PLoS ONE: genetinis polinkis į CagA-sistema sąveiką molekulių ir genų-aplinkos Sąveika su fitoestrogenų: dėl tariamų rizikos veiksnys skrandžio vėžio

Anotacija

Tikslai

įvertinti, ar genai, kurios koduoja CagA-bendrauja molekules ( SRC
PTPN11
CRK
CRKL
CSK
c-MET parsisiųsti ir Grb2
) yra susiję su skrandžio vėžio rizika ir ar tarp šių genų sąveikos ir fitoestrogenų keisti skrandžio vėžio riziką.

metodai

atradimas etape 137 kandidatės SNP septyniose genų buvo analizuojami 76 incidentas skrandžio vėžio atvejų ir 322 kontrolinės grupės iš Korėjos "Multi-Center vėžio kohortos , Penki svarbūs SNP trijuose genuose ( SRC
C-MET parsisiųsti ir CRK
) buvo pakartotinai įvertinta 386 atvejų ir 348 kontrolės pratęsimo etapą. Kursai koeficientai (PVA) skrandžio vėžio rizika buvo įvertinta reguliuojamas pagal amžių, rūkymas, H. pylori
serologinis pozityvumas ir CagA padermės pozityvumo. Apibendrinti atokiausių visos tirtos populiacijos (462 atvejai ir 670 Controls ") buvo pristatyti naudojant pooled- ir meta-analizė. Koncentracija plazmoje fitoestrogenų (genisteinas, daidzeinas, ekvolio ir enterolactone) buvo matuojamas naudojant laiko išspręsta fluoroimmunoassay.

Rezultatai

SRC
rs6122566, rs6124914 C -MET
rs41739, ir CRK
rs7208768 parodė reikšmingą genetinius pasekmes skrandžio vėžio tiek Suminė ir metaanalizė be heterogeniškumas (sukaupiami arba = 3.96 [95% PI 2.05-7.65], 1,24 [95 % PI = 1,01-1,53], 1,19 [95% PI = 1,01-1,41], ir 1,37 [95% PI = 1,15-1,62], atitinkamai; meta arba = 4.59 [95% PI 2,74-7,70], 1,36 [95% PI = 1,09-1,70], 1,20 [95% PI = 1,00-1,44], ir 1,32 [95% PI = 1,10-1,57], atitinkamai). Rizikos alelis, CRK
rs7208768 turėjo žymiai padidėjusi rizika skrandžio vėžio žemoje fitoestrogenų lygių ( P sąveika
< 0,05).

Išvados

Mūsų rezultatai rodo, kad SRC
c-MET parsisiųsti ir CRK
vaidina svarbų vaidmenį skrandžio kancerogenezėje keičiant CagA signalo transductions ir sąveiką tarp CRK
genų ir fitoestrogenų keisti skrandžio vėžio riziką

nurodomoji dalis:. Jonas JJ, CHO LY Ko KP Shin A Ma SH Choi PAGAL et al. (2012), genetinį imlumą ant CagA-sistema sąveiką molekulių ir genų-aplinkos Sąveika su fitoestrogenų: dėl tariamų rizikos veiksnys skrandžio vėžio. PLoS ONE 7 (2): e31020. Doi: 10,1371 /journal.pone.0031020

redaktorius: Deodutta Roy Floridos tarptautinis universitetas, Jungtinės Amerikos Valstijos

Įstojo: Lapkričio 30, 2011 m Priėmė: Gruodžio 29, 2011 m Paskelbta: Vasario 24, 2012

Visos teisės saugomos: © 2012 Yang et al., Tai atviros prieigos straipsnis platinama pagal Creative Commons Attribution licencija, kuri leidžia nevaržomai naudotis, paskirstymo ir dauginimąsi bet kokioje laikmenoje sąlygomis, su sąlyga, kad pirmasis autorius ir šaltinis įskaitomos

Finansavimas:. Šis tyrimas parėmė suteikimo iš nacionalinio R & d vėžio kontrolės programa, sveikatos apsaugos ministerija ir gerovės, Korėjos Respublika (0520140) ir Pagrindinio tyrimų laboratorija (BRL) programos per Nacionalinę mokslinių tyrimų fondo Korėjos finansuojamą ministerijos Švietimas, mokslas ir technologijos (2.011-0.001.564). Į finansuotojai neturėjo vaidmenį studijų dizainas, duomenų rinkimo ir analizės, sprendimų skelbti, ar ruošiant rankraštį

konkuruojančių interesų.. Autoriai pareiškė, kad nėra konkuruojantys interesai egzistuoja

Įvadas

Helicobacter pylori
( h. pylori
), grupė man žmogaus skrandžio kancerogenas Tarptautinės agentūros vėžio tyrimų (IARC) [1], yra stipriausia rizikos veiksnys skrandžio vėžio išsivystymo, ir nuolat h. pylori
infekcija yra pirmas žingsnis link skrandžio kancerogenezėje [1] - [3]. Nepaisant daugybės įrodymų, kad H. pylori
vaidina svarbų vaidmenį skrandžio kancerogenezėje tik nedidelė dalis užsikrėtusių žmonių plėtoti skrandžio vėžiu. Tai reiškia, kad kiti veiksniai dalyvauja patogeniškumo mechanizmas, H. pylori
gali keisti individualų jautrumą skrandžio vėžio. Mūsų ankstesni tyrimai parodė, H. Pati pylori
infekcija nebuvo susijęs su skrandžio vėžio rizika, tačiau specialiai CagA teigiamas h. pylori
infekcija labai padidėjusia rizika, skrandžio vėžio 3.57 kartus [4], [5].

citotoksinas susijęs genas A (CagA), kuri imunodominuojantis baltymų išsiskiria H. pylori
, atrodo, yra vienas iš patogeninių keičiančius veiksnius [6] - [8]. Po užkrėsti H. pylori
į skrandžio epitelinių ląstelių, CagA veikia kaip pagrindinis kancerogeninio ir virusinės komponento per nuoseklus CagA signalo perdavimo keliu. Pirmasis žingsnis prasideda nuo CagA ir įvairių baltymų, pavyzdžiui, SRC, SHP2, CRK, CRKL ir CSK sąveikos po fosforilinimo ir c-met ir Grb2 be fosforilinimo [9] - [12]. Tirozinas fosforilinarai CagA iki SRC šeimos kinazės sąveikauja su SHP2 tirozino fosfatazės (kurį koduoja PTPN11
onkogeno), CRK, CRKL ir CSK ir skatina ląstelių sklaida, disociacija ir mirtingumą prijungtas prie vėžio išsivystymo [8], [12] - [15]. Be to, ne fosforilinarai CagA sąveikauja su c-met ir Grb2 kuris skatina onkogeninio atsakymą įskaitant ląstelių proliferaciją ir morfologinių pokyčių, pavyzdžiui, kolibrių formavimo [8], [16] - [19]. Tai CagA translokacijos ir jo ląstelinė sąveika su šių baltymų gali būti labai svarbi pradėti žingsnis skrandžio kancerogenezėje [9] - [12].

Mobilieji pakeitimas į CagA teigiamas H. pylori
patogeniškumo mechanizmas, atrodo, paaiškinti skirtingą jautrumo skrandžio vėžio tarp H. Pylori
užkrėstus asmenis. Nuo mobilieji funkcijos gali būti reglamentuojama jų šeimininko genus, genetiniai variantai, susiję su CagA sąveikaujančių molekulių gali būti individualiam skrandžio vėžio jautrumą raktas. Remiantis tariamų genetinių skirtumų, mes iškėlė hipotezę, kad genų koduoja CagA-bendrauja baltymų gali pakeisti riziką skrandžio vėžio. Be to, mes sutelktas į fitoestrogenų kaip efektas modifikatorius į CagA signalo perdavimo procesą. Tyrimai pranešė, kad fitoestrogenų su priešuždegiminių, antibakterinių ir antioksidacinių savybių gali slopinti H. pylori
veikla ir skrandžio vėžio ląstelės augimo ir proliferacija [20] - [22]. Ypač, genisteinas, vienas iš fitoestrogenų ir fosfotirozino kinazės inhibitorių, Pranešama, kad būtų veiksminga blokavimo CagA fosforilinimo [23].

Jei vertinti hipotezes, dviejų pakopų genetinė analizė, kad orientuota į genų, kurie koduoja tiesiogiai CagA privalomos molekules SRC
PTPN11
CRK
CRKL
CSK
C- RER parsisiųsti ir Grb2
, buvo atliktas, kad įtraukti: 1) atradimas etapas, kad patikrintu ir nustatė vieno nukleotido polimorfizmas (SNP) su dideliu genetinės asociacijos skrandžio vėžio; 2) išplėtimas etapas, kad iš naujo išanalizavo svarbiausius SNP atradimo stadijoje. Be to, į pietus nuo analizės, mes įvertino genų-aplinkos sąveiką, siekiant nustatyti, ar fitoestrogenų lygiai keisti tarp genų polimorfizmas asociacija, kuri tiesiogiai koduoti CagA privalomos molekules ir rizikos skrandžio vėžio.

Metodai

etika pareiškimas

tyrimų protokolus pagal institucinius ekspertizės valdyba Seulo nacionalinio universiteto ligoninė (H-0110-084-002 už KMCC tyrimo ir C-0910-049-297 buvo patvirtintas einamųjų lizdinė atveju -control tyrimas) ir institucinių peržiūros valdybos Hanyang universitetinės ligoninės (2003-4). Be to, visi dalyviai pasirašė informuoto sutikimo formą prieš įvesdami tyrimus.

Studijų gyventojų

Dviejų fazių genetinis asociacija tyrimas buvo atliktas. Lizdinė atvejo ir kontrolės tyrimas gyventojai buvo įdarbinti iš Korėjos "Multi-Center vėžio kohortos (KMCC). Detali informacija apie KMCC yra aprašyti kitur [24]. Trumpai tariant, dalyviai buvo įdarbinti iš keturių miesto ir kaimo vietovėse (Hamanas, Chungju, Uljin ir Youngil) Korėja. Informacija apie individualių savybių, įskaitant bendro gyvenimo būdo ir aplinkos poveikio buvo surinkta naudojant standartizuotus interviu pagrindu klausimynus. Kraujo ir vietoje šlapimo mėginiai taip pat buvo renkami. Visi dalyviai buvo pasyviai stebimi iki kompiuterinėmis įrašų sąsajų su nacionaliniu vėžio registro, nacionalinės mirties liudijimo, ir sveikatos draudimu medicininius įrašus. Buvo pranešta, kad pasyvūs tolesnių metodai KMCC būti labai efektyvus ir išsamus [25].

2002 m, iš 136 skrandžio vėžio atvejų viso apibrėžta pagal Tarptautinę statistinę ligų klasifikacijos ir susijusios sveikatos problemos 10. Patikrinimo (TLK-10, C16) buvo nustatyta atradimas etape. Tarp jų, 84 dėklai, išskyrus atvejus diagnozuota Prieš įdarbindami (n = 36) ir be kraujo mėginių (n = 16) Iš pradžių buvo atrinkta genotipo. Keturi vėžio nemokamai valdikliai (n = 336) buvo priderinta prie kiekvieno skrandžio vėžio byloje dažnis tankio bandinių ėmimo, atsižvelgiant į amžių (± 5 metai), lyties, gyvenamojo rajono, ir registracijos metus. Aštuoniais atvejais ir 14 kontrolės priemonės buvo atmesti dėl prastos genotipo veiklos rezultatų, todėl, 76 atvejai ir 322 kontrolės priemonės buvo įtrauktos į atradimas etape.

pratęsimo etapo, 388 skrandžio vėžio atvejis-kontrolė rinkiniai buvo parenkamos taip : 1) 334 skrandžio vėžio atvejų, įskaitant nustatytas gruodžio 31, 2002 136 atvejais buvo nustatyta iš KMCC gruodžio 31, 2008. Išskyrus atvejus analizuojamos atradimas fazės (n = 84) ir be kraujo mėginiai (n = 51), 199 skrandžio vėžio atvejai atitiko 1:1 kontrolei, atsižvelgiant į amžių (± 5 metai), lytį ir registracijos metus. 2) 189 naujai diagnozuota skrandžio vėžio atvejai Chungnam universitetinėje ligoninėje ir Hanyang universiteto GURI ligoninės su informuoto sutikimo buvo įdarbinti nuo 2002 kovo iki rugsėjo 2006. Kraujo mėginiai buvo imami diagnozę arba prieš skrandžio vėžio operacijos. Be to, suderintos pagal amžių (± 5 metai), lytį ir registracijos metus (nuo 2001 iki 2005) 189 bendruomeninės kontrolė buvo atsitiktinai atrinkti iš KMCC. Iš 388 skrandžio vėžio atvejo-kontrolės rungtynes, du atvejai ir 40 kontrolės priemonės buvo panaikintos dėl prastos genotipo ir nepakankamo mėginio ir, pagaliau, 386 atvejai ir 348 patikrinimai buvo analizuojami pratęsimo etapą.

genus kandidates ir SNP pasirinkimą

CagA signalo perdavimo kelias, CagA tiesiogiai jungiasi prie septynių baltymų, kurie veda į nuoseklių procesų. Šeimininko genus kodavimo septynis baltymus buvo atrinkti taip: V-Crk sarkomos viruso CT10 onkogeno homologas ( CRK
); V-Crk sarkomos viruso CT10 onkogeno homologas (paukščių) -kaip ( CRKL
); C-Src tirozino kinazės ( CSK
); augimo faktoriaus receptoriaus-jungiasi baltymas 2 ( Grb2
); Met Proto-onkogeno (, C-RER
); branduolinės veiksnys aktyvuotų T-ląstelių, baltymų tirozino fosfatazės, ne receptorius 11 tipas ( PTPN11
) kodavimas SHP2 tirozino fosfatazės ir V-Src sarkoma (Schmidt-Ruppin A-2) virusinė onkogeno homologas ( . SKC
)

SNP kandidatės buvo atrinkti pagal tris kriterijus: SNP pranešama, kad 1) galimą funkcinę svarbą vėžio ankstesniais tyrimais; 2) nepilnametis alelio dažnis (MAF) > 0,05 Azijos gyventojų viešųjų duomenų bazių, tokių kaip SNP500Cancer ar tarptautinės HapMap projekto naudojant dbSNP ID (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp); ir kartu 3) MAF > 0,05 japonų (JET) tarptautinėje HapMap projektą. Galiausiai, 137 SNP su projektavimo rezultatas = 1,1 ir r ^{2 > 0,8 buvo genotipą į ekraną didelius SNP skrandžio vėžio riziką. 108 SNP yra įsikūręs introno regione; 24 SNP yra įsikūręs promotoriaus regione (gretutines regioną ar UTR); penki SNP yra įsikūręs kodavimo regione.}

genotipo

atradimas etape 137 SNP septyniose kandidačių genų, koduojančių CagA sąveikaujančių baltymų buvo genotipą. Išmatavus koncentracijas genomo DNR visų studijų dalykų spektrofotometru (NanoDrop ND-1000, NanoDrop technologijos), genotipo buvo atliekama naudojant GoldenGate ™ analizė (Illumina®, San Diegas, CA, JAV). Siekiant užtikrinti kokybės kontrolę ir įvertinti vidaus temą atitikčių norma, 52 pakartojimai mėginiai buvo atsitiktinai pasiskirstę genotipo plokštės. Concordance normos visiems tyrimams buvo didesnis nei 99%. 137 VNP-ai, 21 SNP buvo iškrito dėl gedimo genotipo (4 SNP), SNP pareikalavimo tarifas < 90% (7 SNP), HWE < 0,0001 (1 SNP) ir MAF ≤0.05 (9 SNP). Aštuoniais atvejais ir 14 kontrolės priemonės taip pat buvo atmesti dėl genotipo pareikalavimo tarifas < 90%. Galiausiai, buvo analizuojami 116 SNP septyniose genų (genotipo norma, 99,6%) 76 atvejų ir 322 kontrolės

pratęsimo etapui, penki SNP su žalio P- pervežimas vertės <.; 0.02, tag SNP ar didesnės dizaino balai (rs6122566 ir rs6124914 į SRC
; rs41739 ir rs41737 į , c-RER
; rs7208768 į CRK
) nurodyta atradimas analizės buvo nustatytas genotipas naudojant "Illumina VeraCode GoldenGate Analizės su BeadXpress pagal gamintojo protokolu (Illumina®, JAV) [26]. Norėdami užtikrinti genotipo metodų dviejų fazių patikimumą, 188 mėginiai buvo genotipą du kartus kiekvieną metodą. Konkordancijos norma buvo > 98,4%. Dvi bylos ir 40 kontrolės su nepakankamo DNR (n = 15) arba genotipo pareikalavimo tarifas < 90% (n = 27) buvo atmesti. Galiausiai, penki SNP trijuose genuose (genotipo norma 99,6%) buvo analizuojami 386 atvejų ir 348 kontrolės.

h. pylori
infekcija ir CagA serologinis pozityvumas

h. pylori
infekcija ir CagA serologinis pozityvumas buvo įvertintas naudojant immunoblot testą, Helico Blot 2.1 ™ ( "MP Biomedicals Azijos ir Ramiojo vandenyno, Singapūras). Helico dėmė 2.1 ™ rinkiniai buvo pranešta, kad turi didelį jautrumą ir specifiškumą (už jautrumą, 99% identiškai tiek, nes specifika, 98% ir 90%, atitinkamai). [27]

matavimai fitoestrogenų biologinių žymenų

koncentracijai plazmoje keturių fitoestrogenų biologinius žymenis, kurie buvo 1) izoflavonai: genisteinas, daidzeinas ir ekvolio (daidzeinas metabolito) ir 2) Lignan: enterolactone buvo matuojamas naudojant laiko išspręsti fluoroimmunoassay rinkiniai (Labmaster, Suomija). Po nemokama fitoestrogenų biologiniai žymenys buvo paimti iš 200 įxL plazmos mėginio, į VICTOR3 ™ 1420 Multilabel Counter išmatuoto laiko išspręsti fluorescencijos (Perkin-Elmer). Išsamios matavimo metodai fitoestrogenų biologinių žymenų aprašyti kitur [28]. Iš viso studijų gyventojų koncentracija plazmoje keturių biologinių žymenų buvo matuojamas 406 atvejų ir 417 kontrolės su pakankamo tūrio plazmos (> 200 pl).

Statistinė analizė

Norėdami palyginti pagrindines savybes tarp skrandžio vėžio atvejų ir kontrolės, chi-square testą ir studentų, T-
testas buvo atliktas. P
k dydžiai už skirtumu proporcingai už lyties, amžiaus, H. pylori
infekcija, CagA ir Vaca serologinis pozityvumas, rūkymas, alkoholio vartojimas, ir gastritas istorija tarp atvejų ir kontrolės buvo nustatytas.

Hardy-Weinberg pusiausvyra (HWE) kontrolinėje grupėje buvo įvertintas naudojant chi- kvadrato testas ar tiksli Fišerio testas su atkirtos lygio HWE < 0,0001. Be atradimas etape minimalus pasaulinė P
k dydžiai ( P
< 0,05), tikimybė, santykis bandymas (LRT) 1 laisvės laipsniu (df) priedų modelio ir LRT 2 df į genotipinis modelio buvo apskaičiuojamas pasirinkti didelius SNP. Naudojant tris genetinius modelius, priedų, recesyvinis ir dominuojančius modelius, buvo analizuojamas ryšys tarp pasirinktų VNP-ai ir skrandžio vėžio rizika asociacija. Permutuoto P
k dydžiai buvo apskaičiuotas 100000 pakaitos bandymų bendrosios SNP analizė. Norėdami išvengti melagingais asociacijas su klaidingai teigiamų rezultatų, pataisytą permutuoto P
k dydžiai ant kelių VNP-ai būklės ir klaidinga atradimas norma (FDR), naudojant Benjamini-Hochberg metodas buvo apskaičiuota [29]. Skrandžio vėžio rizika buvo įvertinta kaip šansų santykį (AR) ir 95% pasikliautinasis intervalas (KĮ), naudojant besąlygiškai logistinės regresijos modelį reguliavimo už rizikos veiksnių, kurie buvo amžius, rūkymas statusas (nors vs.
Niekada) H. pylori
infekcija (teigiamas vs.
neigiamas) ir CagA serologinis pozityvumas (teigiamas vs.
neigiamas). Be to, haplotipas analizė buvo atlikta genų, kurių sudėtyje yra reikšmingai susijęs SNP iš individualios SNP analizę, naudojant Haploview 4.1 programinę įrangą (www.broad.mit.edu/mpg/haploview/~~HEAD=dobj).

pratęsimo fazės, svarbiausia nustatytos atradimas etape SNP buvo iš naujo įvertinti. Remiantis priedą arba recesyvinius modelių, skrandžio vėžio rizika buvo įvertinta kaip atokiausių regionų ir 95% KĮ naudojant besąlygiškai logistinės regresijos modelį Koreguojant pačių kintamųjų paminėtų aukščiau. Apibendrinant rezultatus iš atradimų ir pratęsimo etapais, pooled- ir meta-analizės buvo atliktos. Naudojant fiksuoto poveikio modelį, apibendrinti atokiausiems regionams ir 95% KĮ buvo skaičiuojamas. Be to, heterogeniškumas visoje tyrimų buvo įvertintas pagal Cochran Q statistikos [30].

Naudojant dispersinės analizės ir kovariacijos (ANCOVA) su amžiumi, rūkymą (nors vs.
Niekada), h. pylori
infekcija (teigiamas vs.
neigiamas) ir CagA serologinis pozityvumas (teigiamas vs.
neigiamas), kaip galimų rizikos veiksnių, skrandžio vėžio, iš phytoestrogen biologinis lygių tarp atvejais ir būdais kontrolė buvo palyginti. Sluoksninė analizė aukšto ir žemo lygio fitoestrogenų biologinių žymenų (genisteinas, daidzeinas, ekvolio ir enterolactone) kai ribinės lygiai lėmė Spline analizė buvo atlikta naudojant besąlyginės logistinės regresijos modelius. Sąveika tarp svarbiausių VNP-ai ir fitoestrogenų biologinius žymenis, taip pat buvo skaičiuojamas kaip atokiausių regionų ir 95% KĮ pakoreguotą dėl amžiaus, rūkymo statusą (nors vs.
Niekada) h. pylori
infekcija (teigiamas vs.
neigiamas) ir CagA serologinis pozityvumas (teigiamas vs.
neigiamas).

Visi statistinės analizės buvo atliekamos naudojant SAS programinės įrangos versija 9.2 ( SAS Institute, Cary, Šiaurės Karolina), o Šaudyti programinės įrangos versija 1.07 (http://pngu.mgh.harvard.edu/purcell/plink) [31]. Metaanalizė buvo atliekami naudojant Stata 10 versija (Stata, College Station, TX).

Rezultatai

Nebuvo didelis skirtumas tarp atvejų ir kontrolės pagal lytį h. pylori
infekcija, CagA /Vaca serologinis pozityvumas, rūkymas /gėrimas statusą ir skrandžio opa istorija atradimas ir pratęsimo etapų (p > 0,05). CagA /Vaca serologinis pozityvumas ir dabartinių rūkalių dalis buvo reikšmingai didesnis tarp skrandžio vėžio atvejų bendrus duomenis ( P
= 0,03 P
< 0,01 P
= 0,02, atitinkamai) (lentelė S1).

iš 116 VNP-ai iš septynių kandidačių genų, koduojančių CagA bendrauja baltymus analizuojamos atradimas etape 22 SNP trijose genų SRC
, c-RER
, ir CRK
, buvo reikšmingai susijęs su skrandžio vėžiu ( p
-LRT < 0,05). SRC
rs6122566 gerokai padidėjo rizika skrandžio vėžio recesyvinius modelių (arba = 4.90 [95% PI 1,19-14,2]). Trylika SNP, kurie buvo rs41739, rs16945, rs41738, rs6566, rs10435378, rs41737, rs2023748, rs41736, rs41735, rs6951311, rs183642, rs2237717 ir rs38859 į , C-MET
genas parodė reikšmingą geno dozės poveikį tiesinio tendencija testai ( p
< 0,05). CRK
rs7208768 turėjo šiek tiek didelę geno dozės poveikį. 100.000 pakaitos testai bendrojoje SNP analizė parodė, SRC
rs6122566 C-MET
rs41739 ir CRK
rs7208768 su svarbiausių permutuoto P CR.LT - vertė kiekvienoje geno ( p
_{kombinacija = 0,00284 p
kombinacija = 0,00989 p
kombinacija = 0,01392, atitinkamai). Ribinio reikšmė ištaisyti permutuoto p
-Pridėtinės buvo pastebėta, SRC
rs6122566 ( P
= 0,0918), tačiau visi FDR P
k dydžiai visų genetinių modelių nebuvo reikšmingas ( p
> 0.2). (lentelė S2),}

haplotipas blokai buvo identifikuoti pagal LD ​​sklypo (S1 paveiksle). Didžiausias blokas buvo pastatytas su svarbiausių VNP-ai įskaitant rs41739, rs6566, ir rs41738, bet visų, P
-Pridėtinės nebuvo reikšmingas ( P
> 0,05). Keturi apibrėžta blokai SRC parsisiųsti ir vienas blokas apibrėžta CRK
neparodė Statistinis reikšmingumas į omnibus testą. Šio haplotipas analizės rezultatai nebuvo pateikti informaciją ne tik atskirų SNP rezultatų (duomenys neparodyti).

pratęsimo fazės, du VNP-ai, rs6122566 ir rs6124914, į SRC pervežimas genų ir rs7208768 į CRK
liko reikšmingai susijęs su padidėjusia rizika skrandžio vėžio (arba = 4.01, [95% PI: 1,62-9,96]; arba = 1.30, [95% PI: 1,00-1,70]; arba = 1.33, [95% PI: 1,08-1,64], atitinkamai). Asociacijos tarp į C-MET
geno (rs41739 ir rs41737) ir skrandžio vėžio rizika VNP-ai buvo susilpnintas. Kombinuotoje analizę, įtrauktą atradimas ir plėtros etapus, rizikos įvertį, SRC
rs6122566 į recesyvinis modelio buvo reikšmingai susijęs su skrandžio vėžiu, tiek Suminė ir metaanalizė (OR = 3.96, [95% PI: 2,05-7,65]; arba = 4.59, [95% PI: 2,74-7,70], atitinkamai). Be to, SRC
rs6124914 C-MET
rs41739 ir CRK
rs7208768 parodė reikšmingus genų dozės poveikį skrandžio vėžio ir analizes. Nebuvo heterogeniškumas visoje analizių (Cochran Q testas P
> 0,05). (Lentelė S3)

Tarp iš 823 temų (406 atvejų ir 417 kontrolės), kurie buvo matuojamas viso koncentracija kraujo plazmoje keturių fitoestrogenų biologinių žymenų, bendra koncentracija genisteinas, daidzeinas ir enterolactone atvejais buvo gerokai mažesnis nei kontroliniuose (genisteinas 167,6 nmol /L tais atvejais, vs.
200,2 nmol /l kontrolės p
= 0,0004; daidzeinas 91,4 nmol /l tais atvejais, vs
131,6 nmol /L kontrolės p
. < 0,0001; enterolactone 51,0 nmol /L atvejų vs
77,7 nmol /L kontrolės p
. < 0,0001). Bendras koncentracija plazmoje ekvolio A daidzeinas metabolito, buvo mažesnis tais atvejais, tačiau statistiškai reikšmingas (50,3 nmol /l atvejais vs
62,2 nmol /l kontrolės;. P
= 0,0977) , Be sluoksniuotoji analizė pagal fitoestrogenų biologinių žymenų, didelė genų-aplinkos sąveika buvo stebėta, CRK
. Rizikos alelis CRK
rs7208768 turėjo žymiai padidėjusi rizika skrandžio vėžio žemoje fitoestrogenų lygiais. Tiksliau, A rs7208768 alelis buvo susijęs su didesniu rizikos skrandžio vėžio žemoje genisteinas, daidzeinas, ekvolio ir enterolactone ir statistiškai reikšmingas (arba = 1.91, [95% PI: 1,44-2,52] žemoje genisteinas, arba = 2.09, [95% PI: 1,46-3,01] žemoje daidzeinas arba = 1,87 [95% PI: 1,26-2,78] žemoje ekvolio arba = 1.77, [95% PI: 1,10-2,85] žemoje enterolactone). P
-sąveikos buvo reikšmingas ( P
= 0,0001 P
= 0,0013 P
= 0,0147 P
= 0,0404, atitinkamai) (lentelė S4 ").

nors papildomi susiskirstė į sluoksnius analizę taip pat buvo atliekami siekiant aptikti tarp CagA seropozityvumo ir kiekvieno geno poveikį skrandžio vėžio rizikos sąveiką, sąveikos nebuvo reikšmingas bet kurios iš trijų genų, SRC
c-MET parsisiųsti ir CRK
(duomenys neparodyti).

Diskusijos

CagA išskiriančių H. pylori
infekcija atsiranda vaidinti svarbų vaidmenį skrandžio kancerogenezėje per paeiliui CagA signalo perdavimo keliu. CagA pradžių jungiasi prie septynių baltymų komponentų aktyvuoti netipiškų korinio atsakymus, kuriais grindžiamos skrandžio vėžio vystymąsi. Nuo funkcija baltymo gali būti reguliuojamas pagal jų šeimininko genus, genus, kurie koduoja CagA sąveikaujančių molekulių gali būti suteikta galimybė keisti riziką skrandžio vėžio. Įvertinti šią hipotezę, mes genotipą 137 SNP septynių kandidačių genų ir parodė, kad genetiniai variantai SRC
(rs6122566 ir rs6124914) C-MET
(rs41739) ir CRK
(rs7208768) buvo reikšmingai susijęs su skrandžio vėžio riziką. Be to, interaktyvus efektas CRK
genetinis polimorfizmas, rs7208768 ir keturi fitoestrogenų biologiniai žymenys, genisteinas, daidzeinas, ekvolio ir enterolactone skrandžio vėžio rizika buvo analizuojami.

SRC, ne receptorių baltymų tirozino kinazės (TK), atrodo, kad svarbu skrandžio kancerogenezėje. Kai švirkščiamas į skrandžio epitelinių ląstelių, CagA patiria tirozino fosforilinimo iki SRC šeimos kinazės [8], [12], [18]. Tirozino fosforilinimo iš CagA yra neatskiriama žingsnis nustatant eilės ląstelių signalinių mechanizmą. Nes kai CagA bendrauja molekules, tokias kaip SHP-2, CRK ir CSK tik sugebėti reaguoti fosforilintu CagA, SRC gali būti svarbesnis įtakojant kitus Cellular funkcijas ir paskatinti vystymąsi skrandžio vėžio. Be to, SKC buvo pranešta vaidinti svarbų vaidmenį navikų progresavimo ir tarpininkauti vėžio vystymąsi ir metastazes [32]. Atrodo, kad būti pakeista priimančiosios geno Mobilieji veikla SRC ir mūsų rezultatai rodo, kad SRC
rs6122566 ir rs6124914 gali būti rizikos modifikatoriai skrandžio kancerogenezėje. SRC
genetinius variantus, kurie daro įtaką ląstelių gebėjimus skrandžio epitelinių ląstelių, susijusių su skrandžio vėžio riziką.

Nepaisant susilpninto reikšmę pratęsimo analizės C-MET
kuri yra tapatinama su HGFR
(hepatocitų augimo faktoriaus receptoriaus) gali būti nepriklausomas rizikos genų skrandžio vėžio. Daugybė ankstesni tyrimai pranešė, kad c-MET ", viena iš receptorių TKS, skatina invazinių navikų augimą, ląstelių invaziją ir mirtingumo bei stiprinimas ir /arba padidėjusi C-MET buvo susijęs su įvairių žmogaus karcinoma, įskaitant skrandžio vėžio [17], [ ,,,0],33] - [36]. Kalbant apie c-MET ląstelių mechanizmo, CagA vaidina svarbų vaidmenį kaip adapteris baltymų, Tab, tarpininkauti receptorių TK signalizacijos kontroliuojant keletą aukštutinių komponentus aktyvuoto receptorius, pavyzdžiui, Grb2, PLCγ ir SHP-2 [37] klasterį, [38]. Iki funkciškai mėgdžiodami GAB adapterio baltymų, CagA gali skatinti nenormalus platinimu ir mirtingumą skrandžio epitherial ląstelių [39]. Šioje studijoje, iš , C-MET
genas (rs41739) buvo reikšmingai susijęs su skrandžio vėžio rizikos ir galimos genetinės jautrių veiksnys skrandžio vėžiui polimorfizmas. Suderinamas su mobiliojo ryšio svarbą ir funkcijas, , C-MET
genas atrodo keisti skrandžio kancerogenezėje riziką per CagA signalo perdavimo keliu.

CRK adapteris baltymą, kuris turi sandūrų izoformų, CRK-man ( SH2-SH3) ir CRK-II "(SH2-SH3-SH3), jungiasi prie TKS ir kontroliuoja perrašymo ir Citoskeletas reorganizaciją reguliavimą ląstelių veiklą [40]. Taip pat, per šį adapterį baltymų integruoja įvairias korinio ryšio signalus ir jos reguliacijos sutrikimas yra prijungtas prie žmogaus karcinoma [41]. Sąveika tarp CRK ir fosforilinto CagA buvo pranešta, kad biologinis sąlyga, kad sukelia morfologinius pokyčius, ląstelių sklaidos ir dereguliavimo ląstelių ląstelių sukibimą skrandžio epitelio [14]. Keletas tyrimų parodė, kad padidėjusią CRK yra susijusi su įvairių tipų žmogaus vėžio, įskaitant plaučių, skrandžio ir storosios žarnos vėžiu [42], [43]. Mūsų išvados taip pat remti genetinio potencialo, CRK
rs7208768 nuo skrandžio vėžio ir tiek genetinės ir ląstelių dydžio CRK plėtrai.

Dar įdomiau, reikšmingos sąveikos tarp CRK
genetinis polimorfizmas ir keturių fitoestrogenų biologiniai žymenys, genisteinas, daidzeinas, ekvolio ir enterolactone, modifikuotas skrandžio vėžio riziką. Tyrimai parodė, apsauginį poveikį fitoestrogenų skrandžio vėžio [20], [28], o ypač, genisteinas slopino ERK signalo perdavimo kaskados sukeltas H. Helicobacter pylori infekcija
žaisti vaidmenį kaip tirozino kinazės inhibitorius [44]. Atsižvelgiant į CRK yra pagrindinė prieš molekulė ERK aktyvinimą, rizikingas genetiniai variantai CRK
aktyvuoti ERK signalizacijos gali būti užblokuotas fitoestrogenų, ir tarpininkauti skrandžio vėžio vystymąsi.

SRC, c-RER ir CRK taip pat dalyvauja baltymų TKS, kuri yra įvairi multigene šeima, kurią kontroliuoja ląstelių signalo perdavimo kelias tarpininkės iš tolesnių korinio įvairūs procesai ir vaidina reikšmingą vaidmenį įvairių klinikinių ligų [45] vystymuisi [46]. TKs taip pat žinomas kaip onkogenų dalyvaujančių žmogaus piktybinių navikų. SRC yra siejamas su ne-receptorių TK ir c-MET receptorius TK, o CRK yra adapteris baltymą, kuris rišasi su TK-fosforilintų baltymų ir stiprina pagrindinius baltymų signalo transdukcijos keliu [41]. Šie trys molekulės užkoduoti SRC
C-MET
, ir CRK
genai gali savarankiškai sukelti ląstelių diferenciaciją, sukibimą, mirtį ir morfologinių pokyčių iki transmiting ląstelių signalus, susiję su jų TK veiklą, nepaisant sąveikos su CagA. Be to, abi, genai, susiję su TK veiksmų atrodo, vaidina lemiamą vaidmenį kaip jautrių veiksnys skrandžio vėžio atsižvelgiant genisteinas, kuri yra tirozino kinazės inhibitorius gali sumažinti skrandžio vėžio riziką [28]. Tai rodo, kad genetiniai jautrumą, SRC
C-MET
, ir CRK
skrandžio kancerogenezėje turėtų būti traktuojami kaip nepriklausomi rizikos veiksniai, kurie pakeičia ląstelių perduoti signalo į TK priklausomas manieros, nes neinfekuotiems asmenims su CagA išskiriamas h. Pylori
gali būti gresia skrandžio vėžio, priklausomai nuo individualių genetinių variantų trijų genų.

Nors PTPN11
CRKL
CSK
ir Grb2
neparodė jokio reikšmingo ryšio su skrandžio vėžiu, šiame tyrime, jų genetiniai reiškiniai neturėtų būti pamiršta. Ląstelių lygiu, šios molekulės yra reikšmingai susiję su neįprastos poveikio kuriomis grindžiami skrandžio kancerogenezės [12]. Kaip viena iš žmogaus prokalbės onkogenų, PTPN11
koduoja citoplazmos tirozino fosfatazės su SHP2 ir gali sukelti netipiško hiperaktyvaciją į ERK signalizacijos [47]. Tyrimas taip pat pranešė, kad PTPN11
genetinis variantas padidino skrandžio atrofija ir vėžio tarp CagA teigiamas H riziką. pylori
infekuotų žmonių [48]. Į CagA signalo perdavimo kelias, CRKL veikia gana panašiai CRK; CSK žlugdo kurio SRC šeimos kinazės ir CagA-SHP2 signalizacijos veiklą; ir Grb2 veikia kaip trigeris aktyvuoti anksčiau /MEK /ERK kelią [14], [18], [49]. Tolesni tyrimai su didesniu skaičiumi skrandžio vėžio atvejų ir platesnio aprėpties genetinių polimorfizmas šių genų yra pagrįstas.

Skrandžio Kancerogeninis sukeltas CagA teigiamas H. Pylori
infekcija gali būti infered iš mūsų studijų rezultatų ir peržiūros ląstelių mechanizmus [16], [18], [47] (S2 pav.) Kai CagA suleidžiama skrandžio ephithelial ląsteles, SKC inicijuoja CagA fosforilinimas, kuri sąveikauja su CRK adapterio baltymų ir SHP2 skatinti ERK aktyvinimą.

• PLoS ONE identifikavimas Serumas mikro RNR kaip nauji neinvazinis biologinių žymenų ankstyvam Skrandžio Cancer
• PLoS ONE: aktyvinimas transkripcijos faktorius 4 suteikia naviko atsparumą daugeliui fenotipo skrandžio vėžio ląsteles per Transactivation iš SIRT1 Expression