statistisch significante bevinding getuige in zowel hoge kwaliteit subgroep of lage-en-matige kwaliteit tegenhanger, gezien het feit dat de samengevoegde ultraperifere regio's (95% CI, p-waarde) was 1,20 (0,91-1,60, p = 0,199) voor de eerste en 0,61 (0,34-1,11, p = 0,104) voor het laatste. Wanneer etniciteit sub-stratificatie werd uitgevoerd voor hoogwaardige subgroep, werd een statistisch significante bevinding veel ogenschijnlijk getuige bij Aziaten maar geen statistisch significante bevinding werd gemeld bij blanken omdat de gepoolde UPR (95% CI, p waarde) was 2,54 (1,77-3,65, p = 0,000) voor het voormalige en 0,98 (0,82-1,17, p = 0,803) voor het laatste, respectievelijk. Zoals voor Asp312Asn polymorfisme, werd een statistisch significante bevinding getuige in hoge kwaliteit subgroep, maar niet in lage-en-matige kwaliteit tegenhanger, gezien het feit dat de gepoolde OR's (95% CI, p-waarde) was 1,56 (1,05-2,33, p = 0,028) voor de eerste en 1,42 (0,85-2,40, p = 0,184) voor het laatste. Ook wanneer etniciteit sub-stratificatie werd uitgevoerd voor hoogwaardige subgroep een statistisch significante bevinding was blijkbaar veel meegemaakt bij Aziaten maar geen statistisch significante bevinding werd gemeld bij blanken omdat de gepoolde UPR (95% CI, p-waarde) 2,37 waren (1.29- 4,36, p = 0,005) voor het voormalige en 1,31 (0,86-1,99, p = 0,211) voor het laatste, respectievelijk.

de gegevens waren bovendien gelaagde, in lijn met de publicatie de tijd, in de eerdere publicatie subgroep ( artikels gepubliceerd vóór of in 2007) en de latere publicatie subgroep (artikels gepubliceerd na 2007). Zoals voor XPD Lys751Gln polymorfisme, geen statistisch significante bevindingen werden waargenomen op grond van het feit dat de gepoolde OR's (95% CI, p-waarde) was 0,89 (0,66-1,19, p = 0,428) in de voormalige en 1,23 (0,84-1,81, p = 0,285) in de tweede, respectievelijk. Zoals voor Asp312Asn polymorfisme, werd een statistisch significante bevinding waargenomen in de latere publicatie subgroep, maar niet in de eerdere publicatie subgroep met het argument dat de gepoolde OR's (95% CI, p-waarde) was 1,46 (1,02-2,09, p = 0,041) in de eerste en 1,61 (0,89-2,92, p = 0,115) in de tweede, respectievelijk.

bij maagkanker werd ingedeeld in niet-cardia (en distale) en cardia subtypes, werd een statistisch significante bevinding gevonden bij niet -cardia type, maar niet onder de soort cardia voor XPD Lys751Gln polymorfisme op grond van het feit dat de samengevoegde ultraperifere regio's (95% CI, p-waarde) was 2,03 (1,16-3,54, p = 0,013) tussen het type non-cardia en 0,88 (0,66-1,18, p = 0,403) tussen cardia type. Zoals voor Asp312Asn polymorfisme, werd geen statistisch significante bevinding waargenomen bij cardia type op de grond dat de gepoolde OR (95% CI, p-waarde) was 0,89 (0,56-1,43, p = 0,642), maar OR (95% CI, p-waarde ) met betrekking tot het type non-cardia kon niet worden berekend, omdat slechts één studie [21] duidelijk vermeld het aantal genotypen van non-cardia type.

Op het gebied van pathologie, maagkanker kunnen worden ingedeeld in de darm, diffuus, of gemengd subtypen, maar slechts 1 studie [19] duidelijk geregeld en hebben het aantal genotypen van diffuse subtype kanker; dus pathologische subtype stratificatie niet kon worden gedaan in onze meta-analyse.

Factoren die van invloed, zoals Helicobacter pylori
infectie of rookgedrag kon niet in onze meta-analyse, omdat benodigde relevante gegevens van worden geanalyseerd ten minste twee studies konden niet toegankelijk in meta-analyse.

als genotyperingstechnieken werden onderzocht geen statistisch significante bevinding werd vermeld bij elke genotypering techniek subgroep XPD Lys751Gln polymorfisme omdat gepoolde OR's (95% CI, p waarde) was 0,94 (0,68-1,29, p = 0,701) en 1,67 (0,68-4,14, p = 0,265) in RFLP en TagMan subgroepen, respectievelijk; echter een statistisch significante bevinding werd opgemerkt in RFLP genotypering subgroep, maar niet in directe sequencing subgroep Asp312Asn polymorfisme omdat gepoolde OR's (95% CI, p-waarde) was 1,90 (1,09-3,31, p = 0,023) en 1,24 (0,70-2,20, p = 0,450), respectievelijk.

Sensitivity Analysis

meta-analyses herhaaldelijk uitgevoerd bij ieder afzonderlijk onderzoek was verwijderd. De resultaten gaven aan dat random-effecten Schattingen voor en na de verwijdering van elk onderzoek waren vergelijkbaar als geheel, wat suggereert matig hoge stabiliteit van de resultaten meta-analyse. Voor XPD Lys751Gln polymorfisme, zoals getoond in Figuur 3, deel A, de meest beïnvloeden één studie van het gepoolde schattingen leek de studie van Lang XD et al. [25], toevallig afgeweken HWE de gevoeligheidsanalyse echter aangegeven matig hoge stabiliteit van de resultaten uit de feiten dat de UPR (95% BI, p-waarde) was 1,12 (0,85-1,48, p = 0,410) voor de verwijdering van die studie en 0,98 (0,83-1,15, p = 0,781) na de verwijdering van die studie. Gezien de studie [16] uitgevoerd door Huang et al WY. dat wordt afgeweken van HWE, de ultraperifere regio's (95% BI, p-waarde) was 1,12 (0,85-1,48, p = 0,410) voor de verwijdering van die studie en 1,17 (0,87-1,58, p = 0,309) na de verwijdering van deze studie voor de all etniciteit, met vermelding van hoge stabiliteit van de resultaten. Ook na het verwijderen van de studie [29] uitgevoerd door Engin AB et al., Ook afgeweken van HWE, de OR (95% BI, p-waarde) werd 1,19 (0,91-1,57, p = 0,209) voor de all etniciteit, aangeeft hoge stabiliteit van de resultaten. Als alle drie afgeweken-HWE studies [16], [25], [29] werden verwijderd, de OR (95% BI, p-waarde) werd 1,06 (0,88-1,28, p = 0,555) voor de all etniciteit, matig met vermelding hoge stabiliteit van de resultaten (het illustreren figuren zijn weggelaten vanwege de lengte van het papier).

voor Asp312Asn polymorfisme, zie figuur 3 deel B, de meest invloedrijke één studie van het gepoolde schattingen leek de studie van Chen Z et al. [28], de gevoeligheidsanalyse echter aangegeven matig hoge stabiliteit van de resultaten uit het feit dat de ultraperifere regio's (95% BI, p-waarde) was 1,48 (1,12-1,97, p = 0,007) voor de verwijdering van die studie en 1,32 (1,04-1,70, p = 0,025) na de verwijdering van die studie. Als alle drie afgeweken-HWE studies [17], [27], [30] werden verwijderd, de OR (95% BI, p-waarde) werd 1,56 (1,05-2,33, p = 0,028) voor de all etniciteit, ook met vermelding van matig hoge stabiliteit van de resultaten (het illustreren figuren zijn weggelaten vanwege de lengte van het papier).

Cumulatieve meta-analyse

Cumulatieve meta-analyses van XPD Lys751Gln polymorfisme vereniging werden uitgevoerd bij Aziaten en Kaukasiërs via het assortiment van publicatie tijd en het totale aantal steekproefomvang. Zoals getoond in Figuur 4, deel A, kan de neiging tot significante associaties voor XPD Lys751Gln polymorfisme worden gezien bij Aziaten. In figuur 4 deel B van de neigingen in de richting van nul verenigingen voor XPD Lys751Gln polymorfisme kan worden opgemerkt tussen blanken in chronologische volgorde. Soortgelijke neigingen kon worden waargenomen voor Asp312Asn polymorfisme tussen de verschillende etnische bevolkingsgroepen (figuren niet getoond).

Publication Bias Analyse

Publication vooringenomenheid werd voorlopig onderzocht door trechter percelen kwalitatief en geschat door Begg en testen Egger's kwantitatief . Voor XPD Lys751Gln polymorfisme, de trechter plot (Figuur 5A) blijkt dat puntjes bijna symmetrisch verdeeld, voornamelijk binnen pseudo 95% betrouwbaarheidsgrenzen. P-waarden waren 0,428 en 0,989 in de test Begg's en test Egger's, respectievelijk, insinueren geen bekendmaking vooringenomenheid. Voor Asp312Asn polymorfisme, de trechter plot (Figuur 5B) liet zien dat puntjes bijna symmetrisch verdeeld, voornamelijk binnen pseudo 95% betrouwbaarheidsgrenzen. P-waarden waren 0,108 en 0,045 in de test Begg's en test Egger's, respectievelijk, insinueert geen of een kleine publicatie vooringenomenheid.

Discussie

In onze meta-analyse statistisch significante bevindingen waren blijkbaar opgemerkt in Aziaten, maar niet in Kaukasiërs voor zowel de XPD Lys751Gln en XPD Asp312Asn polymorfismen. Ook op basis van de bevindingen van de cumulatieve meta-analyses, kon de neigingen in de richting van significante associaties in Aziaten voor zowel XPD Lys751Gln en XPD Asp312Asn polymorfismen uiteraard worden gezien wanneer naargelang hun publicatie tijd en de totale grootte monster. XPD Gln751Gln (CC) en Asn312Asn (AA) genotypes lijken meer vatbaar zijn voor maagkanker in Aziaten zijn. Onze meta-analyses suggereren dat Gln751Gln (CC) en Asn312Asn (AA) genotypes kunnen belangrijke biomarkers van maagkanker vatbaarheid voor Aziaten, de aanname dat verder moet worden bevestigd in de toekomst goed opgezette studies in Aziatische bevolkingsgroepen. Ook de verschillende of zelfs tegenstrijdige risico verenigingen, zo ja, tussen de verschillende etnische groepen moet verder worden zorgvuldig onderzocht en bevestigd in de toekomst.

Voor XPD Asp312Asn SNP, hoewel I
^{2 ( %) was 19,2 en τ 2 was 0,0354, zoals getoond in Tabel 4, die in theorie weinig of geen heterogeniteit; praktisch, na etniciteit subgroepanalyse, de waarden van de I
2 (%) en τ 2 werd 0,0 en 0,0000 voor Aziaten en 41,6 en 0,0587 voor Kaukasiërs, respectievelijk verder aangeeft dat eigenlijk geen heterogeniteit bestond onder Aziaten studies eerder dan onder blanken tegenhangers. Gezien dit, denken we dat stratificatie of subgroep analyses nog steeds nodig zijn in onze meta-analyse.}

• PLoS ONE: Aangeboren immuniteit en Non-Hodgkin lymfoom (NHL) gerelateerde genen in een geneste case-control studie voor maagkanker Risk
• PLoS ONE: Het openbaren van het moleculaire mechanisme van maagkanker Marker annexine A4 in Cancer Cell Proliferation behulp Exon Arrays