Háttér katalógusa
A jobb eredmény szenvedő betegek gyomorrák, jobb megértését szolgáló genetikai és epigenetikai események ebben rosszindulatú daganat van szükség. Bár CpG sziget metiláltsági fenotípus (CIMP) és mikroszatellit-instabilitás (MSI) kimutatták, hogy döntő fontosságú szerepet játszanak a gyomorrák patogenezisében, klinikai jelentősége az események a túlélésre eredmények gyomorrákos betegeknél továbbra is ismeretlen. Katalógusa
módszerei
Ez a vizsgálat pácienscsoporton kórosan megerősítette gyomorrák, aki sebészi reszekció. A kohorsz 68 gyomorrák elemeztük. CIMP és MSI állapotokat határoztuk elemzésével promoter CpG-sziget metilációs állapotát 28 gén /lókusz, és genetikai instabilitást 10 mikroszatellit markerek, ill. A Cox-féle arányos kockázati modell végeztünk többváltozós elemzés kor, stádium, tumor differenciálás, KRAS katalógusa mutáció jelenlétét, és a kombinált CIMP / PMS1- katalógusa metilációs állapotát kapcsolatban teljes túlélés (OS). Eredmények katalógusa többváltozós elemzés, hosszabb OS szignifikáns korrelációt mutatott alacsonyabb patológiai stádium ( P katalógusa = 0,0088), a jobb tumor differenciálás ( P = katalógusa 0,0267) és CIMP magas és PMS1- 3 'katalógusa denaturált állapot ( P katalógusa = 0,0312). Rétegződése CIMP állapot tekintetében PMS1- katalógusa metilációs állapotát is lehetővé tette a jóslat, gyomorrák prognózisa. Katalógusa Következtetések katalógusa CIMP és /vagy PMS1- katalógusa metilációs állapotát lehet egy lehetőség, hogy prognosztikai biomarkerek betegek gyomorrák. bevezető hivatkozás: Shigeyasu K, Nagasaka T, Mori Y, Yokomichi N, Kawai T, a Fuji T, et al. (2015) klinikai jelentősége PMS1- metiláció és CpG Island metiláltsági fenotípus prognosztikai markerek gyomorrákos betegeknél. PLoS ONE 10 (6): e0130409. doi: 10,1371 /journal.pone.0130409 katalógusa Szerkesztő: Hassan Ashktorab, Howard University, Egyesült Államok katalógusa Beérkezett: Február 18, 2015-ig; Elfogadva: 20. május 2015; Megjelent: június 29, 2015 katalógusa Copyright: © 2015 Shigeyasu et al. Ez egy nyílt hozzáférésű cikk feltételei szerint terjeszthető a Creative Commons Nevezd meg! Licenc, amely engedélyezi a korlátlan használatát, a forgalmazás és a reprodukció bármilyen adathordozón, feltéve, hogy az eredeti szerző és a forrás jóváírásra katalógusa Az adatok elérhetősége: Minden lényeges adatot belül a papír és az azt támogató információs fájlokat. katalógusa Forrás: Ezt a munkát támogatott KAKENHI támogatások 19390351 és 20590572 TN, és támogatásokkal R01 CA72851 és 181.572 a National Cancer Institute, National Institutes of Health, és pénzeszközöket a Baylor Kutatóintézet AG. katalógusa Érdekütközés: a szerzők kijelentették, hogy nem ellentétes érdekek léteznek. katalógusa Bevezető katalógusa a gyomorrák a második vezető oka a rák val kapcsolatos halálesetek mintegy 700.000 megerősítette pusztulás évente világszerte, bár az előfordulási fokozatosan csökkent [1-3]. A gyomorrák általában diagnosztizáltak előrehaladott stádiumban, amely az elsődleges oka a gyenge prognózis [4]. Hogy javítsa a kimenetelét gyomorrák, az azonosítás a genetikai vagy epigenetikai események a progresszióját gyomorrák szükséges. A legfontosabb epigenetikus esemény a progresszióját rák metiláció promoter CpG régiók kulcsfontosságú tumorszuppresszor gének. A CpG-szigetek csaknem 1-kb hosszú DNS-szekvenciákat nagy guanin-citozin tartalom promóter régiók gének [5]. Ezzel szemben a normál sejtekben, CpG-szigetek belül tumor szuppresszor gének a rákos sejtek gyakran hipermetilációja, ami egy CpG-szigetre metiláltsági fenotípus (CIMP) [6,7]. Epigenetikai csendesítése tumor kapcsolatos gének miatt CpG-szigetre metilációs nemrégiben számoltak be gyomorrák. Aberrált CpG sziget metilációját > 100 növekedést szabályozó gének gyomorrákban eddig beszámoltak [8-24], azonban a klinikai jelentősége CIMP gyomorrákban marad felderítetlen és nehezen érthető. Katalógusa Ezzel szemben , mismatch repair (MMR) hiány a gyomorrák is fontos genetikai esemény. Genetikai instabilitást számán belül mikroszatellit ismétlések (vagy mikroszatellit) nevezik mikroszatellit-instabilitás (MSI). MSI egy olyan funkció által okozott hibás DNS MMR rendszer. Funkcionális inaktiválása MMR gének, mint például a PMS1- katalógusa vagy MSH2 katalógusa, a promoter metiláció felelős az MSI-high (MSI-H) fenotípus gyomorrák. Egy korábbi tanulmány, gyomorrák MSI-H mutatott nagyobb gyakorisággal antrális helyen, a bél altípus, kisebb előfordulási nyirokcsomó-metasztázis, és a jobb túlélés, míg a mikroszatellit stabil (MSS), illetve az MSI-L gyomorrák [17,25 -30]. Azonban a klinikai jelentősége MMR hiányosság gyomorrák továbbra is ismeretlen. Katalógusa Tekintettel e különbség a tudás, ebben a tanulmányban, feltártuk a jelentősége CIMP és MMR-hiány gyomorrákban, és meghatározták a hozzájárulás prognosztikai markerek gyomorrákos betegeknél. katalógusa anyagok és módszerek katalógusa szövetmintából katalógusa Ez a vizsgálat egy kohorsz betegek kórosan megerősítette gyomorrákos átesett sebészi eltávolítását a Okayama University Hospital (Okayama, Japán) 1998-2004. Összesen 68 gyomorrák szövetek és illesztett normál gyomornyálkahártya elemezték. Minden normális gyomornyálkahártya szöveteket nyert oldalak szomszédos, de legalább 5 cm-re, az eredeti tumor. Minden beteg írásos beleegyezését adta, és az jóváhagyta a vizsgálatot az etikai bizottság a Okayama University Hospital. Minden beteg írásos beleegyezését adta a használat az adatokat későbbi elemzések. Minden gyomor rákos és a normális gyomornyálkahártya frissen fagyasztott szöveti mintákat, amelyből a DNS-t extraháljuk alkalmazásával QIAamp DNA Mini Kit (QIAGEN) alkalmazva. MSI elemzést végeztünk vizsgálata 2 mononukleotid ismétlődő (BAT25 és BAT26), 12. dinukleotid ismétlődések (D17S250, D18S35, D18S58, D18S69, D2S123, D4S1559, D4S2381, D4S470, D5S107, D5S346, és D8S87, TP53) és egy tetranukleotid ismétlődések, MYCL, a korábban ismertetett módon [ ,,,0],31]. Daganatok mutatja allél elmozdulások ≥5 15 markerek sorolták MSI-H (továbbiakban ezt mint "MSI"), és a többi sorolták mikroszatellit stabil (MSS). Katalógusa A nátrium-hidrogén-szulfit módosítása és CIMP elemzések Mivel a gyakori hipermetiláció több gén egyik jellegzetessége a daganatok CIMP megvizsgáltuk a metilációs állapotát 28 promoter CpG sziget kapcsolatos loci ( APC katalógusa, CACNA1G Közvetlen szekvenálást végeztünk azonosítani KRAS
MSI elemzés
, CHFR katalógusa, COX2 katalógusa, DAPK katalógusa, DCC katalógusa, HPP1 katalógusa, MGMT-Mp régió katalógusa, MGMT-Eh régió katalógusa, MINT1 katalógusa, MINT2 katalógusa, MINT31 katalógusa, PMS1- 5 'katalógusa, PMS1- 3 'katalógusa, p14 katalógusa, p16 katalógusa, RASSF1A katalógusa, RASSF2A-régióban1 katalógusa, RASSF2A-régióban2
, RASSF3 katalógusa, RASSF5 katalógusa, RASSF6 katalógusa, RUNX3 katalógusa, SFRP2-régióban1 katalógusa, SFRP2- régióban2 katalógusa, UNC5C katalógusa, 3OST2 katalógusa, FOXL2 katalógusa), és a megfelelő primer szekvenciákat sorolja S1 táblázatban. Genomi DNS-hidrogén-szulfit-módosított átalakítani, hogy minden metilálatlanok citozin maradványok az uracil. Röviden, 0,5-2,0 ug DNS-t denaturáltuk NaOH, kezelünk nátrium-biszulfittal, és megtisztítottuk a Wizard DNA Clean-up rendszer (Promega). A metilációs állapotát minden egyes CIMP kapcsolatos lókusz értékeltük egyesítjük biszulfit restrikciós analízissel (COBRA). Polimeráz láncreakció (PCR) COBRA végeztük a biszulfit-módosított templát DNS-t egy 25 nl-es PCR-keverék, amely 12,5 jil HotStarTaq Master Mix (Qiagen), 0,5 nmol /liter az egyes PCR-primert, és körülbelül 25 ng biszulfit-módosított DNS-t. PCR-termékeket emésztjük hozzáadásával restrikciós enzimmel 37 ° C-on 12 órán át. Az emésztett DNS-t elválasztottuk 3% -os agaróz gélen 1 × Tris-acetát-EDTA pufferrel, és megfestettük etidium-bromiddal. A normál humán vastagbél-DNS-t kezelünk SSSI metilázzal (New England Biolabs) alkalmaztunk pozitív kontrollként az metilezett allélek, és a DNS-t a normál limfociták alkalmaztunk kontrollként metilálatlan allélek. Vizet adunk alkalmaztunk negatív PCR kontroll ellenőrzésére PCR szennyeződést. CIMP-magas definiáltuk, nem kevesebb, mint 10, a metilációs ezen lókuszok.
KRAS
mutáció elemzések
exon 2 (kodon 12/13) mutációkat. PCR KRAS
gén végeztünk egy 25
E. coli szuperbaktériumok terjedése a rossz WC -higiénia miatt,
Az antibiotikum -rezisztencia mindössze két évtized alatt megduplázódik
Egy nagy tanulmány szerint a SARS-CoV-2 vírusterhelés a gyermekeknél a legalacsonyabb
A bélbaktériumok előre jelezhetik a pulmonális hipertónia kockázatát
Az új számítási modellezési módszer megjósolja, hogy a bél mikrobái hogyan változnak az idő múlásával
A SARS-CoV-2 fertőzés meghosszabbítja a vírusszaporodást és a limfociták elvesztését rákos betegeknél
A tisztítószerek növelhetik a gyermekkori asztma leletek kockázatát
A Simon Fraser Egyetem Egészségtudományi Karának (SFU) kutatóinak új tanulmánya szerint a csecsemők háztartási tisztítószereinek való kitettsége növelheti a gyermekkori asztma kockázatát a gyermekekné
A COVID-19 során bekövetkező új gazdaszervezet-vírus-mikrobióma kölcsönhatások meghatározhatják az eredményt
A 2019-es koronavírus-járvány (COVID-19), a súlyos akut légzőszervi szindróma 2-es koronavírus (SARS-CoV-2) okozta, több mint egy éve rohamosan terjed. Bár elsősorban légúti betegség, megnyilvánulásai
A bélbaktériumok erősebb izmokhoz kapcsolódnak idős embereknél
Egy merész új tanulmány azt sugallja, hogy az idősebb felnőttek izomerője nagyobb lehet a következők miatt:részben, bélbaktériumokat érintő mechanizmusok. A bélbaktériumok az izomtömeghez és a fizik