Stomach Health > Mo. Gesondheet >  > Gastric Cancer > Gastric Cancer

PLOS NËMMEN: genetesch waat op CagA-proposéiert Molekülle an Gene-Ëmwelt Zesummespill mat Phytoestrogens: Eng Putative Risk Faktor fir Gastric Cancer

Wat VerfÜgung

jeeweileger VerfÜgung

ob Genen ze diskutéieren, datt gerannt CagA- proposéiert Molekülle ( SRC VerfÜgung, PTPN11 VerfÜgung, CRK VerfÜgung, CRKL VerfÜgung, CSK VerfÜgung, c-begéint
a GRB2 VerfÜgung) sinn mat gastric Kriibs Risiko verbonnen an ob eng Interaktioun tëschent dësen Genen an phytoestrogens änneren Risiko gastric Kriibs. VerfÜgung

Method VerfÜgung

an der Entdeckung Phas, 137 Kandidat SNPs zu siwen Genen sech zu 76 Tëschefall gastric Kriibs Fäll an 322 reagéiert Kontrollen vun der koreanesch Multi-Center Cancer Kohort analyséiert. Fënnef bedeitendst SNPs zu dräi Genen ( SRC VerfÜgung, c-begéint VerfÜgung a CRK VerfÜgung) waren an 386 Fäll an 348 Kontrolle vun der Extensioun Phase du-bewäert. Chance nennen (Örs) fir Risiko gastric Kriibs multiplizéiert sech fir Alter ugepasst, Fëmmen, H. pylori VerfÜgung seropositivity an CagA Deformatioun komm. Zesummegefaasst Örs am Ganzen Etude Bevëlkerung (462 Fäll an 670 Kontrollen) benotzt pooled- an meta-Analyse presentéiert. Plasma Konzentratioune vun phytoestrogens (genistein, daidzein, equol an enterolactone) waren mat der Zäit-geléist fluoroimmunoassay gemooss. VerfÜgung

Resultater VerfÜgung

SRC VerfÜgung rs6122566, rs6124914, c -MET VerfÜgung rs41739, an CRK VerfÜgung rs7208768 zougedréckt a wesentleche genetesch Effekter fir gastric zu Kriibs souwuel d'hinzeginn an meta-Analyse ouni heterogeneity (hinzeginn oDER = 3,96 [95% CI 2.05-7.65], 1,24 [95 % CI = 1.01-1.53], 1.19 [95% CI = 1.01-1.41], an 1,37 [95% CI = 1.15-1.62], respektiv; meta oDER = 4,59 [95% CI 2.74-7.70], 1,36 [95% CI = 1.09-1.70], 1,20 [95% CI = 1.00-1.44], a 1.32 [95% CI = 1.10-1.57], bzw.). Risiko allele vun CRK VerfÜgung rs7208768 haten eng wiesentlech méi Risiko fir gastric Kriibs bei niddereg phytoestrogen Niveauen ( p Interaktioun VerfÜgung &Si besteet; 0,05). VerfÜgung

Konklusiounen VerfÜgung

eis Conclusiounen hindeit datt SRC VerfÜgung, c-begéint VerfÜgung a CRK VerfÜgung eng Schlësselroll an gastric carcinogenesis Leeschtung vun modulating CagA Signal transductions an Interaktioun tëscht CRK
Gentherapie an phytoestrogens gastric Kriibs Risiko änneren VerfÜgung

Fro:. Yang JJ, Cho LY, Ko KP, Shin a, Ma néirens, Choi BY, et al. (2012) genetesch waat op CagA-proposéiert Molekülle an Gene-Ëmwelt Zesummespill mat Phytoestrogens: Eng Putative Risk Faktor fir Gastric Cancer. PLoS NËMMEN 7 (2): e31020. Doi: 10.1371 /journal.pone.0031020 VerfÜgung

Redakter: Deodutta Roy, Florida International University, Vereenegt Staate vun Amerika VerfÜgung

Arnaque: 30. November 2011; Akzeptéiert: 29. Dezember 2011; Publizéiert: 24. Februar 2012 zu

Copyright: © 2012 Yang et al. Dëst ass eng oppen-Zougang Artikel ënnert de Bedingunge vun der Lizenz BY Creative Commons verdeelt, déi bereet benotzen Genehmegungen, Distributioun, an Reproduktioun vun all mëttelgrouss, gëtt d'Original Auteur an d'Quell Kaiser sinn VerfÜgung

Funding:. Dës Etude vum Ministère finanzéiert d plangen fir Cancer Control, Gesondheetsministère an Wuelergoen, Republik Korea (0520140), an der Grondakommes Research schafft (BRL) Programm duerch d'National Research Foundation vun Korea vun; war vun Subventiounen aus der National R &ënnerstëtzt Educatioun, Wëssenschaft a Technology (2011-0001564). D'funders hu keng Roll am Etude Design, Daten Kollektioun an Analyse, Décisioun, oder Virbereedung vun der mëttelalterlech Handschrëft ze publizéieren VerfÜgung

Wettsträit Interessen:.. D'Auteuren hunn deklaréiert, datt keng Competitioun Interessen existéieren VerfÜgung

Aféierung VerfÜgung

Helicobacter pylori VerfÜgung ( H. pylori VerfÜgung), eng Grupp sin mënschlech gastric carcinogen vun der Internationaler Agence fir Fuerschung op Cancer (IARC) [1], ass de bäschte Risk Faktor vun der gastric Kriibs Entwécklung, an unhalend H. pylori VerfÜgung Wonn ass den éischte Schrëtt a Richtung gastric carcinogenesis [1] - [3]. An trotz ville Beweiser datt H. pylori VerfÜgung eng wichteg Roll bei gastric carcinogenesis spillt, nëmmen e klengen Deel vum Personal Leit entwéckelen gastric Kriibs. Dëst beinhalt déi aner Faktoren am pathogenic Mechanismus vun H Équipe. pylori VerfÜgung kann fir gastric Kriibs eenzelne waat ännert. Eis virdrun Studien bewisen H. pylori VerfÜgung Wonn selwer war net mat der gastric Kriibs Risiko verbonnen mä speziell positive CagA H. pylori VerfÜgung Wonn vill méi Risiko fir gastric Kriibs vun 3.57-fantastesch [4], [5]. VerfÜgung

Cytotoxin-verbonne Gentherapie A (CagA), eng immunodominant FAQ secreted vun H. pylori VerfÜgung, schéngt eng vun den pathogenic verbidden Faktore ze ginn [6] - [8]. No Droberoderin H. pylori VerfÜgung an gastric epithelial Zellen, Akten CagA als eng grouss carcinogenic an virulent Komponent duerch Signal transduction Passerelle mi CagA. Déi éischt Etapp fänkt mat der Interaktioun tëscht CagA an diversen Proteinen wéi SRC, SHP2, CRK, CRKL, an CSK der phosphorylation an c-kennegeléiert an GRB2 ouni phosphorylation [9] - [12]. Tyrosine phosphorylated CagA vum SRC Famill kinases openee mat SHP2 tyrosine phosphatase (encoded vun der PTPN11 VerfÜgung oncogene), CRK, CRKL an CSK an induces Zell Effekt, dissociation a veruerteelt ugeschloss Kriibs Entwécklung [8], [12] - [15]. Ausserdeem, Net-phosphorylated CagA openee mat c-kennegeléiert an GRB2 déi dorënner oncogenic Äntwert ënnerstëtzt Zell Prolifératioun an morphological Ännerungen wéi hummingbird Équipe [8], [16] - [19]. Dëst CagA br an hir bewosst Interaktioun mat deenen Proteinen kann en entscheedende Schrëtt an domat zu gastric carcinogenesis ginn [9] -. [12] VerfÜgung

bewosst Verfall vun der CagA positive H. pylori VerfÜgung pathogenic Mechanismus schéngt verschidde waat gastric Kriibs ënnert H ze erklären. Pylori VerfÜgung Krankheet Persounen. Zanter bewosst Funktiounen kënne vun hirem Provider Genen regulariséiert ginn, genetesch Varianten un der CagA proposéiert Molekülle Zesummenhang kann de Schlëssel fir eenzel gastric Kriibs waat ginn. Baséiert op der putative genetesch Differenzen, Hypothes mir dass Genen CagA-proposéiert Proteinen déi gerannt Risiko fir gastric Kriibs änneren kann. Desweideren, do hu mer op phytoestrogens wéi en Effekt geännert an d'transduction Prozess CagA Signal. Etuden hu bericht, dass phytoestrogens mat anti-demagogesch, anti-bakteriell an Anti-oxidant Eegeschafte inhibit kann H. pylori VerfÜgung Aktivitéit an gastric Kriibs Zell Wuesstem an Prolifératioun [20] - [22]. Besonnesch, genistein, eent vun phytoestrogens an phosphotyrosine kinase inhibitors, ass Rapport en effektive blocker fir CagA phosphorylation ginn [23]. VerfÜgung

der hypotheses ze diskutéieren, eng zwee-Etapp genetesch Analyse datt op Genen do déi direkt gerannt CagA-verbindlech Molekülle, SRC VerfÜgung, PTPN11 VerfÜgung, CRK VerfÜgung, CRKL VerfÜgung, CSK VerfÜgung, c- erfëllt VerfÜgung a GRB2 VerfÜgung, war gehaal, dorënner: 1) d'Entdeckung Phase datt opgefouert an eenzeg Nukleotid schiefgang (SNPs) mat engem groussen genetesch Veräin op gastric Kriibs identifizéiert; 2) d'Extensioun Phase, datt s-analyséiert déi bedeitendst SNPs zu der Entdeckung Phase. Ausserdeem, an engem Sous-Analyse, évaluéiert mir der Gentherapie-Ëmwelt Interaktioun fir festzestellen, ob phytoestrogen Niveauen der Associatioun tëscht der Gentherapie schiefgang änneren déi direkt CagA-verbindlech Molekülle an Risiko vun gastric Kriibs gerannt. VerfÜgung

Method VerfÜgung

IFLA- breakpoint VerfÜgung

d'Etude Ëmwelt- sech duerch de Finanzpolitiker Kritik Verwaltungsrot vun Seoul National University Hospital (H-0110-084-002 fir d'KMCC studéieren an C-0910-049-297 guttgeheescht fir de Moment gemaach Fall -control studéieren) a vun de Finanzpolitiker Kritik Verwaltungsrot vun Hanyang University Hospital (2003-4). Desweideren, ënnerschriwwen all Participanten eng Awëllegung Form virun der Studien am Gaang. VerfÜgung

Sécuritéit Populatioun VerfÜgung

Zwee-Phase genetesch association Etüde war. D'gemaach case-Kontroll Etude Bevëlkerung war vun der Koreanesch Multi-Center Cancer Kohort (KMCC) rekrutéiert. Detailléiert Informatiounen iwwer d'KMCC ass soss beschriwwen [24]. Kuerz, goufen Participanten aus véier urban an ländlech Géigenden (Haman, Chungju, Uljin, an Youngil) an Korea agestallt. Informatiounen iwwert eenzel Elementer och allgemeng Liewensstil an Ëmwelt aussetzt war mat standardiséierte Interview-baséiert gesammelt questionnaires. Blutt an Spot Pipi Echantillon waren och gesammelt. All Mataarbechter huet passively gefollegt-up duerch Kapellen Rekord linkages un d'national Kriibs Etat, d'national Doud Certificat, an d'Krankekeess medezinesch Rekorder. Déi passiv Suivi Methode vun der KMCC hunn héich efficace a komplett ze ginn [25] gemellt ginn. VerfÜgung

Am Dezember 2002, am Ganzen 136 Fäll gastric Kriibs definéiert no der International statistique Course vu Krankheete Verbonnen gesondheetlech Problemer 10. Versioun (ICD-10, C16) waren an der Entdeckung Phase identifizéiert. Ënnert hinnen, 84 Fäll Fäll ausser virun Rekrutement festgestallte (n = 36) an ouni Bluttprouwen (n = 16) huet sech am Ufank fir genotyping ausgewielt. Véier Kriibs-gratis Kontrollen (n = 336) sech un all gastric Kriibs Fall vun Heefegkeet Dicht probéieren reagéiert baséiert op Alter (± 5 Joer), Geschlecht, z'évitéieren, an Aschreiwung Joer. Aacht Fäll an 14 Kontrollen waren wéinst aarmséileg genotyping Leeschtung ausgeschloss, an dofir, 76 Fäll an 322 Kontrolle waren an der Entdeckung Phase abegraff. VerfÜgung

An der Extensioun Phas, 388 gastric Kriibs case-Kontroll baut ausgewielt sech wéi follegt : (N = 84) an ouni Bluttprouwen 1) 334 op 31 Dezember identifizéiert 136 Fäll och gastric Fäll Kriibs, 2002 waren 31 vun der KMCC ascertained am Dezember 2008 d'Fäll vun der Entdeckung Phase analyséiert ausgeschloss (N = 51), 199 gastric Kriibs Fäll goufen 1:1 zu Kontrolle reagéiert no Alter (± 5 Joer), Geschlecht, an Aschreiwung Joer. 2) 189 nei gastric Kriibs Fäll um Chungnam University Hospital an Hanyang University GURI Hospital mat Awëllegung festgestallte sech aus Mäerz rekrutéiert 2002 bis September 2006 Bluttprouwen sech bei der Zäit vun Diagnos oder virun gastric Kriibs Agrëff gesammelt. Zousätzlech 189 Communautéit-baséiert Kontrollen vun Alter (± 5 Joer), Sex an Aschreiwung Joer reagéiert huet (vun 2001 bis 2005) huet sech zoufälleg aus der KMCC ausgewielt. Vun der 388 Mätscher gastric Kriibs case-Kontroll, zwee Fäll a 40 Kontrollen waren wéinst aarmséileg genotyping a genuch Prouf éliminéiert an endlech, 386 Fäll an 348 Kontrolle waren an der Extensioun Phase analyséiert. VerfÜgung

Kandidatelänner Genen an SNP Auswiel VerfÜgung

an der CagA Signal transduction Passerelle, CagA Photo'en direkt zu siwen Proteinen datt zu mi Prozesser Féierung. Provider Genen der siwen Proteinen Zeechesaatz sech wéi follegt ausgewielt: v-Crk sarcoma Virus CT10 oncogene homolog ( CRK VerfÜgung); v-Crk sarcoma Virus CT10 oncogene homolog (Vullegripp) -like ( CRKL VerfÜgung); c-Src tyrosine kinase ( CSK VerfÜgung); Wuesstem Faktor receptor-gebonnen FAQ 2 ( GRB2 VerfÜgung); Erfëllt proto-oncogene ( c-begéint VerfÜgung); nuklear Faktor vun ageschalt T-Zellen, FAQ tyrosine phosphatase, Net-receptor Typ 11 ( PTPN11 VerfÜgung) Zeechesaatz SHP2 tyrosine phosphatase an v-Src sarcoma (Schmidt-Ruppin A-2) Haren oncogene homolog ( . SRC VerfÜgung) VerfÜgung

Kandidatelänner SNPs sech no der dräi Critèren ausgewielt: Rapport SNPs 1) zu virdrun Studien eng méiglech funktionell Relevanz fir Kriibs ze hunn; 2) minor allele Frequenz (MAF) > 0,05 an asiatesch Bevëlkerung am ëffentlechen Datebanke wéi SNP500Cancer oder déi international HapMap Projet mat dbSNP IDen (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp); a soll 3) MAF > 0,05 op Japanesch (JET) an d'international HapMap Projet. Endlech, 137 SNPs mat engem Design stoung = 1,1 an r 2 > 0,8 genotyped waren der grousser SNPs fir gastric Kriibs Risiko ze Ecran. 108 SNPs sinn an der intron Regioun läit; 24 SNPs sinn an de Promoteur Regioun läit (Reliefsailen Regioun oder UTR); fënnef SNPs sinn an der coding Regioun wellkomm. VerfÜgung

Genotyping VerfÜgung

An der Entdeckung Phas, 137 SNPs zu siwen Kandidat Genen Zeechesaatz CagA proposéiert Proteinen genotyped goufen. No Konzentratioune vun Frankräich DNA fir all Etude Sujete vun engem spectrophotometer (NanoDrop ND-1000, NanoDrop Technologies) Moossen, war genotyping benotzt GoldenGate ™ assay (Illumina®, San Diego, CA, USA) gesuergt. Fir Qualitéitskontroll an deeër Zollformalitéiten-Sujet concordance Tarif, 52 zweete Echantillon sech zoufälleg an der genotyping zappen verdeelt suergen. Concordance Tariffer fir all assays sech méi wéi 99%. Vun der 137 SNPs, goufen 21 SNPs wéinst Echec vun genotyping (4 SNPs), SNP Opruff Taux &Si besteet nëmmen aus; 90% (7 SNPs), HWE &Si besteet; 0.0001 (1 SNPs) an MAF ≤0.05 (9 SNPs). Aacht Fäll an 14 Kontrollen waren och wéinst genotyping Opruff Taux &Si besteet ausgeschloss; 90%. Endlech, 116 SNPs zu siwen Genen (genotyping Taux vun 99,6%) vun 76 Fäll an 322 Kontrolle waren analyséiert VerfÜgung

An der Extensioun Phas, fënnef SNPs mat enger Matière p- VerfÜgung Wäert &Si besteet. 0,02, Markéierung SNPs oder héich Design Fändelen (rs6122566 an rs6124914 zu SRC VerfÜgung; rs41739 an rs41737 zu c-begéint VerfÜgung; rs7208768 zu CRK VerfÜgung) an der Entdeckung Analyse identifizéiert mat der Illumina VeraCode GoldenGate Assay mat BeadXpress laut den Hiersteller d'Protokoll (Illumina®, USA) sech genotyped [26]. Fir d'Zouverlässegkeet vun der genotyping Methode vun der zwou Phasë suergen, goufen 188 Echantillon zweemol vun all Method genotyped. D'concordance Taux war > 98,4%. Zwee Fäll a 40 Kontrolle mat genuch DNA (n = 15) oder genotyping Opruff Taux &Si besteet; 90% (n = 27) sech ausgeschloss. Endlech, fënnef SNPs zu dräi Genen (genotyping Taux vun 99,6%) waren an 386 Fäll an 348 Kontrollen analyséiert. VerfÜgung

H. pylori VerfÜgung Wonn an CagA seropositivity VerfÜgung

H. pylori VerfÜgung Wonn an CagA seropositivity benotzt immunoblot assay, Helico Blot 2.1 ™ (MP Biomedicals Asien Pazifik, Singapur) bewäert. Helico Blot 2.1 ™ Trikoten goufen gemellt héich Empfindlechkeet a Spezifizitéit ze hunn (fir Sensibilitéit, 99% identically zu souwuel; fir Spezifizitéit, 98% an 90%, respektiv). [27] VerfÜgung

Miessunge vun Phytoestrogen biomarkers

Plasma Konzentratioune vun véier phytoestrogen biomarkers dass 1 waren) isoflavones: genistein, daidzein, an equol (daidzein metabolite) an 2) lignan: enterolactone gemooss goufen mat Zäit-geléist fluoroimmunoassay Trikoten (Labmaster, Finnland). No gratis phytoestrogen biomarkers sech aus 200 μL vu Plasma Prouf ofgebaut, de VICTOR3 ™ 1420 Multilabel blëtzaarteg gemooss Zäit-geléist fluorescence (Perkin-Elmer). Detailléiert Miessung Methode fir phytoestrogen biomarkers sinn soss [28] beschriwwen. (> 200 μL) vun der total Etude Bevëlkerung, Plasma Konzentratioune vun de véier biomarkers sech an 406 Fäll an 417 Kontrolle mat genuch Plasma Volumen gemooss. VerfÜgung

statistique Analyse VerfÜgung

déi elementar Eegenschaften ze vergläichen tëschent gastric Kriibs Fäll a Kontrollen, déi Chi-Feld Test an Student heeschen Chinchilla VerfÜgung Test huet gehaal. P VerfÜgung -values ​​fir Ënnerscheed zu Undeel fir Geschlecht, Alter, H. pylori VerfÜgung Wonn, CagA an VacA seropositivity, Zigarette fëmmen, Alkohol drénken, an gastritis Geschicht tëscht Fäll a Kontrollen huet alles. VerfÜgung

Hardy-Weinberg Gläichgewiicht (HWE) an d'Kontroll Grupp bewäert gouf mat de chi- Metercarré Test oder Fisher d'exakt Test mat e präventive Niveau vun HWE &Si besteet; 0,0001. An der Entdeckung Phas, minimum global p VerfÜgung -values ​​( p VerfÜgung &Si besteet; 0,05) an der Bewäertung Verhältnis Test (LRT) mat 1 Ofschloss vun der Fräiheet (DF) an der additive Modell an LRT mat 2 DF an der genotypic Modell bedeitendst SNPs déieren sech berechent. Benotzt dräi genetesch Modeller, additive, recessive an dominant Modeller, war d'Associatioun tëscht der gewielter SNPs an gastric Kriibs Risiko analyséiert. Permutated p VerfÜgung -values ​​sech duerch 100.000 permutation Tester zu der eenzeg SNP Analyse geschat. Fir spurious Associatiounen mat falschen positive Resultater vermeiden, déi korrigéiert permutated p VerfÜgung -values ​​op der Bedingung vun Multiple SNPs an de falschen Entdeckung Tarif (FDR) mat engem Benjamini-Hochberg Language berechnen sech [29]. Gastric Kriibs Risiko war als Chance nennen geschat (Örs) an 95% Vertraue Intervalle (Direktiven ugeet) benotzt Fra Logistikzenter Réckgang Modell fir Risiko Faktoren ugepasst datt Alter waren, Fëmmen Status (jee vs. VerfÜgung ni), H. pylori VerfÜgung Wonn (positiv vs. VerfÜgung negativ) an CagA seropositivity (positiv vs. VerfÜgung negativ). Zousätzlech war haplotype Analyse fir Genen standing vill verbonne SNPs aus individuell SNP Analyse mat Haploview 4,1 Software (www.broad.mit.edu/mpg/haploview/). VerfÜgung

An der Extensioun Phas mat, déi bedeitendst SNPs zu der Entdeckung Phase identifizéiert goufen du-bewäert. Baséiert op der additive oder recessive Modeller, war gastric Kriibs Risiko als Örs an 95% Well ugeholl fir déi selwecht covariates benotzt Fra Logistikzenter Réckgang Modell verwisen ugepasst. Fir d'Resultater vun der Entdeckung WikiCommons an der Extensioun Phasen, pooled- an meta-Analyse huet gehaal. Benotzt fix Effekt Modell, zesummegefaasst Örs an 95% Well sech berechnen. Och, heterogeneity ganze Studie war vun der Cochran Q Statistiken bewäert [30]. VerfÜgung

Ausschöpfung Analyse vun Varianz an Leit (ANCOVA) mam Alter, Status fëmmen (jee vs. VerfÜgung ni), H. pylori VerfÜgung Wonn (positiv vs. VerfÜgung negativ) an CagA seropositivity (positiv vs. VerfÜgung negativ) als potentiell Gefor Facteure fir gastric Kriibs, d'Mëttel vun der phytoestrogen uweist Niveau tëscht Fäll an Kontrollen waren Verglach. Stratified Analyse vun héich a nidderegen Niveau vun phytoestrogen biomarkers (genistein, daidzein, equol an enterolactone) wou de präventive Niveau vun der Spline Analyse sech décidéiert gouf mat senger Fra Logistikzenter Réckgang Modeller gehaal. Zesummespill Effekter tëscht der Tip SNPs an phytoestrogen biomarkers sech och als Örs berechnen an 95% Well fir Alter ugepasst, Status fëmmen (jee vs. VerfÜgung ni), H. pylori VerfÜgung Wonn (positiv vs. VerfÜgung negativ) an CagA seropositivity (positiv vs. VerfÜgung negativ). VerfÜgung

All statistesch Analyse gemaach goufen benotzt SAS Software Versioun 9.2 ( SAS Institut, Cary, North Carolina), an PLINK Software Versioun 1.07 (http://pngu.mgh.harvard.edu/purcell/plink) [31]. Meta-Analyse huet gehaal benotzt StataLanguage Versioun 10 (StataLanguage, College Station, Suerge). VerfÜgung

Resultater VerfÜgung

Et war keen groussen Ënnerscheed tëscht Fäll a Kontrollen no Geschlecht, H. pylori VerfÜgung Wonn, CagA /VacA seropositivity, Fëmmen /drénken Status an gastric oppent Geschicht vun der Entdeckung an Extensioun Phasen (p > 0,05). CagA /VacA seropositivity an den Undeel vum Stroum Fëmmerten sech vill méi héich ënnert gastric Kriibs Fäll vun der hinzeginn Donnéeën ( p VerfÜgung = 0,03, p VerfÜgung &Si besteet; 0,01, p VerfÜgung = 0,02, respektiv) (Table S1). VerfÜgung

vun de 116 SNPs an der siwen Kandidat Genen Zeechesaatz CagA Proteinen analyséiert an d'Entdeckung Phas, 22 SNPs zu dräi Genen proposéiert, SRC VerfÜgung, c-begéint VerfÜgung, an CRK VerfÜgung, waren däitlech mat gastric Kriibs ( p VerfÜgung -LRT &si besteet; 0,05) assoziéiert. SRC VerfÜgung rs6122566 vill méi Risiko fir gastric Kriibs an der recessive Modeller (ODER = 4,90, [95% CI 1.19-14.2]). Dräizéng SNPs datt rs41739 waren, rs16945, rs41738, rs6566, rs10435378, rs41737, rs2023748, rs41736, rs41735, rs6951311, rs183642, rs2237717 an rs38859 zu c-begéint VerfÜgung Gentherapie zougedréckt e wesentleche Gentherapie-Portioun Effet vun der linear Trend Tester ( p VerfÜgung &Si besteet; 0,05). CRK VerfÜgung rs7208768 haten eng liicht bedeitendst Gentherapie-Portioun Effekt. 100.000 permutation Tester zu der eenzeg SNP Analyse zougedréckt SRC VerfÜgung rs6122566, c-begéint VerfÜgung rs41739 a CRK VerfÜgung rs7208768 mat den Tip permutated p VerfÜgung - Wäert vun all Gentherapie ( p VerfÜgung permutation = 0,00284, p VerfÜgung permutation = 0,00989, p VerfÜgung permutation = 0,01392, bzw.). Den Agankssteiersaz Bedeitung vun der korrigéiert permutated p VerfÜgung -value fir observéiert gouf SRC VerfÜgung rs6122566 ( p VerfÜgung = 0.0918) mee all FDR p VerfÜgung -values zu all genetesch Modeller sech net wichteg ( p VerfÜgung > 0,2). (Table S2) VerfÜgung

Haplotype Bausteng vun der LD Komplott (Dorënner S1) bestëmmt goufen. Déi gréisst Spär gouf mat déi bedeitendst SNPs dorënner rs41739, rs6566 gebaut, an rs41738, mä den Omnibus p VerfÜgung -value war net wichteg ( p VerfÜgung > 0,05). Véier Bleck definéiert, déi vun SRC VerfÜgung an eng Spär definéiert, déi vun CRK VerfÜgung rauszesichen weisen statistesch Bedeitung vun der Omnibus Test. D'Resultater vun der haplotype Analyse net präsent Informatiounen iwwer eenzel SNP Resultater (Donnéeën net gewisen). VerfÜgung

An der Extensioun Phas, zwee SNPs, rs6122566 an rs6124914, vun SRC VerfÜgung Gentherapie an rs7208768 zu CRK VerfÜgung nach vill mat enger méi Risiko fir gastric Kriibs verbonne (ODER = 4,01, [95% CI: 1.62-9.96]; ODER = 1,30, [95% CI: 1.00-1.70]; ODER = 1,33, [95% CI: 1.08-1.64], bzw.). Associatiounen tëscht der SNPs zu c-begéint VerfÜgung Gentherapie (rs41739 an rs41737) a Gefor gastric Kriibs huet attenuated. An der kombinéiert Analyse, datt d'Entdeckung an Extensioun Phasen, de Risiko Estimatioun vun abegraff SRC VerfÜgung rs6122566 an der recessive Modell war vill mat gastric Kriibs verbonne souwuel an der hinzeginn an meta-Analyse (ODER = 3,96, [95% CI: 2.05-7.65]; ODER = 4,59, [95% CI: 2.74-7.70], bzw.). Desweideren, SRC VerfÜgung rs6124914, c-begéint VerfÜgung rs41739 a CRK VerfÜgung rs7208768 zougedréckt a wesentleche Gentherapie-Portioun Effekter fir gastric Kriibs zu souwuel analyséiert. Et war keen heterogeneity ganze Analysë (Cochran Q Test, p VerfÜgung > 0,05). (Table S3) VerfÜgung

Vun engem Total vun 823 Punkten (406 Fäll an 417 Kontrollen) déi gemooss goufen de Plasma Niveau vun de véier phytoestrogen biomarkers, de globale Konzentratioune vun genistein, daidzein an enterolactone zu Fäll goufen däitlech méi niddreg wéi déi vun der Kontrollen (genistein 167,6 nmol /L zu Fäll vs. 200,2 nmol /L an Kontrollen VerfÜgung , p VerfÜgung = 0,0004; daidzein 91,4 nmol /L zu Fäll vs 131,6 nmol /L an Kontrollen VerfÜgung, p VerfÜgung &Si besteet;. 0,0001; enterolactone 51,0 nmol /L an Fäll vs VerfÜgung 77,7 nmol /L an Kontrollen, p VerfÜgung &Si besteet;. 0.0001). Allgemeng Plasma Konzentratioune vun equol, engem daidzein metabolite, goufen am Fäll manner mä net statistesch relevant (50.3 nmol /L fir Fäll vs VerfÜgung 62,2 nmol /L fir Kontrollen;. p VerfÜgung = 0.0977) . An stratified Analyse no phytoestrogen biomarkers, e wesentleche Gentherapie-Ëmwelt Interaktioun war vun CRK VerfÜgung observéiert. Risiko allele vun CRK VerfÜgung rs7208768 haten eng wiesentlech méi Risiko fir gastric Kriibs bei niddereg phytoestrogen Niveauen. Speziell, war d'A allele vun rs7208768 mat engem gréisseren Risiko vun gastric Kriibs verbonne um niddereg genistein, daidzein, equol an enterolactone a statistesch relevant (ODER = 1,91, [95% CI: 1.44-2.52] um niddereg genistein; ODER = 2,09, [95% CI: 1.46-3.01] um niddereg daidzein; ODER = 1,87, [95% CI: 1.26-2.78] um niddereg equol; ODER = 1,77, [95% CI: 1.10-2.85] um niddereg enterolactone). D' p VerfÜgung -interaction war bedeitendst ( p VerfÜgung = 0,0001, p VerfÜgung = 0,0013, p VerfÜgung = 0,0147, p VerfÜgung = 0,0404, bzw.) (Table S4). VerfÜgung

wann zousätzlech stratified Analysë och eng Interaktioun tëscht CagA seropositivity an all Gentherapie Effekt fir gastric Kriibs Risiko, Interaktioune net relevant waren an keng vun den dräi Genen z'entdecken gehaal huet, SRC VerfÜgung, c-begéint VerfÜgung a CRK VerfÜgung (Donnéeën net gewisen). VerfÜgung

Diskussioun VerfÜgung

CagA-secreting H. pylori VerfÜgung Wonn schéngt eng wichteg Roll an gastric carcinogenesis via mi CagA Signal transduction Passerelle ze spillen. CagA Photo'en Ufank bis siwen FAQ Komponente aberrant bewosst Äntwerte aktivéieren, datt d'Entwécklung vun gastric Kriibs underlie. Zanter Funktioun vun der FAQ kann duerch hir Provider Genen regulariséiert ginn, Genen datt CagA proposéiert Molekülle gerannt kann een Risiko fir gastric Kriibs ze beaarbechten. Fir dëst Hypothes diskutéieren, genotyped mir 137 SNPs zu siwen Kandidat Genen a bewisen, dass genetesch Varianten vun SRC VerfÜgung (rs6122566 an rs6124914), c-begéint VerfÜgung (rs41739) an CRK
(rs7208768) sech mat gastric Kriibs Risiko vill verbonnen. Ervirgestrach, en interaktiven Effet vun CRK VerfÜgung genetesch polymorphism, rs7208768, a véier phytoestrogen biomarkers, genistein, daidzein, equol an enterolactone op Risiko gastric Kriibs analyséiert goufen. VerfÜgung

SRC, eng Net-receptor FAQ tyrosine kinase (TkLanguage), schéngen essentiell gastric carcinogenesis gin. Eemol gastric epithelial Zellen heijen, awer CagA tyrosine phosphorylation vum SRC Famill kinases [8], [12], [18]. D'tyrosine phosphorylation vun CagA ass en integralen Schrëtt am mi bewosst sécher Mechanismus bestëmmend. Well e puer CagA Molekülle wéi SHP-2 proposéiert, CRK an CSK si just gebass mat phosphorylated CagA dodran, kann SRC méi wichteg ginn an beaflossen Wéinst senger bewosst Funktiounen an Pinguin Entwécklung vun gastric Kriibs. Zousätzlech huet SRC gemellt gouf eng wichteg Roll an entholl Werdegang ze spillen a Kriibs Entwécklung an Metastasen [32] Mediate. Bewosst Aktivitéit vum SRC ebenfalls vun de Provider Gentherapie an eis Resultater verännert gin dass SRC VerfÜgung rs6122566 an rs6124914 kann Risiko modifiers zu gastric carcinogenesis ginn. zu SRC genetesch Variatioune datt de bewosst Muecht an gastric epithelial Zellen Afloss verbonne si mat gastric Kriibs Risiko. VerfÜgung

Trotz der attenuated Bedeitung vun der Erweiderung Analyse, c-begéint VerfÜgung déi ass Zifferen mat HGFR VerfÜgung (hepatocyte Wuesstem Faktor receptor) en onofhängege Risiko Gentherapie fir gastric Kriibs kann. Villen virdrun Studie confirméiert, dass c-begéint, ee vun de receptor TKs, war mat verschiddene Mënsch carcinoma dorënner gastric Kriibs [17], verbonne invasiv entholl Wuesstem, Zell Invasioun, a veruerteelt, a amplification an /oder overexpression vun c-begéint ënnerstëtzt [ ,,,0],33] - [36]. Am Sënn vun c-sech bewosst Mechanismus, spillt CagA eng Roll als en adapter FAQ, Gab, receptor TkLanguage sécher vun engem Stärekoup vun afgerappt Komponente um ageschalt receptor kontroléieren wéi Grb2, PLCγ, an SHP-2 [37] zu Mediate, [38]. Vum System den Gab adapter FAQ Wäerr, CagA kéint Manque Prolifératioun a veruerteelt vun gastric epitherial Zellen [39] stimuléieren. Am Moment studéieren, eng polymorphism vun c-begéint VerfÜgung Gentherapie (rs41739) mat Risiko gastric Kriibs vill verbonne war an engem méiglech genetesch Rief Faktor op gastric Kriibs. Konsequent mat der bewosst Wichtegkeet an Funktioun, c-begéint VerfÜgung Gentherapie schéngt de Risiko fir gastric carcinogenesis duerch CagA Signal transduction Passerelle. VerfÜgung

CRK adapter FAQ ze beaarbechten déi splicing isoforms huet, CRK-ech ( SH2-SH3) an CRK-II (SH2-SH3-SH3), Photo'en ze TKs an Kontrollen Transkriptiouns an cytoskeletal Regruppementer modulating bewosst Aktivitéiten [40]. Och, integréiert dëser adapter FAQ verschidde bewosst Signaler an sengen dysregulation ass fir de Mënsch carcinoma verbonne [41]. Zesummespill tëschent CRK an phosphorylated CagA gouf confirméiert enger biologescher Viraussetzung ze sinn, datt zu morphological Klimawandel féiert, Zell Effekt an Dereguléierung vun Zell-Zell Haftung an der gastric epithelium [14]. Puer Studien hunn overexpression vun CRK uginn dass mat verschiddenen Zorte vu mënschlechen Cancers dorënner haett, gastric an Colon Kriibs [42] verbonnen ass, [43]. Eis Conclusiounen ënnerstëtzen och d'genetesch Potential vun CRK VerfÜgung rs7208768 op d'Entwécklung vun gastric Kriibs an zwou genetesch a bewosst Magnitude vun CRK. VerfÜgung

Méi Spannen, bedeitendst Interaktiounen tëschent den CRK
genetesch polymorphism a véier phytoestrogen biomarkers, genistein, daidzein, equol an enterolactone, gastric Kriibs Risiko geännert. Studien uginn Schutzpatrounin Auswierkunge vun phytoestrogens op gastric Kriibs [20], [28], a virun allem, genistein der Erk Signal transduction CASCADE inhibited entschlof vun H. pylori VerfÜgung Wonn eng Roll als tyrosine kinase inhibitor gespillt [44]. Betruecht CRK déi grouss Offloss Protein vun Erk Aktivéierung ass, déi geféierlech genetesch Varianten vun CRK VerfÜgung der Erk sécher ze aktivéieren kann duerch phytoestrogens blockéiert ginn, an d'Entwécklung vun gastric Kriibs Mediate. VerfÜgung

SRC, c-kennegeléiert an CRK sinn och an d'FAQ TKs Équipe datt e verschiddenste multigene Famill as dat eng Rei vun afgerappt bewosst Prozesser bewosst Signal transduction Passerelle Kontrollen mediating a spillt bedeitend Roll an der Entwécklung vu verschidde Krankheete Krankheeten [45], [46]. TKs sinn och als oncogenes Équipe an mënschlechen malignancies bekannt. SRC gehéiert zu engem Net-receptor TkLanguage an c-begéint ass eng receptor TkLanguage, iwwerdeems CRK en adapter FAQ ass deen zu TkLanguage-phosphorylated Proteinen Photo'en a stäerkt den Haaptgrond Proteinen am Signal transduction Passerelle [41]. Dës dräi Molekülle encoded vun SRC VerfÜgung, c-begéint VerfÜgung, an CRK VerfÜgung Genen kann onofhängeg Zell dat, Haftung, Doud an morphological Ännerunge vun transmiting Zell Signaler induce Zesummenhang mat hir TkLanguage Aktivitéiten egal dÉxistenz CagA. Futhermore, Genen ze TkLanguage Aktioun Zesummenhang Agrément eng wichteg Roll wéi enger Rief Faktor fir gastric Kriibs que genistein missen, datt en tyrosine kinase inhibitor ass kann gastric Kriibs Risiko reduzéieren [28]. Dëst bedeit datt genetesch susceptibilities vun SRC VerfÜgung, c-begéint VerfÜgung, an CRK VerfÜgung zu gastric carcinogenesis soll als onofhängegen Risiko Faktoren behandelt ginn, datt de bewosst Signal transduction zu TkLanguage änneren onselbstänneg Manéieren well uninfected Persoune mat CagA secreting H. Pylori VerfÜgung kann fir gastric Kriibs Risiko ginn je op eenzelne genetesch Varianten vun den dräi Genen. VerfÜgung

wann PTPN11 VerfÜgung, CRKL VerfÜgung, CSK
a GRB2 VerfÜgung keng wichteg Associatioun mat gastric Kriibs an de Grëff ze studéieren, hir genetesch Effekter präsentéieren soll net weisen huet. Um bewosst Niveau, sinn dës Molekülle vill ze aberrant Effekter ze dinn, datt gastric carcinogenesis underlie [12]. Als ee vun de Mënscherechter proto-oncogenes, PTPN11 VerfÜgung mat SHP2 cytoplasmic tyrosine phosphatase encodes a kann aberrant hyperactivation vun der Erk sécher [47] induce. Eng Etude huet confirméiert och, datt e PTPN11 VerfÜgung genetesch Passe de Risiko fir gastric atrophy a Kriibs ënnert CagA positive H fräi. pylori VerfÜgung Krankheet Leit [48]. An der CagA Signal transduction Passerelle, Wierker CRKL ganz ähnlech ze CRK; CSK féiert eng Aktivitéit vum SRC Famill kinase an CagA-SHP2 sécher; an GRB2 Akten als ausgeléist RAS /MEK /Erk Passerelle [14], [18], [49] ze aktivéieren. Weider Studie mat enger grousser Zuel vun gastric Kriibs Fäll an indirekten Deckung vun genetesch schiefgang an dës Genen si hëllt. VerfÜgung

Gastric carcinogenesis entschlof vun CagA positive H. Pylori VerfÜgung Wonn kann aus eiser Etude Resultater an review vun bewosst Mechanismen [16], [18], [47] (Dorënner S2) infered ginn. Eemol CagA zu gastric ephithelial Zellen heijen ass, Initiaten SRC CagA phosphorylation datt mat CRK adapter FAQ a SHP2 openee der Erk Aktivatioun ze förderen.

Other Languages