PLoS ONE: Tumore Content Chart-Assisted HER2 /CEP17 digitale Analisi PCR di cancro gastrico biopsia campioni

Astratto

Valutazione HER2
amplificazione del gene è una componente essenziale del processo decisionale per il cancro gastrico avanzato o metastatico terapeutico. Un metodo semplice che è applicabile alle piccole, fissati in formalina, campioni di biopsia inclusi in paraffina è auspicabile in aggiunta o in sostituzione attualmente utilizzato HER2 immunoistochimica e nei protocolli di ibridazione in situ. In questo studio, abbiamo sviluppato un metodo PCR digitale microfluidica a base per la determinazione HER2
e cromosoma 17 centromero (CEP17) copiare i numeri e la stima rapporto contenuto del tumore (TCR). Il il rapporto HER2
/CEP17 è determinato da tre variabili-TCR e numero di copie assoluti di HER2
e CEP17-esaminando le cellule tumorali; solo il rapporto tra questi ultimi due può essere ottenuta tramite PCR digitale utilizzando l'intero campione senza purificare cellule tumorali. TCR è stata determinata mediante analisi di immagine semiautomatico. Abbiamo sviluppato un tumore grafico Content, che è un piano di coordinate rettangolari costituito da Dati HER2
/CEP17 digitale PCR e TCR che delinea amplificati, non amplificato, e le aree equivoci. Applicando questo metodo, 44 ​​cliniche gastrici campioni bioptici di cancro sono stati classificati come amplificato (n = 13), non amplificato (n = 25), o equivoci (n = 6). A titolo di confronto, 11 campioni sono risultati positivi, 11 erano negativi, e 22 sono stati equivocamente immunoistochimica. Così, il nostro nuovo metodo ha ridotto il numero di campioni equivoci 22-6, eliminando così la necessità di conferma da parte di fluorescenza o dual-sonda ibridazione in situ a < 30% dei casi. PCR digitale dei contenuti grafico-assistita tumore è applicabile anche a più siti nei tessuti asportati chirurgicamente. Questi risultati indicano che questa analisi è una valida alternativa alla HER2 immunoistochimica nei tumori gastrici che può servire come base per la valutazione automatizzata di HER2
stato

Visto:. Matsusaka K, Ishikawa S, Nakayama A, Ushiku T, Nishimoto A, Urabe M, et al. (2016) Tumor Content Chart-Assisted HER2 /
CEP17 digitale analisi PCR di cancro gastrico biopsia campioni. PLoS ONE 11 (4): e0154430. doi: 10.1371 /journal.pone.0154430

Editor: Yves St-Pierre, INRS, Canada

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