MUC5AC war gehale zu gastric carcinogenesis Équipe gin well aberrant MUC5AC Ausdrock vun Patienten ërem fonnt gouf mat gastric Kriibs (GC). An dëser Etude, Längt schiefgang zu engem komplizéierte widderhuelen Regioun bascht ze MUC5AC VerfÜgung Promoteur sech zu 230 Patienten mat GC an 328 Kriibs-gratis Kontrollen évaluéieren. Alleles vun 1,4 an 1,8 KB huet bedeitend méi verwandelt an GC Grupp wéi an Kontrollen. Am Géigesaz, 2,3 an 2,8 KB alleles Priedegt wesentlech méi Ofstänn zu Patiente wéi an Kontrollen. Alleles sech dann an ufälleg kléngen (S; 1,4 an 1,8 KB), Schutzkleedung (P; 2,3 an 2,8 KB) an dësen Texter (N; all aner alleles) Kategorien mat Respekt un hir linkage mat dem waat bis GC. Jiddferee mat genotype SS no enger 2,7-fantastesch fräi Risiko vun GC Optriede, mä PN genotype war mat enger däitlech reduzéiert Risiko vun dëser Kriibs assoziéiert. Desweideren, homozygous oder heterozygous Persounen mat een oder zwee Exemplare vun 1,4 KB allele en virdrunner Alter vun agesat a méi spezifesch Metastasen Etapp mat Patienten ouni dës allele (Bonferroni Verglach zougedréckt korrigéiert p = 1,35 × 10 Fro:. Wang C, Wang J, Liu Y, Yinan X, Zhang C (2014) MUC5AC VerfÜgung Offloss Komplex widderhuelen Regioun Längt schiefgang Sidd mat waat a Séminairen Etapp vun Gastric Cancer Associéierten. PLoS NËMMEN 9 (6): e98327. Doi: 10.1371 /journal.pone.0098327 VerfÜgung Redakter: Javier S. Castresana, Universitéit vun Navarra, Spuenien VerfÜgung Arnaque: 14. Februar 2014; Akzeptéiert: 30. Abrëll 2014; Publizéiert: Juni 2, 2014 VerfÜgung Copyright: © 2014 wang et al. Dëst ass eng oppen-Zougang Artikel ënnert de Bedingunge vun der Lizenz BY Creative Commons verdeelt, déi bereet benotzen Genehmegungen, Distributioun, an Reproduktioun vun all mëttelgrouss, gëtt d'Original Auteur an d'Quell Kaiser sinn VerfÜgung Funding:. Dës Aarbecht war déi National Natural Science Foundation vu China ze Innovation Research Group (Nr 81370590) ënnerstëtzt. D'funders hu keng Roll am Etude Design, Daten Kollektioun an Analyse, Décisioun, oder Virbereedung vun der mëttelalterlech Handschrëft ze publizéieren VerfÜgung Wettsträit Interessen:.. D'Auteuren hunn deklaréiert, datt keng Competitioun Interessen existéieren VerfÜgung Gastric Kriibs (GC) ass eent vun de meescht genannten malignancies an der zweeter Virwaat Ursaach vum Kriibs-Zesummenhang Doud weltwäit [1]. Allerdéngs bleift seng Mechanismus onkloer. Obwuel verschidde Ëmwelt- Facteuren, wéi Ernährung, Zigarette fëmmen a Helicobacter pylori VerfÜgung, kënnen ze carcinogenesis vun gastric epithelial Zellen droen [2] - [4], nëmmen eng Ëmwandlung vun de zu esou Risiko Faktoren ausgesat Populatioun entwéckelen GC während hirem Liewen. Dëst deit drophin, datt genetesch Faktoren eng wichteg Roll spillen eng individuell d'waat fir GC zu Bestëmmung [5], [6]. VerfÜgung Mucins sinn e Grupp vun Objeten, komplex, héichgradeg glycosylated extracellular Proteinen wichteg an epithelial homeostasis ënnerhalen. Cancer Zellen observéiert oft aberrant Formen oder Montanten vun mucins auszedrécken, an dës geometrescher Figur si geduecht eng Roll an carcinogenesis ze spillen, besonnesch am Regulatioun vun entholl Zell dat, Prolifératioun, an entholl Invasioun [7]. Zum Beispill, overexpression vun MUC1 an MUC4 zu verschidde Forme vu adenocarcinoma dréit zu der Regelung vun Kriibs Zell Prolifératioun via en normaalt Gespréich mat epidermal Wuesstem Faktor regulator (EGFR) an extracellular Signal-reegelen kinases [8]. Velcich et al VerfÜgung. bewisen, datt Muc2 VerfÜgung MUC5AC ass eng secreted. gelies-administrativ mucin an enger Bewaacher vun gastric foveolar epithelial Zellen [10]. MUC5AC war zu gastric carcinogenesis gin Équipe gehale well gastric carcinoma engem méi nidderegen Niveau vun MUC5AC Ausdrock ze enthalen ewéi normal gastric mucosa fonnt gouf [11] - [13], a verschidde Krankheete Etuden bewisen, dass MUC5AC Ausdrock Niveau mat Gravitéit vun GC verbonne war; Ee, dës Donnéeën [12] huet onkompatibel, [14]. Et huet op MUC5AC Funktioun klenge Fuerschung ginn an d'Mechanismen seng Roll am GC Entwécklung Basisdaten, bis et kierzlech gemellt huet, datt MUC5AC silencing, eng kleng hairpin RNS-haltege lentivirus benotzt, gastric Kriibs Zell Invasioun an Migratioun kënschtlech [13] fräi. Dëst gëtt zu Beweiser datt verännert Niveau vun MUC5AC Ausdrock kënnt an GC pathogenesis Équipe ginn. Funktionell genetesch schiefgang zu der Regelung Regioun betreffen kann MUC5AC VerfÜgung Ausdrock Gentherapie, an dann zu enger Individuen "waat ze gastric Kriibs bäidroen. VerfÜgung widderhuelen Regioune vun DNA sinn uechter d'mënschlech Nepgen gemeinsam a sinn Zeeche vun hir dynamesch, onbestänneg Fonctiounen [15], [16]. Si sinn déi grouss Generator vun genetesch Variant a sinn als substantiell genetesch Verännerlechkeet zu underlie, mat Roman kennen esou Regiounen Erklärung vill vun der "Vermësster 'heritability zu polygenic Krankheeten [17], [18], dorënner GC [19]. Allerdéngs, kann dës Zort vu genetesch Variant net zu Nepgen-grouss association Studien (GWAS) Brieder agebaut ginn an eng Erausfuerderung ass zouverlässeg ze bewäerten. Intensiv review vun der MUC5AC VerfÜgung Offloss Regulatioun Regioun an ëm eng komplizéiert widderhuelen Regioun (Limburg MUC5AC-u VerfÜgung widderhuelen Regioun). Mir mat dësem Fall-Kontroll Etude der Natur a wäit vun genetesch schiefgang bannent dëser Regioun ze bestëmmen, an der Associatioun vun all genetesch Variant mat der Optriede an Werdegang vun GC ze entdecken. VerfÜgung Datebank Recherchen an Analyse vun den Offloss Regioun vun MUC5AC d'UCSC Nepgen Browser (http://genome.ucsc.edu) an der GRCh37 /hg19 Verëffentlechung vun de Mënscherechter Nepgen huet benotzt, fir generéieren enger Kaart der Plaz an huet grouss Frankräich Charakteristike vun de MUC5AC VerfÜgung Gentherapie weist, dorënner histone H3 lysine 27 acetylation (H3K27AC) Zoustand, Transkriptiouns Faktor bindend Siten, gemeinsam Single-Nukleotid schiefgang (SNPs), an repetitive Haaptrei Frankräich Charakteristike vun der Offloss Regioun. Den DNA Haaptrei vun der Offloss Regioun vum Ensembl erofgeluede war (http://useast.ensembl.org/Homo_sapiens/Info /Index). VerfÜgung IFLA- Ausso VerfÜgung Dës Etude gouf mat der Leedung Akraafttriede vun der Medical IFLA- Comité vun Shandong Universitéit an informéiert schrëftlech Erlaabnes war vun all Themen dobäi. D'mëttelalterlech Handschrëft enthalen net Patient Informatiounen z'identifizéieren. D'Date goufen anonym an all Medeziner Ënnersich analyséiert goufen no de Prinzipie vun der Deklaratioun vun Helsinki ausgedréckt gehaal. VerfÜgung Sécuritéit Sujeten VerfÜgung Zwee honnert an drësseg Patienten mat GC sech zu Shandong Province agestallt, nordëstleche China, tëscht Januar 2011 an Dezember 2012. All Diagnosen vun GC sech pathologically confirméiert; Exklusioun Kritären agebaut eng Geschicht vu Kriibs vun all aner Uergel (net ursprénglech aus Mo) oder weiderentwéckelt radiotherapy Chimiotherapie goen mussen. Dräi honnert an zwanzeg-aacht Kriibs-gratis Persounen ouni Magnéitfeld oder bekannt Cancers sech als Kontrollen gesammelt. All dës Sujeten waren am selwechten Wunnfläche wéi de Fäll wunnen, d'Majoriteit vun hinne waren aus de gesond Fräiwëlleger ausgewielt, an e klengen Deel vun eiser Alter Kontrollen waren aus inpatients mat mëll Ausdauer Krankheete vun de Spideeler gesammelt. Hirem Alter a Geschlecht sech mat deene vun Patienten mat GC iwwereneestëmmen. All Sujeten waren genetesch stinn ethnesch Han Chinese. All Thema war individuell mat engem pretested Questionnaire bewäert ze demographesch Daten an Informatiounen iwwert Zesummenhang Risiko Faktoren kréien, dorënner Tubak an Alkohol Konsum. Persounen, déi op d'mannst eemol am Dag fir méi wéi ee Joer gefëmmt huet den Fëmmerten definéiert, an déi, déi fir méi wéi sechs Méint dräi oder méi alkoholescht Gedrénks pro Woch verbrannt goufen Alkohol drénken considéréiert. Séminairen Donnéeën an agebousst Charakteristiken vun Patiente sech vun hir medezinesch Geschicht zeechent an questionnaires gesammelt a confirméiert, an GC entholl, Node an Metastasen (TNM) Etappen sech no de System vun der Weltgesondheetsorganisatioun kléngen (DÉI). VerfÜgung uplanzen an DNA Extraktioun VerfÜgung One Randerscheinung Blutt Prouf mL war vun all Sujet gesammelt. Frankräich DNA war vun all Prouf mat engem geännert Salz Extraktioun Technik isoléiert [20]. VerfÜgung Mir kritt Otemschwieregkeeten Echantillon vun 36 GC Patienten an eiser Kohort, an Echantillon vun all Patient bestoung vun kriibserreegend Otemschwieregkeeten, déi jeweileg Para-carcinoma (definéiert als 1.0 cm ewech vun der entholl Mass) a ronderëm noncancerous gastric mucosal Stoffer. Frankräich DNA gouf aus dëse Echantillon ofgebaut Blood mat an Zell Kultur DNA Mini Kit (Tiangen Biotech, Peking, China). VerfÜgung Assessment vun allele Gréisste VerfÜgung MUC5AC-u VerfÜgung widderhuelen Regioun genotyping war mat der polymerase Kette Reaktioun (Hinnen alleguer) gesuergt; der Gentherapie-spezifesch benotzt primer Message sech wéi follegt zesummen: Sënn 5'- TCCACCCTAACCCTGTCAGCCGC-3 "; antisense 5'- GTGGCAGGAGTGTGGGGAAAGG G-3 ". Hinnen alleguer amplification vun DNA gouf zu engem Ganzen Reaktioun Volume vun 50 μL, wouvun 100 NG Frankräich DNA gesuergt, 0,2 μM vun all primer an 25 μL PrimeSTAR Max DNA Polymerase (Takara, Japan). engem 5 Minutt initial denaturation bei 94 ° C, gefollegt vun 30 Zykle vun 10 Spiller bei 98 ° C an 2 Minutten op 68 ° C: Hinnen alleguer war an engem 9700 Thermacycler (Perkin-Elmer, CA, USA) als Konsequenz gehaal. Hinnen alleguer Produite vun gelies electrophoresis (1 Volt /cm) an geréckelt gefiermt duerch 1.0% agarose gelies analyséiert goufen. VerfÜgung DNA sequencing assay VerfÜgung Fir d'genotyping Resultater, Hinnen alleguer-Kick DNA Echantillon (amplicons confirméieren ) sech un BGI Tech (Peking, China) fir d 'Offäll an Sanger sequencing ausgewielt a geschéckt. Dëst assay war mat Respekt un de Beem uplanzen an Etude Design gehaal blann. VerfÜgung statistique Analyse VerfÜgung SPSS 13,0 Software (SPSS, Chicago, IL, USA) war fir statistesch Analyse agestallt. Differenzen an demographescher Verännerlechen, fëmmen an drénken Gewunnechten, an gruppéiere allelic Ofstänn tëscht Fall a Kontroll Participanten sech mat der Chi-wäissfeldreg Test oder Fisher d'exakt Test Verglach. Réckgang analyséiert goufen standing d'Chance nennen (Örs) fir Associatioun vun GC a MUC5AC-u VerfÜgung widderhuelen Regioun genotypes tëscht der Kontrollen a GC Patienten ze bestëmmen. Örs sech mat der natierlecher uräicheren an hir Standard Feeler geschat. Den Chi-wäissfeldreg Test oder genau Test d'Fisher sech fir Verglach vun de Medeziner an agebousst Charakteristiken vun Patienten benotzt. Fir verschidde Vergläicher erlaben, sech p Wäerter (PC) mat der Korrektur Bonferroni korrigéiert; pc = p × 31 sou, an der ganzer studéieren, 31. statistesch Tester gehaal huet. All Tester goufen zwee-eesäitegen, mat pc &Si besteet;. 0,05 als statistesch relevant gin VerfÜgung Umeldung vun den MUC5AC-u VerfÜgung widderhuelen Regioun VerfÜgung intensiv review vun der MUC5AC VerfÜgung Offloss Regioun eng komplizéiert 1710 BP widderhuelen Regioun (Limburg MUC5AC-u VerfÜgung widderhuelen Regioun) läit tëscht nucleotides -3162 bis -1452 Offloss vun der ATG Initiatioun codon ( Figur 1). Dës Positioun ass direkt matgeholl gouf vun engem Frankräich nët mat der Muecht puer Transkriptiouns Faktore ze kruet. D' MUC5AC-u VerfÜgung widderhuelen Regioun vill ënnerbrach onregelméissegen Widerhuelung vun verschidden Virsaz enthält an ass e komplizéierten Kombinatioun vun microsatellite (e.g., CTCA), minisatellite (e.g., CATTCACT oder CATTCACTCATT) an megasatellite (e.g., ACCCATTCACTCACTCACTTATTCACTC) Widerhuelung. Op der Regioun 5, eng 300 BP Haaptrei gouf fonnt genee verduebelt gin, Chef-ze-Schwäif. VerfÜgung Sécuritéit Populatioun VerfÜgung All Individuen vun der Etude (328 Kriibs-gratis Kontrollen an 230 GC Patienten) waren aus engem Han Chinese Bevëlkerung an ouni bekannt ierflech Krankheet. Béid Gruppe ähnlechen distributions vun Alter, Geschlecht an Alkohol Konsum (χ Association vun widderhuelen Regioun genotypes mat de Risiko vun GC VerfÜgung Frankräich DNA Echantillon sech aus ganz Blutt vun all den Themen an benotzt den Skeletter isoléiert der MUC5AC-u VerfÜgung widderhuelen Regioun ze Meenungsfreiheet nennt. Eight alleles mat erauskomm Gréisste vu 1,1 bis 2,8 KB rangéiert sech an dëser Han Chinese Bevëlkerung (Dorënner 2) identifizéiert. Déi 1,1 KB allele war déi gemeinsam, den 1.8 a 2.0 KB alleles sech manner heefeg, an déi aner waren all relativ Verschiddenheet (Table 1). VerfÜgung D'gesamt Verdeelung vun de MUC5AC-u VerfÜgung widderhuelen Regioun alleles ënnert mam GC Patienten ënnerscheet däitlech, datt aus an Kontrollen fonnt (χ Baséierend op dës Observatiounen, mir der aacht alleles wéi ufälleg (S) séiert, Schutzkleedung (P), oder automatesch mat Respekt ze riskéieren (N) folgendermoossen: S, 1,4 oder 1,8 kB; P, 2,3 oder 2,8 KB; an N, all aner alleles. Twenty-eent MUC5AC-u VerfÜgung widderhuelen Regioun genotypes total an eisem Fall-Kontroll Populatioun identifizéiert goufen (Table S3), waren d'genotypes dann als nn definéiert, SN, PN, SP, SS, an do war keen PP genotype an eiser Kohort. De stäerkste gemeinsam genotype (nn) war als Referenz Grupp bezeechent. Persounen mat der homozygous genotype SS no enger 2,7-fantastesch fräi Risiko vun GC Optriede (ODER = 2,683, 95% CI = 1.554-4.361, pc = 0,012; Table 2). D'PN genotype mat enger däitlech reduzéiert Risiko vun GC verbonne war (ODER = 0,257, 95% CI = 0.116-0.569, pc = 0.031). Weder vun der heterozygous genotypes SN an SP huet mat enger Ännerung assoziéiert an de Risiko vun GC (souwuel p > 0,05). VerfÜgung Séminairen a agebousst Charakteristiken um Diagnos vun GC Patienten mat ënnerscheedlecher MUC5AC-u Als bestëmmte Variabel Zuel vun zwee widderhuelen schiefgang, contraire Auswierkungen op de Risiko an hätt vun Kriibs [21] duebel ze huele sinn gemellt, mir den Alter op agesat a Krankheete Etappen tëschent GC Patienten am Verglach mat an ouni MUC5AC-u VerfÜgung widderhuelen Regioune vun 1,4, 1,8 oder 2,3 kB getrennt VerfÜgung An eisem Beispill, fofzéng GC Patienten (6,5%) duerchgefouert der 1,4 kB allele. dräi vun hinnen huet fir dës allele homozygous an de Rescht goufen heterozygous. A signifikativ méi héich Prozentzuelen vun GC Patienten mat op d'mannst eng Kopie vun den 1,4 KB allele sech jonk (&Si besteet; 50 Joer) Eenzelen oder mat méi fortgeschratt T (T4) an M (M1) Etappen am Verglach mam et subtil (66,7% vs. 17,2 %, p = 4,37 × 10 sech Et 128 GC Patienten (55.7%) an eisem Beispill déi de duerchgefouert 1.8 kB Versioun vun der MUC5AC-u VerfÜgung widderhuelen Regioun; 35 Patienten goufen fir dat allele homozygous. Homozygous Patienten Lien eng eeler Alter vun agesat ze hunn (≥ 50 Joer), an manner avancéiert T (Doriwwer eraus-T3), N (N0), an TNM (Etapp 0-II) Etappen am Verglach mat Patienten, déi fir de 1.8 net homozygous sech kB allele (5.7% vs. 23,1%, p = 0,021; 60,0% vs. 35,4%, p = 0,006; 51,4% vs. 29,2%, p = 0,010; 68,6% vs. 37,9%, p = 7.43 × 10 Mir fannen Individuen net de homozygous genotype 2,3 /2,3 kB an eisem Beispill weist. Ee, fofzéng GC Patienten (6,5%) waren fir dëst allele heterozygous. Heterozygous Patienten goufen eeler um GC agesat wéi Patienten deen net huet, obwuel dëst Resultat op e marginalen Niveau vu Bedeitung huet an net d 'Verbesserung fir Multiple Tester iwwerlieft. Et war kee groussen Ënnerscheed zu distributions vun T, N, M oder TNM Etappe vu Kriibs tëscht Patienten mat eent oder keng Kopie vun den 2,3 KB allele (Table 5). VerfÜgung Analys vun widderhuelen Regioun Onstabilitéit zu Kriibs Stoffer Als widderhuelen Regioune vun DNA zu verschiddenen Mënsch malignancies stabil sinn, dorënner GC [22], mir ob nächst sech d'hypervariable MUC5AC-u VerfÜgung widderhuelen Regiounen am Längt tëscht Kriibs, Para-carcinoma ënnerscheet an Ëmfeld normal Stoffer aus 36 GC Patienten. D'Resultat huet keen Differenzen zu Band Muster tëscht Para-carcinoma an normal Stoffer an all 36 Patiente; Ee, Längt hire Restaurant goufen DNA Echantillon vun Kriibs Stoffer an zwee GC Patienten (Dorënner 3) observéiert. An zwee Fäll waren Bands nogewise eng Verréckelung vun laang alleles zu Kriibs Otemschwieregkeeten ze kuerz alleles an Para-carcinoma Otemschwieregkeeten weist. An ee Fall, verréckelt ee allele vun 2.0 KB zu engem Roman, 0,9 KB allele, an, an engem anere Fall, eent allele verréckelt vun 2,3 KB zu 1,4 KB. Ënnert de 36 Patienten gastric Kriibs getest, d'Frequenz vu Kriibs-Zesummenhang Nepgen Emplazéiren am MUC5AC-u VerfÜgung widderhuelen Regioun 5,6% war. VerfÜgung Sanger sequencing vun der 1,1, 1,4 an 1,8 KB alleles aus dräi GC Patienten VerfÜgung Hinnen alleguer amplicons vun de 1,1 kB an 1,4 kB alleles aus der Otemschwieregkeeten gastric Kriibs DNA sech mat Erfolleg dem Sanger sequencing Technik Nepgen. Dës Message sinn am Entstoen Informatiounen Fichieren opgezielt. Mir gedanzt de ganze Brochstéck vun engem 1,8 KB amplicon (Hinnen alleguer amplicon der gastric Kriibs Otemschwieregkeeten DNA benotzt) ze féieren, oder all aner Fragmenter > 1,8 KB, wéinst der komplizéiert an repetitive Struktur vun der Zil- Regioun an Aschränkungen vun der Technik. De Message weisen déi selwecht Haaptgrond genetesch Struktur an repetitive Unitéiten den Daniel Nepgen Referenzmaterial Haaptrei UCSC mä mat verschiddene globale Virsaz. Déi initial 300 BP um Enn "5 vun 1,4 KB MUC5AC-u widderhuelen Regioun Haaptreiestären VerfÜgung si genee an engem Kapp-ze-Schwäif Muster verduebelt. VerfÜgung an dëser Etude, évaluéieren mir d'Associatioun vun genetesch Variant zu engem widderhuelen Regioun no der MUC5AC VerfÜgung Promoteur mat der Gefor vun engem Optriede an Werdegang vun GC. Eis Etude vun de verschiddenste biologescher Funktiounen vun MUC5AC am gesond a diseased Staaten, déi eenzegaarteg Lag vun der Regioun Potential Regulatioun der Gentherapie Ausdrock, déi besonnesch dynamesche Natur vun der widderhuelen Haaptrei, an den Effet vun dëser Onstabilitéit op generéieren Roman kennen ugeholl gouf. VerfÜgung Analys vun 230 GC Patienten an 328 Kontrollen huet d' MUC5AC-u VerfÜgung widderhuelen Regioun war absolut polymorphic, mat aacht anere alleles (plus e 0,9 kB allele an der Kriibsfuerschung Otemschwieregkeeten aus ee GC Patient) ginn elo zu engem Han Chinese Populatioun aus Nordosten China. Baséiert op der Verdeelung a Ënnerscheeder vun allelic Ofstänn tëscht GC Patienten a Kontrollen, goufen dës aacht alleles an ufälleg alleles kléngen (S: 1,4 an 1,8 KB), Schutzpatrounin alleles (P: 2,3 an 2,8 KB), an dësen Texter alleles (N: de anerer). Jiddferee Träger zwee Rief alleles (SS) haten eng 2,7-fantastesch fräi Risiko vun Entwécklungslänner GC, an der genotype PN war mat engem reduzéierten Risiko vun gastric Kriibs assoziéiert. Eis Conclusiounen hindeit datt genetesch Variant vun dëser Regioun vill mat waat fir GC verbonnen ass, an domat op déi bestehend Beweiser derbäi, dass an MUC5AC Ausdrock Ännerungen ass an der pathogenesis vun dëser malignant Krankheet Équipe. VerfÜgung An weider Analyse, mir fonnt dass dës genetesch Varianten huet mat GC waat net nëmmen assoziéiert, mä och mat sengen hätt. Mir fonnt Patienten mat der 1,4 KB allele en virdrunner Alter vun GC agesat haten a sech méi wahrscheinlech T an M Etapp Krankheeten ze hunn viraussetzt. Als fortgeschratt T an M Etappen mat engem aarme hätt am allgemengen verbonne sinn, uginn eis Resultater datt GC Patienten mat der 1,4 KB allele zu méi rapid Werdegang vun der Krankheet verbonne waren. Am Géigesaz, homozygous Patiente fir déi 1,8 KB allele Lien eng eeler Alter bei Diagnos ze hunn a manner avancéiert T, N, an TNM Etappen wéi aner Patienten, déi besot dëser genotype kéint de Risiko vun Entwécklungslänner fortgeschratt gastric Kriibs geloss a mat engem besseren verbonne ginn Resultat VerfÜgung widderhuelen Regioune vun der Nepgen hunn als nonfunctional "Junk" DNA virdrun entlooss ginn. Ee, hunn eng rezent Etude déi bis zu 25% vun der Gentherapie Promoteuren an der Saccharomyces cerevisiae VerfÜgung Nepgen enthale widderhuelen Message [23]. Eng ähnlech Verdeelung vun zwee Widerhuelung vun de Promoteure vun Homo VerfÜgung Genen bewisen, och dat vun widderhuelen-haltege Promoteuren gefuerene Genen vill méi héich Préisser vun transcriptional Féiss hat [23]. Eng Rei vu Studien hun gewisen, dass vill Variatioune vun widderhuelen Regioune vun Promoteuren Gentherapie Ausdrock Afloss an genetesch waat fir verschidde Mënsch Entwécklungsstéierungen [24] bäidroen - [26], a fir Cancers souwéi [27] - [29]. Puer molekulare Mechanismen d'Auswierkunge vun widderhuelen Regiounen an Promoteuren op der Gentherapie Ausdrock underlie kann; zum Beispill, kënnen se d'Zuel vun Transkriptiouns Faktor bindend Siten, déi Ännerungen an der Abstand vun kritescher Promoteur Elementer, well d'Aktivitéit vun RNS-verbindlech Proteinen oder Afloss der chromatin Struktur [23] ofzeänneren. Laut der Enzyklopedie vun DNA Elements (gerannt) Donnéeën, sinn fir visualization an download via de Browser UCSC Genom (http://genome.ucsc.edu/), d'Regioun vum wouvun MUC5AC-u VerfÜgung widderhuelen Regioun enthält Stärekéip vun bekannt Transkriptiouns Faktor bindend Siten an ass fir histone H3 lysine 27 acetylation (H3K27ac), eng zouverlässeg Bewaacher fir aktiv chromatin beräichert. Sou laang Variatioune vun dëser widderhuelen Regioun kéint bedeitend Impakt op DNA Struktur an Transkriptiouns Faktor hunn obligatoresch, an domat op der Gentherapie Regulatioun. Dofir, fir eis Opklärung vun enger Associatioun tëscht der Längt vun der widderhuelen Regioun an enger Verännerung GC Risiko kéint vun hire Restaurant zu MUC5AC Niveau erkläert ginn. Dëst wäert an Zukunft Studien lant ginn, déi dat dann ob der 1,4 an 1,8 KB alleles Promoteur Aktivitéit revaloriséiert an wann 2,3 an 2,8 KB alleles et géint. Esou Studien gëtt et Hëllef déi exakt Roll dëser Regioun spillt zu der Entwécklung an hätt vun GC opgedeckt. VerfÜgung Frankräich Instabilitéit huet dës Distanz ze entholl Initiatioun an Werdegang vun der Heefung vun der Pluralitéit genetesch hire Restaurant schnelle responsabel fir Kriibs Zell Entwécklung Afloss [30]. Obwuel spontan rearrangements vun widderhuelen Regiounen sech méi dacks an der Linn meeschten fonnt wéi zu somatic Zellen [31], hunn e puer Studien bewisen widderhuelen Regioune vun verschiddenen Mënsch neoplasms stabil sinn [32] - [34], dorënner GC [35]. Wann mir d'iwwerpréift MUC5AC-u widderhuelen Regioun Längt vun DNA aus normal a Kriibs Stoffer aus puer GC Patienten VerfÜgung, fonnt mir zwee Beispiller vun Längt hire Restaurant. Béid ëmgerechent laang ze kuerz alleles, an déi 1,4 KB allele, assoziéiert an eiser Etude mat enger méi Risiko vun GC, wossten an ee Fall. Obwuel d'genetesch Emplazéiren Frequenz relativ niddereg ass, beinhalt dëst Resultat datt Onstabilitéit um dëst nët an e puer Fäll un der pathogenesis vun gastric Kriibs dréit. VerfÜgung D'Verdueblung vun engem 300 BP DNA Segment am Ufank vun dëser komplizéierter widderhuelen Regioun ass an dësem Kontext relevant. Dës Verdueblung ass wahrscheinlech geschitt Multiple mol ze hunn déi grouss allelic Varianten bis Formulaire, deen an ~300 BP Soue aus all aner meeschtens ënnerscheeden. Zum Beispill, spekuléieren mer der 1,4 KB allele vun dëser Duplikatioun vun den 1,1 KB allele generéiert gouf, wat déi gemeinsam allele vun eiser Etude Populatioun ass. Dës Verdueblung Evenement ka mat Nepgen Onstabilitéit verbonne ginn déi extensiv an tumorigenesis, Entwécklung an Metastasen vun gastric Kriibs betraff ass. Et sinn Rapporten vun ähnlechen Verdueblung Evenementer am groussen Mëtt widderhuelen exons vun MUC5AC VerfÜgung [36]. VerfÜgung Obwuel mir hu erreechen net Roman Message hinnen mat der Referenz Haaptrei an dräi gewielte GC Patienten Ënnerscheedung, aus 1,1, 1,4 an 1,8 kB allele DNA Fragmenter, mir hu vill SNPs, déi eventuell als verroden fir allele gesin an zu staark LD mat anere genetesch lues ausserhalb vun der Regioun, äusser vun der Längt Ënnerscheeder ginn hätt. Wéinst der grousser Komplexitéit, Längt, héich Ähnlechkeet ganzer Regioun, an de Limitte vun der sequencing Technik, hätt mer déi ganz Regioun vun der DNA amplicons aus alle Sujeten net leien; also, aner sequencing Fonctiounen a genetesch Varianten hunn net ganz wahrscheinlech opgedeckt gouf. Desweideren, kann mer net soen, ob et méi dramatesch genetesch stattfannen Evenementer Doudesfäll am Nepgen DNA vun de Kriibs Otemschwieregkeeten sinn déi méi usprochsvollen ginn, mä wahrscheinlech méi produktiv. VerfÜgung Fir de beschte vun eisem Wëssen, dat déi ass éischte Rapport vun der Associatioun tëscht genetesch Variant unzeginn MUC5AC-u VerfÜgung widderhuelen Regioun an gastric Kriibs Risiko. Mir hunn ëm d' MUC5AC VerfÜgung Promoteur sinn däitlech verbonne mat waat fir GC, a mat hir de Medeziner Etappen bestëmmte genetesch Längt Varianten an der widderhuelen Regioun gewisen. Spéit, grouss-Skala Prozesser, wéi och gutt-entworf mechanistic Studium, sinn néideg eis Conclusiounen ze validéieren. VerfÜgung D'Auteuren Dr. Xiaowei Yang fir hir technesch Ënnerstëtzung, statistesch Analyse a virsiichteg Diskussioun Merci. Mir erkennen all vun de Sujeten an der Etude, an d'Efforten vun hirer Famill. VerfÜgung
Aféierung VerfÜgung
Method VerfÜgung
Resultater VerfÜgung
widderhuelen Regiounen VerfÜgung
Diskussioun VerfÜgung
Ennerstëtzung Informatiounen VerfÜgung Dorënner S1. VerfÜgung Abberzuel Haaptrei Formatioun vun MUC5AC-u widderhuelen Regioun Varianten. Hinnen alleguer amplicons vun de 1,1 KB, 1,4 KB, an 1,8 KB alleles aus der gastric DNA Kriibs Otemschwieregkeeten sech mat de Sanger sequencing Technik Nepgen. A.1.1 KB voll Haaptrei. B. 1,4 KB voll Haaptrei. C. 1.8 KB allele Haaptrei mat enger Schéier bei 3 'Säit VerfÜgung Doi:. 10,1371 /journal.pone.0098327.s001 VerfÜgung (TIF) VerfÜgung Table S1. VerfÜgung Distributions vun ausgewielt Beméien an gastric Kriibs Fäll a Kontrollen VerfÜgung Doi:. 10,1371 /journal.pone.0098327.s002 VerfÜgung (Intrigue) VerfÜgung Table S2. VerfÜgung TNM Etappen am Fäll vun gastric Kriibs VerfÜgung Doi:. 10,1371 /journal.pone.0098327.s003 VerfÜgung (Intrigue) VerfÜgung Table S3. VerfÜgung Distribution vun MUC5AC-u widderhuelen Regioun genotypes zu gastric Kriibs Fäll a Kontrollen VerfÜgung Doi:. 10,1371 /journal.pone.0098327.s004 VerfÜgung (Intrigue) VerfÜgung
Arbeschterlidder VerfÜgung
Wuesstumsprobleemer bei virzäitege Puppelcher verbonne mat verännert Darmbakterien
Mikroplastik identifizéiert am mënschlechen Offall fir d'éischte Kéier
Berichten Etiketten op kommerzielle Kefir Produkter mikrobiell Niveauen korrekt?
Glycyrrhizinsäure als Medikamentkandidat fir COVID-19
Aart vun ieweschte Loftwee Bakterien kéint d'Asthma Schwieregkeet beaflossen
Staark Mikrobiom am fréie Liewen verbonne mat manner Atmungsinfektiounen
Fuerscher manipuléieren Bakterienaarten am Darm mat Diät
Wëssenschaftler vun der Stanford University School of Medicine hu gewisen datt andeems dDiät an engem Mausmodell manipuléiert gëtt, et ass méiglech dEngraftment vun engem spezifesche Bakteriestamm iww
Sinn DNA-baséiert Diaken a personaliséiert medizinesch Liewensmëttel d'Zukunft fir Gewiichtsverloscht?
Déi meescht Leit wëssen datt Genen vun den Elteren ierflecher sinn an datt dDNA vun deenen Elteren kombinéiert fir eng individuell eenzegaarteg genetesch Make -up ze kreéieren. Dëst bestëmmt Aspekter
Biologesch Therapie kann de Risiko vu schwéiere COVID-19 erofgoen
Eng rezent Observatiounsstudie vu spuenesche Fuerscher, aktuell verfügbar op medRxiv* Virdruck Server, suggeréiert datt Patienten mat immun-mediéierten Krankheeten, déi biologesch Therapie kréien, e