PLoS ONE: polymorphismes et un haplotype dans HEPARANASE associations génétiques avec la progression et le pronostic du cancer gastrique dans une population chinoise du Nord

Résumé

Contexte

héparanase humaine joue un rôle important dans le développement du cancer et des polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) dans le gène héparanase (de HPSE) se sont révélés être en corrélation avec le cancer gastrique. La présente étude a examiné les associations entre les SNP individuels ou haplotypes dans HPSE et de la sensibilité, des paramètres clinicopathologiques et le pronostic du cancer gastrique dans un large échantillon de la population Han dans le nord de la Chine.

Méthodologie /Principales constatations

L'ADN génomique a été extrait des échantillons de tissus fixés au formol paraffine normale à partir de 404 patients gastriques et du sang de 404 témoins sains. Six SNP ont été génotypés par désorption /ionisation laser à temps de vol spectrométrie de masse assistée par matrice. Un chi-carré (χ2) essai et de régression logistique inconditionnelle ont été utilisés pour analyser le risque de cancer de l'estomac; un test Log-rank et Cox modèle des risques proportionnels ont été utilisés pour produire des analyses de survie et une méthode de Kaplan-Meier a été utilisée pour cartographier les courbes de survie. Les taux moyens de génotypage de succès étaient plus de 99% dans les deux groupes. Haplotype CA dans le bloc composé de rs11099592 et rs4693608 avait une plus grande distribution dans le groupe de types Borrmann 3 et 4 (P = 0,037), le groupe d'un plus grand nombre de métastases des ganglions lymphatiques (N3 vs groupe N0, P = 0,046), et d'ailleurs a été corrélé à une faible survie (CG vs CA: HR = 0,645, IC à 95%: 0,421 à 0,989, P = 0,044). En outre, les génotypes rs4693608 AA et rs4364254 TT ont été associés à une faible survie (P = 0,030, HR = 1,527, IC à 95%: 1,042 à 2,238 pour rs4693608 AA; P = 0,013, HR = 1,546, IC à 95%: 1,096 à 2,181 pour rs4364254 TT). Il n'y avait pas de corrélation entre les SNP ou haplotypes individuels et le risque de cancer de l'estomac.

Conclusions /Importance

Un haplotype fonctionnel dans HPSE a été trouvé, qui comprenait les importants rs4693608 SNP. SNP dans HPSE jouent un rôle important dans la progression du cancer de l'estomac et à la survie, et peut-être peut-être un marqueur moléculaire pour les valeurs de pronostic et de traitement

Citation:. Li AL, Song YX, Wang ZN, Gao P, Miao Y, Zhu JL, et al. (2012) polymorphismes et un haplotype dans HEPARANASE associations génétiques avec la progression et le pronostic du cancer gastrique dans une population chinoise du Nord. PLoS ONE 7 (1): e30277. doi: 10.1371 /journal.pone.0030277

Editeur: Masaru Katoh, National Cancer Center, le Japon

Reçu: 13 Octobre 2011; Accepté 12 Décembre 2011; Publié 20 Janvier, 2012

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