PLOS ONE: Epigenetisk tysta MIR-338-3p Bidrar till Tumörframkallande vid ventrikelcancer genom att rikta SSX2IP

Abstrakt

MicroRNA har nyligen erkänts som spelar en framträdande roll i tumörbildning och metastas. Här rapporterar vi att MIR-338-3p var epigenetiskt tystas i magcancer och dess nedreglering var signifikant korrelerad med magcancer kliniskt patologiska funktioner. Påfallande, återställa MIR-338-3p uttryck i SGC-7901 gastric cancerceller hämmade proliferation, migration, invasion och tumörbildning In vitro Mössor och In vivo
, åtminstone delvis genom att inducera apoptos. Dessutom visar vi onkogenen SSX2IP är ett mål för MIR-338-3p. Vi föreslår att MIR-338-3p fungerar som en tumörsuppressor i magcancer, och metylering status för dess CpG-ö skulle kunna tjäna som en potentiell diagnostisk markör för magcancer

Citation. Li P, Chen X, Su L, Li C, Zhi Q, Yu B, et al. (2013) Epigenetisk tysta MIR-338-3p Bidrar till Tumörframkallande vid ventrikelcancer genom att rikta SSX2IP. PLoS ONE 8 (6): e66782. doi: 10.1371 /journal.pone.0066782

Redaktör: Alfons Navarro, universitetet i Barcelona, ​​Spanien

Mottagna: 17 januari 2013, Accepteras: 10 maj 2013; Publicerad: 24 juni 2013

Copyright: © 2013 Li et al. Detta är en öppen tillgång artikel distribueras enligt villkoren i Creative Commons Attribution License, som tillåter obegränsad användning, distribution och reproduktion i alla medier, förutsatt den ursprungliga författaren och källan kredit

Finansiering:. Denna studie har finansierats med bidrag från National Natural Science Foundation i Kina (nummer 30872476, 81072012, 81172324, 91229106, 30900670 och 81.272.749), vetenskap och teknik kommissionen i Shanghai kommun (nummer 10jc1411100, 09DZ1950100, 09DZ2260200, 11jc1407602 och 101.409.042.000), Shanghai Key Disciplin ( S30204), och projekt i National Science & Teknik pelare Program Kina (nummer 2008BA152B03 och 2011BA203191), Kina Post Science Foundation (nummer 2011M500796). Finansiärerna hade ingen roll i studiedesign, datainsamling och analys, beslut att publicera, eller beredning av manuskriptet

Konkurrerande intressen:.. Författarna har förklarat att inga konkurrerande intressen finns

Introduktion

Gastric cancer är en malignitet med hög förekomst och den näst vanligaste orsaken till cancerdöd worldwide [1]. Den tidiga diagnostiska hastighet av magcancer är låg, och patienterna är i allmänhet svårt att få diagnosen tills cancern har utvecklats till framskridet stadium eller metastaser. Således är det av stor betydelse att genomföra en fördjupad undersökning av patogenesen av magcancer och att leta efter nya molekylära beslutsfattare och terapeutiska mål.

MicroRNAs är små RNA som reglerar genuttryck, och de är inblandade i en mängd olika biologiska signalvägar [2]. Flera studier har avslöjat betydande skillnad av mikroRNA expression profiling mellan tumörceller och celler härledda från normala vävnader, vilket tyder på att mikroRNA har spelat en viktig roll i tumörbildning [3], [4]. Således har MicroRNAs nyligen blivit en hotspot av genetisk diagnos och behandling mål som nya onkogener eller suppressorgener [5], [6]. Onormalt uttryck av mikroRNA i vävnader eller serum är nära besläktad med flera humana maligniteter inklusive magcancer [7], [8], och flera nedregleras mikroRNA i magcancer vävnader har tumörhämmande funktioner. Till exempel var Let-7 mikroRNA familj först hittade som en repressor av RAS, förtrycka RAS och c-myc uttryck på translationell nivå [9]. Uttrycksnivån för låt-7a har minskat avsevärt i gastriska tumörer, medan Ras-protein är betydligt högre i gastric tumör [10]. Dessutom har MIR-15b, MIR-16 och MIR-21 etc anslutits till utveckling och klinisk diagnos av magcancer [11], [12]. Vår grupp har också rapporterat cancer roll miR-126, MIR-409-3p och MIR-155 i magcancer [13] - [15]

MicroRNA microarray utfördes för att detektera miRNA profiler i magsäcken. cancer, och vi fann att mIR-338-3p var betydligt nedregleras (opublicerade data). MIR-338-3p, ligger på kromosom 17q25.3 med en längd av 22 nt, rapporterades första gången i prion-inducerad neurodegeneration som ett uttryck för MIR-338-3p reduceras i hjärnan hos möss som infekterats med mus-anpassad skrapa [ ,,,0],16]. MIR-338-3p kunde reglera mRNA-nivån av sin värd gen Apoptos-associerad tyrosinkinas (AATK) i rått neuroner [17]. Å andra sidan, miR-338-3p var uppreglerat hos patienter med sporadisk amyotrofisk lateralskleros (Sals), en annan typ av nervsystemet lesioner [18]. Viktigt har en roll MIR-338-3p i tumörbildning tidigare föreslagits, som MIR-338-3p är nedregleras i ändtarmscancer [19], och regleras av hepatit B-virus X protein (HBx) för att inhibera proliferation och invasion av hepatomceller genom att binda till målgener CyclinD1 och smoothened i hepatocellulärt karcinom [20] - [22]. Det är dock fortfarande okänd roll MIR-338-3p i GC.

I den aktuella studien analyserade vi ytterligare nedreglering uttryck av MIR-338-3p i GC vävnader jämfört med patient matchad normal vävnader, och fastställt att uttrycksnivån för mIR-338-3p var nära korrelerad med clinicopathologic variablerna i GC. Ektopiskt uttryck av MIR-338-3p hämmar proliferation, invasion och metastas av gastric cancerceller, minskar tumörframkallande förmågan hos gastric cancerceller i nakna möss, och främjar apoptos. Vi visar också att MIR-338-3p kan fungera som en tumörsuppressor genom att direkt rikta SSX2IP. Således, våra resultat tyder på att MIR-338-3p är en potentiell diagnostisk markör och terapeutiskt mål för magcancer.

Material och metoder

1. Cellinjer och kultur

De humana magcancer-cellinjer SGC-7901, NCI-N87, BGC-823 och AGS köptes från Shanghai institut för Biological Sciences, Chinese Academy of Sciences [23] - [26]. KATO-III och SNU-1 köptes från ATCC (American Type Culture Collection) [24], [27], MKN28 och MKN45 erhölls från den japanska Cancer Research Resources Bank [28], den immortaliserade gastrisk epitelceller linje, GES -1, var en gåva från professor Feng Bi (Huaxi sjukhus, Sichuan University, Chengdu i Sichuanprovinsen, PR Kina) [29], [30]. HEK293T, humana embryonala njurcellinjen, bevarades i vårt institut. De gastriska cancercellinjer odlades i RPMI1640 kompletterat med 10% FBS (fetalt bovint serum) vid 37 ° C i en fuktad atmosfär av 5% CO2. HEK293T-celler odlades i DMEM (Dulbeccos modifierade Eagles medium) kompletterat med samma odlade villkoret ovan.

2. Etik Uttalande

Skriftligt informerat samtycke i studien erhölls från alla deltagare. Studieprotokollet godkändes av den etiska kommittén i Ruijin Hospital, School of Medicine, Shanghai Jiao Tong University.

3. Vävnadsprover

Primära magcancer vävnader och matchade icke-tumörvävnad samlades in från 66 patienter som genomgick radikal gastrostomi vid institutionen för kirurgi, Ruijin Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine. Ingen av patienterna erhöll preoperativ behandling. Alla vävnadsprover samlades in med patienternas informerat samtycke och bekräftas av patologisk undersökning och den histologiska skriva baserades på Lauren klassificering. TNM klassificeringen definitioner enligt den internationella unionen mot cancer (2002).

4. RNA-isolering och qPCR

Totalt RNA isolerades från cellinjer och vävnadsprover genom mir
Vana ™ miRNA Isolation Kit (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA) enligt tillverkarens instruktioner. Kvalitet och kvantitet av RNA-proverna bedömdes av standard-elektrofores och spektrofotometriska metoder. Uttrycksnivån för MIR-338-3p i cellinjer och vävnadsprover mättes med qPCR och beräknades såsom beskrivits [13]. Uttrycksnivån för SSX2IP mRNA mättes med qPCR enligt TaqMan Gene Expression Analyser protokoll (Applied Biosystems). GAPDH mRNA-nivån användes för normalisering.

5. DNA-isolering och metyleringsanalys

Genomiskt DNA från vävnadsprover renades med användning DNAzol (Invitrogen). Natriumbisulfit omvandling utförts med hjälp av Qiagen Epitect Bisulfite Kit (Qiagen) enligt tillverkarens anvisningar. Metyleringen statyer utfördes genom Metylering specifik PCR (MSP). Primrarna för metylerade eller ometylerade DNA som designats av programvaru Metyl Primer Express v1.0 (ABI) .Det metylering framåt primer för CpG Mir-338-3p: 5'-GGCGGAGTTTATGGTTTTC-3 'och den omvända primern: 5' -AAACCTAACCGATCCTCG-3 ', den unmethylation framåtriktad primer för CpG av mIR-338-3p: 5'-TGGTGGAGTTTATGGTTTTT-3' och den omvända primern: 5'-AAACCTAACCAATCCTCACAA-3 '

6.. Transient transfektion av miRNA härmar

miRNA-338-3p härmar och negativa kontroll härmar köptes från GenePharma (Shanghai, Kina) .Cells såddes i cellodlingsplattor 20 timmar före transfektion för att säkerställa 70% cellsammanflödet vid ögonblick av transfektion. Transfektion av miRNA härmar i celler utfördes med användning av Lipofectamine2000 (Invitrogen) enligt tillverkarens förfarande. Mirna härmar arbetat på slutlig koncentration av 100 nM. Vid 48 h post-transfektion qPCR och Western blöt utförs.

7. Cellprolifereringsanalys

cellproliferation bedömdes genom WST (vattenlösligt tetrazoliumsalt) analys med användning av en cell Counting Kit-8 (Dojindo) i enlighet med tillverkarens instruktioner. Vid 24 h efter transfektion med miRNA härmar, celler (2 x 10 ^{3 celler /brunn) var utsäde i 96-brunnars plattor. Plattorna inkuberades i 5 dagar. Antalet livsdugliga celler bestämdes genom mätning av absorbansen vid 450 nm.}

8. Mjukagar-kolonibildningsanalys

GC-celler transfekterade med miRNA härmar återsuspenderades med 0,3% mjuk agar i RPMI1640 innehållande 10% FBS och skiktades på 0,6% stelnat agar i RPMI1640 innehållande 10% FBS i 6-brunnars plattor (1 × 10 ^{3 celler /brunn). Plattorna inkuberades vid 37 ° C i en fuktad atmosfär av 5% CO _{2. Kolonier som innehåller åtminstone 50 celler räknades.}}

9. Cell migration och invasion Assay

Migration av celler utfördes med användning av QCM ^{TM24-Well Kolorimetrisk Migration Assay Kit (Millipore) i enlighet med tillverkarens instruktioner. För invasionen test, har Cell Invasion Assay Kit (Millipore) användes i enlighet med tillverkarens instruktioner. Celler (1 x 10 5) i 300}

• PLOS ONE: Postoperativ kemoradioterapi mot Postoperativ kemoterapi för helt opererande Gastric cancer med D2 lymfkörtlar: A Meta-Analysis
• PLOS ONE: Mir-184 bindningsställe rs8126 T > C polymorfism i TNFAIP2 är förknippad med risk för Gastric Cancer