Stomach Health > Mo. Gesondheet >  > Gastric Cancer > Gastric Cancer

PLOS NËMMEN: MYC Dereguléierung an Gastric Cancer an Seng Clinicopathological Implications

Wat VerfÜgung

Eis Etude ënnersicht d 'Bezéiung tëschent MYC VerfÜgung hire Restaurant an clinicopathological Fonctiounen am gastric Cancers. Mir bewäert den Effet vun MYC VerfÜgung mRNA Ausdrock a sengem FAQ immunoreactivity, souwéi Kopie Zuel Variant, Promoteur DNA methylation, a Punkt kennen, an 125 gastric adenocarcinoma an 67 paried Net-neoplastic Stoffer. Mir gesinn, datt 77% vun de MYC immunoreactivity virgestallt erhéijen déi vill mat fräi mRNA Ausdrock verbonne war ( p VerfÜgung &Si besteet; 0,05). Dës Observatiounen huet mat enger verstäerkter entholl Extensioun an der Präsenz vun Metastasen ( p VerfÜgung &Si besteet; 0,05) assoziéiert. MYC FAQ Ausdrock ass och méi dacks an intestinal-Typ observéiert wéi an diffusen-Typ erhéijen ( p VerfÜgung &Si besteet; 0.001). Zousätzlech MYC VerfÜgung mRNA an FAQ Ausdrock vill mat hire Kopie Zuel verbonne waren ( p VerfÜgung &Si besteet; 0,05). De Gewënn vun MYC VerfÜgung Exemplare goufe mat spéiden-agesat, intestinal-Typ, fortgeschratt entholl Etapp, an der Präsenz vun fernen Metastasen ( p VerfÜgung &Si besteet; 0,05) assoziéiert. A hypomethylated MYC VerfÜgung Promoteur war an 86,4% vun entholl Echantillon fonnt. MYC VerfÜgung hypomethylation war mat diffusen-Typ, fortgeschratt entholl Etapp, déif entholl Extensioun, an der Präsenz vun lymph Node Metastasen ( p VerfÜgung &Si besteet; 0,05) assoziéiert. Desweideren, presentéiert uechtzéng entholl Echantillon mannst ee bekannt stattfannen. D'Präsenz vun MYC VerfÜgung Projet'en war mat diffusen-Typ entholl verbonne ( p VerfÜgung &Si besteet; 0.001). Eis Resultater weisen, datt MYC VerfÜgung Dereguléierung haaptsächlech mat aarmséileg prognostic Fonctiounen verbonne war a Beton och d'Presenz vun verschidden Weeër an intestinal-Typ Équipe an diffusen-Typ gastric carcinogenesis. Sou, eis Conclusiounen hindeit datt MYC VerfÜgung fir Medeziner stratification an hätt eng nëtzlech Bewaacher kann VerfÜgung

Fro:. De Souza Črt, Leal MF, Calcagno DQ, Costa Sozinho R, Borges BdN, Montenegro RC, et al. (2013) MYC VerfÜgung Dereguléierung an Gastric Cancer an Seng Clinicopathological Konsequenzen. PLoS NËMMEN 8 (5): e64420. Doi: 10.1371 /journal.pone.0064420 VerfÜgung

Redakter: Masaru Katoh, National Cancer Center, Japan VerfÜgung

Arnaque: 30. Januar 2013; Akzeptéiert: 12. Abrëll 2013; Publizéiert: 22. Mee 2013 VerfÜgung

Copyright: © 2013 de Souza et al. Dëst ass eng oppen-Zougang Artikel ënnert de Bedingunge vun der Lizenz BY Creative Commons verdeelt, déi bereet benotzen Genehmegungen, Distributioun, an Reproduktioun vun all mëttelgrouss, gëtt d'Original Auteur an d'Quell Kaiser sinn VerfÜgung

Funding:. D'Auteuren sinn ze Conselho nacional de Desenvolvimento Científico E Tecnológico wëllkom (CNPq; CRTdS, AKCRdS, SEBdS, RRB an MdACS) an Fundação de Amparo à Pesquisa Estado de São Paulo (FAPESP; DQC an MFL) maachen datt dës Etude den dënn an fellowships Ënnerstëtzung. D'funders hu keng Roll am Etude Design, Daten Kollektioun an Analyse, Décisioun, oder Virbereedung vun der mëttelalterlech Handschrëft ze publizéieren VerfÜgung

Wettsträit Interessen:.. D'Auteuren hunn deklaréiert, datt keng Competitioun Interessen existéieren VerfÜgung

Aféierung VerfÜgung

Gastric Kriibs ass de véiert heefegsten Typ vu Kriibs a bleift den zweete Spëtzekandidat Ursaach vum Kriibs-Zesummenhang Doud weltwäit [1]. Dëse Kriibs ass normalerweis bei fortgeschratt Etappen festgestallte an der eenzeger curative Therapie verlaangt sinn chirurgesch resection [2]. Soumat ass gastric Kriibs engem schlëmmen ëffentlech Gesondheet Problem vun der Welt. Eng verbessert Versteesdemech vun der Biologie vun dësem Patient ass kritesch a kann nëtzlech sinn Patient Gestioun ze guide, wéi och nei therapeutesch Optiounen ze entwéckelen. VerfÜgung

MYC VerfÜgung ass eent vun de meescht studéiert oncogenes aner aus sengem Veräin mat enger grousser Zuel vu Krankheeten [3]. MYC spillt eng Roll bei verschiddene fundamental Fonctioun vun Zell Biologie, dorënner d'Regulatioun vun Zell Wuesstem an Prolifératioun, ukuerbelt, dat, apoptosis, an angiogenesis (fir review gesinn [4], [5]). Dofir, MYC ass eng integrator vun extracellular an intracellular Signaler, a seng bewosst phenotype ass op Otemschwieregkeeten Standuert hänkt [6], [7]. Net verwonnerlech, Dereguléierung vun MYC Funktiounen dréit zu der entholl phenotype. VerfÜgung

MYC VerfÜgung Dereguléierung wéinst Gentherapie amplification [8], [9], chromosomal br oder Enregistréiere [10], [11] , déi kennen [12], an epigenetic Ännerungen [13], [14], gouf zu verschidden Zorte vun Cancers, virun allem zu gastric Kriibs gemellt. MYC Ausdrock ass oft nik oder am Mënsch neoplasms dereguléierte [4], a schéngt op d'crossroad vun e puer wichteg Weeër a Prozesser an carcinogenesis Équipe ze ginn [15], e Schlëssel Event zu gastric carcinogenesis Wiesen [9]. Virdrun, hien huet eisen Grupp dass MYC VerfÜgung mRNA Ausdrock a kopéieren Zuel hëlt während der mi Schrëtt vun intestinal-Typ gastric carcinogenesis vun engem Net-Mënsch Primaten Modell [16], suggeréiert datt MYC VerfÜgung vläicht implizéiert an gastric entholl Initiatioun an Werdegang. VerfÜgung

d'Verständnis vun MYC VerfÜgung Biologie ass vu primordialer Wichtegkeet hir Roll an der pathogenesis vun gastric Kriibs ze entschlësselen. Bis Datum, gëtt et keng Etude correlating MYC VerfÜgung stattfannen, amplification, FAQ /mRNA Niveauen, a methylation an dëser neoplasia. Hei, évaluéiert mir d'Relatioun tëschent MYC VerfÜgung hire Restaurant an clinicopathological Fonctiounen am gastric Kriibs. Zousätzlech, MYC VerfÜgung mRNA Ausdrock an FAQ immunoreactivity, souwéi verschidde molekulare Mechanismen virdrun Zesummenhang mat sengem Dereguléierung als Kopie Zuel Variant (CNV), stattfannen, an DNA methylation, goufen an der selwechter Formatioun vun gastric Kriibs analyséiert Echantillon. VerfÜgung

spontan a Methode VerfÜgung

IFLA- breakpoint VerfÜgung

All Echantillon mat schrëftlech informéiert Zoustëmmung an Akraafttriede vun der University Hospital (Belém, Para, Brasilien) ethesch review Conseils ofgeleet goufen ( Protokoll Nummer:. 142004) VerfÜgung

Séminairen Echantillon VerfÜgung

125 gastric adenocarcinoma an 67 entspriechend Net-neoplastic gastric Stoffer (Kontroll Echantillon) sech aus Patienten vun den João de Barros Barreto University Spidol kritt surgically vun Para Stat, Brasilien. All Sujeten waren net ze entweder Chimiotherapie oder radiotherapy virum Agrëff ausgesat. Gastric erhéijen sech no Lauren séiert [17] an erhéijen benotzt Standard Critèrë vun TNM Darmstadt haut [18]. D'clinicopathological Fonctiounen an Dësch 1 an 2. VerfÜgung

Leschten entholl a Kontroll uplanzen sech séier gefruer an flëssege Stéckstoff bis Nukleinsaier Offäll gewisen. Aneren Deel vun der selwechter Stoffer war formalin-fix a paraffin Ënnerbewosstsinn. Fir d'unisse zu situ VerfÜgung hybridization (FISH) assay, de Rescht entholl Prouf disaggregated war wéi virdru beschriwwen [19]. VerfÜgung

MYC immunoreactivity VerfÜgung

Immunohistochemical fir MYC FAQ analyséiert goufen standing op 125 formalin-fix, paraffin-Ënnerbewosstsinn entholl Sektiounen. Immunohistochemical staining war no Calcagno standing et al. VerfÜgung [10]. Entholl Otemschwieregkeeten Rubriken (3 oder 4 mm-décke) waren an xylene an rehydrated zu engem graded Serie vun Ethanol deparaffinized. (; Sc-40, Santa Cruz Déi, USA a Zymed®, USA dilution 1:50) No Hëtzt-entschlof epitope retrieval, goufen d'Otemschwieregkeeten Sektiounen mat Primärschoul Maus monoclonal antibody géint MYC incubated. Eng universell peroxidase-conjugated Secondaire antibody Kit (LSAB System, DakoCytomation, USA) war fir d'Detectioun System benotzt. Mir ginn 3,30-diamino-benzidine /H 2O 2 (Dakocytomation, Dänemark) wéi der chromogen an hematoxylin wéi d'counterstain. All nuklear stain mat oder ouni cytoplasmic staining war considéréiert engem positive Resultat ze ginn, onofhängeg vun der Intensitéit. A MYC-positiv Fall war wéi een definéiert fir dës FAQ 10% oder méi entholl Zellen positive mussen. VerfÜgung

Nukleinsaier Extraktioun VerfÜgung

D'Frankräich DNA (gDNA) war mat der QIAamp DNA Mini Kit ofgebaut (QIAGEN, Däitschland) folgenden d'Uweisungen d'Hiersteller. Total RNS war mat Dräilännereck-reagent® (Life Technologies, USA) laut den Hiersteller d'Protokoll ofgebaut. DNA an RNS Konzentratioun an Qualitéit sech mat der NanoDrop spectrophotometer (Kisker, Däitschland) alles. RNS Integritéit war vun gelies electrophoresis (1% agarose gels) alles. All Echantillon waren op -80 ° C bis benotzen gespäichert. VerfÜgung

MYC VerfÜgung mRNA Ausdrock VerfÜgung

mRNA Niveauen vun A quantitate MYC VerfÜgung, total RNS isoléiert war vum 49. vläit normal an entholl Stoffer mat Trizol (Life Technologies, USA). D'RNS war ëmgedréint ausserdeem d'High-Kapazitéit cDNA Archive Kit mat laut den Hiersteller d'Protokoll (Life Technologies, USA). Ergänzen DNA war dann déi real-Zäit Hinnen alleguer Kick mat der TaqMan Ämter kaaft wéi Assays-op-Nofro Produkter fir Gene Expression (Life Technologies, USA) op engem 7500 Fast Real Time Hinnen alleguer (Life Technologies, USA). GAPDH VerfÜgung Gentherapie war wéi eng intern Kontroll fir RNS Input ausgewielt an Transkriptiouns Effizienz ëmgedréint. an intern Kontroll ( GAPDH VerfÜgung: NM_002046.3): All real-Zäit ëmgedréint Transkriptiouns grouss Hinnen alleguer (RT-qPCR) waren an triplicate fir zwou Zil- Gentherapie (Hs00153408_m1 MYC VerfÜgung) gesuergt.

rel quantification (RQ) vun der Gentherapie Ausdrock war no Livak an Schmittgen berechent [20]. Déi entspriechend Kontroll Prouf als calibrator aus all entholl designéierte war. VerfÜgung

MYC VerfÜgung Kopie Zuel VerfÜgung

FISH an qPCR benotzt goufen bis fier MYC VerfÜgung Kopie Zuel zu engem Ziel vun 49 erhéijen, an der Etude vun der Ausdrock benotzt déi selwecht. FISH war no un de Protokoll vu Pinkel standing et al. VerfÜgung [21] mat Modifikatioune vun Calcagno agefouert et al. VerfÜgung [22]. Zellen sech hybridized mat Spektrum Orange VerfÜgung Studiebäihëllefe (LSI Vysis /Abbott Galaxy, IL) fir d' MYC VerfÜgung Gentherapie Regioun (8q24.12-q24.13) a Käre sech counterstained mat 4 ", 6-diamidino-2-phenylindole antifade. Fluorescence war eng Olympus BX41 fluorescence microscope (Olympus, Japan) mat excitation Filtere fir 4 'fonnt benotzt, 6-diamidino-2-phenylindole (260 nm) an rhodamine (570 biergof). Fir all Fall, goufen 200 interphase Käre mat engem ASI Bild Analyse System (Obwuel My Imaging, Israel) analyséieren. Positiv MYC VerfÜgung Gentherapie Signaler wossten wéi rout Flecken an Kären a sech mat der Critèren vun Kohl Faarwen et al. VerfÜgung [23]. Fir misinterpretation verhënneren wéinst technesche Fehler, normal lymphocyte Kären an normal gastric Otemschwieregkeeten als Kontroll benotzt goufen. Fësch Resultater ware wéi de Prozentsaz vun virgestallt MYC VerfÜgung amplification vun enger Zell, an deem mir de Prozentsaz vun Zellen berechent weist 3 oder méi Signaler fir d' MYC VerfÜgung Studiebäihëllefe vun Zell. VerfÜgung

qPCR war mat grouss TaqMan CNV assays gesuergt (Life Technologies, USA) fir d' MYC VerfÜgung Gentherapie (Hs01764918_cn) a fir d'intern Kontroll RNAse P VerfÜgung (Ƹ3326). Multiplex qPCR Reaktioune waren am quadruplicate mat gDNA standing laut den Hiersteller d'Protokoll an Vëlos Konditiounen an 7500 Fast Real-Time Hinnen alleguer (Life Technologies, USA). Der relativer Kopie Zuel war fir all Prouf mat der Copy Ament Software V1.0 (Life Technologies, USA) geschat. Commercial Mënsch gDNAs (G1521 an G1471; Promega, USA) sech fir Eechung benotzt VerfÜgung

MYC VerfÜgung methylation VerfÜgung

D'methylation Muster an Heefegkeet vun de MYC Promoteur sech zu 125 erhéijen an 67 reagéiert Kontroll Echantillon vun duerch-spezifesch Hinnen alleguer (MSP) wéi virdru beschriwwen [24] bewäert. gDNA (2 μg) vun all Echantillon war vun bisulfite Behandlung geännert, unmethylated cytosines zu uracils Ëmrechnung an methylated cytosins dropp [25] geklappt. Spezifësch primers fir den MYC VerfÜgung Promoteur sech wéi follegt zesummen: F5'-TAGAATTGGATTGGGGTAAA-3 'an R5'-CCAACCAAAAATCAACATGAAT-3 "fir d'unmethylated Reaktioune (erwaart Produit Gréisst vun 291 BP); F5'-TAGAATTGGATCGGGGTAAA-3 'an R5'-CGACCGAAAATCAACGCGAAT-3 "fir d'methylated Reaktioune (erwaart Produit Gréisst vun 290 BP), wéi virdru beschriwwen [26]. VerfÜgung

Hinnen alleguer Reaktioune waren mat 0,1 duerchgefouert μmol /L vun dNTPs, 2 μmol /L vun MgCl 2, 0,5 μmol vun primers, 1,25 u vun Taq DNA polymerase, an 100 NG vun bisulfite-geännert DNA. No initial denaturation fir 5 min bei 94 ° C, 40 Monaco um 9 4 ° C fir 45 ass, 52,4 ° C fir 45 ass, an 72 ° C fir 30 den goufen higeriicht, déi vun enger Finale Extensioun duerno fir 5 min bei 72 ° C. Hinnen alleguer Produiten sech op 3% agarose gels an electrophoresed direkt iwwerlaascht. D'gelies huet mat SYBR® Safe DNA gelies Stain (Life Technolgies, USA) Kierchefënster an direkt ënner UV Wiederwelt visualized. Als positiv Kontroll vun all MSP Reaktiounen, war e gDNA Prouf komplett methylated CpG Methylase benotzt (SssI, New England Biolabs, USA) folgenden d'Uweisungen d'Hiersteller. . Ausserdeem, goufen d'primers fir Wildwest-Typ benotzt kompletten Ëmbau vun der DNA an der bisulfite Reaktioun kritt ze kontrolléieren VerfÜgung

Echantillon waren als stratified: 1) Echantillon hypomethylated wann positive amplification Produit nëmmen an der Hinnen alleguer mat spezifesche primers nogewise gouf fir unmethylated Message; 2) hypermethylated Echantillon wou positiv amplification nëmmen an der Hinnen alleguer mat spezifesche primers fir methylated Message fonnt huet; 3) partiell methylated Echantillon wou positiv amplification an der Hinnen alleguer mat den zwee primer baut festgestallt gouf. VerfÜgung

MYC VerfÜgung Genotyping VerfÜgung

Déi dräi exons vun der MYC
Gentherapie sech fir stattfannen Analyse vun all 125 gastric Kriibs Echantillon ausgewielt. Déi folgend primers sech fir Hinnen alleguer amplification an sequencing entworf: Exon 1 F5'-TTTATAATGCGAGGGTCTGGA-3 'an R5'-GCATTCGACTCATCTCAGCA-3 "(erwaart Produit Gréisst vun 654 BP); 2 Exon F5'-CTGCCTCCCGCTTTGTGT-3 'an R5'-TTTGATGAAGGTCTCGTCGT-3 "(erwaart Produit Gréisst vun 423 BP), F5'-TGGGAGGAGACATGGTGAA-3' an R5'-TGCCAATGAAAATGGGAAAG-3" (erwaart Produit Gréisst vun 507 BP); Exon 3 F5'-TGTCCAGAGACCTTTCTAACGTAT-3 'an 5'-CCGTAGCTGTTCAAGTTTGTG-3 "(erwaart Produit Gréisst vun 663 BP), 5'-TGTCCGTCCAAGCAGAGG-3' an 5'-TGATGAAAACAAACAGGGATG-3" (erwaart Produit Gréisst vun 639 BP). VerfÜgung

D'Hinnen alleguer Reaktioune waren mat 0,1 μmol /L vun dNTPs duerchgefouert, 2 μmol /L vun MgCl 2, 0,5 μmol /L vun primers, 1 u vun Taq polymerase, an 100 NG vun DNA. D'Hinnen alleguer ware 95 ° C fir 10 min, gefollegt vun 35 Zykle vun 1 min vun denaturation bei 95 ° C, 1 min vun annealing Temperatur (rangéiert vun 59 bis 61 ° C), an 1 min vun Extensioun bei 72 ° C. D'amplicons sech op eng 2% agarose gelies mat SYBR® Safe DNA gelies Stain (Life Technolgies, USA) an direkt ënner UV Wiederwelt visualized Kierchefënster getrennt. VerfÜgung

Amplicons sech mat de Sanger Method Nepgen [27]. Direct sequencing war mat duerchgefouert der Big Dye® Terminatorv3.1 Cycle Sequencing Kit (Life Technologies, USA) an analyséiert op enger Abi PRISM® 3130 genetesch Organer (Life Technologies, USA) Pop 7 Polymer benotzt. D'zu silico stattfannen Sich war mat der Chromas Pro 1.5 (Technelysium dëss Ltd, Australien) gesuergt. D'Referenz Haaptrei war Gene ID: 4609 (NCBI). Varianten mat manner wéi 1% minor allele Frequenz huet sech gemellt. Pathogenicity vun missense Projet'en war duerch an silico Analyse évaluéieren benotzt PolyPhen (http://genetics.bwh.harvard.edu/pph/) an z (http://sift.jcvi.org). VerfÜgung

statistique Analyse VerfÜgung

MYC VerfÜgung methylation, stattfannen, oder hir Produiten "immunoreactivity Chance Verhältnis (oDER) fir clinicophatological Fonctiounen war vun Logistikzenter Réckgang geschat. Den Alter bei gastric Otemschwieregkeeten probéieren war den covariate am Réckgang Modell definéiert. VerfÜgung

d'Normalitéit vun Verdeelung fir grouss Verännerlechen war vun der Shapiro-Wilk d'Test getest. Daten, déi normalerweis net verdeelt goufen waren (z-stoung Transformatioun) ëmgewandelt eng normal Verdeelung fir Analyse. Analyse vun MYC VerfÜgung mRNA Ausdrock a kopéieren Zuel sech duerch de Generol Linearschrëft Model (GLM) mat Upassung vun Alter, standing wat den Effet Gréisst stellt a observéiert Muecht (OP) vun all Analyse. Den Effet Gréisst fir GLM Analysë op Eta wäissfeldreg war baséiert (η 2), an déi 0,15 an drënner war als klengen Effekt Gréisst alles, 0.16-0.40 als mëttel- Effekt Gréisst, a virun 0,40 als eng grouss Wierkung Gréisst. VerfÜgung

d'Korrelatioun tëscht mRNA Ausdrock a kopéieren Zuel vun de Pearson Test analyséiert huet, an déi e Wäert vun hirer Korrelatioun souguer gemaach ginn (r) drënner 0,30 war als schwaach Korrelatioun alles, 0.30-0.70 als mëttel- Korrelatioun, an iwwer 0,70 als staark Korrelatioun. VerfÜgung

an all Analysë, war d'Vertraue nolauschterer 95% an p VerfÜgung manner wéi 0,05 Wäerter, waren däitlech considéréiert. VerfÜgung

Resultater VerfÜgung

MYC VerfÜgung amplification ass bekannt ze héich FAQ /mRNA Ausdrock vun gastric carcinogenesis [28] Ee Beräich ze ginn, fir déi bescht vun eisem Wëssen, hunn puer Studien opgeféiert ginn d'Roll vun methylation ze beschreiwen an MYC VerfÜgung Projet'en an dësem Prozess. Fir dëst Zil z'erreechen, analyséiert mer 125 Fäll vun deenen 68% Männercher sech an 32% waren Weibercher. Déi heeschen Alter vun eiser Prouf Formatioun huet 62 Joer (Gamme vun 26-89 Joer). E bësse méi héich Frequenz vun intestinal-Typ (56.8%) an Net-cardic (58.4%) erhéijen goufen observéiert (Table 1 an 2). VerfÜgung

MYC nuklear FAQ war positiv an 76,8% (96/125) fonnt vun gastric erhéijen (Dorënner 1). MYC FAQ Ausdrock war méi dacks zu intestinal-Typ wéi diffusen-Typ erhéijen observéiert ( p VerfÜgung &Si besteet; 0,001, ODER = 7,856, CI 95% = 2.803-22.013) (Table 1). (; CI 95% = 1.152-9.315 p = 0,026, ODER = 3.276), déif entholl Extensioun ( p VerfÜgung = 0,045, ODER = 2,975, CI 95% = 1,027 MYC immunostaining war och mat spéiden-agesat assoziéiert -8.623), an der Präsenz vun fernen Metastasen ( p VerfÜgung &Si besteet; 0,001, oDER = 17,682, CI 95% = 3.914-79.882) (Table 1). Futhermore, MYC immunoreactivity war mat fräi mRNA Ausdrock verbonne ( p VerfÜgung = 0,003, η 2 = 0.178, OP = 0.870) an MYC VerfÜgung Kopie Zuel vun FISH ( p VerfÜgung = 0,009, η 2 = 0.139, oP = 0.759) a vun qPCR ( p VerfÜgung = 0,003, η 2 = 0.177, oP = 0.869) (Table 1).

Den Ausdrock Niveau vun MYC VerfÜgung mRNA war héich an all entholl Echantillon wéi hir vläit Kontrollen (RQ = 3,39 ± 0,14; Gamme vun 1.57-5.18). Eng fräi MYC VerfÜgung mRNA Ausdrock huet mat enger verstäerkter entholl Extensioun ( p VerfÜgung = 0,006, η 2 = 0.152, OP = 0.801) verbonnen, Presenz vun lymph Node Metastasen ( p VerfÜgung = 0,023, η 2 = 0.107, OP = 0.632), an fernen Metastasen ( p VerfÜgung &Si besteet; 0,001, η 2 = 0.788, OP = 1) (Table 2 ). Zousätzlech war d'mRNA Niveau direkt un d'soll MYC VerfÜgung Kopie Zuel ( p VerfÜgung &Si besteet; 0,01; r = 0.716). VerfÜgung

Ufank vun MYC
Kopien war an all gastric adenocarcinoma Echantillon vun FISH an qPCR assays fonnt. Vun FISH, war d'mengen Prozentsaz vun Zellen Fotoe MYC VerfÜgung amplification 72,1% (Gamme vun 50 op 83,5% Zellen mat amplification) (Dorënner 2 A a B). Déi heeschen vun MYC VerfÜgung Kopië vun qPCR war 4.5 (Rei 3 bis 9 Exemplairen) (Dorënner 2 C). VerfÜgung

FISH an qPCR Analysë weisen, datt fräi MYC VerfÜgung Zuel Kopie verbonne war mat spéiden-agesat ( p VerfÜgung &Si besteet; 0,001; η 2 = 0.257, OP = 0,976; p VerfÜgung = 0,025; η 2 = 0.103, OP = 0,662 bzw.), intestinal-Typ Kriibs ( p VerfÜgung = 0,037; η 2 = 0.091, OP = 0,557; p VerfÜgung = 0,009; η 2 = 0.139, oP = 0,762, bzw.), an der Präsenz vun fernen Metastasen ( p VerfÜgung = 0,001; η 2 = 0.221, oP = 0,942; p VerfÜgung &Si besteet; 0,001; η 2 = 0.356, OP = 0,999, bzw.). Zousätzlech, MYC VerfÜgung amplification vun FISH war mat fortgeschratt entholl Etappen verbonne ( p VerfÜgung = 0,037; η 2 = 0.091, OP = 0.558), awer nëmmen zwou fréi erhéijen sech zu dësem Ziel vun Echantillon (Table 2) analyséiert. VerfÜgung

All Echantillon gastric Kriibs virgestallt positive amplification mat enger unmethylated primer virbereet. Spannen, ware 86,4% vun Kriibs Echantillon hypomethylated. Op der aner Hand, d'Präsenz vun unmethylated Message um MYC VerfÜgung Promoteur war an 28,4% vun Kontroll Echantillon (partiell methylated Echantillon), proposéiert de Verloscht vun methylation an dës Echantillon (Dorënner 3) observéiert. D'primers d'Spezifizitéit an MSP Resultater ware mat de bisulfite sequencing Hinnen alleguer (BSP) Approche confirméiert [29] zu deem mir zoufälleg fënnef hypomethylated Echantillon ausgewielt; fënnef hypermethylated Echantillon a fënnef partiell methylated Echantillon (Donnéeën net gewisen). MYC VerfÜgung hypomethylation méi war dacks an de diffusen-Typ observéiert als Verglach zu der intestinal-Typ gastric Kriibs ( p VerfÜgung = 0,007; ODER = 8,554; 95% CI = 01.798-40.695, mat diffusen-Typ als Referenz Grupp). Zousätzlech, MYC VerfÜgung hypomethylation mat fortgeschratt entholl Etappen verbonne war ( p VerfÜgung = 0,033; ODER = 6,602; 95% CI = 1.162-37.501), déif entholl Extensioun ( p
= 0,022; oDER = 4,752; 95% CI = 1.257-17.965), an der Präsenz vun lymph Node Metastasen ( p VerfÜgung = 0,032; oDER = 5,12; 95% CI = 1.149-22.814) (Table 1). VerfÜgung

mat Bezuch zu der Gentherapie sequencing, war kee Roman stattfannen an gastric erhéijen fonnt. Dräizéng (10.4%) entholl Echantillon mannst ee bekannt stattfannen virgestallt, mat Varianten op manner wéi 1% minor allele Frequenz. Am Ganzen, goufen 18 Projet'en identifizéiert, mat 4 Echantillon suer- Co-Preretraite kennen. An Exon 1, fënnef mat GG a véier mat CG am rs117856857; um rs73707292 ee mat GG; a véier mat CT um rs4645949. An Exon 2, missense kennen betreffend, harbored zwee erhéijen engem stattfannen um codon 47 geplatzt enger Verännerung vum tyrosine zu histidine (rs114570780; z Cepheid = Liewer; PolyPhen Cepheid = wahrscheinlech mëcht), an zwee um codon 72 geplatzt enger Verännerung vum proline zu serine (rs28933407; z Cepheid = toleréiert; PolyPhen Cepheid = Lupp wahrscheinlech). All entholl mat engem stattfannen an Exon 2 virgestallt een oder zwee bekannt stattfannen an Exon 1. Exon 2 kennen nëmmen an diffusen-Typ erhéijen an fortgeschratt Etapp fonnt goufen. Nee stattfannen war zu Exon 3. D'Präsenz vun bekannt identifizéiert MYC VerfÜgung kennen mat diffusen-Typ erhéijen ( p VerfÜgung = 0,004, ODER = 21,717, 95% CI = 2.678-176.111 verbonne war; mat diffusen-Typ als Referenz Grupp) an der Präsenz vun fernen Metastasen ( p VerfÜgung = 0,032, oDER = 4,492, 95% CI = 1.141-17.679). VerfÜgung

Diskussioun VerfÜgung

d'MYC FAQ huet ronn 15% vun de Genen vun de Mënscherechter Nepgen en Effekt op [30]. Sou, an hire Restaurant MYC Dereguléierung a verschiddene biologescher Weeër an Kriibs Initiatioun an Werdegang Équipe Resultat kann [5]. gouf awer, bis Datum, d 'Relatioun tëschent MYC VerfÜgung hire Restaurant an clinicopathological Parameteren net gutt verstanen hunn. Eis Echantillon virgestallt eng männlech-weiblech Verhältnis vun 2:1 an der Majoritéit vun de Patienten goufen eeler wéi fofzeg-fënnef. Ausserdem war de intestinal-Typ gastric Kriibs méi heefeg wéi den diffusen-Typ an erhéijen sech méi heefeg an Net-Cardia. Dës epidemiological Donnéeë sinn am Aklang mat virdrun Studien [28], [31] -. [33] VerfÜgung

Chromosomal translocations am MYC VerfÜgung nët ass ganz Commun an haematopoietic Cancers. Allerdéngs, an zolitt Mënsch erhéijen wëll gastric Kriibs, MYC VerfÜgung hire Restaurant sinn allgemeng wéinst Gentherapie amplification [34]. Ausserdeem, MYC VerfÜgung ass déi dacks Implikatioune FAQ-coding Gentherapie ganze all Kriibs Zorte [35] zu unerkannt. Am Moment studéieren, observéiert mir dräi oder méi MYC VerfÜgung Gentherapie Kopië vun all gastric erhéijen studéiert, corroborating mat virdrun Studien am primäre gastric erhéijen vun Individuen vun eiser Populatioun [10], [28], [36] - [39], esou wéi och aus Osteuropa Asien an Europa [40] - [42]. Och, MYC VerfÜgung amplification war zu Plasma [43] an am gastric Kriibs Zell Linnen etabléiert an eise Grupp observéiert [44] - [47]. Ausserdeem, déi eis Grupp observéiert datt clonal héich amplification vun MYC VerfÜgung ass manner heefeg an diffusen-Typ wéi zu intestinal-Typ Primärschoul gastric Kriibs [10], [22], [28], an deem Beton war duerch dëser Etude. VerfÜgung

MYC overexpression ass wéi rangéiert vun 15,6% op 100% am primäre gastric Cancers beschriwwen [9]. An kënschtlech VerfÜgung Studie mat Uewerschenkel-verwandelt bewisen MYC Ausdrock vun gastric Kriibs Zell Linnen déi wichteg Roll vun MYC Ausdrock vun gastric entholl Zell Wuesstem, Survival, an den Ënnerhalt vun entholl Zell Parameteren datt zu malignant Potential bäidroen kënnen [48 ]. Desweideren, Mehndiratta et al. VerfÜgung, [49] weisen eng drastesch ofgeholl (40%) an MYC Ausdrock vu béiden mRNA an FAQ a seng afgerappt Ziler siRNA benotzt. VerfÜgung

Am Moment studéieren, 76,8% vun gastric erhéijen zougedréckt MYC immunoreactivity an all erhéijen, intestinal an diffusen Typ, presentéiert Ausdrock fräi mRNA Verglach zu hire vläit Kontrollen. Ausserdeem, observéiert mir dass MYC immunoreactivity a fräi mRNA Ausdrock huet mat enger verstäerkter entholl Extensioun a Präsenz vun Metastasen assoziéiert. Dës Conclusiounen hindeit datt MYC eng Roll an der entholl invasiveness, Metastasen huet, an domat aggressiveness, corroborating enger viregter Etude [37]. Obwuel verschidde Analysë engem klengen Effekt Gréisst virgestallt, sinn dës Experienz och am Accord mat enger viregter Etude vun eisem Grupp an Net-Mënsch hie war sech sécher, an deem mer eng kontinuéierlech Steigerung vun MYC VerfÜgung mRNA Ausdrock bewisen a kopéieren Zuel während der mi Schrëtt vun intestinal-Typ gastric carcinogenesis zu N-Duerch-nitrosourea (MNU) -treated Net-Mënsch hie war sech sécher [16]. Op der aner Hand, all Associatioun tëscht MYC an histological Schouljoer, entholl Standuert, lymph Node Metastasen, oder agebousst Etapp gouf vun engem gastric Kriibs studéieren an enger chinesescher Bevëlkerung [50], verstärkt entwéckelt festgestallt, datt d'Herkunft vun der Tréischterin Bevëlkerung huet vläicht un biologically a klinesch gastric Kriibs subsets [51]. VerfÜgung

Obwuel, Gentherapie amplification net onbedéngt assoziéiert ass oder fir hir overexpression néideg, eiser Etude weist dass MYC immunoreactivity, MYC VerfÜgung mRNA Niveauen, a Zuel Kopie sech direkt soll. VerfÜgung

DNA methylation engem mächtegst Mechanismus vun transcriptional Repressioun ass. Adäquate Frankräich methylation-Musteren ëmmer méi zu Kriibs Zellen verännert: souwuel Iwwerhand (hypermethylation) a Verloschter (hypomethylation) vun methylated Siten observéiert goufen [52], [53]. Hypomethylation um spezifesch Promoteuren kann de aberrant Ausdrock vun oncogenes a Verloscht vun imprinting zu puer loci [44] aktivéieren. Sou wäit, puer Studien diskutéiert der Relatioun tëscht der methylation Muster vun MYC VerfÜgung a seng Wierkung op Gentherapie Ausdrock an op carcinogenic Prozesser. MYC VerfÜgung hypomethylation war virdrun mat der oncogenic Werdegang an Metastasen kopéiert an engem Grenzwäerter Modell vun Liewer Kriibs [54] an am mënschleche colorectal Kriibs Echantillon [55] assoziéiert. [58] an Zell Linnen [48] - Zousätzlech, MYC VerfÜgung hypomethylation war och mat MYC VerfÜgung Ausdrock vun gastric erhéijen [26], [56] assoziéiert. Allerdéngs waren mir kapabel e wesentleche association tëschent MYC VerfÜgung hypomethylation a sengem Ausdrock an eiser Echantillon ze observéieren. Ënnert anere Facteuren, kann dës opgepasst Associatioun zu der Presenz vun wéinst gin MYC VerfÜgung amplification zu all erhéijen mat hypomethylated Promoteuren (86.4% vun Echantillon) an domat, d'méiglech Effet vun dëser epigenetic Modifikatioun baut op MYC VerfÜgung transcriptional Regulatioun. VerfÜgung

Suzuki et al. VerfÜgung [59] awer virdrun, dass en héije Niveau vun hypomethylation eng Luucht vun aarme hätt zu souwuel gastric an Colon Kriibs war, an epigenetic hire Restaurant sech Alter ofhängeg, ier genetesch hire Restaurant occuring. Am Moment studéieren, e puer Kontrollen virgestallt schonn unmethylated Message am MYC VerfÜgung Promoteur. Zousätzlech, hien mir dass MYC VerfÜgung hypomethylation mat enger méi aggressiv phenotype (entholl aggressiveness, Presenz vun lymphnode Metastasen, an histological Zorte vu Kriibs) assoziéiert gouf. Dës Conclusiounen hindeit datt MYC VerfÜgung demethylation während entholl Werdegang ganzt kann an dësem kéint eng gemeinsam Manifestatioun zu gastric carinogenesis ginn [60], [61], well an dësem Mechanismus huet fir aner Genen vun e puer entholl Zorte observéiert ginn [ ,,,0],62], [63]. Wéi scho fir DNA hypermethylation proposéiert [64], kann de Promoteur hypomethylation als eng nei Generatioun vun biomarkers ginn an hält diagnostic an prognostic Versprieche fir clinicians. VerfÜgung

Fir de beschte vun eisem Wëssen, MYC
Gentherapie exons hunn ni zu Mënsch gastric erhéijen komplett Nepgen. Hei, mir Nepgen der dräi exons vun MYC VerfÜgung: Exon 1 ass eng non-coding FAQ, exons 2 an 3 sin FAQ-coding [iwwerpréiwe gesinn (Pelengaris & Khan, 2003)]. Mir hu keng nei stattfannen fannen, awer mir observéiert datt 4 erhéijen missense Projet'en virgestallt (rs114570780 an rs28933407) op Exon 2. Dës kennen an eng verännert conserved Haaptrei vun waren MYC VerfÜgung: d'transactivation public [4] , [65]. Ausserdeem ware souwuel identifizéiert Projet'en wéi wahrscheinlech Lupp no ​​der PolyPhen Software considéréiert. D'Ännerung vun proline zu serine um codon 72 war och als pathogenic Variant am NCBI dbSNP Datebank (http://omim.org/) virdrun gemellt. Soumat kënnen souwuel Projet'en um Exon 2 MYC Aktivitéit zu gastric erhéijen betreffen. Ausserdeem war d'Präsenz vun MYC VerfÜgung kennen mat fernen Metastasen assoziéiert. Mä, si weider Ermëttlungen néideg ze klären wann MYC VerfÜgung Projet'en eng Roll an der metastatic Prozess hunn. VerfÜgung

Laut Lauren klasséieren, ass gastric adenocarcinoma séiert haaptsächlech an intestinal an diffusen Zorte [17]. Intestinal-Typ gastric Kriibs Verlaf duerch eng Rei vu mi Schrëtt, mat atrophic gastritis vun intestinal metaplasia duerno Ufank, intraepitelial neoplasia, an carcinoma [66]. Wéinst dem, den diffusen-Typ et sech meeschtens net aus precancerous lesions [67], [68]. Am Moment studéieren, observéiert mir datt de intestinal-Typ méi heefeg MYC immunoreactivity virgestallt, souwéi eng héich Zuel vun MYC VerfÜgung Exemplare wéi diffusen-Typ erhéijen, déi mat virdrun Studie vun eisem Grupp corroborates [10] , [22], [28], [38]. Zousätzlech, MYC VerfÜgung hypomethylation an Punkt kennen sech méi dacks zu diffusen-Typ observéiert als Verglach zu intestinal-Typ erhéijen. Sou, ënnerstëtzen eis Conclusiounen datt dës zwee histological bestemmt verschidden genetesch Weeër verfollegen an zwee kann z'ënnerscheedde gouffen [67]. VerfÜgung

An Conclusioun, eisen Daten drop hindeit datt MYC VerfÜgung overexpression an Promoteur hypomethylation hutt vläicht eng Roll an der gastric carcinogenesis Prozess. MYC VerfÜgung Dereguléierung verbonne war haaptsächlech aarmséileg prognostic Fonctiounen. Eis Resultater och d'Presenz vun verschidden Weeër stäerken an intestinal-Typ Équipe an diffusen-Typ gastric carcinogenesis. Sou, eis Conclusiounen hindeit datt MYC eng nëtzlech Bewaacher fir Medeziner stratification an hätt kënnen. VerfÜgung

Other Languages