PLOS ONE: Tumor Content Chart-Assisted HER2 /CEP17 Digital Análise por PCR de câncer gástrico Biópsia amostras

Abstract

Avaliando HER2
amplificação do gene é um componente essencial do processo de decisão terapêutica para o cancro gástrico avançado ou metastático. Um método simples que é aplicável a, amostras de biópsia de pequenos, fixadas em formalina e embebidas em parafina é desejável como um adjuvante ou como um substituto para a imuno-histoquímica de HER2 actualmente utilizados e em protocolos de hibridação in situ. Neste estudo, foi desenvolvido um método de PCR digital baseada em microfluidics para determinar HER2 Comprar e cromossomo 17 centrômero (CEP17) copiar números e estimar relação de conteúdo de tumor (TCR). O relação de HER2
/CEP17 é determinada por três números de cópias absolutos de variáveis-TCR e HER2 Comprar e CEP17-examinando células tumorais; somente o rácio das duas últimas podem ser obtidas por PCR digital usando todo o espécime sem purificar células tumorais. TCR foi determinada por análise de imagem semi-automático. Nós desenvolvemos um gráfico conteúdo do tumor, o que é um plano de coordenadas retangulares que consiste em Dados HER2
/CEP17 digital de PCR e TCR que delineia amplificados, não amplificado, e áreas equívocas. Ao aplicar este método, 44 ​​amostras de biópsias gástricas cancro clínicos foram classificados como amplificado (n = 13), não amplificado (n = 25), ou equívoca (n = 6). Por comparação, 11 amostras foram positivas, 11 foram negativas, e 22 foram equivocally imuno-histoquímica. Assim, o nosso novo método reduziu o número de amostras equívocos 22-6, obviando assim a necessidade de confirmação por fluorescência ou dupla sonda de hibridização in situ para < 30% dos casos. análise de PCR digital de tumor conteúdo assistida-chart é também aplicável a vários sites em tecidos ressecados cirurgicamente. Estes resultados indicam que esta análise é uma alternativa útil para HER2 imuno-histoquímica em câncer gástrico que pode servir como base para a avaliação automática de HER2
estatuto

Citation:. Matsusaka K, Ishikawa S, Um Nakayama, Ushiku t, Nishimoto A, Urabe M, et al. (2016) Tumor Content Chart-Assisted HER2 /Tablet CEP17 Digital Análise por PCR de câncer gástrico biópsia espécimes. PLoS ONE 11 (4): e0154430. doi: 10.1371 /journal.pone.0154430

editor: Yves St-Pierre, INRS, Canadá

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