D'epidermal Wuesstem Faktor receptor (EGFR) sécher Passerelle reguléieren Zell Prolifératioun, dat, an Iwwerliewe, an ass oft an esophageal an gastric Cancers dysregulated. Puer Studien hunn iwwerpréift globaalt der Associatioun tëscht germline genetesch Varianten an der EGFR Passerelle a Gefor vun esophageal an gastric Cancers. Baséierend op engem Nepgen-grouss association Etude vun enger Populatioun Han Chinese, iwwerpréift mir 3443 SNPs zu 127 Genen vun der EGFR Passerelle fir 1942 esophageal squamous Zell carcinomas (ESCCs), 1758 gastric Cancers (GCs), an 2111 Kontrollen. SNP-Niveau analyséiert goufen benotzt Logistikzenter Réckgang Modeller gehaal. Mir huelen d'resampling-baséiert Lycée Geleeënheet gekierzt Produit Approche déi gene- an Passerelle-Niveau Associatiounen ze bestëmmen. D'EGFR Passerelle war vill mat GC Risiko ( P VerfÜgung = 2,16 × 10 Fro:. Li W-Q, Hu N, Wang Z, Yu K, Su H, Wang L, et al. (2013) genetesch Varianten an Epidermal Wuesstem Factor Receptor Passerelle Genen an Risk vun Esophageal Squamous Zell Carcinoma an Gastric Cancer an enger chinesescher Bevëlkerung. PLoS NËMMEN 8 (7): e68999. Doi: 10.1371 /journal.pone.0068999 VerfÜgung Redakter: Valli De Re, CENTRO di Riferimento Oncologico, IRCCS National Cancer Institut, Italien VerfÜgung Arnaque: 24. Mäerz 2013; Akzeptéiert: 4 Juni, 2013; Publizéiert: 18. Juli 2013 zu Dëst ass eng oppen-Zougang Artikel, fräi vun all Copyright, a ginn fräi kopéiert kënne, verdeelt, iwwerdroen, geännert, opgebaut, oder soss duerch iergendeen fir all erlaabt Zweck benotzt. D'Aarbecht ass net ënnert der Creative Commons CC0 Domaine public Engagement sinn VerfÜgung Funding:. D'Shanxi Uewerstad Gastrointestinal Cancer Genetik Project vun der National Cancer Institut (NCI) Kontrakt NO2-SC-66211 mam Shanxi Cancer Hospital ënnerstëtzt gouf an Institut. Der Ernährung Interventioun Utilisatioun vun NCI ënnerstëtzt goufen Kontrakter NO1-SC-91030 a HHSN261200477001C mat der Cancer Institut vun der chinesescher Academy vun Medical Sciences. Déi aktuell Analyse gouf vun der Intramural Research plangen vun der National Instituter Gesondheetsminister (NIH), NCI, an der Divisioun vun Cancer Epidemiology a Genetik ënnerstëtzt. D'funders hu keng Roll am Etude Design, Daten Kollektioun an Analyse, Décisioun, oder Virbereedung vun der mëttelalterlech Handschrëft ze publizéieren VerfÜgung Wettsträit Interessen:. D'Auteuren hu folgend Interessen. Carol GIFFEN an Xiaoqin Xiong si ugestallt vun Informatiounen Management Services Galaxy Et gi keng Patenter, Produiten an Entwécklung oder vermaart Produiten ze erklären. Dëst heescht net de onvergläichleche 'Auteuren ofzeänneren un all déi Politiken PLOS NËMMEN op sharing Daten a Material, wéi fir Auteuren online am Guide detailléiert. VerfÜgung ERBBs oder Faktor kenne epidermal Wuesstem (EGFRs gehéieren) an déi receptor tyrosine kinase (RTK) superfamily a si wichteg Signaler Proteinen zu normal gestallt Konditiounen [1], [2]. Zum Beispill, ligand-gebonnen EGFRs sinn Reglementatioun vun Zell-Zyklus Werdegang, Prolifératioun, Survival, Invasioun, an anere Kriibs Contributioun Prozesser [3], [4]. Net verwonnerlech also, Membere vun der EGFR Famill, besonnesch EGFR (och bekannt als ERBB1 oder HER1) an ERBB2 (HER2), goufen zu der Entwécklung vun villen Mënsch Cancers agebonne a sinn als therapeutesch Ziler verfollegt [3], [4] , [5]. Am Bezuch op esophageal an gastric Kriibs, héich EGFR an ERBB2 Niveauen hunn mat aarmséileg esophageal an gastric Kriibs Iwwerliewe [4], [6], [7] soll ginn. Therapien de EGFR Famill gezielt huet dës Distanz zu esophageal an gastric Kriibs hätt verbesseren [4]. Puer Studien hun och somatic Projet'en vun Genen vun der EGFR Famill an esophageal an gastric Cancers [8], [9], [10], [11], [12] verroden. Ausserdeem, huet eng Roll fir matgeholl sécher vun der EGFR Famill och fonnt ginn, mat Molekülle an der MAPK /Erk Passerelle an esophageal an gastric Cancers ageschalt Équipe [13], [14], [15]. VerfÜgung opgrond vun der Bedeitung vun dëser Passerelle, genetesch Variatioune vun EGFR sécher Proteinen konnt mat predisposition vergläichen ze esophageal an gastric Cancers. Mä nëmmen e puer Studien hunn d'Roll vun germline Single Nukleotid schiefgang (SNPs) zu dësen Cancers propagéieren. Dës puer virewech Studien hu just Deckung vun de Genen an dëser Passerelle limitéiert [16], [17], [18], [19], [20], [21], [22], [23]. Obwuel SNPs an dëser Passerelle hunn net erreecht Nepgen-grouss Bedeitung an publizéiert Nepgen-grouss association Studien (GWAS) [24], [25], [26], [27], [28], [29], [30], [31], [32], esou eng Critèren vläicht fir z'entdecken modest Associatiounen zevill konservativ ginn. Dofir, kann Passerelle Analyse hëllefen wichteg genetesch Contributiounen deenen eenzelne Effekt ze gesin bis identifizéiere kënnen ze kleng gin der GWAS Bedeitung Critèren ze ginn fonnt benotzt [33], [34]. Baséierend op eise GWAS Donnéeën an ethnesch Chinese Sujeten [24], mir globaalt bewäert Associatiounen tëscht genetesch Varianten an der EGFR Passerelle an de Risiko vun esophageal squamous Zell carcinoma (ESCC) an gastric Kriibs (GC) vun 1942 ESCC Fäll, 1758 GC Fäll ( 1126 Fäll vun gastric Cardia Kriibs (GCA) an 632 vun gastric noncardia Kriibs (GNCA)), an 2111 Kontrollen an der Regioun Taihang Mountain of China lieft, e Gebitt mat engem héije Risiko vun ESCC an GC. VerfÜgung IFLA- breakpoint VerfÜgung d'Shanxi ieweschte gastrointestinal (UGI) Cancer Genetik Project (Shanxi, um ClinicalTrials.gov als NCT00341276 registréiert) kritt schrëftlech informéiert Zoustëmmung vu Sujeten der Shanxi Elterendeel studéieren ze déplacéieren an Punkto GWAS (aktuell Etude) an d'ganz Prozedure goufen duerch Shanxi Cancer Hospital an Institut Finanzpolitiker Kritik Verwaltungsrot guttgeheescht. D'Linxian Ernährung Interventioun Utilisatioun (NITs, um ClinicalTrials.gov als NCT00342654 registréiert) kritt schrëftlech informéiert Zoustëmmung vu Sujeten der NIT Elterendeel studéieren a Punkto GWAS (aktuell Etude) an déi ganz Prozeduren sech duerch Cancer Institut vun der chinesescher Academy vun ofgeseent ze déplacéieren Medical Sciences Finanzpolitiker Kritik Verwaltungsrot. D'NCI Special Ënnersich Finanzpolitiker Kritik Verwaltungsrot guttgeheescht der béid Shanxi an NIT Elterendeel Studien wéi och a Punkto GWAS (aktuell Etude). VerfÜgung Sécuritéit Bevëlkerung VerfÜgung D'Etude Participanten aus zwee ieweschte gastrointestinal Coursë waren ( UGI) gehaal Projeten Kriibs an der Géigend Taihang Mountain zu China: d'Shanxi an NITs studéieren. D'Shanxi Etude gouf am Joer 1997 goufen an huet e Fall-Kontroll Deel an engem Fall-nëmmen Portioun. Mir Coursë nei-diagnostizéiert, histologically-bestätegt ESCC an GC Fäll, an, am Fall-Kontroll Deel vun dëser Etude, Alter (± 5 Joer) -, sex-, an Noperschaft-stemmt Kontrollen waren bannent 6 Méint vun der Identifikatioun Coursë vun all Fall [35]. Bluttprouwen sech um Aschreiwung gesammelt. D'NITs goufen 1985 zu Linxian Ausgangspunkt an getest den Effet vun der Pluralitéit Vitamin a Quelle Kombinatioune deeglech fir bis zu sechs Joer op d'Resultat vun esophageal an gastric Cancers [36]. Mir gesammelt Blutt an 1999 an 2000 speziell DNA aus NIT Mataarbechter ze kréien. Während de Suivi duerch 31. Dezember 2010, all nei-diagnostizéiert, histologically bestätegt ESCC an GC Fäll zesumme mat Kontrollen vun en age- a Geschlecht-stratified zoufälleg anerer subcohort, goufen zu der aktueller genetesch Analyse abegraff. All iwwerpréift esophageal Cancers sech ESCC, an all GCs sech adenocarcinomas. GCAs goufen als déi definéiert an der proximal 3 cm vun de Mo läit, hierkommen GNCAs déi am Rescht vun der Mo huet. VerfÜgung Gene a VerfÜgung SNP selektionéiert Mir standing eng extensiv Literatur Sich vun der EGFR Passerelle Genen [1], [2], [3], [4], [5]. A Gentherapie war an eiser Analyse abegraff wann et an op d'mannst een vun den folgenden Datenbanken referenzéiert war: ErbB sécher Passerelle an Kegg (http://www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?pathway:map04012, Sensor 20. Dez 2012), EGF Passerelle an BioCarta sécher (http://www.biocarta.com/pathfiles/h_egfPathway.asp, Sensor 20. Dez 2012), oder ErbB receptor sécher, ErbB2 /ErbB3 sécher, EGF receptor sécher, oder ErbB4 sécher Passerelle vun der Passerelle Zesummespill Datebank NCI (http://pid.nci.nih.gov/browse_pathways.shtml, Sensor 20. Dez 2012). Mir identifizéiert Ganzen 131 EGFR Passerelle Genen. Nee SNPs Ëmgéigend zu AREGB VerfÜgung, EIF4EBP1 VerfÜgung, PAK3 VerfÜgung, an SHC1 VerfÜgung an eiser Donnéeën, loosst 127 Genen (Table S1) fir Analyse. Eng total vun 3443 SNPs innerhalb dëse Genen an hir Reliefsailen Beräicher (20 KB Offloss an 10 KB afgerappt), mat engem mannerjäregen allele Frequenz vun > 1% (am Fäll a Kontrollen kombinéiert) sech an eiser Analyse, an der voller Lëscht mat abegraff vun dësen SNPs waren an Table S2. VerfÜgung Genotyping an Qualitéitskontroll VerfÜgung Genom-grouss Scannen war gesuergt mat der Illumina 660W onerfëllt, déi an eiser publizéiert GWAS op UGI Kriibs detailléierte dës [24 ass ]. Duerno Rapport, gescannt mir zousätzlech Punkten op der selwechter Plattform op der selwechter Plaz. Déi initial an zousätzlech Thema Scanner Donnéeën mécht ähnlechen Veraarbechtung an Qualitéitskontroll Filter Chef. Mir ausgeschloss SNPs mat engem vermësst Taux > 5%, Theme mat enger Réalisatioun Taux vun all SNPs &Si besteet; 94%, Theme mat Manque heterozygosity Wäerter mengen (> 30% oder &Si besteet; 25%), Geschlecht discordant Sujeten, oder exzellent zweete Puer. phs000361.v1: D'GWAS Daten op UGI Kriibs an der Etude Populatiounen hunn op d'Datebank vun Genotypes an Phenotypes (dbGaP, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/, studéieren Bäitrëtt Zuel verschéckt ginn. P1). VerfÜgung statistique Analyse VerfÜgung Mir der Associatioun tëscht Genen vun der EGFR sécher Passerelle a Gefor vun ESCC an GC propagéieren. Fir Exercice Analyse Gentherapie-Niveau, mir duerchgefouert éischt eraus SNP-Niveau Analyse. Mir berechent d'Chance nennen (Örs) an 95% Vertraue Intervalle (Direktiven ugeet) fir Risiko vun ESCC oder GC verbonne mat engem mannerjäregen allele mussen, fir all SNP Fra Logistikzenter Réckgang an eng additive Modell benotzt, fir Alter ugepasst, Geschlecht, a studéieren ( Shanxi oder NIT). Mir hu net Bevëlkerung stratification betruecht, well et keng Beweiser fir wesentleche Problemer mat Bevëlkerung substructure war [24]. Mir ginn eng dominant Modell fir SNPs wann d'erwaart Zuel vun Sujeten der minor allele Droen manner war wéi fënnef. VerfÜgung Gene-Niveau Associatiounen sech da mat de Lycée Geleeënheet gekierzt Produit (ARTP) Approche, berechent déi rank- applizéiert gekierzt Test Statistiken an enger permutation-baséiert probéieren Prozedur (1.000.000 resamplings) [34]. Association Signaler iwwer eng Formatioun vun SNPs bannent engem Gene kombinéiert huet iwwerdeems fir SNP linkage disequilibrium (LD) Strukturen an Multiple Vergläicher Comptabilitéit. Mir évaluéiert och d'Associatioun vun de globale EGFR Passerelle mat ESCC an GC, déi d'Associatiounen tëscht all Resultat an Genen bannent der Passerelle weltwäit kombinéiert. Mir ginn de ARTP Method mat 1.000.000 resamplings enger eenzeger Resumé Passerelle-Niveau ze kréien P VerfÜgung -value fir all Kriibs Typ. VerfÜgung Am Secondaire analyséiert, mir Weideren fir Zigarette fëmmen ugepasst (jee oder ni ), Alkohol ofgeroden (jee oder erfreet /ni), an der Famill Geschicht vun UGI Kriibs (jo oder nee). Zanter Resultater vun dësen SNP-Niveau Secondaire analyséiert wéi déi aus der Primärschoul Modeller Fong ähnleche Resultater gewisen, presentéieren mir nëmmen d'Primärschoul an de Pabeier analyséiert. VerfÜgung Mir getest der Associatioun tëscht SNPs an ESCC an GC vun subgroups vum Geschlecht , fëmmen, Alkohol ofgeroden, an Famill Geschicht vun UGI Kriibs. D' P VerfÜgung fir Interaktiounen tëschent SNPs an dës Verännerlechen benotzt likehood Verhältnis Tester iwwerpréift VerfÜgung statistique Bedeitung fir gene- an Passerelle-baséiert analyséiert wéi definéiert war P VerfÜgung &Si besteet. 0,05. Well keen vun der SNPs der Bonferroni-korrigéiert Bedeitung Niveau erreecht (1.45 × 10 Eng total vun 1942 Fäll vun ESCC, 1758 Fäll vun GC (1126 GCA an 632 GNCA Fäll), an 2111 Kontrollen goufen aus der Shanxi an NIT Studien (Table S3) abegraff. Am Allgemengen, déi mengen Alter war 56,0 Joer zu Kontrollen, 56,0 am ESCCs, a 56,3 am GCs. VerfÜgung Mir gehaal Gentherapie-Niveau Analyse ënnert der 127 Genen, a fënnef Genen identifizéiert, dorënner GNAI3 VerfÜgung , CHRNE VerfÜgung, PAK4 VerfÜgung, WASL VerfÜgung, an Bass VerfÜgung, dass vill mat ESCC Risiko verbonnen huet ( P VerfÜgung &si besteet; 0,05) (Table 1). Zéng Genen mein verbonne mat Risiko vun GC, dorënner FYN VerfÜgung, MAPK8 VerfÜgung, MAP2K4 VerfÜgung, GNAI3 VerfÜgung, MAP2K1 VerfÜgung , TLN1 VerfÜgung, PRLR VerfÜgung, PLCG2 VerfÜgung, RPS6KB2 VerfÜgung, an PIK3R3 VerfÜgung ( P VerfÜgung &Si besteet; 0,05) (Table 2). Ënnert de GC-verbonne Genen, GNAI3 VerfÜgung, MAP2K1 VerfÜgung, FYN VerfÜgung, an MAPK8 VerfÜgung sech mat GCA verbonnen, an MAPK8 d'Passerelle-Niveau Analyse eng statistesch relevant Associatioun vun de globale EGFR Passerelle mam GC Risiko ( P = D'SNP-Niveau Associatiounen sinn an Table dës 3. Obwuel keent vun der SNPs d'Bedeitung Niveau iwwerschratt no fir verschidde Vergläicher correcting, bei engem reduzéierten loung vun 0,001, rs1884361 ( NRG3 VerfÜgung) mat ESCC Risiko verbonne war, an rs9387033 ( FYN VerfÜgung ), rs9788973 ( MAP2K4 VerfÜgung), rs7187863 ( PLCG2 VerfÜgung), an rs7720677 ( PRLR VerfÜgung) sech mam GC Risiko verbonnen. Mir och eng Korrelatioun fir rs549386 ( TGFA VerfÜgung) mat GCA, souwéi Korrelatioun fir rs16947307 an rs9923225 (souwuel am WWOX VerfÜgung) mat GNCA identifizéiert. An der Ënnergrupp gebueden, hu mir net relevant Interaktiounen tëschent SNPs an aner Charakteristiken um loung vun 0,001 fest (Donnéeën net gewisen). VerfÜgung Somatic Projet'en a verännert Regulatioun vun EGFR Passerelle Genen hunn schonn zu der Entwécklung an hätt vun esophageal an gastric Cancers [6], [7], dicht agebonne [8], [9], [10], [11], [12], [13], [14], [ ,,,0],15]. Am Géigesaz, ass et manner evident, ob germline genetesch Varianten am EGFR Passerelle mat dëse Cancers verbonne sinn. Rezent GWASs hunn vill Risiko loci verbonne mat ESCC oder GC identifizéiert, mä also wäit, et huet keng Beweiser fir eng Associatioun mat genetesch Varianten an EGFR Passerelle gouf. Passerelle-baséiert Approche entwéckelt goufen Nepgen-grouss Daten méi effizient am Räich, an si d'Potential Roman Conclusiounen ze gesinn [33], [34]. Mir globaalt Genen vun der EGFR Passerelle a Gefor vun ESCC an GC mat der ARTP Approche bewäert. Obwuel keent vun de Genen d'Bonferroni-Korrektur fir verschidde Vergläicher begéint, bei engem loung vun 0,05, observéiert mir dass puer Genen, souwéi de globale EGFR Passerelle, mat Risiko vun GC verbonne waren. D'Resultater proposéiert och Associatiounen tëscht Multiple EGFR-Zesummenhang Genen an ESCC Risiko. VerfÜgung Mir identifizéiert fënnef Genen vill mat ESCC Risiko verbonnen. Ënnert hinnen, GNAI3 VerfÜgung a CHRNE VerfÜgung sech däitlech zu souwuel ESCC an GCA, mä net zu GNCA. GNAI3 VerfÜgung zu 1p13.3 Zeechesaatz Guanine Nukleotid-verbindlech FAQ G (k) subunit alpha, gouf déi bedeitendst Gentherapie fir ESCC an och mam Risiko vun GC, besonnesch GCA soll. Guanine Nukleotid-verbindlech Proteinen (G Proteinen) sinn als modulators oder transducers zu verschiddenen transmembrane sécher Weeër Équipe. One virdrun Etude proposéiert eng Associatioun tëscht rs11184738 ( PRMT6 VerfÜgung, matzen am 1p13.3) an ESCC Risiko vun enger GWAS Scanner awer net zu der Confirmatioun Etapp [28]. GNAI3 VerfÜgung ass 2,3 Mbps wellkomm afgerappt vun PRMT6 VerfÜgung, an d'Top SNP am GNAI3 VerfÜgung (rs1434285) war net zu héich LD mat rs11184738 an eiser GWAS Donnéeën (r zéng Genen huet vill mat GC Risiko vun eiser Etude assoziéiert. FYN VerfÜgung zu 6q21 gouf déi bedeitendst Gentherapie am GC Ensembel, mä war verbonne nëmme mat GCA an net mat GNCA. FYN FAQ gehéiert zu der Membran-verbonne Src tyrosine kinase Famill an huet e dréien Roll am Zell Haftung, Prolifératioun an apoptosis [37]. MAPK8 VerfÜgung zu 10q11 gouf déi bedeitendst Gentherapie fir GNCA a war och mat GCA assoziéiert. MAPK8 ass e Member vun der mitogen-ageschalt FAQ kinases an ass Équipe zu Zell Prolifératioun, dat, apoptosis an Transkriptiouns. Rezent Passerelle-baséiert Fuerschung uginn dass MAPK8 VerfÜgung mat rectal Kriibs an pancreatic Kriibs verbonne war, [38], [39]. VerfÜgung Well d'Norm Single-nët Methode kann SNPs mat moderéiert Wierkung Gréisst eseu , déi mir engem resampling-baséiert ARTP Method, déi association Signaler ganze eenzelne SNPs bannent engem Gene kombinéiert, Gentherapie-Niveau Associatiounen ze berechnen. Zousätzlech zu de genannte-ervirgehuewen Genen, proposéiert eise Resultater, datt e puer aner Genen och mam Risiko vun GC oder ESCC verbonne waren, och wann eenzel SNPs an dëse Genen goufen virdrun GWAS Etuden net gemellt. Mir hunn och wichteg Genen vun der Gentherapie-Niveau Analyse fir déi déi eenzel SNPs fir SNP-Niveau Analyse vun der Pré-definéiert loung net relevant waren, underscoring d'Noutwennegkeet vun enger méi integréierter Verständnis vun de genetesch Contributiounen wéi d'SNP-Niveau Perspektiv nëmmen . VerfÜgung Eis Resultater sinn biologically plausibel. D'EGFR Famill gouf gin upregulated fonnt an ass d'Zil vun somatic kennen UGI Cancers, an engem Medeziner Prozess fir Therapien verbessert Kriibs hätt uginn der EGFR Famill gezielt [4], [6], [7]. Virum Studien hu bericht och d'Roll vun afgerappt sécher vun EGFR Famill Genen vun UGI Cancers. Eng rezent Rapport uginn, datt d'MAPK Passerelle Toast an esophagogastric Kriibs folgenden Aktivatioun vun RTKs stimuléiert war [13]. Eng zweet Etude gewisen, datt oncogenic CagA GC Risiko vun activating Erk sécher Weeër gefördert [15]. VerfÜgung virdrun GWASs uginn genetesch Varianten vun PLCE1 VerfÜgung als gemeinsam waat loci fir ESCC an GCA awer net fir GNCA [24], [27]. An eiser Analyse, fonnt mir zwee Genen bedeitendst fir ESCC an GCA awer net fir GNCA, weider suggeréiert datt eng gemeinsam genetesch Mechanismus fir d'Entwécklung vun ESCC an GCA bäidroen kënnen. VerfÜgung An eiser Etude, mir virewech biologescher Wësse benotzt systematesch Associatiounen tëscht Genen vun der EGFR Passerelle a Gefor vun ESCC an GC zu engem héich-Risiko Bevëlkerung am Norde Mëtt China ermëttelen. Fir eis Wëssen, ass dat déi éischt Étude globaalt d'Roll vun genetesch Variant zu EGFR Passerelle Genen a Gefor vun UGI Cancers ermëttelen. Déi relativ grouss Echantillonen Gréisst Nodeems eis d'Associatiounen fir ESCC, GC allgemeng a vun anatomic Siten mat enger ugemoossener Muecht ze bewäerten. Mir erkennen och, awer d'Limiten vun eiser Etude. Éischt, hu mir keng Informatiounen iwwert Helicobacter pylori VerfÜgung ( H. Pylori VerfÜgung) Wonn [40], déi eng Suerg besonnesch fir d'Analyse vun GNCA ginn hätt. Allerdéngs huet e rezent Ëmfro ënnert NIT Plasma Echantillon engem prevalence vun H. pylori VerfÜgung seropositivity vun 96,6% ënner GNCA, 95,8% ënner GCA, a 93,9% ënner Kontrollen (Engels Daten), engem multiplex assay mat H benotzt. pylori VerfÜgung komm definéiert als dräi oder méi antigens positive [41] ginn. Obwuel d'multiplex Method méi sensibel wéi traditionell ELISAs gin hautdësdaags, datt dës serological Ënnersichung engem Héich H. pylori VerfÜgung souguer ënnert Kontrollen an dësem Beräich Wonn Tarif, suggeréiert, dass eis Resultater Bezuch sech duerch d'Feele vun Informatiounen daitlech Wettbewerbsverzerrungen gin op H. pylori VerfÜgung Wonn. Zweet, weider replications an onofhängeg Populatiounsschichte sinn néideg, fir festzestellen, ob de Associatiounen mir tëscht EGFR Passerelle Genen an de Risiko vun ESCC an GC observéiert real sinn. Drëttel, de Pre-definéiert EGFR Passerelle datt mir net bedeiten getest kann all-System Zesummenhang EGFR Genen wéinst Aschränkungen an aktuell Wëssen. Véiert, weider generalizability zu anere Populatiounen verlaangt eruwoen, well eiser Etude nëmmen ënnert héich-Risiko Han Chinese gehaal huet. VerfÜgung An Conclusioun, eiser Etude bedeitendst Associatiounen tëscht der germline genetesch Variatioune vun de globale EGFR sécher Passerelle an e puer eenzel identifizéiert Genen an de Risiko vun GC, wéi och eenzel Genen an de Risiko vun ESCC, eng méiglech Roll fir EGFR Passerelle Genen an der Entwécklung vun UGI Cancers suggeréiert. Weider Studien sinn hëllt d'Associatiounen an onofhängeg Populatiounsschichte ze confirméieren an d'Basisdaten biologescher Mechanismen ze entdecken. VerfÜgung
&Si besteet; 0,05). Fir ESCC, mir hunn eng wichteg Passerelle-Niveau association net fest ( P VerfÜgung = 0.72), mee Gentherapie-Niveau analyséiert Associatiounen tëscht ugeholl GNAI3 VerfÜgung, CHRNE VerfÜgung, PAK4 VerfÜgung, WASL VerfÜgung, an Bass VerfÜgung, an ESCC ( P VerfÜgung &Si besteet; 0,05). Eis Daten proposéiere eng Associatioun tëscht spezifesch Genen vun der EGFR sécher Passerelle a Gefor vun GC an ESCC. Weider Studien sinn hëllt dësen Associatiounen ze validéieren an Basisdaten Mechanismen ze ermëttelen VerfÜgung Aféierung VerfÜgung
spontan a Methoden VerfÜgung
Resultater VerfÜgung
, TLN1 VerfÜgung, RPS6KB2 VerfÜgung, MAP2K4 VerfÜgung, an PIK3R3 VerfÜgung mat GNCA verbonne waren ( P VerfÜgung &si besteet; 0,05 ). Mir sinn och e puer zousätzlech Genen verbonne nëmme mat GCA ( TGFA VerfÜgung, RASA1 VerfÜgung, JAK2 VerfÜgung, HSP90AA1 VerfÜgung, DLG4 identifizéiert VerfÜgung , an CHRNE VerfÜgung) oder GNCA ( NEDD4 VerfÜgung, PTK2 VerfÜgung, HBEGF VerfÜgung, CHRNA1 VerfÜgung), mee net mat total GC. Genen mat der stäerkst Associatiounen waren GNAI3 VerfÜgung fir ESCC ( P VerfÜgung = 8,17 × 10
= 2,63 × 10
2,16 × 10 Diskussioun VerfÜgung
Ennerstëtzung Informatiounen VerfÜgung Table S1. VerfÜgung D'Associatiounen tëscht all EGFR Passerelle Genen a Gefor vun esophageal squamous Zell carcinoma an gastric adenocarcinoma VerfÜgung Doi:. 10,1371 /journal.pone.0068999.s001 VerfÜgung (DOCX) VerfÜgung Table S2. VerfÜgung D'NCBI dbSNP Identifikatiounen, matzen Genen, an chromosomes vun SNPs an der Etude abegraff VerfÜgung Doi:. 10,1371 /journal.pone.0068999.s002 VerfÜgung (DOCX) VerfÜgung Table S3. VerfÜgung Charakteristiken vun der Etude Participanten VerfÜgung Doi:. 10,1371 /journal.pone.0068999.s003 VerfÜgung (DOCX) VerfÜgung