PLoS One: NOD1 és NOD2 genetikai variánsok együtt Risk gyomorrák és prekurzorok egy kínai Population

absztrakt katalógusa

Háttér katalógusa

A genetikai variánsai nukleotid-kötő oligomerizációs domént tartalmazó fehérje (NOD) befolyásolja az eredményét Helicobacter pylori katalógusa ( H katalógusa. pylori katalógusa) fertőzés és gyomorrák kialakulásában. Hogy vizsgálja genetikai variánsai NOD1 katalógusa és NOD2 katalógusa együtt gyomorrák (GC) és prekurzorok a populáció-alapú vizsgálatot végeztek Linqu megyében, Kína. Katalógusa

módszerek katalógusa

TagSNPs a NOD1 katalógusa és NOD2 katalógusa genotipizálása által Sequenom MASS tömb 132 GC, és 1198 alanyok rákmegelőző gyomornyálkahártya-elváltozások, és korrelált a fejlődése gyomor elváltozások 766 alanyoknál követési adatokat. katalógusa

Eredmények katalógusa

Ezek hét tagSNPs, NOD1 katalógusa rs2709800 és NOD2 katalógusa rs718226 jártak gyomornyálkahártya-elváltozások. NOD1 katalógusa rs2709800 TG genotípus hordozók voltak csökkent kockázatával intestinalis metaplasia (IM, OR: 0,53; 95% CI: 0,31-0,92), míg a NOD2 katalógusa rs718226 G allél (AG /GG) kimutatta megnövekedett kockázatot diszplázia (DYS, OR: 2,96; 95% CI: 1,86-4,71) és GC (OR: 2,35; 95% CI: 1,24-4,46). Sőt, additív kölcsönhatás rs718226 és H katalógusa. pylori katalógusa találtak DYS vagy GC szinergizmus index 3,08 (95% CI: 1,38-6,87), illetve 3,99 (95% CI: 1,55-10,22), ill. A nyomon követési adatok azt mutatták, hogy a NOD2 katalógusa rs2111235 C allél (OR: 0,52; 95% CI: 0,32-0,83) és rs7205423 G allél (OR: 0,56; 95% CI: 0,35-0,89) jártak csökkent a progresszió kockázata H katalógusa. pylori katalógusa-fertőzött egyénekben. Katalógusa

Következtetések katalógusa

NOD1 katalógusa rs2709800, NOD2 katalógusa rs718226, rs2111235, rs7205423 és egymásra rs718226 és H katalógusa. pylori
fertőzés kapcsolatban lehet a kockázata a gyomor elváltozások.

bevezető hivatkozás: Li Z-X, Wang Y-M, Tang F-B, Zhang L, Zhang Y, Ma J-L, et al. (2015) NOD1 katalógusa és NOD2 katalógusa genetikai variánsok együtt Risk gyomorrák és prekurzorok a kínai népesség. PLoS ONE 10 (5): e0124949. doi: 10,1371 /journal.pone.0124949 katalógusa

Akadémiai Kiadó: Yifeng Zhou, Medical College of Soochow Egyetem, Kína katalógusa

Beérkezett: január 11, 2015; Elfogadva: március 19, 2015; Megjelent: május 1, 2015 katalógusa

Copyright: © 2015 Li et al. Ez egy nyílt hozzáférésű cikk feltételei szerint terjeszthető a Creative Commons Nevezd meg! Licenc, amely engedélyezi a korlátlan használatát, a forgalmazás és a reprodukció bármilyen adathordozón, feltéve, hogy az eredeti szerző és a forrás jóváírásra katalógusa

Az adatok elérhetősége: Minden lényeges adatot belül a papír és az azt támogató információs fájlokat. katalógusa

Forrás: Ezt a munkát támogatták a Tudományos és Technológiai, Kína [2010DFB30310], Nemzeti Alap Research Program China [973 programot 2010CB529303], és a nemzeti Természettudományi Alapítvány Kína [81171989]. katalógusa

Érdekütközés: A szerzők kijelentették, hogy nem ellentétes érdekek léteznek. katalógusa

Bevezető katalógusa

közel egymillió új gyomorrák (GC) történt világszerte, 42% -uk a Kínában [1, 2]. Kitartó Helicobacter pylori katalógusa ( H katalógusa. pylori katalógusa) fertőzés idéz elő gyomor krónikus gyulladás, ami egy átmenet a normál nyálkahártya krónikus atrophiás gastritis (CAG), majd intestinalis metaplasia (IM) és dysplasia (DYS), és ezt követően növeli a GC [3-5]. A korábbi vizsgálatok során a beavatkozás Linqu megyében, a vidéki területeken, ahol magas mortalitása GC Shandong tartomány Kína [6], jelezte, hogy H katalógusa. pylori katalógusa felszámolása jelentősen csökkentheti annak kockázatát, hogy a GC és a prekurzorok [7-9]. Annak ellenére, hogy a magas előfordulási gyakorisága H katalógusa. pylori fertőzés katalógusa, csak egy kis hányada fertőzött alanyok végül fejleszteni GC [10], ami arra utal, hogy a befogadó genetikai polimorfizmusok, különösen a gyulladással kapcsolatos gének döntő fontosságú szerepet játszanak a gyomorrák karcinogenezissel [11, 12]. Katalógusa

A nukleotid-kötő oligomerizációs domén (NOD) szerű receptorok (NLRs) tartozik evolúció konzervatív mintázat felismerő receptorok (PRRS) család helyüket a citoplazmában. A stimulált exogén kórokozó-asszociált molekuláris mintázatok (PAMP) vagy endogén károsodással összefüggő molekuláris mintázatok (Damps) [13], NLRs indukálhat NF-kB és a MAPK jelátviteli utak aktiválását és expresszióját immunválasz citokinek és kemokinek [14]. Aktiválása NLRs vezetheti veleszületett immunválasz szabályozása adaptív immunválasz, és szintén részt vehet karcinogenezissel keresztül szabályozzák az apoptózist [15, 16]. Katalógusa

két tagja NLRs, nevezetesen NOD1 és NOD2 számoltak be, hogy a kulcsfontosságú szabályozói krónikus infiammation kiváltott H katalógusa. pylori fertőzés katalógusa [17, 18], és hogy kapcsolatban klinikai kimenetelét H katalógusa. pylori fertőzés katalógusa [18]. Bár egyetlen nukleotid polimorfizmusok (SNP) a NOD1 katalógusa és NOD2 katalógusa, mint rs2066842 (P268S), rs2066844 (R702W), rs2066845 (G908R), és rs2066847 (L1007insC) találták, hogy járó kockázat a GC és rákot megelőző elváltozások kaukázusi populációban [19-21], a legtöbb ilyen SNP voltak monomorf a kínai populációban. A bizonyítékok a szövetség között SNP a NOD1 katalógusa és NOD2 katalógusa kockázatával GC vagy rákmegelőző elváltozások a kínai populációban korlátozott. Bár Wang et al. a korrelációs nyolc tagSNPs a NOD1 katalógusa és NOD2 katalógusa kockázatával GC egy kórházi alapú eset-kontroll vizsgálat [22], a kapcsolat a genetikai variánsok NOD1 katalógusa és NOD2 katalógusa, rákmegelőző elváltozások gyomor- és azok alakulását a folyamat gyomor carcinogenesis még nem tisztázott. Így a genomot egyesület tanulmányok vagy tagSNP vizsgálatokban a SNP teljes kódoló régióját NOD1 katalógusa és NOD2 katalógusa a kínai népesség van szükség, különösen a magas kockázatú populációban GC .

1994-ben és 2002-ben indult két randomizált, prospektív vizsgálatok, hogy gátolja a progresszióját gyomor sérülések és GC Linqu megyében [7, 8]. A kiindulási adatok, valamint a nyomon követési információkat lakosság a placebo-karon és a kezeletlen csoportok a két kohorsz adtak nekünk egy egyedülálló lehetőség, hogy vizsgálja meg a szövetség között genetikai polimorfizmusok NOD1 katalógusa és NOD2 katalógusa és alakulását gyomor sérülések, és a lehetséges kölcsönhatások H katalógusa. pylori fertőzés katalógusa.

Módszerek katalógusa

Vizsgálati terv és a népesség katalógusa

Két, egymástól független véletlen beavatkozás vizsgálatok Linqu megyében indult 1994 (kohorsz I bejegyzett a US National Cancer Institute PDQ adatbázist próba szám NCI-OH-95-C-N029; elérhető http://www.cancer.gov/clinicaltrials/) és 2002 (kohorsz II nyilvántartásba HARECCTR0500053 összhangban WHO ICTRP követelmények ) rendre [7, 8]. Minden résztvevő ment endoszkópos szűrés, feltéve vérmintákat kiinduláskor, ismételt endoszkópos vizsgálat az ugyanazon eljárások a próba végén. A részletes információk a vizsgálati populáció, endoszkópos eljárásokat és kritériumokat a gyomor patológia már korábban leírták [7, 8]. Röviden, az egyes tantárgyak, biopsziát vettünk a szokásos helyeken a gyomor és a szövettani eredmények kiértékelését három vezető patológusok pekingi egyetem Cancer Kórház önállóan szerint a frissített Sydney rendszer [23] és Padovo Nemzetközi Osztályozása [24]. Mindegyik biopsziát szerint osztályozott jelenléte vagy hiánya a felszínes gastritis (SG), CAG (enyhe vagy súlyos), IM, határozatlan dysplasia (IndDYS) DYS vagy GC. Minden tárgy jelöltek globális diagnózis alapján a legsúlyosabb diagnózis között bármelyik biopszia. Kiindulási adatok: életkor, nem, dohányzás története, stb minden résztvevő kaptuk standard strukturált kérdőív. Katalógusa

A jelenlegi vizsgálatban az alanyok különböző rákmegelőző elváltozások gyomor kiinduláskor beleértve SG, CAG, IM, IndDYS és DYS voltak véletlenszerűen kiválasztott minden patológia rétegek. Szabványosítása mindkét vizsgálatban alanyok rákmegelőző elváltozások tovább osztályozták SG (311), CAG (306), IM (300), és DYS (303). Emellett összesen 139 GC sem azonosíthatjuk a kiindulási szűrés ideje alatt, illetve nyomon követés időszakában vontunk be. Miután genotipizált a kiválasztott 1359 alanyok 29 közülük kizártak az alacsony DNS-koncentráció, majd ezt követően egy összesen 1330 alanyokat végül vettek részt a vizsgálatban. Közülük 766 alanyok befejezése nyomon követése a placebo-karon a két csoportban kerültek kiválasztásra, hogy értékelje az egyesület közötti genetikai polimorfizmusok a NOD1 katalógusa vagy NOD2 katalógusa és fejlődésének H
. pylori katalógusa -asszociált gyomornyálkahártya-elváltozások (1. ábra). A tanulmány által jóváhagyott intézményi Review Board a pekingi egyetem Cancer Kórház, és minden témában írásos beleegyező nyilatkozatban. Katalógusa

vérminta levételét és DNS-készítményből katalógusa

Egy 5 ml vérmintát gyűjtöttünk minden egyes tárgy hagytuk megalvadni 30 és 40 perc, szobahőmérsékleten, majd centrifugáltuk 965 g-vel 15 percig. A kapott szérumot elválasztjuk fiolákba. A vérrög és a szérum lefagyasztottuk közvetlenül -20 ° C-on, és tároljuk -70 ° C hőmérsékleten fagyasztóban. Nagy molekulatömegű genomi DNS-t izoláltunk vérrög standard proteináz-K emésztés és fenol-kloroform extrakciót a vérminta.

Helicobacter pylori
meghatározás

H katalógusa. pylori katalógusa állapot határoztuk enzim-kapcsolt immunoassay (ELISA) a kiinduláskor és ^{13C-urea kilégzési teszt ( 13C-UBT) után anti- H katalógusa . pylori katalógusa kezelés kohorsz I. és teljes kohorsz II. Részletek a H katalógusa. pylori
antitest vizsgálattal korábban ismertetett [25]. Röviden, a szérum anti H katalógusa. pylori katalógusa IgG és IgA szinteket mértünk külön, két példányban ELISA eljárásokat. Minőségellenőrzési mintákat vizsgáltak a Vanderbilt Egyetemen, Nashville, TN. Az egyén úgy gondolták, hogy pozitívnak H katalógusa. pylori fertőzés katalógusa ha az átlagos optikai sűrűség sem az IgG vagy IgA > 1,0, a cut-off érték alapján H katalógusa. pylori katalógusa negatív személyek és referenciaszérumokkal. Katalógusa}

A tárgyak kohort II H katalógusa. pylori katalógusa állapot határoztuk ^{13C-UBT kiinduláskor 2002 Részletek az 13C-UBT leírták korábbi közlemények [26]. Röviden, miután a kiindulási mintákat a kilégzett CO _{2 gyűjtemény, résztvevő ezután kérte, hogy igyon 20 ml vízben egy pirulát 80 mg 13C-karbamid (min. 99 atom% 13C). A kilégzett CO 2 gyűjtjük mintavevő csövek 30 perc múlva. 13CO 2 értékeket meghatároztuk gáz izotóp arány tömegspektrométer, és minden koncentráció 13CO 2 30 perc, amely meghaladta a kiindulási koncentráció legfeljebb négy részből 1000 (> 0,4 %) úgy tekintették, mint a pozitív eredményt. katalógusa}}

TagSNPs kiválasztás és genotípus-katalógusa

TagSNPs a NOD1 katalógusa és NOD2 katalógusa géneket választott tervezhető készlet közös SNP a minor allél frekvencia (MAF) több mint 0,05 genotipizált a han kínai (CHB) populáció mintáit HapMap Project (HapMap adatok Rel 27 PhaseII + III Feb09, az NCBI B36 szerelés dbSNP B126). Alkalmazása Haploview szoftver 4.2-es verzió (elérhető: http://www.broadinstitute.org/scientific-community/science/programs/medical-and-population-genetics/haploview/) A páros kapcsolódási egyenlőtlenség (LD) r ^{2 ≥ 0,80, 16 tagSNPs (7 tagSNPs az NOD1 katalógusa és 9 tagSNPs az NOD2 katalógusa) kezdetben vontak be a kísérleti tanulmány, amely lefedte a teljes gént és 5k bp kiterjesztés 5'-szegélyező és 3'-határoló. a tervezés során, vagy Hardy-Weinberg okokból 2 tagSPNs (rs2709800 és rs2907749) rögzítése 28 out of 47 (59,5%) SNP a NOD1 katalógusa, és 5 tagSNPs (rs718226, rs1077861, rs2111235, rs3135500 és rs7205423) rögzítése 18 a 24-ből (75,0%) SNP a NOD2 katalógusa vontak be a végső elemzés (S1 táblázat).}

a genotípus végeztük KPS Biotechnology Co., Ltd. (Peking, Kína) által Sequenom MassARRAY rendszer (Sequenom, San Diego, CA, USA). az összesen 10 ng genomiális DNS-t izoláltunk a perifériás vér limfociták az egyes vizsgálati alanyok használták genotípus. Ismétlődő teszteket végeztünk 5%, a minták egyre egyezés mértéke 100%. Genotyping primerek mind a hét SNP bemutatott S2 táblázatban. katalógusa

Statisztikai módszerek katalógusa

a Pearson-féle χ katalógusa ^{2 próbával összehasonlítani a megoszlása ​​nem, dohányzási, H katalógusa. pylori fertőzés katalógusa a különböző gyomornyálkahártya-elváltozások vagy evolúció csoportok, míg Kruskal-Wallis, vagy a Wilcoxon-tesztet használjuk tesztelés korkülönbség. A Hardy-Weinberg a genotípus eloszlás tesztelték a jóságát fit χ katalógusa 2 teszt referencia csoportban (SG tárgyak). Az evolúció státusza gyomornyálkahártya-elváltozások egyes személyekre sorolható progresszió-csoport, nincs változás csoport vagy regresszió csoport a korábban leírtak szerint a globális kórszövettani diagnózis változások kezdetén és végén [27]. Katalógusa}

Odds értékeket (OR ) és a 95% -os konfidencia intervallum (CI) számoltuk ki feltétlen logisztikus regressziós kockázatának értékelésére gyomornyálkahártya-elváltozások vagy evolúció összefüggő SNP valamint gén- H katalógusa. pylori katalógusa együttes hatásának kiszűrésével potenciális zavaró. Multiplikatív gén- H katalógusa. pylori katalógusa kölcsönhatások mértük köztük fő hatása a változókat és termékek, mind a logisztikus regressziós modell likelihood ratio. És adalékanyag gén- H katalógusa. pylori katalógusa kölcsönhatást vizsgáltuk a hozzávetőleges varianciabecsléshez a szinergia-index és a 95% -os [28]. Ha az érték P katalógusa < 0,05 értéket tekintettük statisztikailag szignifikánsnak. Az összes statisztikai elemzést végezte Statistical Analysis System software (9.2 verzió; SAS Institute, Cary, NC). Katalógusa

Eredmények katalógusa

Az összesen 1330 személy (727 férfi és 603 nő), az átlagos életkora 48,54 ± 8,69 év alapvonal bevonásra, beleértve a 297 alanyok SG, 299 CAG, 300 IM, 302 DYS és 132 GC, ill. 766 alanyok követési adatokat, 240 volt progresszió, 194 volt regresszió és 332 maradt változatlan. Az eloszlás az életkor, a nem, a dohányzás és a H katalógusa. pylori fertőzés katalógusa állapot szignifikánsan különbözött a gyomor elváltozás csoportok ( P katalógusa < 0,01). Az átlagéletkor a GC esetben idősebb volt SG kontrollok (53,83 ± 9,89 vs. 47,56 ± 8,32), és az arányok a férfiak (76,52% vs. 58,25%), a dohányzás (62,12% vs. 44,44%) és a H katalógusa. pylori fertőzés katalógusa (76,52% vs. 32,66%) magasabb volt GC ellentétben SG. A kohorsz design, csak H katalógusa. pylori katalógusa fertőzési állapot megmutatta statisztikai különbség alakulása csoportok. Részletes információk a önkénteseknél az 1. táblázatban felsorolt ​​katalógusa

Az egyesületek közötti hét tagSNPs a NOD1 katalógusa (rs2709800 és rs2907749) és a NOD2 katalógusa (rs718226, rs1077861, rs2111235 , rs3135500 és rs7205423) a kockázatok a GC és a prekurzorok értékeltük feltétlen logisztikus regressziós modell az életkor, a nem, a dohányzás és a H katalógusa. pylori fertőzés katalógusa állapotát. Figyelembe SG csoport referenciaként kockázatokat rákmegelőző elváltozások és GC korrelált az NOD1 katalógusa rs2709800 G allél, de csak TG genotípus IM alanyok elérte a statisztikai szignifikancia (OR: 0,53; 95% CI: 0,31-0,92) . Mert NOD2 katalógusa, rs718226 AG genotípus (OR: 2,50; 95% CI: 1,28-4,88), illetve kombinált AG + GG genotípus járó kockázat GC (OR: 2,35; 95% CI: 1,24-4,46) . A G allélja rs718226 is társult kockázati rákmegelőző elváltozások gyomor azonban a statisztikai szignifikancia csak figyeltek DYS csoportban. Témák hordozó AG genotípus tapasztalt 2,79-szor magasabb kockázata DYS (OR: 2,79; 95% CI: 1,71-4,55), és az alanyok GG genotípus vagy G allél hordozók, a kockázat DYS volt 3,33 (OR: 4,33; 95 % CI: 1,38-13,60), illetve 1,96 (OR: 2,96; 95% CI: 1,86-4,17) szer nagyobb, mint kontroll volt. (2. táblázat) hotelben

Vizsgáltuk továbbá az esetleges közös hatások és kölcsönhatások a NOD1 katalógusa rs2709800 vagy NOD2 katalógusa rs718226 és H katalógusa. pylori katalógusa fertőzés kockázatát gyomor elváltozások (3. táblázat). Mivel NOD1 katalógusa rs2709800 G allél találtak csökkenésével jár kockázatát gyomor sérülések, vettünk H katalógusa. pylori katalógusa negatív SG tárgyak szállító TG vagy GG genotípus referenciaként. Kockázatok gyomornyálkahártya-elváltozások szignifikánsan magasabb volt, akiknél a TT genotípus és H katalógusa. pylori fertőzés katalógusa, a legkülső régiók voltak 2,71 (95% CI: 1,27-5,78) a CAG, 11,06 (95% CI: 5,31-23,06) az IM, 8,16 (95% CI: 3,92-16,96) az DYS és elérte 11,38 (95% CI: 4,04-32,06) GC, ill. Hasonlóképpen, összehasonlítva NOD2 katalógusa rs718226 AA genotípus és H katalógusa. pylori katalógusa negatív betegek, H katalógusa. pylori katalógusa fertőzött G allélt hordozók tapasztalt több mint 20 dob nagyobb kockázatot DYS (OR: 25,23; 95% CI: 11,37-55,59) és GC (OR: 29.66; 95% CI: 11,18-78,69). Egy additív kölcsönhatás NOD2 katalógusa rs718226 G allél és a H katalógusa. pylori fertőzés katalógusa találtak DYS vagy GC, a szinergizmus index 3,08 (95% CI: 1,38-6,87), illetve 3,99 (95% CI: 1,55-10,22), ill. Katalógusa

A relatív progressziójának kockázatát vagy regressziót hét tagSNPs függetlenül képest progresszió (nincs változás és regresszió), vagy nem regresszió (nincs változás és progresszió) betegen észlelt. Amint azt a 4. táblázat mutatja, az életkor, a nem, a dohányzás, H katalógusa. pylori katalógusa állapotát, és az alapvonal patológia, NOD2 katalógusa rs2111235 és rs7205423 csatlakoztak a progresszió kockázata. Témák hordozó rs2111235 TC genotípus (OR: 0,64; 95% CI: 0,44-0,92), illetve C allél (OR: 0,71; 95% CI: 0,50-0,99), és akiknél rs7205423 CG genotípus (OR: 0,69; 95% CI: 0,48-0,98) volt csökkent kockázatát progresszió. Azonban nincs összefüggés ezek között tagSNPs regressziós találtak. Katalógusa

A kockázatok progresszió kapcsolódó két SNP tovább vizsgálták a rétegzés kiindulási patológia vagy H katalógusa. pylori fertőzés katalógusa állapotát. Mivel néhány alanyok SG (N = 55), ebben kohorszvizsgálatban és csak 6 a 144 DYS tárgyak végül előrehaladtával vizsgáltuk közötti összefüggések tagSNPs és kockázatai progresszió CAG és IM rétegek. Ebben CAG csoportban, összehasonlítva a NOD2 katalógusa rs2111235 TT genotípus, a progresszió kockázata körülbelül a fele volt csökkent alanyoknál TC genotípus (OR: 0,51; 95% CI: 0,30-0,89), illetve C allél (OR: 0,58 95% CI: 0,35-0,90). Progressziójának kockázatát csak foglalkozni H katalógusa. pylori katalógusa pozitív csoportban. H katalógusa. pylori katalógusa pozitív betegek NOD2 katalógusa rs2111235 C allél (TC + ​​CC) és a NOD2 katalógusa rs7205423 G allél (CG + GG) fordult elő csökkent progressziójának kockázatát, a legkülső régiók voltak: 0,52 (95% CI: 0,32-0,83) az rs2111235 és 0,56 (95% CI: 0,35-0,89) az rs7205423 volt (5. táblázat). katalógusa

Vita katalógusa

Ebben populáció-alapú vizsgálat, megvizsgáltuk a szövetség között a testület hét tagSNPs NOD1 katalógusa és NOD2 katalógusa gének kockázatait GC és rákmegelőző gyomornyálkahártya-elváltozások, valamint azok alakulását. Ahhoz, hogy a legjobb tudásunk szerint, ez az első tanulmány hatások vizsgálata genetikai polimorfizmusok NLR gének kockázatát gyomor sérülések és fejlődése gyomor elváltozások a kínai lakosság nagy a kockázata a GC. Katalógusa

NOD1 és NOD2 kifejezve az epiteliális és az antigén-prezentáló sejt felismerő peptidoglikán-eredetű peptidek specifikusan [29, 30], döntő fontosságú lehet a H
. pylori katalógusa összefüggő folyamat gyulladás és karcinogenitás [15, 18, 31-33]. Több, mint kifejezése NOD1 és NOD2 találtak humán sejtvonalakban megtámadni H
. pylori katalógusa CAG PAI-pozitív törzsek [34, 35]. NOD1 aktiválás lehet, elengedhetetlen indukcióját mindkét NF-kB és az AP-1 aktiváció során H
. pylori
fertőzés bevonásával a transzlokáció az NF-kB és az AP-1-komplexek a sejtmagba [18], míg a NOD2 volt szükség indukciója gyulladás citokin pro-IL-1β H
. pylori katalógusa fertőzött sejtekben [36]. Ezért polimorfizmust a két gén befolyásolhatja következményei H katalógusa. pylori
kiváltott krónikus gyulladás és a további kapcsolódnak kockázatát gyomor elváltozások.

Ebben a vizsgálatban, egy intron variáns rs2709800 a NOD1
azt találtuk, hogy mérsékelten járó kockázat gyomor elváltozások. Alanyok TG genotípus alacsony kockázata IM képest TT genotípus. Bár nem funkcionális vizsgálatok ezen polimorfizmus jelentett korábban, azt jósolták, hogy a G allél variáns összefüggésben lehet nonszensz közvetített mRNS bomlás (NMD), amely okozhat alacsony kifejeződése NOD1. Ezért a G allél hordozók nagyobb valószínűséggel alacsony NOD1 kifejezés utáni állapot fertőzött H katalógusa. pylori katalógusa, ami azt eredményezheti, alacsony NF-kB által közvetített gyulladást a gyomor hámban és következésképpen lehetnek kapcsolatosak kisebb a kockázata a gyomor elváltozások, mint a T allélt hordozók. Ugyanakkor az egyesületek igényeket érvényesíteni kell a funkcionális vizsgálatok. A nonsynonymous variáns neve rs2075820 (E266K) NOD1 katalógusa gént először kimutatni a kísérleti tanulmány. Azonban, mivel nincs statisztikai szignifikancia volt megfigyelhető, azt kizártuk a további vizsgálat ebben a vizsgálatban.

Bár több funkcionális variánsok NOD2
mint például rs2066842 (P268S), rs2066844 (R702W), rs2066845 (G908R), és rs2066847 (L1007insC) vizsgáltak a kaukázusi populációban [19-21], SNP számoltak monomorph a kínai népesség HapMap adatbázisban. A mi munkánkban alkalmazott tagSNP stratégiát, amely az egész sorozata NOD2 katalógusa, és megállapította, rs718226 AG vagy GG genotípus fokozott kockázatával jár a GC vagy DYS. Az rs718226 található 3 'közel régió NOD2 katalógusa, valószínűleg részt utáni transzkripció szabályozása. További vizsgálatot kell végezni, hogy felfedje a funkcionális jelentősége. Katalógusa

Tekintettel a potenciálisan funkcionális jelentősége a NOD1 katalógusa vagy NOD2 katalógusa és H katalógusa. pylori fertőzés katalógusa [29], mi is érdekli a lehetőség kölcsönhatás és együttes hatása között NOD1 katalógusa vagy NOD2 katalógusa polimorfizmus és H katalógusa. pylori fertőzés katalógusa. Szignifikáns együttes hatásait H katalógusa. pylori fertőzés katalógusa és NOD1 katalógusa rs2709800 vagy NOD2 katalógusa rs718226 a kockázata gyomor sérülések és additív kölcsönhatás NOD2 katalógusa rs718226 és H katalógusa. pylori fertőzés katalógusa. Bár a pontos mechanizmus a H katalógusa. pylori katalógusa -asszociált karcinogenezissel nem tisztázott, indokolt lehet, hogy ezek a polimorfizmusok befolyásolhatják poszt transzkripciós szabályozása NOD2, ligand elismerése, vagy aktiválása veleszületett immunválasz [29, 37]. Következésképpen fokozott szekréciója a gyulladáskeltő citokinek miatt tartós H katalógusa. pylori fertőzés katalógusa, felerősítette a krónikus gyulladás és végül hozzájárultak a GC. Katalógusa

A bél típusú GC véljük a végeredmény többlépcsős átmeneti gyomornyálkahártya évek alatt a krónikus gyulladás stressz és CAG egy viszonylag gyakori H katalógusa. pylori katalógusa -asszociált gyulladásos állapot és fontos lehet a gyomor karcinogenezis [38]. Ebben a vizsgálatban a NOD2 katalógusa rs2111235 TC genotípus találták csökken a kockázata a progresszió CAG alanyokon és H katalógusa. pylori katalógusa fertőzöttekéhez. Az rs2111235 egy intron a változat és a C allél az előrejelzések társított NMD, ami csökkentheti a kifejezés a NOD2
és szekréciója proinflammatorikus citokinek keresztül NF-kB útvonal után H
. pylori fertőzés katalógusa. Ezért CAG alanyok rs2111235 C allél alacsonyabbak lehetnek a gyulladás intenzitását után H katalógusa. pylori fertőzés katalógusa alsó és progressziójának kockázatát. Katalógusa

A SNP NOD2 katalógusa rs7205423 található intergénrégióba a NOD2 katalógusa, és a CYLD
gén, egy de-ubiquitinating enzim aktiválásának gátlása az NF-kB [39, 40]. A vizsgálat során megfigyelték, hogy a NOD2 katalógusa rs7205423 G allél negatívan korrelált progressziójának kockázatát a H katalógusa. pylori katalógusa fertőzött alanyok, ami összhangban volt a másik összehasonlító vizsgálatban GC esetben kontrollokat a kínai populációban [22]. A G allélja rs7205423 lehet egy összeillesztési helyet [22], azonban további funkcionális vizsgálatokra van szükség. Két SNP nevű rs2907749 és rs3135500 is találtak összefüggést a kockázata GC korábban [22], de ez a két SNP nem nyert statisztikai különbség GC és ellenőrzéseket a jelen tanulmányban. A vizsgálati populáció választott kohorszvizsgálatban egy olyan területen, nagy a kockázata a GC talán hozzájárulhat a különbséget. Ezen túlmenően, a különbségek a patogenezisében a diffúz és bél típusú GC lehet szintén egy lehetséges magyarázata, hogy az ellentmondás. Az egyesület között rs2907749 és kockázatát GC csak foglalkozni a diffúz típusú esetek Wang tanulmány [22], míg a legtöbb GC esetet találtak, intesztinális típusú a korábbi tanulmányok Linqu megyében [41]. Következésképpen, egy másik érvényesítő tanulmány, amely több GC esetekben van szükség. Katalógusa

Kihasználva a hosszú távú követés csoportban, szisztematikusan elemezni SNP NOD1 katalógusa és NOD2 katalógusa kapcsolódó azzal a kockázattal jár a GC. Ez a populáció-alapú vizsgálat kialakítása lehetővé tette számunkra, hogy vizsgálja meg az SNP-spektrum rákmegelőző elváltozások gyomor és tárja fel a kapcsolatot az SNP-k és fejlődése gyomor elváltozások a folyamat GC fejlődését. Ugyanakkor a tanulmány arra is vannak korlátai. Mivel nagyon kevés a normális gyomor nyálkahártyáját a lakosság körében, amit csak a kiválasztott alanyok SG kontrollként okozhat alulbecsült közötti társulás SNP-k és kockázatát gyomor elváltozások. Különben is, korlátozza a 132 GC észlelt esetek Eddigi korosztályok egy olyan területen, nagy a kockázata a GC megnövelt homogenitását vizsgálati populáció. Ugyanakkor a relatív kis minta GC ebben a tanulmányban felhív egy független eset-kontroll vizsgálat, beleértve egy megfelelő kontroll csoport, valamint több GC esetben. Hasonlóképpen, akiknél követési adatokat ebben a vizsgálatban résztvevő csak kiválasztott placebo karon beavatkozás nélkül, amely lehetővé tette, hogy nem áll rendelkezésre, hogy elemezzék a lehetséges kölcsönhatásokat a kezelések között, mint a fokhagyma pótlás, és SNP-k a progresszió gyomor elváltozások. Sőt, ahogy átvette a címkézés SNP stratégia funkcionális jelentősége az újonnan azonosított polimorfizmusok beleértve NOD2 katalógusa rs718226, rs2111235 valamint rs7205423 a H katalógusa. pylori katalógusa -asszociált gyomor carcinogenesis korlátozott, és tovább kell pontosítani. Katalógusa

Összefoglalva, ebben a populáció-alapú vizsgálat találtunk NOD1 katalógusa rs2709800 és NOD2
rs718226 jártak kockázata rákmegelőző elváltozás gyomor- vagy GC. Ezen kívül jelentős additív kölcsönhatás NOD2 katalógusa rs718226 és H katalógusa. pylori
fertőzés volt megfigyelhető, ami arra utal, hogy a genetikai és környezeti tényezők hozzájárulnak a etiológiája GC együtt. A tanulmány azt is megállapította két SNP NOD2 katalógusa (rs2111235 és rs7205423) korrelált a progresszió kockázata gyomor elváltozások, különösen a H katalógusa. pylori katalógusa fertőzött népesség, jelezve SNP szolgálhat potenciális kockázat markerek GC megelőző gyakorlatok. További vizsgálatok a nagyobb minta együtt funkcionális vizsgálatok szükségesek, hogy erősítse meg ezeket a megállapításokat. Katalógusa

alátámasztó információk
S1 táblázat. Tag és foglyul SNP NOD1 és NOD2 gén. Katalógusa doi: 10,1371 /journal.pone.0124949.s001 katalógusa (DOCX) hotelben S2 táblázat. Genotyping primerek SNP NOD1 és NOD2 gén. Katalógusa doi: 10,1371 /journal.pone.0124949.s002 katalógusa (DOCX) hotelben

• PLoS One: ATOH1 képes szabályozni a tumorképző gyomorrák sejtek indukálva differenciálása Cancer Stem Cells
• PLoS One: Kockázati tényezők a kórházi felvételek után Radical gastrectomián gyomorrák: előretekintő tanulmány