abstraktné
Pozadie
Ak chcete zlepšiť výsledný stav pacientov trpiacich rakovinou žalúdka, je je nutná lepšie pochopenie základných genetických a epigenetických udalostí v tomto malignity. Aj keď CPG ostrov methylator fenotyp (Cîmpu) a mikrosatelitních nestabilita (MSI), bolo preukázané, že hrajú kľúčovú úlohu v žalúdku rakoviny patogenézy, klinický význam týchto udalostí na výsledky prežitia u pacientov s karcinómom žalúdka zostáva neznámy.
Táto štúdia zahŕňala súboru pacientov s patologicky potvrdeným rakovinou žalúdka, ktorí mali chirurgické resekciu. bola analyzovaná Do štúdie bolo zaradených 68 karcinómov žalúdka. Cîmpu a MSI stavy boli stanovené na základe analýzy promótor CPG ostrov stav metylácie 28 génov /loci, a genomické nestability na 10 mikrosatelitních markerov, resp. Cox je úmerný modelu nebezpečnosť bola vykonaná viacrozmerné analýzy vrátane veku, štádium, nádorové diferenciácie, Kras Výsledky podľa viacrozmerné analýzy, už OS významne koreluje s nižším patologické fáze ( P Cîmpu a /alebo MLH1 Citácia :. Shigeyasu k, Nagasaki T, Mori Y, Yokomichi N, Kawai T, Fuji T, et al. (2015) klinický význam MLH1 metylácie CPG ostrova a Methylator fenotyp ako prognostických markerov u pacientov s karcinómom žalúdka. PLoS ONE 10 (6): e0130409. doi: 10,1371 /journal.pone.0130409 Editor: Hassan Ashktorab, Howard University Spojené štáty prijatá: 18. februára 2015; Prijaté: 20.mája 2015; Uverejnené: 29.júna 2015 Copyright: © 2015 Shigeyasu et al. Toto je článok o otvorenej distribuovaný pod podmienkami Creative Commons Attribution licencie, ktorá umožňuje neobmedzené použitie, distribúciu a reprodukciu v nejakom médiu, za predpokladu, že pôvodný autor a zdroj sú pripísané Data Dostupnosť: Všetky relevantné údaje spadajú do papiera a jeho podporné informácie súbory Financovanie :. Táto práca bola podporená granty KAKENHI 19390351 a 20590572 do TN a granty R01 CA72851 a 181572 z National Cancer Institute, National Institutes of Health, a prostriedky z Baylor výskumného ústavu k AG Konflikt záujmov :. autori vyhlásili, že žiadne konkurenčné záujmy neexistujú Úvod žalúdka rakovina je druhou najčastejšou príčinou rakoviny. spojené so štúdiom úmrtia, s asi 700.000 potvrdených uhynutých zvierat ročne po celom svete, hoci výskyt sa postupne znižoval [1-3]. rakovina žalúdka je všeobecne diagnostikovaná v pokročilom štádiu, čo je hlavnou príčinou jeho zlú prognózu [4]. Pre zlepšenie výsledku karcinómu žalúdka, je nutná identifikácia genetických alebo epigenetických udalostí v progresii rakoviny žalúdka. Najvýznamnejšie epigenetické udalosť v progresie rakoviny je metylácie CPG promotorových oblastí kľúčových génov nádorových supresor. CPG ostrovy sú takmer 1-kb sekvencie DNA s vysokým obsahom guanínu, cytozín v promotorových oblastiach génov [5]. Na rozdiel od normálnych buniek, CPG ostrovy vnútri nádorových supresorových génov v nádorových bunkách sú často hypermethylated, čo vedie k CPG ostrov methylator fenotyp (Cîmpu) [6,7]. Epigenetické umlčanie génov nádorových súvisiacich kvôli CPG ostrov metylácii bola nedávno popísaná v karcinómu žalúdka. Aberantne CPG ostrov metylácie > 100 rastovo regulačných génov v karcinómu žalúdka doteraz boli popísané [8-24], však, klinický význam Cîmpu u karcinómu žalúdka zostáva nepreskúmanej a zle rozumie Na rozdiel. , mismatch opravy (MMR) deficit u karcinómu žalúdka je tiež dôležitým genetické udalosti. Genomická nestabilita v počte mikrosatelitních repetície (alebo mikrosatelity) sa označuje ako mikrosatelitov nestabilitu (MSI). MSI je funkcia spôsobené chybným systémom DNA MMR. Funkčné inaktivácie MMR génov, ako je napríklad MLH1 S ohľadom na túto medzeru vo vedomostiach, v tejto štúdii sme skúmali význam Cîmpu a MMR deficiencie u karcinómu žalúdka a stanovená ich prínos ako prognostický markery u pacientov s rakovinou žalúdka. materiáloch a metódach vzorky tkanív Táto štúdia zahŕňali kohortu pacientov s patologicky potvrdeným karcinómom žalúdka, ktorí podstúpili chirurgickú resekciu na Okayama University nemocnice (Okayama, Japonsko) od 1998-2004. bolo analyzovaných celkom 68 žalúdočných rakovinové tkanive a ich spárovaných normálne žalúdočnú sliznicu. Všetky normálne žalúdočnej sliznice tkaniva boli získané od miest susediacich s, ale najmenej 5 cm od, pôvodného nádoru. Všetci pacienti poskytované písomný informovaný súhlas a štúdia bola schválená etickou komisiou Okajama fakultnej nemocnice. Všetci pacienti poskytované písomný informovaný súhlas na použitie svojich údajov pre budúce analýzy. Všetky karcinómov žalúdka a normálne žalúdočnej sliznice boli vzorky čerstvé mrazené tkaniva, z ktorých DNA bola extrahovaná s použitím QIAamp DNA Mini Kit (QIAGEN). MSI analýza bola vykonaná vyšetrenia 2 mononukleotidy repetície (BAT25 a BAT26), 12-dinukleotid repetície (D17S250, D18S35, D18S58, D18S69, D2S123, D4S1559, D4S2381, D4S470, D5S107, D5S346, a D8S87, TP53), a jeden Tetranukleotidové opakuje, MYCL, ako bolo opísané skôr [ ,,,0],31]. Nádory ukazujúci alelické posuny v ≥5 z 15 markerov boli klasifikované ako MSI-H (ďalej v texte len "MSI"), a zvyšok bol klasifikovaný ako stabilný mikrosatelity (MSS). Vzhľadom k častým hypermetylace z niekoľkých génov je jedným z charakteristických rysov nádorov s Cîmpu sme skúmali stav metylácie 28 promótor CPG ostrova súvisiace loci ( APC Priame sekvenovanie bolo vykonané pre identifikáciu KRAS software JMP (ver 10,0, SAS Institute Inc. .) bol použitý na vykonanie štatistickej analýzy. Student t-test bol použitý pre porovnanie spojité premenné, a Fisherov presný test bol použitý na analýzu kategorické premenné. Celkové prežívanie (OS) bola meraná odo dňa operácie k dátumu úmrtia. Metóda podľa Kaplan-Meiera a log-rank štatistiky týkajúce sa rozdielov medzi rôznymi prognostické faktory boli použité na odhad rozdelenia OS. Cox modely úmerný nebezpečnosti boli použité pre výpočet pomeru rizika (HR) s zodpovedajúce 95% interval spoľahlivosti (CI). Univariantní alebo multivariačný logistické regresná analýza bola vykonaná na stanovenie rozdielov medzi HR každej skupine. Všetky uvádzané P Štúdium populácie V tejto štúdii sme skúmali 68 pacientov s rakovinou žalúdka. V promotorových CPG v MLH1 28 CPG loci vrátane APC výsledky prežitia u pacientov založených na MLH1 3 ' prekrývajúcich vzťah medzi Cîmpu a stav metylácie MLH1 3 ' Rovnako tak ceny OS 5-rok boli analyzované na Cîmpu vysokými a Cîmpu nízkych skupín, a predstavovala v Cîmpu vysokého skupiny o niečo vyššia ako v Cîmpu nízku skupinu, ale rozdiel nebol významný ( log-rank P Podiel deficitu génovej reparácie a stavu Cîmpu na mieru prežitia miery prežitie 5 rokov boli analyzované a porovnané medzi týmito skupinami; Cîmpu-high / MLH1 3 ' Vzťah medzi MLH1 prekrývajúce sa vzťah medzi MLH1 5 ' analýza s mnohými premennými pre prežitie výsledkovej predikátory a Cox modelu proporcionálneho rizika vrátane veku, štádium, diferenciácie, Kras Diskusia metylácie DNA v rakovinových bunkách sa stala témou intenzívne vyšetrovanie. Inaktivácia tumor supresorových génov CPG metyláciou promotorové oblasti urýchľuje karcinogenéze kvôli regulácii aberantne bunkového cyklu a proliferácie [15]. Niektorí kandidát nenormálne boli hlásené denaturovaný gény v rakoviny žalúdka. RASSF1A Súčasné CPG metylácie v mnohých génov bola definovaná ako Cîmpu u kolorektálneho karcinómu (CRC) a rakoviny žalúdka [15,40,53- 57], a bolo preukázané, že koreluje s hypermetylace nádorových supresorových génov. Avšak, dôkaz pre Cîmpu v karcinómu žalúdka, nie je tak presvedčivé, ako je tomu v prípade CRC [58,59]. V karcinómu žalúdka, Cîmpu-high bola popísaná v 41% [40] a 31% [54] nádorov. Pacienti s Cîmpu vysokého rakoviny žalúdka majú podstatne kratšiu prežitia ako pacienti s Cîmpu nízkym rakoviny žalúdka [54,60]. Ďalšia správa ukázala, že Cîmpu bola spojená s lepším prežitím u rakoviny žalúdka [54]. Nedávne meta-analýza sa zamerala na silnom vzťahu Cîmpu H. pylori, EBV, a MSI, ale Cîmpu nemohol vykazujú prognostický potenciál pre karcinómu žalúdka [61]. Na rozdiel od toho u nestability mikrosatelity opakuje v rámci rôznych génov, rastovo regulačné je definovaná ako MSI. Štandardné panel, ako je napríklad panel NCI, sa odporúča, vrátane mononukleotidy (BAT26 a BAT25) a dinukleotid (D2S123, D5S346, a D17S250) sa opakuje [62]. môžu byť identifikované tri úrovne MSI: na vysokej úrovni MSI (MSI-H), nízkoúrovňové MSI (MSI-L), a MSS. Fenotyp MSI-H u karcinómu žalúdka bola hlásená k účtu pre 5% -50% MSI pozitívnych nádorov [17]. MSI je funkcia spôsobené chybným systémom DNA MMR. Funkčné inaktivácie MMR génov, ako je napríklad MLH1 Ako je uvedené vyššie, a Cîmpu stav MMR-deficit sú kľúčové črty karcinómu žalúdka a môže odrážať rozdiely v prežitie pacientov trpiacich týmto malignity. Významná korelácia medzi Cîmpu a MSI bola hlásená u GC [61]. Avšak, údaje o synergické efekty týchto parametrov sú zriedkavé a je vyžadovaný viacrozmerné analýza týchto genetických a epigenetických parametrov. V našej štúdii CACNA1G Avšak, Cîmpu a nedostatok MMR sú na sebe závislé. MSI spojené s sporadických CRC vznikajú pri procese, ktorý zahŕňa Cîmpu [66,71]; Preto by malo byť vykonávané integrovanú štatistickú analýzu Cîmpu a MMR deficitu. Napríklad v dvanástniku adenokarcinómov, Cîmpu / MLH1 Na záver, naše údaje naznačujú, že stratifikácia pacientov s Cîmpu založené na MLH1
status mutácie a kombinovaná Cîmpu / MLH1
stav metylácie vo vzťahu k celkovému prežitiu (OS).
= 0,0088), lepšie diferenciácie nádoru ( P
= 0,0267) a Cîmpu vysoká a MLH1 3 '
metylovaného stavu ( P
= 0,0312). Stratifikácia stavu Cîmpu s ohľadom na MLH1
stavu metylácie ďalej umožnila predikciu žalúdočné rakoviny prognózou.
Závery
stav metylácie môže mať potenciál byť prognostické markery u pacientov s rakovinou žalúdka
alebo MSH2
tým, že promótor metylácie je zodpovedný za MSI-high (MSI-H) fenotypu u karcinómu žalúdka. V predchádzajúcej štúdii karcinómu žalúdka s MSI-H vykazovali vyššiu frekvenciu antrálnej miesta, črevné subtypu, nižší výskyt lymfatických uzlín a lepšie prežívanie v porovnaní s mikrosatelitov stabilný (MSS) alebo MSI-L karcinómov žalúdka [17,25 -30]. Avšak klinický význam deficitu MMR u karcinómu žalúdka zostáva neznámy.
MSI analýza
sodný bisulfite modifikácie a analýzy Cîmpu
COX2
DAPK
DCC
HPP1
MGMT-Mp región
MGMT-Eh región
, MINT1
MINT2
MINT31
MLH1 5 '
MLH1 3 '
p14
p16
RASSF1A
RASSF2A-region1
RASSF2A-REGION2
, RASSF3
RASSF5
RASSF6
RUNX3
SFRP2-region1
SFRP2- REGION2
UNC5C
3OST2
FOXL2
) a zodpovedajúce sekvencie primérov sú uvedené v tabuľke S1. Genómovej DNA bola bisulfitového-upravený tak, aby previesť všetky nemethylované cytosinové zvyšky na uracil. V stručnosti, 0,5 až 2,0 ug DNA boli denaturovaný v roztoku hydroxidu sodného, spracuje s bisulfitového sodným a čistená pomocou DNA systémy čistenia Wizard (Promega). Stav metylácie každej Cîmpu súvisiace lokuse bola hodnotená v kombinácii hydrogénsiričitanu restrikčné analýzou (COBRA). Polymerázová reťazová reakcia (PCR) pre COBRA bola vykonaná na templátové DNA bisulfitového modifikované v 25 ul PCR zmesi obsahujúce 12,5 ul HotStarTaq Master Mix Kit (Qiagen), 0.5 mmol /L každého PCR primeru, a približne 25 ng bisulfitového modifikované DNA. PCR produkty boli štiepené pridaním reštrikčného enzýmu pri 37 ° C počas 12 hodín. Štiepená DNA bola oddelená na 3% agarózovom géli v 1 x Tris-acetát-EDTA pufru a farbené etidiumbromidom. Normálny ľudský hrubého DNA spracuje SSSI metyláza (New England Biolabs), bol použitý ako pozitívna kontrola pre metylovaných alel, a DNA z normálnych lymfocytov bol použitý ako kontrola pre nemethylovaných alel. Voda bola použitá ako negatívna kontrola pre monitorovanie PCR kontaminácii PCR. Cîmpu-high bola definovaná ako nie menšie ako 10 metylácie týchto lokusov.
Kras
mutácie analýzy
exón 2 (12/13) kodónoch mutácie. PCR za Kras
génu bola vykonávaná v 25 ul PCR zmesi obsahujúce 12,5 ul HotStarTaq Master Mix kit s primermi. Purifikačný súpravy QIAquick PCR bola použitá pre čistenie PCR produktov, a boli priamo sekvenované na sekvenátoru DNA ABI 310 [32].
štatistickej analýzy
hodnoty sú obojstranné, a P Hotel < 0,05 bola považovaná za označujú štatistickú významnosť.
Výsledky
gén, šírenie CPG metylácie v jej 3 'regiónu bola stanovená, že je rozhodujúci pre MLH1 expresiu [33]. Popis súboru pacientov a rôznych klinicko-funkcií na základe pohlavia, veku, fázu, diferenciáciu nádoru, stavu MSI Kras
mutácie, a MLH1 3 '
metylácie je uvedený v tabuľke 1. tieto stavy boli porovnané medzi Cîmpu vysokými a nízkymi Cîmpu-skupín. Z týchto parametrov, stavu MSI a MLH1 3 '
metylačného statusu ukázala významné rozdiely medzi 2 skupinami (tabuľka 1).
Stav metylácie
CACNA1G
CHFR
COX2
DAPK
DCC
HPP1
MGMT-Mp región
, MGMT-Eh región
, MINT1
MINT2
MINT31
MLH1 5 '
MLH1 3'
p14
p16
RASSF1A
RASSF2A-region1
RASSF2A-REGION2
RASSF3
RASSF5
RASSF6
RUNX3
SFRP2 -region1
SFRP2-REGION2
UNC5C
3OST2 stroje a FOXL2
boli analyzované pre zistenie stavu Cîmpu každého rakoviny žalúdka , Metylácia spektrum týchto lokusov je znázornený na dlaždice mapa (obr 1a). V týchto loci CACNA1G
CHFR
DCC
HPP1
MINT1
MINT2
, MINT31
MLH1 5 '
MLH1 3'
p16
RASSF2A-region1
RASSF2A-REGION2
RUNX3
SFRP2-REGION2
UNC5C
3OST2 stroje a FOXL2
boli významne methyluje v Cîmpu vysokého skupiny (tabuľka 2).
metylácie a stavové Cîmpu v žalúdočných rakovín
bola analyzovaná. 10 pacientov bolo v Cîmpu-high / MLH1 3 '
methylata, jeden pacient bol v Cîmpu-low / MLH1 3'
methylata, 20 pacientov bolo v Cîmpu vysoká / MLH1 3 '
non-metylovaný a 37 pacientov boli v Cîmpu-low / MLH1 3'
nemethylovaných skupín (obr 1b). Kaplan-Meierove krivky prežitia boli vytvorené v súlade s MLH1 3 '
metylačného statusu. Rýchlosti OS 5-rok boli stanovené pre MLH1 3 '
methylata a nemethylovaných skupín. Miery OS 5-ročnej boli významne vyššie vo MLH1 3 '
denaturovaným skupiny v porovnaní so nemethylovaných skupiny. (Log-rank P
= 0,0257; Obr 1c)
= 0,0688; obr. 1d)
methylata, Cîmpu-low / MLH1 3'
methylata, Cîmpu vysoká / MLH1 3 '
non-metylovaný a Cîmpu-low / MLH1 3 '
non-methylata skupiny. Zistili sme, že celková miera prežitia boli vyššie u kombinovanej Cîmpu-high / MLH1 3 '
methylata skupina, v porovnaní s ostatnými skupinami, kde sú rozdiely neboli štatisticky významné (log-rank P
= 0,0706; obr. 1e)
metylácie a MSI
metylácie a 3 '
stav metylácie bola analyzovaná. 10 pacientov bolo klasifikované ako MLH1 5 '
methyluje / 3'
methylata, 8 pacientov as MLH1 5 '
methyluje / 3'
non methylata, 1 pacient ako MLH1 5 '
non-methyluje / 3'
methylata a 49 pacientov ako 5 '
non-methyluje / 3'
non-methylata (obr 2a). V denaturovaným skupiny MLH1 3 '
, viac ako 80% pacientov došlo MSI. Naproti tomu, v nemethylovaných skupiny MLH1 3 '
, takmer vo všetkých prípadoch boli MSS (obrázok 2b). Kaplan-Meierove krivky prežitia boli vytvorené v súlade s MLH1 5 '
metylačného statusu. Miery prežitia 5 rokov boli analyzované na MLH1 5 '
metylovaných a non-metylovaných skupín a predstavovala v MLH1 5 mierne vyššia'
denaturovaným skupine, ako v nepodnikateľskej methylata skupina, avšak rozdiely neboli štatisticky významné (log-rank P
= 0,1009; obr 2c). Prežitie Kaplan-Meier krivky boli generované v závislosti na stave MSI. Miera prežitia 5 rokov boli analyzované pre skupiny MSI a MSS, a rýchlosť je v skupine MSI o niečo vyššia, než v skupine, MSS, ale rozdiely neboli štatisticky významné (log-rank P
= 0,1316; obr 2d).
status mutácie, a Cîmpu / MLH1 3 '
metylačnej stav vo vzťahu k OS bol použitý na vykonanie multivariačný analýzy (tabuľka 3). Iba etapa ( P
= 0,0088), diferenciácia ( P
= 0,0267), a Cîmpu / MLH1
stav metylácie ( P
= 0,0312) boli štatisticky významné prediktory OS. pomer rizika bol v Cîmpu-high výrazne nižšia / MLH1 3 '
methylata skupiny.
p14ARF stroje a MGMT
[34-38]; CHRNA3
DOK1 stroje a GNMT
[39]; p16
hMLH1
MINT1
MINT2
MINT12
MINT25
a MINT31
[40]; APC
CDH1
MHL1
CDKN2A
CDKN2B stroje a RUNX3
[17 ]; CDH1
[41]; DKK3
[42]; Ptení
[43]; MGMT
[44]; TFPI2
[22]; CACNA2D3
[45]; PCDH10
[46]; SOX2
[47]; MAL
[48]; a COX2
[49] bolo skôr oznámené, ktoré majú byť hypermethylated u karcinómu žalúdka. Metylácie p16
promotorových CPG ostrovov je marker malígneho potenciálu dysplázia v žalúdku [50]. Metylácie MGMT
je spojená s pokročilom štádiu a zlou prognózou [44]. Aberantne metylácie DNA v týchto génoch môžu podporiť rozvoj rakoviny žalúdka. Avšak, presné génové ciele hypermetylace pre karcinogenézy, zostávajú neznáme [51,52].
alebo MSH2
podľa mutačné inaktiváciu a metylácie promótorom je zodpovedný za fenotyp MSI-H v karcinómu žalúdka. Najmä, podobne ako CRC, metylácii MLH1
je spojená s fenotypom MSI-H [15,40,63,64], pretože MLH1
metylácie predchádza strate expresie proteínu. Leite M et al. hlásil, že MLH1
promotér hypermetylace bola pozorovaná u 78,7% (70/89) analyzovaných prípadov MSI [65]. Metylácie regióne 3 ' je vyžadované MLH1
promótor, ktorý sa nachádza v blízkosti jej začiatku transkripcie (TSS), na umlčanie génu. 5 'koniec promotora je tiež náchylný k metylácii, ale to nie je funkčne dôležité, ak sa metylácie sa vzťahuje na kritické oblasti 3' [66,67]. Stav MSI je zodpovedný za mutáciu génov regulujúcich bunkový cyklus a apoptotické signalizáciu, vrátane TGFβRII
IGFIIR
TCF4
Riz
BAX
CASPASE5
FAS
BCL10 stroje a APAF1
[17,25] a gény udržanie genómovej integrity vrátane MSH6
MSH3
MED1
RAD50
BLM
ATR
a MRE11
[17,68]. Karcinómov žalúdka s MSI-H vykazujú vyššiu frekvenciu antrálnej miesta, črevné subtypu, nižší výskyt lymfatických uzlín, a lepšie prežitie oproti tým rakovinou žalúdka s MSS alebo MSI-L [17,25-30].
CHFR
DCC
HPP1
MINT1
MINT2
, MINT31
MLH1 5 '
MLH1 3'
p16
RASSF2A-region1
RASSF2A-REGION2
RUNX3
SFRP2-REGION2
UNC5C
3OST2 stroje a FOXL2
boli významne methyluje v Cîmpu vysokého skupiny. Konkrétne sme popísali promótor metylácie FOXL2
rakoviny žalúdka. FOXL2
je gén kódujúci transkripčný faktor Forkhead a má zásadný význam pre ovariálnej funkcie [69]. FOXL2
reguluje bunkový cyklus tým, že prinúti G1 zatknutie a chráni bunky pred oxidačným poškodením tým, že podporuje oxidovaného reparácia DNA a tým, že zvyšuje množstvo agenta glutathionu antioxidačné [69]. FOXL2
potláča proliferáciu, inváziu a podporuje apoptózu rakovinových buniek krčka maternice [70]. Promotér metylácie FOXL2
môžu mať významnú úlohu pri vzniku nádorov u karcinómu žalúdka. Na rozdiel od toho MLH1 3 '
metylácie bola nutná pre nedostatok MMR a ukázala MSI. MLH1 3 '
metylácie skupina mala tendenciu k dobrou prognózou v odhade prežitie Kaplan-Meier.
stav metylácie vykazovali významnú prognostickú hodnotu v oboch OS a čas do recidívy (TTR) v viacrozmerné analýzy [72]. Pacienti s Cîmpu-high / MLH1
-unmethylated nádory mal najhoršie OS a TTR [72]. V našej viacrozmerné analýze pacientok s karcinómom žalúdka, len Cîmpu-high / MLH1 3 '
methylata skupina mala dobrú prognózu. Dôvodom pre dobrou prognózou v Cîmpu-high / MLH1 3 '
methylata skupina zostáva neznámy. Tento jav môže byť z dôvodu synergického inaktiváciu životne dôležitých génov v dôsledku mutácií a metylácie promótorom. Ak chcete ďalej potvrdzujú naše zistenia, ak by sme vykonali nezávislé overenie našich výsledkov z údajov o pacientovi v predložených The Cancer Genome Atlas databázy (TCGA). [73-75] Cîmpu-high / MLH1
hyper-methyluje skupina vykazovala častejšie lymfatických uzlín (p = 0,0009), štádia pokročilé ochorenie (p = 0,0078; S1 File) a mierne lepší Disease prežitie zadarmo (S2 File). Na druhú stranu, môže stav Cîmpu /MSI nevykazujú významnú hodnotu ako prognostický marker (S2 tabuľka). Tento výsledok ukazuje, že MLH1
má najdôležitejšiu úlohu medzi MMR génov v karcinogenéze GC. Ďalšie vyšetrovanie je potrebné objasniť vzťah medzi stavom Cîmpu a deficitom MMR. Tento prístup povedie k novej stratégie pre liečbu rakoviny žalúdka.
stav metylácie môže umožniť predikciu karcinómu žalúdka prognóza. Cîmpu-high / MLH1 3 '
methylata skupina mala dobrú prognózu, ale aj iné skupiny môžu vyžadovať intenzívnu liečbu zlepšenie prežitia, ktorý musí byť overená v ďalších štúdiách.
podporné informácie
S1 súborov. Vzťah medzi Cîmpu a MLH1
metylácie u pacientov s karcinómom žalúdka v databáze TCGA.
Skúmali sme metylačného statusu 17 promótor CPG ostrova súvisiace loci ( APC
DAPK
DCC