Background VerfÜgung
d'Resultat vun Patienten aus gastric Kriibs ze verbesseren Leed, e bessert Versteesdemech vun Basisdaten genetesch a epigenetic Evenementer vun dëser malignancy ass néideg. Obwuel CpG Insel methylator phenotype (CIMP) an microsatellite Instabilitéit (MSI) gewise goufen dréien Rollen an gastric Kriibs pathogenesis ze spillen, bleift d'Medeziner Bedeitung vun dësen Evenementer op Iwwerliewe Resultater am Patienten mat gastric Kriibs onbekannt. VerfÜgung
Method VerfÜgung
Dës Etude abegraff engem Patient Kohort mat pathologically gastric Kriibs bestätegt deen chirurgesch resections haten. A Kohort vun 68 gastric Cancers analyséieren. CIMP an MSI statuses sech duerch analyséiert Promoteur CpG Insel methylation Status vun 28 Genen /loci, a Frankräich Onstabilitéit um 10 microsatellite lues, respektiv sech. A proportional Risikoe Modell d'Cox war fir multivariate Analyse dorënner Alter, Bühn, entholl dat gesuergt, KRAS VerfÜgung stattfannen Zoustand, an kombinéiert CIMP / MLH1 VerfÜgung methylation Statut par rapport zu globale Iwwerliewe (OS). VerfÜgung Resultater VerfÜgung Vun multivariate Analyse, méi OS vill mat manner pathologic Bühn soll war ( P VerfÜgung = 0.0088), besser entholl dat ( P VerfÜgung = 0.0267) an CIMP-héich an MLH1 3 'VerfÜgung methylated Status ( P VerfÜgung = 0.0312). Stratification vun CIMP Status mat Bezuch op MLH1 VerfÜgung methylation Zoustand weider aktivéiert Cepheid vun hätt gastric Kriibs. VerfÜgung Konklusiounen VerfÜgung CIMP an /oder MLH1 VerfÜgung methylation Status vläicht e Potential hun prognostic biomarkers fir Patiente mat gastric Kriibs gin VerfÜgung Fro:. Shigeyasu K, Nagasaka T, Mori Y, Yokomichi N, Kawai T, Fuji T, et al. (2015), Séminairen Bedeitung vun MLH1 Methylation an CpG Island Methylator Phenotype als Prognostic lues an kennen mat Gastric Cancer. PLoS NËMMEN 10 (6): e0130409. Doi: 10.1371 /journal.pone.0130409 VerfÜgung Redakter: Hassan Ashktorab, Howard University, USA VerfÜgung Arnaque: 18. Februar 2015; Akzeptéiert: 20 Mee, 2015; Publizéiert: 29. Juni 2015 VerfÜgung Copyright: © 2015 Shigeyasu et al. Dëst ass eng oppen Zougang Artikel ënnert de Bedingunge vun der Lizenz CC BY verdeelt, déi bereet benotzen Genehmegungen, Distributioun, an Reproduktioun vun all mëttelgrouss, gëtt si vum original Auteur an d'Quell Kaiser VerfÜgung Data Disponibilitéit: All Daten sinn bannent de Pabeier a seng Ennerstëtzung Informatiounen Fichieren VerfÜgung Funding:. Dës Aarbecht vun KAKENHI Subventioune 19390351 an 20590572 zu TN, an déi Subventioune R01 CA72851 an 181572 vun der National Cancer Institut, National Instituter Gesondheetsminister ënnerstëtzt gouf, a Gelder aus der Baylor Research Institut zu AG VerfÜgung Wettsträit Interessen:. d'Auteuren hunn deklaréiert, datt keng Competitioun Interessen existéieren VerfÜgung Gastric Kriibs ass den zweete Spëtzekandidat Ursaach vum Kriibs. -related Doudesfäll, mat ronn 700.000 bestätegt mortalities jäerlech weltwäit, obwuel d'Heefegkeet lues ofgeholl huet [1-3]. Gastric Kriibs ass um Diplôme Etapp allgemeng diagnostizéiert, déi d'Primärschoul Ursaach vu sengem aarm hätt ass [4]. Fir d'Resultat vun gastric Kriibs, Identifikatioun vun genetesch oder epigenetic Evenementer an de Werdegang vun gastric Kriibs verbesseren ass néideg. Déi wichtegst epigenetic Event am Werdegang vun Kriibs ass methylation vum Promoteur CpG Regioune vun Schlëssel entholl suppressor Genen. CpG Insele si bal 1-KB laang Message vun DNA mat héije guanine-cytosine Inhalt vun Promoteur Regioune vun de Genen [5]. Am Géigesaz zum normalen Zellen, sinn Inselen CpG bannent entholl suppressor Genen zu Kriibs Zellen oft hypermethylated, Virwaat zu enger Insel methylator phenotype CpG (CIMP) [6,7]. Epigenetic silencing vun entholl-Zesummenhang Genen wéinst CpG Insel methylation huet viru kuerzem zu gastric Kriibs gemellt ginn. Aberrant CpG Insel methylation vu > 100 Wuesstem-reglementaresche Genen vun gastric Kriibs huet also wäit gemellt ginn [8-24], allerdéngs, bleift d'Medeziner Bedeitung vun CIMP zu gastric Kriibs onerfuerschten a wéineg verstan VerfÜgung Am Géigesaz. , net fonnt Reparatur (MMR) hunn an gastric Kriibs ass och eng wichteg genetesch event. Frankräich Onstabilitéit bannent der Zuel vun microsatellite Widerhuelung (oder microsatellites) ass microsatellite Instabilitéit (MSI) Limburg. MSI ass eng Funktioun vun engem futtisse DNA MMR System ëmmer. Funktionell inactivation vun MMR Genen, wéi MLH1 VerfÜgung oder MSH2 VerfÜgung, vum Promoteur methylation fir d'MSI-Héich (MSI-H) phenotype zu gastric Kriibs responsabel ass. An enger viregter studéieren, zougedréckt gastric Kriibs mat MSI-H eng héich Frequenz vun antral Standuert, intestinal subtype, kleng Heefegkeet vun lymph Node Metastasen, a verbessert Iwwerliewe, am Verglach zu microsatellite stabil (Camion wäit) oder MSI-L gastric Cancers [17,25 -30]. Allerdéngs bleift d'Medeziner Bedeitung vun MMR hunn zu gastric Kriibs onbekannt. VerfÜgung Am Hibléck op dës Schéier am Wëssen, an dat studéieren, lant mir d'Bedeitung vun CIMP an MMR hunn zu gastric Kriibs an sech hire Bäitrag als prognostic lues an Patienten mat gastric Kriibs. VerfÜgung Ray uplanzen VerfÜgung Dës Etude engem Kohort vun Patienten mat pathologically bestätegt gastric Kriibs abegraff déi chirurgesch resection um Okayama University weiderentwéckelt huet Spidol (Okayama, Japan) vun 1998-2004. Eng total vun 68 gastric Kriibs Stoffer an hir gepasst normal gastric mucosa goufen analyséiert. All normal gastric mucosa Stoffer sech aus Siten bascht ze, mä op d'mannst 5 cm ewech, d'original entholl kritt. All Patienten gëtt schrëftlech informéiert Zoustëmmung an der Etude war vun der ethesch Comité vun der Okayama University Hospital guttgeheescht. All gëtt Patienten Awëllegung Uleedung vun hiren Donnéeën geschriwwe fir Zukunft ze maachen. All gastric Cancers an normal gastric mucosa sech frësch-gefruer Otemschwieregkeeten uplanzen, aus deem DNA ofgebaut gouf e QIAamp DNA Mini Kit (QIAGEN) benotzt. VerfÜgung MSI Analyse VerfÜgung MSI Analyse vun Ënnersichung gemaach huet vun 2 mononucleotide Widerhuelung (BAT25 an BAT26), 12 dinucleotide Widerhuelung (D17S250, D18S35, D18S58, D18S69, D2S123, D4S1559, D4S2381, D4S470, D5S107, D5S346, an D8S87, TP53), an eng tetranucleotide Widerhuelung, MYCL, wéi virdru beschriwwen [ ,,,0],31]. Erhéijen weist allelic unzepassen an ≥5 vun 15 lues sech als MSI-H kléngen (Kapp wéi "MSI" bezeechent), an de Rescht huet den microsatellite stabil (Camion wäit) klassifizéiert. VerfÜgung Natrium bisulfite Ännerungen an CIMP analyséiert VerfÜgung Well heefeg hypermethylation vu verschiddene Genen eent vun de charakteristesche Charakteristike vun erhéijen mat CIMP ass, ze propagéieren mir de methylation Status vun 28 Promoteur CpG Insel-Zesummenhang loci ( APC VerfÜgung, CACNA1G KRAS VerfÜgung stattfannen Analysë VerfÜgung Direct sequencing Leeschtung war z'identifizéieren KRAS statistique Analysë VerfÜgung JMP Software (Haaptbanalitéite 10.0, SAS Institut INC statistesch Analyse ze Leeschtunge gouf.) benotzt. Student an d'T-Test gouf benotzt kontinuéierlech Verännerlechen ze vergläichen, an genau Test d'Fisher war benotzt Diskussioun Verännerlechen ze analyséieren. Allgemeng Survival (OS) war vun der Operatioun Datum fir den Datum vum Doud gemooss. D'Kaplan-Meier Method an umellen-Platz war fir Differenzen tëscht verschiddene prognostic Faktore waren benotzt OS distributions ze schätzen. Cox proportional iwwerschloen Modeller goufen benotzt der iwwerschloen Verhältnis (SH) ze berechnen mat 95% Vertraue nolauschterer entspriechend (CI). Univariate oder multivariate Logistikzenter Réckgang Analyse war standing d'Differenzen am HR tëscht all Grupp ze bestëmmen. All Rapport P VerfÜgung Wäerter sinn zwee-eesäitegen, an P VerfÜgung &Si besteet; 0,05 war als statistesch Bedeitung unzeginn. VerfÜgung Sécuritéit Populatioun VerfÜgung An dëser Etude, mir 68 Patiente mat gastric Kriibs ze propagéieren. An de Promoteur CpGs vun der MLH1 VerfÜgung Gentherapie, Verbreedung vun CpG methylation bannent seng 3 'Regioun huet sech e kriteschen fir MLH1 Ausdrock ze ginn [33]. Eng Beschreiwung vun de Patient Kohort a verschidde clinicopathological op Sex baséiert Fonctiounen, Alter, Bühn, entholl dat, MSI Status, KRAS VerfÜgung stattfannen, a MLH1 3 'VerfÜgung methylation ass an Table 1 gewisen. dës statuses sech tëscht der CIMP-héich an CIMP-niddereg Gruppen Verglach. Vun deene Punkten, MSI Status an MLH1 3 'VerfÜgung methylation Status zougedréckt bemierkenswäert Differenzen tëscht der 2 Gruppen (Table 1). VerfÜgung Methylation Status VerfÜgung 28 CpG loci dorënner APC VerfÜgung, CACNA1G VerfÜgung, CHFR VerfÜgung, COX2 VerfÜgung, DAPK VerfÜgung, DCC VerfÜgung, HPP1 VerfÜgung, froen-MP Regioun VerfÜgung, froen-Eh Regioun VerfÜgung, MINT1 VerfÜgung, MINT2 VerfÜgung, MINT31 VerfÜgung, MLH1 5 'VerfÜgung, MLH1 3' VerfÜgung, P14 VerfÜgung, p16 VerfÜgung, RASSF1A VerfÜgung, RASSF2A-region1 VerfÜgung, RASSF2A-region2 VerfÜgung, RASSF3 VerfÜgung, RASSF5 VerfÜgung, RASSF6 VerfÜgung, RUNX3 VerfÜgung, SFRP2 -region1 VerfÜgung, SFRP2-region2 VerfÜgung, UNC5C VerfÜgung, 3OST2 VerfÜgung a FOXL2 VerfÜgung fir Bestëmmung vum CIMP Status vun all gastric Kriibs analyséiert goufen . Methylation Spektrum vun dësen loci ass am Mosaik Kaart (Lalumi 1a) gewisen. An dës loci, CACNA1G VerfÜgung, CHFR VerfÜgung, DCC VerfÜgung, HPP1 VerfÜgung, MINT1 VerfÜgung, MINT2 traureg Resultater am Patiente baséiert op MLH1 3 'VerfÜgung methylation an CIMP Status vun gastric Cancers VerfÜgung d'phpNuke Relatioun tëscht CIMP a MLH1 3 'VerfÜgung war methylation Status analyséiert. 10 Patienten goufen an der CIMP-Héich / MLH1 3 'VerfÜgung methylated, 1 Patient war an der CIMP-niddereg / MLH1 3' VerfÜgung methylated, 20 Patienten goufen an der CIMP héich / MLH1 3 'VerfÜgung Net-methylated an 37 Patiente an der CIMP-niddereg waren / MLH1 3' VerfÜgung Net-methylated Gruppen (Lalumi 1b). Kaplan-Meier Iwwerliewe Kéieren waren entsteet no dem MLH1 3 'VerfÜgung methylation Status. De 5-Joer OS Tariffer sech fir d' MLH1 3 'VerfÜgung methylated an Net-methylated Gruppen sech. De 5-Joer OS Tariffer sech vill méi héich am MLH1 3 'VerfÜgung methylated Grupp am Verglach zu den Net-methylated Grupp. (Umellen-Platz P VerfÜgung = 0,0257; Lalumi 1c) VerfÜgung Anerersäits, de 5-Joer OS Tariffer sech fir d'CIMP-héich an CIMP-niddereg Gruppen ze analyséieren, an der Taux war méi héich an de CIMP-héich Grupp wéi an der CIMP-niddereg Grupp mä den Ënnerscheed ass net wichteg ( aloggen-Platz P VerfÜgung = 0,0688;. Lalumi 1d) VerfÜgung Bäitrag vun fonnt Reparatur hunn an CIMP Status ze Iwwerliewe Taux VerfÜgung De 5-Joer Iwwerliewe Tariffer goufen analyséiert a Verglach ënnert dëse Gruppen; CIMP-Héich / MLH1 3 'VerfÜgung methylated, CIMP-niddereg / MLH1 3' VerfÜgung methylated, CIMP héich / MLH1 3 'VerfÜgung Net-methylated an CIMP-niddereg / MLH1 3 'VerfÜgung Net-methylated Gruppen. Mir bemierken, datt de globale Iwwerliewe Tariffer vun de kombinéiert CIMP-héich héich waren / MLH1 3 'VerfÜgung methylated Grupp, am Verglach zu deenen anere Gruppen, wou d'Ennerscheeder net statistesch relevant waren (umellen-Platz P Bezéiung tëschent MLH1 VerfÜgung methylation an MSI VerfÜgung D'phpNuke Relatioun tëschent MLH1 5 'VerfÜgung methylation a 3 'VerfÜgung methylation Status analyséieren. 10 Patienten goufen klassifizéiert als MLH1 5 'VerfÜgung methylated / 3' VerfÜgung methylated, 8 Patiente wéi MLH1 5 'VerfÜgung methylated / 3' VerfÜgung Net- methylated, 1 Patient wéi MLH1 5 'VerfÜgung Net-methylated / 3' VerfÜgung methylated, an 49 Patiente wéi 5 'VerfÜgung Net-methylated / 3 Multivariate Analyse fir Iwwerliewe Resultat dacks VerfÜgung a Cox proportional Risikoe Modell, dorënner Alter, Etapp, dat, KRAS VerfÜgung stattfannen Zoustand, an CIMP / zu methylation Statut par rapport zu OS 'MLH1 3 gouf benotzt fir Leeschtunge multivariate Analyse (Table 3). Nëmmen Etapp ( P VerfÜgung = 0.0088), dat ( P VerfÜgung = 0.0267), an CIMP / MLH1 VerfÜgung methylation Status ( P VerfÜgung = 0.0312) sech statistesch relevant dacks vun OS. Hazard Verhältnis war wesentlech méi déif an d'CIMP-Héich / MLH1 3 'VerfÜgung methylated Grupp. VerfÜgung DNA methylation zu Kriibs Zellen ass e Sujet vun intensiv Enquête. Inactivation vun Genen suppressor entholl vun CpG methylation vum Promoteur Regiounen gut iwwerstan carcinogenesis well vun aberrant Zell Zyklus Regulatioun an Prolifératioun [15]. Verschidde Kandidat aberrantly methylated Genen vun gastric Kriibs hun gemellt ginn. RASSF1A VerfÜgung, p14ARF VerfÜgung, an froen VerfÜgung [34-38]; CHRNA3 VerfÜgung, DOK1 VerfÜgung, an GNMT VerfÜgung [39]; p16 VerfÜgung, hMLH1 VerfÜgung, MINT1 VerfÜgung, MINT2 VerfÜgung, MINT12 VerfÜgung, MINT25 VerfÜgung, an MINT31 VerfÜgung [40]; APC VerfÜgung, CDH1 VerfÜgung, MHL1 VerfÜgung, CDKN2A VerfÜgung, CDKN2B VerfÜgung, an RUNX3 VerfÜgung [17 ]; CDH1 VerfÜgung [41]; DKK3 VerfÜgung [42]; PTEN VerfÜgung [43]; froen VerfÜgung [44]; TFPI2 VerfÜgung [22]; CACNA2D3 VerfÜgung [45]; PCDH10 VerfÜgung [46]; SOX2 VerfÜgung [47]; Camion VerfÜgung [48]; an COX2 VerfÜgung [49] huet sech virdrun am Rapport gastric Kriibs hypermethylated gin. Methylation vun p16 VerfÜgung Promoteur CpG Inselen ass eng Bewaacher fir malignant Potential vun dysplasia am Mo. [50]. Methylation vun froen VerfÜgung ass mat fortgeschratt Etapp an aarme hätt verbonne [44]. Aberrant DNA methylation an dës Genen kann Entwécklung vun gastric Kriibs förderen. Mä genee Gentherapie Ziler vun hypermethylation fir carcinogenesis bleiwen onbekannt [51,52]. VerfÜgung Concurrent CpG methylation zu Multiple Genen ass definéiert als CIMP zu colorectal Kriibs (CRC) an gastric Kriibs [15,40,53- 57], a gouf mat hypermethylation vun entholl suppressor Genen ze vergläichen gewisen. Allerdéngs ass de Beweis fir CIMP zu gastric Kriibs net esou iwwerzeegend wéi de Fall fir CRC ass [58,59]. An gastric Kriibs, CIMP-héich ass zu 41% [40] an 31% [54] erhéijen beschriwwen. Patienten mat CIMP-héich gastric Kriibs hun vill méi kuerz Iwwerliewe wéi déi mat CIMP-niddereg gastric Kriibs [54,60]. Aner Rapport zougedréckt datt CIMP mat besser Iwwerliewe vun gastric Kriibs verbonne war, [54]. Déi leschte meta-Analyse huet mat H. pylori, EBV op der staarker Relatioun vun CIMP do, an MSI, mä CIMP konnt net eng prognostic Potential fir gastric Kriibs weisen [61]. VerfÜgung Am Géigesaz, Instabilitéit um microsatellites Widerhuelung bannent verschidde Wuesstem-reglementaresche Genen ass wéi MSI definéiert. Eng Norm Rot, wéi de NCI erschéngt, ass ugeroden, dorënner mononucleotide (BAT26 an BAT25) an dinucleotide (D2S123, D5S346, an D17S250) Widerhuelung [62]. Dräi Niveaue vun MSI kann identifizéiert ginn: Héich-Niveau MSI (MSI-H), héich-Niveau MSI (MSI-L), a Camion wäit. D'MSI-H phenotype zu gastric Kriibs gemellt fir 5% -50% MSI positive neoplasms zu Kont [17]. MSI ass eng Funktioun vun engem futtisse DNA MMR System ëmmer. Funktionell inactivation vun MMR Genen, wéi MLH1 VerfÜgung oder MSH2 VerfÜgung, vun mutational inactivation an Promoteur methylation ass responsabel fir d'MSI-H phenotype zu gastric Kriibs. Besonnesch, ähnlech zu CRC, methylation vun MLH1 VerfÜgung mam MSI-H phenotype assoziéiert ass [15,40,63,64] well MLH1 VerfÜgung methylation duerno de Verloscht vun FAQ Ausdrock. Leite M et al. confirméiert datt MLH1 VerfÜgung Promoteur hypermethylation war zu 78,7% (70/89) vun der analyséiert MSI Fäll [65] observéiert. Methylation vun der Regioun 3 vun den MLH1 VerfÜgung Promoteur, deen zu senger transcriptional Start Site (TSS) enk ass, fir Gentherapie silencing néideg ass. Déi 5 'Enn vun de Promoteur ass och ufälleg fir methylation, mä dat ass net System wichteg ausser der methylation zu der kritescher 3 Preventioun' Regioun [66,67]. MSI Zoustand ass responsabel fir d'stattfannen vun Genen Regulatioun Zell-Zyklus a apoptotic sécher, dorënner TGFβRII VerfÜgung, IGFIIR VerfÜgung, TCF4 VerfÜgung, RIZ VerfÜgung, Bax VerfÜgung, CASPASE5 VerfÜgung, Sekondär VerfÜgung, BCL10 VerfÜgung, an APAF1 VerfÜgung [17,25] an Genen erhalen Frankräich Integritéit , dorënner MSH6 VerfÜgung, MSH3 VerfÜgung, MED1 VerfÜgung, RAD50 VerfÜgung, BLM VerfÜgung, ATR VerfÜgung, an MRE11 VerfÜgung [17,68]. Gastric Cancers mat MSI-H weisen eng héich Frequenz vun antral Standuert, intestinal subtype, kleng Heefegkeet vun lymph Node Metastasen, a verbessert Iwwerliewe Verglach zu deene vun gastric Kriibs mat Camion wäit oder MSI-L [17,25-30]. VerfÜgung Als uewen beschriwwen, CIMP an MMR-hunn Zoustand sinn Schlëssel Fonctiounen vun gastric Kriibs a vläicht Iwwerliewe Differenzen an Patienten aus dëser malignancy spigelen Leed. Grouss Korrelatioun tëscht CIMP an MSI gouf am GC [61] gemellt. Allerdéngs, Daten der synergistic Auswierkunge vun dëse Parameteren iwwert knapp, an multivariate Analys vun dësen genetesch a epigenetic Parameteren ass néideg. An eiser Etude, CACNA1G VerfÜgung, CHFR VerfÜgung, DCC VerfÜgung, HPP1 VerfÜgung, MINT1 VerfÜgung, MINT2 Allerdéngs CIMP an MMR hunn op all aneren ofhängeg sinn. MSI-verbonne sporadesch CRCs duerch e Prozess opwerft, datt CIMP doranner [66,71]; also, sollen integréiert statistesch Analyse vun CIMP an MMR hunn opgeféiert ginn. Zum Beispill, an ausléisen adenocarcinomas, CIMP / MLH1 VerfÜgung methylation Status awer e wesentleche prognostic Wäert vun zwou OS an Zäit-ze-Terrain (TTR) zu multivariate Analyse [72]. Patienten mat CIMP-Héich / MLH1 VerfÜgung -unmethylated erhéijen hat de schlëmmste OS a TTR [72]. An eiser multivariate Analyse vun Patienten mat gastric Kriibs, nëmmen d'CIMP-Héich / MLH1 3 'VerfÜgung methylated Grupp hat eng gutt hätt. De Grond fir gutt hätt am CIMP-Héich / MLH1 3 'VerfÜgung methylated Grupp bleift onbekannt. Dëse Phänomen kann wéinst synergistic inactivation vun kruzial Genen wéinst stattfannen an Promoteur methylation ginn. Fir weider eis Conclusiounen confirméieren, standing mir eng onofhängeg Confirmatioun vun eise Resultater aus an Patient Donnéeën deposéiert D'Cancer Genom Atlas Datebank (TCGA). [73-75] CIMP-Héich / MLH1 VerfÜgung zwéinHyperfeinstrukturniveaue-methylated Grupp awer méi heefeg lymph Node Metastasen (p = 0.0009), fortgeschratt Krankheet Etapp (p = 0,0078; S1 Datei), a liicht besser gratis Genau Iwwerliewe (S2 Datei). Wéinst dem CIMP /MSI Status de wesentleche Wäert als prognostic Bewaacher (S2 Table) net weisen kann. Dëst Resultat weist dass MLH1 VerfÜgung huet déi wichtegst Roll ënnert MMR Genen vun der carcinogenesis vun GC. Weider Enquête ass néideg der Relatioun tëscht CIMP Status an MMR hunn, fir. Dës Approche fir eng nei Strategie fir d'Behandlung vun gastric Kriibs Féierung gëtt. VerfÜgung An Conclusioun, eisen Daten drop hindeit datt stratification vun Patienten mat CIMP baséiert op MLH1 VerfÜgung methylation Status Cepheid vun gastric Kriibs erméigleche kann Iwwregens hätt. D'CIMP-Héich / MLH1 3 'VerfÜgung methylated Grupp huet gutt hätt, mä aner Gruppen kënnen intensiv Behandlung fir Verbesserung vun Iwwerliewe brauch, wat an Zukunft Studien validéiert ze ginn brauch. VerfÜgung Aféierung VerfÜgung
spontan a Methode VerfÜgung
, CHFR VerfÜgung, COX2 VerfÜgung, DAPK VerfÜgung, DCC VerfÜgung, HPP1 VerfÜgung, froen-MP Regioun VerfÜgung, froen-Eh Regioun VerfÜgung, MINT1 VerfÜgung, MINT2 VerfÜgung, MINT31 VerfÜgung, MLH1 5 'VerfÜgung, MLH1 3 'VerfÜgung, P14 VerfÜgung, p16 VerfÜgung, RASSF1A VerfÜgung, RASSF2A-region1 VerfÜgung, RASSF2A-region2
, RASSF3 VerfÜgung, RASSF5 VerfÜgung, RASSF6 VerfÜgung, RUNX3 VerfÜgung, SFRP2-region1 VerfÜgung, SFRP2- region2 VerfÜgung, UNC5C VerfÜgung, 3OST2 VerfÜgung, FOXL2 VerfÜgung), an den entspriechende primer Message sinn am S1 Table opgezielt. Frankräich DNA war bisulfite-geännert all unmethylated cytosine Reschter ze uracils ze konvertéieren. An dowéinst, 0.5-2.0 μg vun DNA goufen NaOH denatured, mat Natrium bisulfite behandelt, a sidd mat der Wizard DNA Clean-up System (Promega). D'methylation Status vun all CIMP-Zesummenhang nët war vun kombinéiert bisulfite Restriktioun Analyse (Ophiophagus) bewäert. Polymerase Kette Reaktioun (Hinnen alleguer) fir Ophiophagus war op engem bisulfite-geännert Skelett DNA an enger standing 25-μL Hinnen alleguer Mëschung wouvun 12,5 μL vun HotStarTaq Master Mix Kit (QIAGEN), 0,5 μmol /L vun all Hinnen alleguer primer, an ongeféier 25 NG vun bisulfite-geännert DNA. Hinnen alleguer Produiten goufe vun Zousätzlech vun Restriktioun Aktivitéit bei 37 ° C fir 12 h verdaut. D'verdaut DNA war zu 1 × Tris-acetate-héich ass an Kierchefënster mat ethidium bromide op 3% agarose gels getrennt. Mënsch normal colonic DNA behandelt mat SssI methylase (New England Biolabs) war wéi enger positiver Kontroll fir methylated alleles benotzt, an DNA aus normal lymphocytes war als Kontrollorgan fir unmethylated alleles benotzt. Waasser war als negativ Hinnen alleguer Kontroll benotzt Hinnen alleguer kontaminéierte ze kontrolléieren. CIMP-héich war definéiert als net manner wéi 10 vun der methylation vun dësen loci. VerfÜgung
Exon 2 (codon 12/13) kennen. Hinnen alleguer fir KRAS VerfÜgung Gentherapie gouf zu engem 25-μL Hinnen alleguer Mëschung wouvun 12,5 μL vun HotStarTaq Master Mix Kit mat primers gesuergt. Déi Offäll QIAquick Hinnen alleguer Kit war benotzt Hinnen alleguer Produiten wesssen, a si waren op en Abi 310 DNA sequencer direkt Nepgen [32]. VerfÜgung Resultater VerfÜgung
, MINT31 VerfÜgung, "VerfÜgung, MLH1 3 'MLH1 5 zur VerfÜgung, p16 VerfÜgung, RASSF2A-region1 VerfÜgung, RASSF2A-region2 VerfÜgung, RUNX3 VerfÜgung, SFRP2-region2 VerfÜgung, UNC5C VerfÜgung, 3OST2 VerfÜgung, an FOXL2 VerfÜgung an der CIMP-héich Grupp (Table 2) mein methylated. VerfÜgung
= 0,0706;. Lalumi 1e) VerfÜgung
Net-methylated (Lalumi 2a). An der MLH1 3 'VerfÜgung methylated Grupp, méi wéi 80% Patienten zougedréckt MSI. Am Géigesaz, am MLH1 3 'VerfÜgung Net-methylated Grupp, bal all Fäll zougedréckt Camion wäit (Lalumi 2b). Kaplan-Meier Iwwerliewe Kéieren waren entsteet no MLH1 5 'VerfÜgung methylation Status. De 5-Joer Iwwerliewe Tariffer sech fir d' MLH1 5 analyséiert 'VerfÜgung methylated an Net-methylated Gruppen, an den Taux war méi héich an de MLH1 5' VerfÜgung methylated Grupp wéi an der Net- methylated Grupp mä d'Ënnerscheeder waren net wichteg (umellen-Platz P VerfÜgung = 0,1009; Lalumi 2C). Kaplan-Meier Iwwerliewe Kéieren waren entsteet no MSI Status. De 5-Joer Iwwerliewe Tariffer sech fir d'MSI a Camion wäit Gruppen ze analyséieren, an den Taux war méi héich an der MSI Grupp wéi am Camion wäit Grupp mä d'Ënnerscheeder waren net wichteg (umellen-Platz P VerfÜgung = 0,1316; Figebam 2D). VerfÜgung Diskussioun VerfÜgung
, MINT31 VerfÜgung, "VerfÜgung, MLH1 3 'MLH1 5 zur VerfÜgung, p16 VerfÜgung, RASSF2A-region1 VerfÜgung, RASSF2A-region2 VerfÜgung, RUNX3 VerfÜgung, SFRP2-region2 VerfÜgung, UNC5C VerfÜgung, 3OST2 VerfÜgung, an FOXL2 VerfÜgung sech an der CIMP-héich Grupp vill methylated. Besonnesch, an Untersuchungshaft mir Promoteur methylation vun FOXL2 VerfÜgung zu gastric Kriibs. FOXL2 VerfÜgung ass eng Gentherapie eng forkhead Transkriptiouns Faktor Zeechesaatz an ass wiesentlech fir spillt Funktioun [69]. reguléieren FOXL2 VerfÜgung der Zell Zyklus vun G1 verhaft Pinguin a schützt Zellen aus oxidative Schued duerch oxidized Spur DNA Reparatur a vun de Montant vun der anti-oxidant Agent glutathione waarden [69]. FOXL2 VerfÜgung Prolifératioun Hien, Invasioun an ënnerstëtzt apoptosis vun cervical Kriibs Zellen [70]. De Promoteur methylation vun FOXL2 VerfÜgung kënnen eng wichteg Roll an tumorigenesis zu gastric Kriibs hunn. Am Géigesaz, zu methylation 'MLH1 3 war fir MMR hunn an zougedréckt MSI néideg. D' MLH1 3 'VerfÜgung methylation Grupp haten eng Tendenz fir e gutt hätt am Kaplan-Meier Iwwerliewe Schätzung. Informatiounen Ennerstëtzung
S1 Fichier. Relatioun tëscht CIMP a MLH1 VerfÜgung methylation zu Gastric Kriibs Patienten zu TCGA Datebank. VerfÜgung Mir propagéieren der methylation Status vun 17 Promoteur CpG Insel-Zesummenhang loci ( APC VerfÜgung, CACNA1G
, CHFR VerfÜgung, DAPK VerfÜgung, DCC VerfÜgung, froen VerfÜgung, renovéiert VerfÜgung,