PLoS ONE: sovraespressione di nucleare che induce l'apoptosi Fattore 1 alterato la proteomica profilo di Human cancro gastrico delle cellule MKN45 e indotti Cell Cycle arresto in G1 /S Phase

Estratto

Nucleare fattore che induce l'apoptosi 1 (NAIF1) è stato precedentemente segnalato per indurre apoptosi. Inoltre, l'espressione di NAIF1 era significativamente down-regolato nei tessuti di cancro gastrico umano rispetto ai tessuti normali adiacenti. Tuttavia, il meccanismo con cui il gene NAIF1 induce apoptosi non è completamente conosciuto. I nostri risultati mostrano che NAIF1 è stata minimamente espresso in tutte le linee di cellule di cancro gastrico testati. I nostri dati dimostrano anche che NAIF1 è localizzata nei nuclei delle cellule, come rilevato dal monitoraggio della fluorescenza verde della proteina di fusione NAIF1-GFP usando la microscopia confocale a fluorescenza. Successivamente, un approccio di proteomica comparativa è stato utilizzato per identificare l'espressione differenziale delle proteine ​​tra linee di cellule di cancro gastrico MKN45 /NAIF1 (-) e MKN45 /NAIF1 (+). Abbiamo trovato cinque proteine ​​(proteasoma 26S subunità 2, proteasoma 26S subunità 13, NADH deidrogenasi Fe-S proteina 1, chaperonin contenente TCP1 subunità 3 e tioredossina reduttasi 1) che erano up-regolati e tre proteine ​​(ribonucleasi inibitore 1, 14-3- 3 proteine ​​Epsilon isoforma e binding protein apolipoproteina aI) che sono stati down-regolato nelle cellule MKN45 overexpressing NAIF1. Abbiamo anche scoperto che NAIF1 potrebbe indurre l'arresto del ciclo cellulare in fase G1 /S, modificando l'espressione di proteine ​​del ciclo cellulare cyclinD1, cdc2 e p21. Le proteine ​​differenzialmente espresse identificate qui sono legati a diversi programmi cellulari che coinvolgono ciclo cellulare, apoptosi, e la regolamentazione di trasduzione del segnale e suggeriscono che NAIF1 può essere un soppressore del tumore nel cancro gastrico. La nostra ricerca fornisce la prova che chiarisce il ruolo di come funzioni NAIF1 nel carcinoma gastrico

Visto:. Yang M, Zhong J, Zhao M, Wang J, Gu Y, X Yuan, et al. (2014) sovraespressione di nucleare che induce l'apoptosi Fattore 1 alterato la proteomica profilo di Human cancro gastrico delle cellule MKN45 e indotti Cell Cycle arresto in G1 /S fase. PLoS ONE 9 (6): e100216. doi: 10.1371 /journal.pone.0100216

Editor: Rossella Rota, Ospedale Pediatrico Bambino Gesu ', Italia |

Ricevuto: October 27, 2013; Accettato: 23 MAGGIO 2014; Pubblicato: 13 Giugno 2014

Copyright: © 2014 Yang et al. Questo è un articolo ad accesso libero distribuito sotto i termini della Creative Commons Attribution License, che permette l'uso senza restrizioni, la distribuzione e la riproduzione con qualsiasi mezzo, a condizione che l'autore originale e la fonte sono accreditati

Finanziamento:. Questa ricerca è stato sostenuto dal Programma nazionale di ricerca di base chiave della Cina (2007CB914700). I finanziatori avevano alcun ruolo nel disegno dello studio, la raccolta e l'analisi dei dati, la decisione di pubblicare, o preparazione del manoscritto

Competere interessi:.. Gli autori hanno dichiarato che non esistono interessi in competizione

Introduzione

cancro gastrico è una delle neoplasie più comuni nel mondo causando circa l'8% e il 10% dei casi di cancro e di decessi annuali, rispettivamente. Secondo il rapporto epidemia a livello mondiale dalla Organizzazione Mondiale della Sanità, quasi un milione di casi di cancro gastrico e 738.000 decessi si stima che si sono verificati nel 2008 [1], [2]. Molti sforzi sono stati presi in clinica; tuttavia, la mortalità dei pazienti affetti da cancro gastrico è ancora alto come il 70% [2]. Una ragione di questo alto tasso di mortalità è che i malati di cancro gastrico sono spesso non diagnosticata fino a quando la fase avanzata, che è troppo tardi per fornire un trattamento efficace. Quindi, vi è una evidente necessità di trovare nuovi bio-marcatori e strategie efficaci per la diagnosi precoce e il trattamento del cancro gastrico.

La proteomica è stato utilizzato in molte aree di ricerca, tra cui la ricerca sul cancro. campioni comuni in analisi proteomica per la ricerca sul cancro comprendono tessuti e sangue di pazienti affetti da cancro, così come le linee di cellule di cancro con differenti sfondi o diversi trattamenti [3] - [6]. Queste analisi proteomica sono stati usati per indagare l'origine e lo sviluppo del cancro o per cercare biomarker diagnostici. I risultati che abbiamo ottenuto con metodi di proteomica sono non solo a causa della regolamentazione diretta di livello trascrizionale, ma riflettono anche modificazioni post-traduzionali delle proteine ​​[3], [7]. Pertanto, siamo in grado di analizzare sia l'espressione e la regolazione della proteina con analisi proteomica. Nonostante un sacco di tecniche emergenti, elettroforesi 2-dimensionale accoppiata alla spettrometria di massa è rimasto il metodo più utilizzato per l'analisi proteomica.

Il fattore che induce l'apoptosi nucleare gene codificante umana 1 (NAIF1) si trova sul cromosoma 9q34.11 . NAIF1 codifica una proteina con un Myb
-come dominio nella sua regione N-terminale [8], [9]. Studi precedenti hanno dimostrato che la sovraespressione di NAIF1 in linee cellulari tumorali umane HeLa e MKN45 induce apoptosi [8], [10]. . Inoltre, Luo et al
scoperto che NAIF1 è significativamente espresso in tessuto gastrico normale, mentre la sua espressione è down-regolato o perso nei tessuti di cancro gastrico ( P <
0,001). Inoltre, l'espressione NAIF1 è stata maggiore nei ben differenziato ( P
= 0,004) rispetto a cancro gastrico moderately- o scarsamente differenziate [10]. Tuttavia, il ruolo di NAIF1 nella regolazione del profilo di espressione proteica cellulare è sconosciuta.

Nel presente studio, abbiamo utilizzato la tecnologia proteomica basato su elettroforesi 2-dimensionale combinata con MALDI-TOF spettrometria di massa per identificare le proteine ​​associate alla funzioni biologiche di NAIF1. I profili di espressione proteica della linea di cellule di cancro gastrico, MKN45 con o senza NAIF1 sovraespressione sono stati analizzati e confrontati con 24 centimetri di pH immobilizzato gradiente di pH (IPG) strisce 3-10 gamma NL. Per convalidare questi dati, abbiamo misurato i livelli di espressione di RNA di tutte le proteine ​​espresse in modo diverso e tre proteine ​​sono state ulteriormente verificata mediante western blotting. I nostri risultati dimostrano che NAIF1 induce arresto del ciclo cellulare in G1 fase /S, regolando i livelli di espressione di cyclinD1, cdc2 e proteine ​​p21. I risultati del nostro studio potrebbero portare ad una migliore comprensione di come funziona NAIF1 nell'indurre l'apoptosi e può anche far luce sulla diagnosi e la terapia dei tumori gastrici in futuro.

Materiali e Metodi

Colture cellulari e trasfezione

linee di cellule di cancro gastrico umano MKN45, BGC823, AGS e SGC7901 sono stati ottenuti dal Tumor Cell Bank di cinesi Accademico delle scienze mediche e coltivate in mezzo essenziale minimo liquido Dulbecco (DMEM) supplementato con 10% inattivato al calore siero fetale bovino (FBS), 100 IU /ml di penicillina, 100 ug /ml di streptomicina a 37 ° C in un umidificata al 5% CO _{2 atmosfere. trasfezione del DNA è stata effettuata utilizzando il reagente di trasfezione X-tremeGENE HP DNA (Roche, Svizzera) in base alle istruzioni del produttore.}

plasmidi di espressione

I plasmidi di espressione pEGFP-N1-NAIF1, che esprime una NAIF1-GFP proteina di fusione, e pEGFP-N1, che esprime la proteina fluorescente verde (GFP), è stato gentilmente fornito dal Dr. Qing Luo [10].

ciclo cellulare distribuzione analisi

in crescita esponenziale cellule sono state trasfettate con il vettore pEGFP-N1 o il plasmide pEGFP-N1-NAIF1. Le cellule sono state raccolte a 24 ore o 48 ore dopo la trasfezione, e 1 × 10 ^{6 cellule sono state lavate due volte con soluzione salina tamponata con fosfato (PBS) e fissate con 4% paraformaldeide a 4 ° C per 1 h. Dopo la centrifugazione, il pellet cellulari sono stati risospesi in soluzione colorante (0,05 mg /ml di ioduro di propidio (PI), 0,2 mg /ml RNasi, e 0,1% Triton X-100) a 4 ° C per 15 minuti al buio. Citometria a flusso di analisi per la GFP e PI è stata effettuata utilizzando un analizzatore di cellule BD LSR II (BD, San Jose, CA, USA). PI fluorescenza è stata misurata tra la popolazione di cellule positive GFP e la distribuzione dei cicli cellulari sono stati analizzati utilizzando il software ModFit LT3.2. Tre campioni separati sono stati preparati e tutti i saggi sono stati eseguiti in triplicato.}

Quantificazione dell'apoptosi

La quantificazione di apoptosi è stata effettuata utilizzando il PE annessina V apoptosi Detection Kit I (BD). Brevemente, BGC823 o MKN45 cellule sono state trasfettate con il vettore pEGFP-N1 o il plasmide pEGFP-N1-NAIF1. Dopo 24 ore o 48 ore dopo la trasfezione, sono state raccolte le cellule, lavate con PBS freddo due volte e poi ri-sospese con tampone assorbente (10 mM Hepes /NaOH (pH 7,4), 140 mM NaCl, 2,5 mM CaCl _{2) . Le cellule risospese sono state incubate con ficoeritrina (PE) coniugato Annessina V (AV) e 7-Amino-actinomicina (7-AAD), e poi misurata mediante citometria a flusso utilizzando l'analizzatore cellule BD LSR II. Quattro distinte popolazioni cellulari potrebbe essere rilevato in un dot-plot: cellule vitali (AV ^{- /7-AAD -), cellule apoptotiche fase precoce (AV + /7-AAD - ), le cellule apoptotiche in ritardo-fase (AV + /7-AAD +), e le cellule necrotiche (AV - /7-AAD +). Un minimo di cellule positive 10.000 GFP sono stati contati per campione e il dato è stato segnalato come la percentuale di cellule apoptotiche (AV + /7-AAD - e AV + /7-AAD + ) tra le cellule totali. Tre preparati campioni indipendenti sono state fatte e tutte le analisi sono state ripetute in triplice copia.}}

confocale a scansione

Quarantotto ore dopo la trasfezione, le cellule sono state lavate tre volte con PBS e fissate con paraformaldeide al 4% per 15 min. a temperatura ambiente. Per migliorare la permeabilità della membrana cellulare, le cellule sono state incubate con 0,5% Triton X-100, seguito da incubazione con 4 ', 6-diamidino-2-fenilindolo (DAPI) per macchiare i nuclei. distribuzione cellulare di NAIF1 è stato analizzato monitorando la fluorescenza verde della proteina di fusione NAIF1-GFP utilizzando un microscopio Leica Microsystems Heidelberg GmbH.

preparazione di proteine ​​per 2-DE

Per ogni campione, 5 × 10 ^{6 cellule sono state raccolte e lisati in 1 ml di tampone di lisi (7 M urea, 2 M tiourea, 2% CHAPS, 20 mM DL-ditiotreitolo (DTT), 1 mM phenylmethylsulfonylfluoride (PMSF), 30 mM di sodio fluoruro, e 0,25 mg /ml RNaseA) per 1 ha temperatura ambiente, e poi centrifugato a 4 ° C per 30 min. a 12.000 rpm. Il surnatante è stato trasferito in una nuova provetta e concentrato con 0,1 M NH _{4COOH. Lysis Buffer inserito in un volume finale di 800 ml, e la concentrazione di proteine ​​è stata determinata con un saggio Bradford (Tiangen, Pechino, Cina).}}

bidimensionale elettroforesi

elettroforesi bidimensionale è stato eseguito come [5] descritto in precedenza. In breve, 1 mg di proteine ​​è stato diluito a 450 ml con tampone di reidratazione (7 M urea, 2 M tiourea, 2% CHAPS, e 20 mm DTT). strisce IPG (IPG, 24 cm, pH 3-10, NL, GE Limit.) sono state reidratate con i campioni reidratati per 18 ore a temperatura ambiente. Le proteine ​​sono stati sottoposti a isoelettrofocalizzazione con un Ettan IPGphorIII (GE, CT, USA) successivamente per 1 ora a 100 v, 1 ora a 250 v, 1 ora a 500 v, 1 ora a 1000 V, 1 ora a 3000 V, 1 h a 5000 v, 2 ore a 8000 v e 6 ore a 8000 v per ottenere un totale di 80 KVH. Dopo la focalizzazione isoelettrica, strisce IPG sono stati equilibrati con equilibrante buffer I (6 M urea, 150 mM Tris-HCl (pH 8,8), 30% glicerolo, 2% SDS, 1% DTT) per 15 min. seguita da una seconda incubazione con un altro tampone equilibratore II (6 M urea, 150 mM Tris-HCl (pH 8,8), 30% glicerolo, 2% SDS, 2,5% iodoacetamide) per 15 min. La seconda dimensione della SDS-PAGE è stata effettuata con il 12,5% gel SDS-PAGE utilizzando i sei sistemi verticali Ettan DALT (GE).

Gel colorazione e immagine analisi

La SDS-PAGE gel sono state fissate nel fissare-buffer (10% CH _{3COOH, 40% C 2H 5OH, e il 50% DDH 2O) per 30 minuti. I gel sono stati poi lavati in DDH 2O per 10 min. 3 volte e colorati con Coomassie blu G-250.}

I gel sono stati sottoposti a scansione con uno scanner di immagini utilizzando il software MagicScan per valutare i modelli pronti. software ImageMaster platino (versione 5.0) è stato impiegato per analizzare le immagini del gel. Le macchie che sono stati osservati sia sul gel di controllo e gel NAIF1 stati analizzati e l'intensità di ciascun punto è stata quantificata calcolando il volume loco dopo normalizzazione dell'immagine gel. L'analisi quantitativa delle immagini gel (tre repliche /campione) sono state prese e macchie con differenze statisticamente significativo (t-test, * P
< 0,05). sono stati asportati e digerito per l'identificazione

Proteine identificazioni

differentemente espressi spot proteici sono stati estratti e de-macchiati in 50 mM NH _{4HCO 3 /acetonitrile (50/50) e asciugati per centrifugazione a vuoto. I pezzi di gel sono stati poi digeriti con 10 ng /ml tripsina (Promega, WI, USA) in 50 mM NH 4HCO 3 tampone a 37 ° C durante la notte. Il liquido tripsina è stato trasferito in una provetta pulita, diluita con 100 ml 60% acetonitrile /0,1% acido trifluoroacetico, e trattata con ultrasuoni per 15 minuti, tre volte. Tutto il liquido acquisito è stato raccolto e essiccato sotto vuoto e conservato a -80 ° C. I peptidi eluiti sono stati analizzati utilizzando un Bruker Ultraflex MALDI-TOF /TOF equipaggiato con la fonte SCOUT da BGI-Pechino. I risultati di spettro di massa sono stati in contrasto contro le sequenze di mammiferi dal database NCBInr (non ridondante) per l'identificazione peptide mass fingerprinting.}

RNA Isolation, RT e Real-time PCR Q

L'RNA totale è stato estratto usando il reagente TRIzol (Invitrogen) secondo il protocollo del produttore. cDNA è stato sintetizzato mediante trascrizione inversa utilizzando 1 mg di RNA totale con oligo (dT) _{18 primer e M-MuLV trascrittasi inversa (Takara).}

Per la retromarcia trascrizionale PCR, primer per NAIF1 e β-actina erano come segue: NAIF1 senso, 5'- AGCCACGGTCACCCTGACACA-3 ', e anti-senso, 5'- CGTGTCTGCATGCTGGGCCAT-3'; senso beta-actina, 5'- GGGCACGAAGGCTCATCATT-3 ', e anti-senso, 5'-AGCGAGCATCCCCCAAAGTT. Tutti i primer sono stati progettati utilizzando NCBI esplosione e acquistati da Sangon, Pechino
.

PCR quantitativa è stata eseguita con il kit di SYBR Green qPCR (Takara, Giappone) con un sistema di reazione di 20 microlitri istituito in base alle istruzioni del produttore. espressione del gene bersaglio è stato analizzato utilizzando appropriati real-time qPCR primer (Tabella 1). β-actina è stata utilizzata per la normalizzazione. Il tempo reale qPCR è stata eseguita su un cycler ABI7300 (ABI, MA, USA) con le seguenti condizioni: denaturazione per 30 s a 95 ° C, seguiti da 40 cicli di denaturazione per 5 s a 95 ° C, ed estensione per 31 s a 60 ° C. Melting analisi della curva è stata eseguita alla fine di convalidare la specificità del prodotto atteso PCR. Espressione relativa è stato calcolato utilizzando i due metodi curva standard. Tre campioni indipendenti sono stati preparati per ogni condizione e ogni esperimento è stato eseguito in triplice copia.

Western Blotting

Western blotting è stata eseguita come descritto in precedenza. Brevemente, 2 × 10 ^{6 cellule sono state raccolte con flusso medio, pellettato mediante centrifugazione per 5 minuti a 500 g
, e lavato 3 volte con PBS. Le cellule sono state lisate con 100 microlitri di buffer di lisi (50 mM Tris-HCl, pH 7.4, 150 mM NaCl, 1,5% NP-40, 0,1% SDS, e 50 ug /PMSF ml, con appena aggiunto cocktail inibitore della proteinasi) su ghiaccio per 30 min. Lisati sono stati centrifugati a 13.000 rpm per 15 min. e la concentrazione proteica è stata misurata usando metodi Bradford. Cinquanta microgrammi proteine ​​è stato separato il 12% SDS-PAGE e trasferite su membrane di polivinilidene difluoruro. Le membrane sono state bloccate con il 5% di BSA in TBST per un'ora a temperatura ambiente seguita da incubazione con soluzioni anticorpo primario in base alle istruzioni del produttore (β-actina, 1:5000, Sigma, NAIF1, 1:1000, Santa Cruz; 14- 3-3 ε, 1:500, Santa Cruz; TCP1-γ, 1:1000, Abcam; TXNRD1, 1:1000, Abcam; CyclinD1, 1:1000, CST, cdc2, 1:500, CST, e p21, 1 :500, CST). Le membrane sono state lavate 3 volte con TBST, seguita da incubazione con appropriati anticorpi secondari per due ore a temperatura ambiente. I segnali sono stati rilevati utilizzando il sistema ECL chemiluminescenza. β-actina è stato impiegato come controllo.}

Analisi statistica

Tutte le analisi statistiche sono state effettuate utilizzando SPSS 13.0 software (SPSS Inc., Chicago, IL, USA). I dati sono stati espressi come media ± SD. t-test di Student è stato utilizzato per confronto statistico. Un valore associato di P <.
0.05 è stato considerato significativo

Risultati

transfettati NAIF1 localizzato nel nucleo

Sia invertire trascrizionali PCR e occidentali esperimenti blotting ha dimostrato che NAIF1 è stata minimamente espresso in linee cellulari di cancro gastrico, MKN45, BGC823, AGS, e SGC7901; considerando NAIF1 fu facilmente rilevato quando è stato trasfettato nelle cellule (Figura 1A. e B). Abbiamo trasfettato una costruzione fusione NAIF1-GFP in MKN45 e BGC823 cellule e un vettore GFP è stato utilizzato come controllo. La microscopia confocale dimostrato che quando le cellule sono state trasfettate con il costrutto pEGFP-N1-NAIF1, fluorescenza verde è stata rilevata in nuclei; al contrario, il segnale flurescent verde è stato rilevato durante l'intera cella quando trasfettate con il vettore di GFP (Fig. 1C). Gli stessi risultati sono stati osservati anche in altre linee cellulari quali BGC823 (Figura S1). Questi risultati confermato che transfettate proteina NAIF1 è localizzata nel nucleo.

NAIF1 indotta arresto del ciclo cellulare in G1 fase /S

Il profilo del ciclo cellulare delle cellule di cancro gastrico sotto l'effetto di NAIF1 è stata studiata Il prossimo. cellule GFP-positive sono stati analizzati per garantire la popolazione corretta è stata utilizzata (figura S2). analisi citofluorimetrica dimostrato che NAIF1 indotto un significativo cambiamento nella distribuzione del ciclo cellulare: un aumento della popolazione di cellule nella fase G0 /G1 e una diminuzione nella fase S è stato osservato in cellule che sovraesprimono NAIF1 rispetto alle cellule trasfettate con il vuoto vettore, entrambi dopo trasfezione 24 he 48 h. Come mostrato nella Figura. 2A, citometria a flusso rivelato che 24 ore dopo la trasfezione, circa il 54% del BGC823 cellule trasfettate con pEGFP-N1 vettoriale erano in fase G0 /G1, e il 34% e il 12% delle cellule erano in fase S e G2 di fase /M, rispettivamente, . D'altra parte, in BGC823 cellule trasfettate con il pEGFP-N1-NAIF1 costruiscono c'è stato un netto aumento della percentuale di cellule in G0 /fase G1 (74%), così come una diminuzione della percentuale di cellule in fase S (26%) e fase G2 /M (0%). Quarantotto ore dopo la trasfezione, circa il 36% delle cellule di controllo BGC823 erano in G0 /fase G1 e 59% e il 5% delle cellule sono in fase S e G2 /M di fase, rispettivamente. In BGC823 cellule trasfettate con il pEGFP-N1-NAIF1 costruiscono, circa il 55% delle cellule erano in G0 /fase G1 e 37% e l'8% delle cellule erano in fase S e G2 /M di fase, rispettivamente. In MKN45 cellule, 24 ore dopo la trasfezione, circa il 56% delle cellule trasfettate con il vettore pEGFP-N1 erano in G0 /fase G1, e il 29% e il 15% delle cellule erano in fase S e G2 /M di fase, rispettivamente. Circa il 76% dei MKN45 cellule trasfettate con il costrutto pEGFP-N1-NAIF1 erano in fase G0 /G1, e le percentuali di cellule in fase S e G2 /M fase erano diminuite al 24% e 0%, rispettivamente. Quarantotto ore dopo la transfezione, circa il 43% delle cellule di controllo MKN45 erano in G0 /fase G1, e 43% e il 14% delle cellule erano in fase S e G2 /M di fase, rispettivamente. In MKN45 cellule trasfettate con il pEGFP-N1-NAIF1 costruiscono, circa il 56% delle cellule erano in G0 /fase G1, e il 28% e il 16% delle cellule erano in fase S e G2 /fase M, rispettivamente (Figura. 2B). Questi risultati dimostrano chiaramente che l'iperespressione di NAIF1 indotta arresto del ciclo cellulare in G1 /S fase cellule di cancro gastrico BGC823 e MKN45.

Per chiarire il meccanismo attraverso il quale NAIF1 indotto l'arresto del ciclo cellulare, abbiamo esaminato i possibili ruoli di cyclinD1 , p21 e CDC2 proteine, che sono importanti nella regolazione del ciclo cellulare in fase G1 /S. Quarantotto ore dopo la trasfezione, i livelli di espressione di cyclinD1 e cdc2 sono diminuiti rispetto alle cellule di controllo, sia nelle cellule BGC823 e MKN45. Inoltre, i livelli di espressione di p21 sono stati aumentati (fig. 2C).

comparata analisi proteomica della linea di cellule di cancro gastrico MKN45 con o senza espressione extra di NAIF1 proteine ​​

I profili proteici di MKN45 cellule trasfettate con il pEGFP-N1-NAIF1 costruisce il gruppo trattato o con il vettore pEGFP-N1 come gruppo di controllo sono stati misurati mediante 2-DE 48 ore dopo la trasfezione. In totale, più di 700 punti sono stati risolti, di cui 11 proteine ​​era > 1,5 volte differenziale espressa come determinato da analisi con ImageMaster versione 5.0. Gli spot proteici differenzialmente espressi sono stati asportati dal gel, e 8 proteine ​​sono state identificate mediante MALDI-TOF /TOF. Rappresentante trattati e gruppo di controllo mappe gel 2-DE sono mostrati in figura. 3A e gli spot proteici differenzialmente espressi sono contrassegnati. Megascopic 2-DE immagini gel di ciascuno dei punti proteici differenzialmente espressi sono rappresentati in figura. 3B e 3C. Cinque delle proteine ​​erano up-regolati nel gruppo trattato compresa NADH deidrogenasi (ubichinone) Fe-S proteina 1 (NADUSF1), chaperonin contenente TCP1 subunità 3 (TCP1-γ), tioredossina 1 (TXNRD1), proteasoma 26S subunità 2 ( PSMC2) e del proteasoma 26S subunità 13 (PSMD13). 3 proteine ​​sono state down-regolato, tra cui l'inibitore della ribonucleasi 1 (RNH1), proteina 14-3-3 epsilon isoforma (14-3-3 ε) e apolipoproteina A-I binding protein (APOAIBP). La tabella 2 illustra le informazioni specifiche su queste proteine ​​e il loro livello di espressione differenziale.

Validazione delle proteine ​​differenzialmente espresse

Real-time qPCR e western blotting sono state eseguite per verificare la 2-DE risultati. livelli di espressione genica delle proteine ​​identificate sono stati analizzati mediante real-time qPCR e sono in linea con i risultati 2-DE, ad eccezione di una proteina, 14-3-3ε (Figura. 4A). Tre proteine ​​sono stati selezionati in base alla loro importanza e le funzioni possibili per ulteriori analisi mediante western blotting per verificare i risultati 2-DE. I risultati mostrano che i livelli di espressione della proteina di TXNRD1 e TCP1-γ sono risultati significativamente aumentati nel gruppo NAIF1 rispetto al gruppo di controllo ( P
< 0,05), mentre il livello di espressione della proteina di 14-3-3ε era significativamente diminuita nel gruppo NAIF1 ( P <
0,05) (Figura 4B.). Nel complesso, i risultati Western Blot sono in linea con i risultati della 2-DE

Discussione

Diversi studi sono stati condotti per descrivere il gene NAIF1.; tuttavia, poco si sa circa il profilo NAIF1 proteomica è sovraespresso. Lo scopo del presente studio è stato quello di rilevare e identificare le proteine ​​la cui espressione viene modificata in cellule MKN45 overexpressing NAIF1. Inoltre, la prova è fornita per spiegare come NAIF1 funzioni indurre l'apoptosi delle cellule e di altre attività. Una strategia 2-DE è stato impiegato in questo studio per la sua comoda metodologia e alta efficienza. In totale, abbiamo rilevato e identificato 5 proteine ​​che sono state up-regolati e 3 proteine ​​che sono stati down-regolato nelle cellule MKN45 overexpressing NAIF1 rispetto al gruppo di controllo. Le proteine ​​identificate implicano una serie di attività fisiologiche, come la degradazione delle proteine, il controllo del redox cellulare omeostasi, progressione del ciclo cellulare, la regolazione del citoscheletro, risposta allo stress cellulare, apoptosi e regolazione del metabolismo. Il profilo del ciclo cellulare delle linee di cellule di cancro gastrico, BGC823 e MKN45 è stato anche studiato, ed i nostri risultati hanno dimostrato che l'iperespressione di NAIF1 può indurre l'arresto del ciclo cellulare in G1 /S fase tramite alterando i livelli di espressione delle proteine ​​di regolazione del ciclo cellulare cyclinD1, CDC2 e p21 .

Risultati da western blotting e invertire trascrizionale PCR ha dimostrato che NAIF1 è stata minimamente espresso in cellule di cancro gastrico. I dati presentati nel presente documento è analoga alla scoperta di Luo nei tessuti [10]. Inoltre, abbiamo confermato che NAIF1 è una proteina nucleare nelle linee di cellule di cancro gastrico MKN45 e BGC823. Dal DNA genomico esiste principalmente nel nucleo, questi dati suggeriscono che NAIF1 può funzionare nel nucleo interagendo con il DNA genomico e nucleoproteina per influenzare l'espressione di geni e proteine ​​completo. Per questo motivo abbiamo effettuato analisi proteomica per indagare il profiling proteomica delle cellule MKN45 overexpressing NAIF1.

regolazione anomala del ciclo cellulare è una caratteristica notevole delle cellule tumorali [11]. Gli studi hanno dimostrato che molte piccole molecole possono attivare i punti di controllo del ciclo cellulare e indurre arresto del ciclo cellulare, che consentono alle cellule per riparare i difetti. Tuttavia, repairation successo può portare ad apoptosi [12] - [15]. I nostri risultati mostrano che NAIF1 induce arresto del ciclo cellulare in G1 /S fase. Transizione da G1 a fase S richiede l'attivazione del gruppo di cyclinD-Cdk4 /6 e ciclina-cdc2 (noto anche come Cdk1). Nel frattempo, p21 inibisce l'attività di cdc2 e media montaggio e l'attivazione di cyclinD-CDK4 /6 nel citoplasma, così come inibendo la loro attività nel nucleo [16]. In questo studio, l'analisi western blotting ha rilevato che i livelli di espressione della proteina di cyclinD1 e cdc2 sono diminuiti, mentre il livello di espressione della proteina di p21 è stata aumentata nelle cellule overexpressing NAIF1. Questi risultati suggeriscono che G1 /S arresto del ciclo cellulare indotta da NAIF1 è mediato attraverso il p21 e via cyclinD1. Inoltre, abbiamo dimostrato che 48 ore dopo la trasfezione, la popolazione di cellule apoptotiche aumentata di circa il 10% in cellule che sovraesprimono NAIF1 a seguito di arresto del ciclo cellulare (figura S3).

proteasoma 26S è un organello conservatore in tutta la cellule eucariotiche ed è responsabile della degradazione delle proteine ​​intracellulari [17]. Le proteine ​​che vengono degradati 26S proteasoma sono coinvolti in una serie di processi biologici che comprendono l'apoptosi, ciclo cellulare e la crescita e la regolazione dell'espressione di molti geni che a loro volta regolano altri processi [18]. Disturbi dell'equilibrio degradazione proteica conduce l'origine e lo sviluppo del cancro. Così, proteasoma 26S è un attraente bersaglio terapia del cancro. Qui, abbiamo scoperto che due subunità del proteasoma 26S, PSMC2 e PSMD13, erano entrambi up-regolati in MKN45 cellule overexpressing NAIF1. PSMC2 e PSMD13 sono subunità del proteasoma 19S, che è la particella normativo (RP) del proteasoma 26S. PSMC2 è un ATPasi mentre PSMD13 è un non-ATPasi. Alcuni ricercatori ritengono che l'inibizione del proteasoma 26S può portare ad apoptosi delle cellule di carcinoma, e inibitori del proteasoma potrebbe essere utilizzato per trattare il cancro [19] - [21]. Tuttavia, uno studio di Tan et al.
Suggerisce che il fattore di necrosi tumorale (TNF) -α attiva il sistema proteasoma 26S con up-regolazione dei livelli di espressione delle subunità 26S proteasoma [22]. TNF-α è una citochina ben noto che può indurre l'apoptosi in un intervallo di celle tumorali, ed ora è utilizzato in clinica come trattamento regionale dei sarcomi dei tessuti molli avanzato a livello locale e melanomi metastasi al fine di evitare di arti amputazione [23]. Come TNF-α, NAIF1 ha anche la capacità di indurre apoptosi, il che implica che il proteasoma 26S può essere coinvolto nel processo di apoptosi indotta da NAIF1.

I nostri dati dimostrano anche che due proteine, TXNRD1 e NDUFS1, sono up-regolata da NAIF1. TXNRD1 regola lo stato redox dei tioli delle proteine ​​nelle cellule di mammifero, e le funzioni sia la promozione e la prevenzione del cancro in diversi tipi di carcinomi [24] - [27]. Non ci sono stati studi per indagare il ruolo di TXNRD1 nel cancro gastrico. A nostro parere, TXNRD1 possa partecipare alla soppressione della gastrico genesi cancro o l'up-regolazione di TXNRD1 può essere un meccanismo di adattamento in risposta allo stress ossidativo generato dalla sovraespressione di NAIF1. Il gene NDUFS1 codifica una subunità 75 kDa Fe-S, che è uno dei sette subunità mitocondriali di complesso I [28]. Ho complesso è il più grande degli enzimi della catena respiratoria e carenza del complesso I è la principale causa di una serie di malattie mitocondriali congenite, come la sindrome di Leigh [29]. Inoltre, il 75 kDa subunità del complesso I è un substrato caspasi, che è coinvolto nella via apoptosi mitocondriale. è richiesto Caspase scissione di NDUFS1 per diversi cambiamenti mitocondriali associati apoptosi, tra cui i livelli di ATP, la produzione di ROS, e la perdita di integrità della membrana plasmatica e così via [30]. Dal momento che NAIF1 induce apoptosi attraverso la via mitocondriale [8], ipotizziamo che l'up-regolazione di NDUFS1 partecipa al processo di apoptosi indotta da NAIF1.

TCP1-γ è stata identificata come un chaperonin nel citoplasma degli eucarioti. Precedenti ricerche hanno trovato che TCP1-γ è significativo espresso nei tumori di carcinoma epatocellulare rispetto ai tessuti tumorali appaiati adiacenti non maligne [31], [32]. Tuttavia, la relazione tra TCP1-γ e il cancro gastrico è ancora sconosciuto e sono necessari ulteriori studi.

D'altra parte, abbiamo identificato tre proteine, 14-3-3ε, RNH1 e APOAIBP, che erano il basso regolato in MKN45 cellule overexpressing NAIF1. 14-3-3 è una famiglia di proteine ​​che consiste di proteine ​​multifunzionali che legano e modulano le funzioni di una vasta gamma di proteine ​​cellulari. Inoltre, partecipano a diversi processi biologici, tra cui regolazione del ciclo cellulare checkpoint, l'apoptosi, e il controllo della crescita cellulare [33]. Diversi studi hanno riportato che l'espressione 14-3-3ε è aumentata nel cancro del polmone, cancro hepatocelluar, cancro al seno e carcinoma a cellule squamose della vulva [34] - [37]. L'unica eccezione a questa maggiore espressione 14-3-3ε è nei tessuti cancro gastrico, dove l'espressione è diminuita [38]. Inoltre, studi precedenti hanno dimostrato che la up-regolazione di 14-3-3ε può impedire l'apoptosi Bad-triggered in cellule endoteliali [39], e farmaci non steroidei anti-infiammatori possono indurre l'apoptosi delle cellule tumorali del colon-retto sopprimendo 14-3- espressione 3ε [40]. Inoltre, uno studio istopatologico ha riferito che in 114 pazienti con carcinoma epatocellulare, elevata espressione di 14-3-3ε era significativamente associato con un alto rischio di metastasi e diminuito i tassi di sopravvivenza [35]. esperimenti cellulari confermato che una maggiore espressione 14-3-3ε induce migrazione delle cellule di carcinoma epatocellulare e promuove la transizione epitelio-mesenchimale (EMT) inducendo Zeb-1 e lumaca espressione [41]. Per concludere, 14-3-3ε è un notevole oncogene che partecipa allo sviluppo di diversi tumori e svolge un ruolo importante nella apoptosi e le metastasi. Qui, abbiamo scoperto che 14-3-3ε è down-regolato in MKN45 cellule overexpressing NAIF1, suggerendo che 14-3-3ε possono essere coinvolti nel processo di apoptosi indotta da NAIF1. Inoltre, i nostri dati implica che oltre ad indurre l'apoptosi e arresto del ciclo cellulare, NAIF1 può svolgere un ruolo nella migrazione delle cellule e metastasi. I nostri risultati dimostrano che i livelli di espressione della proteina di 14-3-3ε sono diminuiti, mentre i livelli di RNA sono stati aumentati. Questi risultati rivelano che NAIF1 regola i livelli di espressione di posttranslationally 14-3-3ε. I nostri dati mostrano i livelli di espressione differenziale di 14-3-3ε sono in contrasto con Leal del [38], che può essere dovuto alla differenza tra cellule e tessuti, o può essere attribuita al bias nella selezione del campione.

RNH1 è una proteina citoplasmatica che inibisce RNasi e forma eterodimeri ad alta affinità con loro di svolgere un ruolo controverso nell'angiogenesi [42]. C'è stato un aumento di studi di ricerca per indagare il rapporto tra RNH1 e cancro.

• PLoS ONE: Epidermal Growth Factor-simili dominio-contenenti proteine ​​7 (EGFL7) Migliora EGF Receptor-AKT segnalazione, epitelio-mesenchimali transizione, e metastasi delle cellule cancro gastrico
• PLoS ONE: il cenno del capo-Like Receptor Segnalazione Via in Helicobacter pylori e correlate cancro gastrico: A Case-Control Study e l'espressione genica Analisi