Stomach Health > elodec Zdravje >  > Gastric Cancer > želodčni rak

Plos ONE: Karakterizacija različno izraženih genov, ki sodelujejo v poteh, ki sodelujejo v želodca Cancer

Povzetek

Če želite raziskati vzorce izražanja genov pri raku želodca, skupaj 26 v paru raka želodca in noncancerous tkiva iz bili vključeni bolniki za gensko analizo izraz mikromrež. so bile uporabljene metode Limma za analizo podatkov, in geni so se šteje, da je bistveno različno izražena, če False Discovery Rate (FDR) vrednost je bila < 0,01 P
-vrednost WAS < 0,01 in pregib spremembe (FC) je bil > 2. Nato so Gene Ontologija (GO), kategorije se uporabljajo za analizo glavnih funkcij različno izraženih genov. Skladno s Kjotskim Enciklopediji genov in baze podatkov genomov (kegg), smo našli poti bistveno povezane z diferencialno genov. Gen-zakon omrežja in ko-ekspresija omrežje bila zgrajena vsakokrat na osnovi razmerja med genov, proteinov in snovi v bazi. 2371 mRNA in 350 lncRNAs štejejo za bistveno različno izraženi geni so bile izbrane za nadaljnjo analizo. GO kategorije, pot analize in omrežje Gene-zakon je pokazala dosledno rezultat, da so up-urejena geni odgovorni za tumorigeneze, migracije, angiogenezo in nastanek mikrookolja, dol urejena geni pa so vključeni v presnovo. Ti rezultati te raziskave zagotavljajo nekatere nove ugotovitve kodiranega RNA, lncRNAs, poti in sodelovanja izraz omrežje na raka želodca, ki bo uporaben za usmerjanje nadaljnje preiskave in ciljno zdravljenje za to bolezen

Navedba. Li H Yu B, Li J Su L Yan M Zhang J, et al. (2015) Karakterizacija različno izraženih genov, ki sodelujejo v poteh, ki sodelujejo v želodca raka. PLoS ONE 10 (4): e0125013. doi: 10,1371 /journal.pone.0125013

Akademska Urednik: Francisco J. Esteban, Univerza v Jaén, ŠPANIJA

Prejeto: 9. november 2014; Sprejeto: 6. marec 2015; Objavljeno: 30. april 2015

Copyright: © 2015 Li et al. To je prost dostop članek razširja pod pogoji Creative Commons Attribution License, ki omogoča neomejeno uporabo, distribucijo in razmnoževanje v katerem koli mediju, pod pogojem, da prvotni avtor in vir knjižijo

Razpoložljivost podatkov: Vsi pomembni podatki so v papir in njene dodatne informacije datotek. Vse mikromrež datoteke so na voljo na NCBI Gene Expression Omnibus (GEO) baze podatkov (pristop številka "GSE65801"; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE65801).

Financiranje: To delo je podprta s sredstvi za analizo iz National Natural Science Foundation Kitajske [No. 81172324, št 91229106, št 81272749, in št 8

Other Languages