PLoS ONE: Analyse von deregulierten microRNAs und ihrer Zielgene in Magenkrebs

Abstrakt

Hintergrund

MicroRNAs (miRNAs) sind weit verbreitet nicht-kodierenden RNAs untersucht, die die Genexpression modulieren. MiRNAs sind in verschiedenen Tumoren, einschließlich Magenkrebs (GC) dereguliert und haben mögliche diagnostische und prognostische Bedeutung. Das Ziel unserer Studie war es miRNA Profil in GC Gewebe zu bestimmen, durch Auswertung von deregulierten miRNAs im Plasma von GC Patienten gefolgt. Mit verfügbaren Datenbanken und bioinformatische Methoden wir auch potentielle Zielgene bestätigt unterschiedlich exprimiert miRNA zu bewerten sollen und diese Erkenntnisse in GC Gewebe zu validieren.

Methoden

Die Studie 51 GC Patienten eingeschlossen und 51 Kontrollen. Zunächst abgeschirmt wir miRNA-Expressionsprofil in 13 Gewebeproben von GC und 12 normalen Magen-Gewebe mit TaqMan niedriger Dichte Array (TLDA). In der zweiten Stufe differentiell exprimierte miRNAs wurden in einer Replikationskohorten Verwendung qRT-PCR in Gewebe- und Plasmaproben validiert. Anschließend analysierten wir mögliche Zielgene von deregulierten miRNAs Bioinformatik-Ansatz, bestimmt deren Expression in GC Geweben und Korrelationsanalyse durchgeführt mit miRNAs Targeting.

Ergebnisse

• PLoS ONE: Vorhersage-Modell für Magenkrebsinzidenz in der koreanischen Population
• PLoS ONE: Rollen von DPY30 in der Proliferation und Motilität des Magen-Krebs Cells