esouguer-telangiectasia mutated (ophieft) ass eng Ser /dëss FAQ kinase datt e kritesch Roll an DNA Schued-entschlof sécher an Initiatioun vun Zell Zyklus Bomm sécher an Äntwert ze DNA-Lupp Agenten wéi ioniséierender Stralung spillt. Mir hunn am Rapport virdrun de ophieft FAQ Verloscht vun immunohistochemistry (IHC) an 16% vun de Mënscherechter gastric Kriibs (GC) Otemschwieregkeeten. Mir Hypothes, datt ophieft VerfÜgung Gentherapie intron Projet'en vun microsatellite Onstabilitéit geziilte (MSI) Ursaach ophieft FAQ Verloscht vun engem Ziel vun GC. Mir studéiert mononucleotide Projet'en am intron vun ophieft VerfÜgung Gentherapie, ophieft IHC an MSI am GC. Zéng Mënsch gastric Kriibs Zell goufe fir den ophieft VerfÜgung Gentherapie stattfannen um introns studéiert, RT-Hinnen alleguer, direkt sequencing, an immunohistochemistry. GC Stoffer vun 839 Patienten sech fir MSI an ophieft IHC analyséiert. Ënner hinne waren 604 Fäll vun der ophieft VerfÜgung Projet'en um introns virecht Exon 6, Exon 10 an Exon 20. Two Mënsch GC Zell Linnen (SNU-1 a -638) zougedréckt ophieft VerfÜgung analyséiert intron kennen, Läsche vun RT-Hinnen alleguer an direkter sequencing, an ophieft FAQ Verloscht vun IHC. D'Ofstänn vun ophieft VerfÜgung stattfannen, MSI, an ophieft FAQ Verloscht ware 12,9% (78/604), 9,2% (81/882) an 15,2% (134/839), bzw.. Analyse vun Associatiounen ënnert MSI, ophieft Gentherapie stattfannen, a Verloscht ophieft FAQ réischt héich Co-bestehend ophieft VerfÜgung Gentherapie hire Restaurant an MSI. ophieft VerfÜgung intron stattfannen an ophieft FAQ Verloscht vun 69,3% fonnt goufen (52/75) an 53,3% (40/75) vun MSI positive GC. MSI komm an ophieft FAQ Verloscht sech zu 68,4% (52/76) an 48,7% (37/76) vun GC mat ophieft intron stattfannen presentéieren. ophieft VerfÜgung stattfannen an ophieft FAQ Verloscht hat Charakteristiken vun Alter, distal Lag vun entholl, grouss entholl Gréisst, an histologic intestinal Typ. Eis Etude kéint als dass interpretéiert ginn ophieft VerfÜgung Gentherapie stattfannen um intron kéint vun MSI cibléiert ginn an zu enger ausgewielt Grupp vun GC zu ophieft FAQ Verloscht Féierung. VerfÜgung Fro: Kim t, Choi SI, Min HL, Kim MA, Kim WH (2013) stattfannen um Intronic Widerhuelung vun der esouguer-Telangiectasia Mutated (ophieft) Gene a ophieft Protein Verloscht vun primär Gastric Cancer mat Microsatellite Onstabilitéit . PLoS NËMMEN 8 (12): e82769. Doi: 10.1371 /journal.pone.0082769 VerfÜgung Redakter: Hoguen Kim, Yonsei University College vun der Medezin, Republik Korea VerfÜgung Arnaque: 21 Juli, 2013; Akzeptéiert: 27 Oktober 2013; Publizéiert: December 6, 2013 VerfÜgung Copyright: © 2013 Kim et al. Dëst ass eng oppen-Zougang Artikel ënnert de Bedingunge vun der Lizenz BY Creative Commons verdeelt, déi bereet benotzen Genehmegungen, Distributioun, an Reproduktioun vun all mëttelgrouss, gëtt d'Original Auteur an d'Quell Kaiser sinn VerfÜgung Funding:. Dëst Fuerschung war duerch de Ministère vun Science, ICT &finanzéiert duerch Grondakommes Science Research plangen duerch d'National Research Foundation vun Korea (NRF) ënnerstëtzt; Zukunft plangen (NRF-2012R1A1A2004648). D'funders hu keng Roll am Etude Design, Daten Kollektioun an Analyse, Décisioun, oder Virbereedung vun der mëttelalterlech Handschrëft ze publizéieren VerfÜgung Wettsträit Interessen:.. D'Auteuren hunn deklaréiert, datt keng Competitioun Interessen existéieren VerfÜgung esouguer-telangiectasia mutated (ophieft) Gentherapie ass eng Komponent vun DNA-Schied Äntwert (DDR) an ass duerch DNA duebel staarkt Break (DSBs) ausgeléist, a Signaler der Zell-Zyklus Bomm dem Passage vun Zellen ze lues duerch de Cycle DNA flécken ze vereinfachen. Der Gentherapie ass en der bis chromosome 11q22-23. D' ophieft VerfÜgung Gentherapie ass ganz grouss, e Frankräich Regioun vun 150 kB Rennsport, mat vun 66 exons mat engem coding Haaptrei vun 91668 BP. VerfÜgung ophieft ass an Äntwerte DSBs agebonne datt physiologically zu spezialiséiert Zell Zorte wéi meeschten Zellen an lymphocytes geschéien. D'ophieft FAQ hëlleft Zellen zu beschiedegt oder futtis DNA strands ginn. D'ophieft FAQ Koordinate DNA Reparatur vun Enzymen activating datt d'gebrach strands befestegt. Effikass Reparatur beschiedegt DNA strands hëlleft d'Stabilitéit vun der genetesch Informatiounen senger Zell erhalen [1]. VerfÜgung ophieft Verloscht war zu 16% vun der Mënschheet GC Otemschwieregkeeten zu engem groussen Kohort Etude [2] observéiert. Inactivation vun der ophieft VerfÜgung Gentherapie vläicht e reegelméissegen Evenement vun der Entwécklung vun der Mënschheet gastric Kriibs (GC) ginn; awer, am Zesummenhang mat den Evenementer op de Verloscht vun ophieft VerfÜgung Ausdrock am GC net vun der niddereg prevalence vun ophieft VerfÜgung stattfannen erkläert ginn hätt. Déi meescht vun den ophieft VerfÜgung am primäre GC Zell Linnen an GC Stoffer identifizéiert kennen sech Punkt kennen [3]. VerfÜgung D'DNA fonnt Reparatur (MMR) System corrects de Feeler datt während DNA Gedächtnis hierkommen homologous recombination an Net-homologous Enn vereente implizéieren an der Reparatur vu DNA DSB geschéie kéint. Projet'en am DNA DSB Reparatur Genen wéi ophieft, MRE11, RAD50, NBS1 VerfÜgung a ATR VerfÜgung, sinn postulated eng Roll an der Entwécklung vun gastrointestinal malignancies mat engem leider MMR Funktioun ze spillen. An colorectal erhéijen mat engem leider MMR System, kennen vun intronic mononucleotide Widerhuelung vun ophieft VerfÜgung a MRE11 VerfÜgung zu aberrant splicing zu Resultat, gefollegt vun reduzéiert Ausdrock vun der Show-Typ FAQ fonnt goufen [4 ]. VerfÜgung Ongeféier 10% vun GC ass mat microsatellite Instabilitéit (MSI) assoziéiert. MSI bezitt an der Zuel vun Nukleotid Widerhuelung vun microsatellite Regiounen ze hire Restaurant am coding Regioune vun Genen, an Resultater am frameshift kennen. MSI huet an d'FAQ identifizéiert ginn Regioune vun bekannt Zil- Genen coding dorënner TGF-βRII, IGFIIR, Bax VerfÜgung [5-7], a hRAD50 VerfÜgung Genen [8]. D' hRAD50, BLM VerfÜgung, an BRACA1 VerfÜgung Genen hunn puer dovun (A) mononucleotide am coding Regiounen Widerhuelung, der hMSH6 VerfÜgung huet (C) 8 TRACT, der NBS1 VerfÜgung huet den (a) 7 TRACT, an déi ophieft VerfÜgung den (T) 7 TRACT huet. Frameshift Projet'en vun dësen Genen mat ofwiesselnd incidences sech virdrun [9-11] gemellt. VerfÜgung Nieft der Häerd vu zu neutral microsatellite Message alldeeglech Projet'en, déi MSI generéiert och kennen Kriibs Genen, i.e., an déi Genen, déi eng aktiv Roll an der multistep Prozess vun carcinogenesis Leeschtung. Obwuel widderholl Message vun der coding Regioun vun Genen kuerz wéi déi typesch microsatellite loci fir Gentherapie androën benotzt ginn, hir propensity fir Jongen spontan slippage Feeler beim Gedächtnis ass nach méi héich wéi déi vun nonrepetitive Message. Projet'en vun enger intronic widderhuelen sech gemellt fir induce leider Ausdrock vun MRE11 VerfÜgung Gentherapie [12,13]. Polypyrimidine widderhuelen Projet'en am ophieft VerfÜgung Gentherapie kann déi richteg mRNA splicing [14] desorganiséieren. Mä, et ass kee Beweis datt Enregistréiere /Läschen op dës Net-coding mononucleotide Message geschitt Afloss normal ophieft FAQ Funktioun vun MSI-Zesummenhang GC. Am Mënsch GC Otemschwieregkeeten mat MSI, d'Frequenz vun ophieft VerfÜgung stattfannen an der Associatioun mat de Verloscht vun FAQ Funktioun ass net kloer verstanen. Mir hunn dat mononucleotide TRACT hire Restaurant zu intron vun Hypothes ophieft VerfÜgung Gentherapie mat Verloscht vun ophieft FAQ Funktioun am GC mat MSI verbonnen ass. VerfÜgung Mir propagéieren Projet'en am intronic (T) 15 am ophieft VerfÜgung Gentherapie Matsproocherecht Haaptrei (IVS) virecht Exon 6, déi 6 zu Mënsch Zell Linnen gastric Kriibs zu 22 BP Läsche vun Exon an . Am Moment studéieren, kennen vun der ophieft VerfÜgung Gentherapie zesumme mat der Präsenz vun MSI goufen Mënsch GC Zell Linnen an alleréischter GC Stoffer iwwerpréift. Eis Resultater weisen, datt ophieft VerfÜgung Gentherapie intron stattfannen am GC mat MSI heefeg war an däitlech mat Verloscht vun ophieft FAQ Funktioun verbonne war. VerfÜgung IFLA- breakpoint VerfÜgung Dëst Retrospektiv Etude Leeschtung war d'Echantillonen iwwer de Regaler no der pathologic Diagnos benotzt, an all vun den Echantillon waren ier d'Etude anonymized. Dëst Retrospektiv Etude gouf vun de Finanzpolitiker Kritik Verwaltungsrot vun Seoul National University Hospital (H-1010-065-336) mat waiver vun Awëllegung ënnert der Bedingung vun der anonymization guttgeheescht. VerfÜgung Zell Linnen an Otemschwieregkeeten Echantillon VerfÜgung Zéng Mënsch Zell gastric Kriibs lines- SNU-1, SNU-5, SNU-16, SNU-216, SNU-484, SNU-601, SNU- 620, SNU-638, SNU-668 an SNU-719 goufen aus der koreanesch Zell Linn Bank (Seoul, Korea) kritt. (; Hyclone, Lorgan, féier, USA FBS) an Antibiotiken (100 U /ML penicillin G an 100 ug /ML streptomycin) bei 37 ° C an enger humidified 5% All Zell Strecken an RPMI1640 mat 10% An et Bovine serum nà ugebaut CO 2 incubator. Eng Zell-Linn Rutsch Otemschwieregkeeten Partie war vun recoltéiert a mënschlech GC Zell Linnen fest war fir immunohistochemistry kritt (Superbiochips, Korea). VerfÜgung Formalin-fix, paraffin-Ënnerbewosstsinn GC Otemschwieregkeeten uplanzen vu 839 Patienten, déi fir curative gastrectomy mécht Primärschoul gastric Kriibs Behandlung tëscht 1 DNA erauszéien a MSI Determinatioun VerfÜgung entholl Otemschwieregkeeten Echantillon op Glas drënner waren ënnert engem Liicht microscope iwwerpréift. En Deel vun der entholl zu deem de Prozentsaz vun entholl Zellen e Minimum vu 50% vun all Zellen an datt Géigend iwwerschratt a vläit engem Beräich vun normal mucosal Otemschwieregkeeten kee entholl Zellen mat sech ausgeprägt an knappen mat engem Messer viischt. D'knappen Otemschwieregkeeten war vun 1,5 ml microtubes mat 50 μL vun Otemschwieregkeeten lysis Prellbock (0,5% Tween gesammelt 20 [Fläch, St Louis, MO], 100 mm Tris HCl gefiermt [pH 7,6], 1 mm héich, an 20 μg proteinase K [ ,,,0],Fläch]). De Krunn sech op 55 ° C fir 24 bis 48 Stonnen incubated bis de Otemschwieregkeeten-haltege lysis gefiermt kloer gouf. Proteinase K war fir 10 Minutten duerch incubation bei 95 ° C inactivated, an de Quecksëlwer DNA war bei -20 ° C bis benotzen gespäichert. MSI war um loci BAT25, BAT26, D2S123, D5S346, an D17S250 évaluéieren. Erhéijen sech als MSI + séiert, wann op d'mannst 2 (40%) vun de 5 microsatellite lues mat alleles vun verännert Gréisst vun entholl DNA Verglach mat DNA aus Net-entholl Otemschwieregkeeten verbonne waren. VerfÜgung Detektioun vun Projet'en vun ophieft um intron VerfÜgung mononucleotide Widerhuelung VerfÜgung Hinnen alleguer amplification war zu 10 μL Volumen mat 1 μL Frankräich DNA, 5 pmol all vun vir an ëmgedréint primers gesuergt, a 5 μL Premix. Drësseg-dräi Zykle vun Hinnen alleguer ware fir 30 sec mat Zyklus Parameter vun 95 ° C gesuergt, 30 sec op eng annealing Temperatur entspriechend fir all primer Pair an 65 ° C fir 1 min, gefollegt vun 10 min Extensioun bei 72 ° C. Variant vun mononucleotide widderhuelen am ophieft VerfÜgung Gentherapie war mat engem Hinnen alleguer-baséiert assay fonnt. Frankräich DNA huet mat primers- F-CCTTTTTCTGTATGGGATTATGG Implikatioune verstärkt, R-TGAACATCTTGTGAAGGTTTCAG fir exon6 (T) 15 (155 BP), F-TCCTTTTAGTTTGTTAATGTGATGGA, R-GCTGTTGGGGTAGAAGCTGA fir exon10 (T) 15 (165 BP), an F-GCCAATGGAAGATGTTCTTGA, R- CATCTTGGTCACGACGATACA fir exon20 (T) 15 (178 BP). VerfÜgung Detektioun vun aberrant splicing zu ophieft Total RNS (2,5 μg) vu Mënsch gastric Kriibs Zell Linnen virbereet duerch Trizol reagent (GIBCO-BRL) war fir d'éischt-staarkt cDNA Synthes mat Superscript II Réckproduktioun Transcriptase (GIBCO-BRL) an oligo-d (T) 12-18 primer benotzt. An aliquot vun der Reaktioun Mëschung vun Hinnen alleguer Implikatioune war verschiddene Segmenter vun ophieft cDNA zu synthesize. VerfÜgung Hinnen alleguer amplification zu 20 μL Volumen Leeschtung war mat 1 μL ëmgedréint-ausserdeem cDNA, 5 pmol all vun vir an ëmgedréint primers, an 10 μL Premix. Drësseg-fënnef Zykle vun Hinnen alleguer ware fir 30 sec mat Zyklus Parameter vun 95 ° C gesuergt, 30 sec op eng annealing Temperatur entspriechend fir all primer Pair an 72 ° C fir 1 min, gefollegt vun 10 min Extensioun bei 72 ° C. Hinnen alleguer Produite sech an 2% agarose gelies wouvun ethidium bromide an visualized ënner UV-Luucht electrophoresed. β-actin war wéi eng intern Standard benotzt. VerfÜgung Dräi RT-Hinnen alleguer primer Puer ofgeleet vun ophieft VerfÜgung Message (GenBank NM_000051) benotzt huet F-TGGTGCTATTTACGGAGCTG an R-TTCGAAAGTTGACAGCCAAA gët vun Exon z'entdecken 5-7 (Produit Gréisst: 347 BP), F-TCCCTTGCAAAAGGAAGAAA an R-TACTGGTGGTCAGTGCCAAA fir Exon 9-11 (Produit Gréisst: 504 BP), an F-TGGAGAAGAGTACCCCTTGC an R-GATTGACTCTGCAGCCAACA fir Exon 19-22 (Produit Gréisst: 415 BP ). VerfÜgung Sequencing Analyse VerfÜgung Sequencing war vun der dideoxy-Ketten anze- Method benotzt DNA sequencing Kit (Obwuel Biosystems) an dem Abi PRISM 310 genetesch Organer duerchgefouert. Implikatioune Hinnen alleguer Produite goufen sidd enzymatically engem presequencing Kit benotzt (Amersham Life Science, Cleveland, Oh, USA), no der Taktik vum Fabrikant, an dann Nepgen direkt BigDye terminator Method (Obwuel Biosystems, Foster City, CA, USA) benotzt. Sequencing Reaktioune waren op en Abi 3100 automatiséiert sequencer lafen (Obwuel Biosystems, Biosystems, Foster City, CA, USA) an d'Donnéeë kritt huet mat DNA sequencing Analyse 3,7 Software analyséiert (Obwuel Biosystems, Foster City, CA, USA). Déi nei Donnéeën huet an GenBank (Bäitrëtt Nummer: KF704396) verschéckt ginn VerfÜgung Immunohistochemistry VerfÜgung Vertriederin entholl-Spär Rubriken an Zell-Linn vill Rubriken vun 4-μm deck waren deparaffinized an rehydrated zu graded. Alkohol. Antigen retrieval war vun Drock -cooking der Echantillon vun 0,01 mol /L citrate Prellbock fir 5 min erreecht. D'Kanéngchen monoclonal antibody (Copie Y170 kritt aus Epitomics, Burlingame, CA, USA) war fir immunohistochemistry benotzt. Ophieft war an der Keimzell vun normal gastric mucosa, stromal Zellen, an lymphocytes Kierchefënster. Intensitéit war graded den 0 (ganz negativ), ± (equivocal staining, Signal observéiert nëmmen op héich-Muecht microscopy mat × 40 Nasmyth), + /3 (schwaach positiv), ++ /3 (mëttelméisseg positiv) an +++ /3 (ganz positiv, bal gläich ze lymphocytes an neutrophils). D'Critèrë fir negativ Fäll goufen als manner wéi 10% vun Zellen Kierchefënster sou schwaach positiv (+ /3) oder méi intensiv virbereet, dat ass, méi wéi 90% vun Zellen ganz negativ (0) oder equivocal staining (±) weist [2 ]. VerfÜgung statistique Analyse VerfÜgung D'SPSS 15,0 Pak fir statistesch Analyse benotzt gouf. Chi-Feld Test an Modell huet proportional Risikoe Cox benotzt. All P-Wäerter sinn zwee eesäitegen a P Wäerter &Si besteet;. 0,05 wéi wichteg dorunner ware fir de statisteschen Methoden an dëser Etude VerfÜgung stattfannen um intronic mononucleotide Widerhuelung vun der ophieft Gentherapie zu Mënsch gastric Kriibs Zell Linnen VerfÜgung vun 10 Mënsch gastric Kriibs Zell Linnen, SNU-1 an SNU-638 huet den MSI positiv, ophieft VerfÜgung Gentherapie kennen positiv an ophieft Verloscht vun IHC charakteriséiert. An SNU-1 an SNU-638, 22, woubäi hien huet misse Läsche vun Exon 6 war vun RT-Hinnen alleguer fonnt an et war zu Kierzunge Haaptrei Analyse (Dorënner 1) confirméiert. SNU-5, SNU-16, SNU-484, SNU-601, SNU-620, SNU-668, an SNU-719 huet MSI negativ an déi wëll Typ ophieft VerfÜgung Gentherapie. Obwuel SNU-216 MSI negativ war, harbored se kennen an de ophieft VerfÜgung Gentherapie, an hu staark ophieft Ausdrock vun IHC fonnt (Table 1). stattfannen um intron mononucleotide Widerhuelung vun der ophieft VerfÜgung Gentherapie an microsatellite Onstabilitéit an Otemschwieregkeeten gastric Kriibs VerfÜgung D'Heefegkeet vun intronic stattfannen am ophieft VerfÜgung Gentherapie alles war wéi 12,9% (78/604). D'Heefegkeet vun de ophieft VerfÜgung Gentherapie stattfannen war 9,3% (50/540) zu intron virecht IVS 6; 11,0% (59/534) zu intron IVS virecht 10 an 8,8% (46/523) zu intron IVS viru 20; ënnert hinnen, IVS 6 a IVS 10 overlapped zu 39, IVS 10 an 20 IVS zu 35, IVS 10 an 20 IVS zu 34, IVS 6, IVS 10 an 20 IVS an 31 Fäll (Table 2). D'Ofstänn vun MSI komm war 9,2% (81/882) an ophieft FAQ Verloscht war 15,2% (134/839) an eiser Etude vun GC. An 596 Fäll, goufen d'Associatiounen ënnert MSI (Dorënner 2A), ophieft Gentherapie stattfannen (Dorënner 2B), an ophieft FAQ Verloscht (Dorënner 3) analyséieren. ophieft VerfÜgung intron stattfannen an ophieft FAQ Verloscht vun 69,3% fonnt goufen (52/75) an 53,3% (40/75) vun MSI positive GC. MSI komm an ophieft FAQ Verloscht sech zu 68,4% (52/76) an 48,7% (37/76) vun GC mat ophieft intron stattfannen presentéieren. MSI komm an ophieft intron stattfannen sech zu 35,7% (40/112) an 33,0% (37/112) vun GC mat ophieft FAQ Verloscht (Table 3) fonnt. D'Frequenz vun ophieft IHC Resultater weisen eng wiesentlech méi héich ophieft Verloscht vun engem Ënnergrupp vun MSI positiv a ophieft VerfÜgung stattfannen positive GC (Dorënner 4A). Drësseg dräi vun 596 Fäll (5.5%) hunn déi all dräi molekulare Funktiounen (Dorënner 4B). VerfÜgung Location VerfÜgung Widerhuelung (Wëllschwäin Typ) VerfÜgung Intron stattfannen am GC VerfÜgung Intron stattfannen an MSI positive GC Downloads Clinicopathologic kennenzeléieren vun ophieft VerfÜgung Gentherapie stattfannen am GC VerfÜgung GC Patienten mat ophieft VerfÜgung Gentherapie stattfannen sech mat Alter, grouss entholl Gréisst, distal Standuert, intestinal Typ, déif Invasioun, an manner um Terrain Taux assoziéiert. GC Patienten mat negativen ophieft IHC sech mat Alter, grouss entholl Gréisst assoziéiert, gutt mëttelméisseg ënnerscheet Typ un, an intestinal Typ vun Lauren d'Klassifikatioun (Table S1). Chi-Feld Test ophieft VerfÜgung Status Gentherapie stattfannen an ophieft IHC negativ a positiv Gruppe mat clinicopathologic Verännerlechen war gesuergt. An der ophieft IHC negativ Grupp, ophieft VerfÜgung positive stattfannen GC sech mat Alter (P = 0.032) an distal Standuert (P = 0.045) assoziéiert. An der ophieft IHC positive Grupp, ophieft VerfÜgung Gentherapie stattfannen war mat gutt oder mëttelméisseg ënnerscheet Typ vun GC (P = 0.022) (Table S1). VerfÜgung traureg Analyse VerfÜgung assoziéiert d'Cox proportional Risikoe Modell war an zwou univariate an multivariate Tester benotzt. Univariate Cox Réckgang Analyse fir globale Iwwerliewe a Krankheet gratis Iwwerliewe zougedréckt a wesentleche predictive Wäert vun e puer etabléierten prognostic Facteure wéi lymph Node Metastasen, Déift vun entholl, an Lauren d'Klassifikatioun vun histologic Typ. De Patient Grupp deen adjuvant chemotherpy dobäi haten eng bedeitend héich relativ Risiko fir allgemeng (OS) an Krankheet gratis Iwwerliewe (DFS) (P &Si besteet; 0,001, rel Risiko = 3,82 [95,0% CI, 2.81-5.18] fir OS a P &Si besteet; 0,001, rel Risiko = 5,63 [95,0% CI, 3.69-8.58] fir DFS). Allerdéngs war fir ophieft VerfÜgung intron stattfannen, MSI, oder ophieft IHC Verloscht kee groussen Tendenze vu Familljemembere Risiko (RR) observéiert. Multivariate Analyse Verännerlechen vun Déift vun entholl, lymph Node Status, Lauren d'Klassifikatioun vun histologic Typ, adjuvant Chimiotherapie benotzt, ophieft VerfÜgung intron stattfannen, a ophieft FAQ Ausdrock war gesuergt. Ophieft intron stattfannen huet eng déif relativ Risiko mat engem geséchert Bedeitung fir globale Iwwerliewe (P = 0,05, rel Risiko = 0,60, [95,0% CI 0.36-1.00]) (Table 4). Eis Resultater weisen, dass déi kennen vun engem intron widderhuelen am ophieft VerfÜgung Gentherapie Resultat vun aberrant splicing, Virwaat zu 22 BP Läschen a ophieft FAQ Ausdrock Verloscht vun GC Zell Linnen. Des Resultater sinn konsequent mat der viregter Rapport [13] wat d'Identifikatioun vun enger splicing Mängel an der MRE11 VerfÜgung Virleefer ët verbonne Projet'en vun e puer dovun (T) 11 widderhuelen bannent Matsproocherecht Haaptrei 4 (IVS-4), ausschliesslech an MMR-erhéijen Kriibs Zell Linnen an alleréischter erhéijen. Eis Resultater Teamchef Verloscht ophieft FAQ am GC vill mat der Präsenz vun intronic Gentherapie stattfannen am ophieft VerfÜgung vergläichen. VerfÜgung An esouguer-Telangiectasia Patienten, 70% -90% vun ophieft VerfÜgung Projet'en sinn lächerlech, Frame dréint, oder splicing kennen datt d'FAQ [16] truncate. Laut kosmescher Datenbanken (http://www.sanger.ac.uk/cosmic), déi kennen op coding Regioune vun ophieft VerfÜgung Gentherapie zu 5% (433 vun 9249) nogewise goufen vun verschiddenen Cancers. Dorënner zougedréckt Mo. Kriibs stattfannen nëmmen zu 1,35% (1 of 74). Obwuel ophieft VerfÜgung Gentherapie stattfannen am GC virdrun gemellt gouf [3,9], war verständlech Erklärung vun der héich Frequenz vun stattfannen limitéiert an relativ héich Heefegkeet vun funktionell Verloscht vun ophieft [2]. An eiser Etude, huet iwwer 70% vun MSI positive GC bedeitendst ophieft VerfÜgung Gentherapie intronic stattfannen mat ophieft FAQ Verloscht verbonnen. Eis Resultater Ënnerstëtzung staark dass intronic stattfannen vun der ophieft VerfÜgung mat enge MSI ass ee vun de groussen Mechanisme vun ophieft Verloscht vun mënschlech GC. Ophieft Verloscht ass zu MSI positive Colon-Kriibs Zell Linnen mat intronic shortening verbonne zu aberrant splicing zougeschriwwen. Ejima et al. gesichte ophieft VerfÜgung Gentherapie Projet'en 62 Puer oligonucleotide primers benotzt, fir d 'Regioun vun Exon 4 duerch Exon 65 vun ophieft VerfÜgung a seng Reliefsailen introns rangéiert entspriechend. Shortening vun mononucleotide tracts vun ophieft VerfÜgung introns virgesin fir 34 (87%) vun 39 intronic Ännerungen. Drësseg-ee vun hinne waren an der 5. Colon-entholl Zell Linnen mussen MSI (LS180, HCT15, HCT116, SW48, an LoVo) fonnt. Si huet och niddereg Ausdrock vun ophieft FAQ zu MSI positive colorectal Kriibs Zell Linnen [14]. D'ophieft Ausdrock ass op ville Broscht carcinomas bedeitend reduzéiert, an fonnt keen ophieft VerfÜgung stattfannen an datt Zell Linn [17]. Dëst bedeit verschiddenen Fonctiounen vun ophieft VerfÜgung Gentherapie hire Restaurant tëscht gastrointestinal an Broscht Cancers. VerfÜgung Nieft kennen, Genen entholl suppressor kann duerch methylation vun cytosine Reschter bannent CpG Inselen inactivated ginn déi an der etabléiert sinn Promoter vun villen Genen. ophieft VerfÜgung Gentherapie ass eng Verfilmung Zil fir epigenetic silencing duerch surfen methylation vu sengem proximal Promoteur Regioun deemolegt Weltbild mat fräi radiosensitivity an niddreg FAQ Ausdrock vun engem Mënsch Linn colorectal entholl Zell [18] a mënschlech glioma Zell Linn [18]. ouni ophieft VerfÜgung Gentherapie kennen. VerfÜgung D'MSI Reklamme vun der ophieft VerfÜgung Gentherapie e Lien tëscht MSI an DNA Reparatioun am GC vertrieden. Puer Studien weisen, dass funktionell Verloscht vun ophieft an MSI fräi ass a mënschlech ophieft VerfÜgung Gentherapie eng grouss Zil- fir inactivation zu MSI positive GC Zell Linnen an Stoffer ass [19,20]. De Grond fir Contreras héich Heefegkeet vun ophieft VerfÜgung Gentherapie intron stattfannen an MSI positive GC kéint wéinst der mononucleotide Widerhuelung (T) 15, an enger Längt vun 13 nucleotides oder méi sech besonnesch ufälleg sinn an dëser shortening geziilte [14 ]. D'Frequenz vun ophieft VerfÜgung Gentherapie frameshift stattfannen (T) 7 am Exon 6 coding Haaptrei am MSI positive GC war nëmme 6% (2/36) [8] gemellt ginn, deen ass méi kleng wéi eisen Observatioun. VerfÜgung Et ass confirméiert datt ophieft hunn Zellen zu de Wuesstem-inhibitory Auswierkunge vun PARP inhibitor, olaparib, an gastric Kriibs Zellen mat reduzéierter ophieft VerfÜgung Ausdrock sensitizes [21]. Puer dovun (Kréien-ribose) polymerase inhibitors Moment sinn am Medeziner Prozesser géint eng Varietéit vun Cancers évaluéiert, inklusiv vun Colon carcinoma [22]. An GC, ass ophieft hunn eng Estimatioun vun Äntwert ze PARP inhibitor [23-25] gin bekannt. A Bewaacher vun homologous recombination, 51 Rad, predictive Bewaacher vun neoadjuvant anthracylcine-baséiert Chimiotherapie zu Broscht Kriibs [26] souwéi vun PARP inhibitor am GC gin ass bekannt [24]. VerfÜgung Eis Resultater weisen, datt ophieft FAQ Verloscht ass net eng aggressiv Faktor vun GC, obwuel et vill mat encadréiere Trend vun HR zu MSI negativ GC verbonnen ass. Dëst ass vergläichbar mat aner Studien dass ophieft FAQ Verloscht als Apdikter prognostic Faktor gemellt [20]. An eise Studien, ophieft VerfÜgung stattfannen an ophieft negativ GC hu verschidde clinicopathologic Charakteristiken; Ee, huet dës Grupp keng Iwwerliewe Ënnerscheed mat anerer weisen. An MSI negativ Grupp, HR vun GC mat ophieft FAQ Verloscht war vill héich, awer, an MSI positive Grupp, HR am GC mat ophieft FAQ Verloscht net wichteg war. Dëst bedeit datt MSI e Potential molekulare Faktor ass biologescher Behuele vun GC betrëfft. Also, eiser Etude ënnerstëtzt dass MSI Status der Empfindlechkeet op PARP inhibitor Afloss konnt duerch de Statut vun DNA Schued Äntwert FAQ Ausdrock duerch mononucleotide Auswierkungen Widerhuelung hire Restaurant. VerfÜgung Am Resumé, ophieft VerfÜgung Gentherapie stattfannen am GC ass 12,9%, an 33,0% vun GC mat ophieft VerfÜgung Gentherapie stattfannen mat ophieft FAQ Perte verbonnen ass. MSI positive GC zougedréckt ophieft VerfÜgung stattfannen zu 69,7%. Eis Resultater hindeit, datt d'Resultat vun ophieft Verloscht a Sensibilitéit fir chemotherapeutic Massa, olaparib, kéint besser verstane ginn, wann Fäll stratified baséieren op ophieft VerfÜgung Gentherapie stattfannen Statut oder MSI. VerfÜgung Eis studéieren réischt ophieft VerfÜgung Gentherapie intron stattfannen an 69% vun MSI positive GC präsent ass an 49% vun ophieft VerfÜgung intron stattfannen assoziéiert ass mat Verloscht vun ophieft FAQ. Dës proposéiere der ophieft VerfÜgung Gentherapie intron stattfannen vun microsatellite Onstabilitéit cibléiert ass verbonne mat ophieft FAQ Verloscht vun engem Ziel vum Mënsch gastric Kriibs. VerfÜgung Aféierung VerfÜgung
spontan a Methode VerfÜgung
Resultater VerfÜgung
MSI
ophieft VerfÜgung Gentherapie stattfannen vun intronic mononucleotide Widerhuelung VerfÜgung ophieft VerfÜgung sequencing
ophieft VerfÜgung RT-Hinnen alleguer
ophieft IHC
Bat 26 VerfÜgung Bat 25 VerfÜgung IVS 6 VerfÜgung IVS 10 VerfÜgung IVS 20 VerfÜgung Exon 6 VerfÜgung Exon 10
Exon 20 VerfÜgung Exon 6 VerfÜgung Exon 10 VerfÜgung Exon 20
SNU-1 +++++ 22-BP delnono22-BP delnonoNegativeSNU-5 ----- nonononononoPositiveSNU-16 ----- ndndndnononoPositiveSNU-216 - +++ nononono nonoPositiveSNU-484-----ndndndnononoPositiveSNU-601-----ndndndnononoPositiveSNU-620-----ndndndnononoPositiveSNU-638+++++22-bp delnono22-BP del nonoNegativeSNU-668 ----- ndndndnononoPositiveSNU-719 ----- ndndndnononoPositiveTable 1. Microsatellite Onstabilitéit Status an ophieft VerfÜgung Gentherapie Profiler vu mënschlechen gastric Kriibs Zell Linnen. VerfÜgung IVS, Matsproocherecht Haaptrei; IHC, immunohistochemistry. CSV Luet CSV
Intron stattfannen an ophieft IHC negativ GC VerfÜgung em <> ophieft VerfÜgung IVS 6 (T) 1550/540 (9.3%) 42/50 (84.0%) 29/111 (26.1%) ophieft VerfÜgung IVS 10 (T) 1559/534 (11.0%) 47/59 (78.7%) 29/111 (26.1%) ophieft VerfÜgung IVS 20 (T) 1546 /523 (8,8%) 34/46 (73.9%) 22/107 (20.6%) ophieft VerfÜgung IVS 6 oder IVS 10 oder IVS 20 (T) 1578/604 (12.9%) 53/76 (69.7%) 37/112 (33.0%) Table 2. Incidencies vun ophieft VerfÜgung Gentherapie intron stattfannen an der gastric Cancers (GC) VerfÜgung IVS, Haaptrei intervenéiert. MSI, microsatellite Onstabilitéit; IHC, immunohistochemistry. CSV Luet CSV
ophieft IHC
MSI VerfÜgung ophieft VerfÜgung stattfannen VerfÜgung N VerfÜgung Negativ VerfÜgung Positiv VerfÜgung NegativeNegative49768 (13.7 %) 429 (86.3%) Positive244 (16.7%) 20 (83.3%) Subtotal52172 (13,8%) 449 (86.2%) PositiveNegative237 (30.4%) 16 (69.6%) Positive5233 (63.5%) 19 (36.5%) Subtotal7540 (53.3 %) 35 (46.7%) Negative52075 (14.4%) 445 (85.6%) Positive7637 (48.7%) 39 (51.3%) Total596112 (18.8%) 484 (81.2%) Table 3. Heefegkeet vun ophieft FAQ Ausdrock vun subgroups no microsatellite Instabilitéit bemierkbar (MSI) Zoustand a ophieft VerfÜgung stattfannen intron. VerfÜgung CSV CSV
Allgemengen traureg VerfÜgung
Genau Free traureg
rel Risiko VerfÜgung 95,0% CI VerfÜgung P Wäert VerfÜgung N
rel Risiko
95,0% CI VerfÜgung P Wäert VerfÜgung N VerfÜgung Détailléiert Gastric Cancer8.263.00-22.750.005965.051.81-14.130.00544Lymph Node positive6.663.47-12.770.005963.201.58-6.480.00544Diffuse Typ histology1.431.06 -1.940.025961.611.09-2.360.02544Adjuvant chemotherapy0.990.57-1.730.985962.171.00-4.720.05544 ophieft VerfÜgung intron mutation0.600.36-1.000.055960.560.29-1.080.08544ATM FAQ loss1.190.82-1.730 .355961.100.67-1.810.70544Table 4. Multivariate Cox Réckgang Analyse. VerfÜgung CSV CSV Luet Diskussioun VerfÜgung
Konklusiounen VerfÜgung
Ennerstëtzung Informatiounen VerfÜgung Table S1. VerfÜgung Clinicopathologic kennenzeléieren vun gastric carcinoma mat der ophieft Gentherapie stattfannen an ophieft FAQ Ausdrock. VerfÜgung Doi: 10,1371 /journal.pone.0082769.s001 VerfÜgung (DOCX) VerfÜgung
Probiotika als adjuvant Therapie fir COVID-19 Patienten
Raw Déierefudder e Risiko fir Mënschen an Déieren
Detailléiert Kaart vum mënschlechen Zongmikrobiom
Microbiome kéint hëllefen de Virkriibsrisiko bei Fraen mat HPV z'identifizéieren
Spider Venom Peptid kéint hëllefen de Péng am irritablen Darmsyndrom ze stoppen
Vaginale Bakterien verbonne mat virzäiteger Gebuert
Proteinboten aus dem mënschleche Mikrobiom werfen Liicht op d'mënschlech Gesondheet
De mënschleche Kierper gouf fir Joerhonnerte studéiert, awer et ginn ëmmer nach Geheimnisser déi sech nach entfalen. Zum Beispill, et gouf entdeckt datt et Billiounen Bakterien am Kierper liewen, déi,
Organesch Äppel hunn probiotesch Eegeschaften
En Apel den Dag ... seet dat aalt Spréch. Et géif schéngen datt jiddereen daccord ass, beurteelen no der Nummer 1 Positioun déi Äppel ënner Friichten op der ganzer Welt halen, mat 83 Milliounen Äppel
Féiert Hypertonie ëmmer zu eeschte COVID-19?
Verursacht vum infektiösen Agent, schwéier akut Atmungssyndrom Coronavirus 2 (SARS-CoV-2), dCoronavirus Krankheet 2019 (COVID-19) ass dacks méi schwéier bei deenen mat ënnerierdesche medizinesche Bedé