Ploche ONE: Asociácie medzi počtom kópií DNA aberácií na chromozóme 5q22 a karcinóm žalúdka

abstraktné

Pozadie

Žalúdočné rakovina je obyčajná rakovina. Objavovanie nových genetických biomarkerov by mohli pomôcť identifikovať vysoko rizikové jedinca. variácie počtu kópií (CNV), v poslednej dobe bolo preukázané, že ovplyvňujú riziko pre niekoľko druhov rakoviny. Cieľom tejto štúdie bol požadovaný pre testovanie vzťah medzi počtom kópií v oblasti varianty a GC.

Methods

Celkom 110 pacientov s rakovinou žalúdka a 325 zdravých dobrovoľníkov bolo zaradených do tejto študovať. Hľadali sme CNV a našiel CNV (variačný 7468), obsahujúci časť APC
génu, SRP19
gén a REEP5
génu. Vybrali sme štyri sondy zacielenie na APC-intron8
APC-exon9
SRP19 stroje a REEP5
vypočúvať tento CNV. Konkrétne TaqMan sondy značené rôznymi fluorofor reportér boli použité v platforme real-time PCR na získanie počtu kópií. Oba pôvodné non-celočíselné údaje a spracované údaje celočíselné o počte kópií boli použité pre analýzy.

Výsledky

pacientov Žalúdočné Caner mala nižší počet kópií non-celočíselné ako kontrolná pre APC exon9
sonda (Upravená p = 0,026) a SRP19
sonda (Upravená p = 0,002). Analýza celé číslo kópií prinieslo podobný priebeh aj keď menej významné (po očistení p = 0,07 za APC exon9
sondy a Upravený p = 0,02 za SRP19
sondy).

závery

stratami CNV u 5q22, najmä v oblasti DNA obklopujúcej APC-exon 9
, môže byť spojená s vyšším rizikom vzniku rakoviny žalúdka.

Citation : Tsai PC, Huang SW, Tsai HL, Ma CJ, Hou MF, Yang IP, et al. (2014) o pridružení medzi počte kópií génov aberácií na chromozóme 5q22 a rakoviny žalúdka. PLoS ONE 9 (9): e106624. doi: 10,1371 /journal.pone.0106624

Editor: Qing-Yi Wei, Duke Cancer Institute, Spojené štáty

• Ploche ONE :. Chirurgické Výsledky a prognostické faktory T4 rakovina žalúdka u pacientov bez Distant Metastasis
• Ploche ONE: proteín tepelného šoku 60 Nadmerná expresia je spojená s progresiou a prognózou u žalúdka Cancer