Stomach Health > skrandžio sveikatos >  > Gastric Cancer > skrandžio vėžys

PLoS ONE: klinikinė reikšmė MLH1 metilinimas ir CpG Island Methylator Fenotipas kaip prognostiniai Žymekliai pacientams, sergantiems skrandžio vėžiu

Anotacija

Fonas

Jei pagerinti pacientams, kenčiantiems nuo skrandžio vėžio rezultatą, geriau suprasti pagrindinių genetinių ir epigenetinių įvykius šiame piktybinių navikų yra privalomi. Nors CpG sala methylator fenotipas (CIMP) ir Mikrosatelitinis nestabilumas (MSI) buvo įrodyta, kad vaidina pagrindinį vaidmenį skrandžio vėžio patogenezės, klinikinė reikšmė šių įvykių išgyvenimo rezultatus pacientams, sergantiems skrandžio vėžiu tebėra nežinoma.

metodai

Šis tyrimas apėmė pacientų kohortos su patologiškai patvirtino skrandžio vėžiu, kuris turėjo chirurginės rezekcijų. buvo analizuojama 68 skrandžio vėžiu kohortos. CIMP ir MSI statusai buvo nustatyti analizuojant promotoriaus CPG sala metilinimo statusą 28 genų /loci ir genomo nestabilumo metu 10 mikrosatelitinių žymenų, atitinkamai. COX anketa proporcingas pavojai modelis buvo atlikta Dispersinės analizės, įskaitant amžių, etape, naviko diferenciacijos kras
mutacijų būklė ir kartu CIMP / MLH1
metilinimas statusas, atsižvelgiant į bendro išgyvenamumo (OS).

rezultatai

Dispersinės analizės duomenimis, ilgiau OS reikšmingai koreliavo su mažesniu patologinis etape ( p
= 0.0088), geriau naviko diferenciacijos ( p
= 0,0267) ir CIMP aukščio ir MLH1 3 "
metilo statusas ( P
= 0,0312). Stratifikacija CIMP statusą atsižvelgiant į MLH1
metilinimas būsenos toliau leido prognozuoti skrandžio vėžio prognozei.

Išvados

CIMP ir /arba MLH1
metilinimas statusas gali turėti galimybę būti prognostiniai biologiniai žymenys skirti pacientams, sergantiems skrandžio vėžiu

nurodomoji dalis:. Shigeyasu K Nagasaka T Mori Y Yokomichi N Kawai, T Fuji T et al., (2015) klinikinė reikšmė MLH1 metilinimas ir CpG Island Methylator Fenotipas kaip prognostiniai Žymekliai pacientams, sergantiems skrandžio vėžiu. PLoS ONE 10 (6): e0130409. Doi: 10,1371 /journal.pone.0130409

redaktorius: Hassanas Ashktorab Howard universitetas, JAV

Įstojo: Vasario 18, 2015; Priėmė: Gegužės 20, 2015 m Paskelbta: Birželis 29, 2015

Visos teisės saugomos: © 2015 Shigeyasu et al., Tai atviros prieigos straipsnis platinama pagal Creative Commons Attribution licencija, kuri leidžia nevaržomai naudotis, paskirstymo ir dauginimąsi bet kokioje laikmenoje sąlygomis, su sąlyga, kad pirmasis autorius ir šaltinis įskaitomos

Duomenų Prieinamumas: Visi susiję duomenys yra per popieriaus ir jo Pagalbinė informacija failus

finansavimas:. Šis darbas buvo remiamas KAKENHI dotacijų 19390351 ir 20590572 ir TN, o dotacijų R01 CA72851 ir 181572 iš nacionalinio vėžio instituto, National Institutes of Health, ir lėšos iš Baylor tyrimo instituto prie AG

konkuruojančių interesų:. autoriai paskelbė, kad konkuruojantys interesai egzistuoja

Įvadas

Skrandžio vėžys yra antra pagrindinė priežastis, dėl vėžio. "susiję mirtys, iš kurių apie 700.000 patvirtino mirtingumo kasmet visame pasaulyje, nors sergamumas palaipsniui sumažėjo [1-3]. Skrandžio vėžys paprastai diagnozuojamas pažengęs, kuris yra pagrindinė priežastis jos blogos prognozės [4]. Norėdami pagerinti skrandžio vėžio rezultatą, reikia identifikuoti genetinių ar epigenetinių įvykių skrandžio vėžio progresavimą. Svarbiausia epigenetinius įvykis vėžio progresavimui metilinimo promotoriaus CpG regionuose pagrindinių vėžinių slopintuvas genų. CpG salos yra beveik 1 kb ilgio sekos DNR su dideliu guanino-citozinu turinio promotoriaus regionuose [5] genuose. Skirtingai normalios ląstelės, CpG salos per auglio slopinamojo genų vėžio ląstelių dažnai hypermethylated, dėl to CpG sala methylator fenotipo (CIMP) [6,7]. Epigenetinius triukšmo slopinimo naviko susijusių genų, nes CpG salos metilinimo neseniai buvo pranešta skrandžio vėžio. Netipinė CpG sala metilinimo > 100 augimo reguliavimo genų skrandžio vėžio šiol buvo pranešta [8-24], tačiau klinikinė reikšmė CIMP skrandžio vėžio lieka neištirta ir prastai suprato

priešingai. , neatitikimas remontas (MMR) trūkumas skrandžio vėžio taip pat yra svarbus genetinis įvykis. Genomo nestabilumas per mikrosatelitiniai kartojasi (arba mikrosatelitai) skaičius vadinamas mikrosatelitinio nestabilumą (MSI). MSI yra funkcija, kurią sukelia su defektais DNR MMR sistema. Funkcinis inaktyvacijai MMR genų, pavyzdžiui, MLH1
arba MSH2
iki rengėjas metilinimas yra atsakinga už MSI aukštas (MSI h) fenotipas skrandžio vėžio. Ankstesniame tyrime, skrandžio vėžys su MSI-H parodė aukštesnį dažnį antralinių vietoje, žarnyno potipio, rečiau limfmazgių metastazių, ir pagerinti išgyvenimo, lyginant su mikrosatelitiniai stabilus (MSS) ar MSI-L skrandžio vėžio [17,25 -30]. Tačiau klinikinė reikšmė MMR trūkumo skrandžio vėžiu tebėra nežinoma.

Atsižvelgiant į šį atotrūkis žinių, šiame tyrime mes tyrinėjo CIMP ir MMR trūkumo reikšmę skrandžio vėžio ir nustatė savo įnašą, kaip prognostinė žymekliai pacientams, sergantiems skrandžio vėžiu.

medžiagos ir metodai

Audinių mėginiai

Šis tyrimas apėmė pacientams, sergantiems patologiškai patvirtino skrandžio vėžio kohortos, kurie buvo atliktos chirurginės rezekcija esant Okayama University ligoninė (Okayama, Japonija) nuo 1998-2004. buvo analizuojama 68 skrandžio vėžiu audinių ir jų suderintų normaliomis skrandžio gleivinės viso. Visos normalios skrandžio gleivinės audiniai buvo gauti iš vietose, gretimose, bet ne mažiau kaip 5 cm atstumu nuo, į pirminio naviko. Visi pacientai pateikiami raštiški informuotas sutikimas, o tyrimas buvo patvirtintas etikos komitetui Okayama University ligoninėje. Visi pacientai pateikiami raštiški informuotas sutikimas už naudojimąsi jų duomenų ateitis analizes. Visi skrandžio vėžio ir normalus skrandžio gleivinė buvo šaldytos audinio mėginiai, iš kurių DNR buvo išgauti naudojant QIAamp DNR Mini Kit (Qiagen).

MSI analizė

MSI analizė atlikta nagrinėjant 2 mononukleotido kartojasi (BAT25 ir BAT26), 12 dinukleotidas kartojasi (D17S250, D18S35, D18S58, D18S69, D2S123, D4S1559, D4S2381, D4S470, D5S107, D5S346 ir D8S87, TP53), ir vienas tetranukleotido kartojasi, MYCL, kaip aprašyta anksčiau [ ,,,0],31]. Navikai, rodantys alelių permainos ≥5 iš 15 žymeklių buvo klasifikuojami kaip MSI-H (priimant tokį sprendimą vadinamiems MSI), o likusi dalis buvo klasifikuojami kaip Mikrosatelitinis stabilios (MSS).

Natrio bisulfito modifikavimas ir CIMP analizuoja

Kadangi dažnai hypermethylation kelių genų yra viena iš pagrindinių savybių auglių su CIMP, mes ištirti metilinimo statusą 28 promotoriaus CpG salos susijusių lokusų ( APC
CHFR
COX2
DAPK
"DCC
HPP1
" MGMT-Mp regionas
"MGMT-Eh regionas
MINT1
MINT2
MINT31
MLH1 5 '
MLH1 3 '
P14
P16
RASSF1A
RASSF2A-regionas1
RASSF2A-REGION2
RASSF3
RASSF5
RASSF6
RUNX3
SFRP2-regionas1
SFRP2- REGION2
UNC5C
3OST2
FOXL2
), ir atitinkami gruntas sekos yra išvardytos S1 lentelėje. Genomo DNR buvo bisulfito modifikuoti konvertuoti visus nedenatūruotą citozino likučius į uracilai. Trumpai tariant, 0,5-2,0 mikrogramų DNR buvo denatūruotas NaOH, gydomi natrio bisulfitu ir išgrynintas naudojant vedlį DNR valymo sistema (PROMEGA). Metilinimo statusas kiekvieno CIMP susijusiai lokuso buvo įvertintas pagal Kombinuotosios bisulfito apribojimų analizę (COBRA). Polimerazės grandininė reakcija (PGR) COBRA buvo atliekamas su bisulfito modifikuotas DNR šablono į 25-mikrol, PGR mišinio, turinčio 12,5 įxL HotStarTaq pagrindinio mišinio rinkinio (Qiagen), 0,5 mikromoliai /l kiekvieną PGR pradmens, ir maždaug 25 ng bisulfito modifikuotų DNR. PGR produktai buvo suardomas pridedant restrikcijos fermentu 37 ° C temperatūroje 12 valandų. Virškinant DNR buvo atskirtos 3% agarozės gelyje 1 × Tris-acetatas-EDTA buferinio tirpalo ir nudažomi su etidžio bromido. Žmogaus normalusis storosios žarnos DNR gydomi SssI metilazę (New England Biolabs) buvo naudojamas kaip teigiama kontrolė metilintų alelių, ir DNR nuo normalių limfocitų buvo naudojamas kaip nemetilintas alelių kontrolės. Vandens buvo naudojamas kaip kontrolinį neigiamos PGR stebėti PGR užteršimo. CIMP aukšto buvo apibrėžiama kaip ne mažiau kaip 10 šių lokusų metilinimo.

, kras
mutacija analizuoja

Tiesioginis sekos buvo atliekama siekiant nustatyti KRAS
Exon 2 (kodono 12/13) mutacijos. PGR už , kras
genas buvo atlikta 25-iL PGR mišinio, turinčio 12,5 pL HotStarTaq magistras Mix rinkinys su pradmenimis. QIAquick PGR valymo rinkinys buvo naudojamas išvalyti PGR produktus, ir jie buvo tiesiogiai sekos ant ABI 310 DNR sequencer [32].

statistines analizes

JMP programinė įranga (ver 10,0, SAS Institute Inc .) buvo panaudota siekiant atlikti statistinę analizę. Stjudento t-testas buvo naudojamas palyginti nuolat kintamuosius ir Fišerio tikslusis testas buvo naudojamas analizuoti kategorinius kintamuosius. Bendras išgyvenamumas (BI) buvo matuojamas nuo operacijos dienos iki mirties dienos. Kaplan-Meier metodu ir log-rank statistika skirtumų tarp įvairių prognostinių faktorių buvo naudojamas įvertinti OS paskirstymą. Cox proporcinės pavojingumo modeliai buvo naudojami apskaičiuoti rizikos santykis (HR) su atitinkamomis 95% pasikliautinasis intervalas (PI). Vienmatės arba daugiamatis logistinės regresijos analizė atliekama siekiant nustatyti HR skirtumus tarp kiekvienos grupės. Visi pateikti P
vertybės yra dvipusiai, ir P
< 0,05 buvo laikomas rodo statistinį reikšmingumą.

Rezultatai

Studijų gyventojų

Šiame tyrime mes ištirti 68 pacientai, sergantys skrandžio vėžio. Per promotoriaus CpGs iš nulėmė MLH1
genas, plitimą CpG metilinimo jos 3 'regione būti už MLH1 išraiška [33] kritinė. Iš paciento kohortos ir įvairių klinikos funkcijų dėl lyties, amžiaus, etape, naviko diferenciacijos, MSI statusą, aprašymas, kras
mutacija, ir MLH1 3 "
metilinimas yra parodyta 1 lentelėje. Šios būsenos buvo lyginami tarp CIMP aukštų ir CIMP mažos grupės. Šių parametrų, MSI statusą ir MLH1 3 "
metilinimo statuso parodė puikių skirtumų tarp 2 grupių (1 lentelė).

Metilinimas statusas

28 CpG lokusų įskaitant APC
CACNA1G
CHFR
COX2
DAPK
"DCC
HPP1
"MGMT-Mp regionas
" MGMT-Eh regionas
MINT1
MINT2
MINT31
, MLH1 5 '
MLH1 3'
P14
P16
RASSF1A
RASSF2A-regionas1
RASSF2A-REGION2
RASSF3
RASSF5
RASSF6
RUNX3
SFRP2 -region1
SFRP2-REGION2
UNC5C
3OST2 parsisiųsti ir FOXL2
buvo analizuojami nustatant CIMP statusas kiekvienai skrandžio vėžio , Metilinimas spektras Šių lokusų yra parodyta plytelių žemėlapyje (1a pav). Be šių lokusų CACNA1G
CHFR
"DCC
HPP1
MINT1
MINT2
MINT31
MLH1 5 '
MLH1 3'
P16
RASSF2A-regionas1
RASSF2A-REGION2
RUNX3
SFRP2-REGION2
UNC5C
3OST2
, ir FOXL2
buvo žymiai metilinti CIMP aukščio grupės (2 lentelė).

Išgyvenimo rezultatai pacientams, pagrįstų MLH1 3 "
metilinimo ir CIMP būklės skrandžio vėžiu pervežimas

sutampa santykiai tarp CIMP ir , buvo analizuojami MLH1 3 "
metilinimas statusas. 10 ligonių buvo CIMP aukšto / MLH1 3 "
metilo, 1 pacientas į CIMP mažai / MLH1 3"
metilo, 20 pacientai buvo į CIMP aukštos / MLH1 3 "
ne metilo ir 37 ligonių buvo CIMP mažai / MLH1 3"
ne metilo grupėmis (1b pav). Kaplan-Meier išgyvenimo kreivės buvo sukurtas pagal MLH1 3 'pervežimas metilinimo statusą. 5 metų OS normos buvo nustatytas MLH1 3 "
denatūruotu ir ne metilo grupėmis. 5 metų OS normos buvo gerokai didesnis, MLH1 3 "pervežimas denatūruotą grupėje, lyginant su ne-metilo grupė. (Log-rank P
= 0,0257; 1c pav)

Taip pat, 5 metų OS normos buvo analizuojami už CIMP aukštų ir CIMP mažai grupių, o norma buvo šiek tiek didesnis CIMP aukščio grupėje, nei CIMP mažai grupei, tačiau skirtumas nebuvo reikšmingas ( log-rank p
= 0,0688; pav. 1d)

įnašas neatitikimas remonto trūkumus ir CIMP statusą išgyvenamumas

5 metų išgyvenamumas buvo analizuojami ir lyginami tarp šių grupių; CIMP aukšto / MLH1 3 "
metilo, CIMP mažai / MLH1 3"
metilo, CIMP aukštos / MLH1 3 "
ne metilo ir CIMP mažai / MLH1 3 "
ne metilinti grupes. Mes pažymėjo, kad bendras išgyvenamumas buvo didesnis bendras CIMP aukšto / MLH1 3 "
metilo grupė, lyginant su kitomis grupėmis, kur skirtumai nebuvo statistiškai reikšmingi (log-rank p
= 0,0706; pav. 1e)

santykiai tarp MLH1
metilinimas ir MSI

sutampa santykiai tarp MLH1 5 '
metilinimas ir buvo analizuojami 3 "
metilinimas statusas. 10 pacientai buvo klasifikuojama kaip MLH1 5 '
denatūruotas / 3 "
metilo, 8 pacientai kaip MLH1 5'
denatūruotas / 3"
ne- metilo, 1 pacientui kaip MLH1 5 '
ne denatūruotas / 3 "
metilinti ir 49 pacientams, 5"
ne denatūruotas / 3 "
ne-metilintas (2a pav). Be MLH1 3 "
denatūruotą grupės, daugiau nei 80% pacientų parodė, MSI. Priešingai, MLH1 3 "
ne-metilo grupė, beveik visais atvejais parodė MSS (2b pav). Kaplan-Meier išgyvenimo kreivės buvo sukurtas pagal MLH1 5 'pervežimas metilinimo statusą. 5 metų išgyvenamumas buvo analizuojami MLH1 5 "
denatūruotu ir ne metilo grupėmis, o norma buvo šiek tiek didesnis, MLH1 5 'pervežimas denatūruotą grupėje, nei ne- metilo grupė, bet skirtumai nebuvo reikšmingi (log-rank P
= 0,1009; 2c pav). Kaplan-Meier išgyvenimo kreivės buvo sukurtas pagal MSI statusą. 5 metų išgyvenamumas buvo analizuojami MSI ir MSS grupių, o norma buvo šiek tiek didesnis MSI grupėje, nei MSS grupės, tačiau skirtumai nebuvo reikšmingi (log-rank P
= 0,1316; pav 2d).

daugiamatė analizė išgyvenamumo išeitys prognozuoti

Cox proporcinės rizikos modelis, įskaitant amžių, etape, diferenciacija, kras
mutacijų būklė ir CIMP / MLH1 3 '
metilinimas statusas, palyginti su OS buvo atlikti daugiamatę analizę (3 lentelė). Tik etapas ( P
= 0,0088), diferenciacija ( P
= 0,0267) ir CIMP / MLH1
metilinimas statusas ( P
= 0,0312) buvo statistiškai reikšmingai prognozavo OS. Rizikos santykis buvo gerokai mažesnis CIMP aukšto / MLH1 3 "
metilo grupė.

Diskusijos

DNR metilinimas yra vėžio ląstelių tapo intensyvaus tyrimo tema. Inaktyvacija auglio slopintuvas genų pagal CpG metilinimo promotoriaus regionų spartina kancerogenezės nes netipiškoms ląstelėms ciklo reguliavimo ir platinimo [15]. Kai kandidatas nenormaliai buvo pranešta Metilinti genų skrandžio vėžio. RASSF1A
p14ARF
, ir "MGMT
[34-38]; CHRNA3
DOK1
, ir GNMT
[39]; P16
hMLH1
MINT1
MINT2
MINT12
MINT25
, ir MINT31
[40]; APC
CDH1
MHL1
CDKN2A
CDKN2B
, ir RUNX3
[17 ]; CDH1
[41]; DKK3
[42]; PTEN
[43]; "MGMT
[44]; TFPI2
[22]; CACNA2D3
[45]; PCDH10
[46]; SOX2
[47]; , Akademijos
[48]; ir COX2
[49] buvo anksčiau pranešta, kad hypermethylated skrandžio vėžio. Metilinimo P16
promotoriaus CpG salų yra žymeklis piktybinio potencialo displazija skrandyje [50]. Metilinimo Mgmt
yra susijęs su pažengęs ir blogos prognozės [44]. Netipinė DNR metilinimas šių genų gali skatinti vystymąsi skrandžio vėžio. Tačiau tikslių genų tikslai hypermethylation dėl kancerogeninio poveikio lieka nežinomi [51,52].

Kartu CpG metilinimas keliomis genų buvo apibrėžiamas kaip CIMP į gaubtinės žarnos vėžio (CRC) ir skrandžio vėžio [15,40,53- 57], ir buvo įrodyta, kad jie koreliuoja su hypermethylation naviko slopintuvas genų. Tačiau už CIMP įrodymų skrandžio vėžys yra ne taip įtikinamai, kaip yra CRC [58,59] atvejis. Skrandžio vėžio, CIMP aukšto buvo aprašyta 41% [40] ir 31% [54] navikų. Pacientai, sergantys CIMP aukščio skrandžio vėžiu yra žymiai trumpesnis išlikimą nei tie, su CIMP-mažo skrandžio vėžio [54,60]. Kitas ataskaita parodė, kad CIMP buvo susijęs su geresniu išlikimo skrandžio vėžio [54]. Neseniai metaanalizė sutelkė dėmesį į tvirtą ryšį dėl CIMP H.pylori EBV, ir MSI, bet CIMP negalėjo parodyti prognostinę potencialą skrandžio vėžio [61].

Priešingai, nestabilumą ne mikrosatelitai kartojasi per įvairių augimo reguliavimo genų yra apibrėžiamas kaip MSI. Standartinis panelė, pavyzdžiui, NVI skydelyje rekomenduojama, įskaitant mononukleotido (BAT26 ir BAT25) ir dinukleotidas (D2S123, D5S346 ir D17S250) pakartoja [62]. galima išskirti tris lygius MSI: aukšto lygio MSI (MSI-H), žemo lygio MSI (MSI L) ir MSS. MSI-H fenotipą skrandžio vėžio buvo pranešta, sudaro 5% -50% MSI teigiamų navikų [17]. MSI yra funkcija, kurią sukelia su defektais DNR MMR sistema. Funkcinis inaktyvacijai MMR genų, pavyzdžiui, MLH1
arba MSH2
, kurį mutacijos nukenksminimo ir promotoriaus metilinimo yra atsakinga už MSI H fenotipą skrandžio vėžio. Visų pirma, panašus į Vaiko teisių konvencijos, metilinimas, MLH1
yra susijęs su MSI-H fenotipą [15,40,63,64], nes, MLH1
metilinimas yra ankstesnė už baltymų raiškos nuostolių. Leite M ir kt. Pranešama, kad MLH1
rengėjas hypermethylation buvo stebimas 78,7% (70/89) analizuojamų MSI atvejais [65]. Metilinimo 3 "regione MLH1
promotorius, kuris yra artimas jo transkripcijos starto svetainėje (TSS), reikalingas genai yra nuslopinami. 5 'galas iš promotoriaus yra taip pat linkę į metilinimo, bet tai nėra funkciškai svarbu, nebent metilinimo tęsiasi į kritinę 3' regione [66,67]. MSI statusas yra atsakinga už genų, reguliuojančių ląstelių ciklą ir Apoptozė signalizaciją, įskaitant TGFβRII pervežimas IGFIIR pervežimas TCF4 pervežimas riz
mutacijos, BAX
CASPASE5
FAS
BCL10
, ir APAF1
[17,25] ir genai išlaikyti genomo vientisumui , įskaitant MSH6
MSH3
MED1
RAD50
BLM
"ATR
, ir MRE11
[17,68]. Skrandžio vėžio su MSI-H rodo aukštesnį dažnį antralinių vietoje, žarnyno potipio, mažesnis sergamumas limfmazgių metastazių ir patobulintą išlikimui, palyginti su tų, skrandžio vėžio su MSS ar MSI-L [17,25-30].

Kaip aprašyta pirmiau, CIMP ir MMR-trūkumas statusas yra pagrindiniai bruožai skrandžio vėžio ir gali atspindėti išgyvenimo skirtumus pacientams, kenčiantiems nuo šio piktybinių navikų. Reikšminga koreliacija tarp CIMP ir MSI buvo pranešta GC [61]. Tačiau duomenų apie sinergetinį poveikį šių parametrų yra menki, reikalingas daugiamatis analizė šių genetinių ir epigenetinių parametrus. Mūsų tyrimo duomenimis, CACNA1G
CHFR
"DCC
HPP1
MINT1
MINT2
MINT31
MLH1 5 '
MLH1 3'
P16
RASSF2A-regionas1
RASSF2A-REGION2
RUNX3
SFRP2-REGION2
UNC5C
3OST2
, ir FOXL2
buvo žymiai metilinti CIMP-aukštos grupės. Visų pirma, mes pranešė promotorių metilinimas yra FOXL2
skrandžio vėžio. FOXL2
yra genas, koduojantis forkhead transkripcijos faktorius ir yra būtina kiaušidžių funkciją [69]. FOXL2
reguliuoja ląstelių ciklą skatinančius G1 suėmimą ir apsaugo ląsteles nuo oksidacinio pažeidimo, skatinant oksiduoti DNR reparacijos ir didinant antioksidantas agentas glutationo [69] suma. FOXL2
slopina proliferaciją, invazija ir skatina apoptozę gimdos kaklelio vėžio ląstelių [70]. Projekto rengėjas metilinimo FOXL2
gali turėti reikšmingą vaidmenį tumorigenezei skrandžio vėžio. Priešingai, MLH1 3 '
metilinimas buvo reikalingas MMR trūkumas ir parodė MSI. MLH1 3 "
metilinimas grupė turėjo tendenciją link geros prognoze Kaplan-Meier išgyvenimo sąmatą.

Tačiau CIMP ir MMR trūkumas yra priklausomi vienas nuo kito. MSI susijęs pavienių CRCS kyla per procesą, kuris apima CIMP [66,71]; Todėl turėtų būti atliekama integruota statistinė analizė CIMP ir MMR trūkumas. Pavyzdžiui, dvylikapirštės žarnos adenokarcinomos, CIMP / MLH1
metilinimas statusas parodė reikšmingą prognostinę vertę tiek OS ir laiko iki pasikartojimo (TTR) į Dispersinės analizės [72]. Pacientai, sergantys CIMP aukšto / MLH1
-unmethylated navikai buvo blogiausia OS ir TTR [72]. Mūsų Dispersinės analizės pacientams, sergantiems skrandžio vėžiu, tik CIMP aukšto / MLH1 3 "
metilo grupė turėjo gerą prognozę. Už geros prognozės Europos Sąjungos oficialiajame CIMP aukšto priežastis / MLH1 3 "
metilo grupė lieka nežinoma. Šis reiškinys gali būti dėl sinergetinio nukenksminti gyvybinių genų dėl mutacijų ir promotoriaus metilinimo. Siekiant dar labiau patvirtina mūsų išvadas, mes atliekame nepriklausomą įteisinimą mūsų rezultatus iš visų pateiktų vėžio genomo Atlas duomenų bazę (TCGA) pacientų duomenimis. [73-75] CIMP aukšto / MLH1
hiper-metilo grupė parodė dažniau limfmazgių metastazių (p = 0.0009), pažangi ligos stadijos (p = 0,0078; S1 sąrašas), ir šiek tiek geresnę ligos reiškinių išgyventas laikotarpis (S2 failas). Kita vertus, CIMP /MSI statusas negali parodyti didelę vertę kaip prognostinis žymuo (S2 lentelė). Šis rezultatas rodo, kad MLH1
turi svarbiausią vaidmenį tarp MMR genų GC kancerogenezėje. Tolesnis tyrimas privalo išsiaiškinti ryšį tarp CIMP statusą ir MMR trūkumas santykius. Šis požiūris lems naują strategiją, skirtą skrandžio vėžiui gydyti.

Taigi, mūsų duomenys rodo, kad stratifikacija pacientams, sergantiems CIMP remiantis MLH1
metilinimas statusas gali padėti prognozuoti skrandžio vėžio prognozė. CIMP aukšto / MLH1 3 "
metilo grupė turėjo gerą prognozę, tačiau kitos grupės gali reikalauti intensyvaus gydymo gerinimo išlikimo, kuris turi būti patvirtintas būsimoms studijoms.

Pagalbinė informacija
S1 failą. Ryšys tarp CIMP ir MLH1
metilinimas skrandžio vėžiu sergantiems pacientams TCGA duomenų bazę.
Mes tyrėme metilinimo statusą 17 promotoriaus CpG salos susijusių lokusų ( APC
CHFR
DAPK
"DCC
" MGMT
MINT
MLH1
P16
RASSF1
RASSF2
RASSF3
RASSF5
RASSF6
RUNX3
SFRP2
ir UNC5C
) į TCGA duomenų bazės (TCGA laikinas). Viršutinė 25% kiekvieno lokuso buvo nustatyta kaip hiper-metilo. CIMP aukšto buvo apibrėžiama kaip ne mažiau kaip 5 hiper-metilinimo šių lokusų (A pav.) Sutapo santykiai tarp CIMP ir buvo analizuojami MLH1
metilinimas statusas. 55 ligonių buvo CIMP aukšto / MLH1
Metilinti, 29 pacientai buvo į CIMP mažai / MLH1
Metilinti, 77 pacientai buvo į CIMP aukštos / MLH1
ne metilo ir 177 pacientai į CIMP mažai / MLH1
ne metilinti grupės (B pav.) Koreliacija tarp naviko gylis, limfmazgių metastazių, tolimos metastazės, scenos ir CIMP / MLH1
metilinimas statusas buvo analizuojami naudojant Fisher'io testą. Teigiamas limfmazgių metastazės (p = 0,0009) ir didesnis etapas (p = 0,0078) buvo teigiamai koreliuoja su CIMP aukšto / MLH1
metilo grupė (C paveikslėlis)
Doi:. 10,1371 /journal.pone. 0130409.s001
(docx)
S2 failą. Ligos Išgyvenamumas be skrandžio vėžiu pacientams TCGA duomenų bazę.
Kaplan-Meier išgyvenimo kreivės buvo sukurtas pagal MLH1
metilinimo statusą. Neužkrėstos išgyvenimo buvo nustatyti MLH1
denatūruotu ir ne metilo grupėmis. Neužkrėstos išgyvenamumas buvo šiek tiek didesnis MLH1
metilo grupė, palyginti su ne denatūruotą grupė, bet skirtumas nebuvo reikšmingas (log-rank P
= 0.1173) (A pav.) Neužkrėstos išgyvenimo Išanalizuoti už CIMP aukštų ir CIMP mažai grupių, o norma buvo šiek tiek didesnis CIMP aukščio grupėje, nei CIMP mažai grupei, tačiau skirtumas nebuvo reikšmingas (log-rank P
= 0,1847) (B paveikslas). Neužkrėstos išgyvenimo buvo analizuojami ir lyginami tarp CIMP-High / MLH1
denatūruotu ir kitas grupes. Mes pažymėjo, kad neužkrėstos išgyvenamumas buvo šiek tiek didesnis bendras CIMP aukšto / MLH1
metilo grupė, lyginant su kitomis grupėmis, kur skirtumai nebuvo statistiškai reikšmingi (log-rank p = 0,1073) (Pav . C),
Doi: 10,1371 /journal.pone.0130409.s002
(docx)
S1 lentelė. Gruntas sekas
Doi:. 10,1371 /journal.pone.0130409.s003
(docx)
S2 lentelė. Daugiamatė analizė rezultatų prognozuoti remiantis CIMP /MSI statuso
Doi:. 10,1371 /journal.pone.0130409.s004
(docx)

Padėka

autoriai norėtų ačiū p Toru Nakai, ponia Tae Yamanishi ir p Akihiro Nyuya techninei pagalbai.

Other Languages