PLOS ONE: Genómica de perfiles de submucosa invasiva del cáncer del estómago por la matriz basada en genómica comparada Hybridization

Extracto

número de copias aberraciones genómicas (CNA) en el cáncer gástrico ya se han caracterizado en gran medida por la gama de hibridación genómica comparada (array CGH) análisis. Sin embargo, la participación de la CNA genómicas en el proceso de invasión de la submucosa y la metástasis de los ganglios linfáticos en el cáncer gástrico temprano aún es poco conocido. En este estudio, para abordar esta cuestión, se recogieron un total de 59 muestras de tumores de 27 pacientes con cáncer gástrico submucosa invasiva (SMGC), analizaron sus perfiles genómicos por CGH array, y los comparó entre muestras pareadas de mucosa (MU) y submucosa (SM) invasión (23 pares), y SM invasión y de los ganglios linfáticos (LN) metástasis (9 pares). En un principio, la hipótesis de que la adquisición de la CNA (s) específico es importante para estos procesos. Sin embargo, se observó ninguna diferencia significativa en el número de CNA genómicas entre emparejado MU y SM, y entre SM emparejado y LN. Por otra parte, no hemos podido encontrar ningún CNA específicamente asociados con la invasión o metástasis LN SM. Entre los 23 casos analizados, 15 presentaron un patrón similar de perfiles genómicos entre SM y MU. Curiosamente, 13 de los 15 casos también mostraron algunas diferencias en los perfiles genómicos. Estos resultados sugieren que la mayoría de SMGCS se componen de subpoblaciones heterogéneas derivadas del mismo origen clonal. La comparación de los CNA genómicas entre SMGCS con y sin metástasis LN reveló que el aumento de 11q13, 11q14, 11q22, 14q32 y amplificación de 17q21 fueron más frecuentes en SMGCS metastásicos, lo que sugiere que estos CNA están relacionados con LN metástasis de cáncer gástrico precoz. En conclusión, nuestros datos sugieren que la generación de subclones genéticamente distintas, en lugar de adquisición de específico CNA en MU, es parte integral del proceso de invasión submucosa, y que subclones que adquieren ganancia de 11q13, 11q14, 11q22, 14q32 o amplificación de 17q21 son propensos a convertirse en metastásico

Visto:. Un Kuroda, Tsukamoto Y, Nguyen LT, Noguchi T, Takeuchi I, Uchida M, et al. (2011) Genómica de perfiles de submucosa invasiva del cáncer del estómago por la matriz basada en hibridación genómica comparada. PLoS ONE 6 (7): e22313. doi: 10.1371 /journal.pone.0022313

Editor: Giuseppe Novelli, Tor Vergata Universidad de Roma, Italia |

Recibido: 25 Febrero, 2011; Aceptado 19 de junio de 2011; Publicado: 21 de julio 2011

Derechos de Autor © 2011 Kuroda et al. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons Attribution License, que permite el uso ilimitado, distribución y reproducción en cualquier medio, siempre que el autor original y la fuente se acreditan

Financiación:. Esta investigación fue apoyado en parte por el Ministerio de Educación, Ciencia, Deportes y Cultura de Japón, y subvenciones-en-Ayudas a jóvenes científicos (B), Nº 20790286 (http://www.mext.go.jp), y el Fondo de Investigación a discreción del Presidente, Universidad de Oita (http://www.oita-u.ac.jp/english/index.html). Sin financiación externa adicional fue recibida para este estudio. Los donantes no tenía papel en el diseño del estudio, la recogida y análisis de datos, decisión a publicar, o la preparación del manuscrito

Conflicto de intereses:.. Los autores han declarado que no existen intereses en competencia

Introducción

el cáncer gástrico sigue siendo una de las enfermedades más mortales, a pesar de su tendencia a la disminución constante en todo el mundo. En general, la mortalidad por cáncer de estómago se estima en 700.000 casos al año (10,4% de todas las muertes relacionadas con el cáncer), ocupando el segundo sólo después del cáncer de pulmón [1]. El resultado clínico es mejor cuando las células tumorales están confinados a la mucosa. Sin embargo, una vez que las células tumorales pasan a través de la mucosa muscular, el resultado clínico se vuelve peor, ya que el riesgo de metástasis de los ganglios linfáticos, que es uno de los más importantes factores pronósticos en el cáncer gástrico, aumenta de manera significativa al 18% o más, en comparación con menos de 4% cuando las células tumorales siguen siendo limitados a la mucosa [2], [3]. Por lo tanto, se requiere una mejor comprensión de los mecanismos implicados en el proceso de invasión de la submucosa.

Se reconoce actualmente que la acumulación de pasos múltiples de anomalías genéticas es responsable de la aparición y la progresión de diversos tipos de cáncer [4]. De hecho, se ha informado de que el número total de aberraciones genómicas aumenta con la progresión del tumor en varios tipos de tumores [5]. También se encontró que las frecuencias de las ganancias en 20q, 20p12, 1q42, 3q27 y 13q34 y pérdidas en 4q34-qter, 4p15, 9p21, 16q22, 18q21 y 3p14, que había sido detectado con frecuencia en el cáncer gástrico, fueron más frecuentes en AGC de en EGC [6]. Mientras tanto, recientemente se ha informado de que, durante el curso de la progresión del tumor, una sola de las células tumorales de origen evoluciona en varias subpoblaciones genéticamente distintas a través de la adquisición de una amplia variedad de aberraciones genómicas. La masa tumoral resultante, que se compone de subpoblaciones genéticamente heterogéneas, se considera a ser resistentes a una variedad de presiones de selección del medio ambiente [7], [8], [9], [10].

basado en series hibridación genómica comparada (CGH array) proporciona información acerca de número de copias aberraciones genómicas (CNA) en todo el genoma [11]. Por otra parte, CGH es aplicable al estudio de la heterogeneidad intratumoral genómico [12], [13], [14], [15] también. Aunque matriz varios grupos han utilizado CGH para identificar regiones que albergan genes oncogénicos o supresores tumorales en el cáncer gástrico [6], [16], [17], [18], [19], [20], [21], [22 ], [23], [24], [25], CNA relacionados con la submucosa invasión y la primera fase de metástasis en los ganglios linfáticos aún no han sido determinados. Por otra parte, dado que la mayoría de estudios previos de CNA en el cáncer gástrico han analizado sólo una muestra para cada tumor, los detalles de la heterogeneidad de los perfiles genómicos dentro de un mismo cáncer gástrico han permanecido en gran medida poco clara.

En este estudio, se determinó la participación de CNA genómicos en el proceso de invasión de la submucosa y la metástasis de los ganglios linfáticos en el cáncer gástrico precoz. Para este propósito, se recogieron muestras de tumores de diferentes partes de un mismo tumor separado, analizaron sus perfiles genómicos por CGH array, y se compararon los perfiles genómicos entre muestras pareadas de mucosa (MU) y submucosa (SM) porciones, y la parte de SM y linfático nodo (LN) metástasis. Por otra parte, mediante la comparación de la CNA entre metastásico y el cáncer gástrico submucosa invasiva no metastásico (SMGC), identificamos el candidato CNA relacionado con LN metástasis de cáncer gástrico precoz.

Materiales y Métodos

Declaración de ética

Este estudio fue aprobado por el comité de ética del hospital de la Universidad de Oita (Número de Registro P-05-04). Consentimiento informado, se obtuvo de todos los pacientes y /o sus familias.

Los pacientes, muestras de tejidos y la extracción de ADN genómico

Veintisiete SMGCS se resecaron quirúrgicamente en el Hospital de la Universidad de Oita. Las secciones de tejido fueron cortados de, tejido incluido en parafina y fijado en formalina y se tiñeron con hematoxilina-eosina (HE) para el análisis histológico y con azul de toluidina (Wako, Osaka, Japón) para la extracción de ADN genómico (Figura 1A). El uso de láser de microdisección de captura, se recogieron muestras 1 a 3 de la MU, SM y /o porción LN metastásico del mismo tejido SMGC por separado. Como resultado, hemos sido capaces de obtener un total de 59 muestras de 27 pacientes (Tabla 1). Todas las muestras incluyen una proporción de células tumorales superiores al 70% del total. ADN genómico fue extraído en acuerdo con el método estándar digestión con proteinasa K, seguido por extracción con fenol /cloroformo. tejido gástrico no neoplásica de los mismos pacientes se utilizó como control normal.

Array CGH y análisis de datos

análisis de CGH-array se realizó con 44 K de oligonucleótidos arrays de CGH (Agilent Technologies Inc. , Palo Alto, CA). El etiquetado y la hibridación se realizaron de acuerdo con el protocolo proporcionado por Agilent Technologies Inc. En resumen, 0,85-2 g de ADN del tumor y una cantidad igual de ADN de control se digirieron con AluI y RsaI (Promega, Madison, WI, EE.UU.) durante 24 horas a 37 ° C. El tumor digerido y el ADN de control se marcaron con Cy5-dUTP y Cy3-dUTP, respectivamente, utilizando un ADN genómico Labeling Kit Plus (Agilent), purificado con Microcon YM-30 filtros (Millipore, Billerica, MA, EE.UU.), y se concentraron de 80,5 l. Igual cantidad de ADN de tumor y de control se combinaron posteriormente y se mezclaron con Cot-1 DNA humano, disuelto en tampón de hibridación (Agilent Oligo aCGH hibridación Kit; Agilent Technologies), desnaturalizado y se hibridaron a la matriz CGH a 65 ° C durante 24 h. Los portaobjetos de vidrio se lavaron y luego escaneado de acuerdo con las instrucciones del fabricante.

Microarray imágenes se analizaron utilizando v.9.5.3.1 extracción de características (Agilent Technologies) con normalización lineal (protocolo CGH-v4_95_Feb07), y los datos resultantes se importaron en el ADN Analytics v.4.0.81 (Agilent Technologies). Tras la normalización de los datos en bruto, se calculó el log2ratio de Cy5 (tumor) a Cy3 (Control). regiones aberrantes fueron determinados por el algoritmo de ADM-2 en un umbral de 8,0. Para detectar las pérdidas y ganancias, establecemos los valores de los parámetros de los filtros de aberración como: número mínimo de sondas en la región 2, log2ratio promedio mínimo absoluto para la región de 0,26, el número máximo de regiones aberrantes 10000, y el porcentaje de penetración por función 0. Del mismo modo, a detectar amplificaciones y deleciones, establecemos los valores de los parámetros de los filtros de aberración como: número mínimo de sondas en la región 2, mínimo log2ratio media absoluta para la región de 1,0, el número máximo de regiones aberrantes 10000, y el porcentaje de penetración por función 0. los datos generados por las sondas asignan a la X y se eliminaron los cromosomas y. posiciones genómicas de sondas y regiones aberrantes se basaron en la secuencia de referencia 2006 humano UCSC marzo (hg18) (NCBI Build 36 secuencia de referencia). Todos los datos son MIAME compatible (http://www.mged.org/Workgroups/MIAME/miame.html) y los datos brutos se han depositado en la base de datos GEO MIAME compatible (http: //www.ncbi.nlm.nih .gov /geo /, número de acceso GSE26800). Una visión general del diseño experimental se muestra en la Figura 1B. Para la comparación de los CNA entre las partes de MU y SM pareadas, se seleccionaron 23 casos del total de 27 (Figura 1B, a y b), ya que los perfiles genómicos de ambas partes en estos casos se habían analizado con éxito. Del mismo modo, para la comparación de CNA entre SM emparejado y porciones LN, se seleccionaron 9 de los 12 casos con una porción LN (Figura 1B, C y D). Además, se compararon las frecuencias de CNA entre los casos con y sin metástasis LN (Figura 1 B, E y F).

La inmunohistoquímica

La inmunohistoquímica se realizó como se describió anteriormente [21] utilizando anti- EGFR (1:100; Dako, Glostrup, Dinamarca), anti-CTTN (1:200; Abcam, Cambridge, MA, EE.UU.) y anti-erbB2; anticuerpos (1:800 Cell Signaling Technology, Berverly, MA, EE.UU.).

El análisis estadístico

se utilizaron la prueba t pareada y la prueba exacta de Fisher. Las diferencias a P
. ≪ 0,05 se consideró estadísticamente significativa

Resultados

clonalidad Genómica y la heterogeneidad en porciones de la mucosa y submucosa SMGC

Para investigar la participación de CNA genómicas en el proceso de invasión submucosa, lo primero que comparó el número de CNA entre muestras pareadas MU y SM a partir de los 23 SMGCS (Figura 2A). Once de los 23 casos mostraron un aumento del número de CNA en la porción de SM, en comparación con la porción de MU, 11 mostraron una disminución en el número, y el caso restante no mostraron cambios (Figura 2A). Como resultado, no hubo diferencia estadísticamente significativa en el número de CNA entre porciones MU y SM emparejados (Figura 2A, no significativo en la prueba t pareada). Por otra parte, para identificar CNA específicamente asociada con la invasión submucosa, se compararon las frecuencias promediados de CNA en la parte de MU con los que están en la parte SM emparejado (Figura 2B), pero no pudimos encontrar ninguna
.

Para investigar la diferencia del CNA entre MU y SM del mismo tumor, se compararon los perfiles genómicos de emparejado MU y SM en cada caso. Un caso representativo se muestra en la Figura 2C, D, E y F. El emparejado MU y las muestras SM comparte un patrón similar de aberración genómica en el cromosoma 9p (Figura 2D). Sin embargo, hubo distintas aberraciones genómicas en cromosomas 7p y 11 en el mismo caso, como se muestra en la figura 2E y F. La amplificación de 7p12 se observó sólo en MU, pero no en SM (Figura 2E), y se observó ganancia del cromosoma 11 sólo en SM, pero no en MU (Figura 2F). Estos resultados sugieren que las células tumorales en el MU y SM de este caso fueron clonalmente relacionados, pero componen de subpoblaciones genéticamente heterogéneos.

A continuación, para determinar si las células tumorales que muestran la amplificación de 7p12 y los que muestran la ganancia de 11q13 de caso 4 fueron muy limitada a la MU y SM, respectivamente, se analizaron secciones de tejido de caso 4 por inmunohistoquímica con anticuerpos contra EGFR, que se amplificó sólo en la parte MU (Figura 2E), y CTTN, que sólo fue adquirida en el SM porción (Figura 2F). Como se muestra en la Figura 3, la inmunorreactividad positiva para EGFR se limita a la porción de MU (Figura 3D, E y F), mientras que sólo la parte de SM mostraron una fuerte inmunorreactividad para CTTN (Figura 3G, H y I). Estos resultados sugieren que, en el caso 4, las células tumorales con 7p amplificación de MU no podrían haber invadido el SM, mientras que los que tienen el cromosoma 11 de ganancia que podría haber invadido el SM.

A continuación, se analizaron clonalidad genómica y la heterogeneidad en la UM y SM de los otros casos. Entre los otros 22 casos, 14 mostraron un patrón similar de la aberración genómico en las MU y SM (figuras S1 (6 casos) y S2 (8 casos)), lo que sugiere que las células cancerosas en el MU y SM de estos casos fueron clonal relacionados . Curiosamente, 12 de los 14 casos mostraron una diferencia significativa en los patrones de perfil genómicas entre MU y SM (figuras S1 (6 casos) y S2 (6 casos)), lo que sugiere que estos casos también se componen de subpoblaciones genéticamente heterogéneas.

clonalidad Genómica y la heterogeneidad en la primaria (SM) y metastásico (LN) porciones de SMGC

a continuación, para investigar la implicación de la CNA en el proceso de metástasis en los ganglios linfáticos del cáncer gástrico precoz, se comparó el número del CNA entre porciones de 9 SMGCS (Figura 4A) primaria emparejado (SM) y metastásico (LN). Tres de los 9 casos mostraron un aumento del número de CNA en la porción LN, mientras que los restantes 6 casos mostraron una disminución (Figura 4A). Como resultado, no hubo diferencia significativa en el número de CNA entre las porciones de SM y LN emparejados (Figura 4A, no significativo en la prueba t pareada). Por otra parte, para identificar CNA específicamente asociados con la metástasis LN, se compararon las frecuencias promediados de CNA en SM con los que están en la parte LN emparejado (Figura 4B), pero no pudimos encontrar ninguna.

Para investigar la diferencia de CNA entre SM y LN del mismo tumor, se compararon los perfiles genómicos de SM emparejado y muestras LN en cada caso. Un caso representativo se muestra en la Figura 4C, D y E. El SM emparejado y muestras LN comparte un patrón similar de aberración genómica en el cromosoma 8 (Figura 4D), lo que sugiere que ambas porciones se derivan del mismo origen clonal. Sin embargo, se observó ganancia del cromosoma 14 sólo en SM, pero no en LN (Figura 4E). Estos resultados sugieren que las células tumorales en las porciones SM y LN de este caso fueron clonal relacionados, pero componen de subpoblaciones genéticamente heterogéneas.

También analizaron clonalidad genómica y la heterogeneidad en SM y LN porciones de otros casos. Entre los otros 8 casos, 5 mostraron un patrón similar de la aberración genómico tanto en SM y LN (Figura S3), lo que sugiere que las porciones SM y LN pareadas de estos casos estaban relacionados clonal. Además, 4 de los 5 casos mostraron una diferencia significativa en los patrones de perfil genómicas entre SM y LN (Figura S3), lo que sugiere que estos casos también se componen de subpoblaciones genéticamente heterogéneos.

Comparación de los perfiles genómicas entre metastásico y no metastásico SMGC

Desde que se detectaron diferencias estadísticamente significativas en las frecuencias de CNA entre SM y se combina porciones LN (Figura 4B), la hipótesis de que las subpoblaciones llevando la metástasis relacionada con el CNA podría estar presente en el SM, así como la porción de LN SMGC metastásico. Por lo tanto, el próximo compararon las frecuencias de CNA en la parte SM de SMGCS metastásicos (12 casos) con los de SMGCS no metastásicos (15 casos), y encontramos que las ganancias en 11q13, 11q14, 11q22 y 14q32 se detectaron con mayor frecuencia en metastásico SMGCS que en SMGCS no metastásico (Figura 5A y Tabla 2). También se compararon las frecuencias de número de copias aberraciones de alto nivel, tales como la amplificación y la supresión, entre los dos grupos, y encontramos que la amplificación de 17q21 fue detectado con mayor frecuencia en SMGCS metastásicos que en SMGCS no metastásico (Tabla 3 y Tabla S1) . Estos resultados sugieren que las ganancias en 11q13, 11q14, 11q22, 14q32 y 17q21 amplificación en participan en la metástasis de LN SMGCS.

La región común mínima de amplificación en 17q21 contenía 5 genes que figuran en la Tabla 3. Desde ErbB2 , un oncogén conocido [26], [27], [28], fue incluido en la lista, se realizó un análisis inmunohistoquímico de sobreexpresión de erbB2 en los 27 casos. Como se muestra en la Figura 5B, los casos con 17q21 amplificación mostraron una fuerte tinción para ErbB2 en SM, mientras que un caso sin amplificación no lo hizo. Por otra parte, la sobreexpresión de ErbB2 se asoció significativamente con la amplificación de 17q21 (Tabla 4), lo que sugiere que la amplificación y la sobreexpresión de ERBB2 puede estar implicada en la metástasis LN de una proporción de SMGCS.

Discusión

Es ampliamente acepta que un tumor se deriva de una sola célula. Sin embargo, la forma en que avanza a una etapa avanzada está siendo objeto de debate. Los primeros estudios de colorrectal y los cánceres de páncreas condujeron a una noción de que el desarrollo y la progresión de estos cánceres están asociados con la acumulación de aberraciones cromosómicas, que se refiere como el modelo de múltiples etapas tumorigénesis [29], [30]. Por ejemplo, las aberraciones genómicas de los genes APC, KRAS, SMAD4 y TP53 están involucrados en la secuencia adenoma-carcinoma en el colon [29]. Sin embargo, estos estudios se centraron en sólo una proporción de los genes relacionados con el tumor, y descuidan el papel de la mayoría de otros genes. Además, este modelo fue incapaz de evaluar la importancia de la heterogeneidad intratumoral genómico para el desarrollo y progresión del tumor. Mientras tanto, los estudios recientes han dado lugar a la creación de otro modelo, denominado modelo de evolución clonal [7], [9], [10]. En este modelo, un solo clon se desarrolla en varias subpoblaciones distintas a través de la acumulación de diversas anomalías genéticas. La población predominante puede ser sustituido por distintas subpoblaciones dentro de una sola masa tumoral a través de los efectos de la presión de selección del medio ambiente y /o la etapa de progresión del tumor. Como consecuencia, varias poblaciones de células genéticamente heterogéneas pueden coexistir dentro de una sola masa tumoral. Evidencia de la heterogeneidad genética intratumoral asociado con la evolución clonal se ha obtenido de una variedad de tumores sólidos, incluyendo cáncer de próstata [14], el esófago de Barrett [31], cáncer de ovario [32], [33], cáncer de cuello uterino [34], cáncer de mama [15], [35], el neuroblastoma [36], el cáncer de páncreas [13], [37], y el cáncer colorrectal [38]. Curiosamente, en un estudio de cáncer de próstata metastásico letal, no CNA relaciona específicamente con el sitio de la metástasis se han encontrado [14]. Del mismo modo, en un estudio de carcinoma de ovario seroso de alto grado, no había evidencia de una relación entre la adquisición de la resistencia a cisplatino y CNA específicos [39]. Estos resultados sugieren que el modelo de la tumorigénesis de varios pasos, en el que las aberraciones específicas juegan un papel importante en el desarrollo y progresión del tumor, no siempre representan la forma en que los tumores adquieren su carácter maligno. En el presente estudio, que inicialmente la hipótesis de que la adquisición de la CNA (s) específica podría ser importante para la invasión submucosa. Sin embargo, no hemos podido encontrar ningún CNA que eran más frecuentes en los SM que en la muestra MU emparejado. Por otra parte, también se observó ninguna diferencia significativa en cuanto al número de CNA en las porciones MU y SM pareadas. Sin embargo, encontramos que la mayoría de SMGCS se compone de subpoblaciones clonalmente-relacionados, pero genéticamente distintos, lo que sugiere que la evolución clonal puede ocurrir durante la progresión del cáncer gástrico. Tomados en conjunto, aunque el número de casos examinados fue limitado, nuestros resultados sugieren que la generación de subpoblaciones genéticamente diferentes en lugar de adquisición de CNA específica en la parte MU puede ser importante para el proceso de invasión submucosa. Sobre la base de estos resultados, proponemos un modelo hipotético para el proceso de SM la invasión y la metástasis LN del cáncer gástrico temprano (Figura 6). Para confirmar esta hipótesis, se necesitan más estudios con muestras más grandes.

Nuestros datos indican que SMGCS se componen de subpoblaciones genéticamente heterogéneos son importantes en el contexto de la investigación sobre el cáncer gástrico y el tratamiento, debido a la heterogeneidad del tumor hace que el desarrollo de medicamentos eficaces difíciles. Desde CNA genómicas tienen un impacto sobre los perfiles de expresión de genes en diferentes tipos de cáncer [16], [21], [40], [41], [42], [43], es posible que cada una de las subpoblaciones genéticamente distintas dentro de un solo tumor puede diferir tanto en comportamiento biológico y la respuesta a medicamentos contra el cáncer, incluyendo agentes de direccionamiento molecular. Cooke et al. han propuesto que la aclaración de las diferentes subpoblaciones genéticas dentro de un solo tumor que permitiría una terapia eficaz el empleo de un agente específico de orientación una aberración genómico común o agentes combinados de orientación aberraciones genómicas únicas en cada una de las distintas subpoblaciones [39]. Esta estrategia puede también aplicar al tratamiento del cáncer gástrico.

Entre los 23 casos que analizamos, 15 mostraron una relación clonal entre las porciones de MU y SM. Por otra parte, 13 de los últimos 15 casos también mostraron diferencias en CNA entre las dos regiones, lo que sugiere que la evolución clonal se produce con frecuencia en la fase temprana de la carcinogénesis gástrica. La relación entre las muestras pareadas MU y SM en los otros 8 casos sin CNA común sigue siendo poco clara. Dos posibles explicaciones para esto puede ser sugeridos. Una de ellas es que los tumores en las partes pareadas, que no tienen CNA comunes, desarrollado de forma independiente. La otra es que las partes pareadas comparten otros tipos de aberraciones genéticas, tales como mutaciones y translocaciones, que no pueden ser detectados por CGH array. En este último caso, la secuenciación de próxima generación podría ser útil para analizar este tipo de relaciones
.

En este estudio, las ganancias en 11q13, 11q14, 11q22, 14q32 y, en 17q21 y amplificación, fueron más frecuentes en la parte SM de SMGCS metastásicos que en los de SMGCS no metastásicos. Curiosamente, las ganancias en 11q13 y 14q32 están involucrados en los informes, las metástasis hepáticas de cáncer de colon [38]. Por lo tanto, estos datos sugieren que el aumento en 11q13 y 14q32 pueden estar implicados en la metástasis de los cánceres gastrointestinales. El cromosoma 17q21 alberga un potente oncogén, ErbB2. Asociación de la expresión de ErbB2 con las características clinicopatológicas de cáncer gástrico se ha investigado en varios estudios [44], [45], [46], [47], [48], [49]. Sin embargo, la influencia de la sobreexpresión de ErbB2 en LN metástasis difería entre los estudios [44], [46], [47]. En el presente estudio, a pesar del número limitado de SMGCS examinados, todos los que tienen la amplificación y la sobreexpresión de ERBB2 mostraron metástasis en los ganglios linfáticos. Se requieren más estudios usando un mayor número de SMGCS para evaluar la importancia de esta tendencia.

Apoyo a la Información
Figura S1.
casos que muestran ambas aberraciones genómicas comunes y diferentes entre las partes MU y SM. Los paneles de la izquierda muestran patrones comunes de aberraciones genómicas en MU y SM para cada caso. El centro y paneles de la derecha muestran diferentes patrones de aberración genómica entre las dos partes en cada caso
doi:. 10.1371 /journal.pone.0022313.s001 gratis (TIF)
figura S2.
casos que muestran ambas aberraciones genómicas comunes y diferentes entre las partes MU y SM. Se muestran patrones comunes y diferentes de la aberración genómica entre MU y SM para cada caso
doi:. 10.1371 /journal.pone.0022313.s002 gratis (TIF)
Figura S3.
casos que muestran ambas aberraciones genómicas comunes y diferentes entre las porciones SM y Ln. Los paneles de la izquierda muestran patrones comunes de aberración genómica entre SM y LN para cada caso. El centro y paneles de la derecha muestran diferentes patrones de aberración genómica entre las dos partes en cada caso
doi:. 10.1371 /journal.pone.0022313.s003 gratis (TIF)
Tabla S1.
amplificaciones y deleciones recurrentes en SMGCS.
doi:. 10.1371 /journal.pone.0022313.s004 gratis (DOC)

Reconocimientos

Agradecemos a Misuzu Taguchi, Yoko Miyanari y Tsuyoshi Iwao por su excelente asistencia técnica

• PLOS ONE: Significado pronóstico de miR-181b y miR-21 en pacientes con cáncer gástrico tratados con S-1 /oxaliplatino o doxifluridina /oxaliplatino
• PLOS ONE: Oncogénicos CagA Promueve gástrico riesgo de cáncer a través de la Activación de ERK vías de señalización: Una de casos y controles anidados Study